用于药物不良反应的危险率评估的制作方法

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专利名称:用于药物不良反应的危险率评估的制作方法
技术领域
本发明涉及用于预测个体药物不良反应(adverse drug reactions)的危险的方法。
参考文献U.S.Patent No.6,583,139。
Arellano,F.,and Sacristan,J.A.(1993).Allopurinol hypersensitivitysyndromea review.Ann.Pharmacother.27337。
Bigby,M.,et al.(1986).Drug-induced cutaneous reactions.A report from theBoston Collaborative Drug Surveillance Program on 15,438 consecutiveinpatients,1975 to 1982.JAMA.256(24)3358-3363。
Chan,S.H.,and Tan,T.(1989).HLA and allopurinol drug eruption.Dermatologica.79(1)32-33。
Edwards,S.G.,et al.(1999).Concordance of primary generalised epilepsyand carbamazepine hypersensitivity in monozygotic twins.Postgrad Med J.75(889)680-681。
Feltkamp,T.E.,et al.(2001).Spondyloarthropathies in eastem Asia.CurrOpin Rheumatol.13(4)285-290。
Gennis,M.A.,et al.(1991).Familial occurrence of hypersensitivity tophenytoin.Am J Med.91(6)631-634。
Green,V.J.,et al.(1995).Genetic analysis of microsomal epoxide hydrolasein patients with carbamazepine hypersensitivity.Biochem Pharmacol.50(9)1353-1359。
Hari,Y.,et al.(2001).T cell involvement in cutaneous drug eruptions.ClinExp Allergy.31(9)1398-1408。
IHWG Technical Manual.Genomic Analysis of the Human MHC。DNABased Typing for HLA Alleles and Linked Polymorphisms.Marcel G.J.Tilanus,Editor in Chief.Distributed by the International HistocompatibilityWorking Group,ISBN number0-945278-02-0。
Khan,M.A.(2000).Updatethe twenty subtypes of HLA-B27.Curr OpinRheumatol.12(4)235-238。
Lazarou J.,et al.(1998).Incidence of adverse drug reactions in hospitalizedpatientsa meta-analysis of prospective studies.JAMA.279(15)1200-1205。
Leeder,J.S.(1998).Mechanisms of idiosyncratic hypersensitivity reactionsto antiepileptic drugs.Epilepsia.39 Suppl 7S8-16。
