信使RNA的包封的制作方法

信使rna的包封
1.本技术是申请号为201580033224.5、申请日为2015年7月2日、发明名称为“信使rna的包封”的中国发明专利申请的分案申请，原申请为国际申请号为pct/us2015/039004的pct国际申请的中国国家阶段申请，该国际申请要求申请日为2014年7月2日，申请号为62/020,163的美国临时申请的优先权。
2.相关申请的交叉引用
3.本技术要求2014年7月2日提交的美国临时专利申请第62/020,163号的优先权，所述申请的公开内容通过引用整体并入本文中。
4.发明背景
5.信使rna治疗(mrt)正在成为治疗各种疾病的越来越重要的方法。mrt涉及将信使rna(mrna)施用到需要用于产生由患者体内的mrna编码的蛋白质的治疗的患者中。脂质纳米粒常用于包封mrna以用于mrna的有效体内递送。然而，用于产生负载mrna的脂质纳米颗粒的当前方法遭受不良的包封效率，低mrna回收率和/或不均匀的粒度。
发明概要
6.本发明尤其提供了一种用于脂质纳米颗粒配制和mrna包封的改良方法。具体地说，本发明基于以下出乎意料的发现：在混合之前预加热mrna溶液和/或脂质溶液产生显着改善的包封效率、mrna回收率以及更均匀和更小的粒度(例如，小于100nm)。
7.因此，在一些实施方案中，本发明提供了一种将信使rna(mrna)包封在脂质纳米颗粒中的方法，其包括混合mrna溶液和脂质溶液的步骤，其中mrna溶液和/或脂质溶液处于大于环境温度的预定温度下。在一些实施方案中，适用于本发明的预定温度为等于或大于约30℃、37℃、40℃、45℃、50℃、55℃、60℃、65℃或70℃。在一些实施方案中，适用于本发明的预定温度介于约25-70℃、约30-70℃、约35-70℃、约40-70℃、约45-70℃、约50-70℃或约60-70℃的范围内。在特定实施方案中，适用于本发明的预定温度为约65℃。
8.在一些实施方案中，mrna溶液和脂质溶液在混合前分别被加热至预定温度。在一些实施方案中，在混合之前，mrna溶液被加热至预定温度且脂质溶液处于环境温度下。在一些实施方案中，通过将环境温度下的mrna储备溶液添加到加热的缓冲溶液中达到预定温度而将mrna溶液加热至预定温度。在一些实施方案中，缓冲溶液具有不大于约4.5(例如，不大于约4.4、4.2、4.0或3.8)的ph。
9.在一些实施方案中，通过无脉流泵混合mrna溶液和脂质溶液。在一些实施方案中，合适的泵是齿轮泵。在一些实施方案中，合适的泵是蠕动泵。在一些实施方案中，合适的泵是离心泵。
10.在一些实施方案中，在介于约150-250ml/分钟、250-500ml/分钟、500-1000ml/分钟、1000-2000ml/分钟、2000-3000ml/分钟、3000-4000ml/分钟或4000-5000ml/分钟的范围内的流速下混合mrna溶液。在一些实施方案中，在约200ml/分钟、约500ml/分钟、约1000ml/分钟、约2000ml/分钟、约3000ml/分钟、约4000ml/分钟或约5000ml/分钟的流速下混合mrna溶液。
11.在一些实施方案中，在介于约25-75ml/分钟、约75-200ml/分钟、约200-350ml/分钟、约350-500ml/分钟、约500-650ml/分钟、约650-850ml/分钟或约850-1000ml/分钟的范围内的流速下混合脂质溶液。在一些实施方案中，在约50ml/分钟、约100ml/分钟、约150ml/分钟、约200ml/分钟、约250ml/分钟、约300ml/分钟、约350ml/分钟、约400ml/分钟、约450ml/分钟、约500ml/分钟、约550ml/分钟、约600ml/分钟、约650ml/分钟、约700ml/分钟、约750ml/分钟、约800ml/分钟、约850ml/分钟、约900ml/分钟、约950ml/分钟或约1000ml/分钟的流速下混合脂质溶液。
12.在一些实施方案中，根据本发明的方法包括首先通过混合柠檬酸盐缓冲液与mrna储备溶液产生mrna溶液的步骤。在某些实施方案中，合适的柠檬酸盐缓冲液包含约10mm柠檬酸盐、约150mm nacl、约4.5的ph。在一些实施方案中，合适的mrna储备溶液含有浓度等于或大于约0.10mg/ml、1mg/ml、约10mg/ml、约50mg/ml或约100mg/ml的mrna。
13.在一些实施方案中，在介于约100-300ml/分钟、300-600ml/分钟、600-1200ml/分钟、1200-2400ml/分钟、2400-3600ml/分钟、3600-4800ml/分钟或4800-6000ml/分钟的范围内的流速下混合柠檬酸盐缓冲液。在一些实施方案中，在约220ml/分钟、约600ml/分钟、约1200ml/分钟、约2400ml/分钟、约3600ml/分钟、约4800ml/分钟或约6000ml/分钟的流速下混合柠檬酸盐缓冲液。
14.在一些实施方案中，在介于约10-30ml/分钟、约30-60ml/分钟、约60-120ml/分钟、约120-240ml/分钟、约240-360ml/分钟、约360-480ml/分钟或约480-600ml/分钟的范围内的流速下混合mrna储备溶液。在一些实施方案中，在约20ml/分钟、约40ml/分钟、约60ml/分钟、约80ml/分钟、约100ml/分钟、约200ml/分钟、约300ml/分钟、约400ml/分钟、约500ml/分钟或约600ml/分钟的流速下混合mrna储备溶液。
15.在一些实施方案中，所述脂质溶液在乙醇中含有一种或多种阳离子脂质、一种或多种辅助脂质、一种或多种基于胆固醇的脂质和peg脂质。在一些实施方案中，将mrna溶液和脂质溶液混合于20％乙醇中，得到脂质纳米颗粒的悬浮液。在一些实施方案中，脂质纳米颗粒通过切向流过滤进一步纯化。
16.在一些实施方案中，大于约50％、55％、60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％的纯化纳米颗粒具有小于约100nm(例如，小于约95nm、约90nm、约85nm、约80nm、约75nm、约70nm、约65nm、约60nm、约55nm或约50nm)的大小。在一些实施方案中，大体上所有的纯化纳米颗粒具有小于100nm(例如，小于约95nm、约90nm、约85nm、约80nm、约75nm、约70nm、约65nm、约60nm、约55nm或约50nm)的大小。
17.在一些实施方案中，大于约70％、75％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％的纯化纳米颗粒具有介于约40-90nm(例如，约40-85nm、约40-80nm、约40-75nm、约40-70nm、约40-65nm或约40-60nm)的范围内的大小。在一些实施方案中，大体上所有的纯化纳米颗粒具有介于约40-90nm(例如，约40-85nm、约40-80nm、约40-75nm、约40-70nm、约40-65nm或约40-60nm)的范围内的大小。
18.在一些实施方案中，纯化的纳米颗粒具有大于约80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％的包封效率。在一些实施方案中，根据本发明的方法产生大于约60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％的mrna回收率。
19.在一些实施方案中，本发明提供了一种将信使rna(mrna)包封在脂质纳米颗粒中
的方法，其包括(a)将mrna溶液和/或脂质溶液分别加热至大于环境温度的预定温度；(b)将加热的mrna溶液和/或加热的脂质溶液混合以产生脂质纳米颗粒的悬浮液；和(c)使脂质纳米颗粒纯化。
