本发明涉及基于生物标志分布型确定受病毒感染的个体的疾病状态的方法和诊断学。更确切地，本发明涉及用于评估病毒的基因编辑治疗的方法和诊断学。
背景技术：
许多人患有病毒感染(例如hiv和肝炎)，病毒在个体的细胞内复制。病毒可以在细胞内潜伏，这意味着病毒不活跃并且不会产生疾病症状，但可以在稍晚的时间变得活跃。常规地，向患有病毒的人给予抗病毒药物，但抗病毒药物不能解决潜伏病毒的问题。因此，可能难以确定个体在治疗后是否摆脱了病毒。
slupsky的pct/us2013/068592公开了一种通过从已知具有第一和第二疾病状态的受试者获得第一和第二组生物样品来确定受试者中疾病状态的方法，每个生物样品包含多个生物标志，第一和第二状态通过预定时间段进行区分；对于每个样品，基于来自多个样品的生物标志的浓度来产生疾病的每种状态的分布型；基于来自具有未知疾病状态的受试者的生物样品来产生分布型；并且将未知疾病状态的分布型与第一和第二疾病状态的分布型进行比较，以确定受试者是否具有第一疾病状态或第二疾病状态之一。这种方法用于确定个体是否患有hiv并且是否最近感染了hiv。
仍需要确定任何类型病毒的感染状态，以及疗法是否有效治疗病毒的方法。
技术实现要素：
本发明提供了诊断面板，其包括用于检测指示病毒存在的至少一种生物标志的测试。
本发明提供了试剂盒，其包括诊断面板、使用说明书、取得并将样品应用于面板的材料、以及生物标志水平及其含义的描述。
本发明提供了一种检测疾病存在的方法，该方法通过取得个体样品，将样品应用于包括至少一种指示疾病的生物标志的诊断面板，检测至少一种生物标志的存在，将生物标志的水平与基线进行比较，并确定个体是否患有疾病。
本发明进一步提供了一种确定疾病阶段的方法，该方法通过取得个体样品，将样品应用于包括至少一种指示疾病的生物标志的诊断面板，检测至少一种生物标志的存在，将生物标志的水平与已知的阶段水平进行比较，并确定个体疾病的阶段。
本发明还提供了一种监测疾病治疗进展的方法，该方法通过取得个体样品，将样品应用于包括至少一种指示疾病的生物标志的诊断面板，检测至少一种生物标志的存在，将生物标志的水平与基线进行比较，并确定治疗是否有效逆转或预防疾病。
本发明提供了一种确定病毒抑制或反弹的方法，该方法通过取得接受基因编辑疗法、抗病毒治疗或其组合治疗的个体样品，将样品应用于包括至少一种指示疾病的生物标志的诊断面板，检测至少一种生物标志的存在，将生物标志的水平与基线进行比较，并确定潜伏病毒是否已被激活。
本发明提供了一种检测潜伏病毒的方法，该方法通过取得个体样品，将样品应用于包括至少一种指示疾病的生物标志的诊断面板，检测至少一种生物标志的存在，将生物标志的水平与基线进行比较，并确定潜伏病毒是否存在于个体中。
具体实施方式
本发明一般针对通过确定至少一种代谢物或生物标志的水平并确定个体的代谢状态来确定病毒存在的诊断面板和方法。诊断面板可以确定各种治疗期间的疾病状态和病毒抑制或反弹。
