区分结肠直肠腺瘤和腺癌的方法和工具的制作方法

专利名称：：区分结肠直肠腺瘤和腺癌的方法和工具的制作方法
技术领域：
：本发明涉及用于肿瘤诊断，更具体是用于诊断结肠直肠腺瘤和腺癌的方法。本发明进一步提供了用于进行这些方法的标记基因、探针和阵列。
背景技术：
：胃肠道的结肠直肠部分的癌症是一种常见病症。在第一阶段，发生良性肿瘤(腺瘤)，其可以转变为恶性癌症(腺癌)。不是所有的腺瘤都进展为腺癌。实际上，这种向腺癌的进展仅仅发生在小的肿瘤亚群中。基因组不稳定性的起始是关键步骤，并且在结肠直肠癌中以两种方式发生(Lengaueretal.(1998)Nature,396，643-649)。已经最广泛研究了导致微卫星不稳定性(縮写为MIS或MIN)的DNA错配修复缺陷(diPietroetal.(2005)Gastroenterology,129，1047-1059)，但仅仅解释了约15%的腺瘤进展为腺癌。在结肠直肠腺瘤进展为腺癌的其他85%的情况下，基因组不稳定在染色体水平(CIN)发生，产生非整倍性。尽管在长时间中，这些染色体异常被认为是继发于癌症发展的随机噪音，已经充分确立了这些DNA拷贝数改变以特定模式发生，并且与不同的临床行为相关(Hermsenetal.(2002).Gastroenterology123,1109-1119)。在结肠直肠癌中经常报道的染色体异常是7pq，8q，13q，20q获得和4pq，5q，8p，15q，17p，18q缺失。已经显示了8q，13q和20q获得以及8p，15q，17p和18q缺失与结肠直肠腺瘤进展为腺癌相关(Hermsenetal.(2002)citedabove)。染色体臂20q的获得是在结肠直肠癌中观察到的最常见的获得，在65%以上的情况下改变(Meijeretal.(1998)J.Clin.Pathol.51,901-909)。20q上的获得，特别是20ql2-ql3区上的获得，也通常在其他类型的实体瘤中描述，并且与胃和结肠直肠癌的不良结局相关。临床上最重要的是尽量早期鉴定上述腺瘤向腺癌的进展，使得能够早期治疗癌，同时避免对腺瘤的不必要的手术干预。理想地，腺癌可以在恶性的细胞存在通过经典显微镜分析还不能检测的阶段时就被鉴定出来。不同的研究参照了单个或有限组的基因，与腺癌相比，它们在腺瘤中显示不同的表达水平，大多数情况下与作为基础的染色体不稳定性不相关(Habermannetal.(2007)GenesChromosomesCancer.46，10-26，US20040258761)。发明概述本发明基于以下观察结果，S卩，当与结肠直肠腺瘤细胞的基因表达模式相比时，在结肠直肠腺癌细胞中的基因表达模式中存在显著差异，并且这些差异与腺癌中的染色体异常的存在相关。因此，可以根据染色体异常对腺癌分类，并且已经鉴定了这些染色体异常的标记基因。在本分析中调查的大量样品得到了用于所有存在的染色体异常的一个标记基因隹A朱no因此，本发明涉及用于癌症诊断的方法和工具，更特别是用于区分结肠和/或直肠中的腺瘤和癌的方法和工具。更具体地，本发明涉及检测腺瘤向腺癌的进展。本发明的方法的优点是它们允许在非常早的阶段，即在能够通过回波描记术、放射照相术或MRI(核磁共振成像)检测到腺癌细胞的存在之前，就能够检测到腺癌细胞的存在。本发明基于以下发现，S卩，结肠直肠腺瘤进展为腺癌，通常是由腺瘤细胞中的染色体获得或缺失的出现而导致的。因此，本发明提供了通过间接分析方法检测染色体获得或缺失而检测腺癌的方法和工具。根据本发明，与从结肠直肠腺瘤进展为腺癌相关的染色体获得或缺失是通过检测染色体获得或缺失的标记基因的改变的表达水平而间接检测的。可以将表达与染色体获得或缺失相关的标记基因分为两类。第一类基因是位于获得或缺失的染色体区域中的那些基因。尽管位于缺失的染色体区域中的基因将不被表达，但细胞中的调节机制可以上调其他完整染色体上的相应基因的表达。与可以预期的相反，并不是位于染色体获得区域上的所有基因都超量表达。因此，仅仅了解染色体获得或缺失区域内的基因的位置还不足以预测基因的表达是否受影响，并且如果受影响，还不足以预测是如何受影响的。第二类基因是这样的基因，即自身不位于染色体获得或缺失的区域中，但其表达受到位于染色体异常上的一个或多个基因的影响。本发明提供了标记基因的组合，其允许可靠检测样品中腺癌细胞的存在。—方面，本发明公开了标记基因，其以前没有被鉴定为结肠直肠腺瘤细胞进展为癌细胞的标记基因(表17)。因此，本发明提供了用于检测患者中结肠直肠腺癌细胞的存在的体外方法，该方法包括以下步骤(a)在该患者的受试样品中检测一种或多种标记基因的表达水平，所述标记基因选自表17中所列的组，和(b)比较用于步骤(a)中的这一种或多种标记基因的表达水平与对照的表达水平。与对照样品相比，受试样品中标记基因表达水平的升高或降低，表明患者中结肠直肠腺癌细胞的存在。根据一个特定的实施方案，本发明的方法包括检测选自表17中所列的组的一种或多种标记基因的表达水平，其中标记基因是以下这样的基因与腺瘤细胞相比，其表达在腺癌细胞中上调。另一方面，本发明提供了广泛的标记基因列表，使得可以用有代表性的数目的标记基因可靠地确定结肠直肠腺瘤细胞进展为腺癌细胞(表1)。因此，本发明提供了用于检测患者中结肠直肠腺癌细胞的存在的体外方法，该方法包括以下步骤(a)在所述患者的受试样品中检测至少12种标记基因的表达水平，所述标记基因选自表l所列的组，和(b)比较用于步骤a)中的标记基因的表达水平与对照样品的表达水平。与对照样品相比，受试样品中这些标记基因表达水平的升高或降低，表明患者中结肠直肠腺癌细胞的存在。另一方面，本发明公开了标记基因，其表达水平与结肠直肠腺瘤细胞中特定类型的染色体异常的存在相关(表2-9)。因此，本发明提供了基于标记基因的检测而检测患者中结肠直肠腺癌细胞的存在的体外方法，所述标记基因的表达与染色体异常的存在相关。更具体地，本发明这方面的方法包括以下步骤(a)在该患者的受试样品中检测一种或多种标记基因的表达水平，所述标记基因的表达在存在染色体异常时改变，和(b)比较用于步骤(a)中的一种或多种标记基因的表达水平与对照样品的表达水平。与对照样品相比，受试样品中所述一种或多种标记基因表达水平的升高或降低，表明患者中腺癌细胞的存在。在本发明这方面的特定实施方案中，所述一种或多种标记基因包括-选自表2中描述的标记基因的两种或更多种标记基因，其表达水平由于染色体-种或多种标记基因，其表达水平由于染色体Sq8p上的染色体缺失而改变，和/或，_选自表3中描述的标记基因的上的染色体获得而改变，和/或，_选自表4中描述的标记基因的3种或更多种标记基因，其表达水平由于染色体13q上的染色体获得而改变，和/或，_选自表5中描述的标记基因的一种或多种标记基因，其表达水平由于染色体15q上的染色体缺失而改变，和/或，_选自表6中描述的标记基因的一种或多种标记基因，其表达水平由于染色体17p上的染色体缺失而改变，和/或，_选自表7中描述的标记基因的3种或更多种标记基因，其表达水平由于染色体18q上的染色体缺失而改变，和/或，_选自表8中描述的标记基因的9种或更多种标记基因，其表达水平由于染色体20q上的染色体获得而改变，和/或，_选自表9中描述的标记基因的两种或更多种标记基因，其表达水平由于染色体20q上的染色体获得而改变。另一方面，本发明公开了代表与结肠直肠腺癌相关的不同染色体异常的标记基因集合。已知这些异常发生在所有存在的结肠直肠腺癌的至少85%中，由此代表了用于检测腺癌的可靠的筛选测定。因此，本发明提供了检测患者中结肠直肠腺癌细胞的存在的体外方法，该方法包括以下步骤(a)在该患者的受试样品中检测多种标记基因的表达水平，所述标记基因代表与结肠直肠腺癌相关的染色体异常的存在，和(b)比较用于步骤a)中的多种标记基因的表达水平与对照样品的表达水平。与对照样品相比，受试样品中所述多种标记基因的表达水平的升高或降低，表明患者中腺癌细胞的存在。更具体地，所述多种标记基因包括-选自表2中描述的标记基因的至少一种标记基因，其表达水平受到染色体8p上的染色体缺失的影响，禾口-选自表3中描述的标记基因的至少的染色体获得而改变，禾口_选自表4中描述的标记基因的至少-的染色体获得而改变，禾口_选自表5中描述的标记基因的至少-的染色体缺失而改变，禾口_选自表6中描述的标记基因的至少-的染色体缺失而改变，禾口_选自表7中描述的标记基因的至少-的染色体缺失而改变，禾口_选自表8或表9中描述的标记基因的至少一种标记基因，其表达水平由于染色体20q上的染色体获得而改变。另一方面，本发明公开了标记基因，其表达水平在结肠直肠腺瘤中存在特定类型的染色体异常时改变，并且其位于该染色体异常内(表10-16)。4中标记基因，其表达水平由于染色体8q上-种标记基因，其表达水平由于染色体13q上-种标记基因，其表达水平由于染色体15q上-种标记基因，其表达水平由于染色体17p上-种标记基因，其表达水平由于染色体18q上因此，本发明提供了检测患者中结肠直肠腺癌细胞的存在的体外方法，该方法包括以下步骤(a)在该患者的受试样品中检测多种标记基因的表达水平，所述标记基因代表与结肠直肠腺癌相关的染色体异常的存在，和(b)比较用于步骤a)中的多种标记基因的表达水平与对照样品的表达水平。与对照样品相比，受试样品中所述多种标记基因表达水平的升高或降低，表明患者中腺癌细胞的存在。更具体地，所述多种标记基因包括-选自表10中描述的标记基因的至少-标记基因，禾口-选自表11中描述的标记基因的至少-,禾口-选自表12中描述的标记基因的至少-t示记基因，-t示记基因，-t示记基因，-t示记基因，-t示记基因，-和选自表13中描述的标记基因的至少和选自表14中描述的标记基因的至少和选自表15中描述的标记基因的至少和选自表16中描述的标记基因的至少-种位于染色体8p上的染色体缺失区中的-种位于染色体8q上的染色体获得区中的4中位于染色体13q上的染色体获得区中的4中位于染色体15q上的染色体缺失区中的4中位于染色体17p上的染色体缺失区中的4中位于染色体18q上的染色体缺失区中的^种位于染色体20q上的染色体获得区中的t示记基因。在本发明的上述方法的特定实施方案中，选择使用的标记基因，使得-表达水平由于染色体8p上的染色体缺失而改变或位于染色体8p上的染色体缺失区中的所述一种或多种标记基因选自表10中描述的NM_020749、NM_004315、NM_003747、NM_016353、NM_152415、NM_006197、NM_000662、NM_000015、D31887、NM_017884、NM_004462、NM_006765、NM_001715、NM_012331、NM_139167、NM_013354和NM_005144组成的一组标记基因，和/或-表达水平由于染色体8q上的染色体获得而改变或位于染色体8q上的染色体获得区中的所述一种或多种标记基因选自表11中描述的NM_138455、NM_032611、NM_032862、AL713790、BC030520、NM_024035、NM_017767、NM_002346、AF289596、NM_012162和AB051475组成的一组标记基因，和/或-表达水平由于染色体13q上的染色体获得而改变或位于染色体13q上的染色体获得区中的所述一种或多种标记基因选自表12中描述的NM_145293、NM_005358、U50531、NM_012158、NM_017817、NM_003899、NM_003903、NM_018386、BC008975、NM_023011、NM_001260、NM_006646、U50524、NM_033111、NM_024808、NM_014832、NM_006002、NM_015057、NM_024546、BC026126、NM_006493、NM_018210和NM_017664组成的一组标记基因，和/或-表达水平由于染色体15q上的染色体缺失而改变或位于染色体15q上的染色体缺失区中的所述一种或多种标记基因选自表13中描述的NM_030574、NM_004255、NM_002573、AB033025、NM_033240、NM_000126、NM_015079、NM_015969和NM_016073组成的一组标记基因，和/或-表达水平由于染色体17p上的染色体缺失而改变或位于染色体17p上的染色体缺失区中的所述一种或多种标记基因选自表14中描述的NM_130766、NM_015721和NM_031430组成的一组标记基因，和/或-表达水平由于染色体18q上的染色体缺失而改变或位于染色体18q上的染色体缺失区中的所述一种或多种标记基因选自表15中描述的NM_004715、NM_006701和NM_014913组成的一组标记基因，和/或-表达水平由于染色体20q上的染色体获得而改变或位于染色体20q上的染色体获得区中的所述一种或多种标记基因选自表16中描述的NM_016397、NM_018270、NM_006602、NM_080476、NM_017896、NM_006097、NM_021809、NM_018840、NM_003600、NM_017495、NM_007002、NM_016354、NM_014071、NM_002212、NM_003185、NM_152255、NM_022082、NM_018244、NM_014902、NM_032013、NM_020182、NM_006886、NM_020673、BC003122、NM_012325、NM_014183、NM_021100、NM_004738、NM_016045、NM_014054、NM_022105、NM_015666、NM_032527、BC025345、NM_033405、NM_006892、NM_005225、NM_000687、BC035639、NM_018677、NM_006047、NM_016436、NM_015511、NM_016082、NM_007238、NM_003908、NM_003610、NM_153360、NM_080425、NM_000114、NM_001853、NM_144498、NM_017798和NM_012384组成的一组标记基因，更特别选自。权利要求3或4的方法，其中表达水平由于染色体20q上的染色体获得而改变的标记基因选自表16中描述的NM_016397、NM_018270、NM_006602、NM_080476、NM_017896、NM_006097、NM_021809、NM_018840、NM_003600、NM_017495、NM_007002、NM_016354、NM_014071、NM_002212、NM_003185、NM_152255、NM_022082、NM_018244、NM_014902、NM_032013、NM_020182、NM_006886、NM_020673、BC003122、NM_012325、NM_014183、NM_021100、NM_004738、NM_016045、NM_014054、NM_022105、NM_015666、NM_032527、BC025345和NM_033405组成的一组标记基因。本发明进一步公开了一个标记基因集合，其表达水平的差异与3种、4种或甚至5种不同的染色体异常相关(表18)。因此，本发明提供了用于检测患者中结肠直肠腺癌细胞的存在的体外方法，该方法包括以下步骤(a)在所述患者的受试样品中检测选自表18中描述的标记基因的一种或多种标记基因的表达水平，和(b)比较用于步骤(a)中的这些标记基因的表达水平与对照样品的表达水平。与对照样品相比，受试样品中这一种或多种标记基因的表达水平的升高或降低，表明患者中腺癌细胞的存在。上文描述的本发明的方法的特定实施方案涉及这样的方法，S卩，其中基于标记基因的P值或FDR值进一步选择标记基因。更特别地，如表1-9指出的，标记基因具有小于0.05，更特别是小于0.01的p或FDR值。上文描述的本发明的方法的进一步特定实施方案涉及这样的方法，即，基于腺癌和腺瘤细胞之间的表达差异的大小，进一步选择标记基因。更特别地，选择这样的标记基因，即根据表2-9，表示为表达水平的差异为至少'2'，更特别为至少'4'。典型地，在本发明的体外方法中，受试样品是包含或怀疑包含结肠直肠病变的细胞的样品。在一个实施方案中，受试样品是来自结肠直肠病变的活检或切除术的样品。或者，受试样品选自尿、血液、唾液、汗液和粪便的样品。在本发明方法的特定实施方案中，对照样品是包含结肠直肠腺瘤细胞(而不是结肠直肠癌细胞)的患者的相同组织的样品。在一个替代实施方案中，对照样品是腺瘤标准物。在一个特别优选的实施方案中，本发明涉及用于检测患者中结肠直肠腺癌细胞的存在的体外方法，该方法包括以下步骤a)在所述患者的受试样品中检测至少表8、9或16的标记基因NM_017495和NM_006602的表达水平，禾口b)比较用于步骤a)中的所述标记基因的表达水平与对照样品的表达水平，其中与所述对照样品相比，所述受试样品中所述至少两种标记基因表达水平的升高，表明所述患者中结肠直肠腺癌细胞的存在。本发明的这种优选方面的进一步的阐述涉及权利要求1的体外方法，包括以下步骤a)在所述患者的受试样品中检测至少表8、9或16的标记基因NM_017495、NM_006602、NM_018840、NM_003600、NM_018270、NM_007002和NM_016397的表达水平，和b)比较用于步骤a)中的所述标记基因的表达水平与对照样品的表达水平，其中与所述对照样品相比，所述受试样品中所述至少7种标记基因表达水平的升高，表明所述患者中结肠直肠腺癌细胞的存在。所述方法使得能够在检查的至少85%，优选至少88%的病例中正确分类和区分腺瘤与腺癌。在本发明的体外方法的特定实施方案中，在DNA或RNA水平确定表达水平。替代实施方案包括在蛋白水平确定标记基因表达。本发明的方法特别适于诊断结肠直肠腺瘤进展为结肠直肠腺癌。本发明的另一方面提供了用于检测结肠直肠腺癌细胞的试剂盒，其中包含用于特异性检测标记基因的试剂，所述标记基因的表达表明腺癌细胞的存在。所述试剂任选用标记物官能化，所述标记物例如选自下组的标记物放射性标记物、磁性标记物、MRI造影标记物、发色标记物和超声标记物。在一个特定实施方案中，试剂盒包含用于特异性检测表1中描述的标记基因中的至少12种标记基因的表达的试剂。或者，提供了用于检测结肠直肠腺癌细胞的试剂盒，其中包含用于特异性检测表17中描述的标记基因中的至少一种标记基因的表达的试剂。本发明的特定实施方案涉及用于检测结肠直肠腺癌细胞的试剂盒，其中包含用于特异性检测一种或多种标记基因的表达的试剂，所述试剂盒包含-用于特异性检测选自表2中描述的标记基因的3种或更多种标记基因的试剂，和/或，_用于特异性检测选自表3中描述的标记基因的一种或多种标记基因的试剂，和/或，-用于特异性检测选自表4中描述的标记基因的两种或更多种标记基因的试剂，和/或，-用于特异性检测选自表5中描述的标记基因的一种或多种标记基因的试剂，和/或，-用于特异性检测选自表e中描述的标记基因的一种或多种标记基因的试剂，和/或，-用于特异性检测选自表7中描述的标记基因的3种或更多种标记基因的试剂，和/或，-用于特异性检测选自表8中描述的标记基因的7种或更多种标记基因的试剂，和/或，_用于特异性检测选自表9中描述的标记基因的7种或更多种标记基因的试剂。本发明的试剂盒的进一步的实施方案涉及用于检测结肠直肠腺癌细胞的试剂盒，其中包含用于特异性检测下组中每一组中至少一种标记基因的表达的试剂的集合表2中描述的标记基因、表3中描述的标记基因、表4中描述的标记基因、表5中描述的标记基因、表6中描述的标记基因、表7中描述的标记基因、表8中描述的标记基因和表9中描述的标记基因。上文描述的本发明的试剂盒的其他特定实施方案提供了用于特异性检测标记基因的试剂，其中根据表1-9，所述标记基因具有小于0.05，更特别是小于0.01的p或FDR值。上文描述的本发明的试剂盒的其他特定实施方案提供了用于特异性检测标记基因的试剂，其中根据表2-9或17，所述标记基因在腺瘤和腺癌细胞之间的表达水平差异是至少'2'，更特别是至少'4'。在本文描述的试剂盒的其他特定实施方案中，所述试剂是寡核苷酸或抗体。寡核苷酸任选排列在支持物上。本文描述的试剂盒的其他特定实施方案涉及包含抗体的试剂盒，其中所述抗体结合于标记基因编码的蛋白。在一个特定实施方案中，抗体结合于标记基因编码的蛋白，从而所述蛋白是分泌的蛋白或细胞表面上的蛋白。本发明的另一方面涉及用于检测患者的结肠直肠组织中的腺癌细胞的体内方法。更具体地，本发明提供了用于检测结肠直肠病变中的腺癌细胞的体内方法，所述方法包括以下步骤使结肠直肠病变与标记的试剂接触，所述试剂能够与选自表17中描述的基因的标记基因表达的蛋白特异性结合或相互作用，和(b)检测该试剂与所述结肠直肠病变的结合或相互作用。检测到结肠直肠病变的病灶内所述试剂的结合或相互作用的差异，表明病变中腺癌细胞的存在。在特定实施方案中，用于本发明的体内方法中的标记基因是编码位于细胞膜上的蛋白、分泌的蛋白或酶的基因。因此，本发明提供了与表17或18中描述的标记基因特异性结合或相互作用的试剂，用作检测结肠直肠腺瘤组织中腺癌细胞的存在的体内诊断剂。因此，本发明也涉及与表17或18中描述的标记基因特异性结合或相互作用的试剂在制备诊断剂中的用途，所述诊断剂用于检测结肠直肠肿瘤组织中腺癌细胞的存在。从下文的详细描述，可以明确本发明的上述和其他特征、特性和优点。这种描述仅仅是出于举例的目的，而不限制本发明的范围。发明详述将参照特定实施方案并参照某些附图描述本发明，但本发明不限于此，而仅仅由权利要求限定。权利要求中的任何参照标记不应该解释为限制范围。描述的附图仅仅是示意性的，不是限制性的。在附图中，出于示意的目的，可以扩大某些元素的大小，并不是按比例尺绘制的。当术语"包含"用于本说明书和权利要求中时，它并不排除其他元素或步骤。当使用不确定或确定物体时在提到单数名词如"一个"或"一种"、"该"时，这包括该名词的复数，除非特别指出了其他含义。此外，说明书和权利要求中的术语"第一、第二和第三"等是用于区分相似元素，不一定是描述顺序或年代次序。要理解的是，如此使用的术语在合适的环境下是可互换的，并且本文描述的发明的实施方案能够以本文描述或说明的顺序之外的顺序操作。提供以下术语或定义，仅仅是为了帮助理解本发明。这些定义不应该解释为具有小于本领域普通技术人员理解的范围。定义本文用到的术语"肿瘤"或"赘生物"是指通过比正常情况更迅速的细胞增殖而生长，并且在起始新的生长的剌激停止后继续生长的异常组织。术语"病变"通常是指由于任何疾病或任何损伤导致的累及任何组织或器官的异常，其在本文中也用于表示赘生物。肿瘤、赘生物或病变可以是良性或恶性的。"癌症"是表示任何类型的恶性赘生物的常用术语。本文用到的"腺瘤"(或未进展的腺瘤)涉及良性上皮赘生物。腺瘤通常是分界清楚的，它们可以是扁平或息肉样的，并且赘生细胞不浸润或侵入邻近组织。本文用到的"腺癌"是指上皮细胞的恶性赘生物。最常见的癌的形式是腺体或腺体样模式。同义词是"腺癌(glandularcancer)，，禾口"腺癌(glandularcarcinoma)，，。恶性细胞的特征通常在于进行性和不受控制的生长。它们可以局部传播或通过血流和淋巴系统传播到身体的其他部分。"进展的腺瘤"是指具有癌病灶的腺瘤。这也称作"恶性息肉"。结肠直肠腺瘤在老年群体中是常见的，但这些恶性前肿瘤中仅仅一小部分(估计大约5%)进展到恶性肿瘤(即结肠直肠腺癌)。"结肠直肠"是指结肠和/或直肠，即整个大肠。本文用到的"染色体异常"是指染色体缺失或获得，即，染色体中缺失或重复的区域。本文用到的"标记基因"是这样一种基因，S卩，其表达在腺瘤和腺癌细胞之间不同(减少或增加)，并且因此其可以用于区分腺瘤和腺癌细胞。"表达概况"是指细胞或样品中一些标记基因的表达水平。本发明提供了用于区分恶性和良性结肠直肠病变和用于诊断受试者中结肠直肠癌的存在的诊断方法和工具。本发明的诊断方法使得能够可靠检测非常早期的结肠直肠癌。本发明的一方面涉及用于检测患者中结肠直肠腺癌细胞的存在的体外方法，该方法包括在所述患者的受试样品中检测一种或多种标记基因的表达水平。将标记基因的表达水平与对照样品的表达水平进行比较，其中与对照样品中的表达水平相比，受试样品中标记基因表达水平的差异，表明患者中结肠直肠腺癌细胞的存在。—般地，用于本发明的方法中的标记基因在腺瘤和癌细胞之间是差异表达的。可以基于差异的大小，即，腺癌样品中发生的标记基因上调或下调的程度(如2倍、4倍或8倍，或甚至更多)进行进一步的选择。表达水平在表中的"作用"标题下表示为1og-2值。因此，等于1的值表示与腺瘤相比，腺癌中的基因表达高2倍，等于2的指是指高4倍的表达，等于3的值是指高8倍的表达，等等。类似地，等于-1的值表示与腺瘤相比，腺癌中的基因表达低2倍，等于-2的指是指低4倍的表达，等于-3的值是指低8倍的表达，等等。或者，也可以基于腺瘤和癌细胞中标记基因的差异表达的统计学显著性的计算(用p-值或FDR(假发现率)值)而进行标记基因的进一步选择。在特定实施方案中，采用这两种选择标准。在本发明的一个实施方案中，通过确定一种或多种标记基因的表达而鉴定患者中腺癌细胞的存在，其中在比较腺瘤和腺癌细胞时，所述标记基因的表达改变(增加或减少)超过2倍、4倍或8倍，和/或所述标记基因在腺瘤或腺癌细胞的标记基因表达和存在之间的关联的P-值小于0.01(是统计学显著的)。可以通过任何临床上可接受的方式采集用于本发明的体外方法中的检测的样品，但是采集的方式使得保留核酸(特别是RNA)或蛋白。根据本发明分析的样品通常是结肠直肠活检物或切除物。来自肿瘤组织的完整细胞或裂解的细胞也可以在不干预的情况下从结肠分离，并且将终止于粪便中。因此，粪便样品也认为是用于分离RNA的合适来源。此外，结肠直肠腺癌细胞可以迁移到其他组织中。因此，也可以使用血液和其他类型的样品。由于目的在于尽早检测结肠直肠腺瘤进展为腺癌，活检物或切除物可能含有大量腺瘤细胞和仅仅少量腺癌细胞。为了增加信号/背景比，可以将切除物在分析之前分为不同的子样品。即使活检物或切除物中的癌细胞总数是有限的，可以预期，至少子样品之一中将含有升高的腺癌与腺瘤细胞的比例。在本发明的体外方法中，在患者的样品中在RNA或蛋白水平确定一种或多种标记基因的表达，并且与对照样品中这些基因的表达进行比较。对照样品可以是来自相同患者的腺瘤样品。或者，对照样品是获自其他个体或获自来自一个或多个其他个体的结肠直肠腺瘤的合并样品的腺瘤样品。也可以通过合并核酸或蛋白的集合而模拟结肠直肠腺瘤组织的RNA/蛋白含量，从而人工制备对照。在第一个实施方案中，特征在于与对照如结肠直肠腺瘤细胞相比，在结肠直肠腺癌细胞中上调或下调的标记基因选自表1。尽管表1列出的任何标记基因都适用于本发明的用于鉴定样品中结肠直肠腺癌细胞的存在的方法中，本发明的一个重要的优点是提供了合适标记物的广泛列表，从而使得检测的可靠性增加。因此，本发明的特定实施方案涉及使用表1的标记基因中的至少2种、至少5种、至少10、12或15种、至少20种、至少50种、至少100种、至少200种、至少500种或全部。在一个特定实施方案中，使用表1的标记基因的一个子集，即表1中P值小于0.01的标记基因。在另一实施方案中，特征在于与对照如结肠直肠腺瘤细胞相比，在结肠直肠腺癌细胞中上调或下调的标记基因选自表1。表17的标记基因以前都没有被鉴定为结肠直肠腺癌的标记基因，并且表17的每种标记基因都适用于本发明的用于鉴定样品中结肠直肠腺癌细胞的存在的方法中。在特定实施方案中，在患者样品中确定表17鉴定的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或更多种基因的表达，并且与对照进行比较，以鉴定患者中腺癌细胞的存在。根据本发明方法的另外的实施方案，使用表1的标记基因的子集，其表达水平与结肠直肠肿瘤细胞中的特定染色体异常直接相关。在一个实施方案中，本发明提供了一个标记基因集合，当结肠直肠腺瘤细胞中染色体8p上发生染色体缺失时，所述标记基因的表达水平改变。这些标记基因列于表2。因此表2中列出的任何标记基因都可以用于本发明的用于鉴定结肠直肠腺癌细胞的方法和工具中。在本发明的方法和工具中，使用表2的标记基因中的至少1种、至少2种、至少3种、至少5种、至少10种、至少20种、至少50种、至少100种、至少200种或全部。额外或替代地，用于本发明的方法中的标记基因选自表2的子集，即表2中FDR(假发现率)值小于0.05或更特别小于0.01的那些标记基因。额外或替代地，用于本发明的方法中的标记基因选自表2的子集，所述子集相应于与腺癌细胞相比，在腺癌细胞中的表达水平增加的那些标记基因。额外或替代地，用于本发明的方法中的标记基因选自表2的子集，所述子集相应于在腺瘤和腺癌细胞中的表达水平相差至少因数2、至少因数4或至少因数8的那些标记基因。同样，可以建立标记基因的子集，所述标记基因在腺瘤和腺癌之间的表达水平的差异(增加或减少)至少是因数2、4或8，并且其FDR值小于0.05或小于O.Ol。在另一实施方案中，本发明提供了一个标记基因集合，当结肠直肠腺瘤细胞中染色体8q上发生染色体获得时，所述标记基因的表达水平改变。这些标记基因列于表3。因此表3中列出的任何标记基因都可以用于本发明的用于鉴定结肠直肠腺癌细胞的方法和工具中。在本发明的方法和工具中，使用表3的标记基因中的至少l种、至少2种、至少3种、至少5种、至少10种、至少20种或全部。额外或替代地，用于本发明的方法中的标记基因选自表3的子集，即表3中FDR(假发现率)值小于0.05或更特别小于0.01的那些标记基因。额外或替代地，用于本发明的方法中的标记基因选自表3的子集，所述子集相应于与腺癌细胞相比，在腺癌细胞中的表达水平增加的那些标记基因。额外或替代地，用于本发明的方法中的标记基因选自表3的子集，所述子集相应于在腺瘤和腺癌细胞中的表达水平相差至少因数2、至少因数4或至少因数8的那些标记基因。同样，可以从表3建立标记基因的子集，所述标记基因在腺瘤和腺癌之间的表达水平的差异(增加或减少)至少是因数2、4或8，并且其FDR值小于0.05或小于0.01。在另一实施方案中，本发明提供了一个标记基因集合，当结肠直肠腺瘤细胞中染色体13q上发生染色体获得时，所述标记基因的表达水平改变。这些标记基因列于表4。因此表4中列出的任何标记基因都可以用于本发明的用于鉴定结肠直肠腺癌细胞的方法和工具中。在本发明的方法和工具的一个实施方案中，使用表4的标记基因中的至少l种、至少2种、至少3种、至少5种、至少10种、至少20种、至少50种、至少100种或全部。额外或替代地，用于本发明的方法中的标记基因选自表4的子集，即表4中FDR(假发现率)值小于0.05或更特别小于0.01的那些标记基因。额外或替代地，用于本发明的方法中的标记基因选自表4的子集，所述子集相应于与腺癌细胞相比，在腺癌细胞中的表达水平增加的那些标记基因。额外或替代地，用于本发明的方法中的标记基因选自表4的子集，所述子集相应于在腺瘤和腺癌细胞中的表达水平相差至少因数2、至少因数4或至少因数8的那些标记基因。同样，可以从表4建立标记基因的子集，所述标记基因在腺瘤和腺癌之间的表达水平的差异(增加或减少)至少是因数2、4或8，并且其FDR值小于0.05或小于0.01。在另一实施方案中，本发明提供了一个标记基因集合，当结肠直肠腺瘤细胞中染色体15q上发生染色体缺失时，所述标记基因的表达水平改变。这些标记基因列于表5。因此表5中列出的任何标记基因都可以用于本发明的用于鉴定结肠直肠腺癌细胞的方法和工具中。在本发明的方法和工具的特定实施方案中，使用表5的标记基因中的至少l种、至少2种、至少3种、至少5种、至少10种、至少20种、至少30种或全部。额外或替代地，用于本发明的方法中的标记基因选自表5的子集，即表5中FDR(假发现率)值小于O.05或更特别小于O.Ol的那些标记基因。额外或替代地，用于本发明的方法中的标记基因选自表5的子集，所述子集相应于与腺瘤细胞相比，在腺癌细胞中的表达水平增加的那些标记基因。额外或替代地，用于本发明的方法中的标记基因选自表5的子集，所述子集相应于在腺瘤和腺癌细胞中的表达水平相差至少因数2、至少因数4或至少因数8的那些标记基因。同样，可以从表5建立标记基因的子集，所述标记基因在腺瘤和腺癌之间的表达水平的差异(增加或减少)至少是因数2、4或8，并且其FDR值小于0.05或小于0.01。在另一实施方案中，本发明提供了一个标记基因集合，当结肠直肠腺瘤细胞中染色体17p上发生染色体缺失时，所述标记基因的表达水平改变。这些标记基因列于表6。因此表6中列出的任何标记基因都可以用于本发明的用于鉴定结肠直肠腺癌细胞的方法和工具中。在本发明的方法和工具的特定实施方案中，使用表6的标记基因中的至少l种、至少2种、至少3种、至少4种、至少6种或全部。额外或替代地，用于本发明的方法中的标记基因选自表6的子集，即表6中FDR(假发现率)值小于0.1的那些标记基因。额外或替代地，用于本发明的方法中的标记基因选自表6的子集，所述子集相应于与腺瘤细胞相比，在腺癌细胞中的表达水平增加的那些标记基因。额外或替代地，用于本发明的方法中的标记基因选自表6的子集，所述子集相应于在腺瘤和腺癌细胞中的表达水平相差至少因数2、至少因数4或至少因数8的那些标记基因。同样，可以从表6建立标记基因的子集，所述标记基因在腺瘤和腺癌之间的表达水平的差异(增加或减少)至少是因数2、4或8，并且其FDR值小于O.1。在另一实施方案中，本发明提供了一个标记基因集合，当结肠直肠腺瘤细胞中染色体18q上发生染色体缺失时，所述标记基因的表达水平改变。这些标记基因列于表7。因此表7中列出的任何标记基因都可以用于本发明的用于鉴定结肠直肠腺癌细胞的方法和工具中。在本发明的方法和工具的特定实施方案中，使用表7的标记基因中的至少l种、至少2种、至少3种、至少5种、至少10种、至少20种、至少50种、至少100种、至少200种或全部。额外或替代地，用于本发明的方法中的标记基因选自表7的子集，即表7中FDR(假发现率)值小于0.05或更特别小于0.01的那些标记基因。额外或替代地，用于本发明的方法中的标记基因选自表7的子集，所述子集相应于与腺瘤细胞相比，在腺癌细胞中的表达水平增加的那些标记基因。额外或替代地，用于本发明的方法中的标记基因选自表7的子集，所述子集相应于在腺瘤和腺癌细胞中的表达水平相差至少因数2、至少因数4或至少因数8的那些标记基因。同样，可以从表7建立标记基因的子集，所述标记基因在腺瘤和腺癌之间的表达水平的差异(增加或减少)至少是因数2、4或8，并且其FDR值小于0.05或小于0.01。在另一实施方案中，本发明提供了一个标记基因集合，当结肠直肠腺瘤细胞中染色体20q上发生染色体获得时，所述标记基因的表达水平改变。这些标记基因列于表8和9，其中表8的数据来自单变量分析，表9的数据来自多变量分析。因此表8或9中列出的任何标记基因都可以用于本发明的用于鉴定结肠直肠腺癌细胞的方法和工具中。在本发明的方法和工具的特定实施方案中，使用表8或9的标记基因中的至少1种、至少2种、至少4种、至少6种、至少8种、至少10种、至少15种、至少20种、至少25种、至少50种、至少100种、至少200种、至少400种、至少600种或全部。额外或替代地，使用的标记基因选自表8或9的子集，即表8或9中FDR值小于0.05或更特别小于0.01的那些标记基因。额外或替代地，用于本发明的方法中的标记基因选自表8或9的子集，所述子集相应于与腺瘤细胞相比，在腺癌细胞中的表达水平增加的那些标记基因。额外或替代地，标记基因选自表8或9的子集，所述子集相应于在腺瘤和腺癌细胞中的表达水平相差至少因数2、至少因数4或至少因数8的那些标记基因。同样，可以从表8或9建立标记基因的子集，其中所述标记基因在腺瘤和腺癌之间的表达水平的差异(增加或减少)至少是因数2、4或8，并且其FDR值小于O.05或小于O.01。在一个特别优选的实施方案中，本发明涉及用于检测患者中结肠直肠腺癌细胞的存在的体外方法，该方法包括以下步骤a)在所述患者的受试样品中至少检测表8、9或16的标记基因NM_017495和NM_006602的表达水平，禾口b)比较用于步骤a)中的所述标记基因的表达水平与对照样品的表达水平，其中与所述对照样品相比，所述受试样品中所述至少两种标记基因表达水平的升高，表明所述患者中结肠直肠腺癌细胞的存在。本发明的这种优选方面的进一步的细节涉及权利要求1的体外方法，包括以下步骤a)在所述患者的受试样品中至少检测表8、9或16的标记基因NM_017495、NM_006602、NM_018840、NM_003600、NM_018270、NM_007002和NM_016397的表达水平，和b)比较用于步骤a)中的所述标记基因的表达水平与对照样品的表达水平，其中与所述对照样品相比，所述受试样品中所述至少7种标记基因表达水平的升高，表明所述患者中结肠直肠腺癌细胞的存在。在超过50%或甚至超过60%的病例中可以在结肠直肠腺瘤细胞中观察到染色体臂20q的获得。对于所述染色体臂20q的获得，发现与腺瘤相比，上述表8、9或16的标记基因NM_017495、NM_006602、NM_018840、NM_003600、NM_018270、NM_007002和NM_016397在腺癌中超量表达，使得能够在至少85%，优选至少88%检查的病例中区分腺瘤与腺癌。上述列于表2-9中的标记基因集合包括与特定类型的染色体异常相关的标记基因。但是，也可能某些基因受到不同染色体异常的上调。因此，表2-9显示了某种程度的冗余。在表2-9中出现1次以上的标记基因特别适用于本发明的方法中，因为它们是"一种"染色体异常的存在的更普遍的特征。表达水平由3、4或5种不同的染色体异常而改变的标记基因列于表18。因此，本发明的方法的特定实施方案涉及使用表18的标记基因中的至少1种、至少2种、至少4种、至少6种、至少8种、至少10种、至少15种、至少20种、至少25种、至少50种、至少100种、至少200种、至少400种、至少600种或全部，用于鉴定患者中的结肠直肠腺癌细胞。额外地或替代地，用于本发明的方法中的标记基因选自表18的子集，其相应于与腺瘤细胞相比，表达水平在腺癌细胞中升高的那些标记基因。本发明不仅提供了在结肠直肠腺瘤和腺癌细胞之间差异表达的标记基因，也进一步将这种差异表达与染色体异常的存在进行关联。这使得能够用代表每种染色体异常的标记基因集合来开发诊断工具。因此，进一步的特定实施方案涉及标记基因集合，其包括表明每种染色体异常的标记基因。更特别地，所述标记基因集合包括-至少1种、至少2种、至少5种、至少10种或更多种选自表2的标记基因(与8p缺失相关的标记基因)和-至少1种、至少2种、至少5种、至少10种或更多种选自表2的标记基因(与8q获得相关的标记基因)和_至少1种、至少2种、至少5种、至少10种或更多种选自表4的标记基因(与13q获得相关的标记基因)和_至少l种、至少2种、至少5种、至少10种或更多种选自表5的标记基因(与15q缺失相关的标记基因)和-至少1种、至少2种、至少5种、10种或更多种选自表6的标记基因(与17p缺失相关的标记基因)和_至少l种、至少2种、至少5种、至少10种或更多种选自表7的标记基因(与18q缺失相关的标记基因)和_至少1种、至少2种、至少5种、至少10种或更多种选自表8或9的标记基因(与20q获得相关的标记基因)。额外地或替代地，用于本发明的方法中的标记基因选自上文列出的标记基因集合的子集，其相应于与腺瘤细胞相比，表达水平在结肠直肠腺癌细胞中升高的那些标记基因。在本发明的其他实施方案中，用于本发明的方法和工具中的、表明每种染色体异常的标记基因的集合包含位于自身获得或缺失的染色体区内的基因。因此，标记基因的集合包括-表10中列出的与8p上的染色体缺失相关的基因中的至少1种、至少2种、至少5种、至少10种或全部。更特别地，一种或多种标记基因选自NM_020749和NM_004315和/或NM_003747、NM_016353、NM_152415、NM_006197、NM_000662、NM_000015和D31887,和_表11中列出的与8(1上的染色体获得相关的基因中的至少1种、至少2种、至少5种、至少IO种或全部。更特别地，一种或多种基因选自NM_138455、NM_032611、NM_032862，和-表12中列出的与13q上的染色体获得相关的基因中的至少l种、至少2种、至少5种、至少10种或全部，特别是NM_145293和/或NM_005358。更特别地，一种或多种基因选自U50531、NM_012158、NM_017817、NM_003899、NM_003903、NM_018386、BC008975和NM—023011，和_表13中列出的与15(1上的染色体缺失相关的基因中的至少1种、至少2种、至少5种、至少IO种或全部。更特别是NM030574，或一种或多种基因选自NM_004255、NM_002573和AB033025。-表14中列出的与17p上的染色体缺失相关的基因中的至少l种、至少2种、至少5种、至少IO种或全部。更特别地，一种或多种基因选自NM_130766、NM_015721和NM—031430，和-表15中列出的与18q上的染色体缺失相关的基因中的至少l种、至少2种、至少5种、至少10种或全部。更特别地，一种或多种标记基因选自NM_004715、NM_006701和NM—014913，和-表16中列出的与20q上的染色体获得相关的基因中的至少1种、至少2种、至少5种、至少10种、至少25种、至少50种、至少100种或全部。更特别地，一种或多种标记基因选自NM_016397和NM_018270和NM_006602。其他特定的标记基因是NM_080476和NMJ)17896之一或这两者。其他特定的标记基因是选自NM_006097、NM_021809、NM_018840、NM_003600、NM_017495、NM_007002和NM_016354的一种或多种。其他特定的标记基因是选自NM_014071、NM_002212、NM_003185、NM_152255和NM_022082的一种或多种。其他特定的标记基因是选自NM_018244、NM_014902、NM_032013、NM_020182、NM_006886、NM_020673和BC003122的一种或多种。额外地或替代地，用于本发明的方法中的标记基因选自上文列出的基因的子集，其相应于与腺瘤细胞相比，表达水平在结肠直肠腺癌细胞中升高的那些标记基因。—般地，上文描述的标记基因在用于检测患者中结肠直肠腺癌细胞的存在的体外方法中使用，该方法包括以下步骤在该患者的受试样品中检测上文的集合和子集中定义的一种或多种标记基因的表达水平，比较使用的标记基因的表达水平与对照样品(如结肠直肠腺瘤细胞)的表达水平。与对照样品相比，受试样品中使用的标记基因表达水平的升高或降低，表明患者中结肠直肠腺癌细胞的存在。本发明的标记基因用于基于DNA、RNA或蛋白的表达分析中。本发明的标记基因的显著优点是它们适用于客观的定量诊断中。基于现有技术中鉴定的标记的方法是有限的，因为它们依赖于少量包含癌细胞的组织学样品的检查。在一个特定的实施方案中，标记基因用于基于DNA或RNA的表达分析中，所述分析提供了灵敏度提高的优点，这是基于DNA或RNA的诊断学的典型特点。本发明的方法和标记基因使得能够在致癌过程的非常早的阶段区分结肠直肠腺瘤与腺癌细胞。可以通过本领域已知的方法实现患者样品中标记基因表达水平的确定。例如，可以通过以下步骤评估各种标记基因的表达分离获自琼脂糖或聚丙烯酰胺凝胶的核酸分子(如RNA或cDNA)，然后与标记基因特异性寡核苷酸探针杂交。或者，可以通过以下步骤确定表达水平的差异标记获自样品的核酸，然后在测序凝胶上分离。将核酸样品置于凝胶上，使得患者和对照或标准核酸位于相邻泳道上。肉眼或通过密度计的方式实现表达水平的比较。在一个特定实施方案中，通过与DNA阵列(也称作"微阵列"或"DNA芯片")杂交，同时评估用于阵列中的所有标记基因的表达。例如，可以通过〃微阵列生物芯片技术〃(SchenaM.，EatonPublishing,2000)中公开的方法进行基于微阵列的表达概况分析。DNA阵列包含固定的高密度探针，用于检测一些基因。阵列上的探针与标记基因的序列的一个或多个部分互补，或与标记基因的整个编码区互补。在本发明中，任何类型的多核苷酸都可以用作用于DNA阵列的探针。典型地，cDNAs、PCR产物和寡核苷酸都可以用作探针。因此，可以通过单轮分析，同时评估多个基因的表达水平。基于DNA阵列的检测方法通常包括以下步骤1)从样品分离mRNA，任选将mRNA转化为cDNA，随后标记该RNA或cDNA。