20.在另一方面，本发明提供了一种通过本文所述的方法产生的脂质纳米颗粒的组合物。在一些实施方案中，本发明提供了一种包含纯化脂质纳米颗粒的组合物，其中大于约90％的纯化脂质纳米颗粒具有小于约100nm(例如，小于约95nm、约90nm、约85nm、约80nm、约75nm、约70nm、约65nm、约60nm、约55nm或约50nm)的单个粒度且大于约70％的纯化脂质纳米颗粒将mrna包封在每个单独颗粒内。在一些实施方案中，大于约95％、96％、97％、98％或99％的纯化脂质纳米颗粒具有小于约100nm(例如，小于约95nm、约90nm、约85nm、约80nm、约75nm、约70nm、约65nm、约60nm、约55nm或约50nm)的单个粒度。在一些实施方案中，大体上所有的纯化脂质纳米颗粒具有小于约100nm(例如，小于约95nm、约90nm、约85nm、约80nm、约75nm、约70nm、约65nm、约60nm、约55nm或约50nm)的单个粒度。在一些实施方案中，大于约75％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％的纯化脂质纳米颗粒将mrna包封在每个单独颗粒内。在一些实施方案中，大体上所有的纯化脂质纳米颗粒将mrna包封在每个单独颗粒内。在一些实施方案中，根据本发明的组合物含有至少约1mg、5mg、10mg、100mg、500mg或1000mg包封的mrna。
21.在一些实施方案中，每个单独的脂质纳米颗粒包含一种或多种阳离子脂质、一种或多种辅助脂质、一种或多种基于胆固醇的脂质和peg脂质。在一些实施方案中，所述一种或多种阳离子脂质选自由以下所组成的组：c12-200、mc3、dlindma、dlinkc2dma、ckk-e12、ice(基于咪唑)、hgt5000、hgt5001、dodac、ddab、dmrie、dospa、dogs、dodap、dodma和dmdma、dodac、dlendma、dmrie、clindma、cplindma、dmoba、docarbdap、dlindap、dlincarbdap、dlincdap、klin-k-dma、dlin-k-xtc2-dma、hgt4003及其组合。
22.在一些实施方案中，一种或多种非阳离子脂质选自dspc(1,2-二硬脂酰基-sn-甘油-3-磷酸胆碱)、dppc(1,2-二棕榈酰基-sn-甘油-3-磷酸胆碱)、dope(1,2-二油基-sn-甘油-3-磷酸乙醇胺)、dopc(1,2-二油基-sn-甘油-3-磷脂酰胆碱)、dppe(1,2-二棕榈酰基-sn-甘油-3-磷酸乙醇胺)、dmpe(1,2-二肉豆蔻酰基-sn-甘油-3-磷酸乙醇胺)、dopg(,2-二油酰基-sn-甘油-3-磷酸(1'-外消旋-甘油))。
23.在一些实施方案中，一种或多种基于胆固醇的脂质是胆固醇或聚乙二醇化胆固醇。在一些实施方案中，一种或多种经peg修饰的脂质包含共价连接至具有c
6-c
20
长度的烷基链的脂质的长度最高达5kda的聚乙二醇链。
24.在一些实施方案中，本发明用于包封含有一个或多个修饰的核苷酸的mrna。在一些实施方案中，本发明用于包封未修饰的mrna。
25.在下面的详细描述、附图和权利要求中，本发明的其它特征、目的和优点是显而易见的。然而，应当理解，详细描述、附图和权利要求在指示本发明的实施方案时仅以说明而非限制的方式给出。在本发明的范围内的各种改变和修改对于本领域技术人员将是显而易见的。
26.附图简述
27.附图仅用于说明的目的而不是为了限制。
28.图1：示出了利用均质流泵进行的示例性大规模脂质纳米颗粒包封mrna的配制过
程的示意图。
29.图2：描绘了用于脂质纳米颗粒的示例性纯化和缓冲液交换系统。
30.图3：描绘了利用蠕动泵进行的示例性大规模脂质纳米颗粒包封mrna的配制过程的示意图。
31.图4：描绘了用于纯化和缓冲液交换的替代性的示例性切向流过滤系统。
32.图5：描绘了利用蠕动泵进行的示例性大规模脂质纳米颗粒包封mrna的配制过程的替代性示意图。
33.定义
34.为了更容易地理解本发明，首先在下文中定义某些术语。在整个说明书中阐述了以下术语和其它术语的附加定义。
35.大约或约：如本文中所用，术语“大约”或“约”在应用于感兴趣的一个或多个值时是指类似于规定的参考值的值。在某些实施方案中，除非另有说明或另外从上下文中明显看出，否则术语“大约”或“约”是指落在规定参考值的任一方向(大于或小于)的25％、20％、19％、18％、17％、16％、15％、14％、13％、12％、11％、10％、9％、8％、7％、6％、5％、4％、3％、2％、1％或更小范围内的一系列值(除了这样的数值将超过可能值的100％以外)。
36.包封：如本文中所用，术语“包封”或语法等价物是指将单个mrna分子限制在纳米颗粒内的过程。
37.提高、增加或减少：如本文中所用，术语“提高”、“增加”或“减少”或语法等价物指示相对于基线测量(诸如在开始本文所述的治疗前在同一个体中的测量，或在不存在本文所述的治疗的情况下在对照受试者(或多个对照受试者)中的测量)的值。“对照受试者”是患有与所治疗的受试者相同形式的疾病的受试者，其与所治疗的受试者具有大约相同的年龄。
38.杂质：如本文中所用，术语“杂质”是指在有限量的液体、气体或固体内的物质，其不同于目标材料或化合物的化学组成。杂质也被称为污染物。
39.体外：如本文中所用，术语“体外”是指发生在人工环境中(例如，在试管或反应容器中、在细胞培养物中等)，而非多细胞生物体内的事件。
40.体内：如本文中所用，术语“体内”是指发生在多细胞生物体(如人类和非人类动物)中的事件。在基于细胞的系统的情况下，该术语可以用于指发生在活细胞中的事件(而不是例如体外系统)。
41.分离的：如本文中所用，术语“分离的”是指这样的物质和/或实体，它们已经(1)与在最初产生时(无论在自然界中和/或在实验环境中)与其结合的组分的至少一些分离，和/或(2)由人工生产、制备和/或制造。分离的物质和/或实体可以与约10％、约20％、约30％、约40％、约50％、约60％、约70％、约80％、约90％、约91％、约92％、约93％、约94％、约95％、约96％、约97％、约98％、约99％或大于约99％的最初与它们结合的其它组分分离。在一些实施方案中，分离的试剂的纯度为约80％、约85％、约90％、约91％、约92％、约93％、约94％、约95％、约96％、约97％、约98％、约99％或大于约99％。如本文中所用，如果物质大体上不含其它组分，则该物质是“纯的”。如本文中所用，分离的物质和/或实体的百分比纯度的计算不应包括赋形剂(例如，缓冲剂、溶剂、水等)。
42.信使rna(mrna)：如本文中所用，术语“信使rna(mrna)”是指编码至少一种多肽的
多核苷酸。本文所用的mrna包括修饰的和未修饰的rna。mrna可以含有一个或多个编码区和非编码区。
