樱花品种"红丰"和"市原虎尾"的分子特异性标记引物的制作方法_2

文档序号:8295013阅读:来源:国知局
种为"红丰"或"市原 虎尾",反之则否。
[0029] 本发明有益效果主要体现在:本发明分子特异性标记引物可对樱花品种"红丰"和 "市原虎尾"进行快速的早期鉴别,方法简单、快捷、准确,是表观特征辨别樱花品种所不能 替代的分子手段。 (四)【附图说明】
[0030] 图1为对樱花品种进行PCR扩增的结果;M为DNA分子量标准;编号8和13分别 为樱花品种"红丰"和"市原虎尾",扩增出了分子量为466bp的特异DNA条带;其余编号为 其它的樱花品种,未见有400bp多大小的特异DNA条带产生。 (五)【具体实施方式】
[0031] 下面结合具体实施例对本发明进行进一步描述,但本发明的保护范围并不仅限于 此:
[0032] 实施例1 :
[0033] (1)樱花品种基因组DNA的提取:
[0034] 取待测樱花品种幼嫩叶片O.Olg,加液氮彻底磨碎,基因组DNA的提取采用 SDS-CTAB法,经多次抽提,来提取获得樱花品种的基因组DNA粗提物。DNA粗提物再经 Magabio核酸纯化试剂盒进行纯化(博日Bioer,杭州,中国)后,通过1. 5%的琼脂糖凝胶 电泳和DNA/RNA紫外分光光度计(GeneQuant Pro, GE Healthcare)来检测完整性、纯度及 浓度。0D260/0D280>1. 8的DNA样品用于后续PCR扩增。DNA提取物于-20°C冰箱贮藏备 用。
[0035] (2)设计特异PCR扩增引物,引物对的序列为:
[0036] 上游引物:5,-AGCGGCCGCTACTAAATAGACAGC-3 ,和下游引物: 5' -AGCGGCCGCTAGAAGAAGAACAAA-3',由上海生物工程技术有限公司合成。
[0037] (4) PCR 扩增:
[0038] PCR 反应液组成:10XPCR Buffer 2. 5 yL,lOmmol/L dNTPs 2. 5 yL,25mmol/ L MgCl22. 5 μ L,5U/ μ L Taq DNA 酶 0· 2 μ L,IOmM 特异引物对各 I μ L,20ng/ μ L 模板 DNA 3 μ L,ddH20 补足至 25 μ L。
[0039] 扩增反应在TC-XP型扩增仪上进行。扩增条件:95°C预变性3min ;95°C变性40s, 65°C退火40s,72°C延伸2min,共35个循环;最后于72°C补平7min,终止温度为4°C。
[0040] (4)电泳检测:取步骤(3) PCR扩增产物5 yL,与I yL 0. 25 %溴酚兰缓冲液混匀, 点样于1. 5%的琼脂糖凝胶上,于IXTAE缓冲液中,5V/cm电压下电泳,电泳结束后,在含 0. 5 μ g/mL EB的水溶液中染色30分钟,然后在上海培清JS-380A自动凝胶图像分析仪上照 相。
[0041] 按照上述方法,分别对20个樱花品种(编号1?20代表樱花品种依次 为:1、红笠(C. serrulata 'Benigasa')、2、红华(C. serrulata 'Kouka')、3、一 叶(C.serrulata 'Hisakura')、4、福绿寿(C.serrulata 'Contorta')、5、普贤 象(C.serrulata 'Albo_rosea')、6、松月(C.serrulata 'Superba')、7、郁金 (C. serrulata <Grandifora, ) 红丰(Cerasus X sieboldii iBeni - yutaka')、 9、御衣黄(C. serrulata 'Gioiko')、10、关山(C. serrulata 'Kanzan')、11、大提灯 (C.serrulata '0jochin')、12、八重红枝垂(C.spachiana 'Plena Rosea')、13、市原虎 尾(C.serrulata 'Albo Plena')、14、咲耶姬(CerasusXyedoensis 'Sakuyahime')、 15、朱雀(C.serrulata 'Shujaku')、16、杨贵妃(C.serrulata 'Mollis')、17、雨情枝垂 (C. spachiana 'Ujou - shidare')、18、菊垂楼(C. serrulata 'Plena-pendula')、19、平野 妹背(C.serrulata 'Imose')、20、旭山楼(C.serrulata 'Asahiyama')的PCR 扩增图谱进 行电泳检测,结果见图1。
