用于与质谱接口的微流体系统的软件的制作方法

文档序号:31217453发布日期:2022-08-20 04:49阅读:来源:国知局

技术特征:
1.一种计算机实现的方法,包括:(a)使用处理器接收时间序列成像数据集,该数据集包括在分离通道中执行的等电聚焦分离的多个图像,其中所述多个图像中的每个图像与不同的时间点对应;(b)使用处理器将所述多个图像中的每个图像转换成根据对应时间点沿着分离通道的长度的位置的强度或吸光度测量;以及(c)使用处理器生成根据沿着分离通道的长度的位置的和根据时间的强度或吸光度测量的热图或3维图。2.如权利要求1所述的计算机实现的方法,其中时间序列成像数据集还包括在分离通道中分离的分析物峰的移动的多个图像。3.如权利要求1或2所述的计算机实现的方法,其中时间序列成像数据集包括多个紫外(uv)吸光度图像。4.如权利要求1-3中的任一项所述的计算机实现的方法,其中时间序列成像数据集包括多个荧光图像。5.如权利要求4所述的计算机实现的方法,其中荧光图像包括天然荧光的图像。6.如权利要求1-5中的任一项所述的计算机实现的方法,其中时间序列成像数据集包括以每分钟至少一个图像的帧速率获取的多个图像。7.如权利要求6所述的计算机实现的方法,其中时间序列成像数据集包括以每30秒至少一个图像的帧速率获取的多个图像。8.如权利要求7所述的计算机实现的方法,其中时间序列成像数据集包括以每10秒至少一个图像的帧速率获取的多个图像。9.如权利要求1-8中的任一项所述的计算机实现的方法,还包括在执行等电聚焦分离的同时对分离通道进行成像,其中在获取图像时迭代地执行(a)-(c)。10.如权利要求1-9中的任一项所述的计算机实现的方法,其中热图或3维图被用于执行选自以下的一项或多项任务:将等电聚焦分离与附加的等电聚焦分离进行比较,将移动反应与等电聚焦分离进行比较,将移动反应与附加的移动反应进行比较,确定等电聚焦分离的完成,监视移动反应的进展,确定电渗流的存在,确定分离性能参数。11.如权利要求10所述的计算机实现的方法,其中分离性能参数是分离分辨率。12.一种计算机实现的方法,包括:(a)使用处理器接收:(i)第一数据集,包括来自在分离通道中执行的等电聚焦分离的根据沿着分离通道的长度的多个强度或吸光度测量;以及(ii)第二数据集,包括根据时间的多个质谱仪总离子测量;(b)使用处理器将第二数据集转换成第三数据集,该第三数据集包括根据质量的离子计数测量;以及(c)使用处理器覆盖第一数据集和第三数据集的图。13.如权利要求12所述的计算机实现的方法,其中(c)还包括使用处理器用第一数据集和第三数据集的图覆盖第二数据集的图。14.如权利要求12或13所述的计算机实现的方法,其中(c)包括对第二数据集进行去卷积以生成第三数据集。
15.如权利要求12-14中的任一项所述的计算机实现的方法,其中,在(c)中,将第一数据集的强度或吸光度的第一峰映射到第三数据集的峰的集合。16.如权利要求15所述的计算机实现的方法,其中第二数据集被用于将第一数据集映射到第三数据集的峰的集合。17.如权利要求15所述的计算机实现的方法,还包括使用处理器将第一峰与峰的集合相关以确定所述第一峰的至少一种分析物种类的质量分布和等电点。18.如权利要求15所述的计算机实现的方法,其中第一峰与分析物峰对应并且产生关于分析物峰中的一种或多种分析物种类的等电点的信息。19.如权利要求18所述的计算机实现的方法,其中峰的集合与分析物峰中的所述一种或多种分析物种类的质量分布对应。20.如权利要求19所述的计算机实现的方法,还包括使用处理器来确定对于给定的等电点的分析物峰中的所述一种或多种分析物种类的身份。21.如权利要求20所述的计算机实现的方法,其中所述一种或多种分析物种类包括不同的蛋白质同种型。22.如权利要求21所述的计算机实现的方法,其中蛋白质同种型包括蛋白质的不同翻译后修饰。23.如权利要求12-22中的任一项所述的计算机实现的方法,其中覆盖图示出(i)根据沿着分离通道的长度的所述多个强度或吸光度测量的强度或吸光度测量和(ii)根据质量的离子计数测量的时间序列。24.如权利要求12-23中的任一项所述的计算机实现的方法,还包括使用耦合到质谱仪的单个集成微流体设备执行等电聚焦分离、移动和电喷雾电离以获得第一数据集和第二数据集。25.如权利要求24所述的计算机实现的方法,其中(b)和(c)在esi-ms的1分钟内或与esi-ms并发地执行。26.如权利要求12-25中的任一项所述的计算机实现的方法,其中(b)或(c)作为用于获取或处理电喷雾电离-质谱(esi-ms)数据的软件包的一部分自动执行。27.如权利要求12-26中的任一项所述的计算机实现的方法,其中(b)和(c)作为用于获取或处理电喷雾电离-质谱(esi-ms)数据的软件包的一部分自动执行。28.一种方法,包括:使用(i)用于一种或多种分析物种类的质谱数据和(ii)一种或多种分析物种类的等电聚焦数据来向一种或多种分析物种类指派翻译后修饰。29.如权利要求28所述的方法,其中翻译后修饰选自:羟基化、甲基化、脂化、乙酰化、二硫键、苏糖酰化、泛素化、糖基化、糖化、氨基酸添加或去除、酰胺化、脱酰胺化、异构化、氧化、岩藻糖基化、唾液酸化和磷酸化。30.如权利要求28或29所述的方法,还包括对包括所述一种或多种分析物种类的分析物的混合物执行等电聚焦分离以生成等电聚焦数据,移动所述一种或多种分析物种类,以及执行电喷雾电离质谱(esi-ms)以生成质谱数据。31.如权利要求30所述的方法,其中等电聚焦分离和移动是使用包括分离通道和集成的电喷雾尖端的单个微流体设备执行的。