Naisbitt,D.J.,et al.(2003).Hypersensitivity reactions to carbamazepinecharacterization of the specificity,phenotype,and cytokine profile ofdrug-specific T cell clones.Mol Pharmacol.63(3)732-741。
Pichler,W.J.,et al.(1997).High IL-5 production by human drug-specifi Tcell clones.Int Arch Allergy Immunol.113(1-3)177-180。
Pirmohamed,M.,et al.(2001).TNFalpha promoter regiongenepolymorphisms in carbamazepine-hypersensitive patients.Neurology.56(7)890-896。
Roujeau,J.C.,et al.(1986).HLA phenotypes and bullous cutaneousreactions to drugs.Tissue Antigens.28(4)251-254。
Roujeau,J.C.,et al.(1987).Genetic susceptibility to toxic epidermalnecrolysis.Arch Dermatol.123(9)1171-1173。
Roujeau,J.C.(1994).The spectrum of Stevens-Johnson syndrome and toxicepidermal necrolysisa clinical classification.J Invest Dermatol.102(6)28S-30S。
Roujeau,J.C.,and Stern,R.S.(1994).Severe adverse cutaneous reactions todrtugs.N Engl J Med.331(19)1272-1285。
Roujeau,J.C.,et al.(1995).Medication use and the risk of Stevens-Johnsonsyndrome or toxic epidermal necrolysis.N Engl J Med.333(24)1600-1607。
Shirato,S.,et al.(1997).Stevens-Johnson syndrome induced bymethazolamide treatment.Arch Ophthalmol.115(4)550-553。
Svensson,C.K.,et al.(2000).Cutaneous drug reactions.Pharmacol Rev.53(3)357-379。
Tas,S.,and Simonart,T.(2003).Management of drug rash with eosinophiliaand systemic symptoms(DRESS syndrome)an update.Dermatology.206(4)353-356。
Wolkenstein,P.,et al.(1995).A slow acetylator genotype is a risk factor forsulphonamide-induced toxic epidermal necrolysis and Stevens-Johnson syndrome.Pharmacogenetics.5(4)255-258。
Yates,C.R.,et al.(1997).Molecular diagnosis of thiopurineS-methyltransferase deficiencygenetic basis for azathioprine andmercaptopurine intolerance.Ann Intern Med.126(8)608-614。
本申请上面或别处引用的所有出版物、专利和专利申请在这里通过参考被全部引入,以达到各出版物、专利申请和专利的公开内容被明确地且各自地被全部引入作为参考的程度。
背景技术
