用于转移标记的系统和方法与流程

本公开总体上涉及组织学和/或病理生物学领域。更具体地，本公开涉及制作和转移用于生物样本的自动下游分析或处理的病理学家标记。

背景技术：

1、已经提出了多种方法来解决用于制备和/或处理用于下游分析或处理的组织学样品的刮取程序的繁琐性质。目前的组织解剖过程是完全手动或完全自动化的。对于完全手动的过程，使用剃须刀片从诸如玻璃载玻片的基底刮取并直接收集感兴趣区域(roi)或“s”区域。例如，用于基底提交的常规工作流程包括完全手动的过程，其中用户使用标准的现成标记笔将染色载玻片上的病理学家感兴趣区域标记手动转移到未染色载玻片。然后，用户使用剃须刀片或等效物刮掉已标记的未染色基底上的感兴趣区域(例如“s”)并收集到容器中。

2、对于完全自动化的过程，操作员将样品插入机器中，并且“s”区域被自动提取。然而，获得所需“s”区域的成功率未接近100％，因此并不令人满意。完全手动的过程完全依赖操作员的手/眼协调，但是其可以实现更接近100％的成功率，因此可以大大提高组织刮取的一致性和准确性。然而，完全手动的过程也会引入工效学/安全问题，因为施加到玻璃表面的恒定力可导致操作员撕裂和工效学问题(例如，腕管)。

3、物理和数字病理学的当前实施方式已经改进了组织学/病理学工作流程的许多领域。然而，仍有一些重要领域的需求未得到满足。一项未满足的需求是某些基底提交无法使用商业数字病理系统进行数字处理。大量案例仍然需要手动玻璃工作流程处理。因此，需要一种方法来转换这个流程以实现全数字化工作流程。

技术实现思路

1、根据本文公开的各种实施方案，提供了一种用于转移病理学家标记的系统。所述系统包括：成像装置，所述成像装置被配置用于对染色载玻片或未染色载玻片进行成像；显示器，所述显示器用于显示所述染色载玻片或所述未染色载玻片的一个或多个图像；机械台/支架，所述机械台/支架用于相对于所述未染色载玻片定位或定向所述染色载玻片，以使得能够对所述未染色载玻片进行物理标记；以及应用程序，所述应用程序用于基于所述物理标记以数字方式绘制一个或多个特征并将所述物理标记转移为坐标以用于进一步处理。

2、根据本文公开的各种实施方案，提供了一种用于转移标记的方法。所述方法包括：将带有病理学家标记的染色载玻片的图像投影到显示器上；将未染色载玻片置于位于所述显示器上的支架上；通过移动所述支架将所述未染色载玻片与所述染色载玻片的所述投影图像对齐；以及将所述病理学家标记物理地转移到所述未染色载玻片上。

3、根据本文公开的各种实施方案，提供了一种用于转移病理学家标记的系统。所述系统包括：成像装置，所述成像装置被配置用于对染色载玻片和未染色载玻片进行成像；显示器，所述显示器用于显示所述染色载玻片和所述未染色载玻片的一个或多个图像；第一应用程序，所述第一应用程序用于对齐染色载玻片或未染色载玻片的一个或多个图像；第二应用程序，所述第二应用程序用于对一个或多个特征进行数字标记并将所述一个或多个特征的数字标记转换为坐标。

4、根据本文公开的各种实施方案，提供了一种以数字方式转移标记的方法。所述方法包括：在成像仪下获得染色载玻片的图像；将所述染色载玻片的所述图像投影到显示器上；对所述染色载玻片的所述图像进行标记；将所述染色载玻片的所述标记转移到未染色载玻片；以及捕获带有转移标记的已标记未染色载玻片。

5、下面详细讨论了这些和其他方面以及实施方式。前述信息和以下详细描述包括各种方面和实施方式的说明性示例，并且为理解所要求保护的方面和实施方式的性质和特性提供了综述或框架。附图提供了对各种方面和实施方式的说明和进一步理解，并且被并入本说明书中并构成本说明书的一部分。

技术特征：

1.一种用于转移病理学家标记的系统，其包括：

2.如权利要求1所述的系统，其中所述第二应用程序用于将所述一个或多个特征的所述数字标记从所述染色载玻片的图像转移到所述未染色载波片的图像。

3.如权利要求1所述的系统，其中所述第二应用程序用于将所述一个或多个特征的所述数字标记转移为坐标以用于进一步处理。

4.如前述权利要求中任一项所述的系统，其中基于视觉提示手动地执行对齐所述一个或多个图像。

5.如权利要求1或权利要求2所述的系统，其中所述成像装置是电子显微镜。

6.如前述权利要求中任一项所述的系统，其中所述染色载玻片包括苏木精和伊红染色的载玻片、包含根据一种或多种光散射性质评估的标本的载玻片或免疫组织化学法染色的载玻片。

