一种利用溶解曲线法同时检测10种生殖病原体核酸的恒温扩增检测试剂盒及其应用的制作方法

文档序号:37519669发布日期:2024-04-01 14:34阅读:19来源:国知局
一种利用溶解曲线法同时检测10种生殖病原体核酸的恒温扩增检测试剂盒及其应用的制作方法

本发明涉及一种恒温扩增检测试剂盒,具体涉及一种利用溶解曲线法同时检测10种生殖病原体核酸的恒温扩增检测试剂盒及其应用。


背景技术:

1、泌尿生殖道感染也称之为性传播疾病,是以性接触为主要传播方式的一组疾病,性传播感染是世界范围内重要的公共卫生问题,严重影响患者生活质量,并具有高发病率和致死率的特点。其对生育、婴儿健康、癌症以及孕期并发症具有直接影响,还可加快hiv的传播。

2、目前检测生殖病原体的分子检测技术主要为基于dna检测的pcr荧光定量法及基于rna检测的sat法。pcr荧光定量法一管检测灵敏度高但指标少,一般为1-4个指标,且检测dna无法判断病原体是否存活,可能存在假阳性结果。用于rna检测的sat法,检测灵敏度高,且由于靶标为rna,可以判断病原体是否存活,但其同样存在单管检测靶标较少,一般为1-4个靶标,且由于单管用酶较多,单指标检测成本较高。

3、以rna为检测模板的等温扩增技术,目前主要是以amv为逆转录酶的基于核酸序列的扩增技术及以mmlv为逆转录酶的tma及sat扩增技术,该两种方法扩增原理几乎完全相同,只是逆转录酶种类存在差别。目前国内针对泌尿生殖道病原体检测主要应用的是tma及sat扩增技术。该两种方法的主要区别在于扩增产物的检测方法,tma主要在反应完成后对产物进行hpa及杂交保护检测,该检测方法由于在反应完成后仍然需要开盖进行检测,一定程度增加了污染的可能。

4、sat检测则通过在反应体系中加入诸如分子信标等探针,对反应进行不开盖实时报告及检测技术(200810111479.0,核酸恒温同步放大检测方法及应用),该方法可在扩增发生产物产生时利用分子信标进行实时检测,利用扩增曲线的有无进行结果的判断,该检测灵敏度高,且不开盖检测,污染可能性小。但该方法目前针对4通道机器单管最多只能分别检测两到三个指标,且实验的rna聚合酶及反转录酶量较多,单个指标成本较高。

5、多通道溶解曲线技术是一种pcr终点检测技术,在pcr扩增结束之后,利用温度的升高实现探针与目的单链的逐渐解链,发生荧光值的变化,通过仪器生成探针熔解曲线。依靠探针tm值的差异,可以在同一管内实现多重检测,使用不同荧光标记的探针,即可实现多通道多重检测。如何将两个维度技术的结合是迫切需要解决的。


技术实现思路

1、为解决检测通量少、单指标检测成本较高的问题,本发明提供一种利用溶解曲线法同时检测10种生殖病原体核酸的恒温扩增检测试剂盒。本发明是等温扩增结合溶解曲线的分析方法,不同于sat方法使用分子信标进行同步放大检测方式,由于等温扩增的产物主要为rna单链,故可以反应完成后的终点检测的溶解曲线分析进行检测,在设计结合探针时,相同荧光通道设计为不同的溶解温度(tm值),通过溶解曲线溶解峰的差异达到判断不同指标的目的。

2、本发明提供如下技术方案:

3、一种利用溶解曲线法同时检测10种生殖病原体核酸的恒温扩增检测试剂盒,10种生殖病原体为沙眼衣原体、淋病奈瑟菌、人型支原体、生殖支原体、解脲脲原体、微小脲原体、单纯疱疹病毒1型、单纯疱疹病毒2型、梅毒螺旋体、阴道毛滴虫,试剂盒包括:

