谷子糊化温度基因分子标记及其应用的制作方法

本发明涉及植物基因领域，具体涉及一种谷子糊化温度基因分子标记及其应用。

背景技术：

由于alk基因同源克隆未发现糊化温度的变异位点，推测谷子糊化温度性状可能是由多基因控制的数量性状。利用粘度速测仪(rva)法，对“s80x大黑谷”ril群体的180个家系在石家庄、长治2个环境收获的种子进行了蒸煮食味品质测定和数据搜集工作。群体两点数据统计结果显示，各指标在两个试验点均呈连续正态分布，说明品质相关性状均为典型的数量性状。而且除了糊化温度和峰值时间两试验点数据分布相当之外，崩解值、消减值和回生值3个指标在山西长治比河北石家庄表现出了更广泛的变异。

技术实现要素：

为解决上述问题，本发明提供了一种谷子糊化温度基因分子标记及其应用。

为实现上述目的，本发明采取的技术方案为：

谷子糊化温度基因分子标记，包括caas3020标记和si038标记，caas3020扩增的125bp的片段和si038扩增的325bp的片段为高糊化温度的标记，caas3020扩增的127bp的片段和si038扩增的329bp的片段为低糊化温度的标记。

上述谷子糊化温度基因分子标记可用于育种后代材料糊化温度的检测，从而进行后代材料的辅助筛选。

本发明具有以下有益效果：

本具体实施的caas3020标记扩增的125bp的片段和si038标记扩增的325bp的片段为高糊化温度的标记，caas3020标记扩增的127bp的片段和si038标记扩增的329bp的片段为低糊化温度的标记，可以作为辅助选择标记用于育种后代材料筛选。

附图说明

图1为本发明实施例中亲本中多态性引物筛选示意；图中，箭头为多态性引物。

图2为本发明实施例中si038标记和caas3020标记在群体中的扫描示意图。

图3为本发明实施例中遗传连锁图谱的示意图。

图4为本发明实施例中qtl定位结果的示意图。

具体实施方式

为了使本发明的目的及优点更加清楚明白，以下结合实施例对本发明进行进一步详细说明。应当理解，此处所描述的具体实施例仅仅用以解释本发明，并不用于限定本发明。

谷子糊化温度基因分子标记，其中第3染色体caas3020-si038标记间的qtl贡献率最大，为17.02％，caas3020扩增的125bp的片段和si038扩增的325bp的片段为高糊化温度的标记，caas3020扩增的127bp的片段和si038扩增的329bp的片段为低糊化温度的标记。

本具体实施利用均匀覆盖谷子各染色体的700个ssr标记对“s80x大黑谷”ril群体的亲本进行检测(如图1所示)，从中筛选出了140个均匀覆盖全基因组的标记对180个家系进行了扫描(如图2所示)，构建了一张包含9个连锁群、90个标记的遗传连锁图谱。如图4所所示，遗传连锁图谱总长度为1160.5cm，标记间平均距离为13.03cm。结合两点品质测定数据，进行了qtl定位，共发掘3个环境下qtl位点26个，其中在第3、4、8染色体出现多性状聚集的现象。在第3染色体上定位到3个性状在两种环境下均可稳定遗传且贡献率较高的主效位点，为进一步精细定位和基因挖掘奠定了基础(如图3所示)。糊化温度在第3、4、6染色体上，其中第3染色体caas3020-si038标记间的qtl贡献率最大，为17.02％。对caas3020和si038两个标记再群体中扩增片段和群体的糊化温度数据进行统计比较，两个标记呈共分离遗传，如表1所示，caas3020扩增的125bp的片段和si038扩增的325bp的片段为高糊化温度的标记，caas3020扩增的127bp的片段和si038扩增的329bp的片段为低糊化温度的标记，可以作为辅助选择标记用于育种后代材料筛选。

表1“s80x大黑谷”部分家系中caas3220和si038扩增片段对应的糊化温度

以上所述仅是本发明的优选实施方式，应当指出，对于本技术领域的普通技术人员来说，在不脱离本发明原理的前提下，还可以作出若干改进和润饰，这些改进和润饰也应视为本发明的保护范围。

技术特征：

技术总结
本发明公开了一种谷子糊化温度基因分子标记及其应用，该分子标记包括CAAS3020标记和SI038标记，CAAS3020扩增的125bp的片段和SI038扩增的325bp的片段为高糊化温度的标记，CAAS3020扩增的127bp的片段和SI038扩增的329bp的片段为低糊化温度的标记，可以作为辅助选择标记用于育种后代材料筛选。

技术研发人员：王永芳;李海权;白辉;降彦苗;耿玲玲;刁现民;智慧;刘国庆
受保护的技术使用者：河北省农林科学院谷子研究所
技术研发日：2017.10.19
技术公布日：2018.02.23