一种血清IFN‑γ和LncRNAs组合物用于制备胃癌诊断试剂盒的用途的制作方法

文档序号:13802815阅读:363来源:国知局
一种血清IFN‑γ和LncRNAs组合物用于制备胃癌诊断试剂盒的用途的制作方法

本发明属于基因诊断领域,涉及诊断试剂盒的开发,具体涉及一种血清ifn-γ和lncrnas组合物用于制备胃癌诊断试剂盒的用途。



背景技术:

胃癌在我国发病率居恶性肿瘤第2位,死亡人数占癌症人数14.33%,居第3位,仅次于肺癌和肝癌。由此可见,胃癌是肿瘤防治的重点。随着肿瘤标志物广泛应用于临床,越来越多学者研究发现,在癌症防治过程中肿瘤标志物发挥重要的作用。ifn-γ是参与免疫调节的重要细胞因子,一般由活化的t淋巴细胞分泌,能够影响肿瘤细胞的生长。ifn-γ在肿瘤患者体内表达水平明显异常。基于此,已有多项研究将ifn-γ作为肿瘤诊断的标志物。

已有研究将血清ifn-γ作为诊断标志物用于诊断胃癌(血清ifn-γ和肿瘤标志物联合检测对胃癌的诊断价值,生物医学工程与临床2016年3月第20卷第2期),但是,单独使用血清ifn-γ诊断胃癌的准确度较低,临床价值低。



技术实现要素:

本发明的目的在于提供血清ifn-γ和lncrnas组合物用于制备胃癌诊断试剂盒的用途,以提高临床诊断胃癌的准确度。

本发明通过下面的技术方案得以实现:

ifn-γ和lncrnanonhsat089447或lncrnanonhsat041499联合用于制备诊断胃癌的诊断组合物的用途。

ifn-γ和lncrnanonhsat089447、lncrnanonhsat041499联合用于制备诊断胃癌的诊断组合物的用途。

优选地,所述ifn-γ、lncrnanonhsat089447、lncrnanonhsat041499为血清ifn-γ、nonhsat089447、nonhsat041499。

ifn-γ和lncrnanonhsat089447或lncrnanonhsat041499联合用于制备诊断胃癌的诊断试剂盒的用途。

ifn-γ和lncrnanonhsat089447、lncrnanonhsat041499联合用于制备诊断胃癌的诊断试剂盒的用途。

优选地,所述ifn-γ、lncrnanonhsat089447、lncrnanonhsat041499为血清ifn-γ、nonhsat089447、nonhsat041499。

本发明的优点:

单独使用血清ifn-γ诊断区分胃癌与健康志愿者时,roc曲线下面积(auc)为0.636。本发明发现,使用血清nonhsat089447或nonhsat041499与血清ifn-γ联合诊断区分胃癌与健康志愿者时,auc可以提高到0.793或0.805;使用血清nonhsat089447和nonhsat041499与血清ifn-γ联合诊断区分胃癌与健康志愿者时,auc可以提高到0.921。本领域技术人员知道,roc曲线下面积在1.0和0.5之间,在auc>0.5的情况下,auc越接近于1,说明诊断效果越好。auc在0.5-0.7时有较低准确性,auc在0.7-0.9时有一定准确性,auc在0.9以上时有较高准确性。因此,血清ifn-γ可以联合血清nonhsat089447和/或nonhsat041499用于制备诊断胃癌的诊断试剂盒。

附图说明

图1为血清ifn-γ单独诊断区分胃癌患者与健康志愿者的roc曲线;

图2为血清ifn-γ联合nonhsat089447诊断区分胃癌患者与健康志愿者的roc曲线;

图3为血清ifn-γ联合nonhsat041499诊断区分胃癌患者与健康志愿者的roc曲线;

图4为血清ifn-γ联合血清nonhsat089447和血清nonhsat041499诊断区分胃癌患者与健康志愿者的roc曲线。

具体实施方式

下面结合具体实施例进一步介绍本发明的技术方案。

一、实验材料

胃癌患者血清标本取自东南大学附属中大医院胃癌手术后患者。所有患者术前均未接受放射治疗、化学治疗及抗肿瘤药物等治疗,均有完整的临床及病理资料。胃癌患者138例(胃癌组),其中女性63例,男性75例;年龄35-75岁,平均年龄63.3岁。