32.如权利要求28-31中的任一项所述的方法,其中等电聚焦数据包括根据沿着分离通道的距离的一个或多个强度或吸光度测量,并且其中强度或吸光度测量中的峰与包括具有相同的给定等电点的一种或多种分析物种类的分析物峰对应。33.如权利要求32所述的方法,还包括,对于给定的等电点,使用质谱数据来区分一种或多种分析物种类的至少一种翻译后修饰。34.如权利要求28-33中的任一项所述的方法,其中等电聚焦数据包括关于所述一种或多种分析物种类的等电点的信息,并且质谱数据包括关于所述一种或多种分析物种类的质量的信息。35.如权利要求28-34中的任一项所述的方法,还包括使用多个翻译后修饰的等电点移位和质量移位的已知值来将翻译后修饰指派给所述一种或多种分析物种类中的至少一种。36.如权利要求28-35中的任一项所述的方法,其中翻译后修饰的指派发生在获取esi-ms数据的1分钟内。37.如权利要求28-36中的任一项所述的方法,其中等电聚焦数据包括关于所述一种或多种分析物种类的一个或多个等电点的信息,其中质谱数据包括关于所述一种或多种分析物种类的一个或多个质量的信息,并且其中翻译后修饰是通过将一个或多个等电点和一个或多个质量与包括多个已知等电点和多个翻译后修饰的质量值的参考相匹配来指派的。38.如权利要求37所述的方法,其中参考包括公开可用的数据。39.一种用于在电喷雾电离(esi)尖端和质谱仪入口之间维持恒定电压差的方法,该方法包括:(a)向分离通道的近端施加第一电压,其中分离通道的远端与esi尖端流体连通及电连通;(b)向辅助流体通道的近端施加第二电压,其中辅助流体通道的远端与分离通道的远端流体连通及电连通;(c)执行分离反应以分离分析物的混合物,其中分离反应发生在分离通道内;以及(d)在反馈回路中监视分离通道的电阻的改变或esi尖端处的电压的改变,该反馈回路调整施加到质谱仪入口的第三电压以维持esi尖端和质谱仪入口之间的恒定电压差。40.如权利要求39所述的方法,其中分离通道是毛细管的内腔。41.如权利要求40所述的方法,其中毛细管包括微瓶喷嘴。42.如权利要求39所述的方法,其中分离通道是微流体设备内的流体通道。43.如权利要求39至42中的任一项所述的方法,其中分离反应包括等电聚焦反应。44.如权利要求39至42中的任一项所述的方法,其中分离反应包括电泳分离反应。45.如权利要求39至44中的任一项所述的方法,其中将第一电压施加在耦合到分离通道的阴极处并且将第二电压施加在耦合到分离通道的阳极处。46.如权利要求39至45中的任一项所述的方法,其中esi尖端或质谱仪入口处的电压保持接地。47.如权利要求39至46中的任一项所述的方法,其中质谱仪入口处的电压保持在第三电压。48.如权利要求39至47中的任一项所述的方法,其中通过将在所述esi尖端处测得的瞬态电压改变添加到第三电压来调整第三电压。
49.如权利要求39至48中的任一项所述的方法,其中esi尖端处的电压是使用电源测量的。50.如权利要求49所述的方法,其中电源耦合到分离通道。51.如权利要求50所述的方法,其中电源耦合到另一个通道,该另一个通道耦合到分离通道。52.如权利要求11所述的方法,其中电源被设置为0微安。53.如权利要求39至48中的任一项所述的方法,其中esi尖端处的电压是使用部署在esi尖端处的电极测量的,并且其中电极被配置为输出0微安的电流。54.如权利要求39至53中的任一项所述的方法,其中反馈回路以至少0.1hz的频率操作。55.如权利要求39至53中的任一项所述的方法,其中反馈回路以至少10hz的频率操作。56.如权利要求39至55中的任一项所述的方法,其中反馈回路将esi尖端处的电压维持在预设值的
±
10%以内。57.如权利要求39至55中的任一项所述的方法,其中反馈回路将esi尖端处的电压维持在预设值的
±
1%以内。58.如权利要求39至55中的任一项所述的方法,其中反馈回路将esi尖端和质谱仪入口之间的恒定电压差维持在预设值的
±
10%以内。59.如权利要求39至55中的任一项所述的方法,其中反馈回路将esi尖端和质谱仪入口之间的恒定电压差维持在预设值的
±
1%以内。60.一种用于在电喷雾电离(esi)尖端和质谱仪入口之间维持恒定电压差(δv
tip-ms
)的方法,该方法包括:(a)为δv
tip-ms
设置目标值(δv
target
);(b)周期性地或连续地监视esi尖端处的第一电压,其中esi尖端与分离通道流体连通及电连通;(c)计算δv
tip-ms
的瞬时值;以及(d)使用反馈回路,周期性或连续地调整质谱仪入口处的第二个电压,使δv
tip-ms
=δv
target
。61.如权利要求60所述的方法,其中,所述分离通道是毛细管的内腔。62.如权利要求61所述的方法,其中毛细管包括微瓶喷嘴。63.如权利要求60所述的方法,其中分离通道是微流体设备内的流体通道。64.如权利要求60至63中的任一项所述的方法,其中在分离通道中进行的分离反应包括等电聚焦反应。65.如权利要求60至63中的任一项所述的方法,其中在分离通道中执行的分离反应包括电泳分离反应。66.如权利要求60至65中的任一项所述的方法,其中esi尖端处的第一电压或质谱仪入口处的第二电压保持接地。67.如权利要求60至66中的任一项所述的方法,其中使用部署在esi尖端处的电极监视esi尖端处的第一电压。68.如权利要求67所述的方法,其中部署在esi尖端处的电极被配置为输出0微安的电
流。69.如权利要求60至30中的任一项所述的方法,其中使用与流体通道电连通并且被配置为输出0微安电流的电源监视esi尖端处的第一电压,该流体通道在靠近esi尖端的位置处与分离通道相交。70.如权利要求60至69中的任一项所述的方法,其中反馈回路以至少0.1hz的频率操作。71.如权利要求60至70中的任一项所述的方法,其中反馈回路以至少10hz的频率操作。72.如权利要求60至71中的任一项所述的方法,其中反馈回路以至少100hz的频率操作。73.如权利要求60至72中的任一项所述的方法,其中反馈回路将δv
tip-ms
维持在δv
target

