细胞胞内氨基酸代谢轮廓分析方法_3

文档序号:9764974阅读:来源:国知局
o)alanine 5.78 363.137 Pipecolicacid;'' 2.91 449.1135 Glyceryiphosphorylethanoiami ne 2.9] 403.06巧 Cysteic acid:' 5.64 457.1425 Acetyl-L-tyrosine" 4.S 456.15S7_4-aminohippurate_
[0054] a鉴定结果用化学标准品验证过的化合物。
[00巧]表2丹醜化衍生氨基酸的线性响应和精密度。
[0057]
[00则 实施例2
[0059] 脂肪酸干预的化pG2细胞胞内氨基酸代谢轮廓分析:
[0060] 1)胎pG2细胞培养和脂肪酸干预
[0061] 在175cm2的细胞培养瓶中贴壁培养化pG2细胞;给予10% FBS的DMEM高糖培养 基,并在37°C,5% C02的恒定条件下令细胞汇合生长至60-70%。
[0062] 用膜蛋白酶消化细胞,细胞重悬于10% FBS的DMEM培养基中。进行细胞计数,制 备密度为2 X IO4细胞/毫升的细胞悬液用于接种96孔板。
[0063] 在96孔板中,每孔接种100 U L上述化pG2细胞悬液(悬浮液用10 % FBS的DMEM 培养基配置而成),并保持在37C及5% C02的条件下培养2地。
[0064] 细胞生长24h后,对其进行脂肪酸干预。施加的脂肪酸为踪搁酸(PA, C 16:0),踪 搁油酸(P0A,C 16:1)及二者联合。脂肪酸干预的方法如下;PA首先在7(TC下用己醇溶解, 然后加入至5% BSA中,终浓度为2mM,超声Imin,在55°C下赔育30min. POA首先用己醇稀 释,然后加入至5%654中,终浓度为1.21111,在421:下赔育15111111.将上述脂肪酸-85八溶 液用0. 22 U M无菌滤膜过滤,再用10% FBS-DMEM培养基稀释。细胞分别暴露于终浓度为 100 U M和60 U M的PA和POA及二者联合溶液。对照组细胞培养基中己醇浓度为0. 005 % .
[0065] 2)基于96孔板的细胞预处理
[0066] 2. 1细胞浑灭和胞内代谢物提取
[0067] 脂肪酸干预4化后,96孔板每一孔中生长的细胞先用200 U L冰冷PBS洗H次,迅 速加入50 U L 21 ;79 (v/v),甲醇/水(4°C )对细胞进行代谢浑灭。再迅速加入50 U L 80% 的甲醇水溶液,其中含浓度为0. 5 U g/mL同位素内标Ala-d4, Va^d8和化p-d5,4°C下静置提 取30min.将提取混合物离必后,取50 U L上层清液用于衍生。
[0068] 2. 2提取液衍生化
[0069] 衍生反应中,先向50y L提取物中加入等体积的0. 5M碳酸钢/碳酸氨钢缓冲溶 液,再加入50 y L 5mg/mL丹礙醜氯后,将溶液充分润旋混合。混合物在60°C,16化pm条件 下反应1小时后,加入30 U L 0. 5M 了胺水溶液,相同条件下反应半小时W终止丹醜化反应。 在13, 000巧m下离必IOmin,上清即可用于LC-MS分析。
[0070] 3) LC-MS 分析
[0071] 色谱分离义用 5cm 服S T3 柱(2. Imm 内径,1. 7 y m 粒径)(Waters, Milford, MA), 同时使用CS预柱(Waters, Milford, MA)进行柱保护。进样量为5化.柱温设定为50°C . 流动相A为0. 1 %甲酸/水(v/v),流动相B为纯己腊。液相洗脱梯度为;0-lmin,2% B ; l-2min线性升至20 % B,维持0. 5min ;在5min和6min,相继升至55 % B和60 % B, Smin处 升至100% B并维持Imin.单次样品运行时间为12min,其中包括预平衡的3min.流动相流 速为0. 3血/min.