用于分离RNA、将其转化为cDNA以及用于标记核酸的方法描述于微阵列技术手册中。2)使来自步骤l的核酸与标记基因的探针杂交。可以用染料，如荧光染料Cy3(红色)或Cy5(蓝色)对来自样品的核酸进行标记。通常，对照样品用不同的染料进行标记。3)检测来自样品的核酸与探针的杂交，并且至少定性，更特别是定量确定研究的不同标记基因的样品中mRNA的量。可以基于信号强度的差异，评估样品和对照之间的表达水平的差异。这些可以通过合适的软件测量和分析，例如但不限于例如Affymetrix提供的软件。在一个特定实施方案中，可以例如根据与特定类型的染色体异常相关的标记基因来排列阵列上的探针。或者，可以开发不同的阵列，每个阵列携带用于检测特定类型的染色体异常的探针。对相应于点样在DNA阵列上的标记基因的探针数目没有限制。例如，可以选择本发明的任何标记基因集合中的1%或更多，5%或更多，20%或更多，50%或更多，70%或更多。同样，标记基因可以由与基因的不同部分杂交的两种或多种探针代表。为每种选择的标记基因设计探针。所述探针典型地是包含5-50个核苷酸残基的寡核苷酸。可以通过PCR或化学合成更长的DNAs。用于合成所述寡核苷酸，并且将其用于基质上的方法是微阵列领域公知的。除了标记基因之外的基因也可以点样在DNA阵列上。例如，可以将表达水平不显著改变的基因的探针点样在DNA阵列上，从而使测定结果标准化，或比较多个阵列或不同测定的测定结果。在本发明的方法的特定实施方案中，通过确定代表性的标记基因表达的蛋白量，评估特定标记基因的表达水平。对于蛋白水平的分析，原则上可以使用本发明描述的每种标记基因，但一些蛋白可能较不适用，这是因为诸如有限的溶解度、非常高或小的分子量或极端等电点等因素。例如可以通过以下步骤实现蛋白水平的标记基因表达水平的确定在聚丙烯酰胺凝胶上从样品分离蛋白，然后在蛋白印迹中用抗体鉴定特异性标记基因得到的蛋白。或者，可以通过二维凝胶电泳系统分离蛋白。二维凝胶电泳是本领域公知的，并且典型地包括沿第一维等电聚焦，随后是沿第二维SDS-PAGE电泳。可以通过确定凝胶上蛋白点的强度进行2DSDS-PAGE凝胶的分析，或可以用免疫检测进行。在其他实施方案中，通过质谱分析蛋白样品。用于体外测定中的样品通常是结肠直肠活检物或切除物，更特别是腺瘤样息肉活检物或切除物。对于体外蛋白表达分析，可以使用活检物或切除物的细胞或细胞裂解物。因此，细胞中蛋白的定位或要分析的蛋白的功能对于分析不重要。预期患者中腺癌细胞的存在由腺癌细胞分泌的某些蛋白水平升高或降低的存在而反映。所述蛋白可以存在于身体的血液、尿、汗和其他部分中。同样，腺癌细胞将蛋白释放到结肠腔中。此外，完整的腺癌细胞或它们的裂解的内容物可以释放到肠道中，并且将存在于粪便中，其可以用作体外蛋白分析的来源。但是，与核酸相反，蛋白不能被扩增。因此，预期在特定实施方案中，本发明的方法包括富集步骤，特别是腺癌材料的富集。例如，样品可以与例如用磁性颗粒官能化的腺瘤和腺癌细胞的细胞膜或细胞器的特异性配体接触。通过磁性颗粒浓縮的材料随后可以进行分析，用于检测标记蛋白。在本发明的另一方面，本发明的标记基因用于体内分析中的结肠直肠腺瘤和腺癌的区别检测。因此，本发明提供了用于在结肠直肠腺瘤组织中检测腺癌细胞的体内方法，所述方法包括以下步骤-使能够与标记基因表达的蛋白特异性结合或相互作用的经标记的试剂与结肠直肠病变接触，禾口-检测所述经标记的试剂与病变中的细胞的结合或相互作用；其中检测到病变中特征在于经标记的试剂的结合或相互作用的差异的病灶，表明结肠直肠腺瘤中腺癌细胞的存在。本发明提供了标记基因集合，其以前没有鉴定为结肠直肠腺癌的标记物，并且可以用于本发明的体内方法中(在表17中显示)。这些标记中的任何一种都适用于本发明的体内诊断方法。本发明的一个特定实施方案提供了标记基因的集合，其选自表17的子集；相应于与腺瘤细胞相比，表达水平在结肠直肠腺癌细胞中升高的那些标记基因。在本发明的方法的一个特定实施方案中，分析了标记基因的集合，从而增加检测的可靠性。更特别地，根据一个特定实施方案，使用试剂的集合，从而每种试剂检测与不同类型的染色体异常相关的标记物，所述染色体异常与结肠直肠腺癌相关。因此，根据一个实施方案，一个标记基因集合用于体内鉴定癌细胞的存在，该标记基因集合包括表明每种染色体异常的标记基因。更特别地，该标记基因集合包括-—种或多种选自表2的基因(与8p缺失相关的标记基因)和-—种或多种选自表3的基因(与8q缺失相关的标记基因)和_—种或多种选自表4的基因(与13q获得相关的标记基因)和-—种或多种选自表5的基因(与15q缺失相关的标记基因)和-—种或多种选自表6的基因(与17p缺失相关的标记基因)和-—种或多种选自表7的基因(与18q缺失相关的标记基因)和_—种或多种选自表8或9的基因(与20q获得相关的标记基因)。额外地或替代地，提供了用于本发明的体内方法中的标记基因的集合，其选自上文描述的标记基因集合，相应于与腺瘤细胞相比，表达水平在结肠直肠腺癌细胞中升高的那些标记基因。在本发明的体内诊断方法的其他实施方案中，表明每种染色体异常的标记基因集合包含位于获得或缺失的染色体区自身内的基因。因此，标记基因的集合包括-选自表IO列出的标记基因的一种或多种基因。更特别地，一种或多种标记基因选自NM_020749和NM_004315和/或选自NM_003747、NM_016353、NM_152415、NM_006197、NM_000662、NM_000015和D31887,和-选自表11列出的标记基因的一种或多种基因。更特别地，一种或多种基因选自NM_138455、NM_032611、NM_032862，和-选自表12列出的标记基因的一种或多种基因，特别是NMj45293和/或NM_005358。更特别地，一种或多种基因选自U50531、NM_012158、NM_017817、NM_003899、NM_003903、NM_018386、BC008975和NMJ)23011，和_选自表13列出的标记基因的一种或多种基因。更特别是NM030574，或一种或多种基因选自NM_004255、NM_002573和AB033025。-选自表14列出的标记基因的一种或多种基因。更特别地，一种或多种基因选自NM_130766、NM_015721和NM_031430，和-选自表15列出的标记基因的一种或多种基因。更特别地，一种或多种标记基因选自NM_004715、NM_006701和NMJ)14913，和22-选自表16列出的标记基因的一种或多种基因。更特别地，一种或多种标记基因选自NM_016397和NM_018270和NM_006602。其他特定的标记基因是NM_080476和NMJ)17896之一或这两者。其他特定的标记基因是选自NM_006097、NM_021809、NM_018840、NM_003600、NM_017495、NM_007002和NM_016354的一种或多种。其他特定的标记基因是选自NM_014071、NM_002212、NM_003185、NM_152255和NM_022082的一种或多种。其他特定的标记基因是选自NM_018244、NM_014902、NM_032013、NM_020182、NM_006886、NM_020673和BC003122的一种或多种。额外地或替代地，提供了用于本发明的体内方法中的标记基因集合，其选自上文描述的标记基因集合，相应于与腺瘤细胞相比，表达水平在结肠直肠腺癌细胞中升高的那些标记基因。本发明的数据分析显示通过不同的染色体异常，可以导致一种标记基因的表达改变。表18显示了由于3种、4种或甚至5种不同异常而改变的标记基因。根据一个特定实施方案，用选自表18列出的标记基因的一种或多种标记基因实施本发明的体内方法。额外地或替代地，用选自表18列出的标记基因的一种或多种标记基因实施本发明的体内方法，所述标记基因相应于与腺瘤细胞相比，表达水平在结肠直肠腺癌细胞中升高的那些标记基因。消化道很容易接触患者中诊断化合物的施用。此外，可以用结肠镜检测经标记的化合物。体内诊断技术进一步允许分析不同的息肉，而不需要采集个体的活检物。特别适用于体内成像的标记基因是编码位于细胞表面或被分泌的蛋白的标记基因。或者，预期由标记基因编码的蛋白的检测是针对保留在细胞质或细胞核中的蛋白。可以通过抗体、结合肽/蛋白(如受体配体或其部分)检测蛋白，如果合适，通过代谢物、酶底物、底物类似物和酶抑制剂检测蛋白。可以用通过细胞内化的化合物，如掺入细胞内的酶底物或类似物、酶抑制剂或某些代谢物间接检测位于细胞内的许多蛋白。因此，通过检测与腺瘤细胞相比，由标记基因编码的蛋白表达或活性的减少或增加，可以体内鉴定腺癌细胞。用发色剂、MRI标记物、用于超声检测的标记物、放射性化合物或促进体内成像的其他工具，可以对任何上文描述的适用于体内检测蛋白的化合物进行进一步官能化。本发明的另一方面涉及用于进行本发明的体内和/或体外检测方法的试剂盒。典型地，本发明的试剂盒含有一种或多种使得能够特异性检测本文公开的一种或多种标记基因的试剂。在一个特定实施方案中，试剂盒包含试剂集合，其允许检测本文描述的标记基因集合。通过试剂盒所适用的检测方法，确定试剂的性质。当意欲用于在DNA/RNA方法中的检测时，试剂典型地是标记物特异性的引物或探针，它们是任选标记的。当检测是在蛋白水平时，试剂典型是含有抗体的抗原结合片段的抗体或化合物。但是，如上文描述的，可以用其他化合物检测蛋白表达，所述其他化合物与感兴趣的标记物特异性相互作用，所述标记物如特异性底物(在酶的情况下)或配体(用于受体)。在特定实施方案中，根据本发明的方法，本发明的试剂盒也包含对照样品。在所附独立和从属权利要求中阐述了本发明的特定和优选方面。从属权利要求的特征可以与独立权利要求的特征以及合适的其他独立权利要求的特征组合，并且不仅仅是权利要求中特意阐述的那些。实施本发明的其他系统和方法的安排对于本领域技术人员是显而易见的。23应该理解，尽管本文讨论了用于本发明的装置的优选实施方案、特定构造和构型，但可以进行形式和细节的各种改变或修饰，而不背离本发明的范围和精神。实施例实施例1:在微阵列中确定差异表达的基因选择肿瘤样品在荷兰阿姆斯特丹的VU-大学医学中心(VUmc)前瞻性采集73个快速冷冻的结肠直肠肿瘤(37个未进展的腺瘤和36个癌)。所有样品都根据伦理委员会的规定使用。所述73个冷冻标本相应于65个患者(31个女性和34个男性)。在这些患者中，6个患者具有多发性肿瘤4个患者具有多发性腺瘤，2个患者具有一个或多个相邻于癌的腺瘤。患者的平均年龄是69岁(范围是47-89岁)。在冷冻设备上进行阵列-CGH和表达微阵列。RNA分离按照供应商的说明书，用TRIzol试剂(Invitrogen，Breda，NL)从快速冷冻的组织分离RNA。在NanodropND-1000分光光度计(Isogen，IJsselstein，NL)中测量RNA和DNA浓度和纯度，在用溴化乙锭染色的1%琼脂糖凝胶中评估完整度。表达微阵列a)阵列平台从Sigma-Genosys(Zwijndrecht，荷兰)获得Compugen(SanJose，CA，USA)设计的HumanRelease2.0寡核苷酸文库，其中含有代表28830种独特基因的60聚体寡核苷酸。以10mM浓度将寡核苷酸溶解于50mM磷酸钠缓冲液pH8.5中，并且采用装备了SMP3针(TeleChemlnternational，Sunnyvale,CA，USA)的OmniGrid100微阵列(GenomicSolutions，AnnArbor，MI，USA)，单个点样到Codelink载玻片(AmershamBiosciences,Roosendaal，NL)上。印刷后，根据制造商的方案(Codelinkslides;AmershamBiosciences,Roosendaal,NL)，处理载玻片。b)标记和杂交首先，以寡-dT为引物(Isogen，IJsselstein,NL)，用SuperScriptTMII逆转录酶(Invitrogen，Breda，NL)将30yg信使RNA逆转录为cDNA。在具有有限量的RNA的样品中，较少量用作起始材料，但至少15yg。将cDNA偶联于FluorolinkCy3和Cy5单官能染料5_包(AmershamBioSciences，Rosendaal，NL)。混合Cy3标记的月中瘤cDNA禾口Cy5标记的参照cDNA，通过加入0.1体积的3M乙酸钠(pH5.2)和2.5体积的冰冷的100%乙醇，用12ligpd(A)40—60(AmershamBiosciences,Rosendaal，NL)，60ligtRNA(Sigma-Aldrich，Zwijndrecht，NL)和24iig人Cot-IDNA(Invitrogen,Breda，NL)共沉淀。通过4。C下以14，000rpm离心10分钟而收集沉淀物。在空气中干燥后，将沉淀物溶解于与终浓度为50%的甲酰胺，2xSCC，10%硫酸葡聚糖和4%SDS的126.7y1杂交混合物中。将cDNA样品在73t:下变性10分钟，然后37t:下温育60分钟，以使得Cot-IDNA能够封闭重复序列。用变性和封闭的杂交混合物将阵列在杂交站(HybArrayl2TM-PerkinElmerLifeSciences，Zaventem，BE)中37。C下温育14小时。杂交后，45。C下在含有50%甲酰胺，2xSCC，pH7的溶液中将载玻片洗涤3分钟，然后在室温下用PN缓冲液(PN:0.1M磷酸钠，0.1%nonidet24P40，pH8)，0.2xSSC，O.lxSCC和0.01xSCC中洗涤1分钟。通过室温下以lOOOrpm离心3分钟而干燥载玻片。c)图像采集、特征提取和标准化通过扫描(AgilentDNA微阵列扫描仪-Agilenttechnologies,PaloAlto，USA)获得阵列的图像，并且用Imagene5.6软件(BiodiscoveryLtd,MarinadelRey，California)进行自动特征提取(两个通道Cy3和Cy5的每个斑点的信号和背景强度的斑点分段和定量)。使用了不良质量斑点的标记的默认设置。用microsoftExcel表格从受试cDNA和参照cDNA的信号中值强度扣除局部背景。进行原始数据的强度的MA作图，以判断总体质量，并且排除不良质量实验。标准化是采用使用"loess"校正的TIGRMidas或采用"Median"标准化进行的，并且在maNorm函数(marrayRbioconductor软件包)中执行，具有相同结果。为了簇集的目的，也进行了阵列间标准化。由50的强度值代替低强度值。从进一步的分析中排除所有肿瘤中超过20%缺失值的基因。数据分析用软件TIGRmultiexperimentviewer(TMev)进行未监督的簇分析。应用完全连锁和欧几里德距离。由于所有的杂交都是针对共同参照进行的，所有比较在不同组的结肠直肠赘生物之间都是相关的，认为与正常结肠直肠粘膜相比没有差异。用Wilcoxon秩检验和考虑亚群的新方法进行腺癌和腺瘤之间表达比较的有监督的分析。结果表1中提供了通过微阵列鉴定出在腺瘤和腺癌之间差异表达的基因。实施例2:表达数据的集成和CGH分析为了调查结肠直肠腺瘤向腺癌进展过程中染色体不稳定性对基因表达的影响，在一系列114个结肠直肠肿瘤(37个未进展的腺瘤，41个进展的腺瘤(恶性息肉)和36个癌)上通过阵列-CGH分析了全基因组拷贝数目改变。这里针对20q上的染色体获取区，详细描述了本发明公开的SR0s的确定。对于41个进展的腺瘤，分析了腺瘤和腺癌成分的DNA拷贝数目改变。在>20%的病例中观察到了lp，4，8p，14q，15q，17p和18的缺失和lq，6p，7，8q，13q，17q，19p，20q和22q的获得，其中8p和18缺失以及13q和20q获得是最频繁的，发生在超过35X的病例中。单独的染色体20的获得发生在超过60%的病例中。在基因组范围，在进展的腺瘤中，拷贝数目改变的模式在腺瘤和腺癌成分之间没有差异，B卩，腺癌成分中发现的异常已经存在于腺瘤成分上，尽管频率或广度较低。随后，分析了37个未进展的腺瘤和36个癌的拷贝数目改变。在73个肿瘤中，67个(34个腺瘤和33个癌)显示了高质量的基因组概况(相应于8%退出)。在腺瘤中，异常的频率明显非常低。相反，腺癌显示了频繁的(>20%的病例)lp，4，8p，14q，15q，17p和18缺失，以及lq，6p，7，8q，13q，17q，19p，20q和22q获得，其中8p和18缺失以及13q和20q获得存在于35%以上的病例中(如同在进展的腺瘤中)。染色体20获得存在于少于15%的腺瘤中，但在超过60%的癌中，大多数影响整个染色体或长臂，如同在进展的腺瘤中。这67个肿瘤(未进展的腺瘤和癌)在DNA拷贝数概况上的等级簇集分析显示了癌和腺瘤明显区分为两个不同的簇，即分别是簇1和簇2，乂2检验。<0.001。在对未进展的腺瘤和腺癌之间有显著差异(p<0.05)的DNA拷贝数改变进行的检索中，我们观察到了4q，8p，8q，13q，15q，18和20是相关区域，其中20q上的基因座差异最显著(p<0.00001)。为了确定具有在结肠直肠癌进展中起作用的推定的癌基因的最相关区域，将STAC应用于石蜡包埋的恶性息肉(n=41)和冷冻的癌(n=33)的合并的集合。对于20q，这些样品的分析发现3个具有异常拷贝获得的相关区域，一个跨4Mb(32-36Mb)，一个跨3Mb(56-59Mb)，第三个跨2Mb(61_64Mb)。这三个区域(最小重叠区-SROs)仍然分别含有80、35和94种基因。对于与腺癌相关的染色体异常的其他区域进行了相似的分析，对于这些区域的每一个，鉴定了SROs。在能获得快速冷冻材料的37个未进展的腺瘤和36个癌中进行了微阵列表达分析。在68个病例(37个腺瘤和31个腺癌，7%退出)中获得了高质量表达数据。阵列-CGH数据在基因组范围内与微阵列表达数据相关，不依赖于腺瘤或腺癌状况。为了比较具有某些染色体异常的肿瘤与缺乏所述异常的肿瘤之间的表达，为了公开表达受到染色体异常的影响的基因，开发了统计学算法(R环境)(deWiel，未发表的数据)。对于染色体异常的每个区域，获得了一系列基因，其基因剂量影响表达水平(表2-9)。鉴定了基因，其作图在染色体异常区内，并且显示了结肠直肠腺瘤和具有相关染色体异常的腺癌细胞之间的差异表达(表10-16)。下文对于20q上的染色体获得区更详细描述了这个过程。以两种不同的方式进行了目的在于鉴定20q上的推定癌基因的表达数据的有监督的分析。首先，研究了癌和腺瘤之间的基因差异表达(表1)，其次，具有20q获得的肿瘤中的基因表达与没有20q获得的肿瘤比较(表8)，以确定哪些基因中的表达水平受到20q获得的存在的影响。第一种方法发现了与腺瘤相比，在腺癌中的基因组范围的122种上调的基因和219种下调的基因(Wilcoxon检验p-值〈le-5或Thas评分〉10.47)。在122种上调的基因中，14种作图在染色体20q上。对于第二种方法，仅仅使用了可以获得阵列-CGH数据和表达数据的肿瘤(腺瘤和腺癌)(n=64)。最为预选，使用在第一种方法中获得的在癌和腺瘤之间的表达值差异表达(上调和下调)的基因(截止p-值<0.05)，以便集中于参与从腺瘤进展到癌的20q上的基因。采用这种分析，在基因组范围鉴定了127种基因，其表达水平是由于20q获得的存在。当我们比较两种方法之间共同的、作图在20q上的基因，即由于该染色体臂的获得而在癌中上调的基因时，发现了9种基因，S卩，TPX2，c20orf24，AURKA(STK6)，RNPC1，TH1L，ADRM1，C20orf20，TCFL5和C20orfl1。对于与结肠直肠腺癌相关的染色体缺失或获得的其他区域，进行了相似的分析。表1:在结肠直肠腺瘤和腺癌细胞之间差异表达的人基因。(数据按p值排序)26基因ID说明(表1)才交正的p^f直NM—000963前列腺内过氧化物合酶2(前列腺G/H合酶和环加氧酶)0(PTGS2),mRNA.BC017卯6克隆IMAGE:4273917,mRNA.0NM—031285假定蛋白PP1057(PP1057),mRNA.0A兩6401全长插入cDNA克隆ZD75H06.0AI546979PN2.1—12—B02.rmynormcDNA5',mRNA序列.0NM—000439前蛋白转化酶枯草蛋白酶/kexin型l(PCSKl),mRNA.0NM—032827假定蛋白FLJ14708(FLJ14708),mRNA.0AK024180cDNAFU14118fis,克隆MAMMA1001848.0AK001058cDNAFLJ10196fis,克隆HEMBA1004776.0丽—145341程序性细胞死亡4(赘生转化抑制物)(PDCD4),转录变0体2,mRNA.NM—016651肝细胞癌新基因3(DAPPER1),mRNA.0NM—013943细胞内氯通道4(CLIC4),mRNA.0NM—006922钠通道，电压门控的，III型，a多肽(SCN3A),mRNA.0NM—005424具有免疫球蛋白和表皮生长因子同源性结构域的酪氨酸0激酶(TIE),mRNA.U80770EST克隆251800mariner转座子Hsmarl序列.0BC039491克隆IMAGE:5547271,mRNA.0NM—145274LOC147184(LOC147184),mRNA.0AF056437克隆HEA2Cri-du-chat关键区mRNA.0AB033100KIAA1274蛋白的mRNA,部分cds.0NM—002731蛋白激酶，cAMP-依赖性，催化的，P(PRKACB)，mRNA.0NM—152621假定蛋白MGC26963(MGC26963),mRNA.0NM—006396千燥综合征/硬皮病自身抗原1(SSSCAl)，mRNA.0BC009558克隆IMAGE:3899550，mRNA，部分cds.0NM—005101a千扰素诱导型蛋白(克隆IFI-15K)(G1P2),mRNA.0NM一O18484溶质载体家族22(有机阴离子/阳离子转运蛋白)，成员110(SLC22A11),mRNA.NM—006944分泌的磷蛋白2,24kDa(SPP2),mRNA.0BF683837602140129F1NIH—MGC—46cDNA克隆0IMAGE:43012875',mRNA序列.27<table>tableseeoriginaldocumentpage28</column></row><table>基因ID说明(表1)校正的p4直AK074150FLJ00223蛋白的mRNA.0AL833463mRNA,cDNADKFZp686P07116(来自克隆0DKFZp686P07116).NM—024505NADPH氧化酶，EF手钙结合域5(NOX5),mRNA.0BC033540RA调节的核基质相关蛋白，克隆MGC:426570IMAGE:4826434,mRNA,完整cds.AF339788克隆IMAGE:208561，mRNA序列.0BG186690RST5665AthersysRAGE文库cDNA,mRNA序列.0刚一O18662在精神分裂症中破坏的1(DISCI),mRNA.0NM—001546DNA结合的抑制剂4，显性失活的螺旋-坏-螺旋蛋白0(ID4),mRNA,AK091130cDNAFLJ33811fis，克隆CTONG2002095.0NM—006030钙通道，电压依赖性的，a2/5亚基2(CACNA2D2),0mRNA.NM—016569T-盒3(尺骨乳腺综合征)(TBX3)，转录变体2,mRNA.0NM—152315假定蛋白MGC342卯(MGC342卯)，mRNA.0丽一006602转录因子样5(基本螺旋-环-螺旋)(TCFL5),mRNA.0AK095147cDNAFLJ37828fis,克隆BRSSN2006575.0NM—019000假定蛋白FLJ20152(FLJ20152),mRNA.0NM—024533假定蛋白FLJ22167(FLJ22167),mRNA.0NM—080661类似于RIKENcDNA0610008P16基因(MGC15937)，0mRNA.NM—014729胸腺高迁移性基团盒蛋白TOX(TOX),mRNA.0NM—032579结肠和小肠特异性的富含半胱氨酸的蛋白前体0(HXCP2),mRNA.NM—002928G-蛋白信号传递的调节物16(RGS16>,mRNA.0醒一014310RASD家族，成员2(RASD2),mRNA.0NM—001249胞外核香三磷酸二磷酸水解酶5(ENTPD5),mRNA.0BC015962克隆IMAGE:4081125,mRNA,部分cds.0NM—016938含EGF的纤蛋白样细胞外基质蛋白2(EFEMP2)，mRNA.0AF085835全长插入cDNA克隆YI41B09.0AK096002cDNAFLJ38683fis,克隆KIDNE2000777.0BM545871AGENCOURT—6500358NIH—MGC—125cDNA克隆0IMAGE:55882285'，mRNA序列.AW975332EST387440MAGE重新排序，MAGNcDNA,mRNA序0基因ID说明^表I)校正的g-值列.NM—138455含胶原三螺旋重复1(CTHRC1),mRNA.NMJH4176类似于遍在蛋白缀合酶的HSPC150蛋白(HSPC150)，mRNA.NM—019012磷酸肌醇3-磷酸结合蛋白-2(PEPP2)，mRNA.NM—006809线粒体外膜的移位酶34(TOMM34),mRNA.BC035027克隆IMAGE:4828469,mRNA.NM_001072UDP糖基转移酶1家族，多肽A6(UGT1A6),mRNANM—007283单酰甘油脂酶(MGLL),mRNA.NM—003655chromobox同源物4(Pc类同源物，果蝇)(CBX4),mRNA.0AK000245cDNAFLJ20238fis,克隆COLF58卯.0BC029775假定基因LOC127421,克隆MGC:353940IMAGE:5186268,mRNA,完整cds.NM—001888晶体蛋白，mu(CRYM),mRNA.0NM—018414GalNAca-2,6-唾液酸转移酶I,长形(ST6GalNAcI),0mRNA.AL355711EST来自克隆208499，完整插入片段.0NM—018270染色体20可读框20(C20orf20)，mRNA.0NM—033225CUB和Sushi多结构域1(CSMD1),mRNA.0AK025017cDNA:FU21364fis'克隆COL02989.0AF147324全长插入cDNA克隆YB22D01.0AK025522cDNA:FLJ21869fis,克隆HEP02442.0NM—033262溶质栽体家族8(钠4丐交换物)，成员3(SLC8A3)，转录0变体a,mRNA.NM—0055183-羟基-3-甲基戊二酰-辅酶A合酶2(线粒体)O(HMGCS2),mRNA.BC008502克隆MGC:14841IMAGE:4295121,mRNA,完整cds.0NMJH4326死亡相关蛋白激酶2(DAPK2),mRNA.0AF086094全长插入cDNA克隆YZ87H06.0AB037842KIAA1421蛋白的mRNA,部分cds.0NM—025087假定蛋白FLJ21511(FLJ21511),mRNA.0NM—003682激活MAP的死亡结构域(MADD)，转录变体4,mRNA.0NM_003657乳腺癌扩增的序列1(BCASl)，mRNA.0NMJ)05卯4MAD,母体抗decapentaplegic同源物7(果蝇)(MADH7),0mRNA.30基因IDNM—004417丽_014766A腿6378BC034757NM—005172NM—012254NM—133367薩—012413AL548449NM—003289NM—153751NM一O16308NM_005375U01O38画—032951驅—003882画—033126BC033971丽—004221画—002346NM020360说明沐1)双特异性磷酸酶1(DUSP1),mRNA.KIAA0193基因产物(KIAA0193),mRNA.cDNA:FLJ22725fis，克隆HSI14917.校正的p,值000印度刺猬同源物(果蝇)，克隆MGC:348150IMAGE:5182642,mRNA,完整cds.无调同源物1(果蝇)(AT0H1),mRNA.0溶质栽体家族27(月旨肪酸转运蛋白)，成员5(SLC27A5),0mRNA.染色体6可读框33(C6orf33)，mRNA.0谷氨酰胺酰-肽环转移酶(谷氨酰胺酰环化酶)(QPCT),0mRNA.AL548449LTI—NFL006—PL2cDNA克隆0CS0DI014YH213prime,mRNA序列.原肌球蛋白2((3)(TPM2),mRNA.0染色体21可读框82(C21orf82)，mRNA.0UMP-CMP激酶(UMP-CMPK),mRNA.0v-myb成髓细胞瘤病毒(myeloblastosisviral)癌基因同0源物(禽类)(MYB)，mRNA.pLKmRNA,完整cds.0WilliamsBeuren综合征染色体区14(WBSCR14),转录变0体1，mRNA.WNTl诱导型信号传递途径蛋白1(WISP1),转录变体1，0mRNA.丝氨酸/苏氨酸激酶PSKH2(PSKH2)，mRNA.0克隆IMAGE:5288527,mRNA.0天然杀伤细胞转录物4(NK4),mRNA.0淋巴细胞抗原6复合物，基因座E(LY6E),mRNA.0磷脂爬行酶(phospholipidscramblase)3(PLSCR3),0mRNA.NM—002167DNA结合的抑制物3,显性失活的螺旋-环-螺旋蛋白0(ID3)，mRNA.NM—003839肿瘤坏死因子受体超家族，成员11a,NFKB的激活物0(TNFRSF11A),mRNA.NMJH2326微管相关蛋白，RP/EB家族，成员3(MAPRE3),mRNA.0NM—001761细胞周期蛋白F(CCNF)，mRNA.031基因id说明，i)......................NM—002345腔蛋白聚糖(LUM),mRNA.0NM—009590含铜的胺氧化酶2(视网膜特异性的)(AOC2)，转录变体02,mRNA.NM_005480滋养蛋白相关蛋白(滋养蛋白辅助蛋白)(TROAP),0mRNA.NM—014465磺基转移酶家族，胞质溶胶，IB,成员1(SULT1B1),0mRNA.BC031648,KIAA1324蛋白，克隆MGC:35166IMAGE:5169952,0mRNA,完整cds.NM一020980水通道蛋白9(AQP9),mRNA.0NM_003890IgG结合蛋白的Fc片段(FCGBP)，mRNA.0NM_014631可能是小鼠5个SH3结构域的直向同源物(FISH),0mRNA.NM—022卯9着丝粒蛋白H(CENPH),mRNA.0NM—001715B淋巴细胞激酶激酶(BLK)，mRNA.0NMJ45235类似于RIKENcDNA1700007B22(LOC92565),mRNA.0NM—006259蛋白激酶，cGMP依赖性，II型(PRKG2),mRNA.0NM—032229假定蛋白FLJ22774(FLJ22774),mRNA.0NMJKB118分泌的蛋白，酸性，富含半胱氨酸(骨粘连蛋白)O(SPARC),mRNANM_006615钙激活中性蛋白酶9(nCL-4)(CAPN9),mRNA.0NM_023028成纤维细胞生长因子受体2(细菌表达的激酶，角质形成O细胞生长因子受体，颅面骨发育不全1,Crouzon综合征，Pfeiffer综合征，Jackson-Weiss综合征)(FGFR2),转录变体10,mRNA.NM—138706)B-1,3-N-乙酰葡糖胺转移酶蛋白(IMAGE:4卯7098),0,0012662mRNA.NM—001343伤残同源物2,促分裂原反应性磷蛋白(果蝇)(DAB2),0,00127427mRNA.NM—014276无毛的重组结合蛋白抑制物(果蝇)样(RBPSUHL),0,00128244mRNA.NM_005476UDP-N-乙酰葡糖胺-2-差向异构酶/N-乙酰甘露糖胺激酶0,00129071(GNE)，mRNA.ALII7475mRNA,cDNADKFZp727C211(来自克隆0,00181782DKFZp727C211).32基因ID说明(表1)校正的p-值BC040548类似于假定蛋白MGC38960,克隆IMAGE:5288206,0,0018289mRNA.画_133柳溶质栽体家族26,成员10(SLC26A10),mRNA.0,00184012醒—009587凝集素，结合半乳糖苷，可溶的，9(半乳凝集素9)0,00185148(LGALS9)，长转录变体，mRNA.AK055091cDNAFU30529fis,克隆BRAWH2001052.0,00186298AK001669cDNAFLJ10807fis，克隆NT2RP4000865，中度类似于0,00187463锌指蛋白ZFP-36.BC036237克隆IMAGE:5297125,mRNA.0.00188642NM_006306SMC1染色体结构维持1样1(酵母)(SMCILI),mRNA.0,00238874NM—016397TH1样(果蝇)(THIL)，mRNA.0,00240313NM—000442血小板/内皮细胞粘附分子(CD31抗原)(PECAMl)，0,00298155mRNA.NM—017898假定蛋白FLJ20605(FU20605),mRNA,0,00344759NM—153025假定蛋白FLJ31606(FLJ31606),mRNA,0,00346751NM_018840推定的Rab5相互作用蛋白(RIP5)，mRNA.0,00348767NM—0(34315N-酰基鞘氨醇酰胺水解酶(酸性神经酰胺酶)10,00350807(AS腦)，mRNA.NM—014353RAB26,成员RAS癌基因家族(RAB26),mRNA.0,00352871BQ425855AGENCOURT_7894797NIH—MGC—72cDNA克隆0,00354959IMAGE',61583905'，mRNA序列.NM—014052GW128蛋白(GW128),mRNA.0,00367821NM—003186转凝蛋白(TAGLN),mRNA.0,00369767AK092226cDNAFLJ34907fis，克隆NT2RI2003392.0,00371734NM—007069HRAS样抑制物3(HRASLS3),mRNA.0,00373722NM—144646免疫球蛋白J多肽，免疫球蛋白a和p多肽的接头蛋白0,00375731(IGJ)，mRNA.NM_003977酰基烃受体相互作用蛋白(AIP)，mRNA.0,00377762NM—002216a间(球蛋白)抑制剂，H2多肽(ITIH2)，mRNA.0,00379815AK075365cDNAPSEC0052fis,克隆NT2RP2000279,弱类似于0,00381891AQUALYSfNIPRECURSOR(EC3.4.21,).NM—002915复制因子C(激活物1)3,38kDa(RFC3),mRNA.0,00383989NM_006946血影蛋白，P,非红细胞2(SPTBN2),mRNA.0,00386111画_003%6sema结构域，7个血小板反应蛋白重复(l型和1型样)，0,00388256跨膜域(TM)和短胞质域，(脑信号蛋白)5A(SEMA5A),33基因id说明(表i).........................................................................................H，e:.色國mRNA.NM—005398蛋白磷酸酶l,调节性(抑制物)亚基3C(PPP1R3C),0,00390425mRNA.BC040302克隆IMAGE:4837012，mRNA.0,00392618NM_004915ATP-结合盒，亚家族G(WHITE),成员1(ABCGl),转0,00394836录变体1,mRNA.AF086547全长插入cDNA克隆ZE12B03.0,0039708AK095226cDNAFU37卯7fis,克隆COLON2009337.0,00399349ALS32060mRNA,cDNADKFZp313L1514(来自克隆0,00414943DKFZp313L1514).AF075039全长插入cDNAYN6IC04.NM—032711假定蛋白MGC130卯(MGC13O卯)，mRNA.NM—016014CGI-67蛋白(CGI-67),mRNA.AK023616cDNAFLJ13554fis,克隆PLACE1007478.U32597前B细胞Ig重链mRNA,第三互补决定区PBUF-DE14,部分cds.NM—002899视黄醇结合蛋白1,细胞(RBPl)，mRNA.NM_001432epiregulin(EREG),mRNA.NM—024933假定蛋白FLJ12056(FLJ12056),mRNA.AW842526MR2-CN0035-170300-201-a06CN0035cDNA，mRNA序0,00596896列.BC002877类似于假定蛋白FUI1585,克隆MGC:112580,005985981MAGE:3942160,mRNA，完整cds.NM_022061线粒体核糖体蛋白L17(MRPL17),核基因编码线粒体蛋0,0059988白，mRNA.NM—002102血型糖蛋白E(GYPE),mRNA.0,00601167NM_003173彩斑3-9同源物的抑制物1(果蝇)(SUV39H1),mRNA.0,00602895NM—032130假定蛋白DKFZp434J0113(DKFZP434J0113),mRNA.0,00603759BC037944克隆IMAGE:5285703，mRNA.0,00605939NM一O04385硫酸软骨素蛋白聚糖2(多功能蛋白聚糖)(CSPG2),0,00606372mRNA.NM—024513含FYVE和巻曲的巻曲结构域1(FYCOl)，mRNA.0,00609009AL834283mRNA,cDNADKFZp547N0315(来自克隆0,00609015DKFZp547N0315).NM—005144无毛(HR),转录变体l,mRNA.0,006116680,004171040,004192880,004638250,00509592克隆0,005122050,005910150,005939410,0059605134基因ID说明(表1)校正的p-值醒一001920饰胶蛋白聚糖(DCN),转录变体Al,mRNA.0,00614351NMJH86卯栽脂蛋白B48受体(APOB48R),mRNA.0,00617057AK000932cDNAFL層70fis，克隆HEMBA腿581.0,00619788薩—003645溶质栽体家族27(脂肪酸转运蛋白)，成员2(SLC27A2)，0,00622542mRNA.BC000712类似于驱动蛋白家族成员Cl,克隆MGC:12020,00625321IMAGE:3506669，mRNA,完整cds.AF085969全长插入cDNA克隆YT85B06.0,00628126NM—133646含不育a基序和亮氨酸拉链的激酶AZK(ZAK),mRNA.0,00630955丽一002135核受体亚家族4，A组，成员1(NR4A1),mRNA.0,0063381醒—021969核受体亚家族O,B组，成员2(NR0B2),mRNA.0,00636637BC033139克隆IMAGE:3844353,mRNA.0,00636691画—006874E74样因子2(ets结构域转录因子)(ELF2)，mRNA.0，00639598丽_001822嵌合蛋白1(CHN1),mRNA.0,00642532薩—006097肌球蛋白调节性轻链2，平滑肌同种型(MYRL2),mRNA.0,00645493AK098571cDNAFLJ25705fis,克隆TST04816,0,00648481AL832272mRNA,cDNADKFZp667P1917(来自克隆0,00651498DKFZp667P1917).画—032746假定蛋白MGC12538(MGC12538)，mRNA.0,00654542画_138639BCL2样12(富含脯氨酸)(BCL2L12),转录变体1,0,00657615mRNA.NM—006361同源框B13(H0XB13),mRNA.0,00660717BQ230145AGENCOURT—7592688NIH—MGC—72cDNA克隆0,00663848IMAGE:60503635',mRNA序列.NM—006150仅LIM结构域6(LM06)，mRNA:0,00666117AK023718cDNAFLJ13656fis，克隆PLACE1011520.0,00667009BC025345类似于LOC149651,克隆MGC:39393IMAGE:4862156,0,00668卯4mRNA,完整cds.NM—012162F盒和富含亮氨酸的重复蛋白6(FBXL6),转录变体1,0,00670201mRNA.画—0017U二聚糖(BGN),mRNA.0,00671714BC041362克隆IMAGE:5273088,mRNA.0,00673423画J)01155联膜蛋白A6(ANXA6),转录变体l,mRNA.0,00674549NM一001809着丝粒蛋白A,17kDa(CENPA),mRNA.0,00676676NM一O16341;岸脂酶C,sl(PLCE)，mRNA.0,0067740735基因ID说明(表1)校正的p-f直薩—017678假定蛋白FLJ20127(FLJ20127),mRNA.0,00679961BC022357克隆MGC:23866IMAGE:429707,mRNA,完整cds.0,00683278AK058066cDNAFLJ25337fis,克隆TST00714.0,00694147NM—003128血影蛋白，(3,非红细胞1(SPTBNl)，mRNA.0，006%992AB019210PMMLP的BM32AmRNA,完整cds.0,0069986AL359603mRNA,cDNADKFZp547E096(来自克隆0,00702752DKFZp547E096).NM—172127钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶(CaM激酶)II50,00747488(CAMK2D),转录变体l，mRNA.AK022350cDNAFU12288fis,克隆MAMMA1001783.0,00750443A腿簡cDNAFLJ簡lfis,克隆PLACE1004405.0,00753421NM—138764BCL2相关X蛋白(BAX),转录变体s,mRNA.0,00756422AK075287cDNAFLJ卯806fis,克隆Y79AA1000750.0,00759448NM—032242假定蛋白DKFZp564A176(DKFZp564A176),mRNA.0,00762498BC015413克隆MGC:21964IMAGE:4394326,mRNA，完整cds.0,00765573NM—002318赖氨酰氧化酶样2(LOXL2),mRNA.0,00768672NM_017843乳腺癌扩增的序列4(BCAS4)，mRNA.0,00771797NM_000196羟基类固醇(11-P)脱氢酶2(HSD11B2),mRNA.0,00774753NM—018685胞环蛋白，肌动蛋白结合蛋白(scraps同源物，果蝇)0,00777622(ANLN),mRNA.NM—001218碳酸酐酶XII(CA12),mRNA.0,00780513應一O17495含RNA结合区(RNPl,RRM)ll(RNPC1)，mRNA.0,00783425AL833091mRNA,cDNADKFZp451M0319(来自克隆0,0078636DKFZp45腦319).NM—033339胱天蛋白酶7，凋亡相关半胱氨酸蛋白酶(CASP7),转0,00789316录变体丫，mRNA.NM—004202胸腺素，p4，Y染色体(TMSB4Y),mRNA.0,00792294NM—000835谷氨酸受体，离子型，N-甲基D-天冬氨酸2C(GRIN2C),0,00795296mRNA.