±
10%以内。74.如权利要求60至73中的任一项所述的方法,其中反馈回路将δv
tip-ms
维持在61的
±
1%以内。75.一种用于维持电喷雾电离(esi)尖端与质谱仪入口之间的恒定电压差的计算机实现的方法,该方法包括:(a)使用处理器接收esi尖端处的第一电压的测量,其中esi尖端与分离通道流体连通及电连通;(b)使用处理器接收质谱仪的入口处的第二电压的测量;以及(c)使用处理器将第一电压与第二电压进行比较,其中如果第二电压与第一电压不同,那么处理器使质谱仪的入口或esi尖端处的电压被调整,使得esi尖端处的电压与质谱仪的入口处的电压之间的差保持恒定。76.如权利要求75所述的计算机实现的方法,还包括:(d)使用反馈回路以指定的频率重复步骤(a)至(c)。77.如权利要求75或权利要求76所述的计算机实现的方法,其中分离通道包括(i)毛细管的内腔或(ii)微流体设备内的流体通道。78.如权利要求77所述的计算机实现的方法,其中毛细管包括微瓶喷嘴。79.如权利要求75至78中的任一项所述的计算机实现的方法,其中在分离通道中执行分离反应,并且其中分离反应包括等电聚焦反应。80.如权利要求75-79中的任一项所述的计算机实现的方法,其中esi尖端处的电压或质谱仪的入口处的电压保持接地。81.如权利要求75-80中的任一项所述的计算机实现的方法,其中esi尖端处的电压是使用放置在esi尖端处的电极来测量的。82.如权利要求75-80中的任一项所述的计算机实现的方法,其中用与在esi尖端附近与分离通道相交的流体通道电连通并且被配置为输出0微安电流的电源来监视esi尖端处的电压。83.如权利要求76所述的计算机实现的方法,其中反馈回路以至少0.1hz的频率操作。84.如权利要求76或权利要求83所述的计算机实现的方法,其中反馈回路以至少10hz的频率操作。

技术总结
描述了用于改进电喷雾电离质谱仪(ESI-MS)数据的质量的方法、设备和系统,作为用于实现化学分离数据和质谱数据之间的改进相关性的方法、设备和系统。设备和系统。设备和系统。


技术研发人员:E
受保护的技术使用者:因塔生物有限责任公司
技术研发日:2020.11.24
技术公布日:2022/8/19
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