7.如权利要求3至6中任一项所述的系统，其中进一步处理包括一个或多个下游过程，所述下游过程至少包括解剖或分离生物标本的一部分。

8.如前述权利要求中任一项所述的系统，其中所述第一应用程序是用于检测所述染色载玻片或所述未染色载玻片的物理性质的计量软件程序。

9.如前述权利要求中任一项所述的系统，其中所述第二应用程序是用于数字标记所述一个或多个特征的标记软件程序。

10.如前述权利要求中任一项所述的系统，其中所述一个或多个图像的所述对齐包括定位和/或定向所述染色载玻片或所述未染色载玻片的所述一个或多个图像，其中所述一个或多个图像的所述定位和/或定向由操作员手动执行。

11.如权利要求10所述的系统，其中所述染色载玻片或所述未染色载玻片的所述一个或多个图像的所述定向包括对所述染色载玻片或所述未染色载玻片的所述一个或多个图像的平移、旋转、缩放或镜像的一个或多个操作。

12.如权利要求10所述的系统，其中所述染色载玻片或所述未染色载玻片的所述一个或多个图像彼此叠加，以获得所述染色载玻片或所述未染色载玻片的所述一个或多个图像的对齐。

13.如前述权利要求中任一项所述的系统，其中所述一个或多个特征包括一个或多个点、直线或曲线，或折线。

14.如权利要求13所述的系统，其中所述一个或多个特征由操作员手动绘制。

15.如权利要求13或权利要求14所述的系统，其中所述第二应用程序用于识别所述一个或多个点或线或所述折线以及将所述一个或多个点或线或所述折线转换为所述一个或多个特征的所述数字标记。

16.如权利要求15所述的系统，其中所述染色载玻片的所述一个或多个图像包括所述染色载玻片的低分辨率图像。

17.如权利要求16所述的系统，其中所述低分辨率图像的一个或多个边界边缘或角部用于识别所述一个或多个点或线或所述折线以及将所述一个或多个点或线或所述折线转换为所述一个或多个特征的所述数字标记。

18.一种用于以数字方式转移标记的方法，其包括：

19.如权利要求18所述的方法，其还包括在将所述染色载玻片的所述标记转移到未染色载玻片之前，对所述染色载玻片的所述图像进行标记。

20.如权利要求18或权利要求19所述的方法，其中所述染色载玻片包括一个或多个预标记。

21.如权利要求20所述的方法，其中对所述染色载玻片的所述图像进行标记包括将所述一个或多个预标记用作参考准则。

22.如权利要求18至21中任一项所述的方法，其中对所述染色载玻片的所述图像进行标记包括在所述显示器上绘制一个或多个特征。

23.如权利要求18至23中任一项所述的方法，其中对所述染色载玻片的所述图像进行标记包括：

24.如权利要求23所述的方法，其中所述染色载玻片的所述图像是所述染色载玻片的低分辨率图像，并且其中所述低分辨率图像用于识别所述一个或多个点或线或所述折线以及将所述一个或多个点或线或所述折线转换为所述一个或多个数字特征。

25.如权利要求24所述的方法，其中所述低分辨率图像的一个或多个边界边缘或角部用于识别所述一个或多个点或线或所述折线以及将所述一个或多个点或线或所述折线转换为所述一个或多个数字特征。

26.如权利要求23至25中任一项所述的方法，其中将所述染色载玻片的所述标记转移到所述未染色载玻片包括：

27.如权利要求26所述的方法，其中将所述未染色载玻片叠加在所述染色载玻片的所述图像上和/或重新定向所述未染色载玻片由操作员手动执行。

28.如权利要求26或权利要求27所述的方法，其中在将所述染色载玻片的所述标记转移到所述未染色载玻片期间，使用所述未染色载玻片的图像来代替所述未染色载玻片。

29.如权利要求18至25中任一项所述的方法，其中将所述染色载玻片的所述标记转移到所述未染色载玻片包括：

30.如权利要求29所述的方法，其中在将所述染色载玻片的所述标记转移到所述未染色载玻片期间，使用所述未染色载玻片的图像来代替所述未染色载玻片。

31.如权利要求30所述的方法，其中所述未染色载玻片的所述图像是微透明的，以允许在将所述染色载玻片的所述标记转移到所述未染色载玻片期间，同时观察所述染色载玻片的所述图像和所述未染色载玻片的所述图像。

