本发明涉及菌株的筛选,具体涉及一种木质纤维素衍生抑制剂耐受菌株的筛选方法的筛选方法。
背景技术:
1、木质纤维素是最丰富的绿色可再生资源,包括农林废弃物、谷物残渣、干草、城市有机固体垃圾等,可以转化为其他形式后被利用。具有来源广泛、价格低廉和可再生性等优点,有巨大的发展潜力。有效利用农林废弃物等木质纤维素资源是降低生物基产品生产成本和绿色生物制造的关键途径。
2、木质纤维素的主要成分是纤维素、半纤维素和木质素等,这些成分相互交联在一起,形成了非常复杂的复合物结构,这种生物顽抗性使木质纤维素难以被直接利用。通过对木质纤维素预处理,可以消除其生物顽抗性,破坏纤维素和半纤维素之间的交联结构。但是木质纤维素水解过程中会产生各种抑制剂性副产物,例如:糠醛,苯酚,乙酸。微生物受到培养环境中抑制剂的影响,严重制约着微生物对纤维素水解液的利用。
3、目前通过设计-改造-测试-学习的循环已经大大改善菌种的开发,但是由于抑制剂耐受性涉及到复杂的代谢和调控网络,它不能完美地被单一基因或少数基因控制。通过理性设计来改造微生物的效率难以满足需要。驯化因其有效性和普适性是改善微生物应对抑制剂耐受性的有效手段。驯化可以在多种尺度上,提高微生物对环境胁迫的耐受性,是微生物加强胁迫反应、克服生存限制的常用手段,微生物经过长期驯化可以筛选出具有基因组突变的优势菌株,这些菌株适应压力环境,以提高产品的产量或菌株的生长速度。随着低成本、高通量dna测序以及生物信息学的不断发展,驯化得到的菌株可以利用生物信息学技术,分析引起菌株变化的原因。总之,微生物在压力环境中,经过长时间驯化可能发生基因突变,通过获得全新表型来适应新的环境。因此,通过驯化可以简单有效的增强微生物对环境的适用能力。
技术实现思路
1、本发明所要解决的技术问题是:针对木质纤维素水解液抑制菌株生长问题,提供一种具有木质纤维素水解液耐受性菌株的筛选方法。
2、为解决上述问题,本发明提供一种木质纤维素衍生抑制剂耐受菌株的筛选方法
3、本发明的技术方案概述如下:
4、s1:培养基准备:按照配方配制hs液体培养基,将木质纤维素水解液中的抑制剂成分配制成复合抑制剂,并对需要使用的装置进行处理。
5、s2:菌株准备:活化菌株,获得二级种子液。
6、s3:发酵:二级种子液30℃,静置发酵。
7、s4:梯度驯化:进行多组连续多轮梯度驯化。
8、s5:传代退化:对驯化后的菌株进行连续传代退化。
9、s6:测定:对退化后菌株木质纤维素水解液中抑制剂耐受性进行测定。
10、优选的,所述步骤s1中hs液体培养基的成分包括:蛋白胨10g/l、酵母浸出粉7.5g/l、磷酸氢二钠10g/l、葡萄糖25g/l,使用ph为5.0,115℃灭菌15min。
11、优选的,所述s1中复合抑制剂的成分包括:苯酚0.5g/l、糠醛1.3g/l和乙酸5.3g/l(简称为fap),过滤除菌。
12、优选的,所述s2中菌株活化为将单菌落接种于5ml hs液体培养基中于30℃,200rpm过夜培养获得一级种子液,取3ml一级种子液转接至新鲜的30ml hs液体培养基于30℃,200rpm培养48h。
13、优选的,所述s3中静置发酵条件为30℃培养箱静置培养至膜的厚度为2mm。
14、优选的,所述s4中多组为3组选取产膜速度较快的一组进行下一轮驯化。
15、优选的,所述s4中连续多轮为将产膜速度较快的一组,取其膜的八分之一将其转移至相同浓度抑制剂培养基中进行下一轮驯化,这样连续驯化6次。
16、优选的,所述s4中梯度驯化为在低浓度驯化6轮后将其膜的八分之一转移至较高浓度的抑制剂培养基直至抑制剂浓度达到100%。
17、优选的,所述s5中连续传代退化为将在100%浓度培养基中驯化的菌株转移至无抑制剂的hs培养基中静置培养至膜的厚度为2mm,取膜的八分之一转移至新鲜的无抑制剂hs培养基中,重复此步骤5次。
18、优选的,所述s6中菌株耐受性测定为菌株在规定时间内产细菌纤维素膜量的测定,并以原始菌株为对照,比较耐受性的变化。
19、本发明的效果是:
20、1.本发明所筛选出的菌株,在木质纤维素水解液中发酵60h细菌纤维素产量为3.4g/l,而相同培养时间内出发菌株细菌纤维素产量为1.1g/l。
21、2.本发明采用梯度迭代驯化的方法,逐级提升菌株木质纤维素水解液耐受性,且多组同时进行筛选,选择其中生长速度快的进行下一轮驯化,提高了菌株筛选的效率。
22、3.本发明采用了传代退化的方法稳定菌株耐受表型,提高了菌株筛选的准确性。
23、4.本发明对木葡萄糖酸醋杆菌产细菌纤维素的量进行测定,提高了筛选的可信度。
24、5.本发明显著提高了菌株耐受性从而提升了细菌纤维素膜的产量。有效利用了农林废弃物等木质纤维素资源,有效降低了细菌纤维素的生产成本。
1.一种木质纤维素衍生抑制剂耐受菌株的筛选方法,其特征在于,包括:以下步骤:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述s1中,hs液体培养基成分包括蛋白胨10g/l、酵母浸出粉7.5g/l、磷酸氢二钠10g/l、葡萄糖25g/l,调节ph为4.9-5.1,调节后于115℃环境中灭菌15min。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述s1中,将木质纤维素水解液中的抑制剂成分配制成复合抑制剂,典型抑制剂成分包括糠醛、苯酚、乙酸,不限制于复合抑制剂且不限制于上述3种成分。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述s2中,将单菌落接种于5mlhs液体培养基30℃过夜培养获得一级种子液,转接部分一级种子液至30mlhs液体培养基,30℃培养48h获得二级种子液。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述s3中,转接部分二级种子液至30ml hs液体培养基,30℃静置发酵.获得细菌纤维素膜。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述s4中,每个浓度进行多轮的驯化,每轮驯化至膜厚度生长至1-3mm结束。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,每轮驯化多组同时进行,选取其中产细菌纤维素膜速度较快的进行下一轮驯化。
8.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述s5中,将驯化后的菌株在hs液体培养基连续传代稳定耐受表型。
9.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述s6中,通过对木葡萄糖酸醋杆菌在规定时间内产细菌纤维素膜的量进行测定,并与原始菌株进行对比,来判断菌株耐受性的提升。