与鸡蛋赤道蛋壳厚度关联的SNP遗传标记在鸡遗传育种中的应用的制作方法

本发明属于家禽遗传育种和畜禽遗传标记，特别涉及与鸡蛋赤道蛋壳厚度关联的snp遗传标记在鸡遗传育种中的应用。

背景技术：

1、蛋壳，于鸡蛋而言，具有重要的生理学功能。蛋壳拥有机械支撑作用，减少了细菌滋生，使鸡蛋免受外界伤害。蛋壳主要由碳酸钙组成，为胚胎发育提供充足的钙源，蛋壳内部有气孔，是鸡蛋与外界交换气体和金属离子的通道，蛋壳厚度与鸡蛋货架期失重有关。蛋壳超微结构由内到外依次为内、外蛋壳膜、乳突层、栅栏层、垂直晶体层和胶护膜(角质层)，蛋壳厚度则由栅栏层决定。蛋壳形成过程由复杂的基因网络调控，因而，蛋壳厚度是多基因控制的数量性状，具体的遗传结构至今并不清楚。

技术实现思路

1、为了解决鸡蛋壳厚度不足的问题，本发明提供了与鸡蛋赤道蛋壳厚度关联的snp遗传标记在鸡遗传育种中的应用，所述snp遗传标记有助于从遗传上改善鸡蛋壳品质，将该snp遗传标记应用于鸡的遗传育种，有利于获得蛋壳厚度优异的鸡品种。

2、本发明通过以下技术方案实现：

3、本发明提供与鸡蛋赤道蛋壳厚度关联的snp遗传标记在鸡遗传育种中的应用，所述与鸡蛋赤道蛋壳厚度关联的snp遗传标记包括est_itpr25，所述est_itpr25对应于ncbi中公布的鸡参考基因组bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息1号染色体第67879581位，ensemble编号为rs315787031，属于基因itpr2第25内含子，此处碱基为a或g。

4、基于同一发明构思，本发明提供一种鸡蛋赤道蛋壳厚度性状的早期选择方法，所述早期选择方法包括基于snp遗传标记est_itpr25的基因型对鸡蛋赤道蛋壳厚度性状进行早期选择；

5、所述est_itpr25对应于ncbi中公布的鸡参考基因组bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息1号染色体第67879581位，ensemble编号为rs315787031，属于基因itpr2第25内含子，此处碱基为a或g。

6、进一步的，所述早期选择方法具体包括：

7、检测待测鸡est_itpr25的基因型；

8、基于所述est_itpr25的基因型对待测鸡的鸡蛋赤道蛋壳厚度性状进行早期选择；

9、其中，所述est_itpr25的gg基因型个体的赤道蛋壳厚度大于ga基因型个体的赤道蛋壳厚度，ga基因型个体的蛋壳厚度大于aa基因型个体的赤道蛋壳厚度。

10、进一步的，所述检测待测鸡est_itpr25的基因型，具体包括：

11、以p_est25f和p_est25r为引物，对待测鸡的基因组dna进行pcr扩增；

12、对pcr扩增产物进行测序，获得待测鸡1号染色体正义链第67879581位的基因型；

13、其中，所述p_est25f的核苷酸序列如seq id no.1所示，所述p_est25r的核苷酸序列如seq id no.2所示。

14、进一步的，所述待测鸡的品种包括东乡绿壳蛋鸡和/或白来航鸡。

15、基于同一发明构思，本发明提供用于检测与鸡蛋赤道蛋壳厚度关联的snp遗传标记的引物，包括检测est_itpr25的引物，所述检测est_itpr25的引物包括p_est25f和p_est25r，所述p_est25f的核苷酸序列如seq id no.1所示，所述p_est25r的核苷酸序列如seq id no.2所示；

16、所述est_itpr25对应于ncbi中公布的鸡参考基因组bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息1号染色体第67879581位，ensemble编号为rs315787031，位于基因itpr2第25内含子，此处碱基为a或g。