4、1)扩增反应液:含10-150mm kcl,5-30mm mgcl2,10-150mm tris-hcl,0.1-5mmdntp,0.1-8mm ntp,3%-30%甘油,1-20mm dtt,0.1-5mm精氨酸,0.05-2mm甲酰胺,0.05-2μm扩增引物1,0.05-2μm扩增引物2;

5、扩增引物有十对:沙眼衣原体、淋病奈瑟菌、人型支原体、生殖支原体、解脲脲原体、微小脲原体、单纯疱疹病毒1型、单纯疱疹病毒2型、梅毒螺旋体、阴道毛滴虫,具体的:

6、(1)沙眼衣原体的扩增引物:

7、ct-扩增引物1:tttgagttctgcttcctccttgc

8、ct-扩增引物2:aattctaatacgactcactataggggcaaggatcgcaaggatctcc

9、(2)淋病奈瑟菌的扩增引物:

10、ng-扩增引物1:cgcacaactctcaaaccgaag

11、ng-扩增引物2:aattctaatacgactcactatagggcagaagtgcgtttggagaagtc

12、(3)人型支原体的扩增引物:

13、mh-扩增引物1:tttggtcaagtcctgcaacga

14、mh-扩增引物2:aattctaatacgactcactatagggccccaccttcctcccagtta

15、(4)生殖支原体的扩增引物:

16、mg-扩增引物1:catagttcattatgcgcaccagttacttg

17、mg-扩增引物2:aattctaatacgactcactatagggctctttaacaacaggggttgggat tag

18、(5)解脲脲原体的扩增引物:

19、uu-扩增引物1:cattgatgttgcacaaggag

20、uu-扩增引物2:aattctaatacgactcactatagggcgtgattttaatgtatcggctttc

21、(6)微小脲原体的扩增引物:

22、up-扩增引物1:cattgatgttgcacaaggag

23、up-扩增引物2:aattctaatacgactcactatagggcgtgattttaatgtatcggctttc

24、(7)单纯疱疹病毒1型的扩增引物:

25、hsv1-扩增引物1:tcctcgaagtacacgtagccc

26、hsv1-扩增引物2:aattctaatacgactcactatagggtacagccgccccctggt

27、(8)单纯疱疹病毒2型的扩增引物:

28、hsv2-扩增引物1:tcctcgaagtacacgtagccc

29、hsv2-扩增引物2:aattctaatacgactcactatagggtacagccgccccctggt

30、(9)梅毒螺旋体的扩增引物:

31、tp-扩增引物1:cgctatttctcgtcgctggt

32、tp-扩增引物2:aattctaatacgactcactataggggaacgtgcctgcctcccc

33、(10)阴道毛滴虫的扩增引物:

34、tv-扩增引物1:ggctgatgaggagtagggttt

35、tv-扩增引物2:

36、aattctaatacgactcactatagggggcggagaaaaatagtatgcgttgc

37、2)酶反应液:1-800u逆转录酶,10-1000u rna聚合酶,0-200u rna酶抑制剂,10%-50%甘油10-200mm tris-hcl,20-200mm kcl,0.1-5mm dtt,0.1-1μg/μl bsa,0-0.5u核糖核酸酶h;

38、3)探针0.05-2μm,探针是一种或多种荧光探针,荧光探针的类型为taqman荧光探针、分子信标或蝎型探针。

39、酶反应液含有四种酶如下:

40、rna聚合酶:t7 rna聚合酶、t3 rna聚合酶、m13 rna聚合酶、sp6 rna聚合酶;

41、逆转录酶:amv反转录酶或mmlv反转录酶;

42、具有降解rna&dna杂交链中rna链活性的核糖核酸酶h;

43、抑制核糖核酸酶a,b,c的鼠源或人源的rna酶抑制剂。

44、扩增引物1与目的核酸负链5'杂交的一段核酸序列;

