从多发性硬化患者分离的质粒编码的复制蛋白的晶体结构的制作方法

文档序号:26003631发布日期:2021-07-23 21:21阅读:来源:国知局

技术特征:

1.msbi1.176rep蛋白的晶体结构,其特征在于:具有(a)p21的空间群和(b)单位晶胞尺寸以及α=90°、β=90.66°和γ=90°。

2.msbi1.176rep蛋白的晶体结构,其包含包括leu11、leu18和/或ile25的疏水口袋。

3.msbi1.176rep蛋白的晶体结构,其包含包括残基lys69、lys73、lys85、arg90、arg78和/或arg96的dna相互作用位点。

4.一种用于产生msbi1.176rep蛋白的晶体或其可结晶化片段的方法,所述方法包括以下步骤:

(a)制备在结晶化试剂中的重组制备的msbi1.176rep蛋白,优选wh1结构域的溶液,

(b)通过蒸气扩散结晶化所述msbi1.176wh1结构域。

5.根据权利要求4所述的方法,其中,所述结晶化试剂包含0.2m乙酸镁和20%peg3350。

6.根据权利要求4所述的方法,其中,所述蒸气扩散是悬滴蒸气扩散方法。

7.一种用于筛选msbi1.176rep蛋白的抑制剂的方法,所述方法包括以下步骤:

(a)提供所述msbi1.176rep蛋白或其可结晶化片段的溶液,

(b)将至少一种候选物化合物与所述溶液中的所述msbi1.176rep蛋白接触,

(c)制备所述msbi1.176rep蛋白的晶体,以及

(d)识别所述msbi1.176rep蛋白的候选物结合化合物。

8.根据权利要求7所述的方法,其中,在步骤(d)中,确定所述候选物化合物与如权利要求3所限定的dna相互作用位点的结合。

9.如权利要求1至3中任一项所限定的晶体结构用于获得原子空间关系数据的用途。

10.根据权利要求9所述的晶体结构用于筛选、识别、设计或优化与所述msbi1.176rep蛋白结合的药品的用途。

11.msbi1.176rep蛋白的晶体结构用于计算机筛选候选化合物与所述msbi1.176rep蛋白结合,特别是与dna相互作用位点结合的能力的用途。


技术总结
本发明涉及从多发性硬化患者分离的质粒编码的复制蛋白的晶体形式,从它们获得的晶体结构信息,制备这样的晶体形式的方法,其用于识别和/或设计所述复制蛋白的抑制剂的用途,以及用于识别、优化和设计应具有与复制蛋白相互作用的能力或抑制复制蛋白的能力的化合物的方法。

技术研发人员:蒂莫·邦德;格兰特·S·汉斯曼;图尔加伊·基利奇;亚力山大·N·波波夫;埃塞尔·米歇尔·德·维利尔斯·祖尔·豪森;哈拉尔德·祖尔·豪森
受保护的技术使用者:德国癌症研究公共权益基金会
技术研发日:2019.11.14
技术公布日:2021.07.23
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