专利名称：一段淋球菌dna序列的特异性确定及其应用的制作方法
技术领域：
本发明涉及一段淋球菌(Neisseria gonorrhoeae)DNA序列的特异性确定及其应用，属于生物医学技术领域。
本发明的技术方案为本发明利用现有的方法确定了长度为197bp的一段淋球菌(Neisseria gonorrhoeae)特异DNA序列及其PCR引物，用引物进行PCR扩增，其序列如下1 gctaaattg cggattggaa aattttgaaa taagaacccc tatcgggctg ttatctgatt61 agggttattt tgacatagtt gtatcatctt aaaaacaagc atacaatctg caaatcttag121 acaaagcaaa acccccgcca aacgccaatc tgcacggggg tttcgagata caacatgagc181 caattataca cccaacccg引物序列为1.5’-gctaaattgcggattggaaa-3’2.5’-cgggttgggtgtataattgg-3’上述的淋球菌特异DNA序列作为基因芯片诊断的探针及PCR扩增检测序列，用于淋球菌的临床诊断。
本发明具有检测方法快速且准确，操作简便，成本低等优点。
图2、图2续是测序图。其中图2是测定的序列、图2续是原始测序图谱。
图3是用Blast软件对PCR扩增产物的测序结果与预计序列的比较分析。
图4、图4续是基因数据库中Blast搜索结果。
图5.基因芯片杂交结果。
本发明可用于PCR方法或基因芯片方法进行淋球菌的临床检测。用本发明提供的序列进行PCR扩增，根据PCR方法获得产物是否出现和大小判断是否为淋球菌感染。也可用本序列为探针，作为基因芯片中的一个检测位点，然后用本发明中的PCR引物序列扩增临床标本，并标记后进行杂交检测。
权利要求
1.一段淋球菌DNA序列的特异性确定，其特征在于长度为197bp，用引物进行PCR扩增，其序列如下1gctaaattg cggattggaa aattttgaaa taagaacccc tatcgggctg ttatctgatt61 agggttattt tgacatagtt gtatcatctt aaaaacaagc atacaatctg caaatcttag121 acaaagcaaa acccccgcca aacgccaatc tgcacggggg tttcgagata caacatgagc181 caattataca cccaacccg引物序列为1.5’-gctaaattgcggattggaaa-3’2.5’-cgggt tgggtgtataat tgg-3’
2.一段淋球菌DNA序列的应用，其特征在于该序列作为用于诊断淋球菌的特异序列的基因芯片及探针的检测位点进行杂交检测。
全文摘要
本发明涉及一段淋球菌DNA序列的特异性确定及其应用，属于生物医学技术领域。本发明通过基因数据库资料的搜寻和分析，确定了一段淋球菌DNA序列的特异性及PCR扩增引物，该序列长度为197bp。通过对人类生殖道淋球菌感染标本的PCR扩增，克隆，获得该序列，测序证明与预计序列一致。再经生物信息学方法分析，基因芯片杂交分析，结果证实了该序列对于淋球菌的特异性。本发明作为基因芯片诊断的探针及PCR扩增检测序列，用于淋球菌的诊断。本发明具有检测方法快速且准确，操作简便，成本低等优点。
文档编号C12P19/34GK1436852SQ0211337
公开日2003年8月20日 申请日期2002年2月9日 优先权日2002年2月9日
发明者谭德勇, 朱宝生 申请人:昆明寰基生物芯片开发有限公司