表、图示800a和/或 指示优选试验分子。
[0106] 作为另外的实例。图8B为对于各模拟的API-API(g卩，参比分子-参比分子)平均径 向分布函数的图示800b。第一曲线801b表示对于模拟API和第一辅料的第一 API-API平均径 向分布函数，第二曲线802b表示对于模拟API和第二辅料的第二API-API平均径向分布函 数。
[0107] 如图示800b所示，计算设备可以确定第一 API-API平均径向分布函数的极大值出 现在约〇.9nm。计算设备也可以确定第二API-API平均径向分布函数(g(r))的极大值出现在 约0.4nm的径向距离(r)。在所述实例中，计算设备可以执行方框702的步骤，确定第一API-API平均径向分布函数的极大值为约0.9,第二API-API平均径向分布函数的极大值为约 0.65。因此，计算设备可以确定第一 API-API平均径向分布函数的极大值小于第二API-API 平均径向分布函数的极大值。
[0108] 在方框704,计算设备可以生成按上升顺序排列平均径向分布函数极大值的表。如 前述实例所述的，计算设备可以生成使得第一辅料在第一排和第二辅料在第二排的表。另 外，计算设备可以在方框706识别第一辅料为优选试验分子，计算设备可以在方框410显示 表、图示800b和/或指示优选试验分子。
[0109] 在上述实例中，计算设备可以包括表示Μ个接触概率的一个或多个、Μ个极大值的 一个或多个、表和/或优选试验分子的信息。当执行方法400的方框410步骤时，计算设备可 以使显示设备显示表示模拟结果例如表和/或优选试验分子的信息。
[0110] 虽然上述方法和实例是描述关于单一计算设备执行所述方法的内容，但每个方法 步骤可以由一个或多个计算设备执行。例如，所述方法的一个或多个可以由分布式计算系 统(例如关于图1描述的分布式计算系统1〇〇)实施。例如，计算终端102可以显示配置为接收 一个或多个输入信号的GUI。然后计算终端可以将一个或多个输入信号经由网络104发送至 服务器设备106。服务器设备106在完成方法400的步骤时，例如可以将信号经由网络104发 送至计算终端102,促使计算终端102的显示部件显示表示模拟结果的信息。
[0111] 关于图和本申请中所述的任何或全部的信息流图、方案和流程图，各步骤、方框 和/或通信可以代表处理根据示例实施方式的信息和/或传输信息。可替代的实施方式包括 在这些示例实施方式的范围中。在这些替代实施方式中，例如，如步骤、方框、传输、通信、请 求、响应和/或信息描述的功能可以由所示或所述的顺序进行执行，包括按基本并行或反向 顺序，这取决于所涉及的功能性。此外，较多或较少的步骤、方框和/或功能可以使用本申请 中所述的任何信息流图、方案和流程图，这些信息流程图、方案和流程图可以部分或全部地 相互合并。
[0112] 表示处理信息的步骤或方框可以对应于电路图，其可配置为执行本申请中所述的 方法或技术的具体逻辑功能。可选择地或另外，表示处理信息的步骤或方框可以对应于模 块、片段或一部分程序代码(包括相关数据）。程序代码可以包括可由处理器执行的一个或 多个指令用于实施所述方法或技术中的具体逻辑功能或作用。程序代码和/或有关数据可 以储存在任何类型的计算机可读介质上，例如储存设备，包括磁盘驱动器、硬盘驱动器或其 他储存介质。
[0113] 计算机可读介质也可以包括储存短时期数据的非暂时性计算机可读介质，例如计 算机可读介质，如寄存器存储器、处理器缓存和/或随机存取存储器(RAM)。计算机可读介质 也可以包括储存较长时期的程序代码和/或数据的非暂时性计算机可读介质，例如二次或 持续性长期存储，例如只读存储器(R0M)、光或磁盘、和/或光盘只读存储器(CD-ROM)。计算 机可读介质也可以为任何其他易失性或非易失性存储系统。计算机可读介质可以考虑例如 计算机可读存储介质或可触摸存储设备。
[0114] 此外，表示一个或多个信息传输的步骤或方框可以对应于相同物理设备中软件 和/或硬件模块之间的信息传输。然而，其他信息传输可以在不同物理设备中的软件模块 和/或硬件模块之间。
[0115] 虽然以上已根据其优选实施方式描述了本发明，但可在本公开内容的范围内修 改。因此本申请意在覆盖本发明使用本申请中披露的一般原则的任何变化、用途或适应。此 外，本申请意在覆盖因为本发明所属领域内已知或通常实践而偏离本披露内容并且落入以 下权利要求限制内的内容。
【主权项】
