用于控制蜂中的瓦螨的组合物的制作方法_5

文档序号:8399081阅读:来源:国知局
增殖质粒DNA 之后,切取病毒片段(包括T7启动子)并进行凝胶纯化。这些充当用于T7指导的体外转 录(MEGAscript?,Ambion,Austin TX)的模板。将反应产物进行DNA酶消化,之后进行苯 酚提取和乙醇沉淀。将最终制品溶解在无核酸酶的水中。
[0118] 在>7、垄缓裏沪琢廢在每个蜂房上放置5 g花粉补充饼,且每夜用无菌的培 养皿将10 ml 50%蔗糖溶液加入蜂巢中。持续饲喂9天,之后仅将其中蜂王已开始产卵的 蜂巢包含在试验中。
[0119] 建立有效蜂巢(蜂王产卵)之后,给一些小型蜂巢补充瓦螨特异性(凋亡抑制剂 (IAP)基因 (SEQ ID NO: 27)或非特异性对照(例如GFP SEQ ID NO: 91) dsRNA,将其加 入供应给蜂巢的10 ml 50%蔗糖溶液中,调节至每只蜂每份饲料约1微克dsRNA,假设所有 蜂消耗近似相同量的蔗糖溶液。持续dsRNA饲喂六天。
[0120] A垄/遵巢中游瓦麟憂费.·在有效蜂巢中饲喂7天后,使一些蜂群与瓦螨群体接触。 其后,再持续dsRNA处理2天。在引入瓦螨群体之后,每天从每个小型蜂巢中收集活蜂和死 蜂(幼虫和成蜂)的样品,连续32天。将每只收集的蜂冷冻在液氮中并且在分子分析前保 藏在-70°C。通过打开蜂巢(无烟)、拆下小型蜂房并从两边给小型蜂房拍照来监测蜂群的 生活力。每天给蜂巢-蜂房拍照,并监测留下的活蜂的数量。把照片下载到电脑并对每个 小型蜂巢计算蜂的总数。
[0121] 为了测试dsRNA毒性,给另一组蜂巢提供瓦螨特异性dsRNA,但不使其与瓦螨群体 接触。两组蜂巢充当额外的对照:未经dsRNA处理并且未接种瓦螨的蜂巢,以及未经dsRNA 处理但已接种瓦螨的蜂巢。
[0122] RT-PCR分析: 孩廢你蔡砍..使用TRIREAGENT方法(Sigma,St. Louis M0,USA)从保藏的蜂中提取总 RNA。简言之,将RNA通过经由离心沉淀和分离来提取,之后重悬在RNA安全溶液(RNAsecure solution)中。
[0123] 其?使用 SYBR Green PCR master mix 连同 Taqman 反转录酶(Applied Biosystems,Foster City,CA)将测定量的RNA (100 ng用于病毒表达分析,100 pg用于 18S rRNA 内参)进行一步 RT-PCR。实时 RT-PCR 在 GeneAmp PCR System 5700 (Applied Biosystems)中进行。无反转录酶或无模板下进行的反应不应产生任何产物。
[0124] 7?姻/?逐分#.·从处理蜂和对照蜂提取总RNA。向RNA中加入甲醛至1. 8%并加热 至65°C。在70V 4°C搅拌下,使RNA(每泳道15 #g)在1. 2%琼脂糖凝胶上电泳。将先前 所述经扩增的瓦螨RNA产物用洋地黄毒苷标记并充当杂交探针。用DIG发光检测试剂盒 (Roche Diagnostics GmbH,Mannheim,Germany)进行检测。通过与电泳RNA分子量标志物 I (Roche)比较来估计RNA大小。在高严格性(0.1 X SSC ;65°C)下进行杂交。
[0125] 蜜聲中摄乂游瓦遵淨?ΤΡ姻游政运.·为了更好地理解dsRNA-瓦螨保护蜂免受 瓦螨侵染的作用机制及其结果,从dsRNA-瓦螨处理的蜂和未处理的对照蜂提取总RNA,使 之经历一组核酸酶的消化,并在PAGE上分离。
[0126] 结果 通过使用用于GFP的探针的狭线印迹杂交确定了 dsRNA在成年蜂体、蜂幼虫(通过成 年蜂喂养)、蜂蛹中的存在情况。通过检测小RNA的RNA印迹确定了从dsRNA到siRNA的加 工(图 2A-E)。
