一种基因组电子酶切所得序列标签的存储方法及系统与流程

文档序号:37337184发布日期:2024-03-18 18:03阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种基因组电子酶切所得序列标签的存储方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的一种基因组电子酶切所得序列标签的存储方法,其特征在于,还包括以下步骤:

3.根据权利要求2所述的一种基因组电子酶切所得序列标签的存储方法,其特征在于:

4.根据权利要求1所述的一种基因组电子酶切所得序列标签的存储方法,其特征在于,还包括以下步骤:

5.根据权利要求1所述的一种基因组电子酶切所得序列标签的存储方法,其特征在于,还包括以下步骤:

6.根据权利要求1所述的一种基因组电子酶切所得序列标签的存储方法,其特征在于,还包括以下步骤:

7.根据权利要求1所述的一种基因组电子酶切所得序列标签的存储方法,其特征在于,所述步骤预设编号的位数具体设置为:

8.一种基因组电子酶切所得序列标签的存储系统,其特征在于:包括数据预存模块(1)、信息排序模块(2)、信息编号模块(3)、标签生成模块(4)、标签计数模块(5)、编号生成模块(7)、存储判断模块(8)和数据存储模块(9);

9.根据权利要求8所述的一种基因组电子酶切所得序列标签的存储系统,其特征在于:还包括位数检测模块(6),所述位数检测模块(6)监测信息编号模块(3)的基因组重编号和标签计数模块(5)的标签数量是否超出位数,若基因组重编号超出位数,则扩大位数并将所有基因组重编号补满位数,若标签数量超出位数,则扩大位数并将所有标签数量补满位数。

10.根据权利要求8所述的一种基因组电子酶切所得序列标签的存储系统,其特征在于:还包括数据查询模块(10)和标签查询模块(11);


技术总结
本发明公开了一种基因组电子酶切所得序列标签的存储方法及系统,属于数据存储的技术领域,其包括预存基因组与物种分类映射表,按照物种分类信息对基因组信息进行排序,根据排好的顺序获得基因组重编号,按照排好的顺序调取基因组信息,并对调取的基因组信息进行电子酶切,获得标签,计算在同一基因组信息中出现的标签数量,预设分段存储阈值,将基因组重编号和标签数量组合获得正式编号,将正式编号转换为键值对,将键值对写入数据库,将数据库以最后一个存储的基因组重编号为名保存,本发明具有有效提高查询电子酶切标签的速度,并且数据库管理方便,占用存储空间小的效果。

技术研发人员:刘江,周丽沙,王修评
受保护的技术使用者:青岛欧易生物科技有限公司
技术研发日:
技术公布日:2024/3/17
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