一种基于l型脱氧核酶生物体系中金属离子的检测试剂盒、检测方法和应用

文档序号:9519351阅读:365来源:国知局
一种基于l型脱氧核酶生物体系中金属离子的检测试剂盒、检测方法和应用
【技术领域】
[0001] 本发明属于生物技术领域,具体涉及一种基于L型脱氧核酶生物体系中金属离子 的检测试剂盒、检测方法和应用。
【背景技术】
[0002] 对生物体内重金属离子灵敏、准确检测是人们一直努力的目标。除了传统的原子 吸收、质谱等方法,近年来,基于体外筛选技术,科学家门发展了一系列具有催化活性的DNA 结构(DNAzyme,中译文为脱氧核酶),由于这些DNAzyme的活性对特定的重金属离子具有强 烈的依赖性,人们因此发展了DNAzyme传感器用于重金属离子如铅、铜、汞、铀酰等的检测, 这些传感器灵敏度高,选择性好,设计简单,反应快速,因此受到了越来越广泛的关注。然 而,复杂的生理环境,限制了DNAzyme在体内的广泛应用。例如,生物基质中存在着大量的 核酸酶,这些核酸酶能够对外源DNAzyme产生非特异性攻击,使得DNAzyme无法稳定存在于 生理环境而报告出假阳性信号;其次,大量的蛋白质能够与DNAzyme非特异性结合,引起探 针结构变化,报告假阳性信号;第三,外源DNAzyme探针与体内核酸属于同一类型,为了避 免DNAzyme与体内其它非特异性的核酸序列产生杂交,需要对核酸探针进行序列的筛选和 优化,这对核酸探针的设计造成了一定的复杂性。
[0003] L-DNA是天然DNA,D型DNA的对映异构体。与D-DNA相比,L-DNA能够抵抗核酸 酶的降解、不与细胞内各种蛋白质产生非特异性结合,同时,L-DNA不会与D型核酸杂交,从 而减少了L-DNA核酸探针设计的复杂性等问题。基于L-DNA的诸多优良性质,我们考虑能 否设计L-DNAzyme用于生物体系中金属离子检测。根据手性底物特异性相关(reciprocal chiralsubstratespecificity)原理,如果物质A与B有特异性识别能力,那么A的镜像 A'则能够与B的镜像B'具有同样的识别能力。基于此,我们推断,如果物质A与B有特异 性识别能力,而B物质是非手性物质,则物质A的镜像A'应该对非手性的物质B具有同样 的识别能力。如果这个推断成立,那么当D-DNAzyme对金属离子具有特异性依赖而产生催 化活性时,其镜像结构:L-DNAZyme同样能够依赖该金属离子而产生催化活性,这样,我们 就能够将D-DNAzyme序列直接转变为L-DNAzyme序列,用于金属离子的检测与成像,而根据 前面的报道,L-DNA不会受到各种生物基质的干扰,从而发展一种生物体系中稳定存在的金 属离子传感器用于金属离子的准确、灵敏检测。