如在此所用的术语“测定”是指确定混合物或样品的特定组分的量的程序。“测定”可与本文的术语“测试”互换使用。
如在此所用的术语“生物标志”是指物质，例如但不限于蛋白质、dna序列、rna序列、代谢物或其他生物物质或当被检测到时，指示个体关于疾病的特定健康或不健康状态的物质，并且尤其是处于激活和/或不活跃状态的病毒。
如在此所用的术语“健康”是指没有疾病，健康状况良好并且患病风险相对较低的个体的状态。
如在此所用的术语“样品”是指来自个体的生物样品，并且可以是但不限于血液、血浆、尿液、唾液、眼泪、组织或脑脊髓液(csf)。
如在此所用的术语“疾病阶段”是指个体中疾病的进展。该阶段可以是侵袭性的、活跃的、急性的、近期的、慢性的、惰性的、非近期的、原发性的、持续性的、减弱的或亚临床的。该阶段也可以不存在疾病。
如在此所用的术语“个体”优选地是指人，但也可指任何动物，例如但不限于猴、狗、猫、兔、蝙蝠、马、绵羊、母牛、猪、小鼠或患有疾病的大鼠。
最一般地，诊断面板包括一组化学、免疫化学和/或酶测定或测试，其可以一起用于监测一组生物标志的水平。诊断面板可以用于确定疾病的存在或个体患病的倾向。诊断面板还可以用于标记疾病进展和疾病阶段，例如最近感染(少于6个月前感染)或慢性感染(超过12个月前感染)。可以为疾病的每个阶段创建各种参考或基线，其可以包括针对疾病阶段的可能水平的特定生物标志。评估疾病的不同阶段或组成部分对于干预或逆转疾病的影响是重要的。诊断面板可以用于确认治疗后疾病的根除。最优选地，诊断面板包括用于检测指示病毒存在的至少一种生物标志的测试。
生物标志优选地是指示疾病，并且尤其是病毒存在的代谢物。代谢物是那些参与用于能量产生、生长、发展、信号传导和繁殖的细胞反应并且可以根据细胞需要从细胞中摄取或释放的化学物质(一般小于1,000da)。这些化学物质包括糖、氨基酸、有机酸以及异生素化合物。代谢物组学(或有时被称为代谢组学)致力于研究细胞或系统中的所有代谢物以及可能由内部或外部压力(例如感染、疾病状态或暴露于毒素)引起的变化。代谢变化可能是由使用这些代谢物的化学反应(即代谢途径)或者摄取或释放这些代谢物的转运蛋白的变化引起的。病毒或细菌对人的感染在细胞水平(感染位点)和全身性(通过先天免疫应答)引起重大变化。这些反应包括但不限于特异性免疫细胞的信号传导，细胞凋亡的信号传导，转运蛋白的变化，以及线粒体功能和能量产生的变化——可以观察到的变化是细胞水平的代谢物浓度的变化，以及血液或尿液中的全身代谢物浓度的变化。
代谢物可以包括但不限于1,3-尿酸二甲酯、左旋葡聚糖、1-甲基烟酰胺、代谢物1,2-羟基异丁酸酯、2-氧化戊二酸酯、3-氨基异丁酸酯、3-羟基丁酸酯、3-羟基异戊酸酯、3-吲哚硫酸酯、4-羟基苯乙酸酯、4-羟基苯基乳酸、4-吡啶酸氧盐、乙酸盐、乙酰乙酸盐、丙酮、己二酸盐、丙氨酸、尿囊素、天冬酰胺、甜菜碱、肉毒碱、柠檬酸盐、肌肉素、肌酸酐、二甲胺、乙醇胺、甲酸盐、海藻糖、富马酸盐、葡萄糖、谷氨酰胺、甘氨酸、代谢物2、代谢物3、马尿酸盐、组氨酸