本发明属于昆虫控制领域,具体涉及一种转运必需体分选复合物iii核心亚基snf7类的双链rna(dsrna),以及该dsrna的制备方法和应用。
背景技术:
escrt-ⅲ,称为转运必需体分选复合物ⅲ(theendosomalsortingcomplexesrequiredfortransport-iii)主要由vps20、snf7/vps32、vps24和vps2四个“核心”亚基组成,是真核细胞中完成内体膜内陷以形成多囊泡体(mvb)的关键组分。escrt-ⅲ的主要功能是募集去泛素化(de-ubiquitin)的酶,促进被泛素(ubiquitin)标记的膜蛋白的降解。除了参与mvb的形成外,escrt-iii还与细胞跨膜蛋白的内化、转运、分选、细胞自噬和细胞分裂等细胞生命活动有关,而这些生命过程又与mvb形成过程密切相关(babst等,2002;res等,2007;capalbo等,2012;tang等,2015)。因此,escrt-iii对于所有真核生物的生长发育均有重要的作用。
snf7属于进化保守的蛋白质家族,在酵母中是由240个氨基酸组成,在果蝇中的同系物为shrb(shrub),在人类的同系物为chmp4,其存在于除古细菌外的其它任何物种(babst等,2002;mcmillan等,2016)。snf7是一种可溶性卷曲螺旋蛋白,含有高度结构化的“四核”螺旋结构域。snf7的功能包括:1)自噬;2)与去泛素酶的相互作用(dub)招募dub到escrt途径;3)多囊泡体内腔内囊泡(ilv)形成mvb;4)细胞分裂(lata等,2008;obita等,2007;ramaseshadri等,2013;
snf7虽为绝大部分生物生命活动中的必需蛋白,但在昆虫中的研究还较少,其中以果蝇和西方玉米根甲虫(westerncornrootworm,wcr,diabroticavirgiferavirgifera)中的研究最多。sweeney等通过对果蝇shrub(即果蝇的snf7)突变体的研究,发现shrb在昆虫的神经形态发生中发挥重要作用(sweeney等,2006)。baum等通过西方玉米根甲虫的rnai实验,发现极低剂量的dsdvsnf7就可导致wcr致死(baum等,2007)。随后bolognesi等通过rnai技术干涉wcr幼虫中的snf7基因的表达,发现试验组幼虫相于对照组生长明显被阻碍,且分别以50ng/ml和1000ng/ml的剂量饲喂幼虫24h后会造成90.3%和94.6%的致死率(bolognesi等,2012)。对玉米根甲虫饲喂dsdvsnf7后,发现泛素化蛋白在幼虫组织中积累,阻碍了中肠和脂肪体的细胞自噬而导致幼虫死亡(ramaseshadri等,2013)。
目前,针对昆虫杀虫剂的研究较多,但主要集中的是昆虫特有基因,如:蜕皮激素受体(ecdysonereceptor,ecr)和几丁质合成酶(chitinsynthase,chs)(wu等,2012;wang等,2012)。这些杀虫剂的主要优点是针对大部分昆虫,是一种宽谱杀虫剂,但其相对安全性不高,且对昆虫的致死效率有限,这极大地限制了昆虫特有基因杀虫剂的使用。由于snf7对昆虫生长发育起至关重要的作用,已有研究者通过设计特异性片段,获得了高效安全的仅针对西方玉米根甲虫的窄谱杀虫剂。通过对褐飞虱snf7这一管家基因进行特异性片段设计,将有助于我们筛选到新的针对褐飞虱的高效安全的窄谱杀虫剂。
技术实现要素:
本发明的目的在于克服现有技术的缺点和不足,提供一种针对褐飞虱防治效果显著的高效安全性杀虫dsrna。
本发明的另一个目的是提供所述高效安全性杀虫dsrna的制备方法。
本发明的再一个目的是提供所述高效安全性杀虫dsrna在制备用于防治褐飞虱的药物中的应用。
本发明的又一个目的是提供使用所述高效安全性杀虫dsrna防治褐飞虱的方法。
为了实现上述目的,本发明提供了以下技术方案:
本发明提供了一种escrt-iii核心亚基snf7类双链rna,其转录模板的正义链的核苷酸序列如seqidno:1所示。
本发明还提供了所述escrt-iii核心亚基snf7类双链rna的制备方法,其包括以下步骤:
1)提取褐飞虱总rna:取成虫,于液氮中研磨,用trizol法提取总rna;
2)合成cdna第一链:将1μg总rna反转录为cdna;
3)制备褐飞虱snf7同源基因nl020727基因中间片段,并制备含有所述中间片段的载体;
4)以步骤3)得到的载体为模板,扩增得到目的片段,即所述escrt-iii核心亚基snf7类双链rna。
具体地,步骤3)的具体操作如下:
