一种紫貂裘皮制品真伪鉴别的MGB探针检测方法与流程

文档序号:18416575发布日期:2019-08-13 19:31阅读:677来源:国知局
一种紫貂裘皮制品真伪鉴别的MGB探针检测方法与流程

本发明属于分子物种鉴定技术领域,具体涉及一种基于mgb探针的实时荧光定量pcr法对紫貂裘皮制品的真伪进行鉴定的方法。本发明检测方法快速、准确。



背景技术:

紫貂(marteszibellina),属食肉目、鼬科、貂属。主要分布于北亚大陆及临近岛屿,俄罗斯、中国、蒙古及朝鲜等国。在中国,主要分布在东北地区和新疆地区,北纬41°以北的针叶林以及温带针阔混交林。紫貂是珍贵毛皮兽类,是“东北三宝”之一,素有“裘中之王”之称,具有“见风愈暖、落雪则融、遇水不濡”的美誉。在皮毛市场巨大的经济利益驱动下,许多不法分子大肆偷猎紫貂,导致紫貂野生种群数量不断减少,目前中国已将其列为国家一级重点保护动物。同时,裘皮市场上,以其他毛皮冒充紫貂皮的情况屡禁不止。

深加工过的裘皮制品在形态特征和理化特性等方面都发生很大改变,因此原有的直观观察法、扫描电镜法、dna测序法等已经不能满足毛皮的精准鉴定。实时荧光定量pcr(quantitativereal-timepcr,qpcr)是在常规pcr基础上添加荧光染料或荧光探针,利用荧光信号积累实时监测整个pcr过程。相比于常规taqman探针法,mgb探针法的优势有两点:一是探针3’端标记了自身不发光的淬灭荧光分子,取代常规可发光的tamra分子,使荧光本底降低,荧光光谱分辨率提高;二是探针3’端另结合了mgb——dna小沟结合物,使得较短的探针可以获得较高tm值,增加了探针的杂交稳定性,结果更精确,分辨率更高。

本发明建立了一种用于紫貂裘皮制品真伪识别的mgb探针的实时荧光定量pcr检测方法,利用mgb探针,能够高效、准确的检测毛皮制品是否为紫貂,避免其他毛皮假冒紫貂毛皮制品的现象,同时能为偷盗偷猎紫貂的案件提供关键证据。线粒体的coi基因是目前国内外公认的dna条码,本发明针对coi基因设计引物和mgb探针。



技术实现要素:

本发明的第一个目的是设计针对紫貂的物种特异性引物和探针。

本发明的第二个目的是建立快速、准确区分紫貂裘皮制品真伪的分子检测方法。

为了达到上述目的,本发明采用以下方案:

1、dna的提取体系

取紫貂针毛至少10根(平均3~4cm)或绒毛5mg放置于2ml离心管中,剪碎,加入280μltne、30μlsds、20μldtt、20μl蛋白酶k,加入150μlbufferc-l(axygen动物基因组提取试剂盒),立即涡旋振荡1min混合均匀。瞬时离心后,将离心管置于56℃水浴中过夜消化处理。离心步骤参照axygen动物基因组提取试剂盒说明书进行,加入350μl蛋白去除液,涡旋振荡30s均匀混合,12000r/min离心10min。将dna制备管置于2ml离心管中,将离心后的上清移至制备管中,12000r/min离心1min。弃掉滤液,加入500μl洗涤液,12000r/min离心1min。弃掉滤液,加入700μl去盐液,12000r/min离心1min。弃滤液,重复一次去盐过程。弃滤液,离心1min。将dna制备管转移到新的1.5ml离心管中,加入65℃预热的eluent洗脱液80μl洗脱dna,-20℃冷冻备用。

2、引物和探针的设计

选取genbank上已发表的紫貂的线粒体coi序列(kj202644、kj202643、kj202642和fj429093),以及相关物种的同源序列,利用megalign进行比对后,选择紫貂物种特异的碱基序列,利用abiprimerexpress3.0设计引物与mgb探针,primer6.0分析引物二级结构,将所设计的引物和探针利用blast再次进行比对分析,确保引物与探针的特异性。

引物和探针设计结果:

3、本发明中qpcr检测方法的建立

在faststartuniversaprobemaster(rox)的基础上,建立20μl反应体系,其中上、下游引物和mgb探针的量从0.3μl到1.5μl,以0.1μl为梯度递加。反应体系中加入模板7μl。根据荧光定量pcr的结果,选择最大的荧光增量和最好的曲线走势作为判定标准,选择引物和探针的最适量。