雇—004453电子转移黄素蛋白脱氢酶(ETFDH)，核基因编码线粒体0,00798319蛋白，mRNA.NM—000633B细胞CLL/淋巴瘤2(BCL2)，核基因编码线粒体蛋白，0,00801366转录变体a,mRNA.AL832848mRNA,cDNADKFZp667H0525(来自克隆0,00804437DKFZp667H0525).基因id说明(表i).......................................NM—138478假定蛋白BC010734(LOC147632),mRNA.0,00807531NM—017卯2缺氧诱导型因子l,a亚基抑制剂(HIF1AN)，mRNA,O，OOSO8294NM_006699甘露糖苷酶，a,1A类，成员2(MAN1A2),mRNA.0,00810649NM—025067假定蛋白FLJ14106(FLJ14106),mRNA.0,00813791NMJ39248脂肪酶，成员H(LIPH)，mRNA.0,00816957NM_018259假定蛋白FLJ10890(FLJ10890),mRNA.0,00820148NM—000629干扰素(a，P和co)受体1(IFNAR1),mRNA.0,00823365NM—018354染色体20可读框46(C20orf46),mRNA.0,00842689NM_007002粘附调节分子1(ADRMl)，mRNA.0,00872553AY006312克隆09叩a41T细胞受体|3链mRNA,部分cds.0,00875737NM—016353锌指，含DHHC结构域2(ZDHHC2),mRNA.0,0089552NM—012112染色体20可读框1(C20orfl),mRNA.0,00898741AF353674BTB结构域蛋白(BDPL)mRNA,部分cds.0,00901986NM—002659血纤蛋白溶酶原激活物，尿激酶受体(PLAUR),mRNA.0，00卯5254NM—020859Shroom相关蛋白(ShrmL),mRNA.0,00928743AL833307mRNA,cDNADKFZp4510249(来自克隆0,00950514DKFZp4510249).NM—052889仅CARD蛋白(COP),mRNA.0,00953873AK095I39cDNAFU37820fis,克隆BRSSN2004142.0,00957255NM—014444y微管蛋白环复合物蛋白(76p基因)(76P)，mRNA.0,00%0662AY101175胞外硫酸酯酶SULF-1mRNA,完整cds.0,00971681NM_003987匹配框基因2(PAX2),转录变体a，mRNA.0,00975066BC018995克隆MGC:205791MAGE:4300679，mRNA,完整cds.0,00978476BC036258克隆IMAGE:5270538,mRNA.0,00981909NM—001855胶原，XV型，a1(COL15A1),mRNA.0,01000145NM—001405肝配蛋白-A2(EFNA2),mRNA.0,01003606NM_032385染色体5可读框4(C5orf4),mRNA.0,01020204BC034571类似于磷脂酶A2，IVB组(胞质溶胶)，克隆MGC:351200,01023686IMAGE:5167964，mRNA，完整cds.NMJ52777染色体14可读框48(C14orf48)，mRNA.0,01027192NM—025244睾丸特异性，10(TSGA10),mRNA.0,01030722NM—015973甘丙肽相关蛋白(LOC51083),mRNA.0,01036579BI791911ie歸4.xlHR85胰岛cDNA克隆IMAGE:50864713'，0,01040057mRNA序列.NM—000435Notch同源物3(果蝇)(NOTCH3)，mRNA.0,01043559基因IDi兑明(表I)NM—024817假定蛋白FU13710(FLJ13710),mRNA.AK022362cDNAFLJ2300fis,克隆MAMMA1001854.AK026367cDNA:FLJ22714fis,克隆HSI13646.AK095808cDNAFLJ38489fis,克隆FEBRA2023550,弱类似于P3蛋白.AK093557cDNAFLJ36238fis,克隆THYMU2001422.NM—006416溶质载体家族35(CMP-唾液酸转运蛋白)，成员1(SLC35A1),mRNA.AB002339KIAA0341基因的mRNA,部分cds,NM一017590遍在的舍tetratricopcptidc的蛋白RoXaN(RoXaN),mRNA.NM—018590假定蛋白MGC40204(MGC40204),mRNA.AK055120cDNAFLJ30558fis,克隆BRAWH2004044.NM—006410HIV-lTat相互作用蛋白2，30kDa(HTATIP2),mRNA.NM_001752过氧化氢酶(CAT),mRNA.NM—000027天冬氨酰氨基葡糖苦酶(AGA),mRNA.AK023072cDNAFLJ13010fis,克隆NT2RP3000542.NM—018182假定蛋白FIJI0700(FLJ10700),mRNA.NM—0I6062CGI-128蛋白(CGI-128),mRNA.NM_021738监理蛋白(super绒毛蛋白)(SVIL),转录变体2,mRNA.AK023713cDNAFLJ13651fis，克隆PLACE1011452.BG109597602280715F1NIH—MGC—86cDNA克隆IMAGE:43'685545',mRNA序列.NM—002691聚合酶(定向于DNA),51,催化亚基125kDa(POLD1),mRNA.NM—0056185样1(果蝇)(DLLl)，mRNA.NM_018453染色体14可读框11(C14orfl1)，mRNA.NM_005538抑制素，pC(INHBC),mRNA.NM—018244染色体20可读框44(C20orf44),mRNA.Z83936mRNA,克隆CD36.躍—014302Sec61y(SEC61G),mRNA.NM_0003%组织蛋白酶K(致密性成骨不全症)(CTSK)，mRNA.BC006270克隆MGC:112911MAGE:3946683,mRNA,完整cds.NM_000698花生四烯酸5-脂加氧酶(ALOX5),mRNA.BC040672克隆IMAGE:4816952,mRNA.校正的p.-值0,010470850,010506340,010860420,010895220,010930260,010961260,010965520,0109978O，Ol匪0,011036720,011072670,011108860,011142320,011145280,011175980,011181940,011209850,011218850,011243920,011255990,01127820,011283010,011307290,011312690,011318490,011341050,011347390,01135420,0113750,0113823138基因ID说明(表1)校正的p^f直NM—014142nudix(二磷酸核苷连接的部分X)-型基序5(NUDT5)，0,01139013mRNA.AK056937cDNAFLJ32375fis,克隆SALGL1000065,弱类似于多0,01140916同源异型-近端染色质蛋白.BC040599克隆IMAGE:5270494,mRNA.0,01141744NM—018180死亡/H(Asp-Glu陽Ala-Asp/His)框多肽32(DDX32),0,01142629mRNA.NM—003155司腺《丐蛋白l(STCl),mRNA0,01143466AK094846cDNAFLJ37527fis,克隆BRCAN2011946.0,01145279NM—003359UDP-葡萄糖脱氢酶(UGDH)，mRNA.0,01146268NM—002840蛋白酪氨酸磷酸酶，受体型，F(PTPRF),转录变体l，0,01146829mRNA.NM—020299醛-酮还原酶家族1,成员BIO(醛还原酶)(AKRIBIO),0,01148835mRNA.NM—000107损伤特异性DNA结合蛋白2,48kDa(DDB2),mRNA.0,01150212画一002250钾中间体/小电导钩激活的通道，亚家族N,成员40,01152414(KCNN4),mRNA.AK0卯685cDNAFU33366fis,克隆BRACE2005556.0,01153615NM一030574含START结构域5(STARD5),mRNA.0,01156016NM—138784假定蛋白BC014341(LOC116123),mRNA.0,01157039醒—005164ATP-结合框，亚家族D(ALD)，成员2(ABCD2)，mRNA.0,01195099AK000899cDNAFLJ10037fis，克隆HEMBA1000968.0,01198594NM—024068假定蛋白MGC2731(MGC2731),mRNA.0,01220686AK093573cDNAFLJ36254fis,克隆THYMU2002157.0,01246125NM_017682卵黄样黄斑萎缩2样蛋白1(VMD2L1),mRNA.0,01249753NM—005585MAD,母体抗decapentaplegic同源物6(果蝇)(MADH6),0,01253313mRNA.NM—007055聚合酶(RNA)III(定向于DNA)(155kD)(RPC155),0,01256894mRNA.NM—024312MGC4170蛋白(MGC4170),mRNA.0,01260496NM—016305染色体18上的滑膜肉瘤异位基因样2(SS18L2),mRNA.0,01264118BC030750克隆IMAGE:4795773,mRNA.0,01267761NM_006067C0X4的近邻(N0C4),mRNA.0,01270932AF506819URBmRNA,完整cds.0,01271425雨一l52299假定蛋白384D8_6(384D8-2)，mRNA.0,0127453339基因IDNM—005570AB032983NM—016614AK097377AL122071AK095100NM—002225丽一030790NM—001145NM—0I4548NM—014747画—012477U05597NM—016400NM—024855AL833742NM—033118NM—003283AL832954NM一08643NM_016073AF130090AK000777NM—004407BC039263CA314483画053286说明(表l)凝集素，甘露糖结合，1(LMAN1),mRNA.KIAA1157蛋白的mRNA,部分cds.TRAF和TNF受体相关蛋白(TTRAP)，mRNA.cDNAFLJ40058fis,克隆TCOLN1000180.校正的j3-值0,012882550,012918740.012955130,01298086mRNA，cDNADKFZp434H1235(来自克隆0,01301681DKFZp434H1235)cDNAFLJ37781fis，克隆BRHIP2027054.0,01305297异戊酰辅酶A脱氢酶(IVD),核基因编码线粒体蛋白，0,01308933mRNA.T-细胞免疫调节蛋白(CDA08),mRNA.0,01312589血管生成素，核糖核酸酶，RNA酶A家族，5(ANG),0,0134382mRNA.原肌球调节蛋白2(神经元的)(TMOD2),mRNA.0,01345882KIAA0237基因产物(KIAA0237)，mRNA.0,01347442WW结构域结合蛋白1(WBP1),mRNA.0，0134959阴离子交换蛋白3心脏同工型(cAE3)mRNA,部分cds.0,01351084Huntingtin相互作用蛋白K(HYPK),mRNA.0,01354745假定蛋白FLJ12785(FLJ12785),mRNA.0,01358427mRNA,cDNADKFZp666E186(来自克隆0,01362128DKFZp666E186).肌球蛋白轻链激酶2,骨骼肌(MYLK2),mRNA.0,01363364肌钙蛋白T1，骨骼的，慢(TNNT1),mRNA.0,0136585mRNA,cDNADKFZp666M1310(来自克隆0,01367019DKFZp666M1310).骨髓细胞上表达的触发受体1(TREM1),mRNA.0,01369592可能是小鼠肝细胞瘤衍生的生长因子的直向同源物，相0,01386387关蛋白(HDGFRP3),mRNA.克隆FLB9530PRO2574mRNA,完整cds.0,01405557cDNAFLJ20770fis,克隆COL06509.0,01409295牙本质基质酸性磷蛋白(DMPl)，mRNA.0,0140964类似于谷氨酸受体，离子型，S1克隆MGC:338690,0141333IMAGE:5273869,mRNA,完整cds.UI-CF-FN0-afh-g-23-O-UI.slUI-CF-FNOcDNA克隆0,01417039UI-CF-FN0-afh-g-23-0-Ul3',mRNA序列.水通道蛋白6，肾特异性(AQP6)，转录变体2,mRNA.0,01420768<table>tableseeoriginaldocumentpage41</column></row><table>基因ID说明(表1.)校正的|>值mRNA.输入蛋白9(FLJ10402),mRNA.0,01517769GTP结合蛋白5(推定的)(GTPBP5),mRNA.0,01519306PM0-HT0339-081199-001-aOlHT0339cDNA,mRNA序0，01521435列.含Rho相关的BTB结构域3(RHOBTB3),mRNA.0,01523039染色体10可读框2(C10orf2),mRNA.0,01525119含三分基序29(TRIM29),转录变体1，mRMA.0,01526791朊病毒蛋白(p27-30)(Creutzfeld-Jakob病，0,01527138Gerstmann-Strausler-Scheinker综合征，致死性家族性失眠症)(PRNP),mRNA.多聚免疫球蛋白受体(PIGR),mRNA.0，0152882锌指蛋白223(ZNF223),mRNA.0,0153254克隆IMAGE:3621749,mRNA,部分cds.0,01532715氯通道，辆激活的,家族成员1(CLCA1),mRNA.0,01536278MR0-ST0019-290999-002-fl)3ST0019cDNA，mRNA序0,01536338列.cDNAFLJ13457fis,克隆PLACE1003343.0,01539979假定蛋白FLJ20174(FU20174),mRNA,0,01540034nephroncjphthisis4(NPHP4)'mRNA.0,01543637硫酸乙酰肝素6-0-磺基转移酶2(HS6ST2),转录变体S,0,01545358mRNA.EST382215MAGE重新排序，MAGKcDNA，mRNA序0,01547312列.nudix(二磷酸核苷连接的部分X)-型基序1(NUDTl),0,01548986mRNA.过氡化物酶体生物发生因子7(PEX7),mRNA.0,01552631溶质载体家族21(有机阴离子转运蛋白)，成员120,01611827(SLC21A12),mRNA.类似于假定蛋白FLJ20897(LOC196549)，mRNA.0,01620044KIAA1764蛋白，克隆MGC:26917IMAGE:4837403,0,01623803mRNA,完整cds.克隆IMAGE:5302158，mRNA.0,01627579FEV蛋白(HSRNAFEV),mRNA.0,01628117asporin(l类LRR)(ASPN),mRNA.0,01631373醒一O18085NM—015666AW382764画一O14899NM—021830NM—01210醒000311NM—002644画一O13361BC002782NM—001285AW386993AK023519NM_017699画_015102NM—147175AW970134NM—002452丽一000288NM_016354訓—145293BC030701BC039414NM_017521画017680基因id说明，q...AA195192zr34g08.rlSoares—NhHMPu—S1cDNA克隆0,0163186IMAGE:6653425',mRNA序列.AK098553cDNAFLJ25687fis，克隆TST04292.0,01632327NM_000773细胞色素P450,亚家族IIE(乙醇诱导型)，多肽10,0163562(CYP2E1),mRNA.NM—139033促分裂原激活的蛋白激酶7(MAPK7),转录变体1,0,01636036mRNA.NM—031472假定蛋白MGCU134(MGC11134),mRNA.0,01639397AK025758cDNA:FU22105fls,克隆HEP17660,0,01639763AF131834克隆24841mRNA序列.0,01643507NM_025194肌醇1,4,5-三裤酸3-激酶C(ITPKC),mRNA.0,01647268NM—144971假定蛋白MGC26641(MGC26641),mRNA.0,0711367BQ921112AGENCOURT一8926187NIH—MGCJ01cDNA克隆0,0171523IMAGE:64630135',mRNA序列.AK024356cDNAFLJ14294fis,克隆PLACE1008181.0,01719111NM—152340假定蛋白FLJ3卯75(FLJ3卯75),mRNA.0,01726114BC036419克隆IMAGE:4797520,mRNA.0,01729993AF257167肠粘蛋白2.1(MUC2)mRNA,部分cds.0,01736846NM—004172溶质载体家族1(神经胶质高亲和力谷氨酸转运蛋白)，成0,01740723员3(SLC1A3)，核基因编码线粒体蛋白，mRNA.AL833444mRNA,cDNADKFZp313M0542(来自克隆0,01744617DKFZp313M0542).NM—152760假定蛋白FLJ30934(FLJ30934),mRNA.0,01755202NM—138573神经调节蛋白4(LOC145957),mRNA,0,01768205BG107100602291004F1NIH_MGC—85cDNA克隆0,01772074IMAGE:43857125',mRNA序列.画—032833蛋白磷酸酶1,调节性(抑制物)亚基15B(PPP1R15B)，0,01775961mRNA.NM—002497NIMA(从不出现在有丝分裂中的基因A)相关的激酶20,01779864(NEK2),mRNA.NM—005651色氨酸2,3匿双加氧酶(TD02),mRNA.0,0178225NM—000669醇脱氢酶1C(I类)，y多肽(ADHlC)，mRNA.0,01783784NM—02519S转录终止因子样蛋白(LOC80298)，mRNA.0,01786133BC039527克隆IMAGE:5742065,mRNA.0,01787722BC022423克隆IMAGE:4247831,mRNA.0,01791677430,01795650,017983560,018000760，018022150,01804308隆0,01806090，018081470,01809983基因id说明(表i)....................然正e.E:iLNMJH3443CMP-NeuAC邻)-N-乙酰氨基半乳糖苷(a)2，6-唾液酸转0,01794513移酶成员VI(ST6GALNAC6),mRNA.AK091117cDNAFLD37兆fis,克隆CTONG2000063.NM—144676假定蛋白MGC23911(MGC239U)，mRNA.NM_022914假定蛋白24432(24432),mRNA.NM—003847过氣化物酶体生物发生因子11A(PEX11A)，mRNA.AK025703cDNA:FLJ22050fis，克隆HEP09454.BG822407602725454F1NIH—MGC—15cDNA克IMAGE:48650535',mRNA序列.NM—145284类似于假定蛋白MGC17347(LOC15卯90)，mRNA.U44954NMDA受体谷氨酸结合链(hnrgw)mRNA,部分cds.AL832540mRNA,cDNADKFZp547A0117(来自克隆0,01812002DKFZp547A0117).BC040627克隆IMAGE:5745252,mRNA.0,01813892AK094649cDNAFLJ37330fis,克隆BRAMY2019509.0,01817818AB053318ALS2CR16mRNA,完整cds.0,01821672NM—000310棕榈轨-蛋白疏酯酶I(蜡样脂-脂褐质沉积症，神经元，0,01827366嬰儿的)(PPTl),mRNA.AF327347DnaJ蛋白SB73mRNA,完整cds.NM—019006与PRK1相关的蛋白(AWP1),mRNA.NM—138340含abhydrolase结构域3(ABHD3),mRNA.NM—025098假定蛋白FLJ22644(FLJ22644),mRNA.NMJ52583假定蛋白MGC40053(MGC40053),mRNA.AK075564cDNAPSEC0264fis，克隆NT2RP3002337.NM—016013CGI-65蛋白(CIA30),mRNA.BC040卯1克隆IMAGE:5743779'mRNA.NM—032744假定蛋白MGC12335(MGC12335),mRNA.NM—015446ELYS转录因子样蛋白TMBS62(elys)，mRNA.NM—006850白介素24(IL24),mRNA.NM—152460假定蛋白FLJ31882(FLJ318S2),mRNA.NM_004657血清剥夺反应(磷脂酰丝氨酸结合蛋白)(SDPR),mRNA.NMJB2848假定蛋白FLJ14827(FLJ14827),mRNA.NM_002759蛋白激酶，千扰素请导型双链RNA依赖性(PRKR),0,01995569mRNA.0,018312130,018350760,018389560,018746250,018785390,018824690,018864150,019417580,019457790,019498150,019538690,019583730,019749140.0199138644基因ID说明，1.)然.正的丄:且NM—000322视网膜变性，慢(色素性视网膜炎7)(RDS)，mRNA.0,019996NM—033280类似于信号肽酶复合物(18kD)(LOC卯701)'mRNA.0,02003648NM—030W2含三分基序8(TRIM8),mRNA.0,02003691NM—002896RNA结合基序蛋白4(RBM4),mRNA.0,02007712BI005815MR4-HN0058-250401-002-cOSiHN0058cDNA,mRNA序0,02007797列.AF055007克隆24707mRNA序列.0,02011793AK022434cDNAFLJ12372fis,克隆MAMMA1002446.0,0201589NM一012332可能是小鼠酰基辅酶A硫酯酶2的直向同源物，线粒0,02020004体(ACATE2),mRNA.NM—020404肿瘤内皮标记物1前体(TEMl)，mRNA,0,02023169AL080129mRNA，cDNADKFZp434D193(来自克隆0,02023645DKFZp434D193)NM一014950KIAA0997蛋白(KIAA0997),mRNA.0,02027152NM—014420dickkopf同源物4(非洲爪蟾)(DKK4),mRNA.0,02027709NM—000901核受体亚家族3，C组，成员2(NR3C2),mRNA.0,0203115AK024101cDNAFU14039fis,克隆HEMBA1005472.0,02031789BC041405克隆IMAGE:5284125，mRNA.0,02035164NM—013368RPA结合反式激活物(RBTl)，mRNA.0,02039194NM—004112成纤维细胞生长因子11(FGF11),mRNA.0,02039592NM—002839蛋白酪氨酸磷酸酶，受体型，D(PTPRD)，转录变体1,0,0204324mRNA.AW178737IL5-H丁0118-070999-001-H09HTO118cDNA，mRNA序0,02047302列.AB067497KIAA1910蛋白的mRNA,部分cds.0,02051381NMJ53498CamKI样蛋白激酶(CKLiK)，转录变体2，mRNA.0,02055475NM_024522假定蛋白FLJ12650(FLJ12650),mRNA.0,02095733NM—014376细胞质的FMR1相互作用蛋白2(CYFIP2)，mRNA,0,02099771NM一052904KIAAI900蛋白(KIAAI卯O),mRNA.0,02103824AB033O5OKIAA1224蛋白的mRNA,部分cds.0,02107894NM_000425LI细胞粘附分子(脑积水，Sylvius1导致的导水管狭窄，0,02111979MASA(智力迟钝，失语症，拖曳步态和拇指内翻)综合征，痉挛性截瘫l)(UCAM),转录变体l，mRNA.NMJ52613假定蛋白MGC26816(MGC26816),mRNA.0,0211608NM—016552睾丸特异性锚蛋白样蛋白1(LOC51281),mRNA.0,0211722445基因ID说明(表1)校正的直NM—004368钙调理蛋白2(CNN2)，mRNA.0,02120197画一O14047HSPC023蛋白(HSPC023),mRNA.0,02124329AK027183cDNA:FU23530fis,克隆LNG06055.0,02128479NM—003594转录终止因子，RNA聚合酶ll(TTF2),mRNA.0,02130092NM_003061裂缝同源物1(果蝇)(裂缝1)，mRNA.0,02132644NM—002267核周蛋白a3(输入蛋白a4)(KPNA3),mRNA.0,0216432NM_005637滑膜肉瘤异位，染色体1S(SS18),mRNA.0,02194216NM—024050假定蛋白MGC2594(MGC2594)，mRNA.0,02198411NM—138933apobec-1互补因子(ACF),转录变体3，mRNA.0,02204884刚—002435磷酸甘露糖异构酶(MPI),mRNA.0，0220卯84BQ014489UI-H-EDl-axt-o-07-0-UI,slNCI—CGAP—EDIcDNA克隆0,02215466IMAGE:58335663'，mRNA序列.画—005161血管紧张素II受体样l(AGTRLl),mRNA.0,0221967NM一000983核糖体蛋白L22(RPL22),mRNA.0，02225%8NM_021910含离子转运调节物的FXYD结构域3(FXYD3)，转录变0,02230176体2,mRNA.AK022111cDNAFLJ12049fis，克隆HEMBB10019%.0,02240608NM—004219垂体肿瘤转化1(PTTG1),mRNA.0,0233409NM—006868RAB31,成员RAS癌基因家族(RAB31),mRNA.0,02335983BC033667克隆IMAGE:510701,mlWA.0:02337195NM—015198K1AA0633蛋白(COBL),mRNA.0,02338389AK096389cDNAFLJ3卯70fis,克隆NT2RP7015676.0,02340358AK075059cDNAFL簡78fis,克隆OVARC1002178.0,02341539NM—000135范可尼贫血，互补A组(FANCA),mRNA.0,02342703NM_000221已酮糖激酶(杲糖激酶)(KHK),转录变体a,mRNA.0,02344749BC037864克隆IMAGE:5272804，mRNA.0,02345899BQ900993AGENCOURT—8585098L叩ski—交感神经干cDNA克隆0,02347033IMAGE:61924095',mRNA序列.AK000930cDNAFLJ濯68fis,克隆HEMBA1001533.0，023楊56丽—015512DKFZP434A236蛋白(DKFZP434A236),mRNA.0,02349156NM一153338假定蛋白FLJ90165(FLJ90165),mRNA.0,02350276BC012852类似于RIKENcDNA4930433D19基因，克隆MGC:98110,0235138IMAGE:3860705,mRNA,完整cds.NM—006229胰脂肪酶相关的蛋白1(PNLIPRP1),mRNA.0,02362165BF332972MR1-BT0796-160600-001-c02BT0796cDNA,mRNA序0,02430956基因ID说明^表1)_...校正的p^直列.NM—013438u遍在蛋白1(UBQLN1),转录变体l,mRNA.0,02444768CA426336UI-H-DF0-bek-n-06-0-UI.slNCI—CGAP_DF0cDNA克0,02454055隆UI-H-DFO-bek-n-06-0-UI3'，mRNA序列.NM—02U27佛波醇-12-豆蔻酸-13-乙酸诱导的蛋白1(PMAIPl),0,02454381mRNA.AK023734cDNAFU13672fis,克隆PLACE1011749.AK056150cDNAFLJ31588fis,克隆NT2RI2002252.Z34278(JER58)MUC5AC粘蛋白的mRNA(部分).NM一021101密蛋白1(CLDNl)，mRNA.NM—052965染色体1可读框19(Clorfl9)，mRNA.BC028630类似于推定的，克隆MGC:33835IMAGE:5262164mRNA,完整cds.AF147791粘蛋白11(MUCll)mRNA,部分cds.AK001130cDNAFLJ10268fis，克隆HEMBB訓觀,弱类似于神0,02512964经元的线状蛋白AD7c-NTPmRNA.AK093095cDNAFU35776fis，克隆TEST12005326.0,02521857NM—015438中间丝样MGC:2625(DKFZP586I2223),转录变体1,0,02548512mRNA.BC039385克隆IMAGE:5298460，mRNA.0,02553063NM_004156蛋白磷酸酶2(formerly2A),催化亚基，卩同工型0,02561765(PPP2CB),mRNA.NM—003731千燥综合征细胞核自身抗原1(SSNA1),mRNA.0,02574443AL122070mRNA,cDNADKFZp434E0535(来自克隆0,02578991DKFZp434E0535)NM—0246U类似于NMDA受体调节的基因2(小鼠)(FLJ11896),0,02582963mRNA.NM一022754sideroflexin1(SFXN1),mRNA.0,02583556NM—014902KIAA0964蛋白(KIAA0964),mRNA.0,02587511BQ312908PM4-BN0143-0106OO-0O3-hO3BN0143cDNA,mRNA序0,02588137列.NM一015469DKFZp564D177蛋白(DKFZp564D177),mRNA.0,02592734NM—005415溶质栽体家族20(磷酸转运蛋白)，成员1(SLC20A1),0,0259597mRNA.NM一006271S100钙结合蛋白Al(S100A1)，mRNA.0，026043760,024585250,024588190,024632740,024677440,024679770,024994980,0250846147基因ID说明(表I).................................然￡^..二！BC041626克隆MGC:523941MAGE:4554923,mRNA,完整cds.0,02608937NM—016646间质千细胞蛋白DSCD28(LOC51336),mRNA.0,02617278J05581多形性上皮粘蛋白(PEM)mRNA,完整cds.0,02629234AB033070KIAA1244蛋白的mRNA,部分cds.0,02630134BC015977克隆IMAGE:4042121,mRNA,部分cds.0,0263379NM_004869空泡蛋白分选4B(酵母)(VPS4B),mRNA.0,02638363NM_0044%叉头框Al(FOXA1),mRNA.0,02641959NM_025042Williams-Beuren综合征染色体区23(WBSCR23),mRNA.0,02642951NMJ45691ATP合酶线粒体Fl复合物组装因子2(ATPAF2),核基0,02650478因编码线粒体蛋白，mRNA.NM一005451emgma(LIM结构域蛋白)(ENIGMA),mRNA.0,02652531NM—030763核小体结合蛋白1(NSBP1),mRNA.0,0265464AJ292079MUC5AC蛋白的部分mRNA(粘蛋白基因，MUC5AC).0,02654933NM—152369假定蛋白MGC45474(MGC45474),mRNA.0,02657049BC03卯98类似于桥粒芯蛋白3(寻常性天疱疮抗原)，克隆0，026581321MAGE:4822945,mRNA,部分cds—NM—139279神经千细胞衍生的神经元存活蛋白(SDNSF),mRNA.0,02658331NM—005154遍在蛋白特异性蛋白酶8(USP8)，mRNA.0,02659402NM—080476CDC91细胞分裂周期91样1(啤酒糖酵母)(CDC91L1),0,02661584mRNA.NM—006812在骨肉瘤中扩增的(OS-9),mRNA.0,02662699AL833081mRNA,cDNADKFZp451J1719(来自克隆0,02662784DKFZp451J1719).NM—012280FtsJ同源物1(大肠杆菌)(FTSJ1),mRNA.0,02663887NM—025137假定蛋白FIJ21439(FLJ21439),mRNA.0,02666133NM—004929钙结合蛋白1,28kDa(CALB1),mRNA.0,02667282NM一000177凝溶胶蛋白(淀粉样变性，Finnish型)(GSN)，mRNA.0,02668387AF074988全长插入cDNAYH78H07.0,02670699BC036321克隆IMAGE:4837485,mRNA.0，02672%2NM一005362黑素瘤抗原,家族A,3(MAGEA3),mRNA.0,02677432NM—004056碳酸酐酶VIII(CA8),mRNA.0,02681978NM—003091小的细胞核核糖核蛋白多肽B和Bl(SNRPB),mRNA.0,02687277BC039324克隆IMAGE:5267076'mRNA.0,02698134丽004252溶质栽体家族9(钠/氢交换蛋白)，同工型(SLC9A3R1),mRNA.调节因子10,0269946<table>tableseeoriginaldocumentpage49</column></row><table>基因IDNM—012483BF998244NM—000662NM—022444NM一031284AK0555卯NM—007243NM—032828BC004287NM_001062NM—001609画_152313AB051475画—018473NM一021158NM—015541AF289596BC041376NM000295NM—007019NM—015141AK025765NM—153246画_004369NM—002257AK025311说明〖表i)，..生正.的,p:li.颗粒溶素(granulysin)(GNLY)，转录变体519,mKNA.0,0297409MR2-GN0158-101100-004-c01GN0158cDNA,mRNA序0,02977459列.N-乙酰转移酶1(芳基胺N-乙酰转移酶)(NAT1)，mRNA.0,02982133溶质栽体家族13(钠/硫酸盐共运输蛋白(sodium/sulfate0,0298378symporters)),成员I(SLC13A1)，mRNA.假定蛋白DKFZp434B195(DKFZP434B195),mRNA.0,0298402cDNAFLJ31028fis，克隆HLUNG2000570:弱类似于40S0,02985185核糖体蛋白S10.nurim(核包膜蛋白)(NRM),mRNA.0,02985406遍在蛋白UBF-fl(UBF-fl),mRNA.0,02986822克隆IMAGE:3618365,mRNA.0,02988449钴胺传递蛋白I(维生素B12结合蛋白，R结合物家族)0，02988618(TCN1),mRNA.酰基辅酶A脱氬酶，短/分支链(ACADSB),核基因編0,029卯056码线粒体蛋白，mRNA.假定蛋白FLJ38932(FU38932),mRNA,KIAA1688蛋白的mRNA,部分cds.未表征的下丘脑蛋白HT012(HT012),mRNA.染色体20可读框97(C20orf97)，mRNA.富含亮氨酸的重复序列和免疫球蛋白样结构域10,02996245(UUG1),mRNA.克隆pp7882未知mRNA.0,02996294类似于假定蛋白5830442F04,克隆MGC:438950,02997856IMAGE:5274634,mRNA,完整cds.丝氨酸(或半胱氨酸)蛋白酶抑制剂，进化枝A(a-1抗0,03002497蛋白酶，抗胰蛋白酶)，成员1(丝氨酸蛋白酶抑制蛋白Al),mRNA.遍在蛋白缀合酶E2C(UBE2C),mRNA.KIAA0089蛋白(KIAA0089),mRNA.cDNA:FU22112fis,克隆HEP18319.假定蛋白MGC45491(MGC45491),mRNA.胶原，VI型，a3(COL6A3)，转录变体l,mRNA.激肽释放酶1，肾/胰腺/唾液(KLK1),mRNA.cDNA:FLJ21658fis，克隆COL08688.0,029915260,029916480,02993230,029947210,030070340,030101490,030116320:030162440:030205450,03020870,0302511550基因id说明(表i)然.f.的P.:llNM—020139氧化还原酶UCPA(LOC56898),mRNA.0,03028312NM一138818假定蛋白BC01卯95(LOC158471),mRNA.0,03029699NM—024725假定蛋白FLJ23518(FLJ23518),mRNA.0,03031068Z34281(MARIO)MUC5AC粘蛋白的mRNA(部分).0,03032928NM一016641RGS16的膜相互作用蛋白(MIR16),mRNA.0,03034296NM一016479scotin(SCOTIN),mRNA.0,03038卯7NM—005011核呼吸因子1(NRF1),mRNA.0,03092476NM一000410血色病(HFE),转录变体l，mRNA.0,03097126NM—002097通用转录因子HIA(GTF3A),mRNA.0,03101791NM—006930S期激酶相关蛋白1A(pl9A)(SKP1A),转录变体1,0,03102828mRNA.NM一021095溶质栽体家族5(钠依赖性维生素转运蛋白)，成员60,03113148(SLC5A6),mRNA.BC008I15,克隆MGC:16981IMAGE:2卯0378,mRNA,完整cds.0,03138386BC017428,克隆IMAGE:4703783,mRNA.0,03169009AK056929cDNAFLJ32367fis.克隆PUAEN1000239.0,03173732NM—152535假定蛋白FLJ31131(FLJ31131),mRNA.0,03178469NM一032316,lml(NICNl),n個A.0,03194013NM一032287假定蛋白DKFZp761017121(DKFZp761017121),0,03243796mRNA.NM—004760丝氨酸/苏氨酸激酶17a(诱导凋亡)(STK17A),mRNA.0,03283367AF339814克隆1MAGE:32106,mRNA序列.0,0331792N23022yx65el2.slSoares黑素细胞2NbHMcDNA克隆0,03322821IMAGE:2666383',mRNA序列，BC029776类似于CG12393基因产物，克隆IMAGE:5188623，0,03327757mRNA,部分cds.BC032716克隆MGC:45425IMAGE:5518697,mRNA，完整cds.0,03327802NMJ)01453叉头框C1(F0XC1),mRNA.0,03332667NMJM)5060RAR相关的孤独受体C(RORC),mRNA.0,03337546AW510657hc89b09.xlSoares—NFL—T_GBC_S1cDNA克隆0,03337569IMAGE:29071613',mRNA序列.NM—006733FSH主要反应(LRPR1，大鼠)同源物1(FSHPRH1)，0,0334244mRNA.NM_004037—磷酸腺普脱氨酶2(同工型L)(AMPD2)，mRNA.0,03347092NMJ52705假定蛋白MGC9850(MGC9850)，mRNA.0,0334734851基因ID说明，1)校正^.p-值NMJ52320假定蛋白FU31295(FLJ31295),mRNA.0,03351929AK001604cDNAFLJ10742fis,克隆NT2RP3001629.0,0335678U55105分离的HR035T细胞受体V-(3互补决定区3mRNA,部0,03361397分cds.AL833538mRNA,cDNADKFZp686DI23(来自克隆0,03361645DKF2p686D123).NM—0227卯基质金属蛋白酶19(MMP19)，转录变体rasi-3，mRNA.0,03361773NM_000433中性粒细胞胞质溶胶因子2(65kDa,慢性肉芽肿病，常染0,03366233色体2)(NCF2),mRNA.NM—018211假定蛋白FL]10770(KIAA1579),mRNA.0,03366524NM—003940遍在蛋白特异性蛋白酶13(异肽酶T-3)(USP13),mRNA.0,03366674AK094894cDNAFLJ37575fis，克隆BRCOC2003125,中度类似于0,03370917丙糖磷酸异构酶(EC5.3丄1).NM—033542染色体20可读框169(C20orfl69),mRNA.0,03371084NM一002165DNA结合的抑制物1,显性失活的螺旋-环-螺旋蛋白0,03371417(ID1),mRNA.BG192666RST11783AthersysRAGE文库cDNA,mRNA序列.0,03380414NM—012421重排的L-myc融合序列(RLF)，mRNA.0,0343279BF242982601877758F1NIH—MGC—55cDNA克隆0,03446119IMAGE:41060555',mRNA序列.NM一000183羟基酰基辅酶A脱氢酶/3-酮脂酰-辅酶A<6充解酶/烯酰辅0,03446605酶A水合酶(三功能蛋白)，P亚基(HADHB),mRNA.NM—000682肾上腺素能，a-2B-，受体(ADRA2B),mRNA.0,034505UNM—003022结合SH3结构域的富含谷氨酸的蛋白样(SH3BGRL),0,03451014mRNA.AK056047cDNAFLJ31485fis，克隆NT2NE2001698.0,03451522NM—020188DC13蛋白(DC13),mRNA.0,03454365NM—052947心脏a-激酶(HAK)，mRNA.0,03455398NMJ44704假定蛋白FLJ30473(FLJ30473)，mRNA.0,03455923AK024933cDNA:FLJ21280fis,克隆COL01884.0,03456453AK027I07cDNA:FLJ23454fis,克隆HSI06959,0,03459224BF0562457k03b03.xlNCI—CGAP—GC6cDNA克隆0,03459761IMAGE:34432603'，mRNA序列.NM—014241蛋白酪氨酸磷酸酶样(脯氨酸代替催化性精氨酸)，成员0,03463541a(PTPLA),mRNA.