43.核酸：如本文中所用，术语“核酸”在其最广泛的意义上是指并入或可以并入多核苷酸链中的任何化合物和/或物质。在一些实施方案中，核酸是经由磷酸二酯键并入或可以并入多核苷酸链中的化合物和/或物质。在一些实施方案中，“核酸”是指个别核酸残基(例如，核苷酸和/或核苷)。在一些实施方案中，“核酸”是指包含个别核酸残基的多核苷酸链。在一些实施方案中，“核酸”包括rna以及单链和/或双链dna和/或cdna。此外，术语“核酸”、“dna”、“rna”和/或类似术语包括核酸类似物，即不具有磷酸二酯主链的类似物。例如，本领域中已知的且在主链中具有肽键而不是磷酸二酯键的所谓“肽核酸”被认为在本发明的范围内。术语“编码氨基酸序列的核苷酸序列”包括互为彼此的简并形式和/或编码相同氨基酸序列的所有核苷酸序列。编码蛋白质和/或rna的核苷酸序列可以包括内含子。核酸可以从天然来源纯化，使用重组表达系统产生并任选地纯化，化学合成等。在合适的情况下，例如在化学合成分子的情况下，核酸可以包含核苷类似物，例如具有化学修饰的碱基或糖、主链修饰等的类似物。除非另有说明，否则核酸序列是以5’至3’方向呈现。在一些实施方案中，核酸是或包含天然核苷(例如，腺苷，胸苷、鸟苷、胞苷、尿苷、脱氧腺苷、脱氧胸苷、脱氧鸟苷和脱氧胞苷)；核苷类似物(例如，2-氨基腺苷、2-硫代胸苷、肌苷、吡咯并嘧啶、3-甲基腺苷、5-甲基胞苷、c-5丙炔基-胞苷、c-5丙炔基-尿苷、2-氨基腺苷、c5-溴尿苷、c5-氟尿苷、c5-碘尿苷、c5-丙炔基-尿苷、c5-丙炔基-胞苷、c5-甲基胞苷、2-氨基腺苷、7-脱氮腺苷、7-脱氮鸟苷、8-氧代腺苷、8-氧代鸟苷、o(6)-甲基鸟嘌呤和2-硫代胞苷)；化学修饰的碱基；生物修饰的碱基(例如，甲基化碱基)；插入的碱基；修饰的糖(例如，2
’‑
氟核糖、核糖、2
’‑
脱氧核糖、阿拉伯糖和己糖)；和/或修饰的磷酸基团(例如，硫代磷酸酯键和5
’‑
n-亚磷酰胺键)。在一些实施方案中，本发明明确地涉及“未修饰的核酸”，意思是未经化学修饰以促进或实现递送的核酸(例如，多核苷酸和残基，包括核苷酸和/或核苷)。
44.盐：如本文中所用，术语“盐”是指源自或可能源自酸和碱之间的中和反应的离子性化合物。
45.大体上：如本文中所用，术语“大体上”是指表现出全部或接近全部范围或程度的感兴趣的特性或性质的定性条件。生物领域的普通技术人员将理解的是，生物和化学现象几乎从不完全发生和/或进行到完全或实现或避免绝对的结果。因此，本文中使用术语“大体上”来体现许多生物和化学现象中固有的潜在完全性缺乏。
46.产率：如本文中所用，术语“产率”是指在包封后回收的mrna相对于作为起始材料的总mrna的百分比。在一些实施方案中，术语“回收率”可与术语“产率”互换使用。
具体实施方式
47.本发明提供了一种用于脂质纳米颗粒配制和mrna包封的改良方法。在一些实施方案中，本发明提供了一种将信使rna(mrna)包封在脂质纳米颗粒中的方法，其包括混合mrna溶液和脂质溶液的步骤，其中mrna溶液和/或脂质溶液处于大于环境温度的预定温度下。
48.在以下章节中详细描述了本发明的各个方面。章节的使用无意限制本发明。每个章节可以应用于本发明的任何方面。在本技术中，除非另外说明，否则使用“或”意指“和/或”。
49.mrna
50.本发明可以用于包封任何mrna。mrna通常被认为是将来自dna的信息携带至核糖体中的rna类型。mrna的存在通常非常短暂，并且包括加工和翻译，随后降解。通常，在真核生物中，mrna加工包括在n末端(5’端)添加“帽”，以及在c末端(3’端)添加“尾部”。典型的帽是7-甲基鸟苷帽，它是通过5
’‑5’‑
三磷酸酯键连接到第一个转录核苷酸的鸟苷。帽的存在对于提供对大多数真核细胞中发现的核酸酶的抗性是重要的。所述尾部通常是聚腺苷酸化事件，通过该事件将聚腺苷酰基部分添加到mrna分子的3’端。这种“尾部”的存在用于保护mrna免受核酸外切酶降解。信使rna由核糖体翻译成构成蛋白质的一系列氨基酸。
51.mrna可以根据多种已知方法中的任一种来合成。例如，根据本发明的mrna可以经由体外转录(ivt)来合成。简言之，通常利用含有启动子的线性或环状dna模板、三磷酸核糖核苷酸池、可以包括dtt和镁离子的缓冲系统以及合适的rna聚合酶(例如，t3、t7或sp6 rna聚合酶)、dna酶i、焦磷酸酶和/或rna酶抑制剂来进行ivt。确切的条件将根据具体应用而变化。
52.在一些实施方案中，体外合成的mrna可以在配制和包封之前进行纯化以除去非所需的杂质，包括在mrna合成期间使用的各种酶和其它试剂。
53.本发明可以用于配制和包封各种长度的mrna。在一些实施方案中，本发明可以用于配制和包封体外合成的长度为等于或大于约1kb、1.5kb、2kb、2.5kb、3kb、3.5kb、4kb、4.5kb、5kb 6kb、7kb、8kb、9kb、10kb、11kb、12kb、13kb、14kb、15kb或20kb的mrna。在一些实施方案中，本发明可以用于配制和包封体外合成的长度介于约1-20kb、约1-15kb、约1-10kb、约5-20kb、约5-15kb、约5-12kb、约5-10kb、约8-20kb或约8-15kb的范围内的mrna。
54.本发明可以用于配制和包封未修饰的mrna或含有通常增强稳定性的一种或多种修饰的mrna。在一些实施方案中，修饰选自修饰的核苷酸、修饰的糖磷酸主链、5’和/或3’非翻译区。
55.在一些实施方案中，mrna的修饰可以包括rna的核苷酸的修饰。根据本发明的修饰的mrna可以包括例如主链修饰、糖修饰或碱基修饰。在一些实施方案中，mrna可以由以下合成：天然存在的核苷酸和/或核苷酸类似物(修饰的核苷酸)，包括但不限于嘌呤(腺嘌呤(a)、鸟嘌呤(g))或嘧啶(胸腺嘧啶(t)、胞嘧啶c)、尿嘧啶(u))；以及嘌呤和嘧啶的修饰的核苷酸类似物或衍生物，如(例如)1-甲基腺嘌呤、2-甲基腺嘌呤、2-甲硫基-n-6-异戊烯基腺嘌呤、n6-甲基腺嘌呤、n6-异戊烯腺嘌呤、2-硫代胞嘧啶、3-甲基胞嘧啶、4-乙酰胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶、2,6-二氨基嘌呤、1-甲基鸟嘌呤、2-甲基鸟嘌呤、2,2-二甲基鸟嘌呤、7-甲基鸟嘌呤、肌苷、1-甲基肌苷、假尿嘧啶(5-尿嘧啶)、二氢尿嘧啶、2-硫代尿嘧啶、4-硫代尿嘧啶、5-羧甲基氨基甲基-2-硫代尿嘧啶、5-(羧基羟甲基)-尿嘧啶、5-氟-尿嘧啶、5-溴-尿嘧啶、5-羧甲基氨基甲基-尿嘧啶、5-甲基-2-硫代尿嘧啶、5-甲基尿嘧啶、n-尿嘧啶-5-氧基乙酸甲酯、5-甲基氨基甲基尿嘧啶、5-甲氧基氨基甲基-2-硫代尿嘧啶、5'-甲氧羰基甲基尿嘧啶、5-甲氧基尿嘧啶、尿嘧啶-5-氧基乙酸甲酯、尿嘧啶-5-氧基乙酸(v)、1-甲基假尿嘧啶、辫苷、.β.-d-甘露糖基辫苷、怀丁苷(wybutoxosine)和氨基磷酸酯、硫代磷酸酯、肽核苷酸、甲基膦酸酯、7-脱氮鸟苷、5-甲基胞嘧啶和肌苷。本领域技术人员从例如美国专利第4,373,071号、美国专利第4,401,796号、美国专利第4,415,732号、美国专利第4,458,066号、美国专利第4,500,707号、美国专利第4,668,777号、美国专利第4,973,679号、美国专利第5,
047,524号、美国专利第5,132,418号、美国专利第5,153,319号、美国专利第5,262,530号和第5,700,642号了解此类类似物的制备，这些专利的公开内容通过引用全部包括在本文中。
56.通常，mrna合成包括在n末端(5’端)添加“帽”，以及在c末端(3’端)添加“尾部”。帽的存在对于提供对大多数真核细胞中发现的核酸酶的抗性是重要的。“尾部”的存在用于保护mrna免受核酸外切酶降解。
57.因此，在一些实施方案中，mrna包括5’帽结构。5’帽的添加通常如下：首先，rna末端磷酸酶从5’核苷酸去除一个末端磷酸基团，留下两个末端磷酸酯；然后通过鸟苷酰转移酶将三磷酸鸟苷(gtp)添加到末端磷酸酯上，产生5
’5’
5三磷酸酯键；然后通过甲基转移酶使鸟嘌呤的7-氮甲基化。2
’‑
o-甲基化也可以发生在7-甲基鸟苷三磷酸残基之后的第一碱基和/或第二碱基上。帽结构的实例包括但不限于m7gpppnp-rna、m7gpppnmp-rna和m7gpppnmpnmp-rna(其中m指示2
’‑
o甲基残基)。
58.在一些实施方案中，mrna包括5’和/或3’非翻译区。在一些实施方案中，5’非翻译区包括影响mrna的稳定性或翻译的一个或多个元件，例如铁反应元件。在一些实施方案中，5’非翻译区的长度可以介于约50个核苷酸和500个核苷酸之间。