、次黄嘌呤、异亮氨酸、乳酸盐、亮氨酸、赖氨酸、甘露醇、代谢物4、代谢物5(可能是甲胺)、代谢物6(可能是甲基胍)、n,n-二甲基甘氨酸、o-乙酰肉毒碱、泛酸盐、丙二醇、焦谷氨酸盐、丙酮酸盐、喹啉酸酯、丝氨酸、琥珀酸盐、蔗糖、代谢物7(可能是酒石酸盐)、牛磺酸、苏氨酸、葫芦巴碱、三甲胺-n-氧化物、色氨酸、酪氨酸、尿嘧啶、尿素、缬氨酸、木糖、顺乌头酸、肌醇、反式乌头酸、1-甲基组氨酸、3-甲基组氨酸、抗坏血酸盐、苯乙酰谷氨酰胺、4-羟脯氨酸、葡糖酸盐、半乳糖、半乳糖醇、植物半乳糖、乳糖、苯基丙氨酸、脯氨酸甜菜碱、三甲胺、丁酸盐、丙酸盐、异丙醇、甘露糖、3-甲基黄嘌呤、乙醇、苯酸盐、谷氨酸盐、甘油及其组合。
代谢物也可以是以下代谢周期中的任何一种：
多嘌呤：鸟苷、鸟嘌呤、黄嘌呤、尿酸、腺苷、肌苷、肌苷酸、次黄嘌呤、黄嘌呤、co2、h2o、尿素、n-氨基甲酰-β-丙氨酸、β-丙氨酸、氨和β-氨基异丁酸酯。
聚胺类：腐胺、亚精胺、精胺、甲硫氨酸、s-腺苷甲硫氨酸、脱去羧基的s-腺苷甲硫氨酸、精氨酸、鸟氨酸、腐胺、n1-乙酰亚精胺、n1-乙酰精胺、elf5a(lys)、elf5a(dhp)、elf5a(hpu)、n1n2-二乙酰精胺、3-氨基丙醛、3-乙酰氨基丙醛、丙烯醛和fdp-赖氨酸蛋白质。
krebs/tca循环：苏式-ds-异柠檬酸盐、草酰-琥珀酸盐、2-氧代-戊二酸盐、草酰-乙酸盐、l-谷氨酸盐、2-羟基-戊二酸盐、丙酮酸盐、乙酰基-coa、顺乌头酸、d-异柠檬酸盐、α-酮戊二酸盐、琥珀酰基-coa、琥珀酸盐、富马酸盐、苹果酸盐、甘氨酸、柠檬酸盐、肉毒碱、(-)o-乙酰基-肉毒碱、顺乌头酸、衣康酸盐、乙醇酸盐、乙醛酸盐、草酸盐、草酰基-coa、甲酸盐、甲酸基-coa和co2。
糖酵解和葡糖异生：葡萄糖、葡萄糖6-磷酸盐(g6p)、果糖6-磷酸盐(f6p)、果糖1,6-磷酸氢盐(f1,6bp)、甘油醛3-磷酸盐(gadp)、二羟基丙酮磷酸盐(dhap)、1,3-双磷酸甘油酸(1,3bpg)、3-磷酸甘油酸(3pg)、2-磷酸甘油酸(2pg)、磷酸烯醇丙酮酸(pep)、丙酮酸盐、d-葡萄糖、d-葡糖酸-1,5-内酯、d-葡糖酸盐、α-d-甘露糖6-p、d-甘露糖、d-果糖、d-山梨糖醇、甘油酮-p、sn-甘油-3p、甘油、d-甘油醛、1,2丙烷-二醇、2-羟基丙醛、3-p-丝氨酸、3-p-羟基丙酮酸盐、d-甘油酸盐、羟基丙酮酸盐、l-丙氨酸、l-丙氨酰基-trna、l-谷氨酸盐、2-氧化戊二酸酯、l-乳酸盐和d-乳酸盐。
氧化磷酸化：三磷酸腺苷(atp)、二磷酸腺苷(adp)、h+、琥珀酸盐、富马酸盐、h2o、o2、nadh和nad+。
戊糖磷酸：葡萄糖-6-磷酸盐、nadp+、nadph、6-磷酸葡糖酸内酯、h2o、h+、6-磷酸葡糖酸盐、co2、核酮糖-5-磷酸盐、核糖-5-磷酸盐、木酮糖-5-磷酸盐、甘油醛3-磷酸盐、景天庚酮糖7-磷酸盐、果糖6-磷酸盐、赤藓糖4-磷酸盐和木酮糖5-磷酸盐、d-核酮糖、d-核糖醇、d-核糖、l-核酮糖、景天庚酮糖1,7p2，和3-氧代-6-p-己酮糖。
