一种支原体DNA实时荧光PCR检测试剂盒及使用方法与流程

文档序号:37186261发布日期:2024-03-01 12:50阅读:13来源:国知局
一种支原体DNA实时荧光PCR检测试剂盒及使用方法与流程

本发明涉及生物检测,尤其涉及ipc c12q1,更具体地涉及,一种支原体dna实时荧光pcr检测试剂盒及使用方法。


背景技术:

1、随着现代生物技术的不断发展,生物制剂在临床研究、实验研究方面的应用越来越广,对生物制剂的质量的要求越来越高。

2、在生物制剂生产过程中,容易被实验环境、操作者鼻腔口腔、实验器材等地方的支原体污染,从而影响生物制品的质量,因此支原体dna的检测是生物制品的重要质控标准。

3、现有专利cn201611225518.0公开了一种猪肺炎支原体的实时荧光pcr检测试剂盒及其用途,针对猪肺炎支原体p46基因序列设计的taqman荧光探针及引物,该试剂盒能够特异性地检测猪肺炎支原体,并具有较高的灵敏度,特异性强和重复性优,可以实现大通量样品的检测。但该试剂盒只适用于一种支原体的检测,且适用于特定场所。无法全面检测生物制剂中大部分支原体。


技术实现思路

1、为了解决现有技术中的问题,本发明第一方面提供了一种支原体dna实时荧光pcr检测试剂盒,包括buffer、引物-探针混合物、内控、阳性模板、无菌水;所述引物-探针混合物包括支原体引物、支原体探针、内控引物和内控探针;所述引物和探针序列包括seq idno.1~6。

2、优选的,所述的buffer包括氯化钾、tris-hcl、氯化镁;进一步优选的,包括400~600mm氯化钾、80~120mm tris-hcl、10~20mm氯化镁。

3、在一种优选的方案中,所述的buffer为500mm氯化钾、100mm tris-hcl(ph8.3)、15mm氯化镁。

4、优选的,所述引物-探针混合物包括8~12μm浓度的支原体引物、8~12μm浓度的支原体探针、8~12μm浓度的内控引物和8~12μm浓度的内控探针;进一步优选的,为10μm浓度的支原体引物、10μm浓度的支原体探针、10μm浓度的内控引物和10μm浓度的内控探针。

5、优选的,所述支原体引物包括支原体上游引物和支原体下游引物;所述内控引物包括内控上游引物和内控下游引物。

6、优选的,所述支原体上游引物为seq id no.1:atgcatcagtacctgag;所述支原体下游引物为seq id no.2:tacgtcgccaacttctgc;所述支原体探针序列为seq id no.3:gtttctcggcaagtgaacgcca;n端与fam基团相连、c端与bhq1基团相连。

7、优选的,所述内控上游引物为seq id no.4:taacatgctcgagggccttac,所述内控下游引物为seq id no.5:tgccttagcagtgccctgtc;所述内控探针序列为seq id no.6:tccacccgtagggagcgtcaac;n端与hex基团相连、c端与bhq1基团相连。

8、优选的,所述支原体包括口腔支原体、关节液支原体、鸡毒支原体、精氨酸支原体、莱氏无胆甾原体、猪鼻支原体、发酵支原体、柠檬螺原体、肺炎支原体、唾液支原体。

9、本发明中,通过特定的引物和探针,能特异性扩增ep2.6.7和jp xvii中提到的口腔支原体、关节液支原体、鸡毒支原体、精氨酸支原体、莱氏无胆甾原体、猪鼻支原体、发酵支原体、柠檬螺原体、肺炎支原体、唾液支原体10中支原体,而对其它生物制剂中常见的污染细菌和基因组无扩增现象,减少了其它因素对检测结果的影响,提高了检测试剂盒的准确性。本发明人通过对ep2.6.7和jp xvii中10种支原体的研究,创造性地设计了特定的上游引物、下游引物和探针,该特定的上游引物、下游引物和探针与10种支原体匹配性和特异性能好,且具有高度保守的特异荧光探针,引物在进行扩增的过程中,探针发生酶解,能够使荧光积累从而被仪器检测到,并且与其他常见的污染源无交叉。