59.在一些实施方案中，3’非翻译区包括下列中的一个或多个：聚腺苷酸化信号、影响mrna在细胞中的位置稳定性的蛋白质的结合位点或mirna的一个或多个结合位点。在一些实施方案中，3’非翻译区的长度可以介于约50个核苷酸和500个核苷酸之间或更长。
60.虽然由体外转录反应提供的mrna在一些实施方案中可以是理想的，但预期了在本发明的范围内的其它来源的mrna，包括由细菌、真菌、植物和/或动物产生的mrna。
61.本发明可以用于配制和包封编码各种蛋白质的mrna。适用于本发明的mrna的非限制性实例包括编码脊髓运动神经元1(smn)、α-半乳糖苷酶(gla)、精氨基琥珀酸合成酶(ass1)、萤火虫荧光素酶、因子ix(fix)、苯丙氨酸羟化酶(pah)和囊性纤维化跨膜传导受体(cftr)的mrna。在实施例部分中详细描述了示例性mrna序列。
62.mrna溶液
63.mrna可以在待与脂质溶液混合的溶液中提供，这样使得mrna可以包封在脂质纳米颗粒中。合适的mrna溶液可以是含有将以各种浓度包封的mrna的任何水溶液。例如，合适的mrna溶液可以含有浓度大于约0.01mg/ml、0.05mg/ml、0.06mg/ml、0.07mg/ml、0.08mg/ml、0.09mg/ml、0.1mg/ml、0.15mg/ml、0.2mg/ml、0.3mg/ml、0.4mg/ml、0.5mg/ml、0.6mg/ml、0.7mg/ml、0.8mg/ml、0.9mg/ml或1.0mg/ml的mrna。在一些实施方案中，合适的mrna溶液可以含有浓度介于约0.01-1.0mg/ml、0.01-0.9mg/ml、0.01-0.8mg/ml、0.01-0.7mg/ml、0.01-0.6mg/ml、0.01-0.5mg/ml、0.01-0.4mg/ml、0.01-0.3mg/ml、0.01-0.2mg/ml、0.01-0.1mg/ml、0.05-1.0mg/ml、0.05-0.9mg/ml、0.05-0.8mg/ml、0.05-0.7mg/ml、0.05-0.6mg/ml、0.05-0.5mg/ml、0.05-0.4mg/ml、0.05-0.3mg/ml、0.05-0.2mg/ml、0.05-0.1mg/ml、0.1-1.0mg/ml、0.2-0.9mg/ml、0.3-0.8mg/ml、0.4-0.7mg/ml或0.5-0.6mg/ml的范围内的mrna。在一些实施方案中，合适的mrna溶液可以含有浓度为至多约5.0mg/ml、4.0mg/ml、3.0mg/ml、2.0mg/ml、1.0mg/ml、.09mg/ml、0.08mg/ml、0.07mg/ml、0.06mg/ml或0.05mg/ml的mrna。
64.通常，合适的mrna溶液还可以含有缓冲剂和/或盐。通常，缓冲剂可以包括hepes、硫酸铵、碳酸氢钠、柠檬酸钠、乙酸钠、磷酸钾和磷酸钠。在一些实施方案中，缓冲剂的合适浓度可以介于约0.1mm至100mm、0.5mm至90mm、1.0mm至80mm、2mm至70mm、3mm至60mm、4mm至
50mm、5mm至40mm、6mm至30mm、7mm至20mm、8mm至15mm或9至12mm的范围内。在一些实施方案中，缓冲剂的合适浓度等于或大于0.1mm、0.5mm、1mm、2mm、4mm、6mm、8mm、10mm、15mm、20mm、25mm、30mm、35mm、40mm、45mm或50mm。
65.示例性盐可以包括氯化钠、氯化镁和氯化钾。在一些实施方案中，mrna溶液中的合适的盐浓度可以介于约1mm至500mm、5mm至400mm、10mm至350mm、15mm至300mm、20mm至250mm、30mm至200mm、40mm至190mm、50mm至180mm、50mm至170mm、50mm至160mm、50mm至150mm或50mm至100mm的范围内。合适的mrna溶液中的盐浓度为等于或大于约1mm、5mm、10mm、20mm、30mm、40mm、50mm、60mm、70mm、80mm、90mm或100mm。
66.在一些实施方案中，合适的mrna溶液可以具有在约3.5-6.5、3.5-6.0、3.5-5.5.、3.5-5.0、3.5-4.5、4.0-5.5、4.0-5.0、4.0-4.9、4.0-4.8、4.0-4.7、4.0-4.6或4.0-4.5的范围内的ph。在一些实施方案中，合适的mrna溶液可以具有不大于约3.5、4.0、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5.0、5.2、5.4、5.6、5.8、6.0、6.1、6.3和6.5的ph。
67.可以使用各种方法来制备适用于本发明的mrna溶液。在一些实施方案中，mrna可以直接溶解于本文所述的缓冲溶液中。在一些实施方案中，mrna溶液可以通过在与用于包封的脂质溶液混合之前混合mrna储备溶液和缓冲溶液来产生。在一些实施方案中，mrna溶液可以通过在与用于包封的脂质溶液混合前即刻混合mrna储备溶液和缓冲溶液来产生。在一些实施方案中，合适的mrna储备溶液可以含有在水中的浓度为等于或大于约0.2mg/ml、0.4mg/ml、0.5mg/ml、0.6mg/ml、0.8mg/ml、1.0mg/ml、1.2mg/ml、1.4mg/ml、1.5mg/ml或1.6mg/ml、2.0mg/ml、2.5mg/ml、3.0mg/ml、3.5mg/ml、4.0mg/ml、4.5mg/ml或5.0mg/ml的mrna。
68.在一些实施方案中，使用泵混合mrna储备溶液与缓冲溶液。示例性泵包括但不限于齿轮泵、蠕动泵和离心泵。
69.通常，缓冲溶液的混合速率大于mrna储备溶液的混合速率。例如，缓冲溶液可以在比mrna储备溶液的速率高至少1倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、15倍或20倍的速率下混合。在一些实施方案中，在介于约100-6000ml/分钟(例如，约100-300ml/分钟、300-600ml/分钟、600-1200ml/分钟、1200-2400ml/分钟、2400-3600ml/分钟、3600-4800ml/分钟、4800-6000ml/分钟或60-420ml/分钟)的范围内的流速下混合缓冲溶液。在一些实施方案中，在等于或大于约60ml/分钟、100ml/分钟、140ml/分钟、180ml/分钟、220ml/分钟、260ml/分钟、300ml/分钟、340ml/分钟、380ml/分钟、420ml/分钟、480ml/分钟、540ml/分钟、600ml/分钟、1200ml/分钟、2400ml/分钟、3600ml/分钟、4800ml/分钟或6000ml/分钟的流速下混合缓冲溶液。
70.在一些实施方案中，在介于约10-600ml/分钟(例如，约5-50ml/分钟、约10-30ml/分钟、约30-60ml/分钟、约60-120ml/分钟、约120-240ml/分钟、约240-360ml/分钟、约360-480ml/分钟或约480-600ml/分钟)的范围内的流速下混合mrna储备溶液。在一些实施方案中，在等于或大于约5ml/分钟、10ml/分钟、15ml/分钟、20ml/分钟、25ml/分钟、30ml/分钟、35ml/分钟、40ml/分钟、45ml/分钟、50ml/分钟、60ml/分钟、80ml/分钟、100ml/分钟、200ml/分钟、300ml/分钟、400ml/分钟、500ml/分钟或600ml/分钟的流速下混合mrna储备溶液。
71.脂质溶液
72.根据本发明，脂质溶液含有适于形成用于包封mrna的脂质纳米颗粒的脂质的混合
