观赏羽衣甘蓝颜色相关的分子标记、引物组及应用

本发明涉及分子育种领域，特别涉及观赏羽衣甘蓝颜色相关的分子标记、引物组及应用。

背景技术：

1、观赏羽衣甘蓝(brassica oleracea var.acephala)是食用甘蓝(卷心菜)的园艺变种，属于十字花科芸苔属(brassica l.)两年生的植物，兼具观赏和食用价值。观赏羽衣甘蓝叶色鲜艳，是冬季和早春重要的观叶植物，在长江流域及其以南地区，多用于布置花坛、花境，或者作为盆栽。观赏羽衣甘蓝具有很高的营养价值，含有丰富的维生素a、维生素b、维生素c、钾、铁、钙等物质，其嫩叶可炒食、凉拌、做汤，常用于搭配各色蔬菜制成色拉。

2、观赏羽衣甘蓝的株型、叶形和叶色丰富，多样性高，研究其及近缘物种的亲缘关系和遗传多样性对资源评价和创制以及新品种培育具有重要意义。分子标记分型技术因具有不受环境影响、测试周期短、供选择的标记数量多、可以进行高通量测序分析的优势，已经广泛用于遗传多样性和亲缘关系分析，新品种鉴定、种子纯度及品种真实性检测，分子标记辅助育种等研究和应用中。不过，目前仍缺少针对观赏羽衣甘蓝的准确、稳定可靠的分子标记。

技术实现思路

1、为了解决现有技术中的至少部分技术问题，本发明提供了一种观赏羽衣甘蓝myb2基因启动子结构变异(sv)的分子标记的特异性引物及应用，从而为观赏羽衣甘蓝分子辅助育种提供理论依据。具体地，本发明包括以下内容。

2、本发明的第一方面，提供一种与观赏羽衣甘蓝颜色相关的分子标记，其能够用于鉴定观赏羽衣甘蓝，所述分子标记为结构变异分子标记，其位于myb2基因启动子上游293bp-580bp。

3、在某些实施方案中，根据本发明所述的与观赏羽衣甘蓝颜色相关的分子标记，其中，所述分子标记具有seq id no.1所示的序列。

4、本发明的第二方面，提供一种引物组合，其用于扩增第一方面所述的分子标记。

5、在某些实施方案中，根据本发明所述的引物组合，其包括正向引物和反向引物，所述正向引物具有seq id no.2所示的序列。

6、在某些实施方案中，根据本发明所述的引物组合，其中，所述反向引物具有seq idno.3所示的序列。

7、本发明的第三方面，提供一种用于鉴定观赏羽衣甘蓝的试剂盒，其包括上述的引物组合。

8、本发明的第四方面，提供本发明所述的分子标记、所述的引物组合，或所述的试剂盒在观赏羽衣甘蓝遗传学分析中的应用。

9、在某些实施方案中，根据本发明所述的应用，其中，所述遗传学分析包括遗传多样性分析、种质鉴定或辅助育种。

10、本发明的第五方面，提供一种用于鉴定植物是否包含观赏羽衣甘蓝的方法，其包括在待鉴定植物的dna中检测是否存在位于myb2基因启动子上游293bp-580bp的分子标记的步骤。

11、在某些实施方案中，根据本发明所述的用于鉴定植物是否包含观赏羽衣甘蓝的方法，其包括以下步骤：

12、(1)从待鉴定植物样品中提取样品dna的步骤；

13、(2)利用正向引物、反向引物通过pcr从所述样品dna中扩增含有所述分子标记的核酸的步骤，其中所述正向引物具有seq id no.2所示的序列，所述反向引物具有seq idno.3所示的序列；和

14、(3)通过电泳检测样品pcr产物的长度来鉴定所述植物。

15、本发明基于观赏羽衣甘蓝和其他甘蓝类蔬菜myb2基因启动子上的结构变异位点开发出的一种sv分子标记，其是观赏羽衣甘蓝中特异的结构变异，通过对检测甘蓝类蔬菜是否存在该sv分子标记，可快速鉴定检测材料是否为观赏羽衣甘蓝。

技术特征：

1.一种与观赏羽衣甘蓝颜色相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记为结构变异分子标记，其位于myb2基因启动子上游。

2.根据权利要求1所述的与观赏羽衣甘蓝颜色相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记具有seq id no.1所示的序列。

3.一种引物组合，其特征在于，其用于扩增权利要求1或2所述的分子标记。

4.根据权利要求3所述的引物组合，其特征在于，包括正向引物和反向引物。

5.根据权利要求4所述的引物组合，其特征在于，所述正向引物具有seq id no.2所示的序列，所述反向引物具有seq id no.3所示的序列。

6.一种用于鉴定观赏羽衣甘蓝的试剂盒，其特征在于，包括权利要求3-5任一项所述的引物组合。

7.根据权利要求1或2所述的分子标记、权利要求3-5任一项所述的引物组合，或权利要求6所述的试剂盒在观赏羽衣甘蓝遗传学分析中的应用。

8.根据权利要求7所述的应用，其特征在于，所述遗传学分析包括遗传多样性分析、种质鉴定或辅助育种。

9.一种用于鉴定植物是否包含观赏羽衣甘蓝的方法，其特征在于，包括在待鉴定植物的dna中检测是否存在位于myb2基因启动子上游结构变异的分子标记的步骤。

10.根据权利要求9所述的用于鉴定植物是否包含观赏羽衣甘蓝的方法，其特征在于，包括以下步骤：

技术总结
本发明公开观赏羽衣甘蓝颜色相关的分子标记、引物组及应用。本发明基于观赏羽衣甘蓝和其他甘蓝类蔬菜MYB2基因启动子上的结构变异位点开发了一种结构变异类型的分子标记，其是观赏羽衣甘蓝中特异的结构变异，通过分子标记检测甘蓝类蔬菜是否存在该结构变异，可快速鉴定检测材料是否为观赏羽衣甘蓝，进而可用于生物技术辅助育种。

技术研发人员：程锋,张扬勇,张磊,李幸,张亢,吕红豪,王勇,王雪霖,季家磊,韩风庆
受保护的技术使用者：中国农业科学院蔬菜花卉研究所
技术研发日：
技术公布日：2024/1/15