[0127] 在用dsRNA-GFP饲喂7天的成年蜂和对照(未饲喂)蜂上放置瓦螨个体。在指定 时间(图1)从瓦螨提取RNA并使之经历使用GFP引物的RT-PCR。结果示于图3中。
[0128] 给蜂饲喂凋亡抑制剂(IAP)基因 (SEQ ID NO: 27)的dsRNA区段。通过RT-PCR 对从该蜂巢收集的瓦螨分析IAP基因的表达(图4)。
[0129] 实施例2 材料和方法 用对应于瓦螨基因区段的dsRNA的两种不同的混合物饲喂蜂巢。所有dsRNA对应于不 与蜂或人序列同源(不携带长于19个碱基的同源序列段)的基因区段。混合物I (最小 处理)包含SEQ ID NO: 1、13、27、30和39。混合物II (最大处理)包含SEQ ID NO: 1、 4、7、10、13、16、19、22、25、27、30、33、36和39。在每个蜂巢中放置三十只瓦螨个体并在两个 月后对每个蜂巢中的瓦螨和蜂计数。每组处理重复3次。
[0130] 结果 在各个蜂巢中未观察到对蜂巢蜂数的可见损害。图5显示了在用瓦螨基因序列的 dsRNA处理之后瓦螨群体的减少。
[0131] 实施例3 用于预防瓦螨相关的蜜蜂疾病的瓦螨特异性dsRNA的大规模现场试验 为了确定在实际现场条件下摄入的瓦螨dsRNA对瓦螨侵染的有效性,以及评价对蜂群 健康的重要参数的影响,在用瓦螨侵染前5天和在侵染后4天,在饲料中给全尺寸蜂巢样品 中的蜂提供瓦螨特异性dsRNA。
[0132] 材料和方法 昆虫材料: 来自以下处理的五个蜂群:远程对照、仅瓦螨dsRNA、仅瓦螨以及在每个时间点:第0天 (病毒施用日)、第7天和终点(第42天)的瓦螨特异性dsRNA +瓦螨。重复测试数次。
[0133] RNA 提取: 使用Tri-Reagent (Sigma,USA)根据制造商提供的方案提取RNA。在上样至凝胶之前, 用DNA酶I处理所有样品并用上样缓冲液(90%甲酰胺、0. 05溴酚蓝、0. 05%二甲苯蓝)重 悬。
[0134] 凝胶电泳和印迹: 使用nanodrop分光光度计测定10 ug新鲜制备的RNA并在变性环境(凝胶含有7M尿 素)中上样至12%丙烯酰胺凝胶(丙烯酰胺:双丙烯酰胺比率为1:19)。电泳之后使用电 印迹法将样品转移至带正电荷的尼龙膜(Roch,USA)。
[0135] 杂交和信号检测: 将膜与新鲜制备的瓦螨区段的DNA探针杂交,所述区段取自不对应于瓦螨特异性 dsRNA本身的dsRNA的区。这使用DIG PCR探针制备试剂盒(Roch,USA)根据制造商方案于 42°C在DIG easyhyb溶液(Roch,USA)中进行。用2 X SSC/0. 1 % SDS将膜洗涤两次,然 后针对严格性在65 °C用0.1 X SSC/0. 1 % SDS洗涤。使用DIG洗涤和封闭试剂盒(Roch, USA)根据制造商方案进一步洗涤膜。使用CSPD-star底物(Roch,USA)进行检测。阳性对 照为对应于已杂交序列的21 nt DNA引物。
[0136] 利用在Kodak制造的化学发光器(chemiluminator)中暴露膜2-12个小时来检测 信号。
[0137] 在不存在瓦螨侵染时,在饲喂瓦螨-dsRNA的蜂巢和对照蜂巢中评价蜂群体健康 的基本参数(封盖幼蜂的数量、蜂巢中蜂的数量、返回的采集蜂以及蜂蜜产量)。
[0138] 实施例4 蜂摄取的dsRNA从蜂转移给瓦蹒以及经由瓦蹒侵染回传给蜂的双向转移 在实施例1和2中,已显示dsRNA可从蜂转移给瓦螨:直接转移给侵染摄取所述dsRNA 的蜂的螨,或者间接转移给侵染由摄取所述dsRNA的蜂喂养的幼虫的螨。为了揭示螨是否 能进一步充当另外的载体,经由寄生将dsRNA或siRNA从螨回传给"幼稚"蜂,在侵染饲喂 dsRNA的蜂之后使瓦螨侵染"幼稚"蜂。