物。在一些实施方案中，合适的脂质溶液是基于乙醇的。例如，合适的脂质溶液可以含有溶解在无水乙醇(即，100％乙醇)中的所需脂质的混合物。在另一个实施方案中，合适的脂质溶液是基于异丙醇的。在另一个实施方案中，合适的脂质溶液是基于二甲亚砜的。在另一个实施方案中，合适的脂质溶液是合适的溶剂(包括但不限于乙醇、异丙醇和二甲亚砜)的混合物。
73.合适的脂质溶液可以含有不同浓度的所需脂质的混合物。例如，合适的脂质溶液可以含有总浓度等于或大于约0.1mg/ml、0.5mg/ml、1.0mg/ml、2.0mg/ml、3.0mg/ml、4.0mg/ml、5.0mg/ml、6.0mg/ml、7.0mg/ml、8.0mg/ml、9.0mg/ml、10mg/ml、15mg/ml、20mg/ml、30mg/ml、40mg/ml、50mg/ml或100mg/ml的所需脂质的混合物。在一些实施方案中，合适的脂质溶液可以含有总浓度介于约0.1-100mg/ml、0.5-90mg/ml、1.0-80mg/ml、1.0-70mg/ml、1.0-60mg/ml、1.0-50mg/ml、1.0-40mg/ml、1.0-30mg/ml、1.0-20mg/ml、1.0-15mg/ml、1.0-10mg/ml、1.0-9mg/ml、1.0-8mg/ml、1.0-7mg/ml、1.0-6mg/ml或1.0-5mg/ml的范围内的所需脂质的混合物。在一些实施方案中，合适的脂质溶液可以含有总浓度为至多约100mg/ml、90mg/ml、80mg/ml、70mg/ml、60mg/ml、50mg/ml、40mg/ml、30mg/ml、20mg/ml或10mg/ml的所需脂质的混合物。
74.任何所需脂质可以以适于包封mrna的任何比率混合。在一些实施方案中，合适的脂质溶液含有包括阳离子脂质、辅助脂质(例如，非阳离子脂质和/或胆固醇脂质)和/或聚乙二醇化脂质的所需脂质的混合物。在一些实施方案中，合适的脂质溶液含有包括一种或多种阳离子脂质、一种或多种辅助脂质(例如，非阳离子脂质和/或胆固醇脂质)和一种或多种聚乙二醇化脂质的所需脂质的混合物。
75.阳离子脂质
76.如本文中所使用，短语“阳离子脂质”是指在选定的ph(如生理ph)下具有净正电荷的多个脂质物种中的任一个。在文献中已经描述了几种阳离子脂质，其中许多是市售的。特别合适在本发明的组合物和方法中使用的阳离子脂质包括在国际专利公开wo 2010/053572(并且具体地说，在段落[00225]处描述的c12-200)和wo 2012/170930中描述的阳离子脂质，这两个文献均通过引用并入本文中。在某些实施方案中，适用于本发明的组合物和方法的阳离子脂质包括描述于2012年3月29日提交的美国临时专利申请61/617,468(通过引用并入本文)中的可电离阳离子脂质，如例如(15z,18z)-n,n-二甲基-6-(9z,12z)-十八碳-9,12-二烯-1-基)二十四碳-15,18-二烯-1-胺(hgt5000)、(15z,18z)-n,n-二甲基-6-((9z,12z)-十八碳-9,12-二烯-1-基)二十四碳-4,15,18-三烯-1-胺(hgt5001)和(15z,18z)-n,n-二甲基-6-((9z,12z)-十八碳-9,12-二烯-1-基)二十四碳-5,15,18-三烯-1-胺(hgt5002)。
[0077]
在一些实施方案中，适用于本发明的组合物和方法的阳离子脂质包括描述于wo 2013063468和标题为“lipidformulations for delivery of messenger rna”的美国临时申请中的阳离子脂质，这两个文献均通过引用并入本文中。在一些实施方案中，阳离子脂质包含式i-c1-a的化合物：
[0078][0079]
或其药学上可接受的盐，其中：
[0080]
每个r2独立地为氢或c
1-3
烷基；
[0081]
每个q独立地为2至6；
[0082]
每个r'独立地为氢或c
1-3
烷基；
[0083]
且每个r
l
独立地为c
8-12
烷基。
[0084]
在一些实施方案中，每个r2独立地为氢、甲基或乙基。在一些实施方案中，每个r2独立地为氢或甲基。在一些实施方案中，每个r2为氢。
[0085]
在一些实施方案中，每个q独立地为3至6。在一些实施方案中，每个q独立地为3至5。在一些实施方案中，每个q为4。
[0086]
在一些实施方案中，每个r'独立地为氢、甲基或乙基。在一些实施方案中，每个r'独立地为氢或甲基。在一些实施方案中，每个r'独立地为氢。
[0087]
在一些实施方案中，每个r
l
独立地为c
8-12
烷基。在一些实施方案中，每个r
l
独立地为正c
8-12
烷基。在一些实施方案中，每个r
l
独立地为c
9-11
烷基。在一些实施方案中，每个r
l
独立地为正c
9-11
烷基。在一些实施方案中，每个r
l
独立地为c
10
烷基。在一些实施方案中，每个r
l
独立地为正c
10
烷基。
[0088]
在一些实施方案中，每个r2独立地为氢或甲基；每个q独立地为3至5；每个r'独立地为氢或甲基；且每个r
l
独立地为c
8-12
烷基。
[0089]
在一些实施方案中，每个r2为氢；每个q独立地为3至5；每个r'为氢；且每个r
l
独立地为c
8-12
烷基。
[0090]
在一些实施方案中，每个r2为氢；每个q为4；每个r'为氢；且每个r
l
独立地为c
8-12
烷基。
[0091]
在一些实施方案中，阳离子脂质包含式i-g的化合物：
(l,2-二肉豆蔻基丙-3-基)-n,n-二甲基-n-羟乙基溴化铵或"dmrie"、3-二甲氨基-2-(胆甾-5-烯基-3-β-氧基丁-4-氧基)-l-(顺式,顺式-9,12-十八碳二烯氧基)丙烷或"clindma"、2-[5'-(胆甾-5-烯基-3-β-氧基)-3'-氧杂戊氧基)-3-二甲基-l-(顺式,顺式-9',l-2'-十八碳二烯氧基)丙烷或"cplindma"、n,n-二甲基-3,4-二油基氧基苄胺或"dmoba"、1,2-n,n'-二油基氨甲酰基-3-二甲基氨基丙烷或"docarbdap"、2,3-二亚油酰基氧基-ν,ν-二甲基丙胺或"dlindap"、l,2-n,n'-二亚油基氨甲酰基-3-二甲基氨基丙烷或"dlincarbdap"、l,2-二亚油酰基氨甲酰基-3-二甲基氨基丙烷或"dlincdap"、2,2-二亚油基-4-二甲氨基甲基-[l,3]-二氧戊环或"dlin
‑‑
dma"、2,2-二亚油基-4-二甲氨基乙基-[l,3]-二氧戊环或"dlin-k-xtc2-dma"以及2-(2,2-二((9z,12z)-十八碳-9,l2-二烯-1-基)-l,3-二氧戊环-4-基)-n,n-二甲基乙胺(dlin-kc2-dma))(参见wo2010/042877；semple等人，nature biotech.28:172-176(2010))，或其混合物(heyes,j.等人，j controlled release 107:276-287(2005)；morrissey,dv.等人，nat.biotechnol.23(8):1003-1007(2005)；pct公开wo2005/121348a1)。在一些实施方案中，所述阳离子脂质中的一种或多种包含咪唑、二烷基氨基或胍鎓部分中的至少一个。
[0098]
