本发明涉及分子生物学,尤其涉及一种e基因突变的重组鸭坦布苏病毒及其制备方法、疫苗。
背景技术:
1、鸭坦布苏病毒(dtmuv)可导致鸭产蛋量大幅下降,死亡率大幅上升,传统疫苗保护效力差,需要多次接种,给养鸭业带来了巨大的经济负担。dtmuv属于黄病毒属,黄病毒科。其基因组只有一个长的独立开放阅读框,编码3个结构蛋白:核衣壳(c)、膜(m)和包膜(e);以及7个非结构蛋白:ns1、ns2a、ns2b、ns3、ns4a、ns4bns5。其中,e蛋白的n糖基化对于病毒的复制、感染性及毒力有重要影响。目前现有文献对于e蛋白n-糖基化的研究都是针对糖基化位点的缺失,如宰俊杰通过对日本乙型脑炎病毒e蛋白第154位氨基酸进行突变,导致了该处糖基化位点的缺失,发现突变后的质粒表达的绝大部分e蛋白构象被破坏,无法被正确折叠,而仅少数的e蛋白具有正确构象,其折叠效率被大打折扣。而增加的糖基化位点对病毒毒力是否会有影响还需进一步研究。因此,构建e基因突变的鸭坦布苏病毒具有重要的意义。
技术实现思路
1、本发明所要解决的技术问题在于,提供了一种e基因突变的重组鸭坦布苏病毒及其制备方法、疫苗,其实现了e基因的突变,为后续疫苗的研究提供了基础。
2、本发明还要解决的技术问题在于,提供上述的突变鸭坦布苏病毒的应用。
3、为了解决上述技术问题,本发明提供了一种e基因突变的重组鸭坦布苏病毒的制备方法,其包括以下步骤:
4、(1)提供/制备含有e基因片段的质粒;
5、(2)采用核苷酸序列如seq id no.1~4所示的引物,以含有e基因片段的质粒为模板进行pcr扩增,得到e-r166k片段和e-d37n片段;
6、(3)将所述e-r166k片段、e-d37n片段同源重组,得到突变质粒e dⅰd37n r166k;
7、(4)将所述突变质粒e di d37n r166k与pf2质粒、pf3质粒、pf4质粒连接,转录为rna后转染细胞,即得到e基因突变的重组鸭坦布苏病毒。
8、作为上述技术方案的改进,其特征在于,步骤(1)中,所述含有e基因片段的质粒为pf1质粒。
9、作为上述技术方案的改进,步骤(2)中,采用核苷酸序列如seq no.1和seq no.4所述的引物对pf1质粒进行pcr扩增,得到e-d37n片段;
10、其中,pcr反应体系包括:2×max buffer 10μl,dntp 4μl,引物各1μl,pf1质粒1μl,phanta max super-fidelity dna polymerase 0.5μl,水32.5μl;
11、pcr反应条件为:98℃预变性3min;98℃变性10s,55℃退火15s,72℃延伸8min,共32个循环;最后72℃延伸10min。
12、作为上述技术方案的改进,步骤(2)中,采用核苷酸序列如seq no.2和seq no.3所述的引物对pf1质粒进行pcr扩增,得到r166k片段;
13、其中,pcr反应体系包括:2×max buffer 10μl,dntp 4μl,引物各1μl,pf1质粒1μl,phanta max super-fidelity dna polymerase 0.5μl,水32.5μl;
14、pcr反应条件为:98℃预变性3min;98℃变性10s,55℃退火15s,72℃延伸8min,共32个循环;最后72℃延伸10min。
15、作为上述技术方案的改进,步骤(3)中,将所述e-r166k片段、e-d37n片段分别进行消化,然后进行同源重组;
16、其中,消化反应体系包括:e-r166k片段或e-d37n片段50μl,dpnⅰ酶1μl;
17、消化反应条件为,在30-40℃恒温反应1-2h。
18、作为上述技术方案的改进,步骤(3)中,将消化后的e-r166k片段、e-d37n片段同源重组,然后转化到dh5α感受态细菌,培养提取得到突变质粒e dⅰd37n r166k;