17、基于同一发明构思，本发明提供上述用于检测与鸡蛋赤道蛋壳厚度关联的snp遗传标记的引物在鸡遗传育种中的应用。

18、基于同一发明构思，本发明还提供一种试剂盒，所述试剂盒包含上述用于检测与鸡蛋赤道蛋壳厚度关联的snp遗传标记的引物。

19、基于同一发明构思，本发明还提供上述一种试剂盒在鸡遗传育种中的应用。

20、本发明实施例中的一个或多个技术方案，至少具有如下技术效果或优点：

21、1.本发明与鸡蛋赤道蛋壳厚度关联的snp遗传标记在鸡遗传育种中的应用，所述与鸡蛋赤道蛋壳厚度关联的snp遗传标记为est_itpr25，该snp遗传标记有助于从遗传上提高鸡蛋赤道蛋壳厚度，进而提升鸡蛋蛋壳品质，将其应用于鸡的遗传育种，有利于获得蛋壳厚度更高的鸡品种。

22、2.本发明与鸡蛋赤道蛋壳厚度关联的snp遗传标记在鸡遗传育种中的应用，将snp遗传标记est_itpr25应用于鸡的遗传育种，有利于辅助筛选出高蛋壳厚度的蛋鸡，从遗传上减少蛋鸡在产蛋后期出现的软壳蛋、砂壳蛋等问题，避免产蛋后期蛋壳质量下降，实现在不降低蛋壳厚度的前提下延长产蛋周期，从而提高养殖收益。

技术特征：

1.与鸡蛋赤道蛋壳厚度关联的snp遗传标记在鸡遗传育种中的应用，其特征在于，所述与鸡蛋赤道蛋壳厚度关联的snp遗传标记包括est_itpr25，所述est_itpr25对应于ncbi中公布的鸡参考基因组bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息1号染色体第67879581位，ensemble编号为rs315787031，属于基因itpr2第25内含子，此处碱基为a或g。

2.一种鸡蛋赤道蛋壳厚度性状的早期选择方法，其特征在于，所述早期选择方法包括基于snp遗传标记est_itpr25的基因型对鸡蛋赤道蛋壳厚度性状进行早期选择；

3.根据权利要求2所述的一种鸡蛋赤道蛋壳厚度性状的早期选择方法，其特征在于，所述早期选择方法具体包括：

4.根据权利要求3所述的一种鸡蛋赤道蛋壳厚度性状的早期选择方法，其特征在于，所述检测待测鸡est_itpr25的基因型，具体包括：

5.根据权利要求3或4所述的一种鸡蛋赤道蛋壳厚度性状的早期选择方法，其特征在于，所述待测鸡的品种包括东乡绿壳蛋鸡和/或白来航鸡。

6.用于检测与鸡蛋赤道蛋壳厚度关联的snp遗传标记的引物，其特征在于，包括检测est_itpr25的引物，所述检测est_itpr25的引物包括p_est25f和p_est25r，所述p_est25f的核苷酸序列如seq id no.1所示，所述p_est25r的核苷酸序列如seq id no.2所示；

7.如权利要求6所述的引物在鸡遗传育种中的应用。

8.一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包含如权利要求6所述的引物。

9.如权利要求8所述的一种试剂盒在鸡遗传育种中的应用。

技术总结
本发明提供了与鸡蛋赤道蛋壳厚度关联的SNP遗传标记在鸡遗传育种中的应用，属于家禽遗传育种和畜禽遗传标记技术领域，所述与鸡蛋赤道蛋壳厚度关联的SNP遗传标记包括EST_ITPR25，所述EST_ITPR25的ensemble编号为rs315787031，对应于NCBI中公布的鸡参考基因组bGalGal1.mat.broiler.GRCg7b版本序列信息1号染色体第67879581位，属于基因ITPR2第25内含子，此处碱基为A或G。所述SNP遗传标记有助于从遗传上改善鸡蛋壳品质，将该SNP遗传标记应用于鸡的遗传育种，有利于获得蛋壳厚度优异的鸡品种。

技术研发人员：曲亮,郭军,童海兵,邵丹,王星果,窦套存,胡玉萍,李永峰
受保护的技术使用者：江苏省家禽科学研究所
技术研发日：
技术公布日：2024/2/25