10、优选的,所述内控的碱基序列为seq id no.7:aacatgctcgagggccttacggcccccgtgggatgctcctacatgtcagga acagttactgacgtaataacgggtgagtccatcataagcgttgacgctccc tacgggtggactgtggagagacagggcactgctaaggc。

11、优选的,所述阳性模板的碱基序列为seq id no.8:gaaaggcgcgcgatacagggtgacagccccgtacacaaaaatgcacatgc tgtgagctcgatgagtagggcgggac。

12、本发明中,通过设置特定的内控和阳性模板,从而提高试剂盒检测的准确度。本发明人发现,当检测特定的10种支原体时,需要有特定的内控和阳性模板作为对照,当内控和阳性模板的碱基序列不恰当,容易导致检测的灵敏度计准确性。本发明人创造性地设计了内控和阳性模板,能相对定量的测出目的支原体的相对表达量。同时,特异性地设计了阳性对照,含有10种支原体共有序列,进而提高了试剂盒检测的准确性。

13、优选的,所述无菌水为纯净水。

14、优选的,所述本发明中的碱基序列由生工、金唯智国内生物合成公司合成。

15、目前,市面上售卖的试剂盒的标准品的扩增效率都较低,且不稳定,且在用于实际操作时,需要操作者在上机检测前进行pcr反应液的配置,该过程繁琐,且操作者很难保证不同批配置的反应液是完全一样的,若是用于比较样品的前后差异,其数据可靠性难以让人信服。本发明中采用的试剂盒简化qpcr反应操作的反应液配置时的操作步骤,试剂盒中有配置好的试剂,可直接用于实验,减少操作者的工作量,节约整个操作时间,且若是用于连续性检测,可使检测结果更具比较性。

16、本发明第二方面提供了一种支原体dna实时荧光pcr检测试剂盒的使用方法,包括配制预混液,加入反应孔、设置qpcr程序、结果判定。

17、所述支原体dna实时荧光pcr检测试剂盒的具体使用方法,具体步骤为:

18、s1:配制预混液:将各试剂于冰上融解,buffer试剂上下颠倒轻轻混匀后轻轻离心,其他试剂涡旋混匀后轻微离心;按照表1的组分配制预混液。

19、s2:加入反应孔:按照表2分组,将对应的模板加入到反应孔底部;

20、s3:设置qpcr程序:选择双通道水解探针法程序(fam为支原体检测通道、hex为内控检测通道)设置反应程序,见表3

21、s4:结果判定:阳性:fam通道和hex通道都有扩增曲线,fam通道的ct值小于40;

22、阴性:hex通道都有扩增曲线,fam通道没有扩增曲线,fam通道的ct值大于40;

23、无效结果:hex通道没有扩增曲线,ct值大于40;

24、表1

25、 试剂组分 单孔用量 buffer 15μl 引物-探针混合物 4μl 内控 1μl 总体积 20μl

26、表2

27、 阴性组 10μl无菌水+20μl预混液 阳性组 10μl阳性模板+20μl预混液 实验组 10μl待测样品+20μl预混液

28、表3

29、

30、有益效果

31、1、本发明中,通过特定的引物和探针,能特异性扩增ep2.6.7和jp xvii中提到的口腔支原体、关节液支原体、鸡毒支原体、精氨酸支原体、莱氏无胆甾原体、猪鼻支原体、发酵支原体、柠檬螺原体、肺炎支原体、唾液支原体10中支原体,而对其它生物制剂中常见的污染细菌和基因组无扩增现象,减少了其它因素对检测结果的影响,提高了检测试剂盒的准确性。

32、2、本发明中,通过特定的500mm氯化钾、100mm tris-hcl(ph 8.3)、15mm氯化镁,提高了试剂盒的准确度。尤其是mg2+的含量能影响试剂盒的特异性和扩增片段的产率。

33、3、本发明中,通过设置特定的内控和阳性模板,从而提高试剂盒检测的准确度。

34、4、本发明中采用的试剂盒简化qpcr反应操作的反应液配置时的操作步骤,试剂盒中有配置好的试剂,可直接用于实验,减少操作者的工作量,节约整个操作时间,且若是用于连续性检测,可使检测结果更具比较性。

35、5、试剂盒已完成方法学验证,检测快速,专一性强,性能可靠。

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