健康志愿者血清标本55例(正常对照组),其中女性26例,男性29例;年龄35-70岁,平均年龄61.5岁。

胃癌组和正常对照组间年龄和性别构成差异无统计学意义。

ifn-γ检测酶联免疫吸附分析(elisa)试剂盒购于raybiotech公司。

二、实验方法

1、血清ifn-γ测定方法

ifn-γ检测采用elisa方法,按照试剂盒说明严格执行。

2、血清lncrnas测定方法

取血清200μl,使用tiangen公司的rnapreppure试剂盒提取总rna。实验过程中应尽可能减少rna降解,以获得纯度和质量均较高、无蛋白和其它杂质污染的rna。用1.5%琼脂糖凝胶电泳分析rna的完整性,紫外分光光度法检测rna浓度。

使用tiangen公司的tianscriptcdna第一链合成试剂盒和oligo(dt)15通用逆转录引物进行逆转录反应。反转录总体系为20μl:1-5μg总rna,2μloligo(dt)15,2μlsuperpuredntps,补rnase-freeddh2o至14.5μl。反应管置70℃加热5min后迅速在冰上冷却2min,加入4μl5xfirststrandbuffer(含有dtt),0.5μlrnasin,1μltianscriptm-mlv,轻轻用移液器混匀,42℃温浴50min。95℃加热5min终止反应,反应产物于-20℃保存备用。

根据genbank目的基因序列,用引物设计软件primerpremier5.0设计nonhsat089447、nonhsat041499特异性引物,由上海生工公司合成。内参引物hs-actb(β-actin)购自上海生工公司。反应体系(20μl):sybrselectmastermix10μl,cdna2μl,上游引物1μl,下游引物1μl,ddh2o6μl。使用abi公司的7500fast荧光定量检测仪进行检测。反应参数:50℃2min;95℃2min,95℃15s,60℃15s,72℃1min,共45个循环。溶解曲线参数:95℃15s,60℃1min,95℃15s,60℃15s。每份样品重复测定3次,获得ct值。以actb的拷贝数作为校正基数,计算各样本中各lncrnas的相对内参表达量,即为该样品中目标lncrnas的相对表达量。

nonhsat089447、nonhsat041499特异性引物如下:

nonhsat089447上游:5’-gtagggcttggatggacttt-3’;

nonhsat089447下游:5’-ccgtcaacacatcaggcct-3’;

nonhsat041499上游:5’-cgattttgggaacctctatc-3’;

nonhsat041499下游:5’-caactgctgggtggagtcta-3’。

3、统计学处理

采用spss20.0软件进行分析,以均值±偏差表示,组间比较采用t检验。评价各项指标应用价值,绘制受试者工作特征(roc)曲线,并计算曲线下面积(auc);以p<0.05为差异有统计学意义。采用roc曲线评价各单项指标及联合指标对胃癌的诊断价值。

三、实验结果

1、两组间肿瘤标志物水平的比较

胃癌组血清中ifn-γ水平明显低于正常对照组,胃癌组血清中nonhsat089447、nonhsat041499的相对表达水平均明显高于正常对照组,差异均有统计学意义(t值分别为1.413、2.034和1.935,p<0.01)。比较结果如表1所示。

表1两组间肿瘤标志物水平的比较(均值±偏差)

2、肿瘤标志物检测胃癌roc曲线分析

单独使用血清ifn-γ诊断区分胃癌与健康志愿者时,roc曲线下面积(auc)为0.636。使用血清nonhsat089447或nonhsat041499与血清ifn-γ联合诊断区分胃癌与健康志愿者时,auc可以提高到0.793或0.805;使用血清nonhsat089447和nonhsat041499与血清ifn-γ三者联合诊断区分胃癌与健康志愿者时,auc可以提高到0.921,准确率高达92.23%。由此可见,血清ifn-γ联合nonhsat089447或nonhsat041499诊断胃癌具有一定的临床价值,血清ifn-γ联合nonhsat089447和nonhsat041499诊断胃癌具有较高的临床价值。两个或三个指标的roc曲线分析结合二元逻辑回归操作。

roc曲线分析结果如表2和图1-4所示。

表2血清ifn-γ单独及联合nonhsat089447和/或nonhsat041499诊断价值比较

本领域技术人员知道,roc曲线下面积在1.0和0.5之间,在auc>0.5的情况下,auc越接近于1,说明诊断效果越好。auc在0.5-0.7时有较低准确性,auc在0.7-0.9时有一定准确性,auc在0.9以上时有较高准确性。因此,血清ifn-γ可以联合血清nonhsat089447和/或nonhsat041499用于制备诊断胃癌的诊断试剂盒。

当前第1页1 2 
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1