技术总结
本发明公开基于kendall相关系数的DNA序列相似性比对方法，其包括如下步骤：1)获取N条待比对的DNA序列；2)选取长度k，按滑动窗口的方式获取每对组合DNA序列的相应的k词，并组合成相应的向量3)以步骤2)所获取的k词，计算每个k词在DNA序列中出现的次数即计算k词在DNA序列中出现的频率向量，将其记为xi，DNA序列所有的k词频率记为X＝{xi}；4)对N条DNA序列k词向量进行两两组合，即得到组合，每个组合k词频率向量记为x，y；5)每种组合的k词频率向量即x，y，计算其对应的kendall相关系数；6)建立N条DNA序列的N*N阶相似系数矩阵，以获取DNA序列的相似性以及进化关系图。本发明提高DNA序列相似性比对的效果，简化计算复杂性并缩短运算时间。
技术研发人员：林劼;林丽玉;江育娥
受保护的技术使用者：福建师范大学
文档号码：201611186639
技术研发日：2016.12.20
技术公布日：2017.05.31