尿素循环：l-鸟氨酸、氨甲酰磷酸、l-瓜氨酸、精氨琥珀酸、富马酸盐、l-精氨酸、尿素、l-天冬氨酸盐、二磷酸腺苷(adp)、单磷酸腺苷(amp)和焦磷酸盐。
脂肪酸β-氧化：反式-δ2-烯酰基-coa、l-β-羟烷基coa、β-酮乙基coa、fadh2、nadh、乙酰基-coa、酰基-coa、丙酰基-coa和琥珀酰基-coa。
核苷酸代谢：amp、肌苷一磷酸(imp)、黄苷一磷酸(xmp)、鸟苷一磷酸(gmp)、核糖-5-磷酸盐、腺苷、肌苷、次黄嘌呤、黄苷、黄嘌呤、鸟苷、鸟嘌呤、尿酸、富马酸盐、腺苷酸琥珀酸、尿苷、尿苷一磷酸(ump)、adp、胸苷、胸腺嘧啶、脱氧核糖-1-磷酸盐、脱氧胸苷一磷酸(dtmp)、脱氧胞苷、atp和脱氧胞苷一磷酸(dcmp)。
辅因子和维生素：棕榈酸视黄酯、棕榈酸盐、棕榈基-coa、异维a酸酯、β-葡糖苷酸、视黄醛、β-胡萝卜素、视黄酸、骨化二醇、25-羟基麦角钙化醇、骨化三醇、甲基钴胺素、5’-脱氧腺苷钴胺素、α-cech、nad+、nadh、adp和atp。
氨基酸代谢：谷氨酸盐、nh4+、α-酮戊二酸盐、丙酮酸盐、草酰乙酸盐、谷氨酸盐γ-半醛、δ1-吡咯啉-5-羧酸盐、瓜氨酸、精氨酸、尿素、鸟氨酸、甘氨酸、co2、nh3、n5,n10-亚甲基thf、3-磷酸甘油酸盐、α-酮丁酸盐、丙酰基-coa、琥珀酰基-coa、乙酰基-coa、丝氨酸、α-氨基-β-酮丁酸盐、氨基丙酮、半胱亚磺酸、β-亚磺酰基丙酮酸盐、亚硫酸氢盐、亚硫酸盐、硫酸盐、丙氨酸、谷胱甘肽、牛磺酸、亚牛磺酸、腺苷5’-磷酰硫酸、3’-磷酸腺苷5’-磷酰硫酸、同型半胱氨酸、α-酮-β-戊酸甲酯、α-酮异己酸、α-酮异戊酸酯、α-甲基丁酰基-coa、甲基巴豆酰基-coa、3-甲基-3-羟基丁酸酰基-coa、2-甲基乙酰乙酰基-coa、异戊酰基-coa、3-甲基巴豆酰基-coa、3-甲基戊烯二酰-coa、3-羟基-3-甲基戊二酰-coa、乙酰乙酸盐、异丁酰基coa、甲基丙烯基-coa、3-羟基异丁酰基-coa、甲基丙二酸单醛、酪氨酸、p-羟基苯基丙酮酸盐、尿黑酸盐、4-马来酰乙酰乙酸盐、4-延胡索酰乙酰乙酸盐、富马酸盐、3-羟基三甲基赖氨酸、4-n-三甲氨基丁醛、γ-丁酰甜菜碱、肉毒碱、尿刊酸酯、4-咪唑啉酮-5-丙酸盐、n-亚胺代甲基-l-谷氨酸盐、n5-亚胺甲基-四氢叶酸盐、组胺、n-甲酸基-犬尿素、犬尿素、犬尿胺酸、3-羟基犬尿素、邻氨基苯甲酸盐、3-羟基邻氨基苯甲酸盐、喹啉酸酯、戊二酰基-coa、和乙酰乙酰基-coa。
可以使用单一代谢物，以及确定疾病状态的代谢物的任何组合。