在一些实施方案中，一种或多种阳离子脂质可以选自xtc(2,2-二亚油基-4-二甲氨基乙基-[1,3]-二氧戊环)、mc3(((6z,9z,28z,31z)-三十七碳-6,9,28,31-四烯-19-基4-(二甲氨基)丁酸酯)、alny-100((3ar,5s,6as)-n,n-二甲基-2,2-二((9z,12z)-十八碳-9,12-二烯基)四氢-3ah-环戊烷并[d][1,3]二氧戊环-5-胺))、nc98-5(4,7,13-三(3-氧代-3-(十一烷基氨基)丙基)-n1,n16-二-十一烷基-4,7,10,13-四氮杂十六烷-1,16-二酰胺)、dodap(1,2-二油基-3-二甲基铵丙烷)、hgt4003(wo 2012/170889，其教导内容通过引用全部并入本文中)、ice(wo2011/068810，其教导内容通过引用全部并入本文中)、hgt5000(美国临时专利申请第61/617,468号，其教导内容通过引用全部并入本文中)或hgt5001(顺式或反式)(临时专利申请第61/617,468号)、氨基醇类脂如wo2010/053572中公开的那些、dotap(1,2-二油基-3-三甲基铵丙烷)、dotma(1,2-二-o-十八碳烯基-3-三甲基铵丙烷)、dlindma(heyes,j.；palmer,l.；bremner,k.；maclachlan,i.“cationic lipid saturation influences intracellular delivery of encapsulated nucleic acids”j.contr.rel.2005,107,276-287)、dlin-kc2-dma(semple,s.c.等人“rational design of cationic lipids for sirna delivery”nature biotech.2010,28,172-176)、c12-200(love,k.t.等人“lipid-like materials for low-dose in vivo gene silencing”pnas 2010,107,1864-1869)。
[0099]
在一些实施方案中，阳离子脂质按重量计或按摩尔计在合适的脂质溶液中构成总脂质的至少约5％、10％、20％、30％、35％、40％、45％、50％、55％、60％、65％或70％。在一些实施方案中，阳离子脂质按重量计或按摩尔计构成总脂质混合物的约30-70％(例如，约30-65％、约30-60％、约30-55％、约30-50％、约30-45％、约30-40％、约35-50％、约35-45％或约35-40％)。
[0100]
非阳离子/辅助脂质
[0101]
如本文中所使用，短语“非阳离子脂质”是指任何中性、两性离子或阴离子脂质。如本文中所使用，短语“阴离子脂质”是指在选定的h(如生理ph)下携带净负电荷的多个脂质物种中的任一个。非阳离子脂质包括但不限于：二硬脂酰磷脂酰胆碱(dspc)、二油酰基磷脂
酰胆碱(dopc)、二棕榈酰磷脂酰胆碱(dppc)、二油酰基磷脂酰甘油(dopg)、二棕榈酰磷脂酰甘油(dppg)、二油酰基磷脂酰乙醇胺(dope)、棕榈酰油酰基磷脂酰胆碱(popc)、棕榈酰油酰基-磷脂酰乙醇胺(pope)、二油酰基-磷脂酰乙醇胺4-(n-马来酰亚胺甲基)-环己烷-l-羧酸酯(dope-mal)、二棕榈酰磷脂酰乙醇胺(dppe)、二肉豆蔻酰磷酸乙醇胺(dmpe)、二硬脂酰基-磷脂酰基-乙醇胺(dspe)、16-o-单甲基pe、16-o-二甲基pe、18-1-反式pe、l-硬脂酰基-2-油酰基-磷脂酰乙醇胺(sope)或其混合物。
[0102]
在一些实施方案中，非阳离子脂质按重量计或按摩尔计在合适的脂质溶液中可以构成总脂质的至少约5％、10％、15％、20％、25％、30％、35％、40％、45％、50％、55％、60％、65％或70％。在一些实施方案中，非阳离子脂质按重量计或按摩尔计在合适的脂质溶液中构成总脂质的约30-50％(例如，约30-45％、约30-40％、约35-50％、约35-45％或约35-40％)。
[0103]
基于胆固醇的脂质
[0104]
在一些实施方案中，合适的脂质溶液包括一种或多种基于胆固醇的脂质。例如，合适的基于胆固醇的阳离子脂质包括例如dc-choi(n,n-二甲基-n-乙基甲酰胺胆固醇)、l,4-双(3-n-油基氨基-丙基)哌嗪(gao等人biochem.biophys.res.comm.179,280(1991)；wolf等人biotechniques 23,139(1997)；美国专利第5,744,335号)或ice。在一些实施方案中，基于胆固醇的脂质按重量计或按摩尔计在合适的脂质溶液中构成总脂质的至少约5％、10％、20％、30％、40％、50％、60％或70％。在一些实施方案中，基于胆固醇的脂质按重量计或按摩尔计在合适的脂质溶液中构成总脂质的约30-50％(例如，约30-45％、约30-40％、约35-50％、约35-45％或约35-40％)。
[0105]
聚乙二醇化脂质
[0106]
在一些实施方案中，合适的脂质溶液包括一种或多种聚乙二醇化脂质。例如，本发明还预期了使用经聚乙二醇(peg)修饰的磷脂和衍生的脂质，如衍生的神经酰胺(peg-cer)，包括n-辛酰基-鞘氨醇-l-[琥珀酰(甲氧基聚乙二醇)-2000](c8 peg-2000神经酰胺)。预期的经peg修饰的脂质包括但不限于共价连接至具有c
6-c
20
长度的烷基链的脂质的长度最高达5kda的聚乙二醇链。在一些实施方案中，经peg修饰的或聚乙二醇化脂质是聚乙二醇化胆固醇或peg-2k。在一些实施方案中，特别有用的可交换脂质是具有较短酰基链(例如，c
14
或c
18
)的peg-神经酰胺。
[0107]
经peg修饰的磷脂和衍生的脂质按重量计或按摩尔计在合适的脂质溶液中可以构成总脂质的至少约5％、10％、20％、30％、40％、50％、60％或70％。在一些实施方案中，聚乙二醇化脂质脂质按重量计或按摩尔计在合适的脂质溶液中构成总脂质的约30-50％(例如，约30-45％、约30-40％、约35-50％、约35-45％或约35-40％)。
[0108]
阳离子脂质、非阳离子脂质、基于胆固醇的脂质和经peg修饰的脂质的示例性组合描述于实施例部分中。例如，合适的脂质溶液可以含有ckk-e12、dope、chol和dmg-peg2k；c12-200、dope、胆固醇和dmg-peg2k；hgt5000、dope、chol和dmg-peg2k；hgt5001、dope、chol和dmg-peg2k；ckk-e12、dppc、chol和dmg-peg2k；c12-200、dppc、胆固醇和dmg-peg2k；hgt5000、dppc、chol和dmg-peg2k；或hgt5001、dppc、chol和dmg-peg2k。组成脂质混合物的阳离子脂质、非阳离子脂质和/或经peg修饰的脂质的选择以及此类脂质相对于彼此的摩尔比是基于所选脂质的特性及待包封的mrna的性质和特性。额外的考虑因素包括例如烷基链
的饱和度，以及所选脂质的大小、电荷、ph、pka、融合性和毒性。因此，可以相应地调整摩尔比。
[0109]
混合过程
[0110]
本发明是基于温度对mrna包封效率和回收率的出乎意料的影响的发现。因此，在一些实施方案中，本发明提供了一种通过混合本文所述的mrna溶液和脂质溶液将信使rna(mrna)包封在脂质纳米颗粒中的方法，其中将mrna溶液和/或脂质溶液加热至大于环境温度的预定温度。如本文中所用，术语“环境温度”是指室内的温度或在没有加热或冷却的情况下包围感兴趣的物体(例如，mrna溶液或脂质溶液)的温度。在一些实施方案中，环境温度是指介于约20-25℃的范围内的温度。
[0111]
因此，大于环境温度的预定温度通常大于约25℃。在一些实施方案中，适用于本发明的预定温度为等于或大于约30℃、37℃、40℃、45℃、50℃、55℃、60℃、65℃或70℃。在一些实施方案中，适用于本发明的预定温度介于约25-70℃、约30-70℃、约35-70℃、约40-70℃、约45-70℃、约50-70℃或约60-70℃的范围内。在特定实施方案中，适用于本发明的预定温度为约65℃。