基因ID说明.(表1>.............NM—000577白介素1受体拮抗剂(IL1RN),mRNA,0,03464096AB006909A型小眼相关转录因子的mRNA,完整cds.0,03468982NM—005622SA高血压相关同源物(大鼠)(SAH)，mRNA.0,03500699BC033549克隆1MAGE:4826963,mRNA.0,03545883AK094613cDNAFIJ37294fis,克隆BRAMY2015211.0,03549913BC030557克隆MGC:40430IMAGE:5218944,mRNA,完整cds.0,03550822BG460041RST42470AthersysRAGE文库cDNA,mRNA序列.0,03551739NM—005981肉瘤扩增的序列(SAS),mRNA.0,03554843NM—004819symplekin,Huntingtin相互作用蛋白I(SPK),mRNA.0,03555774AK074657cDNAFLJ90176fis,克隆MAMMA1000528.0,0356074NM—017423UDP-N-乙酰-a-D-半乳糖胺多肽N-乙酖氨基半乳糖基0,03613069转移酶7(GalNAc-T7)(GALNT7),mRNA.NM—153446卩1,4N-乙酰氨基半乳糖基转移酶(B4GALT),mRNA.0,03618059NM_018043假定蛋白FLJ10261(FLJ10261),mRNA.0,03621866NM—145059L-岩藻糖激酶(FUK),mRNA.0,03628082BC030133类似于黏结蛋白聚糖2(硫酸乙酰肝素蛋白聚糖1，细胞0，0367413表面相关的，纤维聚糖)，克隆IMAGE:4138627,mRNA.NM—004237甲状腺素受体相互作用物13(TRIP13),mRNA.0,03675532NM—016063CG1-130蛋白(CGI-130),mRNA.0,03679156BC039474克隆IMAGE:5528009,mRNA.0,03684196AK056395cDNAFLJ31833fis,克隆NT2RP6000130.0,03685644NM—080658天冬氨酸酰基转移酶-3(ACY-3),mRNA.0,03696394NM—031413猫眼综合征染色体区，候选物2(CECR2)，mRNA.0,03703465NM—004613转谷氨酰胺酶2(C多肽，蛋白-谷氨酰胺卞谷氨酰胺酰转0,03708497移酶)(TGM2)，mRNA.BC039181，类似于二酰基甘油O-酰基转移酶2,克隆0,03711993IMAGE:4746146,mRNA.NM—006732FBJ鼠骨肉瘤病毒癌基因同源物B(FOSB),mRNA.0,03713543NM—013248NTF2样输出因子1(NXT1),mRNA.0,03718602NM—033664钙扭着蛋白11,2型，OB-钙黏着蛋白(成骨细胞)0,0373403(CDH11),转录变体2，mRNA.AK026195cDNA:FLJ22542fis,克隆HSI00，96.0,0374925AK094771cDNAFLJ37452fis,克隆BRAWH2010618.0,03750938NM一015367BCL2样13(凋亡促进物)(BCL2L13),核基因编码线粒0,03752564体蛋白，mRNA.<table>tableseeoriginaldocumentpage54</column></row><table>基因ID说明^表1〗.............................生正的P-JLHOMEOBOX蛋白MEIS3.NM—021809TGFB诱导的因子2(TALE家族同源框)(TGIF2),mRNA.0,03883093NM_022082染色体20可读框59(C20orf59),mRNA.0,03885233NM_001979环氧化物水解酶2，细胞质的(EPHX2),mRNA.0,0388811NM_02408，跨膜'Y-羧基谷氨酸蛋白4(TMG4),mRNA.0,03卯3858AF147359全长插入cDNA克隆YB62B07.0,03卯447AK093330cDNAFLJ36011fis,克隆TESTI2015947.0，03卯6672NM—130847血管动蛋白样1(AMOTL1),mRNA.0,03909476NM—144641假定蛋白FLJ32332(FLJ32332),mRNA.0,039117NMJM5079KIAA1055蛋白(KIAA1055),mRNA.0,03914494NM—016291哺乳动物肌醇hexakisphosphate激酶2(IP6K2)，mRNA.0,03950616NM—004872染色体1可读框8(Clorf8),mRNA.0,03960992NM—001647栽脂蛋白D(APOD),mRNA.0,03966045NM—006630锌指蛋白234(2NF234),mRNA.0,03971INM—013330NME7(NME7)，mRNA.0,03983976NM—005940基质金属蛋白酶11(溶基质蛋白酶3)(MMPll)，mRNA.0,03986544NM—025卯KIAA1641蛋白(KIAA1641),mRNA.0,03989038BM927308AGENCOURT—66885%NIH—MGC—121cDNA克隆0,03991597IMAGE:57683005',mRNA序列.NM—033405过氧化物酶体增殖或激活的受体A相互作用复合物2850,03994113(PRIC285),mRNA.Y14488含SHMT同源性的推定的14kD蛋白的mRNA,克隆0,04006785pUS215.NM_020240非激酶Cdc42效应蛋白SPEC2(SPEC2)，mRNA.0:04018803NM—032709假定蛋白MGC13047(MGC13047),mRNA.0,04023734NM_0022%核纤层蛋白B受体(LBR),mRNA.0,04028677Y1673HIV相关的非何杰金淋巴瘤的mRNA(克隆hll-5).0,04033632NM—014684KIAA0373基因产物(KIAA0373),mRNA.0,040386BE501771hw35a01.xlNCI—CGAP_Kidl1cDNA克隆0,04039597IMAGE:31848723',mRNA序列.NM—006833COP9亚基6(MOV34同源物，34kD)(COPS6),mRNA.0,0404358NM—016042外来体成分Rrp40(RRP40),mRNA.0,04048572AI652393wb20fD2.xlNCI—CGAP—GC6cDNA克隆0,04053576IMAGE:23062353',mRNA序列.NM—017702假定蛋白FLJ20186(FLJ20186),mRNA.0,0405859355基因ID说明(表1)校正的p-值BM918075AGENCOURT_6611357NIH_MGC_106cDNA克隆0,04059716IMAGE:54854425',mRNA序列.BC037917,克隆IMAGE:5277954,mRNA.0,04062836BU957874AGENCOURT—10625720NIH_MGC—141cDNA克隆0,04063622IMAGE:67319865',mRNA序列.NM—144660假定蛋白FLJ25082(FLJ25082),mRNA.0,04068664NM—004403聋，常染色体显性5(DFNA5),mRNA.0,04073718丽—003859多辟醇磷酸甘露糖基转移酶多肽1,催化亚基(DPMl)，0,04074186mRNA.NM—031966细胞周期蛋白Bl(CCNBI)，mRNA.0,04078785AF210651NAG18(NAG18)mRNA,完整cds.0,04079285AL832390mRNA，cDNADKFZp667H2012(来自克隆0,04083864DKFZp667H2012).AK096306cDNAFLJ38987fis,克隆NT2R12005818.0,04084397BU509077AGENCOURTJ0100056NIH—MGC—71cDNA克隆0,04088956IMAGE:65036215'，mRNA序列.丽—032387蛋白激酶，赖氨酸缺陷4(PRKWNK4),mRNA.0,04089522AB046786KIAA1566蛋白的mRNA,部分cds.0,04092379AK091592cDNAFLJ34273fis,克隆FEBRA2003181.0,04094061丽一O18593溶质我体家族16(单羧酸转运蛋白)，成员100,0409466(SLC16A10),mRNA.NM—006392核仁蛋白5A(56kDa，具有KKE/D重复)(NOL5A),0,0409981mRNA.AF161414HSPC296mRNA,部分cds.0,04106758AJ489592糖基化依赖性细胞粘附分子1的mRNA(GLYCAM1基0,04211612因)，分离的KHcl5.NM—018293假定蛋白FLJ0997(FLJ10997),mRNA.0,04220568NM—005877剪接因子3a，亚基l，120kDa(SF3Al),mRNA.0,04225709NM—014172磷酸组氨酸磷酸酶(PHP14),mRNA.0,04230862NM—031299可能是富含小鼠基因的簇的直向同源物，C8基因0,04255496(GRCC8),mRNA.BU737015UI-E-DW0-agh-g-01-0-UI.s2UI-E-DW0cDNA克隆0,04260648UI-E-DWO-agh-g-01-0-UI3',mRNA序列.NM—002158T细胞淋巴瘤病毒增强因子(HTLF),mRNA.0,04264032NM—002192抑制素，(BA(激活素A,激活素ABa多肽)(INHBA),0,04265812基因id说明(表i)mRNA.NM—025263CAT56蛋白(CAT56)，mRNA.0,04270989NMJ52429假定蛋白MGC39320(MGC39320),mRNA.0,04310732NM—006293TYR03蛋白酪氨酸激酶(TYR03),mRNA.0,04312389BC033243克隆IMAGE:5433475,mRNA.0,04314042NM—006283转化，含酸性巻曲的-巻曲蛋白1(TACC1),mRNA.0,04317591AK021616cDNAFLJ1554fis'克隆HEMBA1003037.0,04319234AK094421cDNAFLJ37102fis,克隆BRACE2019258.0,04320864AF191020E2IG5(E2IG5)mRNA,完整cds.0,0432767NM—004853突触融合蛋白8(STX8)，mRNA.0,04335626NM—001461含黄素的单加氧酶5(FM05)，mRNA.0,0433605NM_025212Dvl结合蛋白IDAX(Dvl和轴蛋白复合物的抑制)0,04339205(IDAX),mRNA.Z34280(JUL32)MUC5AC粘蛋白的mRNA(部分).0,04340769BQ310594MRO-BT3002-230701-205-d09BT3002cDNA,mRNA序0,04341237列.NM—018710假定蛋白DKFZp762O076(DKFZp7620076),mRNA.0,0434437NM—014262可能是富含小鼠基因的簇的直向同源物，B基因0,04345924(GRCB)'mRNA.NM—020831成巨核细胞白血病(异位)1(MKL1),mRNA.0,04346436NM_016429外被体蛋白复合物,亚基？2(COPZ2),mRNA.0,04349548BC000885克隆MGC:5619IMAGE:3462332,mRNA,完整cds.0,04354739AF183570未知mRNA.0,04365991NMJ44589假定蛋白FU23841(FIJ23841),mRNA.0,04372647NM—001100肌动蛋白，al,骨骼肌(ACTAl)，mRNA.0,04391093NM—004486高尔基体自身抗原，高尔基体蛋白亚家族a,20,04439631(GOLGA2),mRNA.NMJ38802假定蛋白BC018415(LOC130617),mRNA.0,04444867NM—012469染色体20可读框14(C20orfl4),mRNA.0,04481457NM—001957内皮缩血管肽受体型A(EDNRA)，mRNA.0,04499689NM_020233x006蛋白(MDS006),mRNA.0,04508445NM_152332染色体14可读框47(C14orf47),mRNA.0,04513718BF919368CMO-NT0131-311000-644-g09NT0131cDNA,mRNA序0,0451卯04列.NM033332CDC14细胞分裂周期14同源物B(啤酒糖酵母)0,04523724基因ID说明(表1)校正6，p-值(CDC14B),转录变体3,mRNA.pa濯，卩(PARVB),mRNA.克隆IMAGE:4589300,mRNA,部分cds.真核翻译延伸因子1a1,克隆MGC:25051IMAGE:4478650,mKNA,完整cds.脑特异性蛋白p25a(p25)，mRNA.泛醇-细胞色素c还原酶(6.4kD)亚基(UQCR),mRNA.Tho2mKNA，完整cds,X-盒结合蛋白1(XBPl)，mRNA.在卵巢癌中下调1(DOC1),mRNA.UI-E-DXl-agw-c-13-0-UI.slUI-E-DX1cDNA克隆UI-E-DX卜agw-c-13-0-UI3'，mRNA序列.mRNA,cDNADKFZp667A182(来自克隆0,04537199DKFZp667A182).a-2-糖蛋白1,锌(AZGPl),mRNA.0,04538183WW结构域结合蛋白4(形成素结合蛋白21)(WBP4)，0,04538262mRNA.具有血小板反应蛋白1型基序的解联蛋白样和基质金属0,04539255蛋白酶(reprolysin型)，2(ADAMTS2),转录变体1,mRNA.mRNA，cDNADKFZp76100117(来自克隆0,04539323DKFZp76100117).C6orf37mRNA,完整cds.0,04541387BCL2-相关的抗死亡基因5(BAG5),mRNA.0,04542444溶质栽体家族16(单羧酸转运蛋白)，成员7(SLC16A7),0,04544546mRNA.謝—013327BC033186BC019669函—007030画—006830AF441770NM—005080画一014890BM669556AL832858丽_001185醒—007187丽014244AL831866AF350451NM一004873画0047310,045243010,045287110,045289120,045296120,045319650,045330390,045339770,045341110,04536131NM一—001379DNA(胞嗜咬-5-)-曱基转移酶1(DNMT1)，mRNA.0,04546656NM-—005631平滑的同源物(果蝇)(SMOH),mRNA.0,04559088AK096208cDNAFLJ38889fis，克隆NB9N42000314.0,04564304NM-—004633白介素l受体，II型(IL1R2)，mRNA.0,04572464AK091332cDNAFLJ34013fis,克隆FCBBF2002111.0,04577672画——004616跨膜4亚家族成员3(TM4SF3),mRNA.0,04578628画——015442假定蛋白FLJ128卯(FU12890),mRNA.0,04582892画--004742BAI1相关蛋白1(BAIAP1)，mRNA.0,04588123画_—002662磷脂酶Dl,磷脂酰胆碱特异性(PLD1),mRNA.0,0459612958<table>tableseeoriginaldocumentpage59</column></row><table>基因ID说明(表1)校正的p-值画—152629假定蛋白MGC33662(MGC33662),mRNA.0'047卯25AK021691cDNAFL川629fis,克隆HEMBA1004241.0,04795072画—145654RAD52B(RAD52B),mRNA.0,04800364AK000839cDNAFU20832fis，克隆ADKA03033.0,04806942AK093454cDNAFLJ36135fis,克隆TESTI2024718.0,04823598AF088032全长插入cDNA克隆ZC24D06.0,04846192刚—003266toll样受体4(TLR4),转录变体3,mRNA.0,04851167NM—032251假定蛋白DKFZp434G0920(DKFZp434G0920)，mRNA.0,04851489画—014035SBBI31蛋白(SBBI31)，mRNA.0,04856797AF086365全长插入cDNA克隆ZD66D02.0,04862714AK098031cDNAFLJ40712fis，克隆THYMU2027249.0,04868307画—003134信号识别颗粒14kDa(同源AluRNA结合蛋白)(SRP14),0,04879975mRNA.NM—152904精子抗原HCMOGT-l(HCMOGT-l)，mRNA.0,04884769NM一138414假定蛋白BC011981(LOC112869),mRNA.0,04885262NM一152374假定蛋白FLJ38984(FLJ38984)，mRNA.0,04890326AK024457FLJ00049蛋白的mRNA，部分cds.0,04890561BC012476克隆IMAGE:4537124,mRNA,部分cds.0,04895871A譜0949cDNAFLJ33630fis,克隆BRAMY2022525.0,04939551AK055934cDNAFU31372fis,克隆NB9N42000281.0,04966748NM—005358仅LIM结构域7(LM07),转录变体1，mRNA.0，04%6817AK024118cDNAFU14056fis,克隆HEMBB1000335.0,04966888BI256572602976939F1NIH—MGC—12cDNA克隆0,04972095IMAGE:51162335',mRNA序列.AK091169cDNAFU33850fis,克隆CTONG2005615.0,04972152NM—005416富含脯氨酸的小蛋白3(SPRR3),mRNA.0,04972211M57423磷酸核糖基焦磷酸合成酶亚基IIImRNA,3'末端.0,04977453A腿2101cDNAFU12039fis，克隆HEMBB1001930.0,04982822AF297014RGS8mRNA,部分序列.0,04988203NM—005173ATP酶，Ca+十转运，遍在的(ATP2A3),mRNA.0,04993655刚—014141接触蛋白相关蛋白样2(CNTNAP2),mRNA.0,04999表2:具有8p上的染色体缺失的、在结肠直肠腺瘤和腺癌细胞之间差异表达的人基因(单变量分析)。数据按FDR值排序60基因ID说明(8p缺失，表2)FDR效果NM—018388CHCR(CHCR),mRNA.0，005045-0,54868AK054799cDNAFLJ30237fis,克隆BRACE2002034.0,005971-0，3鄉1NM—016397TH1样(果蝇)(THIL),mRNA.0,0067250,298588蘭—000637谷胱甘肽还原酶(GSR)，mRNA.0,006725-0,33537D31887KIAA0062基因的mRNA,部分cds.0,006725-0,49409NM—006602转录因子样5(基本螺旋-环-螺旋)(TCFL5),mRNA.0,0067250,638295AK026883cDNA:FLJ23230fis,克隆CAE07143.0,0067250,426682NM—018270染色体20可读框20(C20orf20),mRNA.0,0067250,23481觀—004901溶酶体腺苷三磷酸双磷酸酶样1(LYSAL1),0,006725-0,23079mRNA.NM—021928假定蛋白FLJ22649类似于信号肽酶SPC22/230,007549隱0，22392(FU22649),mRNA.NM—003747锚端聚合酶，TRFl-相互作用锚蛋白相关的ADP-0,011251-0,39827核糖聚合酶(TNKS),mRNA.NM—030579细胞色素b5线粒体外膜前体(CYB5-M)，mRNA.0,0128080,247417NM—002609血小板衍生的生长因子受体，卩多狀(PDGFRB)，0,0204830,51344mRNA.NM—033126丝氨酸/苏氨酸激酶PSKH2(PSKH2)，mRNA.0,0204830,472905NM—003014分泌的巻曲相关蛋白4(SFRP4)，mRNA.0,0211770,842529NM—020749AT2受体-相互作用蛋白1(ATIP1),mRNA.0,021177-0,36043画—007002粘附调节分子1(ADRMl)，mRNA.0,0211770,285899NM—057093晶体蛋白，)3A2(CRYBA2),转录变体2,mRNA.0,023543-0,41107NM—172250A型曱基丙二酸尿症(MMAA),mRNA.0,023543-0,34183BC015412克隆IMAGE:4393471,mRNA.0,0235430,397184NM_002640丝氨酸(或半胱氨酸)蛋白酶抑制剂,进化枝B(卯0,023543-0，崔71白蛋白)，成员8(丝氨酸蛋白酶抑制蛋白B8)，mRNA.NM—031285假定蛋白PP1057(PP1057),mRNA.0,0244460,44688NM—001696ATP酶，H+转运，溶酶体31kDa,V1亚基E同工0,0244460,186487型1(ATP6V1E1),mRNA.AK094784cDNAFLJ37465fis,克隆BRAWH2011823,高度类0,0249350,506101基因ID说明FDR效果^e缺失'表2)似于骨形态发生蛋白7前体.NM—018710假定蛋白DKFZp7620076(DKFZp7620076),0,0274240,387812mRNA.NM—006809线粒体外膜的移位酶34(TOMM34),mRNA.0,0290010,404823BM476468AGENCOURT_6476297丽—MGC一85cDNA克0,0304440,429324隆IMAGE:55533955',mRNA序列.NMJ52332染色体14可读框47(C14orf47),mRNA.0,030466-0,3124AW977106EST389215MAGE重新排序，MAGOcDNA，0,0316020,317498mRNA序列.NM_000238钾电压门控的通道，亚家族H(eag相关的)，成员0,0316460,4407762(KCNH2),转录变体l,mRNA.NMJH2155棘皮动物微管相关蛋白样2(EML2),mRNA.0,033412-0，45142AK097647cDNAFLJ40328fis,克隆TEST12031356.0,0334120,296624BC004890克隆IMAGE:3937917，mRNA.0,033412-0,44593NM_006493蜡样脂-脂褐质沉积症，神经元的5(CLN5),0,033965-0,31853mRNA.BC032316克隆IMAGE:5219499,mRNA.0,035205-0,38849NM_003118分泌的蛋白，酸性，富含半胱氨酸(骨粘连蛋白)0,0352050,443985(SPARC)'mRNA.AK090998cDNAFLJ33679fis,克隆BRAWH2002352.0,036982-0，53683NM—022062PBX/有节的1同源框2(PKNOX2),mRNA.0,037750,266646NMJH7872假定蛋白FLJ20546(FLJ20546),mRNA.0,038899-0,24664NM_003186转凝蛋白(TAGLN),mRNA.0,0388990,363435BC025370克隆1MAGE:3945331，mRNA.0,0391110，486875BC013389克隆IMAGE:3932143,mRNA.0,0391110,437633NM_006251蛋白激酶，AMP激活的，a1催化亚基(PRKAAl),0,039111-0,32277mRNA.BQ921U2AGENCOURT_8926187NIH_MGC—101cDNA克0,0391110,492923隆IMAGE:64630135',mRNA序列.AK024156cDNAFLJ14094fis，克隆MAMMA1000372.0,039111-0,42942NM_021095溶质栽体家族5(钠依赖性維生素转运蛋白)，成员O,(BWll0,3787%6(SLC5A6),mRNA.NMJ)04704U3snoRNP相关55-kDa蛋白(U3-55K),mRNA.0,0391110,27622NM001933二氬脂酰胺S-琥珀酰转移酶(2-氧代-戊二酸复合0,039111-0,2567762基因ID说明(8p缺失，表2>FDR效果醒—020169AK023018寵_000285BC01I877AK026367NM—025138NM—020650NM—006197NM—000698AK021812AW296028NM—017933NM—138784丽_080476NMJB2242画一003276刚—002562NM—007236NM一152745謝_003804AL137279BM561501NM—018203画0217240,0403790,0403790,040711克隆0,0416680.0416680,0435720，0451780,0451780.045178物的E2成分)(DLST),mRNA.latexin蛋白(LXN)，mRNA.cDNAFLJ12956fis'克隆NT2RP2005501.肽酶D(PEPD),mRNA.类似于胞质分裂的贡献物1,IMAGE:3347029'mRNA.cDNA:FLJ22714fis，克隆HSI13646.假定蛋白FLJ12661(FLJ12661),转录变体1,0,042841mRNA假定蛋白LOC57333(LOC57333),mRNA.中心粒旁物质1(PCM1),mRNA.花生四烯酸5-脂加氧酶(AL0X5),mRNAcDNAFU11750fis,克隆HEMBA1005568UI-H-BW0-aiu-d-04-0-UI.slNCI—CGAP—Sub60,045452cDNA克隆IMAGE:27306543'，mRNA序列.假定蛋白FLJ20701(FLJ20701),mRNA.0,048261假定蛋白BC014341(LOC116123),mRNA.0,048697CDC91细胞分裂周期91样1(啤酒糖酵母)0,048697(CDC91L1)，mRNA.假定蛋白DKFZp564A176(DKFZp564A176),0,052079mRNA.胸腺生成素(TMPO),mRNA.嘌呤能受体P2X,配体门控的离子通道，(P2RX7),mRNA.钙结合蛋白P22(CHP),mRNA.隨rexophilin1(NXPH1),mRNA.受体(TNFRSF)-相互作用丝氨酸-苏氨酸激酶(RIPK1),mRNA.mRNA,cDNADKFZp43401214(来自克隆0,061202DKFZp43401214).AGENCOURT_6567312NIH_MGC_88cDNA克0,061202隆IMAGE:57397155',mRNA序列.布i定蛋白FIJI0748(FLJ10748),mRNA.0,061202核受体亚家族l,D组，成员1(NR1D1),mRNA.0，0612020,05347170,0564260,0573010,05868310,059712-0,224130,3062790,263666-0,332480,3883520,2665030,474606-0,27764-0,44187-0,355450,340944-0,35263-0,366720,2764570，249169-0,271810,295663-0,20633-0,30813-0,306490,3639350,411812-0,383930,392836<table>tableseeoriginaldocumentpage64</column></row><table>基因ID说明(8p缺失，表2)FDR效果NM—001008NM—0178%NM—000367NM—007011NM—002305AF001892NMJK35877AB033070BC034374濯—032125NM—004403NM—020806NM—005959NM—005469AL713790BI520375刚—000119AB002339刚一004139NMJH2331丽—018422画—00195NM—018043BC002877NM—015721BQ230145核糖体蛋白S4,Y连锁的(RPS4Y),mRNA.0,065715染色体20可读框11(C20orfl1)，mRNA.0,067243硫噪呤S-甲基转移酶(TPMT)，mRNA.0,067243含abhydrolase结构域2(ABHD2),转录变体l,0,067243mRNA.凝集素，结合半乳糖苷,可溶的，1(半乳凝集素1)0,069165(LGALS1),mRNA.MEN1区克隆s/卩mRNA,5'片段.0,069489剪接因子3a，亚基l，120kDa(SF3Al)，mRNA.0,06978KIAA1244蛋白的mRNA,部分cds.0,06978类似于FKSG76,克隆MGC:353900,069786IMAGE:5185621,mRNA，完整cds.假定蛋白DKFZp564D0478(DKFZP564D0478),0,069786mRNA.0.0697860，0697860，069786mRNA.0,069786自克隆0,069786克隆0.069786-0,2411聋，常染色体显性5(DFNA5),mRNA.gephyrin(GPHN),niRNA.褪黑激素受体1B(MTNR1B)，mRNA,过氧化物酶体酰基辅酶A硫酯酶(PTE1)mRNA,cDNADKFZp564F賜2(来DKFZp564F1062).603071853F1丽—MGC—119cDNAIMAGE:51637565',mRNA序列.红细胞膜蛋白带4.2(EPB42),mRMA.KIAA0341基因的mRNA，部分cds.脂多糖结合蛋白(LBP),mRNA.甲硫氨酸亚砜还原酶A(MSRA),mRNA.假定蛋白DKFZp761K1423(DKFZp76IK1423),0,070503mRNA.E2F转录因子5，p130结合(E2F5),mRNA.0,070596假定蛋白FLJ10261(FLJ10261),mRNA.0,070596类似于假定蛋白FL川585，克隆MGC:112580,070596IMAGE:3942160,mRNA,完整cds.gem(核细胞器)相关蛋白4(GEMIN4)，mRNA.0,070946AGENCOURT7592688NIHMGC72cDNA克0,072458-0,853660,227182-0,32273-0,336850,454091-0,58133-0,23195-0,352610,239690,2123840,283821-0,19149匿0'315530,293167-0'255920,0697860,0697860,0697860,069786-0,24152-0,268110,18535-0,22314-0,443710,274336-0,50301-0,203510,2284490,31021665<table>tableseeoriginaldocumentpage66</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage67</column></row><table>[0271]<table>tableseeoriginaldocumentpage67</column></row><table>基因ID说明(8p缺失，表2)FDR效果AK001130cDNAFLJ10268fis,克隆HEMBB1001058,弱类0,083270,318442似于神经元的线状蛋白AD7c-NTPtnRNA.BC014441类似于RIKENcDNA2810405F18基因，克隆0,083328-0，23912MGC:22960IMAGE:4865283,mRNA,完整cds,BC038852克隆IMAGE:5168364,mRNA.0,083328-0,57493NM—019846趋化因子(C-C基序)配体28(CCL28)，转录变体0,083402-0,409811,mRNA.NMJ303298核受体亚家族2,C组，成员2(NR2C2),tnRNA.0，085307-0,20389AK022976cDNAFLJ12914fis,克隆NT2RP2004523.0,0853490,348863AL831875mRNA,cDNADKFZp547E1510(来自克隆0,0855490,206302DKFZp547E1510).AK056573cDNAFLJ32011fis,克隆NT2RP7009507.0,085549-0,25456AK022947cDNAFLJ12885fis，克隆NT2RP2003988.0,0855490,273694NM—024513含FYVE和巻曲的巻曲结构域1(FYC01),mRNA.0,085549-0,21209AB033107KIAA1281蛋白的mRNA,部分cds.0,0867680,231675AF087970全长插入cDNA克隆YU75B05.0,086768-0,26453NM—005276甘油-3-磷酸脱氬酶1(可溶的)(GPDl),mRNA.0,08722-0,23882NM—004315N-酰基鞘氨醇酰胺水解酶(酸性神经酰胺酶)10,08747-0,26787(ASAH1),mRNA.NM—006752饮食过度5(SURF5)，转录变体a,mRNA.0,087470,233567NM—003185TAF4RNA聚合酶II,TATA枢结合蛋白(TBP)相关0,087470,255894因子，135kDa(TAF4),mRNA.AB002314KIAA03，6蛋白的mRNA,部分cds.0,08747-0,322AB037842KIAA1421蛋白的mRNA,部分cds.0,08747-0,32792NM—002979固醇栽体蛋白2(SCP2)，mRNA.0,08865-0,19443BC021575克隆IMAGE:36966,mRNA.0.08S650，36964AK022745cDNAFLJ12683fis，克隆NT2RM4002457.0,088650,379521NM—025209polycombH.log的增强子1,(果蝇)(EPC1),mRNA.0,088650,132535CA314430UI-CF-FN0-afm-n-08-0-UI.slUI-CF-FNOcDNA克0,08865-0,23737隆UI-CF-FN0國afhi-n-08-0-UI3',mRNA序列.NM_020673RAB22A,成员RAS癌基因家族(RAB22A),0,088650,229513mRNA.BQ220757AGENCOURT—7589763顧一MGC—92cDNA克0,088650,288766隆IMAGE:60676965',mRNA序列.68基因ID说明(8p缺失，表2)雇一025047假定蛋白FLJ22595(FLJ22595),mRNA.NM—152415假定蛋白FLJ32642(FLJ32642),mRNA.NM—016569T-框3(尺骨乳腺综合征)(TBX3),转录变体2,mRNA.AK075564cDNAPSEC0264fis,克隆NT2RP3002337.NMJ)02586前B细胞白血病转录因子2(PBX2),mRNA.AF070620克隆24694mRNA序列.BM674956Ul-E-EJ0-ahn-c-06-0-UI.slUI-E-EJOcDNA克隆UI-E-EJ0-ahn-c-06-0-UI3'，mRNA序列.NM—005104含布罗莫结构域2(BRD2),mRNA.AK092106cDNAFLJ34787fis，克隆NT2NE2004740.NMJ53246j艮定蛋白MGC45491(MGC45491),mRNA.NM—013974二曱基精氨酸二曱基氨基水解酶2(DDAH2),mRNA.NMJ)05415溶质栽体家族20(磷酸转运蛋白)，成员1(SLC20A1)，mRNA.NM—031299可能是富含小鼠基因的簇的直向同源物，C8基因(GRCC8),mRNA.BC002782克隆IMAGE:362]749,mKNA，部分cds.NMJ38284白介素17D(IL17D),mRNA.NM—004776UDP-Gal:(3GlcNAc(31,4-半乳糖基转移酶,多肽5(B4GALT5),mRNA.NM—020750核输出蛋白5(XP05),mRNA.AK096002cDNAFLD8683fis,克隆KIDNE2000777.NM—005313葡萄糖调节的蛋白，58kDa(GRP58),mRNA.NM—030763核小体结合蛋白1(NSBP1),mRNA.NM—006644热激105kD(HSP105B),mRNA.AF304443B淋巴细胞激活相关蛋白BC-2048mRNA，完整cds.NM_005015氧化酶(细胞色素c)組装1样(0XA1L),mRNA.NM一005339huntingtin相互作用蛋白2(HIP2),mRNA.AL833655mRNA,cDNADKFZp66700320(来自克隆DKFZp66700320).AK094651cDNAFLJ37332fis,克隆BRAMY2019710.FDR效果0,088650,088650,088650,088650,088650,088650,088650，08%90,089690,08969-0,24253-0,17664-0，41763-0,604260,29,10,1卯677-0,26423-0,16248-0,33180,5203450,2111150,08%90,2588460,089690,3374480,0910530,0910530,0915320,0919340,0934780，093,0,0943270,0943270,0943270,0943270,0943270,0943270,3142130,5097440,1604360,216215-0,89719-0,29814-0，316280,321667-0,7255-0,15643-0,31967-0,347520,094327-0,20019基因ID说明(8p缺失，表2)NM—000088胶原，I型，al(COLlAl),mRNA.NM_000135范可尼贫血，互补A组(FANCA),mRNA.BC016795克隆IMAGE:4067166,mRNA.AB006卯9A型小眼相关转录因子的mRNA,完整cds.NM—000073CD3G抗原，y多肽(TiT3复合物)(CD3G),mRNA.NM—020182跨膜，前列腺雄激素诱导的RNA(TMEPAI),mRNA,BI769135603053727F1NIH—MGC—122cDNA克隆IMAGE:52032075'，mRNA序列.NM_005080X-盒结合蛋白1(XBP1),mRNA.AB007875KIAA0415mRNA,完整cds.AK024940cDNA:FU21287fis,克隆COL01918.AK056609cDNAFLJ32047fis,克隆NTONG2001137.NM—018246假定蛋白FLJ10853(FLJ10853),mRNA.NM—001829氯通道3(CLCN3),mRNA.NM—015666GTP结合蛋白5(推定的)(GTPBP5)'mRNA.NM—009590含铜的胺氧化酶2(视网膜特异性的)(AOC2)，转录变体2,mRNA.NM—014052GW128蛋白(GW128),mRNA.NM—144641假定蛋白FU32332(FLJ32332),mRNA.NM—024035假定蛋白MGC3113(MGC3113),mRNA.画_002398Meisl,骨髓亲嗜性病毒整合位点1H.log(小鼠)(MEISl)，mRNA.NMJM7417UDP-N-乙酖-a-D-半乳糖胺多肽N-乙酰氨基半乳糖基转移酶8(GalNAc-T8)(GALNT8)，mRNA.AL137326mRNA,cDNADKFZp434B0650(来自克隆DKFZp434B0650).NM_002894成视网膜细胞瘤结合蛋白8(RBBP8),mRNA.NM_003359UDP-葡萄糖脱氢酶(UGDH),mRNA.NM_022461假定蛋白FLJ21939类似于5-氮胞嘧啶诱导的基因2(FLJ21939)，mRNA.NMJ52437假定蛋白DKFZp761B128(DKFZp761B128),mRNA.AK056178cDNAFU31616fis，克隆NT2RI2003019.FDR效果0,0943270,0943270,0943270,0943270,0943270,0943270，5100850,192872-0,460230,3539370，2326730,3905290,0943270,2847320,0943270,0943270,0943270，0943270,0943270,0943270，0943270,0943270'0943270,0954340,0954340,095862-0,249260,299914-0,45615-0,26822-0,19685-0，282270,2615540,4589480,2549870,2520080,2878960.51%0，095888-0，408330,0965910,4160070,0973490,097690,09769-0,15438-0,328150,1676860,097690,4009120,0980670,31336670基因ID说明FDR效果(8p缺失，表2)BC020895克隆IMAGE:4704474，mRNA.0,099308-0,31829NM—000862羟基-5-5-类固醇脱氢酶，3|3-和类固醇5-异构酶10,0993310,199437(HSD3B1),mRNA.NM—004657血清剥夺反应(磷脂酰丝氨酸结合蛋白)(SDPR),0,0993310,247845mRNA.NM—020962可能是PuncEll的小鼠相邻物的直向同源物0,0997370,320891(NOPE),mRNA.NM—000574补体的腐解加速因子(CD55,Cromer血型系统)0,099737-0,39095(DAF)，mRNA.