优选地，用诊断面板检测的疾病是病毒，例如但不限于，人类免疫缺陷病毒(hiv)、单纯疱疹病毒(hsv-1和hsv-2)、人类t淋巴细胞病毒(htlv)、约翰坎宁安病毒(jc病毒)、水泡性口炎病毒(vsv)、丙型肝炎病毒(hcv)、乙型肝炎病毒(hbv)、寨卡病毒、登革热病毒、基孔肯亚病毒、埃博拉病毒、腺相关病毒、爱知病毒、澳洲蝙蝠狂犬病病毒、bk多瘤病毒、版纳病毒、巴马森林病毒、布尼奥罗病毒、拉克罗斯布尼亚病毒(bunyaviruslacrosse)、北美野兔布尼亚病毒、猕猴疱疹病毒、金迪普拉病毒、cosavirusa、牛痘病毒、柯萨奇病毒、克里米亚-刚果出血热病毒、多里病毒、道格比病毒、杜文哈格病毒、东部马脑炎病毒、埃可病毒、脑心肌炎病毒、艾巴氏病毒、欧洲蝙蝠狂犬病毒、庚型肝炎病毒、汉坦病毒、亨德拉病毒、甲型肝炎病毒、戊型肝炎病毒、丁型肝炎病毒、马痘病毒、人类腺病毒、人星状病毒、人冠状病毒、人巨细胞病毒、人肠道病毒68、人肠道病毒70、人类疱疹病毒6、人类疱疹病毒7、人类疱疹病毒8、人乳头瘤病毒(hpv)1、hpv2、hpv16、hpv18、人副流感病毒、人类细小病毒b19、人类呼吸道合胞病毒、人鼻病毒、人类严重急性呼吸系统综合症(sars)冠状病毒、人泡沫反转录病毒、人环曲病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒、丙型流感病毒、伊斯法罕病毒、jc多瘤病毒、日本脑炎病毒、呼宁砂粒样病毒、ki多瘤病毒、昆津病毒、拉哥斯蝙蝠病毒、维多利亚湖马尔堡病毒、兰加特病毒、拉沙病毒、洛兹达雷病毒、跳跃病病毒、淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒、马丘波病毒、马雅罗病毒、中东呼吸综合征(mers)冠状病毒、麻疹病毒、孟戈脑心肌炎病毒、默克尔细胞多瘤病毒、莫科拉病毒、传染性软疣病毒、猴痘病毒、腮腺炎病毒、墨累山谷脑炎病毒、纽约病毒、尼帕病毒、诺沃克病毒、阿尼昂尼昂病毒、orf病毒、奥罗普切病毒、皮秦德病毒、脊髓灰质炎病毒、庞塔托鲁静脉病毒、普马拉病毒、狂犬病病毒、裂谷热病毒、罗莎病毒a、罗斯河病毒、轮状病毒a、轮状病毒b、轮状病毒c、风疹病毒、鹭山病毒、萨利病毒a、白蛉热西西里病毒、扎幌病毒、塞姆利基森林病毒、汉城病毒、猴泡沫病毒、猴病毒5、辛德毕斯病毒、南汉普顿病毒、圣路易斯脑炎病毒、蜱传播的玻瓦桑病毒、细环病毒、托斯卡纳病毒、ulukuniemi病毒、牛痘病毒、水痘带状疱疹病毒、天花病毒、委内瑞拉马脑炎病毒、水泡性口炎病毒、西部马脑炎病毒、wu多瘤病毒、西尼罗病毒、雅巴猴肿瘤病毒、雅巴样疾病病毒或黄热病病毒。
通常，诊断面板可以使用支撑结构，例如具有多个孔的扁平微孔板(例如elisa板)来保持样品。根据每次测试的需要，可以将各种酶或抗体应用于孔。壳体可以封闭诊断面板以防止样品在塑料或其他适合的材料中的污染或不想要的扩散。可以包括多种传感器以感测生物标志的浓度数据。处理器可以分析浓度数据并提供疾病或特定疾病阶段存在的结果。
可以使用各种方法检测生物标志的存在，例如但不限于液相色谱法、气相色谱法、液相色谱法-质谱分析法、气相色谱法-质谱分析法、高效液相色谱法-质谱分析法、毛细管电泳法-质谱分析法、核磁共振谱法(nmr)、拉曼光谱学或红外光谱法。
