使用APOE4基序介导的基因以用于诊断和治疗阿尔茨海默氏病的制作方法

文档序号:18744254发布日期:2019-09-21 02:09阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种用于测量载脂蛋白E 4“APOE4”基序介导的基因或其表达产物的活性的分析,所述分析包括:

能够产生由APOE4基序介导的基因的表达产物的细胞;

APOE4基序介导的基因的表达产物;或

其组合。

2.根据权利要求1所述的分析,其中所述细胞包括哺乳动物神经细胞、哺乳动物多能干细胞或由其衍生的细胞,或其组合。

3.根据权利要求1所述的分析,其中所述分析用于测量基因转录、基因转译的活性或所述基因表达产物的生物活性。

4.一种用于鉴别潜在地适用于治疗阿尔茨海默氏病AD的化合物的方法,所述方法包括:

使测试化合物与根据权利要求1所述的分析接触;

在所述分析中测定载脂蛋白E 4“APOE4”基序介导的基因表达的调节水平或APOE4基序介导的基因表达产物的活性的调节水平,或其组合;

其中当与不存在所述测试化合物的情况下的APOE4基序介导的基因表达的活性相比较,APOE4基序介导的基因表达的活性或APOE4基序介导的基因表达产物的活性水平在存在所述测试化合物的情况下调节时,那么其为所述测试化合物潜在地适用于治疗阿尔茨海默氏病的指示。

5.根据权利要求4所述的方法,其中所述方法包括测定APOE4基序介导的基因转录、APOE4基序介导的基因转译、APOE4基序介导的基因表达产物的生物功能或其组合的水平。

6.根据权利要求4所述的方法,其中所述调节为抑制。

7.根据权利要求4所述的方法,其中所述APOE4基序介导的基因位于rs429358的约2Mb内的人类染色体19上。

8.根据权利要求4所述的方法,其中所述APOE4基序介导的基因选自由以下组成的组:PSG1、XRCC1、PINLYP、IRGQ、ZNF576、SRRM5、ZNF428、PLAUR、SMG9、ZNF224、ZNF285、ZNF180、PVR、BCL3、CBLC、BCAM、PVRL2/NECTIN2、CLPTM1、RELB、CLASRP、GEMIN7、MARK4、PPP1R37、NKPD1、TRAPPC6A、BLOC1S3、EXOC3L2、CKM、KLC3、ERCC2、PPP1R13L、ERCC1、FOSB/ΔFOSB、RTN2、VASP、OPA3、GPR4、EML2、GIPR、SNRPD2、QPCTL、FBXO46、SIX5、SYMPK、FOXA3、MYPOP、NOVA2、CCDC61、HIF3A、PPP5C、PNMA8A/PNMAL1、PNMA8B/PNMAL2、DACT3、STRN4、FKRP,和其组合。

9.根据权利要求8所述的方法,其中所述APOE4基序介导的基因选自由以下组成的组:FBXO46、SNRPD2、ZNF285、ZNF180、PVR、ERCC2、QPCTL、SYMPK、MYPOP、CCDC61、XRCC1、ZNF576、ZNF428、SMG9、PPP5C、PNMA8A/PNMAL1、PNMA8B/PNMAL2、DACT3、STRN4、FKRP、RTN2、IRGQ、SRRM5、FOXA3、FOSB/ΔFOSB、SIX5、GPR4,和其组合。

10.根据权利要求8所述的方法,其中所述APOE4基序介导的基因选自由以下组成的组:FBXO46、PPP5C、FKRP、SYMPK、FOSB/ΔFOSB、FOXA3、GPR4、PSG1、PPP1R13L、EXOC3L2、SIX5、PLAUR、KLC3,和其组合。

11.根据权利要求8所述的方法,其中所述分析为小分子库的高通量筛选分析。

12.根据权利要求11所述的方法,其进一步包括鉴别在所述分析中具有抑制性活性的抑制剂且使所述抑制剂经历第二次分析的步骤。

13.根据权利要求4所述的方法,其中所述测试化合物选自由以下组成的组:小分子、寡核苷酸或其衍生物,或肽或其衍生物。

14.根据权利要求13所述的方法,其中所述寡核苷酸为小干扰RNA。

15.根据权利要求4所述的方法,其中所述APOE4基序介导的基因为MIR4531、MIR8085、MIR6088、MIR330、MIR642A、MIR642B、MIR769、MIR320E和其组合,且所述测试化合物为锁核酸修饰的寡核苷酸。

16.一种用于抑制APOE4基序介导的基因或APOE4基序介导的基因表达产物在细胞中的活性的方法,所述方法包括使表达所述APOE4基序介导的基因的细胞与能够抑制所述APOE4基序介导的基因或APOE4基序介导的基因表达产物的活性的化合物接触。