[0112]
可以在混合之前将mrna溶液或脂质溶液或二者加热至高于环境温度的预定温度。在一些实施方案中，mrna溶液和脂质溶液在混合前分别被加热至预定温度。在一些实施方案中，mrna溶液和脂质溶液在环境温度下混合，但在混合后被加热至预定温度。在一些实施方案中，将脂质溶液加热至预定温度，并与环境温度下的mrna溶液混合。在一些实施方案中，将mrna溶液加热至预定温度，并与环境温度下的脂质溶液混合。
[0113]
在一些实施方案中，通过将环境温度下的mrna储备溶液添加到加热的缓冲溶液中以实现所需的预定温度而将mrna溶液加热至预定温度。
[0114]
可以使用泵混合mrna溶液和脂质溶液。因为包封程序能够在广泛的规模下进行，所以可以使用不同类型的泵以适应所需的规模。然而，通常希望使用无脉流泵。如本文中所用，无脉流泵是指可以建立具有稳定流速的连续流的任何泵。合适的泵的类型可以包括但不限于齿轮泵和离心泵。示例性齿轮泵包括但不限于cole-parmer或diener齿轮泵。示例性离心泵包括但不限于由grainger或cole-parmer制造的离心泵。
[0115]
可以在各种流速下混合mrna溶液和脂质溶液。通常，mrna溶液的混合速率可以大于脂质溶液的混合速率。例如，mrna溶液可以在比脂质溶液的速率高至少1倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、15倍或20倍的速率下混合。
[0116]
用于混合的合适流速可以根据规模来确定。在一些实施方案中，在介于约40-400ml/分钟、60-500ml/分钟、70-600ml/分钟、80-700ml/分钟、90-800ml/分钟、100-900ml/分钟、110-1000ml/分钟、120-1100ml/分钟、130-1200ml/分钟、140-1300ml/分钟、150-1400ml/分钟、160-1500ml/分钟、170-1600ml/分钟、180-1700ml/分钟、150-250ml/分钟、250-500ml/分钟、500-1000ml/分钟、1000-2000ml/分钟、2000-3000ml/分钟、3000-4000ml/分钟或4000-5000ml/分钟的范围内的流速下混合mrna溶液。在一些实施方案中，在约200ml/分钟、约500ml/分钟、约1000ml/分钟、约2000ml/分钟、约3000ml/分钟、约4000ml/分钟或约5000ml/分钟的流速下混合mrna溶液。
[0117]
在一些实施方案中，在介于约25-75ml/分钟、20-50ml/分钟、25-75ml/分钟、30-90ml/分钟、40-100ml/分钟、50-110ml/分钟、75-200ml/分钟、200-350ml/分钟、350-500ml/
分钟、500-650ml/分钟、650-850ml/分钟或850-1000ml/分钟的范围内的流速下混合脂质溶液。在一些实施方案中，在约50ml/分钟、约100ml/分钟、约150ml/分钟、约200ml/分钟、约250ml/分钟、约300ml/分钟、约350ml/分钟、约400ml/分钟、约450ml/分钟、约500ml/分钟、约550ml/分钟、约600ml/分钟、约650ml/分钟、约700ml/分钟、约750ml/分钟、约800ml/分钟、约850ml/分钟、约900ml/分钟、约950ml/分钟或约1000ml/分钟的流速下混合脂质溶液。
[0118]
通常，将mrna溶液和脂质溶液混合成溶液，以使得所述脂质可以形成包封mrna的纳米颗粒。这种溶液也被称为配制或包封溶液。合适的配制或包封溶液可以基于溶剂如乙醇。例如，合适的配制或包封溶液可以基于约10％乙醇、约15％乙醇、约20％乙醇、约25％乙醇、约30％乙醇、约35％乙醇或约40％乙醇。
[0119]
合适的配制或包封溶液可以基于溶剂如异丙醇。例如，合适的配制或包封溶液可以基于约10％异丙醇、约15％异丙醇、约20％异丙醇、约25％异丙醇、约30％异丙醇、约35％异丙醇或约40％异丙醇。
[0120]
合适的配制或包封溶液可以基于溶剂如二甲亚砜。例如，合适的配制或包封溶液可以基于约10％二甲亚砜、约15％二甲亚砜、约20％二甲亚砜、约25％二甲亚砜、约30％二甲亚砜、约35％二甲亚砜或约40％二甲亚砜。
[0121]
合适的配制或包封溶液还可以含有缓冲剂或盐。示例性缓冲剂可以包括hepes、硫酸铵、碳酸氢钠、柠檬酸钠、乙酸钠、磷酸钾和磷酸钠。示例性盐可以包括氯化钠、氯化镁和氯化钾。
[0122]
纯化
[0123]
通常，在配制和包封后，将脂质纳米颗粒纯化和/或浓缩。可以使用各种纯化方法。在一些实施方案中，使用切向流过滤纯化脂质纳米颗粒。切向流过滤(tff)，也称为交叉流过滤，是其中待过滤的材料切向地穿过过滤器，而不是通过该过滤器的过滤类型。在tff中，非所需的渗透物通过过滤器，而所需的滞留物沿过滤器前行并在下游被收集。重要的是要注意，所需的材料通常包含在tff的滞留物中，这与通常在传统死端过滤种遇到的情况相反。
[0124]
根据待过滤的材料，tff通常用于微滤或超滤。微滤通常被定义为其中过滤器具有0.05μm和1.0μm之间(包括0.05μm和1.0μm)的孔径的情况，而超滤通常涉及具有小于0.05μm的孔径的过滤器。孔径还确定了特定过滤器的标称分子量限值(nmwl)，也被称为截留分子量(mwco)，其中微滤膜通常具有大于1,000千道尔顿(kda)的nmwl且超滤过滤器具有1kda和1,000kda之间的nmwl。
[0125]
切向流过滤的主要优点在于：在传统的“死端”过滤期间可能聚集在过滤器中并堵塞过滤器的非渗透性颗粒(有时称为“滤饼”)相反沿着所述过滤器的表面前行。这个优点允许切向流过滤被广泛地用于需要连续操作的工业过程中，因为过滤器一般不需要被移除和清洗，所以停工时间显著减少。
[0126]
切向流过滤可以用于几种目的，包括浓缩和渗滤等。浓缩是从溶液中除去溶剂而保留溶质分子的过程。为了有效地浓缩样品，使用具有大大低于待保留的溶质分子的分子量的nmwl或mwco的膜。通常，技术人员可以选择具有比目标分子的分子量低三至六倍的nmwl或mwco的过滤器。
[0127]
渗滤是一个分馏过程，由此非所需的小颗粒通过过滤器，而较大的所需纳米颗粒
十八碳烯基-3-三甲基铵丙烷)、dlindma(heyes,j.、palmer,l.、bremner,k.、maclachlan,i.“cationic lipid saturation influences intracellular delivery of encapsulated nucleic acids”j.contr.rel.2005,107,276-287)、dlin-kc2-dma(semple,s.c.等人“rational design of cationic lipids for sirna delivery”nature biotech.2010,28,172-176)、c12-200(love,k.t.等人“lipid-like materials for low-dose in vivo gene silencing”pnas 2010,107,1864-1869)、ckk-e12(3,6-双(4-(双(2-羟基十二烷基)氨基)丁基)哌嗪-2,5-二酮)、hgt5000、hgt5001、hgt4003、ice、二烷基氨基型、咪唑型、胍型等。辅助脂质可以包括但不限于dspc(1,2-二硬脂酰基-sn-甘油-3-磷酸胆碱)、dppc(1,2-二棕榈酰基-sn-甘油-3-磷酸胆碱)、dope(1,2-二油基-sn-甘油-3-磷酸乙醇胺)、dopc(1,2-二油基-sn-甘油-3-磷脂酰胆碱)、dppe(1,2-二棕榈酰基-sn-甘油-3-磷酸乙醇胺)、dmpe(1,2-二肉豆蔻酰基-sn-甘油-3-磷酸乙醇胺)、dopg(,2-二油酰基-sn-甘油-3-磷酸(1'-外消旋-甘油))、胆固醇等。聚乙二醇化脂质可以包括但不限于共价连接至具有c6-c20长度的烷基链的脂质的长度最高达5kda的聚乙二醇链。