表3:具有8q上的染色体获得的、在结肠直肠腺瘤和腺癌细胞之间差异表达的人基因(单变量分析)。数据按FDR值排序。基因ID说明(8q获得，表3)FDR效果画-—001951E2F转录因子5，p130结合(E2F5),mRNA.0,0003210,37466BM921036AGENCOURT—66331%NIH—MGC一115cDNA克0,0020750,387272隆IMAGE:57523555',mRNA序列.丽-_016308UMP-CMP激酶(UMP-CMPK),mRNA.0,002075-0,25卯9NM-匿000285肽酶D(PEPD)，mRNA.0,0062910,293134NM——145293类似于假定蛋白FLJ20897(LOC196549)，mRNA.0,0231610,187785NM一-004232细胞因子信号传递的抑制物4(S0CS4),mRNA.0,041674-0,30051NM—_022I30高尔基体磷蛋白3(包膜蛋白)(GOLPH3),mRNA.0,041674-0,30666AB033100KIAA1274蛋白的mRNA,部分cds.0,0416740,523579丽-—003014分泌的巻曲相关蛋白4(SFRP4),mRNA.0,0416740,764632NM一—004891线粒体核糖体蛋白L33(MRPL33),核基因编码线0,0416740,175935粒体蛋白，转录变体l,mRNA.画-—032862tigger可转座元件衍生的5(TIGD5),mRNA.0,0416740，319249NM——033126丝氨酸/苏氨酸激酶PSKH2(PSKH2)，mRNA.0,0416740,432724NM-—144660假定蛋白FLJ25082(FU25082),mRNA.0,0505050,302561NM——015127Mid-l相关的氯通道1(MCLC)，mRNA.0,050505-0，25616NM——031920ARG99蛋白(ARG99),mRNA.0,0505050,208365NM——007055聚合酶(RNA)III(定向于DNA)(155kD)0,0505050,14563(RPC155),mRNA.丽—024491plO结合蛋白(BITE),mRNA.0,050505-0,26034画—画006U7过氧化物酶体D3,D2-烯酰-辅酶A异构酶0,050505-0,36647(PECI),mRNA.画-—033120棵角质层H,log2(果蝇)(NKD2),mRNA.0,0505050，693186AF161353HSPC090mRNA，部分cds.0,0535870,234453丽_画0簡6假定蛋白FLJ20261(FLJ20261),mRNA.0,054369-0,28294NM——024522假定蛋白FLJ12650(FLJ12650),mRNA.0,0543690,220378NM——013354CCR4-NOT转录复合物，亚基7(CNOT7),转录变0,054537-0,19074体1,mRNA.NM——031472假定蛋白MGC11134(MGC11134),mRNA.0,060975-0,26471NM——138425假定蛋白BC009925(LOC13246)，mRNA.0,060975-0,27155NM_—003186转凝蛋白(TAGLN),mRNA,0,0784910,33003772<table>tableseeoriginaldocumentpage73</column></row><table>表4:具有13q上的染色体获得的、在结肠直肠腺瘤和腺癌细胞之间差异表达的人基因(单变量分析)。数据按FDR值排序。<table>tableseeoriginaldocumentpage74</column></row><table>基因ID说明(13q获得,表4)FDR效果丽一032229假定蛋白FLJ22774(FLJ22774),mRNA.0,016631-0,76877固—004445EphB6(EPHB6),mRNA.0'0171860,337104NM—0022%核纤层蛋白B受体(LBR),mRNA.0,0187440,219703AW972072EST384056MAGE重新排序，MAGLcDNA,0,0203410,31753mRNA序列.画—012449前列腺的6次跨膜上皮抗原(STEAP)，mRNA.0,020473-0,32771NM_005870sin3相关多肽，18kDa(SAP18),mRNA.0,0206910,219704画—018386假定蛋白FU11305(FLJI1305),mRNA.0,0222160,248688AF075082全长插入cDNAYQ80H06,0,022216-0,29092AL09727mRNA全长插入cDNA克隆EUROIMAGE0,022702-0,18078200247,AK055卯3cDNAFLJ31341fis,克隆MESAN1000050.0,023674-0,44115NMJH4177HSPC154蛋白(HSPC154),tnRNA.0,02626-0,1951NM一006825细胞骨架相关蛋白4(CKAP4),mRNA.0,02765-0,1768L3828230amRNA片段.0,0283210,468719NMJ325187假定蛋白FU12076(FLJ12076),mRNA.0,0283210，19899NM一021945假定蛋白FLJ22174(FLJ22174),mRNA.0,039902-0,41007NM—139167sarcoglycan;(SGCZ)，mRNA.0,0399020,228483画—006022转化生长因子p刺激的蛋白TSC-22(TSC22),0,041160,203489mRNA.NM—006215丝氨酸(或半胱氨酸)蛋白酶抑制剂，进化枝A(a-l0,0421740,444696抗蛋白酶，抗胰蛋白酶)，成员4(丝氨酸蛋白酶抑制蛋白A4),mRNA.画—018559脂多糖特异性反应-7蛋白(LSR7)，mRNA.0,0421740，270419AK024254cDNAFLJ1492fis,克隆NT2RP3000584.0,0421740,224429NM—005358仅LIM结构域7(LM07),转录变体1,mRNA.0,0421740,251855NM一032827假定蛋白FLJ14708(FLJ1470S)，mRNA.0,047016-0,48154BC018758类似于RIKENcDNA1110032022基因，克隆0,051706-0,23603MGC:31967IMAGE:4907976,mRNA,完整cds.廳—030579细胞色素b5线粒体外膜前体(CYB5-M),mRNA.0,0517060,176881AF085893全长插入cDNA克隆YP95A10.。'0517060,217617NM一152322假定蛋白FLJ33957(FLJ33957)，mRNA.0,0517310,373213薩—152707假定蛋白MGC39851(MGC39851),mRNA.0,0536980,195109BC001092类似于假定蛋白FU20378,克隆1MAGE:3506144,0,056537-0,24494基因ID说明FDR效果(13j，表力mRNA.NM—002389膜辅因子蛋白(CD46,滋养层-淋巴细胞交叉反应性0,0566480,241236抗原)(MCP),转录变体a，mRNA.AF086417全长插入cDNA克隆ZD78A02.0,0566480,538334NM—]53751染色体21可读框82(C2IorfS2)，mRNA.0,057336-0,30873NM_003731干燥综合征细胞核自身抗原1(SSNA1),mRNA.0,0580990,218273AL8323卯mRNA,cDNADKFZp667H2012(来自克隆0,063252-0,30417DKFZp667H2012).NM—012158F框和富含亮氨酸的重复蛋白3A(FBXL3A),0,0632520,264664mRNA.NM—005374膜蛋白，棕榈酰化的2(MAGUKp55超家族成员0,063252-0,1742)(MPP2),mRNA.NM_002097通用转录因子IHA(GTF3A),mRNA.0,0632520,268556W02242za57b04.rlSoares胎肝脾1NFLScDNA克隆0,0632520,244961IMAGE:2966235',mRNA序列.NM—004255细胞色素c氧化酶亚基Va(COX5A)，核基因编码0,063252-0,1947线粒体蛋白，mRNA.AF350451C6orf37mRNA,完整cds.0,064674-0,32683BC028119类似于推定的，克隆MGC:40181IMAGE:5172473，0,065315-0,31424mRNA，完整cds.NM—016594FK506结合蛋白11,19kDa(FKBPU),mRNA.0,066266-0,23327NMJH4849突触泡糖蛋白2(SV2),mRNA.0,0662660,151549NMJB2352假定蛋白MGC11296(MGC11296),mRNA.0,0662660,132448NM_078467细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂lA(p21,Cipl)0,0662660,196894(CDKN1A),转录变体2,mRNA.NM一007342核孔蛋白样蛋白1(NLPJ),mRNA.0,0666710,137201AK057085cDNAFLJ32523fis,克隆SMINT2000032.0,068720,393846AF085955全长插入cDNA克隆YR86G04.0,068720,220771NM_144736假定蛋白PR01853(PR01853),转录变体1,mRNA.0,068720,165416NM一007035角膜蛋白聚糖(KERA),mRNA.0,068720,345311NM_152255蛋白酶体(前体，macr叩ain)亚基，a型，7(PSMA7),0,068720,141922转录变体2，mRNA.U50531BRCA2区，mRNA序列CG030.0,068720,305838NM一004128通用转录因子IIF，多肽2(30kD亚基)(GTF2F2),0,068720,20089276<table>tableseeoriginaldocumentpage77</column></row><table>0,0781880'078〗880,0790850,0803380,085964基因ID说明FDR〖13g然H42.................................................................................................mRNA,NM一144778肌盲(muscleblind)样蛋白MBLL39(MBLL39)转录变体1，mRNA.NM—015070KIAA0853蛋白(KIAA0853)，mRNA.NMJ)02212整联蛋白(34结合蛋白(ITGB4BP),mRNA.NM一021258白介素22受体(IL22R),mRNA.NM—014887来自BCRA2区的假定蛋白(CG005),mRNA.NM一004755核糖体蛋白S6激酶，卯kDa,多肽5(RPS6KA5).mRNA.NMJ)31266异源细胞核核糖核苷酸蛋白A/B(HNRPAB),转录0,085964变体1，mRNA.NM—018147Fas凋亡抑制分子(FAIM),mRNA.0,085964NM—002431menageatrois1(CAK组装因子)(廳ATl)'mRNA.0,087716NM—031472假定蛋白MGC1U34(MGC11134),mRNA.0,087716BC0092I0类似于中胚层发育候选物2,克隆MGC:161850,087717IMAGE:3637449,mRNA,完整cds.NMJX32915复制因子C(激活物1)3,38kDa(RFC3)，mRNA.0,089927AF514992核蛋白p30mRNA,部分cds.0,090807NMJ313974二曱基精氨酸二曱基氨基水解酶2(DDAH2),0,090807mRNA.BC008502克隆MGC:14841IMAGE:4295121,mRNA,完整0,090807cds.BF967668602287374T1NIH_MGC_96cDNA克隆0,092551IMAGE:43744993'，mRNA序列.AK092490cDNAFLJ35171fis,克隆PLACE6013220，弱类似0,092847于毛透明蛋白.AL390178mRNA,cDNADKFZp547N064(来自克隆0,092928DKFZp54測64).NM—024618假定蛋白FLJ2M78(FLJ21478),转录变体1,0,093324mRNA.AK097101cDNAFU39782fis,克隆SPLEN2002175.0,093866AK024933cDNA:FU21280fis,克隆COL01884.0,093866NM—004545NADH脱氢酶(泛醌)1(3亚复合物，1,7kDa0,093866(NDUFB1),mRNA,效果0,0781880,2182340,1967960,1853170，431%0,233766-0,18116-0，1542-0,34657-O,顧-0,20932-0,15%10，196477-0,165370,17908-0,286090,241666-0,204270:259092-0,231440,323348-0,36332-0,1751278<table>tableseeoriginaldocumentpage79</column></row><table>表5:具有15q上的染色体缺失的、在结肠直肠腺瘤和腺癌细胞之间差异表达的人基因(单变量分析)。数据按FDR值排序。基因ID说明FDR效果(15g缺失，表5)AK057085cDNAFU32523fis,克隆SMINT2000032.BC010701克隆MGC:16795IMAGE:3855397，mRNA,完整cds.NM—016397TH1样(果蝇)(TH1L)，mRNA.NM—006809线粒体外膜的移位酶34(TOMM34),mRNA.AF156166推定的肿瘤抑制物mRNA.NM—004653SmcyH.log,Y染色体(小鼠)(SMCY),mRNA.NM—003880WNTl诱导型信号传递途径蛋白3(WISP3),转录变体1,mRNA.NM—002755促分裂原激活的蛋白激酶激酶1(MAP2K1)，mRNA.NM一002267核周蛋白a3(输入蛋白a4)(KPNA3),mRNA.0,0428570,213699NM—006726LPS-反应性液泡交通，含岸和锚(LRBA)，mRNA.0,04717-0,17132NM—004323BCL2-相关的抗死亡基因(BAG1),mRNA.0,048517-0，3164NM—003411锌指蛋白，Y连锁的(ZFY),mRNA.0,050424哩0，82401BC035268克隆IMAGE:4779288,mRNA.0,050424-0,25257AK075564cDNAPSEC0264fis，克隆NT2RP3002337.0,057755-0,77583AF085861全长插入cDNA克隆YN67C05.0,057755-0,37833NM—144726假定蛋白FU31951(FLJ31951),mRNA.0,057755-0,27891NM—014786Rho-特异性鸟。票呤-核苷酸交换因子164kDa0,0662750,223783(P164RHOGEF),mRNA.AL713719mRNA,cDNADKFZp667K1916(来自克隆0,0662750,488787DKFZp667K1916).BC038852克隆IMAGE:5168364,mRNA.0,066417-0,70334NM—003121Spi-B转录因子(Spi-l/PU.l相关的)(SPIB),mRNA.0,066417-0,33326Z24725促分裂原诱导型基因mig-2,完整cds.0,066417-0,22419NM—014885细胞分裂后期促进复合物10(APCIO)，mRNA.0,0664170,240729NM—016646间质干细胞蛋白DSCD28(LOC51336),mRNA.0,0664170,267465NM—0022%核纤层蛋白B受体(LBR),mRNA.0,0664170,270704NM一017895死亡/H(Asp-Glu-Ala-Asp/His)框多肽270,0664170,283457(DDX27),mRNA0,0230840，0285430,038230,038230,042210,0428570,0428570,663367-0,400070,3122990,466704-0,34763-0,44454-0,317890,042857-0'2糊380<table>tableseeoriginaldocumentpage81</column></row><table>表6:具有17p上的染色体缺失的、在结肠直肠腺瘤和腺癌细胞之间差异表达的人基因(单变量分析)。数据按FDR值排序。<table>tableseeoriginaldocumentpage82</column></row><table>表7:具有18q上的染色体缺失的、在结肠直肠腺瘤和腺癌细胞之间差异表达的人基因(单变量分析)。数据按FDR值排序。基因ID说明FDR效果(18q缺失，表7)NM一O16397TH1样(果蝇)(TH1L)，mRNA.0,0008240，282卯8腹_004715CTD(羧基末端结构域，RNA聚合酶II,多肽A)0,000824-0,19524磷酸酶,亚基1(CTDP1),转录变体FCPla,mRNA.NM—004539天冬酰胺酰-tRNA合成酶(NARS),mRNA.0,000944-0,24154NM—002894成视网膜细胞瘤结合蛋白8(RBBP8),mRNA.0,001559-0,19184画—021809TGFB诱导的因子2(TALE家族同源框)(TGIF2),0,0015590,364009mRNA.NM—002915复制因子C(激活物1)3,38kDa(RFC3)，mRNA.0,0017920,277825NM—016646间质千细胞蛋白DSCD28(LOC51336),mRNA.0,0035260,246432NM—013451fer-1样3，myoferlin(秀丽新杆线虫)(FER1L3),0,003816-0,26834转录变体1，mRNA.NM—005469过氧化物酶体酖基辅酶A硫酯酶(PTE1),mRNA.0,0038160,317782NM—024522假定蛋白FLJ12650(FLJ12650),mRNA,0,0038160,234068NM—002212整联蛋白(34结合蛋白(ITGB4BP),mRNA.0,0038160,24754BC033940克隆IMAGE:5272723，mRNA，部分cds.0,0045420,320051画—014177HSPC154蛋白(HSPC154),mRNA.0,004542-0,22578BC038852克隆IMAGE:5168364,mRNA.0,006043-0,63205189477UI-E-EJl-aka-c-13-0-UI.rlUI-E-EJ1cDNA克隆0,006686-0,57215UI-E-EJI-aka-c-13-0-UI5',mRNA序列.NM—018439假定蛋白IMPACT(IMPACT),mRNA.0,007012-0,31578腹—08270染色体20可读框20(C20orf20),mRNA.0,0077490，脂34蘭—138425假定蛋白BC009925(LOCI13246),mRNA.0,009635-0,27373画—002296核纤层蛋白B受体(LBR),mRNA.0,0096350,236768觀_006602转录因子样5(基本螺旋-环-螺旋)(TCFL5),mRNA.0'0098S60,501186NM—152777染色体14可读框48(C14orf48)，mRNA.0,0107080,318223Z34281(MARIO)MUC5AC粘蛋白的mRNA(部分).0,011328-1,33357BQ921112AGENCOURT—8926187NIH—MGC—101cDNA克0,0120330,451489隆IMAGE:64630135'，mRNA序列.AK024563cDNA:FLJ20910fis，克隆ADSE00492.0,0120330,349917觀一032611蛋白酪氨酸磷酸酶IVA型，成员3(PTP4A3)，转0,015390,370319录变体1,mRNA.83<table>tableseeoriginaldocumentpage84</column></row><table>基因ID说明(18q缺失，表7)FDR效果NM—_006097肌球蛋白调节性轻链2，平滑肌同种型(MYRL2)，0,0279240,308449mRNA.画_一003118分泌的蛋白，酸性，富含半胱氨酸(骨粘连蛋白)0,0279240,371898(SPARC),mRNA.NM——138340含abhydrolase结构域3(ABHD3)，mRNA.0,028702-0,34834NM——173168SPCX(SPCX),mRNA.0,0287020,2卯214薩-—000238钾电压门控的通道，亚家族H(eag相关的)，成员0,0287020,3623182(KCNH2)，转录变体l,mRNA.画——016569T-框3(尺骨乳腺综合征)(TBX3),转录变体2，0，028702-0,40908mRNA.顧一—006809线粒体外膜的移位酶34(TOMM34),mRNA.0,0287020,327919NM——138573神经调节蛋白4(LOCI45957),mRNA.0,028702-0,33061BC016864克隆1MAGE:3847536,mRNA.0,0287020,335912K00629kpni重复mrna(cdna克隆pcd-kpni-4)，3'末端.0,0289490,200056丽_—005877剪接因子3a,亚基1,120kDa(SF3Al》mRNA.0,028949-0,21253NM——006615钙激活中性蛋白酶9(nCL-4)(CAPN9),mRNA.0,028949-0,56754NM——024426Wilms肿瘤1(WT1)，转录变体D，mRNA.0,029630,688737丽——025138假定蛋白FLJ12661(FU12661)，转录变体1,0,029630,226221mRNA.AK074657cDNAFLJ90176fis,克隆MAMMA1000528.0,02963-0,3027BM921036AGENCOURT_66331%麵—MGC一115cDNA克0,02%30,279055隆IMAGE:57523555'，mRNA序列.雇一—003121Spi-B转录因子(Spi-l/PUl相关的)(SPIB)，mRNA.0,02963-0,256%BC031244双特异性酪氨酸-(Y)-磷酸化调节的激酶4,克隆0,02963-0,31347MGC:39640IMAGE:5266287，mRNA，完整cds.AF088051全长插入cDNA克隆ZD63G05.0,02%3-0,22944NM—030815染色体20可读框126(C20orfl26),mRNA.0,029630,252626NM—014729胸腺高迁移性基团框蛋白TOX(TOX),mRNA.0,029713-0,38597.NM—021945假定蛋白FLJ22174(FLJ22174),mRNA.0，031107-0,41574画_000439前蛋白转化酶枯草蛋白酶/kcxin型1(PCSK1),0,033688-1,05921mRNA.NM_006644热激.105kD(HSP105B),mRNA.0,0336880,312619BC034812类似于HSPC182蛋白，克隆IMAGE:4825606,0,0336880,229524mRNA.85基因ID说明(18q缺失，表7)FDR效果U44954NMDA受体谷氨酸结合链(hnrgw)mRNA,部分0,0336880,235122cds.NM一002885RAP1，GTP酶激活蛋白1(RAP1GA1),mRNA.0,033688-0,17827NM—002573血小板激活因子乙酰水解酶，同工型lb,y亚基0,0336880,17697829kDa(PAFAHlB3)，mRNA.NM—002097通用转录因子IHA(GTF3A)，mRNA.0,0336880,283916NM—025067假定蛋白FLJ14106(FLJ14106),mRNA.0,0347740,136761NM_130785TPTE和PTENH.logous肌醇脂质磷酸酶(TPIP)，0,034774-0，20841mRNA.NMJ)121卯甲酰四氢叶酸脱氢酶(FTHFD),转录变体l,mRNA.0,034774-0,4416NM_080476CDC91细胞分裂周期91样1(啤酒糖酵母)0,0361260，23289(CDC91L1),mRNA.NM—016626假定蛋白LOC51320(LOC51320),mRNA.0，036126-0,22033AK096306cDNAFLJ38987fis,克隆NT2RJ200588.0,0361260,295329AF339772克隆IMAGE:128781,mRNA序列.0,0368250，386798NM—025047假定蛋白FLJ22595(FLJ22595),mRNA.0,036825-0,22813NM—021246淋巴细胞抗原6复合物，基因座G6D(LY6G6D)，0,0368250,781552mRNA.NM—006839内膜蛋白，线粒体(mitofilin)(IMMT)，mRNA.0,036825-0,32053NM—004786硫氧还蛋白样，32kDa(TXNL),mRNA.0,036825-0,19712NM_030789组织特异性(次要)13(HM13)，mRNA.0,0379280,173847AF304443B淋巴细胞激活相关蛋白BC-2048mRNA,完整0,038975-0，6卯41cds.NMJH6400Hurrtingtin相互作用蛋白K(HYPK),mRNA.0，038975-0，23071NM—153751染色体21可读框82(C21orf82)，mRNA.0,038975-0,31597AF086021全长插入cDNA克隆YW21D11.0,038975-0,40572NM_002156热激60kDa蛋白1(陪伴蛋白)(HSPDl)，mRNA.0,039770,174064AJ292079MUC5AC蛋白的部分mRNA(粘蛋白基因，0,043301-1，2742MUC5AC).NM—053055C末端调节蛋白(CTMP),mRNA.0,043301-0,18836NM—004669细胞内氯通道3(CLIC3),mRNA.0,043458-0,63156NM—014066HT002蛋白，高血压相关的钙调节的基因0,0434580,183686(HT002),mRNA.NM一002267核周蛋白a3(输入蛋白ct4)(KPNA3),mRNA.0，0434580,1463186<table>tableseeoriginaldocumentpage87</column></row><table>基因ID说明FDR效果(18q缺失，表7)NM—004588钠通道，电压门控的，II型，(3多肽(SCN2B),0,057233-0,19156mRNA.NM—020749AT2受体-相互作用蛋白l(ATIPl),mRNA.0,057233-0,2583AK095147cDNAFU37828fis,克隆BRSSN2006575.0,057233-0,79158NM—004925水通道蛋白3(AQP3),mRNA.0,057233-0,42326BQ055725AGENCOURT—6796360NIH_MGC—99cDNA克0,057233-0,32696隆IMAGE:58079465',mRNA序列.NM—002345腔蛋白聚糖(LUM)，mRNA.0,0572330,385281雨—002102血型糖蛋白E(GYPE),mRNA.0,057233-0,22666NM—133170蛋白酪氨酸磷酸酶，受体型，T(PTPRT),转录变0,057233-0,35159体1,mRNA.BM669556UI-E-DXl-agw-c-13-0-UI.slUI-E-DX1cDNA克隆0,0578940,211554UI-E-DXl-agw-c-13-0-UI3'，mRNA序列.NM—002225异戊酰辅酶A脱氢酶(IVD)，核基因编码线粒体蛋0，058226-0,193白，mRNA.NM—152400假定蛋白FU39370(FLJ39370),mRNA.0,058226-0,22856丽_006796AFG3ATP酶家族基因3样2(酵母)(AFG3L2),核0,058226-0,20738基因编码线粒体蛋白，mRNA.NM—033111CG016(LOC88523),mRNA,0,0589450,425126NM—004599固醇调节元件结合转录因子2(SREBF2)，mRNA.0,059015-0，24卯2雨_020169latexin蛋白(LXN),mRNA.0，059328-0,1734NM—018414GalNAca-2,6-唾液酸转移酶I，长形0,059328-0,49984(ST6GalNAcI),mRNA.AB033100KIAA1274蛋白的mRNA,部分cds.0,0596160,406927AK056609cDNAFLJ32047fis,克隆NTONG2001137.0,060288-0,24176NM—014052GW128蛋白(GW128)，mRNA.0,0608980,229394AK057045cDNAFLJ32483fis,克隆SKNMC2001503,弱类0,061898-0,38993似于P-SE凝集素糖蛋白配体1前体.NM_017895死亡/H(Asp-Gu-Ala-Asp/His)框多肽270,0619860,201229(DDX27)，mRNA.雨_030579细胞色素b5线粒体外膜前体(CYB5-M)，mRNA.0,0619860，168765NM—007019遍在蛋白缀合酶E2C(UBE2C),mRNA.0,0619980,236312画—007039蛋白酪氨酸磷酸酶，非受体型21(PTPN21)，0,061998-0,24194mRNA.88基因ID说明(18q缺失，表7)FDR效果0,253210,224102-0,53126-0,134120,1683970,2533430,288058完整0,064346-0，33008NMJM8360X染色体可读框15(CXorf5),mRNA.0,061998NM—003185TAF4RNA聚合酶II,TATA框结合蛋白(TBP)相关0,062237因子，135kDa(TAF4)，mRNA.AK075564cDNAPSEC0264fis,克隆NT2RP3002337.0,062237NM—000177凝溶胶蛋白(淀粉样变性，Finnish型)(GSN),0,062237mRNA.NMJ)16299可能是小鼠热激蛋白的直向同源物，70kDa40,062237(HSP70-4),mRNA.BC014362克隆IMAGE:3932221,mRNA.0,063385BC009447克隆MGC:I5887IMAGE:3530481,mRNA,完整0,06351cds.BC041626克隆MGC:52394IMAGE:4554923'mRNA,cds.NM—032709假定蛋白MGC13047(MGC13047),mRNA.AL713719mRNA,cDNADKFZp667K1916(来自DKFZp667K1916).NM—030877联蛋白，|3样1(CTNNBL1),mRNA.NM—024725假定蛋白FLJ23518(FU23518),mRNA.■NM_014657KIAA0406基因产物(KIAA0406),mRNA.NM—032827假定蛋白FLJ14708(FLJ14708),mRNA.NM_145284类似于假定蛋白MGC17347(LOC15卯卯)，mRNA.0,067336NM_015832甲基-CpG结合结构域蛋白2(MBD2)，转录变体睾0,067336丸特异性，mRNA.NM—000901核受体亚家族3，C组，成员2(NR3C2)，mRNA.0，067336NM—032633假定蛋白MGC5457(MGC5457),mRNA.0,067336NM—032527假定蛋白FLJ14972(KIAA1847),mRNA.0,067336NM_001316CSE1染色体分离1样(酵母)(CSEIL),mRNA.0,067336AK095808cDNAFLJ38489fis,克隆FEBRA2023550,弱类似0,067336于P3蛋白.NM—001933二氢脂酰胺S-琥珀酰转移酶(2-氧代-戊二酸复合0,067336物的E2成分)(DLST)，mRNA.BC030750克隆IMAGE:4795773，mRNA.0,067391NM_004453电子转移黄素蛋白脱氢酶(ETFDH),核基因编码线0,06卯33粒体蛋白，mRNA.0,0651%克隆0,06530,0665660,0665660,0673360,067336-0,354490,336830,248269-0,228280,273531-0,448020,250469-0,17895-0,563380,1718880,1533760,212579-0,25346-0,19324-0,3297-0,2040589<table>tableseeoriginaldocumentpage90</column></row><table>基因ID说明FDR效果!(18g缺失，表7)BQ646410AGENCOURT—8511770MH_MGC—100cDNA克0,0800450,706676隆IMAGE:62969495',mRNA序列.NM—003359UDP-葡萄糖脱氬酶(UGDH),mRNA.0,080045-0,28442BC018995克隆MGC:20579IMAGE:4300679,mRNA,完整0,0800450,489487cds.BC033250克隆IMAGE:5441027,mRNA,部分cds.0,0800450,215003NM—001830氯通道4(CLCN4),mRNA.0,0800450,159316NM—003014分泌的巻曲相关蛋白4(SFRP4),mRNA.0,0800450,569245AL833742mRNA,cDNADKFZp666E186(来自克隆0,080045-0,39501DKFZp666E186).NM—015512DKFZP434A236蛋白(DKFZP434A236),mRNA.0,0800450,200372AL834121mRNA,cDNADKFZp761D2121(来自克隆0,080045-0,30573DKFZp761D2121).NM—006833C0P9亚基6(MOV34H.log'34kD)(COPS6)，0,0800450,151558mRNA.NM_013390跨膜蛋白2(TMEM2),mRNA.0,080045-0,24358AK093557cDNAFLJ36238fis,克隆THYMU2001422.0,0800450,236266NM—032044IV型再生基因(REG-IV),mRNA.0,080045-0,79212NM_0I7495含RNA结合区(RNPl,RRM)ll(RNPCl),mRNA.0,0800450,265594NM—152621假定蛋白MGC26963(MGC26963),mRNA.0'080739-0,39756AK092074cDNAFLJ34755fis,克隆NHNPC1000034.0,080739-0,31291NM_003615溶质栽体家族4,碳酸氢钠共转运蛋白，成员70,0807390,18244(SLC4A7),mRNA.NM_152586假定蛋白FLJ37318(FLJ37318),mRNA.0,080739-0,22746NM—002466v-myb成髓细胞瘤病毒癌基因H.log(禽类)样20,0807390,425478(MYBL2),mRNA.BC028376克隆IMAGE:4838541,mRNA.0,080739-0,22249BC011242克隆IMAGE:453763,mRNA.0,0807390,366334AL831862mRNA，cDNADKFZp76112317(来自克隆0,081827-0,16968DKFZp76112317).BC036876克隆IMAGE:5245135,mRNA.0,0821970,275752NMJB3339胱天蛋白酶7，凋亡相关半胱氨酸蛋白酶0,08233-0，22092(CASP7)，转录变体Y,mRNA.NM—000373—磷酸尿苷合成酶(乳清酸磷酸核糖基转移酶和乳0,082580，2964591<table>tableseeoriginaldocumentpage92</column></row><table>基因ID说明(18q缺失，表7)FDR效果NM—014593CpG结合蛋白(CGBP)，mRNA.0,089567NM—001920饰胶蛋白聚糖(DCN),转录变体A1，mRNA.0,089651NM—015338KIAA0978蛋白(KIAA0978),mRNA.0,089651AL080280mRNA全长插入cDNA克隆EUROIMAGE85卯5.0,089798NM_001249胞外核苦三磷酸二磷酸水解酶5(ENTPD5),0,091582mRNA.NM—032857内酰胺酶，(3(LACTB),转录变体l,核基因编码0,092221线粒体蛋白，mRNA.Z36818(xsl66)mRNA，400bp.0,092641BU594226AGENCOURT—8843927NIH—MGC—142cDNA克0,092641隆IMAGE:64496445',mRNA序列.NM_031453假定蛋白MGC11034(MGC11034),mRNA.0,092641NM—003859多碎醇磷酸甘露糖基转移酶多肽1,催化亚基0，092641(DPMI),mRNA.NM—001500GDP-甘露糖4，6-脱水酶(GMDS),mRNA.0,09289NM—016014CGI-67蛋白(CGI-67),mRNA.0,09289NM—016332含础蛋白质X,1(SEPX1),mRNA.0,09289U32248具有TGG重复的mRNA,克隆83.0,093518AK056401cDNAFLJ31839fis,克隆NT2RP7000086.0,093844NM—033126丝氨酸/苏氦酸激酶PSKH2(PSKH2),mRNA.0,093844NM—014071核受体共激活物6(NCOA6)，mRNA.0,094529NM_003526H2B组蛋白家族，成员L(H2BFL),mRNA.0,094617NMJB0582胶原，XV型III,a1(COL18A1),转录变体1,0,094767mRNA.AK002162cDNAFU11300fis,克隆PLACE1009886.0,094934NM—005944由单克隆抗体MRCOX-2鉴定的抗原(MOX2),0，094934mRNA.NM—138432可能是小鼠丝氨酸脱水酶相关序列的直向同源物10,094934(SDS-RS1),mRNA.BC003122克隆IMAGE:3357127，mRNA,部分cds.0,094934NMJB2813假定蛋白FUI4624(FU14624),mRNA.0,094934NM—007345锌指蛋白236(ZNF236),mRNA.0,094934NM_004891线粒体核糖体蛋白L33(MRPL33),核基因编码线0,094934粒体蛋白，转录变体l,mRNA.-0,165440,3422270,250409-0,40611-0，222710,202657-0,20224-0,307360,25132-0,233-0,242490,201764-0,302750,3755090,307430,2169090,1952150,319311-0,269-0,20733-0,170050,2745030,189731-0,170850,12568693<table>tableseeoriginaldocumentpage94</column></row><table>表8:具有20q上的染色体获得的、在结肠直肠腺瘤和腺癌细胞之间差异表达的人基因(单变量分析)。数据按FDR值排序。基因ID说明FDR效果(20q获得,表8)NM—003859多萜醇磷酸甘露糖基转移酶多肽1,催化亚基9，74E-070,418628(DPMI),mRNA.画一021809TGFB诱导的因子2(TALE家族同源框)(TGIF2),7,16E-060,394353mRNA.NM—024522假定蛋白FLJ12650(FLJ12650),mRNA.l,06E-050,261245画一O18840推定的Rab5相互作用蛋白(RIP5),mRNA.l,15E-050,317908NM—030815染色体20可读框126(C20orfl26),mRNA.0,0000790,315633濯一0刚2GW128蛋白(GW128),mRNA.0,0000790,31413AK024563cDNA:FLJ20910fis，克隆ADSE00492.0,0000790，400716画一O17896染色体20可读框11(C20orfl1),mRNA.0,0001110,253047雨—032527假定蛋白FU14972(KIAA1847),mRNA.0,0001110,210606NM一033342含三分基序7(TRIM7)，mRNA.0,000111-0,46251雇一l52777染色体14可读框48(C14orf48)，mRIMA.0,0001480,349834BC033940克隆IMAGE:5272723,mRNA,部分cds.0,0002190,328968NM一016397TH1样(果蝇)(TH1L),mRNA.0,0002770,256703丽一006602转录因子样5(基本螺旋-环-螺旋)(TCFL5),0,0002770,535295mRNA.NM一O16646间质干细胞蛋白DSCD28(LOC51336),mRNA.0,0002830,243076NM一002436膜蛋白，棕榈酰化的l,55kDa(MPPl),mRNA.0,0003520,425174画—024115假定蛋白MGC4309(MGC4309),mRNA.0,0003690,217642NM一012105(3位点APP切割酶2(BACE2),转录变体a，mRNA.0,000392-0,24343AB033070KIAA1244蛋白的mRNA,部分cds.0,000485-0,3724NM一0121卯甲酰四氢叶酸脱氢酶(FTHFD),转录变体1，0,000485-0,52114mRNA.NM一002296核纤层蛋白B受体(LBR)，mRNA.0,0006320,242622AL832390mRNA,cDNADKFZp667H2012(来自克隆0,000691-0,37264DKFZp667H2012).