17.根据权利要求16所述的方法,其中所述化合物为寡核苷酸或其衍生物、肽或其衍生物,或抗体或其抗原结合片段,其中所述抗体选择性结合于APOE4基序介导的基因表达产物。

18.一种用于治疗或预防阿尔茨海默氏病的治疗剂,其包括已鉴别为降低APOE4基序介导的基因表达的水平或APOE4基序介导的基因表达产物的活性水平的根据权利要求4所述的测试化合物。

19.一种用于治疗AD的治疗剂,其包括抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段选择性结合于APOE4基序介导的基因的表达产物。

20.根据权利要求19所述的治疗剂,其中所述抗体或所述其抗原结合片段结合于APOE4基序介导的基因表达产物的胞外域。

21.根据权利要求19所述的治疗剂,其中所述抗体或所述其抗原结合片段经修饰以增加血液穿过血脑屏障进入大脑的转运。

22.根据权利要求19所述的治疗剂,其进一步包括药学上可接受的载剂。

23.一种组合物,其包括含有SEQ ID NO:1内的11到24个连续核苷酸的长度为11到30个核苷酸的寡核苷酸和药学上可接受的载剂。

24.根据权利要求23所述的组合物,其中所述寡核苷酸为双链寡核苷酸。

25.根据权利要求23所述的组合物,其中所述寡核苷酸为单链寡核苷酸。

26.根据权利要求23所述的组合物,其中所述寡核苷酸经化学修饰或调配以使得能够穿过血脑屏障转运到大脑中。

27.根据权利要求23所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸为硫代磷酸酯寡核苷酸、甲基膦酸酯寡核苷酸、亚磷酰胺寡核苷酸、肽核酸寡核苷酸、锁核酸修饰的寡核苷酸,或其组合。

28.一种用于抑制APOE4基序介导的基因在细胞中的表达的方法,所述方法包括使细胞与根据权利要求23所述的组合物接触。

29.一种诊断个体患阿尔茨海默氏病或轻度认知障碍的风险的方法,所述方法包括测定获自所述个体的样品中的APOE4基序介导的基因的水平或APOE4基序介导的基因表达产物的水平,其中与对照相比较,APOE4基序介导的基因的水平的差异或APOE4基序介导的基因表达产物的水平的差异为所述个体患阿尔茨海默氏病或轻度认知障碍的风险升高的指示。

30.根据权利要求29所述的方法,其中所述样品包括组织、细胞或体液。

31.根据权利要求29所述的方法,其中所述APOE4基序介导的基因包括位于人类染色体19上的rs429358的约2Mb内的基因。

32.根据权利要求30所述的方法,其中所述APOE4基序介导的基因选自由以下组成的组:PSG1、XRCC1、PINLYP、IRGQ、ZNF576、SRRM5、ZNF428、PLAUR、SMG9、ZNF224、ZNF285、ZNF180、PVR、BCL3、CBLC、BCAM、PVRL2/NECTIN2、CLPTM1、RELB、CLASRP、GEMIN7、MARK4、PPP1R37、NKPD1、TRAPPC6A、BLOC1S3、EXOC3L2、CKM、KLC3、ERCC2、PPP1R13L、ERCC1、FOSB/ΔFOSB、RTN2、VASP、OPA3、GPR4、EML2、GIPR、SNRPD2、QPCTL、FBXO46、SIX5、SYMPK、FOXA3、MYPOP、NOVA2、CCDC61、HIF3A、PPP5C、PNMA8A/PNMAL1、PNMA8B/PNMAL2、DACT3、STRN4、FKRP,和其组合。

33.一种用于确定患有或处于患有阿尔茨海默氏病或轻度认知障碍的风险下的个体的治疗方案的方法,所述方法包括:

测量APOE4基序介导的基因或APOE4基序介导的基因表达产物在来自所述个体的生物样品中的水平;

将APOE4基序介导的基因或APOE4基序介导的基因表达产物在所述生物样品中的水平与对照水平进行比较;和

基于所述比较选择治疗剂。

34.根据权利要求33所述的方法,其中所述对照为APOE4基序介导的基因或APOE4基序介导的基因表达产物在不具有APOE4等位基因的个体中的标准水平。

35.根据权利要求33所述的方法,其中所述对照为APOE4基序介导的基因或APOE4基序介导的基因表达产物在具有APOE4等位基因的个体中的标准水平。

36.一种用于治疗患有或处于患有阿尔茨海默氏病或轻度认知障碍的风险下的个体的方法,所述方法包括测定所述个体中的APOE基因分型且如果所述个体携载APOE4等位基因,那么向所述个体投予治疗有效量的调节APOE4基序介导的基因的活性的分子。

37.根据权利要求36所述的方法,其中测定所述个体中的所述APOE基因分型的所述步骤包括测定所述个体对于APOE4是纯合抑或杂合的步骤。

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