药物不良反应(ADR,adverse drug reactions)是重要临床问题。根据广泛被引用的meta-分析,ADR介于第四种和第六种最通常的死亡原因之间(Lazarou et al.,1998)。特别地,潜在的严重皮肤性ADR大约占所有医院案例的2-3%(Bigby et al.,1986)。虽然药疹(drug eruption)可能是温和至中等程度的如斑丘疹、红斑多形物(EM)、荨麻疹和混合药疹,当较严重的皮肤性ADR会危急生命并经常导致死亡,如斯-约二氏综合症(SJS,Stevens-Johnsonsydrome)、中毒性表皮坏死溶解(TEN,toxic epidermal necrolysis;Lyell′s综合症)和过敏综合症(HSS,hypersensitivity sydrome)。
SJS的特征在于高烧、不适以及迅速发展的水泡疹斑点和伴随粘膜牵连(mucosal involvement)的靶样损害。TEN具有相似的表现,其具有更广泛的皮肤分离和更高的死亡率(30~40%)。过敏综合症(HSS)的特征在于皮疹、发热、淋巴结肿大和内脏器官牵连,其还被称为DRESS(具有嗜曙红细胞增多和全身症状的药物反应)或DIHS(药物-诱发的过敏综合症)(Tas and Simonart、2003)。具有广泛分布皮疹的HSS患者通常发展为剥脱性皮炎、一种或多种内脏器官牵连(例如,肝炎、肺炎、肾炎、心肌炎、心包炎、肌炎、胰炎、甲状腺炎)和血液异常(嗜曙红细胞增多、非典型淋巴细胞增多、中性粒细胞增多、中性粒细胞减少、血小板减少、贫血)。其它现象可以是淋巴结病、眶周或颜面浮肿。尽管SJS/TEN的发生率很低,每年估计发生率为每百万人3-5例,但这些病情可使得原来健康的人死亡或严重残疾(Roujeau and Stern,1994)。该病情的严重性促使了药物公司撤回了一些新推出的药物。
几乎所有SJS/TEN/HSS病例均是由药物引起的,最常见为磺胺、抗惊厥药、别嘌醇、非甾类抗炎药(NSAID)和抗疟药(Roujeau et al.,1995)。在台湾,抗惊厥药(卡马西平、苯妥因和苯巴比妥)和别嘌醇是导致SJS/TEN的最常见药物。还表明其它药物如NSAID和抗生素引起严重ADR。
药物基因组学的最近进展暗示了ADR可能与遗传变体相关。应用基因组学研究预防药物-诱发副作用的成功例子是在开药方为氮杂硫代嘌呤之前基因分型硫代嘌呤甲基转移酶(TPMT),其中氮杂硫代嘌呤是用于风湿病或癌症的药物(Yates et al.,1997)。TPMT的个体基因组多态性可引起酶缺陷并延缓了代谢率,导致白血球减少。由CLIA(临床试验改善修订会)鉴定的此类分子诊断现由美国(Prometheus Laboratory Inc.;Genaissance Pharmaceutical)和欧洲的相关实验室提供。尽管使用某些药物时易患SJS/TEN/HSS被认为是由遗传决定的(GennisMA、1991;Edwards SG、1999),但仍未鉴定出可靠的遗传因子,目前没有临床可用的用于预测哪些人或对于哪些药物会发生SJS/TEN/HSS的方法。
发明概述本发明提供了一种预测患者发生药物不良反应特别是SJS、TEN或过敏综合症(HSS)的方法。已发现HLA-B等位基因,HLA-B*1502,与多种药物诱发的SJS/TEN相关。卡马西平-诱发的SJS/TEN与HLA-B*1502的相关最为显著,其中所有受试患者均具有HLA-B*1502等位基因。此外,另一种HLA-B等位基因,HLA-B*5801,与别嘌醇诱发的SJS/TEN特别相关。HLA-B*5801还与别嘌醇-诱发的过敏综合症(HSS)相关。卡马西平诱发的较温和皮肤反应如斑丘疹、红斑多形物(EM)、荨麻疹和混合药疹,与第三种等位基因-HLA-B*4601特别相关。
因此,本发明提供了一种评价患者发生应答于药物的药物不良反应的危险的方法,包括使用来自人的生物样本进行HLA分型。与ADR相关的灵敏度至少约为40%的任一HLA等位基因可用作本发明的危险因子。优选地,危险因子的灵敏度至少约为50%、60%、70%、80%、85%或90%。更优选地,灵敏度至少为95%。药物优选卡马西平、别嘌醇、苯妥因、柳氮磺吡啶(sulfasalazine)、阿莫西林、布洛芬和酮洛芬。可供选择地,该药物优选不是非甾类抗炎药。优选地,HLA-B等位基因是危险因子。
