专利名称：与谷子株高基因紧密连锁的分子标记SIsv0115的制作方法
技术领域：
本发明属于分子生物学领域，涉及一种分子标记，具体地，涉及一种与谷子株高基 因紧密连锁的分子标记。本发明还涉及该分子标记的引物、该分子标记在谷子株高基因定 位或谷子遗传育种中的用途、一种谷子株高基因定位方法、以及一种谷子育种方法。
背景技术：
谷子(Setaria italica L. Beauv.)是起源于我国的重要粮食作物，主要在我国的 北方种植，在国家粮食生产和粮食安全中占有较为重要的地位。谷子是二倍体自花授粉作 物，其基因组较小，约470Mb，这些特性使其很适合作为基因组研究的对象。目前，遗传连锁图谱的构建已成为基因定位、图位克隆以及基因组结构与功能研 究的重要基础。而分子标记又是构建遗传连锁图谱的基础。株高作为关系到作物高产和稳 产的重要农艺性状，直接关系到品种的株型、抗倒伏性、区域布局和产量构成性状。因此，迫 切需要发现与谷子株高基因紧密连锁的分子标记。
发明内容
本发明人依据全基因组序列，经过大量的实验和不懈的努力，提供了一种与谷子 (Setaria italica L. Beauv.)株高基因紧密连锁的分子标记SIsvO 115，并由此提供了下述 发明本发明的一个方面涉及一种与谷子株高基因紧密连锁的分子标记SIsv0115，其核 苷酸序列如seq id n0:1所示。其中加边框部分为引物设计区段688bp
权利要求
1. 一种与谷子株高基因紧密连锁的分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO :1所示；或 者其为含有SEQ ID NO :1所示核苷酸序列的DNA片段。
2. 一种重组载体，其含有权利要求1所述的分子标记。
3. —种重组细胞，其含有权利要求2所述的重组载体。
4.权利要求1所述的分子标记的引物，其核苷酸序列如SEQIDNO 2和SEQ ID NO 3 所示。
5.权利要求1所述的分子标记的制备方法，包括下述步骤使用非矮株型的谷子的基因组DNA作为模板，以权利要求4所述的引物进行PCR扩增； 优选地，还包括将PCR扩增的产物进行纯化的步骤；具体地，所述非矮株型的谷子为张谷1 号、张杂谷3号、或张杂谷3号自交产生的F2代中的非矮株型。
6.权利要求1所述的分子标记的检测方法，包括下述步骤(1)根据权利要求1的分子标记的核苷酸序列设计引物；(2)以被检测谷子的基因组DNA作为模板进行扩增；(3)判断扩增产物中是否存在该分子标记。
7.权利要求1所述的分子标记在谷子株高基因定位或检测中的用途。
8. 一种谷子株高基因定位的方法，包括使用权利要求1所述的分子标记的步骤。
9.权利要求1所述的分子标记在谷子辅助育种中的用途。
10. 一种谷子辅助育种方法，包括检测权利要求1所述的分子标记的步骤。
全文摘要
本发明属于分子生物学领域，涉及一种分子标记，具体地，涉及一种与谷子株高基因紧密连锁的分子标记，其核苷酸序列如SEQ IDNO1所示，或者其为谷子基因组中含有SEQ ID NO1所示核苷酸序列的DNA片段。本发明还涉及该分子标记的引物、该分子标记在谷子株高基因定位或谷子遗传育种中的用途、一种谷子株高基因定位方法、以及一种谷子育种方法。本发明发现了与谷子株高基因紧密连锁的分子标记SIsv0115，将谷子基因组DNA序列与谷子株高基因联系起来，更有利于谷子分子标记辅助育种体系的建立。
文档编号C12N1/21GK102002497SQ20101055330
公开日2011年4月6日 申请日期2010年11月22日 优先权日2010年11月22日
发明者全志武, 夏秋菊, 张耕耘, 彭小华 申请人:深圳华大基因科技有限公司