1.一种用于预示和鉴定鸭生长和腹脂率的分子标记方法,其特征在于,包括以下步骤:
以包含VLDLR基因的待测鸭全基因组DNA为模板,用Primer5.0设计引物,扩增长度为374bp,上下游引物序列为:
上游5’-ATTACACTGCCAAATGACC-3’;
下游5’-CGGGAACTGGGATTCTTC-3’;
产物经琼脂糖凝胶电泳检测后进行纯化双向测序,测序鉴定鸭VLDLR基因5'UTR和信号肽编码区多态性;
对鸭VLDLR基因单倍型组合与屠宰性状之间进行关联分析,发现能影响生长速度和腹脂率的有效分子标记信息,进而用于培育出优质肉鸭新品系。
2.根据权利要求1所述的用于检测鸭生长和腹脂率的分子标记方法,其特征在于,所述PCR扩增反应体系为25μL,反应程序为94℃预变性10min,然后35个循环(94℃变性30S,53.5℃退火30S,72℃延伸30S),72℃延伸10min,4℃保存。
3.根据权利要求1所述的用于检测鸭生长和腹脂率的分子标记方法,其特征在于,所述纯化双向测序是以PCR反应的引物作为测序引物,和PCR产物进行纯化测序,使用PHASE软件统计SNP位点的单倍型、单倍型频率及构建单倍型组合。
4.根据权利要求1所述的用于检测鸭生长和腹脂率的分子标记方法,其特征在于,所述鸭VLDLR基因5'UTR和信号肽编码区多态性结果该VLDLR基因具有4个多态位点:g.151、g.170、g.206、g.278-295;
在g.151位点,GA基因型的频率最高,为0.56,AA基因型的频率最低,为0.04,等位基因频率G>A;
在g.170位点,CC基因型的频率最高,为0.50,CT基因型的频率最低,为0.22,等位基因频率C>T;
在g.206位点,AG基因型的频率最高,为0.50,GG基因型的频率最低,为0.17,等位基因频率A>G;
在g.278-295位点,DD型的频率最高,为0.65,DB型的频率最低,为0.11,等位基因频率D>B。
5.权利要求1-4中任一所述的用于检测鸭生长和腹脂率的分子标记方法在鸭育种过程中进行标记辅助选择的应用。