[0142]
信使rna材料
[0143]
密码子优化的人类脊髓运动神经元1(smn)信使rna、精氨基琥珀酸合成酶(ass1)信使rna、修饰的囊性纤维化跨膜传导调节子(cftr，25％假尿苷，25％5-甲基胞苷)信使rna、萤火虫荧光素酶(ffl)信使rna、因子ix(fix)信使rna、苯丙氨酸羟化酶(pah)信使rna和α-半乳糖苷酶(gla)信使rna是通过从编码所述基因的质粒dna模板进行体外转录，随后添加5’帽结构(帽1)(fechter,p.；brownlee,g.g.“recognition of mrna cap structures by viral and cellular proteins”j.gen.virology 2005,86,1239-1249)和长度为约250个核苷酸(如通过凝胶电泳法所测定)的3’聚(a)尾部而合成。存在于每种mrna产物中的5’和3’非翻译区分别表示为x和y，并且定义如下所规定(参见下文)。
[0144]
密码子优化的人类脊髓运动神经元1(smn)mrna：
[0145][0146]
人类α-半乳糖苷酶(gla)mrna：
[0147][0148]
密码子优化的人类精氨基琥珀酸合成酶(ass1)mrna：
[0149][0150]
密码子优化的萤火虫荧光素酶mrna：
[0151][0152]
人类因子ix(fix)mrna：
[0153][0154]
密码子优化的人类苯丙氨酸羟化酶(pah)mrna：
[0155][0156]
密码子优化的囊性纤维化跨膜传导调节子(cftr)mrna：
[0157]
[0158][0159]5’
和3’utr序列
[0160]
脂质纳米颗粒制剂
[0161]
制备报告体积的脂质(阳离子脂质、辅助脂质、两性离子脂质、peg脂质等)的混合物的乙醇溶液，并加热到选定温度。另外，从1mg/ml储备溶液制备mrna的水性缓冲溶液(10mm柠檬酸盐/150mmnacl，ph 4.5)，并加热到选定温度5-10分钟。
[0162]
对于小规模制剂来说，使用注射泵(3.71ml/秒)将脂质溶液迅速注入到水性mrna溶液中，并振荡所得悬浮液以得到脂质纳米颗粒的20％乙醇溶液。用1
×
pbs(ph 7.4)渗滤所得纳米颗粒悬浮液，浓缩，并储存于2-8℃下
[0163]
25℃下的代表性实施例
[0164]
混合ckk-e12、dope、chol和dmg-peg2k的50mg/ml乙醇溶液的等分试样并用乙醇稀释到3ml最终体积。另外，从1mg/ml储备溶液制备ffl mrna的水性缓冲溶液(10mm柠檬酸盐/150mm nacl，ph 4.5)。将脂质溶液迅速注入到水性mrna溶液中，并振荡以得到最终的20％乙醇悬浮液。过滤所得纳米颗粒悬浮液，用1
×
pbs(ph 7.4)渗滤，浓缩，并储存于2-8℃下。最终浓度＝0.20mg/ml ffl mrna(包封)。z
ave
＝91nm pdi(0.16)。
[0165]
37℃下的配制
[0166]
混合ckk-e12、dope、chol和dmg-peg2k的50mg/ml乙醇溶液的等分试样并用乙醇稀释到3ml最终体积。另外，从1mg/ml储备溶液制备fix mrna的水性缓冲溶液(10mm柠檬酸盐/150mm nacl，ph 4.5)。将脂质溶液迅速注入到水性mrna溶液中，并振荡以得到最终的20％乙醇悬浮液。过滤所得纳米颗粒悬浮液，用1
×
pbs(ph 7.4)渗滤，浓缩，并储存于2-8℃下。最终浓度＝0.20mg/ml fix mrna(包封)。z
ave
＝64nm；pdi(0.12)。
[0167]
65℃下的配制
[0168]
混合ckk-e12、dope、chol和dmg-peg2k的50mg/ml乙醇溶液的等分试样并用乙醇稀释到3ml最终体积。另外，从1mg/ml储备溶液制备fix mrna的水性缓冲溶液(10mm柠檬酸盐/150mm nacl，ph 4.5)。将脂质溶液迅速注入到水性mrna溶液中，并振荡以得到最终的20％乙醇悬浮液。过滤所得纳米颗粒悬浮液，用1
×
pbs(ph 7.4)渗滤，浓缩，并储存于2-8℃下。最终浓度＝0.20mg/ml fix mrna(包封)。z
ave
＝73nm；pdi(0.13)。
[0169]
温度对纳米颗粒包封过程的影响
[0170]
乙醇脂质溶液和mrna的水性缓冲溶液(10mm柠檬酸盐/150mm nacl，ph4.5)在配制过程前均在不同的选定温度下加热，以确定温度对制剂的最终产率和包封效率的影响。
[0171]
针对大小、大小分散度、包封效率和产率(或回收率)评价温度对纳米颗粒包封过程的影响。示例性数据显示在表1中。可以看到，温度升高(例如，高于环境温度)的结果是增加的包封效率和/或产率/回收率，以及减小的粒度和/或大小分散度。
[0172]
表1.温度对纳米颗粒形成和mrna包封的影响
[0173][0174][0175]
实施例2.大规模配制过程
[0176]
此实施例说明用于在升高的温度下包封mrna的示例性大规模配制过程。
[0177]
示例性的大规模配制过程示于图1中。使用ismatec可编程数字驱动泵(cole parmer model#cp 78008-10)。使用micropump a卡口吸入靴泵头316ss主体/石墨齿轮/ptfe密封件，0.084ml/转(无内部旁路)(cole parmer型号07002-27)和pharma pure管路尺寸14，0.06"id，1/16"(spectrum labs零件号actu-p14-25n)。
[0178]
mrna的纳米颗粒配制和包封是通过使用
‘
t’接头(或“y”接头)在柠檬酸盐缓冲液(10mm柠檬酸盐缓冲液，150mm nacl，ph 4.5)中混合乙醇脂质溶液和mrna来准备。在柠檬酸盐缓冲液中的mrna和在乙醇溶液中的脂质的示例性流速分别为200ml/分钟和50ml/分钟。在此过程中，同时启动两个泵。制剂的起始和末尾部分均被丢弃，只有中间制剂被收集。精确的流速和无脉流是这个过程的两个重要参数。
[0179]
纯化和缓冲液交换
[0180]
从上述步骤得到的制剂的纯化和缓冲液交换是利用来自spectrum labs的research iii切向流过滤系统，使用改性聚醚砜中空纤维过滤器模块进行。用6倍体积的无菌pbs(ph 7.4)以连续渗滤形式进行缓冲液交换。参见图2。分析制剂的大小(pdi)和包封(产率)。示例性数据呈现在表2中。
[0181]
表2.大规模配制的实例
[0182]
[0183][0184]
使用这种方法，实现了极窄的粒度范围以及高包封效率(例如，》90％的平均值)。
[0185]
为了测试无脉均质流的重要性，将具有一定程度的脉动流的蠕动泵用于所述配制过程。参见图3。在柠檬酸盐缓冲液中的mrna和在无水乙醇中的脂质分别在200ml/分钟和50ml/分钟的流速下混合。示例性结果显示在表3中。可以看到，在此过程中使用蠕动泵产生具有较大尺寸的纳米颗粒的制剂。这可能是由于由脉动流所引起的非均匀混合。
[0186]
表3.使用蠕动泵配制的实例
[0187][0188][0189]
等效物和范围
[0190]
本领域技术人员仅利用常规实验就将认识到或能够确定本文所描述的本发明的具体实施方案的许多等效物。本发明的范围无意受以上描述的限制，而是如以下权利要求中所阐述。