一种猪SNP位点、引物、试剂盒在猪产仔性状筛选中的应用的制作方法

本发明涉及生物育种，具体涉及一种猪snp位点、引物、试剂盒在猪产仔性状筛选中的应用。

背景技术：

1、随着分子生物学相关技术的发展与计算机科学的广泛应用，更多的遗传信息被发掘且对信息的利用效率有了质的飞跃，动物育种从仅利用表型数据的传统选种选育方法发展为利用遗传信息结合表型数据的基因组选择法(genomic selection,gs)。猪作为国内外重要的食用动物且猪肉的供应绝大部分来源于杂交后代，因此将基因组选择应用于猪杂交育种以提升商品猪的性能还需要进行深入探讨。中国作为养猪大国，拥有全球最大的猪肉产品消费市场，为提升猪的生产性能和养猪产业的核心竞争力，目前基因组选择已初步应用于我国良种猪纯繁育种及地方猪改良并卓有成效。

2、蕨麻猪是一种小型、独特的原始藏系猪种，由野猪驯化而来。蕨麻猪产仔数不高，1岁母猪年产一窝，经产母猪年产2窝或2年3窝，每窝平均产仔3.74头。初产母猪每窝产仔1～3头、经产母猪每窝4～7头，最多可达8～10头。蕨麻猪作为藏猪在甘肃省甘南地区的一个分支，从多年产业发展的情况来看，其本品种选育特别是在一些低遗传力和难以测定的性状方面，传统育种的方法效果甚微。所以针对现在巨大的消费市场和需求，急需采用更加高效和准确的育种技术如分子标记辅助育种、基因组选择等，促进养殖行业的快速和稳定发展。

技术实现思路

1、为解决以上所述问题，本发明提供一种蕨麻猪snp位点、引物、试剂盒在猪产仔性状筛选中的应用。本发明首次挖掘得到能够影响蕨麻猪产仔性状的重要分子标记ssc.x:101892220c>t，为快速有效地提高蕨麻猪繁殖性能，提高蕨麻猪经济效益奠定基础。

2、为实现上述目的，本发明采用以下技术方案：

3、ssc.x:101892220c>t位点在猪产仔性状筛选中的应用，所述位点位于x染色体101892220bp位置c>t的突变点，所述位点为sus scorfa 11.1版的基因组位置。

4、进一步地，所述猪繁殖性能鉴别包括总产仔数和产活仔数。

5、进一步地，所述猪为蕨麻猪。

6、进一步地，通过检测ssc.x:101892220c>t位点的基因型鉴别猪产仔性能，ssc.x:101892220c>t位点tt基因型个体产仔性能优于其它基因型。

7、用于扩增ssc.x:101892220c>t位点的引物，所述引物：

8、上游序列为：5'ggaccatttcatcgg 3'(seq id no:1所示)，

9、下游序列为：5'atagcctaacaaagagtg 3'(seq id no:2所示)。其扩增序列如seqid no:3所示。

10、用于鉴别猪产仔性能的试剂盒，所述试剂盒包含以上所述引物。

11、所述引物或所述试剂盒在猪产仔性状筛选中的应用。

12、与现有技术相比，本发明具有以下优势：

13、本发明筛选得到了一种能够显著影响蕨麻猪产仔性状的分子标记ssc.x:101892220c>t，通过ssc.x:101892220c>t位点tt型个体的选育，使得总产仔数由5.88头提升到10.67头，产活仔数从5.58头提升到9.33头，该分子标记可有效用于蕨麻猪产仔性能鉴别和/或育种中。

技术特征：

1.ssc.x:101892220c>t位点在在猪产仔性状筛选中的应用，其特征在于，所述位点位于x染色体101892220bp位置c>t的突变点，所述位点为sus scorfa11.1版的基因组位置。

2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述猪产仔性状包括总产仔数和产活仔数。

3.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述猪为蕨麻猪。

4.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，通过检测ssc.x:101892220c>t位点的基因型鉴别猪产仔性能，ssc.x:101892220c>t位点tt基因型个体产仔性能优于其它基因型。

5.用于扩增ssc.x:101892220c>t位点的引物，其特征在于，所述引物:

6.用于鉴别猪产仔性能的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包含权利要求5所述引物。

7.权利要求5所述引物或权利要求6所述试剂盒在在猪产仔性状筛选中的应用。

技术总结
本发明涉及生物育种技术领域，具体涉及一种猪SNP位点、引物、试剂盒在猪产仔性状筛选中的应用。本发明首次挖掘得到能够影响蕨麻猪产仔性状的重要分子标记Ssc.X:101892220C>T，通过对Ssc.X:101892220C>T位点TT型个体的选育，有效提高了蕨麻猪的总产仔数和产活仔数，本发明为快速有效地提高蕨麻猪繁殖性能，提高蕨麻猪经济效益奠定基础。

技术研发人员：旦智草,闫峻,袁淑芳,张丰霞,才让东智,丁兴文,刘正群,李宁,梁世岳,郑梓,安主草曼
受保护的技术使用者：甘南藏族自治州科学技术情报研究所
技术研发日：
技术公布日：2024/3/12