具体地,本发明一方面提供了评价患者发生应答于药物的药物不良反应的危险的方法,包括确定选自HLA-B*1502、HLA-B*5801和HLA-B*4601的HLA-B等位基因的存在,其中HLA-B等位基因的存在指示了药物不良反应的危险。药物优选卡马西平、别嘌醇、苯妥因、柳氮磺吡啶、阿莫西林、布洛芬和酮洛芬。更优选地,该药物是卡马西平、别嘌醇或苯妥因。
药物不良反应优选是皮肤性药物不良反应如斯-约二氏综合症、中毒性表皮坏死溶解或HSS。在优选实施方案中,药物是卡马西平,等位基因是HLA-B*1502。在另一个优选实施方案中,等位基因HLA-B*5801用于预测应答于别嘌醇的皮肤性ADR如斯-约二氏综合症或中毒性表皮坏死溶解的危险。HLA-B*5801还是别嘌醇-诱发的嗜曙红细胞增多和全身症状的药物反应(如别嘌醇-诱发的过敏综合症)的标记物。除了HLA-B*1502、HLA-B*5801或HLA-B*4601之外,HLA-B15、B58或B46的其它亚型如HLA-B*1503或*1558也可用于预测ADR危险。
使用本领域已知的任一方法可检测等位基因。例如,通过使用与编码等位基因的核酸特异性杂交的寡核苷酸可测定等位基因的存在。优选地,由患者外周血制备的DNA应用于该测定中。等位基因还可通过例如血清学或微细胞毒方法检测。
等位基因的存在还可通过检测该等位基因的等价遗传标记物而测定,该标记物是连接于等位基因的遗传标记物。等价遗传标记物可以是例如SNP(单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism))、微卫星标记物或任一种遗传多态性(genetic polymorphism)。例如,HLA-B*1502单倍型的HLA标记物包括但不限于DRB1*1202、Cw*0801、Cw*0806、A*1101和MICA*019。HLA-B*5801单倍型的HLA标记物包括例如HLA-A*3303、Cw*0302、DRB1*0301和MICA*00201。换言之,存在的HLA-B*1502、5801或4601单倍型而非等位基因本身指示了药物不良反应危险。
本发明另一方面提供了药物基因组序型分析(pharmacogenomicsprofiling)的方法,包括测定至少一种选自HLA-B*1502、HLA-B*5801和HLA-B*4601的HLA-B等位基因的存在。优选地,测定至少两种选自上述的等位基因如HLA-B*1502和HLA-B*5801的存在。更优选地,测定所有三种等位基因的存在。该方法可任选包括测定其它遗传因子。那些其它遗传因子可能与易患包括药物不良反应的任一疾病或医学情形相关。例如,这些其它遗传因子可选自硫代嘌呤甲基转移酶和长-QT综合症(long-QT syndrome)基因。
进一步提供了在药物开发中使用HLA-B*1502、5801或4601作为靶点筛选和/或鉴别可用于治疗药物-诱发的SJS/TEN或HSS的药物的方法。例如表达任一等位基因的细胞可与候选药物接触,结合于等位基因的候选物易于抑制等位基因的表达和/或功能。然后可进一步测试候选物治疗药物诱发不良反应的效力。
此外,与SJS/TEN/HSS相关的HLA等位基因还可用于筛选诱发SJS/TEN/HSS的药物。例如,候选药物可与HLA等位基因接触,结合于等位基因的候选物可诱发SJS/TEN/HSS并可进一步测试。含有HLA等位基因的细胞或动物也可用于筛选诱发SJS/TEN/HSS的药物。
发明详述本发明提供了预测患者发生药物不良反应特别是SJS、TEN或HSS危险的方法。已发现HLA-B等位基因,HLA-B*1502,与多种药物诱发的SJS/TEN相关。卡马西平-诱发的SJS/TEN与HLA-B*1502的相关最为显著,其中所有受试患者具有HLA-B*1502等位基因。此外,另一HLA-B等位基因-HLA-B*5801,与别嘌醇诱发的SJS/TEN或HSS特别相关。与卡马西平相关的较温和皮肤反应比如斑丘疹、红斑多形物(EM)、荨麻疹和混合药疹,与第三种等位基因-HLA-B*4601特别相关。
在详细描述本发明之前,除非另有说明如下定义本申请所用术语。
定义“药物不良反应”是不希望的且非故意的药物作用。特别地,在用于预防、诊断或治疗的剂量下发生药物不良反应。
“药物”是为了预防、诊断或治疗目的给予患者的任何化合物或物质。