画一024898假定蛋白FU22757(FLJ22757),mRNA.0,000704-0,21365画—024592假定蛋白FU13352(FLJ13352)，mRNA.0，000704-0,28523Y11166U71b小核仁RNA基因.0,0012020,582884画—030789组织特异性(次要)13(HM13),mRNA.0,0012220,19987295基因ID说明FDR效果(20c)获得，表8)NM—018270染色体20可读框20(C20orf20),mRNA.0,0012230,186523NM—022105死亡相关转录因子1(DATF1),转录变体1,mRNA.0,00)430,272385NM—005077裂缝的转导蛋白样增强子1(E(spl)H,log,果蝇)0,001704-0,33036(TLEl),mRNA.AY069977前梯度蛋白3mRNA，完整cds.0,001712-0,70293NM—018439假定蛋白IMPACT(IMPACT),mRNA.0，00]712-0,30337NM_018710假定蛋白DKFZp7620076(DKFZp7620076),0,007120,338698mRNA.NM—003839肺瘤坏死因子受体超家族，成员lla，NFKB的激0,001802-0,425775活物(TNFRSF11A),mRNA.7NM—005710聚谷氨酰胺结合蛋白1(PQBP1),mRNA.0,0022470,146744NM一030877联蛋白，p样1(CTNNBL1),mRNA.0，0022470,296816NM—014593CpG结合蛋白(CGBP),mRNA.0,002247-0,20906NM—007039蛋白酪氨酸磷酸酶，非受体型21(PTPN21),0,002254-0,28594mRNA.BQ189477UI-E-EJl-aka-c-13-0-UI.rlUI-E國EJ1cDNA克隆0,00229-0，53703UI-E-EJ卜aka-c-13-0-UI5',mRNA序列.NM—002915复制因子C(激活物1)3,38kDa(RFC3),mRNA.0,002290,24125NM—018414GalNAca-2,6-唾液酸转移酶I,长形0,00229-0,5849(ST6GalNAcI)'mRNA.NM—024792在上皮样肺腺癌中表达的膜蛋白(CT120)，0,002393-0,223mRNA.NM一015338KIAA0978蛋白(KIAA0978),mRNA.0,003090,310714NM—018569假定蛋白PRO0971(PRO0971),mRNA.0,0033340,250694NM—014214肌醇(myo或4)-单磷酸酶2(IMPA2),mRNA.0,00338-0,27004AF085835全长插入cDNA克隆YI41B09.0,003380,554618NM—001432epiregulin(EREG),mRNA.0,003380,72949NM一017495含RNA结合区(RNPI'RRM)ll(RNPC1),mRNA.0,003380,318526NM一002212整联蛋白p4结合蛋白(ITGB4BP)，mRNA.0,003380,219412NM一033120棵角质层H.log2(果蝇)(NKD2),mRNA.0,003380'635327BC002877类似于假定蛋白FIJ11585,克隆MGC:l12580，003386-0,19597IMAGE:3942160,mRNA,完整cds.BC038852克隆IMAGE:5168364,mRNA.0,003386-0,5747AK057624cDNAFLJ33062fis,克隆TRACH200OO32.0,0034850,27666396基因ID说明FDR效果(20c)获得'表8)....................................................................................................NM—014657KIAA0406基因产物(KIAA0406),mRNA.0,0036250,31674NM—020673RAB22A,成员RAS癌基因家族(RAB22A),0,0038320,230507mRNA.NM—006886ATP合酶，H+转运，线粒体Fl复合物，￡亚基0,0038320,227079(ATP5E),核基因编码线粒体蛋白，mRNA.NMJB2872NADPH氧化酶相关的，含C2结构域的蛋白0，003846-0,30115(JTC1),mRNA.AK056292cDNAFLJ31730fis,克隆NT2RI2006838.0,0038460,480505NM—006839内膜蛋白，线粒体(tnitofilm)(IMMT),mRNA.0,003卯1-0,34137NM—006714酸性鞘磷脂酶样磷酸二酷酶(ASM3A),mRNA.0,004209-0,39427NM—002267核周蛋白a3(输入蛋白a4)(KPNA3),mRNA.0,0042090,57742NM—006746中足上的性梳样1(果蝇)(SCMLl)，mRNA.0,0044990,305508NM—016839RNA结合基序，单链相互作用蛋白1(RBMSl)'0,0046290,264982转录变体MSSP-2,mRNA.AK094894cDNAFLJ37575fis,克隆BRCOC2003125,中度0，0051140,195457类似于丙糖磷酸异构酶(EC5.3丄1),NM—03204V型再生基因(REG-IV),mRNA.0,005114-0,9253NM_021945假定蛋白FLJ22174(FLJ22174),mRNA.0,005173-0,4256BC029775假定基因LOC127421,克隆MGC:353940,005173-0，48807IMAGE:51S6268，mRNA,完整cds.BC014971类似于樣i管蛋白，p,2,克隆IMAGE:4873024,0,0051730,243047mRNA.BC040672克隆IMAGE:4816952，mRNA.0,005206-0,33858NM—003185TAF4RNA聚合酶II，TATA框结合蛋白(TBP)相0,0053090,249808关因子，135kDa(TAF4),mRNA.NM—38425假定蛋白BC009925(LOCI13246),mRNA.0,005406-0,24799NM_080476CDC91细胞分裂周期91样1(啤酒糖酵母)0,0054740,241093(CDC91L1),mRNA.NM—053286水通道蛋白6,肾特异性(AQP6),转录变体2,0,005474-0,47621n洲A.NM—000030丙氨酸-乙醛酸氨基转移酶(草酸盐沉着症I高草0,0065880,231166酸尿INM—024868假定蛋白FLJ14124(FIJ14124),mRNA.0,006588-0,36372AF441770Tho2mRNA,完整cds.0,0065880,21043697<table>tableseeoriginaldocumentpage98</column></row><table>基因ID说明FDR效果(20ci获得，表8)....................................................................NM—000273眼白化病1(Nettleship-Falls)(OAl),mRNA.0,0085620,388237AK093418cDNAFU36099fis,克隆TESTI2021057,弱类似0,0088520,400544于视网膜结合蛋白.NMJ)01062钴胺传递蛋白1(維生素B12结合蛋白，R结合物0,008928-0,58802家族)(TCN1),mRNA.BM669556UI-E-DX卜agw-c-13-0-UI.slUI-E-DX1cDNA克0,0089280,222546隆UI-E-DXl-agw-c-13-0-UI3'，mRNA序列.NM一032633假定蛋白MGC5457(MGC5457),mRNA.0,0092720,184803NM—012461TERF1(TRFl)-相互作用核因子2(TINF2)，0,009331-0,16965mRNA.NM一030672假定蛋白FU10312(FUJ0312),mRNA.0,0093310,348971NMJ)14622杂合性缺失，11,染色体区2,基因A0,00952-0,30272(LOH11CR2A),mRNA.NM—021114丝氨酸蛋白酶抑制剂，Kazal型,2(顶体蛋白-胰0,009691-0,30382蛋白酶抑制剂)(SPINK2)，mRNA.NM一014177HSPC154蛋白(HSPC154),mRNA.0,00984隱0，186UNM—001316CSEl染色体分离1样(酵母)(CSEIL),mRNA.0，0101390,227071NM一020315假定蛋白dJ37EI6.5(DJ37E16.5),mRNA.0,0102030,194366NM—130785TPTE和PTENH.logous肌醇脂质磷酸酶(TPIP),0,010213-0,2038mRNA.NMJ)14054染色体20可读框40(C20orf40)，mRNA.0,0102130,208409jihjjj-'、'j，v"i，jiv、i、叫、乂tji主u，uivy厶jfv/，^tJ0H7ZDKFZp686P07116).NM一007002粘附调节分子1(ADRM1),mRNA.0,010370,211848AK021916cDNAFLJ11854fis，克隆HEMBA1006767.0,0109870,231398NM—004715CTD(羧基末端结构域，RNA聚合酶II,多肽A)0,010995-0,14281磷酸酶,亚基1(CTDP1)，转录变体FCPla,mRNA.NM一004902含RNA结合区(RNP1,RRM)12(RNPC2),mRNA.0,0111730,2082%NM—006615钙激活中性蛋白酶9(nCL-4)(CAPN9),mRNA.0,011265-0,53614NM—006644热激105kD(HSP105B),mRNA.0,0113170,301377BC039527克隆IMAGE:5742065,mRNA.0,0114820,263524BC016864克隆IMAGE:3847536,mRNA.0,0114820'3158%NM—003404酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白，0,0116250,23437(3多肽(YWHAB),转录变体l,mRNA.99基因ID说明FDR效果(20cj获得，表8)NM—0246094艮定蛋白FLJ21841(FLJ21841)，mRNA.0，0116250,411411BC008975克隆MGC:16774IMAGE:4215274'mRNA,完整0,0116250,275597cds.AB033045mRNAforKIAA1219蛋白，部分cds.0,0117630，196977AY057051推定的整合膜蛋白mRNA,完整cds.0,0117630,3S4158NM—001151溶质栽体家族25(线粒体栽体腺苷酸异位体)，成0,011763-0,18736员4(SLC25A4),核基因编码线粒体蛋白，mRNA.AK093522cDNAFLJ36203fis,克隆TEST12028426，弱类似0,011763-0,39299于HISTONEH2BF.NM一024861假定蛋白FLJ22671(FLJ22671),mRNA.0,0117630,457049NM—030579细胞色素b5线粒体外膜前体(CYB5-M),mRNA.0,0120530,174642AJ227898部分mRNAIDEE2-8E.0,0121850,280683NM—013390跨膜蛋白2(TMEM2),mRNA,0,012188-0,263NM—014399跨膜4超家族成员tetraspanNET-6(NET-6),0,012449-0,24464mRNA.BC024318克隆IMAGE:3915414,mRNA.0,0126690,257688BC035561克隆MGC:40554IMAGE:5211583,mRNA,完整0,012687-0,27115cds.NM—032950基质金属蛋白酶28(MMP28),转录变体2,mRNA.0,012705-0,38736NMJK)2899视黄醇结合蛋白1,细胞(RBP1)，mKNA.0,0134370,415611NM—031407上游调节元件结合蛋白1(UREB1),mRNA.0,0135270,203237CA447552UI-H-EI0醫aye-j-13-0-UI.slNCI一CGAP一EIOcDNA0,0135270'242779克隆UI-H-E10-aye-j-13-0-UI3'，mRNA序列.AF086417全长插入cDNA克隆ZD78A02.0,0141210,530657NM—019610假定蛋白669(LOC56267).mRNA.0，0]42440,20125NM—001363先天性角化不良1，角化不良蛋白(DKC1),0,0142930,166155mRNA.BC031648KIAA1324蛋白，克隆MGC:351660,014293-0,53032IMAGE:569952,mRNA,完整cds.BC011242克隆1MAGE:4153763,mRNA.0,0142930,391582NM—024533假定蛋白FLJ22167(FLJ22167),mRNA.0,014448-0,38164NMJ44676假定蛋白MGC23911(MGC239n)，mRNA.0.014448-0,13111AL122070mRNA,cDNADKFZp434E0535(来自克隆0'0]444S-0,29939DKFZp434E0535)100<table>tableseeoriginaldocumentpage101</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage102</column></row><table>基因ID说明FDR效果(20g获得，表8)NM一003808肿瘤坏死因子(配体)超家族，成员13(TNFSF13),0,021611-0,33387转录变体a,mRNA.NM_015932假定蛋白HSPC014(HSPC014)，mRNA.0,021680,181839NM—021998锌指蛋白6(CMPX1)(ZNF6)，mRNA.0,021680,229833AF085893全长插入cDNA克隆YP95AI0.0,021680,202777NM一003118分泌的蛋白，酸性，富含半胱氨酸(骨粘连蛋白)0,021680,325687(SPARC),mRNA.NM—013451fer-1样3，myofcrlin(秀丽新杆线虫)(FER1L3),0,022435-0,20185转录变体1，mRNA.NM—006074含三分基序22(TRIM22),mRNA.0,022435-0,26807NM—001324切割刺激因子，3'前RNA,亚基1,50kDa(CSTFl),0,0224350,189653mRNA.NM—015362HSPC002蛋白(HSPC002),mRNA.0,022743-0，24258BC027604类似于CG14I82基因产物，克隆MGC:267820,0227430,164779IMAGE:4838212，mRNA,完整cds.NM_015352蛋白O-岩藻糖基转移酶1(POFUTl),转录变体1，0,0227430,305394mRNA.NM—152429假定蛋白MGC39320(MGC39320),mRNA,0,022749-0,26023NM—018282paraspeckle蛋白1(PSP1),mRNA.0,0227490,278469NM—007032Tara样蛋白(HRIHFB2122),转录变体1，mRNA.0,022749-0,23412BC033196克隆MGC:45840IMAGE:4849453,mRNA,完整0,022749-0,32489cds.NM—032229假定蛋白FLJ22774(FLJ22774),mRNA.0,022749-0,64794AK0卯928cDNAFU33609fis,克隆BRAMY2015890.0,022860>219169NM—023011类似于酵母Up。,变体A(UPF3A),转录变体l,0,022860,156934mRNA.AF339772克隆IMAGE:128781,mRNA序列.0,0233420,350884NM_OM353RAB26,成员RAS癌基因家族(RAB26),mRNA.0,023342-0,36521ALI22043mRNA,cDNADKFZp566G1424(来自克隆0,0233420>282538DKFZp566G1424).NM—021724核受体亚家族l,D组，成员1(NR1D1),mRNA.0,0233420,306694NM_OO0532丙酰辅酶A羧化酶，卩多肽(PCCB),核基因编码0,023342-0,19244线粒体蛋白，mRNA.NM—013974二甲基精氨酸二甲基氨基水解酶2(DDAH2),0,0233420,1809810,0233420，223I72基因ID说明FDR效果(20g获得，表8)mRNA.HSPC296mRNA，部分cds.0,023342-0,21477通用转录因子UIA(GTF3A),mRNA.0,0233420，254443cDNA:FLJ22030fis,克隆HEP08669.0,0233420,478539假定蛋白FU21478(FLJ21478),转录变体1，0,023342-0,23549mRNA.类似于RIKENcDNA4921536K2I，克隆IMAGE:4827637,mRNA.核受体亚家族2,c组，成员2(NR2C2),mRNA.剪接因子3a,亚基l，120kDa(SF3Al),mRNA.cDNA:FLJ21245fis，克隆COL01184.钾电压门控的通道，亚家族H(eag相关的)，成员2(KCNH2)，转录变体l,mRNA.克隆1MAGE:4866059，mRNA.ct间(球蛋白)抑制剂，H2多肽(ITIH2),mRNA.激肽释放酶l,肾/胰腺/唾液(KLK1),mRNA.假定蛋白FLJ23231(F1J23231),mRNA.钼辅因子合成3(MOCS3)，mRNA.丝氨酸/苏氨酸激酶PSKH2(PSKH2),mRNA.类似于假定蛋白F33H2,2-秀丽新杆线虫，克隆MGC:40403IMAGE:5180533，mRNA，完整cds.cDNAFU20845fis，克隆ADKA01901.602690864F1N[H—MGC—97cDNA克隆IMAGE:48232955',mRNA序列.假定蛋白FLJ14564(FLJ14564),mRNA.CDC10细胞分裂周期10H.log(啤酒糖酵母)(CDCIO)，mRJSIA.真核翻译起始因子2,亚基2p,38kDa(EIF2S2),mRNA.合酶，H+转运，线粒体FO复合物，亚基c(亚基9),同工型2(ATP5G2),mRNA.含START结构域5(STARD5)，mRNA.0,026933-0,19682-假定蛋白MGC33338(MGC33338),mRNA.0,027461-0,18439克隆IMAGE:5262734,mRNA.0,0274750,250234AF161414NM一002097AK025683廳—()24618BC031973NM—003298画—005877AK024898顧—000238BC0157卯固—002216薩—002257NM—025079顧—014484醒—033126BC03O520AK000852BG723246刚—032550画一001788NM—003，画—005176NM—030574NM—152366BC0385120,0233420,0235220,0236150,0240920,0245640,0245640,0247570,0247570,0249120,0252330,0259450,0259450,0259450,0261210,026931-0'17191-0,1859-0,443290,314197-0,466440,394375-0,45029-0,277680,3682810,3175750,1911890,163988-0,48691-0,396330,1794530,0269310.1818610,0269310,240383104基因ID说明(20q获得，表S)FDR效果AK093993cDNAFLJ36674fis,克隆UTERU2004197.0,027475-0,28392NM_004738VAMP(液泡相关膜蛋白)相关蛋白B和C(VAPB),0,0275840,288854mRNA.BC04I376类似于假定蛋白5830442F04,克隆MGC:438950,027584-0,34671IMAGE:5274634，mRNA,完整cds.NM—012469染色体20可读框14(C20orfl4)，mRNA.0,0275840.228577NM—017423UDP-N-乙酰-a-D-半乳糖胺多肽N-乙酰氨基半0,02807-0,22549乳糖基转移酶7(GalNAc-T7)(GALNT7),mRNA.AK096918cDNAFLJ39599fis,克隆SKNSH2003174.0,0281370,396244AB054MK1AA1708蛋白的mRNA,部分cds.0,0283490,118787NM—000456亚硫酸盐氧化酶(SUOX),核基因编码线粒体蛋0,028349-0,15531白，mRNA.NM—002905视黄醇脱氢酶5(ll-顺式和9-顺式)(RDH5),0,02848-0,18593mRNA.NM—003358UDP-葡萄糖神经酰胺葡糖基转移酶(UGCG),0,0285790,137583mRNA.AL833275mRNA,cDNADKFZp451C]18(来自克隆0,0288620,284558DKFZp451C118).NM—015392神经增生，分化和控制，l(NPDCl),mRNA.0,028862-0,29974NM—080672Q9H4T4样(HI7739),mRNA.0,028862-0,52739AF118079PR01854mRNA，完整cds.0,0288780,231825NM_000835谷氨酸受体，离子型，N-曱基D-天冬氨酸2C0,0288780,218899(GRIN2C),mRNA.AB033100KIAA1274蛋白的mRNA,部分cds.0,0291540,382182AL831866mRNA,cDNADKFZp76100117(来自克隆0,029154-0,30015DKFZp76100117).NM—001888晶体蛋白，n(CRYM),mRNA.0,029406-0,35197BC040628克隆IMAGE:5745274,mRNA.0,029491-0,3608〗NM_0I8283假定蛋白FLJ10956(FLJ10956),mRNA.0,0297740,120587NM—000537肾素(REN),mRNA.0,029788-0:22482BM476468AGENCOURT—6476297NIH—MGC—85cDNA克0,0301740,296564隆IMAGE:55533955',mRNA序列.AF084362硫辛酸-蛋白连接酶BmRNA，部分cds.0,030307-0,20895AL8342mRNA,cDNADKFZp761D221(来自克隆0，030486-0,299105<table>tableseeoriginaldocumentpage106</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage107</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage108</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage109</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage110</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage111</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage112</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage113</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage114</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage115</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage116</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage117</column></row><table>基因ID说明FDR效果(20cj获得，表8)隆1MAGE:64630135'，mRNA序列.BC029776类似于CG12393基因产物，克隆IMAGE:5188623,0,07184-0,2622mRNA,部分cds.AB037842KIAA1421蛋白的mRNA,部分cds.0,072155-0,23954NM—014587SRY(性别决定区Y)-框8(SOX8),mRNA.0,07260,345598BC034459克隆IMAGE:5185460,mRNA.0,072826-0,21496NM_006721腺香激酶(ADK)'转录变体ADK-long,mRNA.0,0729190,106291NM—016463假定蛋白HSPC195(HSPC195),mRNA.0,0730540,175255AK096306cDNAFU38987fis，克隆NT2RI2005818.0,0730910,228787NM—145293类似于假定蛋白FLJ20897(LOC196549),mRNA,0,0731140,114053NM—018360X染色体可读框15(CXorfl5),mRNA.0,0732750,210295NM一025206fer-1样4(秀丽新杆线虫)(FERL4),mKNA.0,073390,195812NM_013279染色体11可读框9(Cllorf9),mRNA.0,073526-0,25629AK021733cDNAFLJ11671fis,克隆HEMBA1004730.0,0737450,233873BU567822AGENCOURTJ0398839NIH_MGC—82cDNA克0,074029-0,25351隆IMAGE:66145245'，mRNA序列.NM_006668细胞色素P450,亚家族46(胆固醇24-鞋化酶)0，074029-0,23363(CYP46),mRNA.NM—025051假定蛋白FLJ23022(FU23022),mRNA.0,074384-0,26598NM—0I47I4KIAA05卯基因产物(KIAA0590),mRNA.0,07479-0,17485NM_018206空泡蛋白分选35(酵母)(VPS35)，mRNA.0,074790,104322NM—022101假定蛋白FU22965(FU22965),mRNA.0,0750060,130346BC035372克隆MGC:35266IMAGE:5174235,mRNA,完整0,075061-0,2973cds.NM—001910组织蛋白酶E(CTSE),转录变体1,mRNA.0,075061-0,45924BC038767克隆IMAGE:5270478,mRNA.0,075213-0,36496NM—057158双特异性磷酸酶4(DUSP4)，转录变体2,mRNA.0,075244-0,22098BC020844克隆MGC:23971IMAGE:4714217，mRNA,完整0,075708-0，17112cds.濯一—133373类似于,脂酶C,S(LOC113026),mRNA.0,076165-0,21763画——005128染色体21可读框5(C21orf5),mRNA.0,076313-0,22382画_—004394死亡相关蛋白(DAP)，mRNA.0,076313-0,15565NM-—080752染色体20可读框164(C20orfl64),mRNA.0,0763880,203084AF088051全长插入cDNA克隆ZD63G05.0,0767-0,17243118基因ID说明(20q获得，表8)FDR效果AK026418固—014489BC020896NM—016183NM—005944NM—004403NM—033292AF147436NM一O12401麵_簡10薩_144658NM001085画J)18043AK058068NM—022045NM_030925NM—024556AK025793NM—024123NM—024426NM—00〗313NM—005900NM—022445AB013384BC040982BC035660画014080cDNA:FLJ22765fis,克隆KAIA1180.FGF受体激活蛋白1(FRAG1)，mRNA.克隆IMAGE:47]0650,mRNA.染色体1可读框33(Clorf33),mRNA.0,0769540,0774470,0776060,077697由单克隆抗体MRCOX-2鉴定的抗原(MOX2),0,078387mRNA.聋，常染色体显性5(DFNA5),mRNA.0,078387胱天蛋白酶l,凋亡相关半胱氨酸蛋白酶(白介素0,0783871，p，转化酶)(CASP1)，转录变体a,mRNA.全长插入cDNA克隆YP87B10.0，078387丛蛋白B2(PLXNB2),mRNA.0,078387EKN1(EKN1),mRNA.0,078387假定蛋白FLJ32122(FLJ32122),mRNA.0,078859丝氨酸(或半胱氨酸)蛋白酶抑制剂，进化技A0,078863(a-l抗蛋白酶，抗胰蛋白酶)，成员3(丝氨酸蛋白酶抑制蛋白A3)，mRNA.假定蛋白FLJ10261(FLJ10261),mRNA.0,078863cDNAFLJ25339fis,克隆TST00959.0,078863Mdm2,转化的3T3细胞双微体2,p53结合蛋白(小0,079107鼠)结合蛋白，104kDa(MTBP),mRNA.假定蛋白FLJ12577(FLJ12577),mRNA.0,079318假定蛋白FLJ21103(FU21103),mRNA.0,080434cDNA:FLJ22140fis,克隆HEP20977,0,080434淋巴细胞抗原6复合物，基因座G6E(LY6G6E),0,080698mRNA.Wilms肺瘤1(WT1),转录变体D，mRNA.0,08101瓦解蛋白反应调节蛋白1(CRMP1),mRNA.0，08105MAD,母体抗decapeirtaplegicH.log1(果蝇)0,081105(MADH1),mRNA.磁胺素焦磷酸激酶1(TPKl)，mRNA.0,081334HIPlR的mRNA,完整cds.0,081334克隆1MAGE:4798675，mRNA.0,08137克隆IMAGE:5721900，mRNA.0,081442双氧化酶2(DUOX2),mRNA.0,0814420,259588-0,14138-0,552740,104503-0,184310,193986-0,34641-0,22072-0,13448-0,316010,153119-0，3944I-0,345720,2152920,2514060,347034-0,1579-0,281280,215830,5111740,52517-0,17975-0,2798-0,17225-0,17380,420216-0,49211119基因ID说明FDR效果(20cj获得，表8)NM—004092烯酰辅酶A水合酶，短链，1,线粒体(ECHS1),0,081442-0,13245核基因编码线粒体蛋白，mRNA.NMJKJ2874RAD23H.logB(啤酒糖酵母)(RAD23B),mRNA,0,0814420,115098NM—001800细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2D(pl9,抑制0,0814420,175601CDK4)(CDKN2D),转录变体l,mRNA.BI789172ie52h09.xlMelton标准化的人胰岛4N4-HIS10,081442-0,25886cDNA克隆IMAGE:56707613',mRNA序列.AF264629未表征的胃蛋白Z.A43PmRNA,部分cds.0,0814420,222508NM—024卯8假定蛋白FLJ12973(FLJ2973),mRNA.0，08442-0，24063NM一016084RAS，地塞米松译导的1(RASD1),mRNA.0,081443-0,30879NM—005263生长因子依赖性1(GFI1),mRNA.0,08166-0,21716AK024346cDNAFIJ14284fis,克隆PLACE1005898.0'08192-0,27611NM—000274鸟氨酸氨基转移酶(螺旋状萎缩)(OAT),核基因编0,0824010,275897码线粒体蛋白，mRNA.M64247心脏肌钙蛋白ImRNA，完整cds.0,0824010,314683NM—004925水通道蛋白3(AQP3)'mRNA.0,082401-0,33953NM—015926推定的分泌的蛋白ZSIG1(ZSIG11),mRNA.0,082401-0,16468AL137442mRNA,cDNADKFZp566C114(来自克隆0,0826040,274811DKFZp566C114)部分cds.AFU6695PR0222mRNA，完整cds.0,0827350,302746AK096129cDNAFLJ38810fis，克隆LIVER2006251.0,0828770,208516AL834283mRNA,cDNADKFZp547N0315(来自克隆0,0830160,181979DKFZp547N0315).NM—006825细胞骨架相关蛋白4(CKAP4)，mRNA.0,08318-0,1303BC038356克隆IMAGE:4825207,mRNA.0,08334-0,21392NM—003850琥珀酸-辅酶A连接酶，ADP-形成素g,(3亚基0,083340,134511(SUCLA2)，mRNA.NM—032661假定蛋白MGC5139(MGC5139),mRNA.0,08334-0,15739BC014162克隆IMAGE:4547814,mRNA.0,083340,318786BG107100602291004F1NIH—MGC_85cDNA克隆0,083340,224361IMAGE:4385725',mRNA序列.AK093715cDNAFU36396fis,克隆THYMU2009526.0,08334-0,1926NM—006259蛋白激酶，cGMP依赖性，II型(PRKG2)，mRNA.0,08334-0,22058AK0219I3cDNAFUl1851fis,克隆HEMBA1006744.0,08334-0,1134120<table>tableseeoriginaldocumentpage121</column></row><table>基因ID说明FDR效果(20q获得，表8)NM—005618S样l(果蝇)(DLLl),mRNA.0,087756-0,1卯63NM—020182跨膜，前列腺雄激素诱导的RNA(TMEPAI)，0,0877560,281365mRNA.画_152400假定蛋白FLJ39370(FLJ39370),mRNA.0,087756-0,18205AK055903cDNAFLJ3341fis,克隆MESAN1000050.0,087756-0,31828NM—032483HTPAP蛋白(HTPAP),mRNA.0,087963-0,15815AK090706cDNAFLJ33387fis,克隆BRACE2006636.0,087963-0,29997AF130090克隆FLB9530PRO2574mRNA,完整cds.0,0879630,404278BC036799克隆IMAGE:55卯162,mRNA.0,087963-0,20596AK091562cDNAFLJ34243fis,克隆FCBBF3028593,高度0,0879670,170231类似于锌指蛋白ZFP-l.NM—007048嗜乳脂蛋白，亚家族3,成员Al(BTN3Al)，mRNA.0,087967-0,19681NM—003496转化/转录结构域相关蛋白(TRRAP)，mRNA.0,088048-0,17804函—022658同源框C8(HOXC8)，mRNA.0,0882440,177866NM—002023纤调蛋白(FMOD)，mRNA.0,088474-0,27322NM—020865死亡/H(Asp-Glu-Ala-Asp/His)框多肽360,0888310,130167(DDX36)，mRNA.翻一014350TNF诱导的蛋白(GG2-1),mRNA.0，08卯78-0,17898AF086476全长插入cDNA克隆ZD88F12.0'08卯780,27836NM—003155司腺钙蛋白1(STC1),mRNA.0'08卯780,280653NM—002389膜辅因子蛋白(CD46,滋养层-淋巴细胞交又反应性0,0892480,18632抗原)(MCP)，转录变体a,mRNA.画_003635N-脱乙酰酶/N-磺基转移酶(肝素葡糖胺基)20,0896460,149154(NDST2),mRNA.AF344194克隆活性转录的Alu序列.0,089652-0,15984AJ292079MUC5AC蛋白的部分mRNA(粘蛋白基因，0,089795-0,97009MUC5AC).腹_014747KIAA0237基因产物(KIAA0237)，mRNA,0,089874-0,22134画—002447巨噬细胞刺激1受体(c-met相关的駱氨酸激酶)0,089948-0,20784(MST1R),mRNA.画—013261过氧化物酶体增殖激活的受体，y,共激活物10,08999-0,18143(PPARGC1),mRNA.AK098381cDNAFLJ25515fis,克隆CBR06479.0,0卯079-0,10508NM一016129COP9组成型光形态形成H.log亚基4(拟南齐)0,0卯079-0,09671122<table>tableseeoriginaldocumentpage123</column></row><table>基因ID说明(20q获得，表8)FDR效果NM—007283单酰甘油脂酶(MGLL),mRNA.0,094536-0,18844画—OOJ920饰胶蛋白聚糖(DCN)，转录变体Al,mRNA.0,0945360,289786BM804045AGENCOURT—6460684NIH—MGCJ8cDNA克0,0948890,238679隆IMAGE:55612405',mRNA序列.AL833743mRNA，cDNADKFZp666E036(来自克隆0,0951970,279238DKFZp666E036).丽_000607血清类黏蛋白1(ORM1),mRNA.0，0951970,515915謝—032857内酰胺酶，卩(LACTB)，转录变体l,核基因编码0,095306-0,18893线粒体蛋白，mRNA.NM—005卯8甘露糖苷酶，pA,溶酶体(MANBA),mRNA,0,095306-0,17218画一l52368假定蛋白MGC9629(MGC9629),mRNA.0,095560,158407AK097081cDNAFLJ39762fis,克隆SPLEN1000156.0,0955750,229516AK000671cDNAFLJ20664fis,克隆KAIA795.0,095575-0,28289LI0404表面活性剂蛋白B结合蛋白mRNA,完整cds.0,095672-0,23267NM—015446ELYS转录因子样蛋白TMBS62(elys),mRNA.0,0956720,133758雇—018662在精神分裂症中破坏的1(DISCI),mRNA.0,095672-0,34094BG774620602662836F1N1H—MGC—21cDNA克隆0,0957390,104531IMAGE:481簡5',mRNA序列.NM—019067假定蛋白FLJ10613(FLJ10613),mRNA.0,0961010,132872AF058簡克隆G4-10-3粘蛋白4(MUC4)mRNA,部分cds.0,09618-0,4132NM—021182次要组织特异性抗原HB-1(HB-1),mRNA.0,0967940,224357NM—020233x006蛋白(MDS006),mRNA.0,097063-0，2374NM_016940染色体21可读框6(C21orf6),mRNA.0,097245-0,15326AK092373cDNAFLJ35054fis,克隆OCBBF2018380.0,097265-0,16439NM—001550干扰素相关的发育调节物1(IFRD1),mRNA.0,0974850,12646NM_030792假定蛋白PP1665(PP1665),mRNA.0,097860,20522AK024511cDNA:FLJ20858fis，克隆ADKA01561.0,09786-0,23219NM_032313假定蛋白MGC3232(MGC3232),mRNA.0,09786-0,16NM—005141纤维蛋白原，B(3多肽(FGB),mRNA.0,097942-0,57243AB062438OK/SW-CL.30的mRNA,完整cds.0,0979420,495277NM—005759abl-相互作用物2(ABI-2),mRNA.0,0979420,14493NM—053012假定蛋白LOC114137(LOC114137),mRNA.0,097942-0,18464NM_002511神经调节肽B受体(NMBR),mRNA.0，097942-0,16282NM—004479岩藻糖基转移酶7(a(1,3)岩藻糖基转移酶)0,097942-0,23954124<table>tableseeoriginaldocumentpage125</column></row><table>基因ID说明FDR效果(20cj获得，表8)NM—014060MCT-1蛋白(MCT-1),mRNA.0,0999170,1335NM—152703假定蛋白FLJ39885(FLJ39885)，mRNA.0,099917-0,24777NM—003049溶质载体家族10(钠/胆酸共转运蛋白家族)，成员0,099917-0,317541(SLC10A1)，mRNA.表9:具有8q上的染色体获得的、在结肠直肠腺瘤和腺癌细胞之间差异表达的人基因(多变量分析)。