45、扩增引物2的5'端为rna聚合酶(t7 rna聚合酶,t3 rna聚合酶,m13 rna聚合酶,sp6 rna rna聚合酶)启动子,3'端与目的核酸3'杂交的一段核酸序列。

46、探针一端标记有荧光基团(包括atto425、fam、vic/hex/joe、rox、cy5,cy5.5),探针另一端标记有淬灭基团(包括mgb,bhq1,bhq2,bhq3,dabcyl等)。

47、荧光探针序列为:

48、(1)沙眼衣原体的荧光探针:

49、ct-荧光探针:fam-ctgcctgtggggaatcctgctga-bhq1

50、(2)淋病奈瑟菌的扩增引物:

51、ng-荧光探针:fam-tttcttacgcccacgg-bhq1

52、(3)人型支原体的扩增引物:

53、mh-荧光探针:fam-actaacattaagttgaggactc-mgb

54、(4)生殖支原体的扩增引物:

55、mg-荧光探针:hex-ggtgtggatcgagcg-bhq1

56、(5)解脲脲原体的扩增引物:

57、uu-荧光探针:hex-ttgtccgcctttacgag-mgb

58、(6)微小脲原体的扩增引物:

59、up-荧光探针:hex-ttgaccacccttacg-mgb

60、(7)单纯疱疹病毒1型的扩增引物:

61、hsv1-荧光探针:rox-cggctgacgcgcgat-bhq2

62、(8)单纯疱疹病毒2型的扩增引物:

63、hsv2-荧光探针:rox-acccgcgacgcgctcg-bhq2

64、(9)梅毒螺旋体的扩增引物:

65、tp-荧光探针:rox-ctgaatgtggaggagcagtcgacggc-bhq2

66、(10)阴道毛滴虫的扩增引物:

67、tv-荧光探针:cy5-caacttaaacagatccagagttagtcga-bhq3

68、同一荧光通道、不同指标的探针与目的核酸负链杂交的tm值不同,其在体系中的tm值为45-80摄氏度。

69、检测方法:

70、将扩增反应液与模板混合后37-70℃孵育1-30min后,加入酶反应液继续37-50℃孵育30-120min扩增反应结束后,温度以0.01-0.1℃缓慢上升至65-90℃,开始收集溶解曲线,观察仪器溶解峰型,判断是否存在目的核酸。

71、本发明预期可一管同时检测10种泌尿生殖道病原体,包括沙眼衣原体(chlamydiatrachomatis,ct),淋病奈瑟菌(neisseria gonorrhoeae,ng),人型支原体(mycoplasmahominis,mh),生殖支原体(mycoplasma.genitalium,mg)解脲脲原体(ureaplasmaurealyticum,uu),微小脲原体(ureaplasma parvum,up),单纯疱疹病毒1型(herpessimplex virus type 1,hsv1),单纯疱疹病毒2型(herpes simplex virus type 2,hsv2)梅毒螺旋体(treponema pallidum,tp),阴道毛滴虫(trichomonas vaginalis,tv)。

72、与现有技术相比,本发明的有益效果是:

73、1、通过等温扩增结合溶解曲线的分析方法,在同一管内能够同时扩增沙眼衣原体、淋病奈瑟菌、人型支原体、生殖支原体、解脲脲原体、微小脲原体、单纯疱疹病毒1型、单纯疱疹病毒2型、梅毒螺旋体、阴道毛滴虫十个指标,实现多通道多重检测,两个维度技术的结合,可以大大增加检测通量;

74、2、rna检测,判断病原体是否存活,减少假阳性检出,抗生素滥用;

75、3、较常规的sat检测方法单管检测并区分1-4个指标,该发明pcr终点溶解曲线检测单管可检测并区分十个指标,单指标检测成本低;

76、4、闭管检测,且扩增出的核酸产物为rna,不易污染。

当前第1页1 2 
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1