本发明的诊断面板可以包括在试剂盒中。试剂盒可包括诊断面板、使用说明书、取得并将样品应用于面板的材料(例如但不限于拭子、注射器或小瓶)、以及生物标志水平及其含义的描述(例如正常值)。试剂盒可以根据需要包括各种抗体以检测生物标志。
本发明提供了一种检测疾病存在的方法，该方法通过取得个体样品，将样品应用于包括至少一种指示疾病的生物标志的诊断面板，检测至少一种生物标志的存在，将生物标志的水平与基线进行比较，并确定个体是否患有疾病。最优选地，生物标志指示病毒的存在，例如上文所述的任何病毒。可以通过上述任何方法检测生物标志。可以基于已知患有疾病的个体来创建疾病存在的基线。不同浓度的生物标志可以指示疾病的存在。如果确定个体患有疾病，可以推荐治疗。
本发明进一步提供了一种确定疾病阶段的方法，该方法通过取得个体样品，将样品应用于包括至少一种指示疾病的生物标志的诊断面板，检测至少一种生物标志的存在，将生物标志的水平与已知的阶段水平进行比较，并确定个体疾病的阶段。可以通过上述任何方法检测生物标志。可以通过本领域已知的方法基于已知具有特定阶段的个体来创建各种阶段水平基线。不同浓度的生物标志可以指示不同的阶段。根据确定的阶段，可以向个体推荐治疗。
本发明还提供了一种监测疾病治疗进展的方法，该方法通过取得个体样品，将样品应用于包括至少一种指示疾病的生物标志的诊断面板，检测至少一种生物标志的存在，将生物标志的水平与基线进行比较，并确定治疗是否有效逆转或预防疾病。可以通过上述任何方法检测生物标志。可以如上所述创建基线。
治疗可以是基因编辑疗法，例如但不限于crisprcas9、crisprcfp1、zfn、talen、基于白蛋白的编辑器和其他crispr相关核酸酶，例如c2c1、c2c3、tevcas9、古细菌cas9、casy.1-casy.6、casxgrna，或argonaute内切核酸酶gdna。治疗还可以是任何其他抗病毒治疗(蛋白酶抑制剂、整合酶抑制剂、rt抑制剂)例如，但不限于阿巴卡韦、无环鸟苷、阿昔洛韦、阿德福韦、金刚烷胺、安普那韦、安普利近、阿比朵尔、阿扎那韦、立普妥、巴拉维尔(balavir)、西多福韦、双汰芝、度鲁特韦、地瑞那韦、地拉韦啶、去羟肌苷、二十二烷醇、依度尿苷(edoxudine)、依非韦伦、恩曲他滨、恩夫韦地、恩替卡韦、依克利沃(ecoliever)、泛昔洛韦、福米韦生、福沙那韦、膦甲酸钠、磷乙酸钠(fosfonet)、融合抑制剂、更昔洛韦、伊巴他滨(ibacitabine)、异丙肌苷(imunovir)、碘苷、咪喹莫特、茚地那韦、肌苷、干扰素、i型干扰素、ii型干扰素、iii型干扰素、拉米夫定、洛匹那韦、洛韦胺、马拉韦罗、吗啉胍、美替沙腙、奈非那韦(nelfinavir)、奈韦拉平、多吉美(nexavir)、硝唑尼特、核苷类似物、诺维尔、奥司他韦、聚乙二醇干扰素α-2a、喷昔洛韦、帕拉米韦、普利康那利(pleconaril)、鬼臼毒素、雷特格韦、利巴韦林、金刚乙胺、利托那韦、嘧啶、沙奎那韦、索非布韦、特拉匹韦、替诺福韦、替诺福韦酯、替拉那韦、三氟胸苷、三协唯(trizivir)、醋胺金刚烷、特鲁瓦达、伐昔洛韦、缬更昔洛韦、维克韦罗(vicriviroc)、阿糖腺苷、韦拉米啶(viramidine)、扎西他滨、扎那米韦、或齐多夫定。