[0042] 其中仅从编号分别为8和13的樱花品种"红丰"和"市原虎尾"中各扩增出了一 条清晰明亮、稳定的分子量约为400bp多大小的特异DNA条带,而其余编号的樱花品种,未 见有400bp多大小的特殊DNA条带产生,也未有其它非目的条带产生,可见本发明开发出的 分子特异性标记引物用于樱花品种"红丰"和"市原虎尾"的早期鉴定,其稳定性、特异性非 常1?。
【主权项】
1. 樱花品种"红丰"和"市原虎尾"的分子特异性标记引物,所述引物序列如下: 上游引物:5' -AGCGGCCGCTACTAAATAGACAGC-3', 下游引物:5, -AGCGGCCGCTAGAAGAAGAACAAA-3,〇
2. -种利用权利要求1所述的分子特异性标记引物对樱花品种"红丰"和"市原虎尾" 进行快速鉴定的方法,所述方法为:提取待测樱花品种叶片的基因组DNA作为模板,以所述 分子特异性标记引物作为扩增引物,进行PCR扩增,对扩增产物进行电泳检测,若电泳结果 出现466bp的特异DNA条带,则待测樱花品种为樱花品种"红丰"或"市原虎尾",反之则否; 所述分子特异性标记引物序列为: 上游引物:5' -AGCGGCCGCTACTAAATAGACAGC-3', 下游引物:5, -AGCGGCCGCTAGAAGAAGAACAAA-3, 〇
3. 如权利要求2所述的方法,其特征在于所述PCR扩增条件如下:95°C预变性3min; 95°C变性40s,65°C退火40s,72°C延伸2min,共35个循环;最后于72°C补平7min,终止温 度为4°C。
4. 如权利要求2所述的方法,其特征在于所述方法如下: (1) 取待测樱花叶片,加液氮磨碎,以SDS-CTAB法提取待测樱花叶片的基因组DNA; (2) 以步骤⑴提取的基因组DNA为模板,以所述分子特异性标记引物作为扩增引物, 进行PCR扩增: PCR扩增体系每25yL组成如下: lOxPCRBuffer 2_5j.iL 10nrmol/LdNTPs 2.5j.lL 25mmol/LMgCU 2.5j.iL 5U/|iLTaqDNA酶 0.2)aL IOjiM上、下游引物 各lfiL 20iig/|iL模板DNA 3(iL ddH20补足至25|aL; PCR扩增条件如下: 95°C预变性3min;95°C变性40s,65°C退火40s,72°C延伸2min,共35个循环;最后于 72°C补平7min,终止温度为4°C; (3) 取步骤(2)扩增产物5yL,与1yL0. 25 %溴酚兰缓冲液混匀,点样于1. 5%的琼 脂糖凝胶上,于1XTAE缓冲液中、5V/cm电压下电泳,电泳结束后EB染色,于自动凝胶图像 分析仪上照相,若电泳结果出现466bp的DNA条带,则待测樱花品种为"红丰"或"市原虎 尾",反之则否。
【专利摘要】本发明涉及一对特异性高的樱花品种“红丰”和“市原虎尾”的分子特异性标记引物,以及一种能对樱花品种“红丰”和“市原虎尾”进行快速鉴定的方法。所述引物序列如下:上游引物:5′-AGCGGCCGCTACTAAATAGACAGC-3′,下游引物:5′-AGCGGCCGCTAGAAGAAGAACAAA-3′。本发明分子特异性标记引物可对樱花品种“红丰”和“市原虎尾”进行快速的早期鉴别,方法简单、快捷、准确,是表观特征辨别樱花品种所不能替代的分子手段。
【IPC分类】C12Q1-68, C12N15-11
【公开号】CN104611330
【申请号】CN201510024037
【发明人】徐梁, 李海波, 杨少宗, 魏海龙, 赵庆杰, 柳新红
【申请人】浙江省林业科学研究院
【公开日】2015年5月13日
【申请日】2015年1月16日
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