32.如权利要求30或31所述的方法，其中重新定向所述未染色载玻片的所述图像还包括将所述染色载玻片的所述图像和所述未染色载玻片的所述图像同时放大或缩小相同量。

33.如权利要求30或31所述的方法，其中重新定向所述未染色载玻片的所述图像还包括对所述未染色载玻片的所述图像执行平移、旋转、缩放或镜像的一个或多个操作。

34.如权利要求30所述的方法，其中重新定向所述未染色载玻片的所述图像还包括执行所述未染色载玻片的所述图像对所述染色载玻片的所述图像的叠加。

35.如权利要求30所述的方法，其还包括：

36.如权利要求30所述的方法，其还包括：

37.如权利要求18至36中任一项所述的方法，其还包括：

38.如权利要求37所述的方法，其还包括：

39.一种用于转移病理学家标记的系统，其包括：

40.如权利要求39所述的系统，其中所述机械台/支架被手动操作，以相对于所述未染色载玻片定位或定向所述染色载玻片。

41.如权利要求39或权利要求40所述的系统，其中所述成像装置是电子显微镜。

42.如权利要求39至41中任一项所述的系统，其中所述应用程序是用于检测所述染色载玻片或所述未染色载玻片的物理性质的计量软件程序。

43.如权利要求39至42中任一项所述的系统，其中所述染色载玻片包括苏木精和伊红染色的载玻片、包含根据一种或多种光散射性质评估的标本的载玻片或免疫组织化学法染色的载玻片。

44.如权利要求39至43中任一项所述的系统，其中进一步处理包括一个或多个下游过程，所述下游过程至少包括解剖或分离生物标本的一部分。

45.如权利要求39至44中任一项所述的系统，其中所述一个或多个特征包括一个或多个点、直线或曲线，或折线。

46.如权利要求39至45中任一项所述的系统，其中所述染色载玻片还包括一个或多个预标记。

47.如权利要求46所述的系统，其中所述一个或多个预标记被用作将物理标记转移到所述未染色载玻片上的准则。

48.如权利要求39至47中任一项所述的系统，其中所述应用程序用于识别所述物理标记并且用于将所述物理标记转换为所述一个或多个特征。

49.如权利要求48所述的系统，其中所述染色载玻片的所述一个或多个图像包括低分辨率图像，并且所述低分辨率图像用于识别所述物理标记并且用于将所述物理标记转换为所述一个或多个特征。

50.如权利要求49所述的系统，其中所述低分辨率图像的一个或多个边界边缘或角部用于识别所述物理标记以及将所述物理标记转换为所述一个或多个特征。

51.一种用于转移标记的方法，其包括：

52.如权利要求51所述的方法，其中所述支架由操作员手动定位。

53.如权利要求51或权利要求52所述的方法，其中所述染色载玻片还包括一个或多个预标记。

54.如权利要求53所述的方法，其中所述一个或多个预标记用作将所述病理学家标记物理地转移到所述未染色载玻片上的准则。

55.如权利要求51至54中任一项所述的方法，其中将所述病理学家标记物理地转移到所述未染色载玻片上包括在所述未染色载玻片上绘制一个或多个特征或标记。

56.如权利要求55所述的方法，其中所述一个或多个特征包括一个或多个点、直线或曲线，或折线。

57.如权利要求51至56中任一项所述的方法，其中平移、旋转、缩放和/或叠加所述染色载玻片的所述投影图像，以帮助与所述未染色载玻片对齐。

58.如权利要求51至57中任一项所述的方法，其中翻转所述染色载玻片的所述投影图像，以帮助与所述未染色载玻片对齐。

59.如权利要求57或权利要求58所述的方法，其中由操作员手动地平移、旋转、缩放、叠加和/或翻转所述染色载玻片的所述投影图像。

60.如权利要求51至60中任一项所述的方法，其还包括：

61.如权利要求60所述的方法，其中所述染色载玻片的低分辨率图像用于识别所述病理学家标记以及将所述病理学家标记转换为所述一个或多个特征。

62.如权利要求61所述的方法，其中所述低分辨率图像的一个或多个边界边缘或角部用于识别所述病理学家标记以及将所述病理学家标记转换为所述一个或多个特征。

63.如权利要求51至62中任一项所述的方法，其中将所述染色载玻片的所述图像投影到所述显示器上从所述染色载玻片的后面、上方或一侧发生。

64.如权利要求51至63中任一项所述的方法，其中所述转移的病理学家标记用于刮取生物标本的一部分。

65.如权利要求51至64中任一项所述的方法，其中所述染色载玻片包括苏木精和伊红染色的载玻片、包含根据一种或多种光散射性质评估的标本的载玻片或免疫组织化学法染色的载玻片。

技术总结
本文公开的技术涉及用于转移标记的系统和方法。所述系统可以包括用于对染色载玻片和未染色载玻片进行成像的成像装置、用于显示所述染色载玻片和所述未染色载玻片的一个或多个图像的显示器。在各种实施方案中，所述系统可以包括诸如支架的机械台，所述机械台用于相对于所述未染色载玻片定位或定向所述染色载玻片。在各种实施方案中，所述系统可以与用于对齐所述图像以使得能够对所述未染色载玻片进行数字标记的第一应用程序和用于对一个或多个特征进行数字标记并将所述数字标记转移为坐标以用于进一步处理诸如解剖的第二应用程序耦接。

技术研发人员：G·J·S·P·莫拉莱达,A·L·H·袁,H·杨,C·W·李
受保护的技术使用者：基因组健康股份有限公司
技术研发日：
技术公布日：2024/4/7