1.一种基于位流还原的可编程集成电路应用算法侵权判定方法，其特征在于，包括以下步骤：
1）获取样本的逻辑模型，所述样本包括用户自己的文件或器件和待判定的文件或器件；
2）将所述样本文件或从样本器件中提取的位流文件，映射到对应的所述逻辑模型上，然后通过去位置约束，剔除位流物理位置影响；
3）将所述步骤2）得到的已还原的样本进行逻辑分析并分割为时序和非时序：对时序逻辑进行解析，所述解析包括检测是否存在因为扇出上限制约或者布局布线需求而导致的逻辑拷贝和布线资源重驱动，对非时序逻辑进行算法分析，按照依托时序分割的结果，为每一组信号重新匹配，求真值表；
4）根据处理后的时序和非时序逻辑的真值表库，以及芯片外围环境或者客户给出的端口功能描述，进行功能分析和验证；
5）将步骤4）得到的分析和验证后的待判定可的还原模型与用户自己的还原模型进行相似度计算，并根据相似程度，给出侵权与否的判定结果。
2.根据权利要求1所述的一种基于位流还原的可编程集成电路应用算法侵权判定方法，其特征在于，所述逻辑模型的获取包括已有的模型库和通过一般电路、反熔丝电路和支持无损还原的方法获得的模型库。
3.根据权利要求2所述的一种基于位流还原的可编程集成电路应用算法侵权判定方法，其特征在于，反熔丝电路通过电压分析获取位流。
4.根据权利要求3所述的一种基于位流还原的可编程集成电路应用算法侵权判定方法，其特征在于，所述电压分析包括差分电压分析和简单电压分析。
5.根据权利要求1所述的一种基于位流还原的可编程集成电路应用算法侵权判定方法，其特征在于，所述位流物理定位包括原子器件的逻辑定位和原子器件Pin之间的可编程互联的位置信息。
6.根据权利要求1所述的一种基于位流还原的可编程集成电路应用算法侵权判定方法，其特征在于，所述逻辑分析包括去扇出、去拷贝和依据真值表重新做逻辑匹配。
7.根据权利要求1所述的一种基于位流还原的可编程集成电路应用算法侵权判定方法，其特征在于，所示反向还原过程只需要用户提供的配置文件，不破坏样本电路。