步骤1、聚合酶链式反应:试剂包括peasy--020727质粒dna1.5μl、10μm的所述nl020727基因特异性上游引物nl020727-f2μl、10μm的所述nl020727基因特异性下游引物nl020727-r2μl、2×phantamaxbuffer25μl、dntpmix1μl、phantamaxsuper-fidelitydnaploymerase1μl、双蒸水17.5μl;将所述试剂混合得到混合液,总体积为50μl;所述聚合酶链式反应的具体步骤如下:将所述混合液95℃预变性3min,然后进入下列循环:95℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸50s,共30个循环,最后72℃再延伸7min;其中,扩增所述nl020727基因特异性片段的上游引物nl020727-f的序列为:5’-ccctttcactactactcatcttca-3’;下游引物nl020727-r的序列为:5’-gttcttcttcttctttttcttcct-3’;
步骤2、扩增产物纯化:使用magen凝胶回收试剂盒纯化pcr扩增片段,得到纯化产物;
步骤3、中间载体获得:将所述纯化产物按照连接反应体系,克隆到peasy-bluntzero载体,转化到trans1-t1感受态细胞,在含有100ug/ml氨苄青霉素的lb平板上过夜培养,得到菌落;所述连接反应体系为:纯化产物4μl,peasy-bluntzero1μl,总体积共5μl;
步骤4、质粒纯化:将所述菌落接种于lb液体培养基,37℃摇床过夜培养后收取菌液,抽提质粒,得到含有nl020727基因的质粒。
具体地,所述步骤4)的具体操作如下:
步骤a、设计以下特异性引物:
dsnl020727-f:5’-aatgaagggaagagagatcgtgccaaa-3’
dsnl020727-r:5’-tacagcctcatcatcctcagcagtca-3’
dsnl020727-t7f:
5’-ggatcctaatacgactcactataggaatgaagggaagagagatcgtgccaaa-3’
dsnl020727-t7r:
5’-ggatcctaatacgactcactataggtacagcctcatcatcctcagcagtca-3’
步骤b、以含有所述nl020727基因中间片段的载体为模板,使用所述步骤a中的特异性引物分别按照以下反应条件扩增,得到目的片段:
a反应体系如下:
b反应体系如下:
其中,pcr仪扩增程序:94℃预变性5min;94℃变性30s,58℃退火30s,72℃延伸35s,30个循环;72℃再延伸10min;
其中,通过dsrna合成试剂盒合成所述nl020727基因对应的双链rna。
本发明还提供了一种杀虫剂,其包括所述escrt-iii核心亚基snf7类双链rna作为活性成分。
本发明还提供了所述escrt-iii核心亚基snf7类双链rna在制备用于防治褐飞虱的药物中的应用。
本发明还提供了一种使用所述escrt-iii核心亚基snf7类双链rna防治褐飞虱的方法,其包括:使用所述escrt-iii核心亚基snf7类双链rna对褐飞虱进行注射。
优选地,注射所述escrt-iii核心亚基snf7类双链rna的终浓度为0.025μg/μl至0.2μg/μl。
目前防治褐飞虱的主要办法包括农业防治、化学防治和生物防治,由于化学药物带来的抗性作用以及环境污染等问题,使得褐飞虱防治工作难以得到持续性发展。本发明采用escrt-iii核心亚基snf7类双链rna(dsrna),该双链rna的转录模板为褐飞虱snf7同源基因(nl020727)。本发明通过利用褐飞虱snf7该保守基因,筛选得到双链rna,将其用于褐飞虱防治,可有效抑制褐飞虱的正常发育和繁殖,防治效果显著,而且不会产生抗药性和环境污染,安全环保。
附图说明
图1是注射dsnl020727后褐飞虱的mrna相对表达量变化图。
图2是注射dsnl020727后褐飞虱的校正致死率变化图。
图3是注射dsnl020727后褐飞虱的蛋白变化图。
具体实施方式
下面结合实施例及附图对本发明作进一步详细的描述,但本发明的实施方式不限于此。
实施例1
按照以下步骤制备dsrna:
1.选取褐飞虱成虫1天
2.总rna的提取:取1头成虫,于液氮中研磨,用trizol法提取总rna。
3.cdna第一链的合成:按照使用takara公司的primescriptrtreagentkitwithgdnaeraser试剂盒说明书,将1μg总rna反转录为cdna。
4.下面描述nl020727中间片段制备过程。
(1)聚合酶链式反应(pcr)试剂(vazyme
上述聚合酶链式反应的具体步骤如下:将上述混合液95℃预变性3min,然后进入下列循环:95℃变性15s,55℃退火15s,72℃延伸50s,共30个循环,最后72℃再延伸7min。
其中,扩增nl020727基因特异性片段的上游引物nl020727-f的序列为:5’-ccctttcactactactcatcttca-3’(seqidno:2);下游引物nl020727-r的序列为:5’-gttcttcttcttctttttcttcct-3’(seqidno:3);
(2)扩增产物纯化:使用magen凝胶回收试剂盒纯化pcr扩增片段。
(3)中间载体获得:将纯化产物按照下列连接反应体系,中间载体获得:将纯化产物按照下列连接反应体系,克隆到peasy-bluntzero载体(北京全式金生物技术有限公司),转化到trans1-t1感受态细胞(北京全式金生物技术有限公司),在含有100ug/ml氨苄青霉素的lb平板上过夜培养;