19、其中,同源重组的反应体系包括:消化后e-r166k片段600ng,e-d37n片段500ng,5×ce ii buffer 4μl,exnase ii 2μl,水补足至20μl;
20、重组反应的反应条件为:在30-40℃反应0.2-1h。
21、作为上述技术方案的改进,步骤(4)中,分别将突变质粒e di d37n r166k与pf2质粒、pf3质粒、pf4酶切线性化,分别得到f1片段、f2片段、f3片段和f4片段,然后连接;
22、其中,酶切体系包括:esp3 i酶4μl,cutsmart缓冲液5μl,各质粒5μg,水补足至50μl;
23、酶切反应条件为,在30-40℃反应4-5h;
24、其中,连接体系包括:f1片段520ng,f2片段470ng,f3片段600ng,f4片段62ng,10×t4 dna ligase buffer 1μl,t4 ligase 1μl,水补足至10μl;
25、连接反应条件为:在15-20℃反应8-24h。
26、作为上述技术方案的改进,将连接产物转录为rna,然后转染至bhk-21细胞,培养后得到e基因突变的重组鸭坦布苏病毒;
27、其中,转录体系包括:连接产物1μg,2×ntp/cap 10μl,10×reaction buffer
28、2μl,gtp 1μl,t7 rnapol enzyme 2μl,rnase-free water补足至20μl;
29、转录反应条件为:30-40℃反应2-4h。
30、相应的,本发明还公开了一种e基因突变的重组鸭坦布苏病毒,其由上述的制备方法制备而得。
31、相应的,本发明还公开了一种鸭坦布苏病毒疫苗,其包括上述的e基因突变的重组鸭坦布苏病毒。
32、实施本发明,具有如下有益效果:
33、本发明制备了e基因突变的重组鸭坦布苏病毒,其实现了e基因的突变,为后续抗鸭坦布苏病毒的疫苗的制备提供了良好的平台。
1.一种e基因突变的重组鸭坦布苏病毒的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
2.如权利要求1所述的e基因突变的重组鸭坦布苏病毒的制备方法,其特征在于,步骤(1)中,所述含有e基因片段的质粒为pf1质粒。
3.如权利要求2所述的e基因突变的重组鸭坦布苏病毒的制备方法,其特征在于,步骤(2)中,采用核苷酸序列如seq no.1和seq no.4所述的引物对pf1质粒进行pcr扩增,得到e-d37n片段;
4.如权利要求2所述的e基因突变的重组鸭坦布苏病毒的制备方法,其特征在于,步骤(2)中,采用核苷酸序列如seq no.2和seq no.3所述的引物对pf1质粒进行pcr扩增,得到e-r166k片段;
5.如权利要求1所述的e基因突变的重组鸭坦布苏病毒的制备方法,其特征在于,步骤(3)中,将所述e-r166k片段、e-d37n片段分别进行消化,然后进行同源重组;
6.如权利要求5所述的e基因突变的重组鸭坦布苏病毒的制备方法,其特征在于,步骤(3)中,将消化后的e-r166k片段、e-d37n片段同源重组,然后转化到dh5α感受态细菌,培养提取得到突变质粒e dⅰd37n r166k;
7.如权利要求1所述的e基因突变的重组鸭坦布苏病毒的制备方法,其特征在于,步骤(4)中,分别将突变质粒e did37n r166k与pf2质粒、pf3质粒、pf4酶切线性化,分别得到f1片段、f2片段、f3片段和f4片段,然后连接;
8.如权利要求7所述的e基因突变的重组鸭坦布苏病毒的制备方法,其特征在于,将连接产物转录为rna,然后转染至bhk-21细胞,培养后得到e基因突变的重组鸭坦布苏病毒;
9.一种e基因突变的重组鸭坦布苏病毒,其特征在于,由如权利要求1-8任一项所述的制备方法制备而得。
10.一种鸭坦布苏病毒疫苗,其特征在于,包括如权利要求9所述的e基因突变的重组鸭坦布苏病毒。