1. 方法，包括： 通过计算设备使用分子模拟器生成Μ组模拟数据，其中Μ组模拟数据中的每一组包括一 个或多个模拟数据样品，所述一个或多个模拟数据样品表示在溶剂中（i)参比分子中的分 子和（ii)M种试验分子中一种的分子的模拟位置，其中（a)M为自然数，（b)参比分子为活性 药物成分，和(c )M种试验分子各自为聚合物或低聚物辅料； 确定Μ组模拟数据中每一组的α物类与β物类之间的接触概率，提供Μ个接触概率，其中 接触在当β物类粒子在α物类粒子的径向距离范围内时发生，其中α物类和β物类各自为参比 分子、溶剂，或Μ种试验分子中的一个中的一种； 基于Μ个接触概率中的至少一个确定模拟结果;和 使显示设备显示表示模拟结果的信息。2. 权利要求1的方法，进一步包括:通过所述计算设备经由用户界面接收一个或多个输 入，所述一个或多个输入包括表示所述参比分子、Μ种试验分子或溶剂中至少一种的信息。3. 权利要求2的方法，其中为接收所述Μ种试验分子，所述计算设备配置为经由所述用 户界面接收： 对聚合物或低聚物的选择； 对一个或多个取代基的选择;和 对其中所述一个或多个取代基各自连接到所述聚合物或低聚物的位置的选择。4. 权利要求3的方法，其中所述聚合物或低聚物为聚环氧乙烷、聚乙烯吡咯烷酮、纤维 素或环糊精中的一种。5. 权利要求3-4中任一项的方法，其中所述一个或多个取代基包括:一个或多个单体烷 基、酰基或阳离子基团；或 一个或多个能够接枝到其他聚合物或低聚物上的聚合物或低聚物基团。6. 前述权利要求中任一项的方法，进一步包括在生成所述Μ组模拟数据之前，使用所述 分子模拟器确定Μ组热力学平衡条件，其中： Μ组热力学平衡条件各自包括一个或多个对于溶剂体系的热力学平衡条件，所述溶剂 体系包括所述参比分子和所述Μ种试验分子中的一种； 所述分子模拟器使用所述Μ组热力学平衡条件中的一组条件生成Μ组模拟数据中的每 一组;和 所述分子模拟器用于确定Μ组热力学平衡条件中每一组的分子数目，小于所述分子模 拟器用于生成Μ组模拟数据中每一组的分子数目。7. 前述权利要求中任一项的方法，其中： 所述α物类粒子为所述α物类的原子、分子或化学基团中的一种;和 所述β物类粒子为所述β物类的原子、分子或化学基团中的一种。8. 前述权利要求中任一项的方法，其中确定所述Μ个接触概率包括确定Μ个平均径向分 布函数，其中确定Μ个平均径向分布函数中的每一个包括： 确定包括在Μ组模拟数据的一组中所述一个或多个模拟数据样品中每一个的径向分布 函数，提供一个或多个径向分布函数，其中所述一个或多个径向分布函数中的每一个基于 在所述α物类粒子径向距离范围内的所述β物类粒子数目； 使所述一个或多个径向分布函数中的每一个标准化，提供一个或多个标准化径向分布 函数； 将所述一个或多个标准化径向分布函数平均，提供平均径向分布函数;和 确定Μ个平均径向分布函数中每一个的极大值，提供Μ个极大值，其中Μ个极大值中的每 一个都与所述Μ种试验分子中的一种相关联。9. 权利要求8的方法，其中模拟结果包括表示以下的信息：（i)包括在所述Μ种试验分子 中的一种或多种试验分子和（ii)与所述一种或多种试验分子中每一种试验分子相关联的 极大值。10. 权利要求8-9中任一项的方法，进一步包括： 根据与所述一种或多种试验分子的每一种试验分子相关联的极大值，生成排列包括在 所述Μ种试验分子中一种或多种试验分子的表;和 使所述显示设备显示表示所述表的信息。11. 权利要求8-10中任一项的方法，进一步包括： 从所述Μ种试验分子基于与每一种试验分子相关联的极大值来识别优选试验分子，其 中所述模拟结果包括表示所述优选试验分子的信息。12. 权利要求11的方法，其中所述优选试验分子为包括在所述Μ种试验分子中的聚合物 辅料，其与当所述α物类和β物类为API时最低的极大值相关联。13. 权利要求的11方法，其中所述优选试验分子为包括在所述Μ种试验分子中的试验分 子，其与当所述α物类或所述β物类中的至少一个为一种所述溶剂或所述Μ种试验分子中的 一种时最大的极大值相关联。14. 计算设备，包括： 用户界面部件； 显不设备； 处理器;和 非临时性数据存储，其包含可由所述处理器执行的指令以执行权利要求1-13中任一项 所述的方法。15. 系统，包括： 计算设备，其包括用户界面;和 服务器，其配置为执行权利要求1-13中任一项所述方法的步骤，其中所述计算设备配 置为： 经由所述用户界面的输入部件接收所述一个或多个输入;和 在所述用户界面的输出部件上显示表示所述模拟结果的信息。
【专利摘要】披露用于设计试验分子的方法、系统和设备。实例方法包括使用分子模拟器以生成各组模拟数据。每一组模拟数据可以包括模拟数据，表示在溶剂中(i)参比分子中的分子和(ii)M种试验分子中一种分子的模拟位置。所述方法也可以包括确定每一组模拟数据的α物类与β物类之间的接触概率。接触可以在当β物类粒子在α物类粒子的径向距离内时发生。α物类和β物类可以各自为参比分子、溶剂中的一个或M种试验分子中的一种。所述方法可以进一步包括基于至少一个接触概率确定模拟结果。
【IPC分类】G06F19/00
【公开号】CN105593861
【申请号】CN201480054293
【发明人】R·拉森, P·贾, R·施密特, W·波特
【申请人】陶氏环球技术有限责任公司, 密歇根大学董事会
【公开日】2016年5月18日
【申请日】2014年10月23日
【公告号】WO2015061602A1