最优反应体系为:faststartuniversaprobemaster(rox)10μl,上游引物mzf0.5μl,下游引物mzr0.5μl,mgb探针0.5μl,dna模板7μl,ddh2o1.5μl。pcr反应程序如下:95℃10min;95℃10s,60℃30s,50个循环;60℃1min,循环在退火时收集荧光信号。

pcr反应程序为:95℃10min;95℃10s,60℃30s40个循环;60℃1min,循环在退火时收集荧光信号。

判图原则:ct值小于等于35并有明显扩增曲线判为阳性;ct值大于等于40判为阴性;ct值介于35~40之间判为可疑,dna模板加倍重复实验,如果ct值比原来减小并拥有明显扩增曲线判为阳性,否则判为阴性。

4、本发明中qpcr特异性实验

利用紫貂引物和探针,分别加入紫貂皮、鞣质紫貂针毛、水貂、石貂、松貂、黄喉貂、白鼬、麝鼠、貉、浣熊、北极狐、赤狐、藏狐、沙狐、狼、狗、家猫、豹、雪豹、东北虎、孟加拉虎、豹猫、漠猫、猞猁、双峰驼、羊、水牛、羊驼、黑熊、棕熊、马来熊、小灵猫的dna模板进行荧光特异性的实验,反应体系按照qpcr检测方法所确定的最佳反应体系建立。

5、本发明中qpcr的灵敏度实验

将紫貂皮的dna提取液原液按照10倍的梯度倍比稀释,得到100、10-1、10-2、10-3、10-4、10-5、10-6倍的dna溶液。依次用紫貂引物和探针进行检测。

6、重复性实验

取紫貂皮、紫貂鞣质针毛样品各10份,分别用紫貂的引物和探针进行检测,检测结果进行回判率分析。

7、盲测实验

随机准备10份样品,其中1份为紫貂样品,另外9份为其他物种样品。对此10份样品进行盲测实验,通过该盲测实验对本方法的有效性进行检验。

附图说明

图1紫貂引物探针特异性实验结果

图2紫貂梯度灵敏度实验

图3重复性实验结果

图4盲测实验结果

具体实施方式

实施例1

疑似紫貂裘皮制品的检测

1、dna的提取体系

取紫貂针毛10根(平均3~4cm)放置于2ml离心管中,剪碎,加入280μltne、30μlsds、20μldtt、20μl蛋白酶k,加入150μlbufferc-l(axygen动物基因组提取试剂盒),立即涡旋振荡1min混合均匀。瞬时离心后,将离心管置于56℃水浴中过夜消化处理。离心步骤参照axygen动物基因组提取试剂盒说明书进行,加入350μl蛋白去除液,涡旋振荡30s均匀混合,12000r/min离心10min。将dna制备管置于2ml离心管中,将离心后的上清移至制备管中,12000r/min离心1min。弃掉滤液,加入500μl洗涤液,12000r/min离心1min。弃掉滤液,加入700μl去盐液,12000r/min离心1min。弃滤液,重复一次去盐过程。弃滤液,离心1min。将dna制备管转移到新的1.5ml离心管中,加入65℃预热的eluent洗脱液80μl洗脱dna,-20℃冷冻备用。

2、体系和程序

对于待测样品,用20μl含有紫貂探针引物的反应体系进行检测分析。

20μl反应体系包括:faststartuniversaprobemaster(rox)10μl,上游引物mzf0.5μl,下游引物mzr0.5μl,mgb探针0.5μl,dna模板7μl,ddh2o1.5μl。

pcr反应程序为:95℃10min;95℃10s,60℃30s,50个循环;60℃1min,循环在退火时收集荧光信号。

判图原则:ct值小于35并有明显扩增曲线判为阳性;ct值大于35判为阴性;ct值介于35~40之间判为可疑,dna模板加倍重复实验,如果ct值比原来减小并拥有明显扩增曲线判为阳性,否则判为阴性。

结果表明,疑似紫貂裘皮制品的dna提取液,经过qpcr扩增,出现明显的紫貂扩增曲线且ct值小于35,说明为紫貂裘皮制品。检测结果显示,本方法对于紫貂裘皮制品真伪识别的检测结果是准确、可靠、有效的。

序列表

<110>东北林业大学

<120>一种紫貂裘皮制品真伪鉴别的mgb探针检测方法

<160>0

<170>siposequencelisting1.0

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