1.一个治疗乳腺癌的方法，包括：
a)从病人的样品分析一个或几个以下的指标：
(i)在这个组里面至少一个基因的表达：SLC12A7，GZMB，和TAF6L；
(ii)在这个组里面至少一个基因的表达：NFIB,METRN,ROPN1B,TTK,和CCND1；
(iii)在这个组里面至少一个基因的表达：PTTG1,H2AFZ,WDR45L,DEK,MCM2,USP1,CDT1,TMEM97,RER1,MCM6,and LZTFL1；
b)基于基因表达的结果计算一个或几个药物能达到病理完全缓解的概率；
c)基于对药物病理完全缓解的概率的计算从下面的方案中选择最佳的治疗病人的药物：(i)只用蒽环类药物；(ii)用蒽环类和紫杉醇药物；(iii)用蒽环类和多西紫杉醇。
2.一个治疗HER2阴性乳腺癌的方法，包括：
a)从病人的样品分析一个或几个以下的指标：
(i)在这个组里面至少一个基因的表达：SLC12A7,GZMB,C11orf17,TAF6L,CCL5,XCL1,和XCL2；
(ii)在这个组里面至少一个基因的表达：NFIB,ROPN1B,TTK,MELK,CTSL2,和METRN；
(iii)在这个组里面至少一个基因的表达：TPX2,PTTG1,MCM2,MCM6,AURKA,CDKN2C,BRP44,H2AFZ,PNP,SMC4,DEK,TMEM97,NR4A2,C3orf37,LZTFL1,MTPAP,CDC25B,和ABCF1；
b)基于基因表达的结果计算一个或几个药物能达到病理完全缓解的概率；
c)基于对药物病理完全缓解的概率的计算从下面的方案中选择最佳的治疗病人的药物：(i)只用蒽环类药物；(ii)用蒽环类和紫杉醇药物；(iii)用蒽环类和多西紫杉醇。
3.一个治疗HER2阴性，ER阴性乳腺癌的方法，包括：
a)从病人的样品分析一个或几个以下的指标：
(i)在这个组里面至少一个基因的表达：NFIB,MTAP,SNAPC3,RANBP9,COIL,FAM86B1,ITGA6,S100P,RANBP1,PRSS16,SMARCA2,和STK24；
(ii)在这个组里面至少一个基因的表达：TSPYL5和SRI；
b)基于基因表达的结果计算一个或几个药物能达到病理完全缓解(pathological complete response)的概率；
c)基于对药物病理完全缓解的概率的计算从下面的方案中选择最佳的治疗病人的药物：(i)用蒽环类和紫杉醇药物；(ii)用蒽环类和多西紫杉醇。
4.一个治疗HER2阴性，ER阳性乳腺癌的方法，包括：
a)从病人的样品分析一个或几个以下的指标：
(i)在这个组里面至少一个基因的表达：LRP12,CENPF,TUBD1,KIAA1324,和TTK；
(ii)在这个组里面至少一个基因的表达：DBF4,DEK,CDC25B,CCNA2,DLGAP5,MCM2,CDKN2C,FHL1,SIRT3,GTSE1,PCNA,和CCNE2；
b)基于基因表达的结果计算一个或几个药物能达到病理完全缓解的概率。
c)基于对药物病理完全缓解的概率的计算从下面的方案中选择最佳的治疗病人的药物：(i)用蒽环类和紫杉醇药物；(ii)用蒽环类和多西紫杉醇。
5.一个治疗HER2阴性，淋巴结阴性乳腺癌的方法，包括：
a)从病人的样品分析一个或几个以下的指标：
(i)在这个组里面至少一个基因的表达：CHD3,CAP1,GPM6B,和GUSBP3；
(ii)在这个组里面至少一个基因的表达：CDKN2C,GNAI3,LMO4,PSRC1,USP1,和STK38；
b)基于基因表达的结果计算一个或几个药物能达到病理完全缓解的概率；
c)基于对药物病理完全缓解的概率的计算从下面的方案中选择最佳的治疗病人的药物：(i)用蒽环类和紫杉醇药物；(ii)用蒽环类和多西紫杉醇。
6.一个治疗HER2阴性，淋巴结阳性乳腺癌的方法，包括：
a)从病人的样品分析一个或几个以下的指标：
(i)在这个组里面至少一个基因的表达：NFIB和ROPN1B；
(ii)在这个组里面至少一个基因的表达：TPX2,BAT2L1,PMP22,PTTG1,NME5,CENPA,和BANK1；
b)基于基因表达的结果计算一个或几个药物能达到病理完全缓解的概率；
c)基于对药物病理完全缓解的概率的计算从下面的方案中选择最佳的治疗病人的药物：(i)用蒽环类和紫杉醇药物；(ii)用蒽环类和多西紫杉醇。
7.根据权利要求1-6的其中一个方法,所述基因表达包括信使核糖核酸(mRNA)表达，蛋白表达，非编码核糖核酸(non-coding RNA)表达，或小核糖核酸(miRNA)表达。
8.根据权利要求1-6的其中一个方法,所述基因表达由以下的方法测量：DNA阵列芯片，RNA阵列芯片，寡核苷酸阵列芯片，蛋白阵列芯片，一个或多个抗体，一个或多个抗原结合片段，一些探针，一些引物，二代测序技术，或三代测序技术。
9.一个为乳腺癌病人选择化疗方案的试剂盒,所述试剂盒包括一个或多个组分可以从以下基因组中检测出其中至少一个基因的表达,所述基因组包括SLC12A7,GZMB,TAF6L,NFIB,METRN,ROPN1B,TTK,CCND1,PTTG1,H2AFZ,WDR45L,DEK,MCM2,USP1,CDT1,TMEM97,RER1,MCM6,LZTFL1,C11orf17,CCL5,XCL1,XCL2,MELK,CTSL2,TPX2,AURKA,CDKN2C,BRP44,PNP,SMC4,NR4A2,C3orf37,MTPAP,CDC25B,ABCF1,MTAP,SNAPC3,RANBP9,COIL,FAM86B1,ITGA6,S100P,RANBP1,PRSS16,SMARCA2,STK24,TSPYL5,SRI,LRP12,CENPF,TUBD1,KIAA1324,DBF4,CCNA2,DLGAP5,FHL1,SIRT3,GTSE1,PCNA,CCNE2,CHD3,CAP1,GPM6B,GUSBP3,GNAI3,LMO4,PSRC1,USP1,STK38,BAT2L1,PMP22,NME5,CENPA,和BANK1。
10.根据权利要求9的试剂盒,所述基因表达由以下的方法测量：DNA阵列芯片，RNA阵列芯片，寡核苷酸阵列芯片，蛋白阵列芯片，一个或多个抗体，一个或多个抗原结合片段，一些探针，一些引物，二代测序技术，或三代测序技术。