大批量单细胞ATAC‑seq数据质量控制和分析方法与流程

文档序号:12963933阅读:来源:国知局

技术特征:

技术总结
本发明公开了一种大批量单细胞ATAC‑seq数据质量控制和分析方法,其特征在于,包括以下步骤:第一步、原始测序文件的FASTQ格式或者比对完的SAM/BAM格式作为输入文件;第二步、测序片段水平和多细胞水平的质量控制;第三步、单个细胞层面的质量控制;第四步、细胞聚类和细胞特异峰的探测:第五步、给用户提供一份质量控制的报告文档。本发明以scATAC‑seq数据研究作为出发点,构建了一个系统的、全面的质量控制和分析流程,并能够系统地生成针对不同类型的单细胞数据的特异性质量控制、分析和非监督细胞聚类的可视化,加强对单细胞表观遗传组真实的认识。其可适用于不同类型的单细胞ATAC‑seq数据。

技术研发人员:张勇;张超;施威扬;王璐莹
受保护的技术使用者:浙江绍兴千寻生物科技有限公司
技术研发日:2017.07.31
技术公布日:2017.11.21
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