[0072] MS在正离子模式下进行信号采集,质荷比扫描范围为200-1000道尔顿值a)。质谱 分辨率设为15K。离子源参数设置如下:銷气和辅助气流速分别为35和5个单位。!喷雾 电压和毛细管电压分别为4. 5kV和49V ;毛细管温度为35(TC ;离子传输管电压设为100V. [007引 4)数据处理
[0074] 原始数据导入软件Seive进行峰匹配,参数设置如下:m/z窗口设为IOppm ;保留 时间窗口为Imin ;最大的峰个数设为1000 ;最小峰强度阔为1000.其他参数为默认值。在 上述自动峰匹配中,同时对目标氨基酸进行祀向提取。祀向提取时峰的起止时间设为保留 时间减加〇.5min.氨基酸校正至相应样本的总峰面积后进行后续的统计分析。氨基酸代谢 轮廓比较采用主成分分析(PCA)。显著性分析采用Student' S t检验。
[00巧]通过主成分分析(图4),发现PA干预组与对照组在氨基酸代谢轮廓上无明显区 分,POA和PA-POA干预组具有相似的氨基酸代谢轮廓,且远离对照组。送表明在稍高于生理 浓度的脂肪酸干预下,氨基酸池对POA干预更为敏感。与对照组比,POA与PA-POA联合干预 组的胞内Asp, Gln, Glu, Ser, Ala, Pro, Lys, Arg和Tb显著降低,仅Asn含量有所增高(表 3)。PA干预组胞内氨基酸与对照组无显著差异,可能是由于PA浓度稍高于10% FBS-DMEM 培养基中PA的浓度,不足W引起氨基酸代谢的扰动。
[0076] 表3踪搁油酸及联合干预组中与对照组具有显著差异的氨基酸
[0077]
[0078] 本发明公开的胞内代谢轮廓高通量分析方法具有简便快速,灵敏度高且重复性好 的特点,适合于96孔板内培养的细胞W及收获量少的细胞的代谢组高通量分析,如药物的 大规模筛选、评价W及干细胞研究等。
【主权项】
1. 细胞胞内氨基酸代谢轮廓分析方法,所述方法包括: (a) 取洗去培养基的细胞,利用冷甲醇水溶液对细胞进行代谢淬灭和低温静置提取,离 心或过滤,得细胞胞内代谢物提取液; (b) 采用丹磺酰氯作为衍生化试剂,对提取液中含氨基及酚羟基代谢物进行衍生,终止 衍生后,离心或过滤,收集衍生后的溶液; (c) 采用液相色谱-质谱联用的方法,在正离子模式下对衍生后溶液中的细胞胞内代 谢物进行检测。2. 根据权利要求1所述方法,其特征在于:步骤(c)采用高效液相色谱-质谱法进行 代谢轮廓分析; 以PBS清洗去除培养基后的细胞,得洗去培养基的细胞;PBS为预冷至0-4°C的PBS缓 冲盐溶液。3. 根据权利要求1所述方法,其特征在于:冷甲醇水溶液为预冷至0-4°C,体积含 量30-60%甲醇的水溶液,甲醇的水溶液中还含有同位素内标,同位素内标分别为浓度 0· 1-2. 5 μ g/mL 的 Ala_d4、Val_d8 和 Trp_d5 ; 采用冷甲醇水溶液对细胞淬灭后,进行低温静置代谢物提取,提取条件为:细胞淬灭后 的混合液静置于〇_4°C环境下30-60分钟。4. 根据权利要求1所述方法,其特征在于:用于细胞代谢物衍生的试剂包括:缓冲盐溶 液,衍生化试剂以及终止衍生化反应试剂;终止衍生后,离心或过滤,收集衍生后的溶液; 所述缓冲盐溶液指的是〇. 1-0. 5M碳酸钠/碳酸氢钠缓冲盐溶液; 采用0. 5-5mg/mL丹磺酰氯的乙腈溶液作为衍生化试剂; 缓冲盐溶液、衍生化试剂和提取液的体积比为1:1:1,衍生化反应温度为50-70°C,反 应时间为40-60min。5. 根据权利要求3所述方法,其特征在于: 以d6-丹磺酰氯作为参照衍生化试剂,进行辅助鉴定;用于细胞代谢物辅助衍生的试剂 包括:缓冲盐溶液,参照衍生化试剂以及终止衍生化反应试剂;终止衍生后,离心或过滤, 收集辅助衍生后的溶液; 所述缓冲盐溶液指的是〇. 1-0. 5M碳酸钠/碳酸氢钠缓冲盐溶液; 即采用0. 5-5mg/mL d6-丹磺酰氯的乙腈溶液作为辅助衍生化试剂,对提取液中含氨基 及酚羟基代谢物进行辅助衍生化; 缓冲盐溶液、附助衍生化试剂与提取液的体积比为1:1:1,衍生化反应温度为 50-70°C,反应时间为 40-60min。6. 根据权利要求1、3或4所述方法,其特征在于:所述终止衍生化反应试剂指的是 50-500 μ Μ 丁胺水溶液,于每150 μ L衍生体系或辅助衍生体系中终止衍生化反应试剂加入 量为 20-40 μ L。7. 根据权利要求4所述方法,其特征在于:辅助鉴定时,将辅助衍生后的溶液与衍生后 的溶液按等体积混合后再进行步骤(c)的检测分析过程。8. 根据权利要求1所述方法,其特征在于: 所测标本为细胞,步骤(a)所取细胞数量在103-104之间。9. 根据权利要求1所述方法,其特征在于:经衍生的含氨基及酚羟基代谢物,在正离子 模式下,形成质荷比为Μ(分子量)+234. 059, M+307. 148。10.根据权利要求1或8所述方法,其特征在于:所测标本为96孔板培养的细胞,96孔 板每一孔中培养的细胞为一个独立的分析样本。
【专利摘要】本发明公开了一种针对少量细胞(103-104个)的胞内代谢轮廓高通量分析方法,包括简便、高效的细胞淬灭及代谢物提取,代谢物衍生化,以及质谱检测等步骤。本发明公开的胞内代谢轮廓高通量分析方法具有简便快速,灵敏度高且重复性好的特点,适合于96孔板内培养的细胞以及收获量少的细胞的代谢组高通量分析,如药物的大规模筛选、评价以及干细胞研究等。
【IPC分类】G01N30/06, G01N30/02
【公开号】CN105527350
【申请号】CN201410581881
【发明人】许国旺, 周丽娜, 尹沛源, 高鹏, 路鑫
【申请人】中国科学院大连化学物理研究所
【公开日】2016年4月27日
【申请日】2014年10月27日
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