治疗也可以是基因编辑疗法和抗病毒治疗的组合。基于生物标志水平的结果，如果必要的话，可以调整规定的治疗或剂量以改善其在个体中的作用。
诊断面板可以用于在用基因编辑疗法或抗病毒治疗或组合治疗对个体进行治疗期间确定病毒抑制或反弹。以这种方式，可以监测病毒的潜伏群体的激活，并且如果发现活性病毒则可以调整治疗。可以规定不同的治疗，或者可以基于结果改变当前治疗的剂量。例如，在初次感染hiv病毒后，主要的hiv感染会在数周至数月内消退，并且通常会伴随可能持续长达10年的临床“潜伏期”。潜伏期也被称为无症状hiv感染或慢性hiv感染。受试者的cd4淋巴细胞数量反弹，但不是反弹至感染前水平，并且大多数受试者进行血清转化，即在感染的2至4周内其血液中具有可检测水平的抗hiv抗体。在该潜伏期期间，在外周血单核细胞中不存在可检测的病毒复制，并且在外周血中几乎不存在可培养的病毒。在潜伏期(也称为临床潜伏期)期间，感染hiv的人可能不经历hiv相关症状，或只经历轻微症状。在稍晚的时间，病毒可以被激活并且个体可以再次经历症状。本发明可以用于检测何时开始这种激活，从而可以对个体规定适当的治疗。因此，本发明提供了一种确定病毒抑制或反弹的方法，该方法通过取得接受基因编辑疗法、抗病毒治疗或其组合治疗的个体样品，将样品应用于包括至少一种指示疾病的生物标志的诊断面板，检测至少一种生物标志的存在，将生物标志的水平与基线进行比较，并确定潜伏病毒是否已被激活。
大部分潜伏病毒仍然在灭活状态下产生基础水平量的病毒蛋白。基础蛋白仍然会通过测量代谢物转移间接检测到生化转变。因此，通过将来自诊断面板的结果与不存在病毒的基线进行比较，可以确定个体中是否存在潜伏病毒。这可以用于在个体开始出现任何症状之前检测病毒，如果个体已经停止出现任何症状，确定个体是否有在稍晚的时间患病的风险，或者他们是否应该避免某些疗法。因此，本发明提供了一种检测潜伏病毒的方法，该方法通过取得个体样品，将样品应用于包括至少一种指示疾病的生物标志的诊断面板，检测至少一种生物标志的存在，将生物标志的水平与基线进行比较，并确定潜伏病毒是否存在于个体中。
贯穿本申请，包括美国专利在内的各种出版物均由作者和年份以及专利号引用。下面列出了这些出版物的完整引文。这些出版物和专利的公开内容以其全文通过引用由此结合在本申请中，以便更完整地描述本发明所属的现有技术。
已经以示例性的方式描述了本发明，并且应理解，已经使用的术语的目的是处于说明性词语的性质，而非限制性的。
显而易见地，根据以上教导，本发明的很多修改和变化都是可能的。因此，应当理解，在所附权利要求的范围内可以用不同于具体描述的方式来实践本发明。