如果一名患者发生药物不良反应的几率高于普通人群发生药物不良反应的几率,那么该患者具有药物不良反应的“危险”。该患者发生药物不良反应的几率优选至少约为普通人群发生药物不良反应几率的1.5倍,更优选至少约2倍,更加优选至少约3、4、5、6、7、8或9倍,且最优选至少约10倍。可通过本领域已知的任何方法确定该几率,如通过使用危险因子发生率。例如,假定的危险因子存在于在5%的普通人群中。如果该因子存在于具有药物不良反应的10%患者中,那么具有该危险因子的患者发生药物不良反应的几率是普通人群发生药物不良反应几率的2倍。
ADR的“危险因子”是与ADR相关的因子。危险因子的灵敏度优选至少约为40%,更优选至少约50%、60%、70%、80%、85%或90%。最优选地,该灵敏度至少为95%。
预测ADR的危险因子的“灵敏度”是具有危险因子的ADR患者的百分比。换言之,如果每一个SJS患者都具有等位基因A,那么等位基因A预测SJS的灵敏度为100%,如果40名SJS患者中有20人具有等位基因B,那么等位基因B预测SJS的灵敏度为50%。
感兴趣的等位基因的“等价遗传标记物”是指与有感兴趣的等位基因相连的遗传标记物。本发明有用的等价遗传标记物显示了与感兴趣的等位基因的连锁不均衡(linkage disequilibrium)。
“药物基因组序型分析”是指测定与疾病或医学情形特别是药物不良反应相关的存在于受试者体内的遗传因子。典型地,在药物基因组序型分析中确定遗传因子组(a panel of genetic factors),这些因子可能与相同疾病、医学情形或药物反应相关或不相关。
药物“代谢物”是指由于药物在生物体优选哺乳动物更优选人体内代谢而衍生的化合物。
如本文所用,药物“衍生物”是指除了药物中至少一个氢被下列取代基取代之外与药物相同化合物,其中取代基包括卤素、羟基、酰胺基、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳氧基、芳基、芳氧基芳基、羧基、羧基烷基、羧基-取代的烷基、羧基-环烷基、羧基取代的环烷基、羧基芳基、羧基-取代的芳基、羧基杂芳基、羧基取代的杂芳基、羧基杂环基、羧基-取代的杂环基、环烷基、取代的烷基、取代的烷氧基、取代的芳基、取代的芳氧基、取代的芳氧基芳基、取代的环烷基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环的或者取代的杂环基。这些化学基团如下定义或如美国专利号6,583,139中定义。这些取代基优选包含0-10、更优选0-6、更优选0-4且最优选0-2个碳原子。
如本文所用,“烷基”是指优选具有1-10个碳原子且更优选1-6个碳原子的烷基。该术语的例示性基团比如为甲基、叔丁基、正庚基、辛基等。
“取代的烷基”是指具有具有1-10个碳原子、具有1-5个选自下列取代基的烷基烷氧基、取代的烷氧基、酰基、酰基氨基、硫代羰基氨基、酰基氧基、氨基、脒基、烷基脒基、硫代脒基、氨基酰基、氨基羰基氨基、氨基硫代羰基氨基、氨基羰基氧基、芳基、取代的芳基、芳基氧基、取代的芳基氧基、芳基氧基芳基、取代的芳基氧基芳基、氰基、卤原子、羟基、硝基、羧基、羧烷基、羧基-取代的烷基、羧基-环烷基、羧基-取代的环烷基、羧基芳基、羧基-取代的芳基、羧基杂芳基、羧基-取代的杂芳基、羧基杂环基、羧基取代的杂环基、环烷基、取代的环烷基、胍基、胍基砜、硫醇、硫代烷基、取代的硫代烷基、硫代芳基、取代的硫代芳基、硫代环烷基、取代的硫代环烷基、硫代杂芳基、取代的硫代杂芳基、硫代杂环基、取代的硫代杂环基、杂芳基、取代的芳基、取代的杂芳基、杂环基、取代的杂环基、环烷氧基、取代的环烷氧基、杂芳基氧基、取代的杂芳基氧基、杂环基氧基、取代的杂环基氧基、氧基羰基氨基、氧基硫代羰基氨基、-OS(O)2-烷基、-OS(O)2-取代的烷基、-OS(O)2-芳基、-OS(O)2-取代的芳基、-OS(O)2-杂芳基、-OS(O)2-取代的杂芳基、-OS(O)2-杂环基、-OS(O)2-取代的杂环基、-OSO2-NRR、-NRS(O)2-烷基、-NRS(O)2-取代的烷基、-NRS(O)2-芳基、-NRS(O)2-取代的芳基、-NRS(O)2-杂芳基、-NRS(O)2-取代的杂芳基、-NRS(O)2-杂环基、-NRS(O)2-取代的杂环基、-NRS(O)2-NR-烷基、-NRS(O)2-NR-取代的烷基、NRS(O)2-NR-芳基、-NRS(O)2-NR-取代的芳基、NRS(O)2-NR-杂芳基、-NRS(O)2-NR-取代的杂芳基、NRS(O)2-NR-杂环基