【发明内容】

[0004] 本发明针对现有D-DNAzyme易被生物基质干扰,对金属离子的检测容易产生假阳 性信号等问题,提出一种稳定、灵敏、特异性分析生物体系中金属离子的定量定性分析试剂 盒、方法和应用。
[0005] 为了达到上述目的,本发明提供的技术方案为:
[0006] 所述基于L型脱氧核酶生物体系中金属离子的检测试剂盒中含有L-DNAzyme。所 述DNAzyme的序列包括酶链序列和底物链序列;所述酶链序列如SEQ ID NO. 1所示,所述底 物链序列如SEQ ID NO. 2所示。
[0007] 所述检测生物体系中金属离子的方法是将特异性识别金属离子的D-DNAzyme序 列直接转换为L-DNAzyme,然后用L-DNAzyme进行金属离子的检测。所述DNAzyme的序列 包括酶链序列和底物链序列;所述酶链序列如SEQIDNO. 1所示,所述底物链序列如SEQ IDN0. 2所示。所述用L-DNAzyme进行金属离子的检测是将L-DNAzyme加入缓冲液中,配 成L-DNAzyme浓度为50nM的检测溶液,在荧光分光光度计进行定量检测时检测溶液的反应 体积为 200yL。所述缓冲液包括以下成分:50mMNaCl,50mMKCl,5mMMgCl2,50mMHEPES, pH7. 2或pH6. 65,具体来说,用于Pb(II)离子传感时包括以下成分:50mMNaCl,50mM KC1,5mMMgCl2, 50mMHEPES,pH7· 2 ;在血清中检测时,缓冲液盐离子组分相同,pH6· 65,血 清浓度为10%。在标准缓冲液中对Pb(II)的检测灵敏度为0. 7ηΜ,血清中为50ηΜ。
[0008] 下面对本发明作进一步说明:
[0009] 本发明将特异性识别金属离子的D-DNAzyme序列直接转换为L-DNAzyme,根 据手性底物特异性相关原理,该L-DNAzyme同样能够识别对应的金属离子,同时,结合 L-DNAzyme不会被生物基质干扰,实现生物体系中金属离子的定量分析。该L-DNAzyme能够 抵抗生物基质中各组分的干扰,避免假阳性信号的产生,是用于生物体系中金属离子检测 与成像的传感器。信号分子可以为FAM和Dabcyl,不存在金属离子时,标记在DNAzyme上的 FAM基团发出的荧光被Dabcyl淬灭,存在特定金属离子时底物链断裂,发出荧光信号。
[0010] 本发明包括如下内容:(1)根据已经报告的对金属离子特异性响应的D-DNAzyme 序列,设计合成出有荧光-淬灭基团标记的L-DNAzyme荧光探针(使用DNA/RNA自动合成 仪合成L-DNAzyme序列);(2)证明L-DNAzyme具有对金属离子依赖的催化能力,并构建 缓冲液中L-DNAzyme对金属离子的检测体系(使用荧光分光光度计进行考察,反应体积为 200μL,DNAzyme浓度为50nM) ; (3)使用核酸酶、单链结合蛋白等具有代表性的生物基质干 扰物,证明L-DNAzyme不会受到生物基质的干扰;(4)提取血清,构建中金属离子的检测体 系(使用的血清浓度为10%,使用前进行无机酸消解)。(2) - (5)中金属离子参与的实验, 反应时间均为30min。
[0011] 与现有技术相比,本发明的优点在于:
[0012] 首先,本发明是在手性底物特异性相关原理上的一个创新,证明了非手性物质在 对A物质响应的同时,也会对A的镜像A'起到同样的响应效果;
[0013] 其次,本发明不需要筛选、设计新的金属离子传感器,只需把已经筛选出的 D-DNAzyme序列合成出L-DNAzyme序列即可,设计简单、快捷;
[0014] 第三,借助于L-DNA能够抵抗生物基质干扰的优良性能,该方法能够用于生物体 系中金属离子的检测,解决了D-DNAzyme在生物体系中易被降解、干扰的困难;
[0015] 第四,本发明具有通用性,不仅对DNAzyme有特定响应能力的金属离子适应,其他 能够对DNA有特定识别能力的非手性物质,同样适用于该方法。鉴于设计简单、方法通用、 稳定性好、灵敏度高等优点,我们提出的基于L-DNAzyme用于金属离子的定量检测方法有 可能发展成为普及的金属离子定量检测工具。
【附图说明】
[0016] 图1A为本发明原理图。当特异性的金属离子能够催化D-DNAzyme的活性,切断底 物链时,该金属离子同样能够催化相对应的L-DNAzyme发生同样的活性。而D-DNAzyme易 被生物体系中各种生物学基质干扰时,L-DNAzyme能够抵抗这些干扰,从而能够发展生物体 系中稳定的L-DNAzyme传感器用于金属离子的检测。图1B为L-DNA以及D-DNA的结构,两 者呈镜像关系。
[0017] 图2A为铅离子依赖的DNAzyme的序列及结构。图2B为其对铅离子的响应示意 图。底物链上分别标记了荧光基团与淬灭基团,酶链上标记了淬灭基团。双链杂交,荧光被 淬灭。铅离子出现后,酶链切割底物链,荧光基团远离,发出荧光信号,从而有效报告铅离子 的存在。
[0018] 图3B的插图为聚丙稀酰胺凝胶电泳分析L-DNAzyme对底物链的切割活性。插 图通道1不加铅离子,通道2加入铅离子,可以看到铅离子的存在使得底物链被切断。图 3A为GR-5L-DNAzyme用于铅离子的定量检测。能够实现0. 72nM铅离子的检测。图3
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