126<table>tableseeoriginaldocumentpage127</column></row><table>基因ID说明(20q获得，表9)FDR效果26BC029775假定基因LOC127421,克隆MGC:353940,015926-2,59845IMAGE:5186268,mRNA,完整cds.27画一O18690栽脂蛋白B48受体(APOB48R)，mRNA.0,016058-2,6173828画一0219U"氨基丁酸(GABA)A受体,p2(GABRB2),转录0.019169-6,04422变体1，mRNA.29画一O16646间质千细胞蛋白DSCD28(LOC51336),mRNA.0,0218021，43%6630BC0楊72克隆IMAGE:4816952,mRNA.0,023629-1,5883931NM—138409假定蛋白BC010003(L0C112609),mRNA.0,023629-1,7331732NM一005877剪接因子3a,亚基I，120kDa(SF3Al),mRNA.0,023629-1,4930433NM一012190曱酰四氮叶酸脱氢酶(FTHFD)，转录变体1,0,023629-2,42935mRNA.34NM一003600丝氨酸/苏氨酸激酶6(STK6),mRNA.0,0245892,38859735画一018414GalNAca-2，6-唾液酸转移酶I,长形0,024589-3'79484(ST6Ga歸cI),mRNA.36NM一002759蛋白激酶，干扰素诱导型双链RNA依赖性0,0245891,141759(PRKR),mRNA.37NM一080476CDC91细胞分裂周期91样1(啤酒糖酵母)0,0246861,600234(CDC91L1),mRNA.38雇一000311肌病毒蛋白(p27-30)(Creutzfeld-Jakob病，0,0246861,773454Gerstmann-Strausler-Scheinker综合4正，致死性家族性失眠症MPRNP),mRNA.39画一002296核纤层蛋白B受体(LBR)，mRNA.0,025051,54549140NM一053286水通道蛋白6,肾特异性(AQP6),转录变体2,0,029067-2,35392tnRNA.41画—006602转录因子样5(基本螺旋-环-螺旋)(TCFL5)，0,0329592,252188mRNA.42BM669556UI-E-DXl-agw-c-13-0-UI.slUI-E-DX1cDNA克0,0329591,420023隆UI-E-DXl-agw-c-I3-0-Ul3',mRNA序列.43NM一030789组织特异性(次要)13(HM13),mRNA.0,0329591,3381]544则一012"2染色体20可读框1(C20orfl),mRNA.0,0331632,15101745AF258564PP3781mRNA,完整cds.0,0334293,6322846NMJ)00835谷氨酸受体，离子型，N-曱基D-天冬氨酸2C0,0334291,500558(GRIN2C),mRNA.47顧一OI2柳染色体20可读框14('C20orfl4)，mRNA.0,0334291,617033128<table>tableseeoriginaldocumentpage129</column></row><table>基因ID74BC041376757677808182838485868788卯9192939495%97AK021691AF353674AL83428378NM—03274479画000442NM—005538Z34278NM—033339NM—005618NM—016938NM—152369NM—018244则—133367BC03164889BC008502NM_13S340羅_006259丽—024533NMJKM155NM—020831AK095808NM—138573NM00383998NM004237说明(20g获得，表9)类似于假定蛋白5830442F04,克隆MGC:43895IMAGE:5274634,mRNA，完整cds.cDNAFL川629fis,克隆HEMBA1004241.BTB结构域蛋白(BDPL)mRNA,部分cds.mRNA,cDNADKFZp547N0315(来自克隆DKFZp54，315).假定蛋白MGC12335(MGC12335),mRNA.血小板/内皮细胞粘附分子(CD31抗原)(PECAM1),mRNA.4中制素，卩C(INHBC),mRNA.(JER58)MUC5AC粘蛋白的mRNA(部分).胱天蛋白酶7,凋亡相关半胱氨酸蛋白酶(CASP7),转录变体7,mRNA.5样l(果蝇)(DLLl),mRNA.含EGF的纤蛋白样细胞外基质蛋白2(EFEMP2),mRNA.假定蛋白MGC45474(MGC45474),mRNA.染色体20可读框44(C20orf44),mRNA.染色体6可读框33(C6orf33),mRNA.KIAA1324蛋白，克隆MGC:35166IMAGE:5169952,mRNA,完整cds.克隆MGC:14841IMAGE:4295121，mRNA，完整cds.含abhydrolase结构域3(ABHD3),mRNA.蛋白激酶，cGMP依赖性，n型(PRKG2)，mRNA.假定蛋白FLJ22167(FU22167),mRNA.联膜蛋白A6(ANXA6),转录变体l,mRNA.成巨核细胞白血病(异位)1(MKL1),mRNA.cDNAFLJ38489fis,克隆FEBRA2023550,弱类似于P3蛋白.神经调节蛋白4(LOC145957),mRNA.肿瘤坏死因子受体超家族，成员lla,NFKB的激活物(TNFRSF11A),mRNA.曱状腺素受体相互作用物13(TRIP13),mRNA.FDR效果0,055936-1,860450,0559360,056150,0578090,0578860,0578860,0578860,0586720,0586720,0588830,059763。，0647180'0675U0,0705850,0705851,502259-1,351161'423136-3,23807-2,70861,147071-4,85491-1,40297-1,29421,522942-1,602571,488465-1,81794-3,167180,071165-1,661790,07％70,079670,0721910,0755650,0755650，0755650,0755650,075565-1,61731-1,74885-1,972661,760937-1,03031-1,19307-1,28984-1,639750,0755652,118122130<table>tableseeoriginaldocumentpage131</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage132</column></row><table>表10:位于染色体缺失区内并且具有8p上的染色体缺失、显示结肠直肠腺瘤和腺癌细胞之间的差异表达的人基因。8p说明(8p缺失，表10)命中数#弁画一020749AT2受体-相互作用蛋白l(ATIPl),mRNA.3xNM_004315N-酰基鞘氨醇酰胺水解酶(酸性神经酰胺酶)1(ASAH1),3xmRNA.画——003747锚端聚合酶，TRFl-相互作用锚蛋白相关的ADP-核糖聚合2x酶(TNKS)，mRNA.丽-_016353锌指，含DHHC结构域2(ZDHHC2),mRNA.2x画——152415假定蛋白FLJ32642(FLJ32642)，mRNA.2x薩_006197中心粒旁物质1(PCM1),mRNA.2x丽—000662N-乙酰转移酶1(芳基胺N-乙酰转移酶)(NAT1),mRNA.2x画—匿000015N-乙酰转移酶2(芳基胺N-乙酰转移酶)(NAT2),mRNA.2xD31887KIAA0062基因的mRNA,部分cds.2x画—017884PIN2-相互作用蛋白1(PINX1),mRNA.lx画——004462法尼基-二磷酸法尼基转移酶1(FDFT1),mRNA.lx画—006765推定的前列腺癌肿瘤抑制物(N33)，mRNA.lx画一001715B淋巴细胞激酶激酶(BLK),mRNA.lx画_012331曱硫氨酸亚砜还原酶A(MSRA),mRNA.lx觀——139167sarcoglycan;(SGCZ),mRNA.lxNM—013354CCR4-NOT转录复合物,亚基7(CNOT7),转录变体l，mRNA.lx画-_005144无毛(HR),转录变体l,mRNA.lx##:表10-16中的"命中数"是指独立测定的数目，在所述测定中对于给定基因观察到了改变的表达与结肠直肠腺癌细胞的存在之间的关联(与样品的基因组背景无关的改变的表达，即在染色体异常的类型上选择的样品集合的改变的表达)。表ll:位于染色体缺失区内并且具有8q上的染色体获得、显示结肠直肠腺瘤和腺癌细胞之间的差异表达的人基因。133<table>tableseeoriginaldocumentpage134</column></row><table>表12:位于染色体缺失区内并且具有13q上的染色体获得、显示结肠直肠腺瘤和腺癌细胞之间的差异表达的人基因。基因ID说明命中数(13q获得，表12).....................NM__145293类似于假定蛋白FLJ20897(LOC196549)，mRNA.3xN风一005358仅LIM结构域7(LM07),转录变体1,mRNA.3xU50531BRCA2区，mRNA序列CG030.2xNM——012158F框和富含亮氨酸的重复蚤白3A(FBXL3A),mRNA.2xNM——017817RAB20,成员RAS癌基因家族(RAB20),mRNA.2xNM一一003899Rho鸟。票呤核苷酸交换因子(GEF)7(ARHGEF7)，转录变体1,2xmRNA.丽-—003903CDC16细胞分裂周期16同源物(啤酒糖酵母)(CDC16),2xmRNA.NM-—018386假定蛋白FLJ11305(FLJ11305),mRNA.2xBC008975克隆MGC:16774IMAGE:4215274，mRNA,完整cds.2xNM_—023011类似于酵母Upfi,变体A(UPF3A),转录变体l,mRNA.2xNM—_001260细胞周期蛋白依赖性激酶8(CDK8),mRNA.lxNM_—006646WAS蛋白家族，成员3(WASF3),mRNA.xU50524BRCA2区，mRNA序列CG017.lx丽一—033111CG016(LOC88523),mRNA.lxNM——024808假定蛋白FLJ22624(FLJ22624),mRNA,lx画-—014832TBC1结构域家族，成员4(TBC1D4),mRNA.lxNM_一006002遍在蛋白羧基末端酯酶L3(遍在蛋白硫羟酸酯酶)(UCHL3),lxmRNA.丽——015057KIAA0916蛋白(KIAA0916),mRNA.lx画-—024546假定蛋白FLJ13449(FLJ13449),mRNA.lxBC026126假定蛋白KIAA1165,克隆MGC:3415IMAGE:3027907,lxmRNA,完整cds.画_—006493蜡样脂-脂褐质沉积症，神经元的5(CLN5),mRNA.lx画—_018210假定蛋白FU10769(FLJ10769),mRNA.lx雨—_017664假定蛋白FLJ20093(FLJ20093),mRNA.lx表13:位于染色体缺失区内并且具有15q上的染色体缺失、显示结肠直肠腺瘤和腺癌细胞之间的差异表达的人基因。<table>tableseeoriginaldocumentpage136</column></row><table>表15:位于染色体缺失区内并且具有18q上的染色体缺失、显示结肠直肠腺瘤和腺癌细胞之间的差异表达的人基因。基因ID说明(18q缺失，表15)命中数NM—004715CTD(羧基末端结构域，RNA聚合酶II,多肽A)磷酸酶,亚基12x(CTDP1)，转录变体FCPla,mRNA.NM_006701类似于粟酒裂殖酵母diml+(DIMl),mRNA.2xNM—014913KIAA0863蛋白(KIAA0863),mRNA._lx表16:位于染色体缺失区内并且具有20q上的染色体获得、显示结肠直肠腺瘤和腺癌细胞之间的差异表达的人基因。基因ID说明命中数(20g获得，表16)NM—016397TH1样(果蝇)(TH1L),mRNA.8xNM—018270染色体20可读框20(C20orf20),mRNA.8xNM_006602转录因于样5(基本螺旋-环-螺旋)(TCFL5),mRNA.7xNM_080476CDC91细胞分裂周期91样1(啤酒糖酵母)(CDC91L1),6xmRNA.NM—017896染色体20可读框11(C20orfl1),mRNA.6xNM—006097肌球蛋白调节性轻链2,平滑肌同种型(MYRL2),mRNA.5xNM—021809TGFB请导的因子2(TALE家族同源框)(TGIF2)，mRNA.5xNM_018840推定的Rab5相互作用蛋白(RIP5),mRNA.5xNM_003600丝氨酸/苏氨酸激酶6(STK6),mRNA.5xNM017495含RNA结合区(RNPl,RRM)ll(RNPC1),mRNA.5xNM—007002粘附调节分子1(ADRMl)，mRNA.5xNM—016354溶质栽体家族21(有机阴离子转运蛋白)，成员12(SLC21A12),5xmRNA.NM—014071核受体共激活物6(NCOA6),mRNA.4xNM—002212整联蛋白(34结合蛋白(ITGB4BP),mRNA.4xNM—003185TAF4RNA聚合酶II,TATA框结合蛋白(TBP)相关因子，4x135kDa(TAF4)，mRNA.NM—152255蛋白酶体(前体，macropain)亚基，a型，7(PSMA7),转录4x<table>tableseeoriginaldocumentpage138</column></row><table>基因ID说明命中数(20q获得，表16)画一一003908真核翻译起始因子2,亚基2(3,38kDa(EIF2S2),tnRNA.lxNM—003610RAElRNA输出1同源物(粟酒裂殖酵母)(RAE1),mRNA.lxNM-153360假定蛋白FLJ90166(FU90166),mRNA.lx固一080425GNAS复合物基因座(GNAS),转录变体3，mRNA.lxNM—■114内皮缩血管肽3(EDN3),mRNA.lx丽-001853胶原，IX型，a3(COL9A3),mRNA.lxNM—144498氧基固醇结合蛋白样2(OSBPL2),转录变体2，mRNA.lxNM——017798染色体20可读框21(C20orf21),mRNA.lxNM—012384糖皮质激素条件元件结合蛋白2(GMEB2),mRNA.lx表17:具有染色体异常、在结肠直肠腺瘤组织和结肠直肠腺癌组织之间具有改变的表达的标记基因。139<table>tableseeoriginaldocumentpage140</column></row><table>基因ID说明(表n)FDR效果AF191020E2IG5(E2IG5)mRNA,完整cds.0,071441-0,25437AF258564PP3781mRNA,完整cds.0,0334293,63228AF304443B淋巴细胞激活相关蛋白BC-2048mRNA,完整0,094327-0,7255AF339772cds.克隆IMAGE:128781,mRNA序列.0,0368250,386798AF350451C6orf37mRNA,完整cds.0,064674-0,32683AF353674BTB结构域蛋白(BDPL)mRNA,部分cds.0,05615-1,35116AF441770Tho2mRNA,完整cds.0,004211,754557AF514992核蛋白p30mRNA,部分cds.0,090807-0,16537AI546979PN2.1—12—B02.rmynormcDNA5',mRNA序列.0,041285-3,01754AI652393wb20fD2,xlNCI—CGAP—GC6cDNA克隆0,0758680,223284IMAGE:23062353',mRNA序列.AJ292079MUC5AC蛋白的部分mRNA(粘蛋白基因，0,043301-1,2742MUC5AC).AJ489592糖基化依赖性细胞粘附分子1的mRNA0,0506421,402198(GLYCAM1基因)，分离的KHcl5.AJ489980溶质载体家族13的mRNA(钠依赖性二羧酸转运0,076544-0:45616蛋白)'成员2(SLC13A2基因).AK000165cDNAFLJ20158fis,克隆COL08935.0,077657-0，21885AK001130cDNAFL羅68fis,克隆HEMBB1001058,弱类0,083270,318442似于神经元的线状蛋白AD7c-NTPrnRNA.A副l卯3cDNAFLJ11041fis,克隆PLACE1004405.0,0818880,583886AK002162cDNAFL川300fis,克隆PLACE1009886.0,094934-0,269AK021691cDNAFLJ11629fis，克隆HEMBA1004241.0,0559361,502259AK021812cDNAFLJ11750fis,克隆HEMBA1005568.0,045178-0,35545AK021887cDNAFL川825fis,克隆HEMBA1006494.0,072998-0'51913AK022101cDNAFLJI2039fis,克隆HEMBB1001930.0,080006-0,23547AK022220cDNAFLJ12158fis,克隆MAMMA1000522.0,061202-0,32507AK022263cDNAFLJ12201fis,克隆MAMMA1000906.0,084113-0,27479AK022295cDNAFLJ12233fis,克隆MAMMA1001215.0,0938660,230759AK022424cDNAFLJ12362fis,克隆MAMMA1002360.0,099417-0,36672AK022426cDNAFLJ12364fis,克隆MAMMA1002384.0,082429-0,99196AK022479cDNAFLJ12417fis,克隆MAMMA1003039.0,0744570，407503AK022745cDNAFLJ12683fis,克隆NT2RM4002457.0,088650,379521基因ID说明(表17)FDR效果AK022947cDNAFLJ12885fis,克隆NT2RP2003988.0,0855490,273694AK022976cDNAFLJI2914fis,克隆NT2RP2004523.0,0853490,348863AK023018cDNAFLJ12956fis，克隆NT2RP2005501.0,0403790,306279AK023616cDNAFLJ13554fis，克隆PLACE1007478.0,0693170,315352AK024156cDNAFLJ14094fis,克隆MAMMA1OO0372.0,039111-0,42942AK024254cDNAFLJ14192fis，克隆NT2RP3000584.0,0421740,224429AK024423FU00012蛋白的mRNA，部分cds.0,076544-0,22477AK024563cDNA:FLJ20910fis,克隆ADSE00492.0,0120330,349917AK024933cDNA:FU21280fis,克隆COL01884.0,093866-0,36332AK024940cDNA:FLJ21287fis，克隆COL01918.0,094327-0,45615AK025758cDNA:FLJ22105fis,克隆HEP17660.0,0030822,552564AK026367cDNA:FLJ22714fis,克隆HSI13646.0,0416680,388352AK026883cDNA:FLJ23230fis,克隆CAE07143.0,0067250,426682AK027819cDNAFLJ14913fis,克隆PLACE1006782.0,080006-0,38327AK054799cDNAFLJ30237fis,克隆BRACE2002034.0,005971-0，3鄉1AK055091cDNAFLJ30529fis'克隆BRAWH2001052.0,025102-0,32068AK055903cDNAFLJ3341fis,克隆MESAN1000050.0,023674-0,44115AK056178cDNAFU31616fis,克隆NT2RI2003019.0,0980670,313366AK056292cDNAFU31730fis,克隆NT2R12006838.0,0758680,40984AK056柳cDNAFLJ31839fis,克隆NT2RP7000086.0,0938440,375509AK056573cDNAFLJ32011fis,克隆NT2RP7009507.0,085549-0,25456AK056609cDNAFU32047fis,克隆NTONG2001137.0,094327-0,26822AK056680cDNAFLJ321I8fis,克隆PEBLM1000029.0,0765440,189024AK057045cDNAFLJ32483fis,克隆SKNMC2001503,弱类0,061898-0,38993似于P-SE凝集素糖蛋白配体1前体.AK057085cDNAFLJ32523fis,克隆SMINT2000032.0,068720,393846AK057624cDNAFLJ33062fis，克隆TRACH2000032.0,0474220,250799AK057664cDNAFLJ33102fis，克隆TRACH2000898.0,074457-0,32304AK057962cDNAFLJ25233fis,克隆STM01789.0,072458-0,32341AK074192cDNAFLJ23612fis,克隆ADKA02523.0,0771110,255663AK074657cDNAFL颜76fis,克隆MAMMA1000528.0,096835-1,13323AK075564cDNAPSEC0264fis'克隆NT2RP3002337.0,057755-0,77583AK090401FLJ00278蛋白的mRNA.0,0997120,283364AK090998cDNAFLJ33679fis，克隆BRAWH2002352.0,036982-0,53683142<table>tableseeoriginaldocumentpage143</column></row><table>基因ID说明(表l7)FDR效泉AL137326mRNA,cDNADKFZp434B0650(来自克隆DKFZp434B0650).AL137645mRNA,cDNADKFZp586D0924(来自克隆DKFZp586D0924).AL3卯178mRNA,cDNADKFZp547N064(来自克隆DKFZp547N064).AL713719mRNA,cDNADKFZp667K1916(来自克隆DKFZp667K1916).AL713790mRNA,cDNADKFZp564F1062(来自克隆DKFZp564F1062),AL831862mRNA，cDNADKFZp76112317(来自克隆DKFZp7儘317).AL831872mRNA,cDNADKFZp547A1310(来自克隆DKFZp547A1310).AL831875mRNA,cDNADKFZp547EI510(来自克隆DKFZp547E1510).AL832390m脂A,cDNADKFZp667H2012(来自克隆DKFZp667H2012).AL833463mRNA,cDNADKFZp686P07U6(来自克隆DKFZp6旨07116).AL833655mRNA，cDNADKFZp66700320(来自克隆DKFZp66700320).AL833742mRNA，cDNADKFZp666E186(来自克隆DKFZp666E186).AL834121mRNA,cDNADKFZp761D2121(来自克隆DKFZp761D2121).AL834283mRNA,cDNADKFZp547N0315(来自克隆DKFZp547N0315).AW084755xc57d02.xlNCI—CGAP_Eso2cDNA克隆IMAGE:25883553'类似于SW:CHH2—B0MM0P05687绒毛膜类高半胱氨酸HCA蛋白12前体含元件MSR1重复元件AW296028UI-H-BW0-aiu-d-04-0-UI.slNCI—CGAP—Sub6cDNA克隆1MAGE:27306543',mRNA序列，0,0965910,4160070.094710.2821510.0929280,25卯920,0662750,0697860,488787-0,255920.081827-0,169680.061791-0,464650,0855490,012320.206302-1,721060,0482942,3607420,094327-0,347520,0800450,0800450'057謝0,082476-0,39501-0，305731,4231360,4430770,0454520,340944144<table>tableseeoriginaldocumentpage145</column></row><table>基因ID说明(表n)FDR效果IMAGE:3637449,mRNA,完整cds.BC009447克隆MGC:15887IMAGE:3530481,mRNA,完整0,063510,288058cds.BC010701克隆MGC:16795IMAGE:3855397，mRNA,完整0,028543-0,40007cds.BC010857克隆MGC:9168IMAGE:3876839,mRNA,完整0,068720,156838cds.BC011242克隆IMAGE:4153763,mRNA.0,0923120,5178BC011877类似于胞质分裂的贡献物1,克隆0,041668-0,33248謹GE:3347029，mRNA.BC013389克隆IMAGE:3932143,mRNA.0,0391110，437633BC014259克隆MGC:2()791IMAGE:4763971，mRNA,完整0,093866-0,23018cds.BC014362克隆IMAGE:3932221,mRNA.0,0633850,253343BCO14441类似于RIKENcDNA2810405F18基因，克隆0,083328-0'23912MGC:22960IMAGE:4865283,mRNA,完整cds.BC015412克隆IMAGE:4393471，mRNA.0,0235430,397184BC016795克隆IMAGE:4067166,mRNA.0,094327-0,46023BC016864克隆IMAGE:3847536,mRNA.0,0287020，335912BC018758类似于RJKENcDNA1110032022基因，克隆0,051706-0,23603MGC:31967IMAGE:4卯7976,mRNA,完整cds.BCO18995克隆MGC:20579IMAGE:4300679,mRNA,完整0,0800450,489487cds.BC020895克隆IMAGE:4704474，mRNA.0,099308-0,31829BC021575克隆IMAGE:3161966,mRNA.0,088650,136964BC025370克隆IMAGE:3945331,mRNA.0,0391110,486875BC028119类似于推定的，克隆MGC:401S10,065315-0,31424IMAGE:5172473'mRNA,完整cds.BC028376克隆IMAGE:4838541，mRNA.0,080739-0,22249BC029775假定基因LOC127421，克隆MGC:353940,015926-2,59845IMAGE:518626S,mRNA,完整cds.BC029776类似于CG12393基因产物，克隆0,085475-1,31163IMAGE:5188623,mRNA，部分cds.BC030520类似于假定蛋白F33H2.2-秀丽新杆线虫，克隆0,0825810,189826基因ID说明(表17)FDR效果MGC:40柳IMAGE:5180533,mRNA，完整cds.BC030750克隆IMAGE:4795773,mRNA.0,067391-0,31297BC031244双特异性酪氨酸-(Y)-碌酸化调节的激酶4,克隆0,02963-0,31347MGC:396401MAGE:5266287,mRNA,完整cds.BC031266克隆1MAGE:5277162,mRNA.0,09855-0,14471BC031648K1AA1324蛋白，克隆MGC:351660,070585-3,16718IMAGE:5169952,mRNA,完整cds.BC032316克隆IMAGE:5219499,mRNA.0,035205-0,38849BC033204类似于切除修复蛋白(克隆pcDE-72),克隆0,07337-0,21593MGC:45855IMAGE:4876082,niRNA,完整cds.BC033250克隆IMAGE:5441027,mRNA,部分cds.0,0800450,215003BC033940克隆IMAGE:5272723,mRNA,部分cds.0,0045420,320051BC034374类似于FKSG76,克隆MGC:353900,0697860,23969IMAGE:5185621,mRNA,完整cds.BC034459克隆IMAGE:5185460,mRNA.0,094934國0，23%BC034812类似于HSPC182蛋白，克隆IMAGE:4825606,0,0336880,229524mRNA.BC035268克隆IMAGE:4779288，mRNA.0,050424-0,25257BC035372克隆MGC:35266IMAGE:5174235,mRNA,完整0,085475-1，75397cds.BC035600类似于RIKENcDNA2810405J04基因，克隆0,06872-0，21368IMAGE:4430622,tnRNA.BC036004克隆IMAGE:4730399，mRNA.0,082581-0,28908BC036876克隆IMAGE:5245135,mRNA.0,0821970,275752BC038767克隆IMAGE:5270478,mRNA.0,080006-0,51549BC038852克隆IMAGE:5168364,mRNA.0,066417-0,70334BC039098类似于桥粒芯蛋白3(寻常性天疱疮抗原)，克隆0,014074-5,58975IMAGE:4822945,mRNA,部分cds.BC039527克隆IMAGE:5742065,mRNA.0,004211,937765BC039555克隆IMAGE:4184613,mRNA.0,089567-0,20617BC040662克隆IMAGE:4799788,mRNA.0,09卯140,217656BC040672克隆IMAGE:4816952,mRNA.0,023629-1，58839BC041376类似于假定蛋白5830442F04,克隆MGC:438950,055936-1,86045IMAGE:5274634,mRNA,完整cds.147基因ID说明(表n)FDR效果BC04I626克隆MGC:52394IMAGE:4554923，mRNA,完整0,064346cds.BE410139601302451F1NIH—MGC—21cDNA克隆0,081109IMAGE:36368775'，mRNA序列.BE6726877b71e04.xlNCI一CGAP一Lu24cDNA克IMAGE:32336943',mRNA序列.BF683837602140129F1NIH—MGC—46cDNA克1MAGE:43012875'，mRNA序列.BF967668602287374TINIH—MGC_%cDNA克IMAGE:43744993',mRNA序列.BG107100602291004F1NIH_MGC_85cDNA克IMAGE:43857125',mRNA序列.BI520375603071853F1N1H一MGC一119cDNA克IMAGE:51637565',mRNA序列.BI769135603053727F1NIH_MGC—122cDNA克IMAGE:52032075'，mRNA序列.BM476468AGENCOURT一6476297NIH一MGC一85cDNA克隆IMAGE:55533955',mRNA序列.BM561501AGENCOURT—6567312NIH—MGC—88cDNA克0,061202隆IMAGE:57397155'，mRNA序列.BM669556UI-E-DXl-agw-c-13-0-Ul.slUl-E-DXlcDNA克0,032959隆UI-E-DX1-agw-c-13-0-UI3',mRNA序列.BM674956Ul-E-EJ0-ahn-c-06-0-UI.slUl陽E-EJOcDNA克隆0,08865UI-E-EJO-ahn國c-06-0-UI3',mRNA序列.BM921036AGENCOURT—6633I96NIH—MGC—115cDNA克隆IMAGE:57523555'，mKNA序列.BQ055725AGENCOURT_6796360NIH一MGC一99cDNA克隆IMAGE:58079465',mRNA序列.BQ072652AGENCOURT_6763016腦—MGC—118cDNA克隆IMAGE:57561165'，mRNA序列.BQ189477UI-E-EJl-aka-c-13-0-UI.rlUI-E-EJlcDNA克隆UI-E-EJl-aka國c-13-0-UI5',mRNA序列.BQ220757AGENCOURT—7589763NIH一MGC—92cDNA克0,08865隆IMAGE:60676965',mRNA序列.-0,330080,4566隆0,094934-0,53881隆0,099954-0,26208隆0,0925510,241666隆0,0396482,110365隆0,069786-0,2411隆0,0943270，2847320,0304440,4293240，4I18121,420023-0,264230,0020750,3872720,057233-0,326%0,0800060,3027020,006686-0,572150,288766148基因ID说明(表17)FDR效果BQ230145AGENCOURT—7592688NIH—MGC_72cDNA克0,0724580,310216隆IMAGE:60503635',mRNA序列.BQ312908PM4-B翻43掘600-003-h03BN0143cDNA，0,0891160,948883mRNA序列.BQ646410AGENCOURT—8511770NIH—MGC—100cDNA克0,0800450,706676隆IMAGE:62969495'，mRNA序列.BQ7簡2AGENCOURT—8100927Lupski—交感神经千0,0994170,307114cDNA克隆IMAGE:61897735'，mRNA序列.BQ921112AGENCOURT_8926187NIH一MGC—101cDNA0,0391110,492923克隆IMAGE:64630135',mRNA序列，BQ932364AGENCOURT—8854114丽—MGC一71cDNA克0,095037-0,21294隆IMAGE:64736955',mRNA序列.BU594226AGENCOURT—8843927NIH—MGC—142cDNA0,092641-0,20224克隆IMAGE:64496445',mRNA序列.CA314430UI-CF-FN0-afin-n-08-0-UI.slUI-CF-FNOcDNA0,08865-0,23737克隆UI-CF-FN0-afin-n-08-0-UI3',mRNA序列.D31887KIAA0062基因的mRNA，部分cds.0,006725-0,49409H43963yo70al0.slSoares乳腺3NbHBstcDNA克隆0,081086-0,30907IMAGE:1832583',mRNA序列.K00629kpni重复mrna(cdna克隆pcd-kpni-4),3'末端.0,0289490,200056L3828230amRNA片段.0,0283210,468719M27316转运RNA-Ser.0，07%020,78553N23022yx65el2.slSoares黑素细胞2NbHMcDNA克隆0,092312-0,29388IMAGE:2666383',mRNA序列.NM一000015N-乙酰转移酶2(芳基胺N-乙酰转移酶)(NAT2),0,047971-0,23243mRNA.丽—000073CD3G抗原，y多肽(TiT3复合物)(CD3G)，0,0943270,232673mRNA.層—000107损伤特异性DNA结合蛋白2,48kDa(DDB2)，0,044215-0,23951mRNA.丽一000U9红细胞膜蛋白带4.2(EPB42),mRNA.0,069786-0,24152丽—000134脂肪酸结合蛋白2,肠(FABP2),mRNA.0,095037-0,49638丽_000135范可尼贫血，互补A组(FANCA),mRNA.0,0943270,192872NM—000177凝溶胶蛋白(淀粉样变性，Finnish型)(GSN),0'061202-0,16679149<table>tableseeoriginaldocumentpage150</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage151</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage152</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage153</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage154</column></row><table>基因ID说明(表n)FDR效果NM_004403聋，常染色体显性5(DFNA5),mRNA.NM—004407牙本质基质酸性磷蛋白(DMP1),mRNA.NM—004453电子转移黄素蛋白脱氢酶(ETFDH),核基因编码线粒体蛋白，mRNA.NM—004539天冬酰胺酰-tRNA合成酶(NARS),mRNA.NM—004545NADH脱氢酶(泛醌)1P亚复合物，1，7kDa(NDUFB1),mRNA.NM—004588钠通道，电压门控的，II型，p多肽(SCN2B),mRNA.NM—004599固醇调节元件结合转录因子2(SREBF2),mRNA.NM—004603突触融合蛋白IA(脑)(STXIA),mRNA.NM—004653SmcyH.log,Y染色体(小鼠)(SMCY),mRNA.NM_004657血清剥夺反应(磷脂酰丝氨酸结合蛋白)(SDPR),mRNA.NM—004669细胞内氯通道3(CLIC3),mRNA.NM—004699X染色体上的DNA区段(独特的)9928表达的序列(DXS9928E),mRNA.NM—004704U3snoRNP相关55-kDa蛋白(U3陽55K)，mRNA.NM—004715CTD(羧基末端结构域，RNA聚合酶II,多肽A)磷酸酶，亚基1(CTDP1)，转录变体FCPIa，mRNA.核糖体蛋白S6激酶，卯kDa,多肽5(RPS6KA5),mRNA.UDP-Gal:(5GlcNAc|31,4-半乳糖基转移酶，多肽5(B4GALT5),mRNA,NM_004786硫氧还蛋白样，32kDa(TXNL),mRNA.NM—004891线粒体核糖体蛋白L33(MRPL33),核基因编码线粒体蛋白，转录变体l，mRNA.NM_004901溶酶体腺苦三磷酸双磷酸酶样1(LYSALl)，mRNA.NM_004925水通道蛋白3(AQP3),mRNA.NM—004993Machado-Joseph病(脊髄小脑共济失调3,橄榄体脑桥小脑共济失调3，常染色体显性，共济失调蛋白3)(MJD)'转录变体l,mRNA.NM—005015氧化酶(细胞色素c)组装1样(0XA1L),mRNA.NM004755画0047760,0909120,0994290'06卯330,0009440,0938660,0590150,0800060,0428570,0993310,0824760,0847480,0391110,0008240,0368250,0416740,0572330,061591,1715470,268602-0,20405-0,24154-0,175120,057233-0，19156-0，24卯20,402681-0,444540,247845-0,695181,0046740,27622-0,195240,085964-0,181160,0915320,160436-0,197120,1759350,006725-0，23079-0,42326-0,31480,094327-0,15643155基因ID说明(表17)FDR效果NM005374翻00545NM_005054RAN结合蛋白2样1(RANBP2L1)，转录变体1,mRNA.NM—005080X-盒结合蛋白1(XBP1),mRNA.NM—005104舍布罗莫结构域2(BRD2),mRNA.NM—005273乌。票呤核普酸结合蛋白(G蛋白)，p多肽2(GNB2),mRNA.NM_005276甘油-3-磷酸脱氪酶1(可溶的)(GPD1),mRNA.NM—005313葡萄糖调节的蛋白，58kDa(GRP58),mRNA.NM_005339huntmgtm相互作用蛋白2(HIP2),mRNA,NM_005358仅LIM结构域7(LM07),转录变体1,mRNA.NM_005359MAD,母体抗decapentaplegicH.log4(果蝇)(MADH4),mRNA.膜蛋白，棕榈酰化的2(MAGUKp55超家族成员2)(MPP2)，mRNA.溶质栽体家族20(磷酸转运蛋白)，成员1(SLC20A1),mRNA.NMJ)05469过氧化物酶体酰基辅酶A硫酯酶(PTEl)，mRNA.NM—00553干扰素，y-谦导型蛋白16(IFI16)，mRNA.NM一005538抑制素，卩CONHBC),mRNA.NM一005618S样l(果蝇)(DLLl)，mRNA.NM—005637滑膜肉瘤异位，染色体18(SS18)，mRNA,NM—005870sm3相关多肽，18kDa(SAP18),mRNA.NM—005877剪接因子3a,亚基l，120kDa(SF3A1),mRNA.NM_005944由单克隆抗体MRCOX-2鉴定的抗原(M0X2),mRNA.NM_005955金属调节性转录因子1(MTFl)，mRNA.NM_005959褪黑激素受体IB(MTNRIB)，mRNA.NM_006022转化生长因子p刺激的蛋白TSC-22(TSC22),mRNA.NM_006097肌球蛋白调节性轻链2，平滑肌同种型(MYRL2),mRNA.NM—006117过氧化物酶体D3,D2-烯酰-辅酶A异构酶(PECI)，mRNA.NM—006150仅LIM结构域6(LM06),mRNA.0,047390,0943270,088650,0700660,087220'0939890,0943270,0421740,0446640,089690,0805560，0923120,0578860,0588830,0770780,0206910,0236290,0949340，0765440,0697860,04116-0,283-0,24926-0，62480,334504-0,23882-0,29814-0,319670,251855-0,332580,063252-0,1740,2588460,336772-0,363671,147071-1,2942-0,133420，219704-1,49304-0,207330,192013-0,315530,2034890,0623830,3387080,050505-0.366470,089785U02005156基因ID说明(表17)FDR效果NM—_006197中心粒旁物质1(PCM1)，mRNA.0,045178-0,27764NM_—006215丝氨酸(或半胱氨酸)蛋白酶抑制剂，进化枝A。'