技术特征：
1.一种微生物识别用标记的确定方法，其特征在于，包括下述步骤1～8：步骤1：选定全基因组已被破译的微生物；步骤2：对在上述步骤1中选定的微生物所具有的蛋白质进行质量分析，得到蛋白质的基于氨基酸序列的分子量相关离子峰；步骤3：根据在上述步骤2中得到的分子量相关离子峰得到各峰的实测m/z值；步骤4：对于在上述步骤1中选定的微生物，通过基因数据库得到该微生物所具有的蛋白质与氨基酸序列，根据该氨基酸序列信息计算该蛋白质的理论m/z值；步骤5：对在步骤4中计算出的理论m/z值与在上述步骤3中得到的实测m/z值进行比较，将实测m/z值归属于具有与实测m/z值一致的理论m/z值的蛋白质及其氨基酸序列；步骤6：从数据库中获得与在上述步骤5中归属的蛋白质类似的氨基酸序列；步骤7：根据识别分类从具有在上述步骤6中获得的类似的氨基酸序列的微生物中筛选微生物，计算该微生物所具有的蛋白质的氨基酸序列的理论m/z值；步骤8：对在步骤7中计算出的氨基酸序列的理论m/z值进行比较，将具有在每个分类中存在差异的理论m/z值的蛋白质确定为用于识别的标记。2.如权利要求1所述的微生物识别用标记的确定方法，其特征在于，所述质量分析为mald i-ms。3.如权利要求1～2的任一项所述的微生物识别用标记的确定方法，其特征在于，微生物为沙门氏菌。4.一种微生物的识别方法，其特征在于，使用了通过权利要求1所述的方法确定的微生物识别用标记。5.如权利要求4所述的微生物的识别方法，其特征在于，微生物为沙门氏菌。6.一种数据库，其特征在于，包含通过权利要求1所述的方法确定的微生物识别用标记及其理论m/z值、以及从与该标记对应的微生物的属、种、亚种、血清型和株构成的组中选择的至少1种。
技术总结
本发明提供一种基于较少的实测数据来确定用于识别微生物的标记的方法。该微生物识别用标记的确定方法包括下述步骤：步骤1：选定全基因组已被破译的微生物；步骤2：获取微生物的蛋白质的分子量相关离子的峰；步骤3：根据分子量相关峰获取各峰的实测m/z值；步骤4：计算该微生物中存在的蛋白质的理论m/z值；步骤5：比较理论m/z值与实测m/z值，将实测m/z值归属于具有与实测m/z值一致的理论m/z值的蛋白质及其氨基酸序列；步骤6：获得与上述5中归属的蛋白质类似的氨基酸序列；步骤7：计算根据识别分类筛选出的微生物的蛋白质的理论m/z值；步骤8：比较上述蛋白质的理论m/z值，将具有存在差异的理论m/z值的蛋白质确定为识别用标记。异的理论m/z值的蛋白质确定为识别用标记。异的理论m/z值的蛋白质确定为识别用标记。
技术研发人员：福山裕子
受保护的技术使用者：株式会社岛津制作所
技术研发日：2020.06.02
技术公布日：2023/2/3