一种基于网络药理学分析马钱子活性成分镇痛作用的方法与流程

文档序号:21622498发布日期:2020-07-29 02:28阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种基于网络药理学分析马钱子活性成分镇痛作用的方法,其特征在于,包括以下步骤:

s1、获取马钱子的化学成分与成分作用靶点:

以马钱子为关键词,利用batman-tcm数据库检索马钱子现有活性化合物及其靶向基因,根据研究目标,设定筛选标准,获得符合条件的马钱子活性化合物及其靶向基因;

s2、识别疾病作用靶点:

利用disgenet数据库获得与疼痛相关的虚拟目标靶标基因,然后与s1获得符合条件的马钱子活性化合物的靶向基因进行交集,所得的交集基因即为药物-疾病交集靶基因;

s3、构建马钱子与疾病网络,以及筛选核心节点:

将s1获得符合条件的马钱子活性化合物及其靶向基因、s2得到的药物-疾病交集靶基因输入cytoscape3.6.1软件中,利用cytoscape3.6.1软件建立马钱子镇痛“成分-靶点-疾病”网络图,同时计算网络图中的所有节点,确定节点筛选条件,选取核心节点进行后续分析;

s4、对核心节点进行富集分析而解析马钱子镇痛作用机制:

利用david生物分子功能注释系统,对核心节点进行go富集和kegg通路注释分析,预测靶点功能分布,并根据富集因子分析核心通路富集程度,解析马钱子镇痛作用机制。

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,s1中,所述的筛选标准为,阈值:scorecutoff>20、p<0.05。

3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,s3中,通过cytoscape软件计算网络图中所有节点的拓扑参数,选取degree,betweenness,closeness参数作为核心节点的筛选条件,选取核心节点进行后续分析。


技术总结
本发明公开一种基于网络药理学分析马钱子活性成分镇痛作用的方法,包括以下步骤:S1获取马钱子的化学成分与成分作用靶点:以马钱子为关键词,利用BATMAN‑TCM数据库检索获得符合条件的马钱子活性化合物及其靶向基因;S2识别疾病作用靶点:利用DisGeNET数据库获得与疼痛相关的虚拟目标靶标基因,马钱子活性化合物及其靶向基因进行交集,得药物‑疾病交集靶基因;S3构建马钱子与疾病网络,以及筛选核心节点;S4利用DAVID对核心节点进行GO富集和KEGG通路注释分析,预测靶点功能分布,并根据富集因子分析核心通路富集程度,解析马钱子镇痛作用机制。解决了目前马钱子研究周期长、缺乏系统性、研究目标单一等问题。

技术研发人员:邓志军;郭洁文;刘若轩
受保护的技术使用者:广州市中医医院(广州市中医中药研究所)
技术研发日:2020.04.01
技术公布日:2020.07.28
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