[0139] 材料和方法 办7?姻#备.·从克隆到质粒中相对的T7启动子之间的序列制备瓦螨特异性和GFP dsRNA,如在实施例1中所述。长度为200-450 bp的所选瓦螨基因的区段,在序列上不对应 于任何蜂或人基因(少于21个连续碱基的同一性),经选择用于瓦螨dsRNA产生。下表1 详述了用于制备dsRNA的引物的序列,以及扩增子的长度(不包括T7启动子序列)。
[0140] 表1-用于dsRNA制备的引物
【主权项】
1. 一种分离的核酸剂,所述核酸剂包含选自SEQIDNO. 93-105和106的核酸序列。
2. -种核酸构建体,所述核酸构建体包含编码权利要求1的分离的核酸剂的核酸序 列。
3. -种蜂可摄取的组合物,所述组合物包含权利要求1的至少一种核酸剂。
4. 权利要求3的蜂可摄取的组合物,其包含至少五种核酸剂,所述核酸剂各自具有选 自SEQIDNo: 93-105和106的不同的核酸序列。
5. 权利要求3的蜂可摄取的组合物,其包含至少一种具有如在SEQIDNo: 93、96、 100、104和106中所述的核酸序列的核酸剂。
6. 权利要求3的蜂可摄取的组合物,其包含具有如在SEQIDNo: 93、96、100、104和 106中所述的核酸序列的核酸剂的每一种。
7. 权利要求3的蜂可摄取的组合物,其呈选自固体形式和液体形式的形式。
8. 权利要求3的蜂可摄取的组合物,其进一步包含蛋白质。
9. 权利要求8的蜂可摄取的组合物,其中所述蛋白质呈花粉和/或大豆饼的形式。
10. 权利要求7的蜂可摄取的组合物,其中所述液体形式选自蔗糖溶液和玉米糖浆溶 液。
11. 一种预防或治疗蜂巢的狄斯瓦螨侵染的方法,所述方法包括向所述蜂巢的蜂给予 有效量的至少一种具有选自SEQIDNO. 93-105和106的序列的核酸剂,从而预防或治疗 所述蜂巢的狄斯瓦螨侵染。
12. 权利要求11的方法,其中所述蜜蜂为蜂群的蜂,且其中所述给予降低所述蜂群对 蜂群崩溃失调病的易感性。
13. 权利要求11的方法,其中所述给予通过饲喂来实现。
14. 权利要求13的方法,其中所述核酸剂以蜂可摄取的组合物提供,所述蜂可摄取的 组合物选自液体的蜂可摄取的组合物和固体的蜂可摄取的组合物。
15. 权利要求14的方法,其中所述蜂可摄取的组合物包含至少一种具有在SEQIDNo: 93、96、100、104和106中所述的核酸序列的核酸剂。
16. 权利要求14的方法,其中所述蜂可摄取的组合物包含至少五种核酸剂,每一种核 酸剂具有选自SEQIDNo: 93-106的不同的核酸序列。
17. 权利要求11的方法,其中所述核酸剂作为核酸构建体给予。
18. -种降低蜜蜂对蜂群崩溃失调病(CCD)的易感性的方法,所述方法包括向蜜蜂给 予有效量的至少一种选自如在SEQIDNo: 93-95和106中所述的核酸序列的核酸剂,从而 降低蜜蜂对蜂群崩溃失调病(CCD)的易感性。
19. 权利要求18的方法,其中所述核酸剂如在SEQIDNo: 93、96、100、104和106中 所述。
【专利摘要】本文公开了一种分离的核酸剂,所述核酸剂包含减量调节狄斯瓦螨基因产物的表达的核酸序列。所述核酸剂可具有如在SEQ ID NO. 93-106中所述的序列。亦公开了包含所述核酸剂的组合物及其用途。
【IPC分类】A61K31-713, C12N15-113
【公开号】CN104718294
【申请号】CN201380031114
【发明人】E.本-查诺奇, Y.加比安, H.卡莱, E.毛里, I.塞拉, S.沙菲尔, G.亚登
【申请人】耶路撒冷希伯来大学伊森姆研究发展公司, 比奥罗吉克斯公司
【公开日】2015年6月17日
【申请日】2013年4月11日
【公告号】CA2869831A1, EP2836596A2, US8962584, US20120258646, US20150133532, WO2013153553A2, WO2013153553A3
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