0421740,444696(a-1抗蛋白酶，抗胰蛋白酶)，成员4(丝氨酸蛋白酶抑制蛋白A4)，mRNA.雇-—006251蛋白激酶，AMP激活的，a1催化亚基(PRKAAl),0,039111-0,32277mRNA.画_—006259蛋白激酶，cGMP依赖性，II型(PRKG2)，mRNA.0，071967-1,74885NM——006416溶质栽体家族35(CMP-唾液酸转运蛋白)，成员10,077064-1,64993(SLC35A1),mRNA.画-—006492aristaless样同源框3(ALX3),mRNA0,0976520,242826NM-.006493蜡样脂-脂褐质沉积症，神经元的5(CLN5)，0,033965-0,31853mRNA.NM——006602转录因子样5(基本螺旋-环-螺旋)(TCFL5),0,0329592,252188mRNA.NM——0066154丐激活中性蛋白酶9(nCL-4)(CAPN9),mRNA.0，03%48-2,76165丽一—006644热激105kD(HSP105B),mRNA.0,0664170,411448画-—006701类似于粟酒裂殖酵母diml十(DIMl),mRNA.0,085377-0,14439NM_—006726LPS-反应性液泡交通，含岸和锚(LRBA)，mRNA.0,04717-0,17132NM——006746中足上的性梳样1(果蝇)(SCMLl)，mRNA.0,098780,24864觀一一006752饮食过度5(SURF5)，转录变体a,mRNA.0,087470,233567NM——006769仅LIM结构域4(LM04),mRNA.0,093866-0,26606刚——006796AFG3ATP酶家族基因3样2(酵母)(AFG3L2),0,058226-0,20738核基因编码线粒体蛋白，mRNA.觀——006809线粒体外膜的移位酶34(TOMM34),mRNA.0,038230,466704NM-匿0068U肿瘤差异表达的I(TDE1),mRNA.0,0938660,185639画-匿006825细胞骨架相关蛋白4(CKAP4),mRNA.0,02765-0,1768NM_—006833C0P9亚基6(MOV34H.log，34kD)(C0PS6)'0,0800450,151558mRNA.画__006839内膜蛋白，线粒体(mitofilin)(1MMT),mRNA.0,036825-0,32053刚——006886ATP合酶，H+转运，线粒体Fl复合物，e亚基0,0474220,207215(ATP5E),核基因编码线粒体蛋白，mRNA.NM-—006922钠通道，电压门控的，III型，a多肽(SCN3A),0,082581-0,207mRNA.—007002粘附调节分子1(ADRM1),mRNA.0,0479221,658766157<table>tableseeoriginaldocumentpage158</column></row><table>基因ID说明(表17)FDR效果NM—012469染色体20可读框14(C20orfl4),mRNA.0,0334291,617033NM—013354CCR4-NOT转录复合物,亚基7(CNOT7),转录变0,054537-0,19074体1,mRNA.NM—013362锌指蛋白225(ZNF225),mRNA.0,056597-0,48787NM一013390跨膜蛋白2(TMEM2),mRNA.0,047922-1,58866NM_013451fer-1样3,myoferhn(秀丽新杆线虫)(FERlL3),0,003816-0，26834转录变体1，mRNA.NM—013974二曱基精氨酸二曱基氨基水解酶2(DDAH2),0,08%90,211115mRNA.NM—014052GW128蛋白(GW128),mRNA.0,0002192,75826NM—014065HT001蛋白(HTOOl),mRNA.0,0825810,175696NMJH4066HT002蛋白，高血压相关的钙调节的基因0,0434580,183686(HT002),mRNA.NM—014071核受体共激活物6(NCOA6),mRNA.0,0824760,270178NM一014177HSPC154蛋白(HSPC154),mRNA.0,004542-0,22578NM—014282乙酰透明质酸结合蛋白4(HABP4),mRNA.0,0623830,27001NM—014353RAB26'成员RAS癌基因家族(RAB26),mRNA.0,016631-0,43657nm_014444y微管蛋白环复合物蛋白(76p基因)(76P),0,0891160,843388m固A.nm—014471丝氨酸蛋白酶抑制剂，Kazal4型(SPINK4),0,086303-0,41374mRNA.NM—014593CpG结合蛋白(CGBP),mRNA.0,089567-0,16544NMJH4622杂合性缺失，11,染色体区2,基因A0,039648-1,81638(LOH11CR2A),mRNA.NM—014636Ral鸟。票呤核普酸交换因子RalGPSIA0,062383-0,19%1(RALGPS1A),mRNA.NM_0〗4657K1AA0406基因产物(KIAA0406)，mRNA.0,0673360,273531NM—014729胸腺高迁移性基团框蛋白TOX(TOX)，mRNA.0,029713-0,38597NM_014747KIAA0237基因产物(KIAA0237),mRNA.0,051215-1,51108NM—014766KIAA0193基因产物(KIAA0193)，mRNA.0,0137444,253342NM—014786Rho特异性鸟噪呤-核苷酸交换因子164kDa0,0662750,223783(P164RHOGEF),mRNA.NM_014849突触泡糖蛋白2(SV2),mRNA.0,0662660,151549NM—014885细胞分裂后期促进复合物io(APCIO)，mRNA.0,0664170,240729159说明(表n)FDR效果丽_一01柳7来自BCRA2区的假定蛋白(CG005)，mRNA.0,0803380,233766NM_—014902KIAA0964蛋白(KIAA0964),mRNA.0,0479221,345732NM—_015070KIAA0853蛋白(KIAA0853),mRNA.0,0781880,196796画——015127Mid-1相关的氯通道l(MCLC),mRNA.0,050505-0,25616丽__015338KIAA0978蛋白(KIAA0978),mRNA.0，08%510,250409NM-—015476DKFZP586M1523蛋白(DKFZP5画1523),0，0卿87-0,1933mRNA.雇-—015512DKFZP434A236蛋白(DKFZP434A236),mRNA.0,0630040,254703醒一—015540DKFZP727M111蛋白(DKFZP727M111),mRNA.0,0623830,167647NM_—015666GTP结合蛋白5(推定的)(GTPBP5),mRNA.0,0943270,261554NM——015705假定蛋白DJ1042K10.2(DJ1042K10.2),mRNA.0,061202-0，3962NM——015721gem(核细胞器)相关蛋白4(GEMIN4),mRNA.0,0709460,228449NM-—015832曱基-CpG结合结构域蛋白2(MBD2),转录变体0,067336-0,17895睾丸特异性，mRNA.雨——015949CGI-20蛋白(CGI-20),mRNA.0,0950370,227496NM-—015962CGI-35蛋白(CGI-35),mRNA.0,079602-0,30982画一—016004染色体20可读框9(C20orf9),mRNA.0,0949340,21615NM_—016014CGI-67蛋白(CGI-67),mRNA.0,09289-0,24249NM——016127假定蛋白MGC8721(MGC8721),mRNA.0,061202-0,20445NM——016299可能是小鼠热激蛋白的直向同源物，70kDa40,0622370，168397(HSP70-4),mRNA.NM-—016305染色体18上的滑膜肉瘤异位基因样2(SS18L2),0,0824760,194934mRNA.固_—016308UMP-CMP激酶(UMP-CMPK),mRNA.0,002075-0,25909NM——016332含硒蛋白质X,1(SEPXl)，mRNA.0,092890,201764醒_—016354溶质栽体家族21(有机阴离子转运蛋白)，成员120,0800131,550246(SLC21A12),mRNA.NM——016397TH1样(果蝇)(THIL),mRNA.0,0065831,918519画-_016400Huntingtin相互作用蛋白K(HYPK),mRNA.0,090912-1,04747躍--016569T-框3(尺骨乳腺综合征)(TBX3),转录变体2，0,08865-0,41763mRNA.刚扁—016594FK506结合蛋白U,19kDa(FKBPU),mRNA.0,066266-0,23327丽_—016626假定蛋白LOC51320(LOC51320),mRNA.0,036126-0'22033NM——016646间质干细胞蛋白DSCD28(LOC51336),mRNA.0,0218021,439666160基因ID说明(表17)FDR效果NM-—016938含EGF的纤蛋白样细胞外基质蛋白2(EFEMP2),0,0597631,522942mRNA.NM_—017417UDP-N-乙酰-a-D-半乳糖胺多肽N-乙酰氨基半0,095888-0,40833乳糖基转移酵8(GalNAc-T8)(GALNT8)'mRNA.丽-—017495含RNA结合区(RNPl，RRM)ll(RNPCl)'mRNA.0,0392551,951461丽-—017540UDP-N-乙酰-a-D-半乳糖胺多肽N-乙酰氨基半0,094934-0,1997乳糖基转移酶10(GalNAc-TIO)(GALNTIO)，mRNA.NM——017699假定蛋白FLJ20174(FLJ20174),mRNA,0,039648-2,23626NM——017707在肝癌中上调的1(UPLC1),mRNA.0,0%054-0,32197NM-—017709假定蛋白FLJ20202(FLJ20202),mRNA.0,079602-0,5167丽-—017750假定蛋白FLJ202%(FLJ202%),mRNA.0,01679-0,24488NM——017762假定蛋白FLJ20313(FLJ20313),mRNA,0,075595-0,32046NM——017817RAB20，成员RAS癌基因家族(RAB20),mRNA.0,0938660,157212NM_—017872假定蛋白FLJ20546(FLJ20546),mRNA.0,038899-0,24664NM—_017895死亡/H(Asp-Glu-Ala-Asp/His)框多肽270,0664170,283457(DDX27),mRNA.削__017896染色体20可读框11(C20orfU),mRNA.0,0009251,93846NM——017933假定蛋白FLJ20701(FLJ20701),mRNA.0,048261-0,35263NM—_018043假定蛋白FLJ10261(FLJ10261),mRNA.0,070596-0,50301丽——(M8142假定蛋白FLJ10569(FU10569)，mRNA.0,081888-0,30228NM-—018147Fas凋亡抑制分子(FAIM),mRNA.0,085964-0,34657NM——018154假定蛋白FLJ10604(FU10604),mRNA.0,0474220,229376丽-—018203假定蛋白FLJ10748(FLJ10748),mRNA.0,061202-0,38393NM—-018206空泡蛋白分选35(酵母)(VPS35),mRNA.0,0156560,147472NM_—018235假定蛋白FLJ10830(FLJ10830),mRNA.0,095161-0,18303NM-—018244染色体20可读框44(C20orf44)，mRNA.0,0675111,488465NM_匿O18246假定蛋白FLJ10853(FLJ10853),mRNA.0,094327-0,19685NM_—018270染色体20可读框20(C20orf20),mRNA.0,0421120,977697NM——018326假定蛋白FLJ11110(FU11110)，mRNA.0,0691950,141442NM-匿O18360X染色体可读框15(CXorfl5),mRNA.0,0923120,341923NM__018386假定蛋白FLJ11305(FLJ11305),mRNA.0,0222160,248688NM—_018388CHCR(CHCR),mIWA.0,005045-0,54868訓—_018414GalNAca-2,6-唾液酸转移酶I,长形0,024589-3,79484161<table>tableseeoriginaldocumentpage162</column></row><table>基因ID说明(表17)FDR效果NM-—020962可能是PuncEll的小鼠相邻物的直向同源物0,0997370,320891(NOPE),mRNA.NM—_021033RAP2A,RAS癌基因家族的成员(RAP2A),0,0106570,314425mRNA.醒-_02画溶质栽体家族5(钠依赖性维生素转运蛋白)，成员0,0391110,3787%6(SLC5A6),mRNA.NM-—021158染色体20可读框97(C20orf97),mRNA.0,010592,067057画——021246淋巴细胞抗原6复合物，基因座G6D(LY6G6D),0,0368250,781552mRNA.雇一—021258白介素22受体(1L22R),mRNA.0,0811320,515985NM-—021637假定蛋白FLJ14084(FLJ14084),mRNA.0,071297-0,36458NM——021724核受体亚家族1,D组，成员1(NR1D1),mRNA.0,0612020,392836丽一—021738监理蛋白(SVIL),转录变体2，mRNA,0,03532-1,04373醒-—021809TGFB诱导的因子2(TALE家族同源框)(TG1F2),0,0029322,265688mRNA.画-—021911Y-氨基丁酸(GABA)A受体,卩2(GABRB2)，转录0,019169-6,04422变体1,mRNA.丽一—02928假定蛋白FLJ22649类似于信号肽酶SPC22/230,007549-0,22392(FLJ22649),mRNA.NM--02簡假定蛋白FLJ22174(FLJ22174)，mRNA.0，047922-1,93072NM——022062PBX/有节的1同源框2(PKNOX2),mRNA.0,037750,266646NM-—022082染色体20可读框59(C20orf59),mRNA.0,0069643,252232画-—022130高尔基体磷蛋白3(包膜蛋白)(GOLPH3),mRMA.0,041674-0,30666雇-匿022157RagC蛋白(GTR2),mRNA.0,0612020，180955NM-—022461假定蛋白FLJ21939类似于5-氮胞。密啶诱导的基0,097690,167686因2(FLJ2I939),mRNA.薩__023011类似于酵母Upf3，变体A(UPF3A),转录变体1,0,0990140,151456mRNA.NM-—024035假定蛋白MGC3113(MGC3113),mRNA.0,0954340,2878%丽_—024075LENG5蛋白(LENG5),mRNA.0,0796020,149324NM—-024090长链脂肪酰延伸酶(LCE),mRNA.0，0166310,19%65NM——024096假定蛋白MGC5627(MGC5627)，mRNA.0,0565970,218944NM——024110胱天蛋白酶募集结构域家族，成员14(CARD14)，0,0166310,235476转录变体1,mRNA.163<table>tableseeoriginaldocumentpage164</column></row><table>基因ID说明(表17)FDR效果NM一丽-画-画030789.030815030877031266腦一031285NM031299NM-NM—丽_NM_NM—雨一丽-画—031413031453—031472031920031966.032013.032044032125NM—032229刚032242雨一NM-NM—丽-廳032352.032432032527.032576032579NM032611NM—NM—NM-画032633.032709.032744032803NM032813组织特异性(次要)13(M13),mRNA.染色体20可读框126(C20orfl26),mRNA.联蛋白，|3样1(CTNNBL1),mRNA.异源细胞核核糖核脊酸蛋白A/B(HNRPAB)，转录变体1,mRNA.假定蛋白PP1057(PP1057),mRNA.可能是富含小鼠基因的簇的直向同源物，C8基因(GRCC8)，mRNA.猫眼综合征染色体区，候选物2(CECR2),mRNA.假定蛋白MGC11034(MGC11034),mRNA.假定蛋白MGC11134(MGC11134),mRNA.ARG99蛋白(ARG99),mRNA.细胞周期蛋白Bl(CCNB)，mRNA.NDRG家族成员3(NDRG3)，mRNA.IV型再生基因(REG-IV),mRNA.假定蛋白DKFZp564D0478(DKFZP564D0478)'mRNA.假定蛋白FLJ22774(FLJ22774),mRNA.假定蛋白DKFZp564A176(DKFZp564A176)，mRNA.假定蛋白MGC11296(MGC11296),mRNA.结合LIM蛋白的肌动蛋白2(ABLIM2),mRNA.假定蛋白FU14972(KIAA1847),mRNA.染色体Y可读框15B(CYorfl5B)，mRNA.结肠和小肠特异性的富含半胱氨酸的蛋白前体(HXCP2),mRNA.蛋白酪氨酸磷酸酶IVA型，成员3(PTP4A3),转录变体I,mRNA.假定蛋白MGC5457(MGC5457),mRNA.假定蛋白MGC13047(MGC13047)，mRNA.假定蛋白MGC12335(MGC12335),mRNA.溶质栽体家族7(阳离子氨基酸转运蛋白，y+系统)，成员3(SLC7A3),mRNA.假定蛋白FLJ14624(FLJ14624),mRNA.0,0329590,029630,0665660，085%40,0244460，08%90,0854750,0926410,0609750,0505050,0479220,0976520,0800450,0697860,0166310，0520790,0662660,0156560,0673360,0923120,0770640,0673360,0651%0,0578860,0745191,338115。，2526260，248269-0,15420,446880,337448-1,83919-0,30736-0,264710'2083651,6372060,159868-0,792120,212384-0,768770,2491690,1324480,2322910,53376-0，51647-4,923070,015390,3703190,171888-0,35449-3,238070,7073530,0030780,266088165<table>tableseeoriginaldocumentpage166</column></row><table>CN101711362A基因ID说明(表17)FDR效果NM—一138573神经调节蛋白4(LOC145957),mRNA.0,075565-1，28984画一—138706P-l，3-N-乙酰葡糖胺转移酶蛋白0,074457-0,59194(IMAGE:4卯7098),mRNA.NM一—138784假定蛋白BC014341(LOC116123),mRNA.0,048697-0,36672画——138792假定蛋白BC018147(LOC123169)，mRNA.0,093866-0,17206NM_—138963核糖体蛋白S4,Y连锁的2(RPS4Y2),mRNA.0,080006-0,53287NM——139016假定基因LOC128439(LOC128439),mRNA.0,0894220，233019腹—J39167sarcoglycan:(SGCZ),mRNA.0,039卯20,228483NM—_144498氣基固醇结合蛋白样2(OSBPL2),转录变体2，0,0796020'344545mRNA.NM——144618假定蛋白MGC29891(MGC29891),mRNA.0,0994170,189802画_—144641假定蛋白FLJ32332(FLJ32332),mRNA.0,0954340,252008NM_—144660假定蛋白FLJ25082(FLJ25082),mRNA.0,0505050,302561丽一—144664假定蛋白MGC33371(MGC33371),mRNA.0,082476-0,30557薩一_144726假定蛋白FLJ31951(FLJ31951),mRNA.0,057755-0,27891画——144736假定蛋白PR01853(PR01853),转录变体1，0,068720,165416mRNA.NM_—144778肌盲样蛋白MBLL39(MBLL39)，转录变体1,0,0781880,218234mRNA.NM——145235类似于R1KENcDNA1700007B22(LOC92565),0,051215-2,3424mRNA.画一一145284类似于假定蛋白MGC17347(LOC159090),0,0673360,250469mRNA.雇-一145293类似于假定蛋白F1J20897(LOC196549),mRNA.0,0231610,187785薩__152312假定蛋白FU35207(FLJ35207),mRNA.0,0827760,498205NM-—152322假定蛋白FLJ33957(FLJ33957)，mRNA.0，0517310,373213NM_—152332染色体14可读框47(C14orf47),mRNA.0,030466-0,3124NM-匿152369假定蛋白MGC45474(MGC45474),mRNA.0，064718-1,60257蘭——152400假定蛋白FLJ39370(FLJ39370),mRNA.0,058226-0,22856NM——152415假定蛋白FLJ32642(FLJ32642),mRNA.0,08865-0,17664NM——152429假定蛋白MGC39320(MGC39320),mRNA.0,082581-0,25357丽_—152437假定蛋白DKFZp761B128(DKFZp761B128),0,097690,400912mRNA.刚—一l52586假定蛋白FU37318(FLJ37318),mRNA.0,080739-0'22746167<table>tableseeoriginaldocumentpage168</column></row><table>表18:在结肠直肠腺瘤细胞中的三种或更多种不同的染色体异常中具有改变的表达的标记基因。CN基因ID说明(表18)在5种染色体异常中具有改变的表达的标记基因染色体异常NM—016397TH1样(果蝇)(TH1L),mRNA.8p缺失8q获得15q缺失18q缺失20q获得在染色体异常中具有改变的表达的标记基因NM006602转录因子样5(基本螺旋-环-螺旋)(TCFL5),mRNA.NM—016646间质干细胞蛋白DSCD28(LOC51336),mRNA.NM—018270染色体20可读框20(C20orf20),mRNA.NM—021945假定蛋白FLJ22174(FU22174),mRNA.NM—024522假定蛋白FLJ12650(FLJ12650),mRNA.NM—030579细胞色素b5线粒体外膜前体(CYB5-M)，mRNA.8p缺失13q获得18q缺失20q获得13q获得15q缺失18q缺失20q获得8p缺失13q获得18q缺失20q获得13q获得15q缺失18q缺失20q获得8q获得15q缺失18q缺失20q获得8p缺失13q获得15q缺失18q缺失169<table>tableseeoriginaldocumentpage170</column></row><table>CN基因ID说明〖表18).........................................................H^L.!..,BC038S52克隆IMAGE:5168364，mRNA.8p缺失15q缺失18q缺失BM921036AGENCOURT—6633196NEH—MGC—115cDNA克隆8p缺失8q获得18q缺失8p缺失8q获得18q缺失13q获得15q缺失18q缺失13q获得18q缺失20q获得8p缺失8q获得18q缺失8p缺失15q缺失18q缺失8p缺失18q缺失20q获得NM—006117过氧化物酶体D3，D2-烯酰-辅酶A异构酶(PECI),mRNA.8q获得13q获得IMAGE:57523555',mRNA序列.NM—000285肽酶D(PEPD)，mRNA.NM—002267核周蛋白a3(输入蛋白a4)(KPNA3),mRNA.NM—002915复制因子C(激活物1)3,38kDa(RFC3),mRNA.NM—003014分泌的巻曲相关蛋白4(SFRP4),mRNA.NM_005469过氧化物酶体酰基辅酶A硫酯酶(PTE1),mRNA.NM—005877剪接因子3a,亚基l，120kDa(SF3A1),mRNA.NM—006644热激105kD(HSP105B),mRNA.NM—006809线粒体外膜的移位酶34(TOMM34),mRNA.NM—007019遍在蛋白缀合酶E2C(UBE2C),mRNA.18q缺失8p缺失15q缺失18q缺失8p缺失15q缺失18q缺失8p缺失18q缺失20q获得m基因ID说明(4j,).....................................................................................................................舉.^，力宜..NM—007055聚合酶(RNA)III(定向于DNA)(155kD)(RPC155),mRNA.8q获得13q获得18q缺失NM—014052GW128蛋白(GW128),mRNA.8p缺失18q缺失20q获得NM—016938含EGF的纤蛋白样细胞外基质蛋白2(EFEMP2),mRNA.8p缺失18q缺失20q获得NM—018414GalNAca-2,6-唾液酸转移酶I，长形(ST6GalNAcI),mRNA.8p缺失18q缺失20q获得NM_018710假定蛋白DKFZp762O076(DKFZp7620076),mRNA.8p缺失18q缺失20q获得NM—030789组织特异性(次要)13(HM13),mRNA.13q获得18q缺失20q获得NM_080476CDC91细胞分裂周期91样1(啤酒糖酵母)(CDC引L1),8p缺失mRNA.18q缺失20q获得NMJ38425假定蛋白BC009925(LOCI13246)，mRNA.8q获得13q获得18q缺失NM—144726假定蛋白FLJ31951(FLJ31951),mRNA.13q获得15q缺失18q缺失AL832390mRNA,cDNADKFZp667H2012(来自克隆13q获得DKFZp667H2012).18q缺失NM_001951E2F转录因子5,p130结合(E2F5),mRNA.NM—014786Rho-特异性乌。票呤-核苷酸交换因子(P164RHOGEF),mRNA.20q获得8p缺失8q获得18q缺失164kDa8p缺失13q获得15q缺失基因ID说明(表18》生.^，!f.NM—017896染色体20可读框11(C20orfU),mRNA.8p缺失18q缺失20q获得NM_025138假定蛋白FLJ12661(FLJ12661),转录变体1,mRNA.8p缺失13q荻得__18q缺失17权利要求用于检测患者中结肠直肠腺癌细胞的存在的体外方法，该方法包括以下步骤a)在所述患者的受试样品中检测至少表8、9或16的标记基因NM_017495和NM_006602的表达水平，和b)比较用于步骤a)中的所述标记基因的表达水平与对照样品的表达水平，其中与所述对照样品相比，所述受试样品中所述至少两种标记基因表达水平的升高，表明所述患者中结肠直肠腺癌细胞的存在。2.权利要求1的体外方法，包括以下步骤a)在所述患者的受试样品中检测至少表8、9或16的标记基因NM_017495、NM_006602、NM_018840、NM_003600、NM_018270、NM_007002和NM_016397的表达水平，和b)比较用于步骤a)中的所述标记基因的表达水平与对照样品的表达水平，其中与所述对照样品相比，所述受试样品中所述至少7种标记基因表达水平的升高，表明所述患者中结肠直肠腺癌细胞的存在。3.用于检测患者中结肠直肠腺癌细胞的存在的体外方法，该方法包括以下步骤a)在所述患者的受试样品中检测选自表1所列标记基因的至少12种标记基因的表达水平，和b)比较用于步骤a)中的标记基因的表达水平与对照样品的表达水平，其中与所述对照样品相比，所述受试样品中所述至少12种标记基因表达水平的升高或降低，表明所述患者中结肠直肠腺癌细胞的存在。4.用于检测患者中结肠直肠腺癌细胞的存在的体外方法，该方法包括以下步骤a)在所述患者的受试样品中检测选自表17所列标记基因的一种或多种标记基因的表达水平，和b)比较用于步骤(a)中的所述至少一种标记基因的表达水平与对照的表达水平，其中与所述对照样品相比，所述受试样品中所述一种或多种标记基因表达水平的升高或降低，表明所述患者中结肠直肠腺癌细胞的存在。5.用于检测患者中结肠直肠腺癌细胞的存在的体外方法，该方法包括以下步骤a)在所述患者的受试样品中检测一种或多种标记基因的表达水平，所述标记基因的表达在存在染色体异常时改变，其中所述一种或多种标记基因包括_选自表2中描述的标记基因的两种或更多种标记基因，其表达水平由于染色体8。上的染色体缺失而改变，和/或，-选自表3中描述的标记基因的一种或多种标记基因，其表达水平由于染色体8(1上的染色体获得而改变，和/或，-选自表4中描述的标记基因的3种或更多种标记基因，其表达水平由于染色体13(1上的染色体获得而改变，和/或，-选自表5中描述的标记基因的一种或多种标记基因，其表达水平由于染色体15(1上的染色体缺失而改变，和/或，_选自表6中描述的标记基因的一种或多种标记基因，其表达水平由于染色体17。上的染色体缺失而改变，和/或，_选自表7中描述的标记基因的3种或更多种标记基因，其表达水平由于染色体18q上的染色体缺失而改变，和/或，_选自表8中描述的标记基因的9种或更多种标记基因，其表达水平由于染色体20q上的染色体获得而改变，和/或，_选自表9中描述的标记基因的两种或更多种标记基因，其表达水平由于染色体20q上的染色体获得而改变；禾口b)比较用于步骤(a)中的所述一种或多种标记基因的表达水平与对照样品的表达水平，其中与所述对照样品相比，所述受试样品中所述一种或多种标记基因表达水平的升高或降低，表明所述患者中腺癌细胞的存在。6.用于检测患者中结肠直肠腺癌细胞的存在的体外方法，该方法包括以下步骤a)在所述患者的受试样品中检测多种标记基因的表达水平，所述标记基因的表达在存在染色体异常时改变，所述多种标记基因包括_选自表2中描述的标记基因的至少一种标记基因，其表达水平由于染色体8p上的染色体缺失而改变，和/或，_选自表3中描述的标记基因的至少一种标记基因，其表达水平由于染色体8q上的染色体获得而改变，和/或，_选自表4中描述的标记基因的至少一种标记基因，其表达水平由于染色体13上的染色体获得而改变，和/或，-选自表5中描述的标记基因的至少一种标记基因，其表达水平由于染色体15(1上的染色体缺失而改变，和/或，_选自表6中描述的标记基因的至少一种标记基因，其表达水平由于染色体17。上的染色体缺失而改变，和/或，-选自表7中描述的标记基因的至少一种标记基因，其表达水平由于染色体18(1上的染色体缺失而改变，和/或，_选自表8或表9中描述的标记基因的至少一种标记基因，其表达水平由于染色体20q上的染色体获得而改变，禾口b)比较用于步骤a)中的标记基因的表达水平与对照样品的表达水平，其中与所述对照样品相比，所述受试样品中所述多种标记基因表达水平的升高或降低，表明所述患者中腺癌细胞的存在。7.权利要求3-6的任一项的方法，其中根据表l-9，所述标记基因具有小于0.05的p或FDR值。8.权利要求3-6的任一项的方法，其中根据表l-9，所述标记基因具有小于0.01的p或FDR值。9.权利要求3-8的任一项的方法，其中根据表2-9，所述标记基因在腺瘤和腺癌细胞之间的表达水平的差异是至少"2"。10.权利要求3-8的任一项的方法，其中根据表2-9，所述标记基因在腺瘤和腺癌细胞之间的表达水平的差异是至少"4"。11.权利要求5或6的方法，其中表达水平由于染色体8p上的染色体缺失而改变的标记基因选自下组标记基因表10中描述的NM_020749、NM_004315、NM_003747、NM_016353、NM_152415、NM_006197、NM_000662、NM_000015、D31887、NM_017884、NM_004462、NM_006765、NM_001715、NM_012331、NM_139167、NM_013354和NM_005144。12.权利要求5或6的方法，其中表达水平由于染色体8q上的染色体获得而改变的标记基因选自下组标记基因表11中描述的NM_138455、NM_032611、NM_032862、AL713790、BC030520、NM_024035、NM_017767、NM_002346、AF289596、NM_012162和AB051475。13.权利要求5或6的方法，其中表达水平由于染色体13q上的染色体获得而改变的标记基因选自下组标记基因表12中描述的NM_145293、NM_005358、U50531、NM_012158、画_017817、画_003899、画_003903、画_018386、BC008975、画_023011、NM_001260、NM_006646、U50524、NM_033111、NM_024808、NM_014832、NM_006002、NM_015057、NM_024546、BC026126、NM_006493、NM_018210和NM_017664。14.权利要求5或6的方法，其中表达水平由于染色体15q上的染色体缺失而改变的标记基因选自下组标记基因表13中描述的NMJ)30574、NMJ)04255、NMJ)02573、AB033025、NM_033240、NM_000126、NM_015079、NM_015969和NM_016073。15.权利要求5或6的方法，其中表达水平由于染色体17p上的染色体缺失而改变的标记基因选自下组标记基因表14中描述的NM_130766、NM_015721和NMJ)31430。16.权利要求5或6的方法，其中表达水平由于染色体18q上的染色体缺失而改变的标记基因选自下组标记基因表15中描述的NM_004715、NM_006701和NM_014913。17.权利要求5或6的方法，其中表达水平由于染色体20q上的染色体获得而改变的标记基因选自下组标记基因表16中描述的NM_016397、NM_018270、NM_006602、NM_080476、NM_017896、NM_006097、NM_021809、NM_018840、NM_003600、NM_017495、NM_007002、NM_016354、NM_014071、NM_002212、NM_003185、NM_152255、NM_022082、NM_018244、画_014902、画_032013、画_020182、画_006886、画_020673、BC003122、NM_012325、NM_014183、NM_021100、NM_004738、NM_016045、NM_014054、NM_022105、NM_015666、NM_032527、BC025345、NM_033405、NM_006892、NM_005225、NM_000687、BC035639、NM_018677、NM_006047、NM_016436、NM_015511、NM_016082、NM_007238、NM_003908、NM_003610、NM_153360、NM_080425、NM_000114、NM_001853、NM_144498、NM_017798和NM—O12384。18.权利要求5或6的方法，其中表达水平由于染色体20q上的染色体获得而改变的标记基因选自下组标记基因表16中描述的NM_016397、NM_018270、NM_006602、NM_080476、NM_017896、NM_006097、NM_021809、NM_018840、NM_003600、NM_017495、NM_007002、NM_016354、NM_014071、NM_002212、NM_003185、NM_152255、NM_022082、NM_018244、画_014902、画_032013、画_020182、画_006886、画_020673、BC003122、NM_012325、NM_014183、NM_021100、NM_004738、NM_016045、NM_014054、NM_022105、NM_015666、NM_032527、BC025345和NM_033405。19.权利要求1-18的任一项的方法，其中所述受试样品是结肠直肠腺瘤组织的活检物或切除物。20.权利要求1-18的任一项的方法，其中所述受试样品选自尿、血液、唾液、汗液和粪便的样品。21.权利要求1-19的任一项的方法，其中所述对照样品是包含结肠直肠腺瘤细胞而不包含结肠直肠癌细胞的患者的相同组织的样品。22.权利要求1-21的任一项的方法，其中所述表达水平是在蛋白水平确定的。23.权利要求1-21的任一项的方法，其中所述表达水平是在RNA水平确定的。24.权利要求1-23的任一项的方法，其中使用的标记基因是这样的标记基因与腺瘤细胞相比，其表达水平在腺癌细胞中升高。25.权利要求1-24的任一项的方法在诊断结肠直肠腺瘤进展为结肠直肠癌中的用途。26.用于检测结肠直肠腺癌细胞的试剂盒，包含用于特异性检测表1中描述的至少12种标记基因的表达的试剂。27.用于检测结肠直肠腺癌细胞的试剂盒，包含用于特异性检测表17中描述的至少一种标记基因的表达的试剂。28.用于检测结肠直肠腺癌细胞的试剂盒，包含用于特异性检测一种或多种标记基因的表达的试剂，所述试剂盒包含_用于特异性检测选自表2中描述的标记基因的3种或更多种标记基因的试剂，和/或，-用于特异性检测选自表3中描述的标记基因的一种或多种标记基因的试剂，和/或，-用于特异性检测选自表4中描述的标记基因的两种或更多种标记基因的试剂，和/或，_用于特异性检测选自表5中描述的标记基因的一种或多种标记基因的试剂，和/或，_用于特异性检测选自表6中描述的标记基因的一种或多种标记基因的试剂，和/或，_用于特异性检测选自表7中描述的标记基因的3种或更多种标记基因的试剂，和/或，_用于特异性检测选自表8中描述的标记基因的7种或更多种标记基因的试剂，和/或，_用于特异性检测选自表9中描述的标记基因的7种或更多种标记基因的试剂。29.用于检测结肠直肠腺癌细胞的试剂盒，包含用于特异性检测下组中每一组中至少一种标记基因的表达的试剂集合表2中描述的标记基因、表3中描述的标记基因、表4中描述的标记基因、表5中描述的标记基因、表6中描述的标记基因、表7中描述的标记基因、表8中描述的标记基因和表9中描述的标记基因。30.权利要求26-229的任一项的试剂盒，其中根据表1-9，所述标记基因具有小于0.05的p或FDR值。31.权利要求26-29的任一项的试剂盒，其中根据表l-9，所述标记基因具有小于0.01的p或FDR值。32.权利要求27-31的任一项的试剂盒，其中根据表2-9或17，所述标记基因在腺瘤和腺癌细胞之间的表达水平的差异是至少"2"。33.权利要求27-31的任一项的试剂盒，其中根据表2-9或17，所述标记基因在腺瘤和腺癌细胞之间的表达水平的差异是至少"4"。34.权利要求26-33的任一项的试剂盒，其中所述试剂是寡核苷酸或抗体。35.权利要求34的试剂盒，其中所述寡核苷酸排列在支持物上。36.权利要求34的试剂盒，其中所述抗体结合于分泌的蛋白或细胞表面上的蛋白。37.权利要求26-36的任一项的试剂盒，其中所述一种或多种试剂用选自放射性标记物、磁性标记物、MRI造影标记物、发色标记物和超声标记物的标记物官能化。38.权利要求26-36的任一项的试剂盒，其中所述标记基因是这样的基因与腺瘤细胞相比，其表达水平在腺癌细胞中升高。39.用于检测结肠直肠病变中的腺癌细胞的体内方法，所述方法包括以下步骤a)使所述结肠直肠病变与经标记的试剂接触，所述试剂能够与选自表17中描述的基因的标记基因表达的蛋白特异性结合或相互作用，禾口b)检测该试剂与所述结肠直肠病变的结合或相互作用，其中检测到所述结肠直肠病变的病灶内所述试剂的结合或相互作用的差异，表明所述病变中腺癌细胞的存在。40.权利要求39的方法，其中所述标记基因是位于细胞膜上的蛋白、分泌的蛋白或酶。41.与表17或18中描述的标记基因特异性结合或相互作用的试剂，其用作检测结肠直肠腺瘤组织中腺癌细胞的存在的体内诊断剂。42.与表17或18中描述的标记基因特异性结合或相互作用的试剂在制备诊断剂中的用途，所述诊断剂用于检测结肠直肠肿瘤组织中腺癌细胞的存在。全文摘要本发明涉及在结肠直肠腺瘤和腺癌细胞中基因的差异标记以及它们与染色体异常的关联。本发明提供了用于检测与腺瘤进展为腺癌细胞相关的染色体异常的工具。本发明公开了用于体内和体外诊断结肠直肠肿瘤的方法和工具。文档编号G01N33/574GK101711362SQ200880011036公开日2010年5月19日申请日期2008年4月3日优先权日2007年4月5日发明者B·平托莫雷斯德卡瓦尔霍,G·A·梅杰申请人:基督教高等教育科学研究及病人护理协会