连接反应体系如下:
纯化产物4μl
peasy-bluntzero1μl
总体积5μl
(4)质粒的纯化:挑取5个菌斑,进行菌落pcr验证,选取正确的菌落接种于lb液体培养基,37℃摇床过夜培养后收取菌液,按magen质粒dna抽提试剂盒抽提质粒。
(5)序列测定与同源检测:进行测序结果分析,得到nl020727基因的核苷酸序列,长710bp(如seqidno:12所示)。本发明所述escrt-iii核心亚基snf7类双链rna的核苷酸序列如seqidno:1所示,长312bp。
含有nl020727基因的质粒命名为peasy—020727。
实施例2
(1)设计带有t7启动子的特异性引物,进行nl020727的dsrna体外合成,同时使用绿色荧光蛋白基因的引物,合成dsgfp作为对照。
dsnl020727-f:5’-aatgaagggaagagagatcgtgccaaa-3’(seqidno:4)
dsnl020727-r:5’-tacagcctcatcatcctcagcagtca-3’(seqidno:5)
dsnl020727-t7f:
5’-ggatcctaatacgactcactataggaatgaagggaagagagatcgtgccaaa-3’
(seqidno:6)
dsnl020727-t7r:
5’-ggatcctaatacgactcactataggtacagcctcatcatcctcagcagtca-3’(seqidno:7)
dsgfp-f:5’-aagggcgaggagctgttcaccg-3’(seqidno:8)
dsgfp-r:5’-cagcaggaccatgtgatcgcgc-3’(seqidno:9)
dsgfp-t7f:
5’-ggatcctaatacgactcactataggaagggcgaggagctgttcaccg-3’(seqidno:10)
dsgfp-t7r:
5’-ggatcctaatacgactcactataggcagcaggaccatgtgatcgcgc-3’(seqidno:11)
(2)以实施例1得到的名称为peasy--020727的质粒为模板,使用步骤1设计的引物分别按照以下反应条件扩增,得到目的片段。
a反应体系如下:
b反应体系如下:
pcr仪扩增程序:94℃预变性5min;94℃变性30s,58℃退火30s,72℃延伸35s,30个循环;72℃再延伸10min;
(1)通过dsrna合成试剂盒(t7ribomaxtmexpressrnaisystem,promega,usa)合成nl020727对应的dsrna,命名为dsnl020727。
(2)对褐飞虱注射dsnl020727,终浓度为0.025μg/μl、0.05μg/μl、0.1μg/μl和0.2μg/μl四个梯度,以绿色荧光蛋白的dsgfp为对照。
(3)收集步骤(2)注射后24、48、72h的短翅雌性成虫一天的褐飞虱,通过荧光定量pcr的方法进行nl020727基因的mrna相对表达量变化的检测。结果如图1所示,发现注射0.025μg/μl至0.2μg/μl浓度的dsnl020727后,其mrna表达量均显著降低。此外,对注射不同剂量dsnl02072后褐飞虱的致死率进行统计,结果如图2所示,发现在注射四个剂量的dsrna后的13天内,褐飞虱的致死率持续上升,且在第13天的致死率均高达70%,说明dsnl02072阻碍了褐飞虱的正常发育。
(4)收集注射0.05μg/μldsnl020727后1天和5天的褐飞虱,通过westernblot的方法检测nl020727蛋白表达变化,结果如图3所示,发现褐飞虱注射dsnl020727后,随着时间的延长,褐飞虱体内的nl020727蛋白表达水平显著降低。结果说明通过对褐飞虱注射dsnl020727片段,能有效干扰靶标基因的表达,阻碍了nl020727的蛋白质合成。
上述实施例为本发明较佳的实施方式,但本发明的实施方式并不受上述实施例的限制,其他任何在未背离本发明的精神实质与原理下所作的改变、修饰、替代、组合、简化,均因为等效的置换方式,都包含在本发明的保护范围之内。
序列表
<110>中山大学
<120>一种escrt-iii核心亚基snf7类双链rna及其制备方法及应用
<160>12
<170>siposequencelisting1.0
<210>1
<211>312
<212>dna
<213>人工序列(artificialsequence)
<400>1
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ctgctaagcagaactgatggccagcttgaaaacttggaaacattggttcacgacctggag120
tttgctcaaatcgaaacccaggtcgtggaaggattgaaagtaggaaacgatgcgctgaag180
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