、-NRS(O)2-NR-取代的杂环基、单-和二-烷基氨基、单-和二-(取代的烷基)氨基、单-和二-芳基氨基、单-和二-(取代的芳基)氨基、单-和二-杂芳基氨基、单-和二-(取代的杂芳基)氨基、单-和二杂环基氨基、单-和二-(取代的杂环基)氨基、不对称二取代的胺,该胺具有的不同取代基,该取代基选自烷基、取代的烷基、芳基、取代的芳基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环基、取代的杂环基;取代的烷基,其具有被常规保护基团(如Boc、Cbz、甲酰基等)保护的氨基,和烷基/被下列基团取代的烷基-S(O)2-烷基、-S(O)2-取代的烷基、-S(O)2-烯基、-S(O)2-取代的烯基、-S(O)2-环烷基、-S(O)2-取代的环烷基、-S(O)2-芳基、-S(O)2-取代的芳基、-S(O)2-杂芳基、-S(O)2-取代的杂芳基、-S(O)2-杂环基、-S(O)2-取代的杂环基或-SO2-NRR,其中R是氢或烷基。
“烷氧基”是指“烷基-O-”基团,其包括,例如,甲氧基、乙氧基、正丙氧基、异丙氧基、正丁氧基、异丁氧基、仲丁氧基、正戊氧基、正己氧基、1,2-二甲基丁氧基等。
“取代的烷氧基”是指基团“取代的烷基-O-”。
“酰基”是指基团H-C(O)-、烷基-C(O)-、取代的烷基-C(O)-、烯基-C(O)-、取代的烯基-C(O)-、炔基-C(O)-、取代的炔基-C(O)环烷基-C(O)-、取代的环烷基-C(O)-、芳基-C(O)-、取代的芳基-C(O)-、杂芳基-C(O)-、取代的杂芳基-C(O)、杂环基-C(O)-和取代的杂环基-C(O)-,其中烷基、取代的烷基、烯基、取代的烯基、炔基、取代的炔基、环烷基、取代的环烷基、芳基、取代的芳基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环基和取代的杂环基如本文定义。
“酰基氨基”是指基团-C(O)NRR,其中各R独立选自氢、烷基、取代的烷基、烯基、取代的烯基、炔基、取代的炔基、芳基、取代的芳基、环烷基、取代的环烷基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环基和取代的杂环基;其中各R可与氮原子一起连接形成杂环基或取代的杂环基,其中烷基、取代的烷基、烯基、取代的烯基、炔基、取代的炔基、环烷基、取代的环烷基、芳基、取代的芳基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环基和取代的杂环基如本文定义。
“酰基氧基”是指基团烷基-C(O)O-、取代的烷基-C(O)O-、烯基-C(O)O-、取代的烯基-C(O)O-、炔基-C(O)O-、取代的炔基C(O)O-、芳基-C(O)O-、取代的芳基-C(O)O-、环烷基-C(O)O-、取代的环烷基-C(O)O-、杂芳基-C(O)O-、取代的杂芳基-C(O)O-、杂环基-C(O)O-和取代的杂环基-C(O)O-,其中烷基、取代的烷基、烯基、取代的烯基、炔基、取代的炔基、环烷基、取代的环烷基、芳基、取代的芳基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环基和取代的杂环基如本文定义。
“烯基”是指优选具有2-10个碳原子且更优选2-6个碳原子以及具有至少1个且优选1-2不饱和烯基位点的烯基。
“取代的烯基”是指具有1-5个下列取代基的烯基烷氧基、取代的烷氧基、酰基、酰基氨基、硫代羰基氨基、酰基氧基、氨基、脒基、烷基脒基、硫代脒基、氨基酰基、氨基羰基氨基、氨基硫代羰基氨基、氨基羰基氧基、芳基、取代的芳基、芳基氧基、取代的芳基氧基、芳基氧基芳基、取代的芳基氧基芳基、卤原子、羟基、氰基、硝基、羧基、羧基烷基、羧基-取代的烷基、羧基环烷基、羧基-取代的环烷基、羧基芳基、羧基-取代的芳基、羧基杂芳基、羧基-取代的杂芳基、羧基杂环基、羧基取代的杂环基、环烷基、取代的环烷基、胍基、胍基砜、硫醇、硫代烷基、取代的硫代烷基、硫代芳基、取代的硫代芳基、硫代环烷基、取代的硫代环烷基、硫代杂芳基、取代的硫代杂芳基、硫代杂环基、取代的硫代杂环基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环基、取代的杂环基、环烷氧基、取代的环烷氧基、杂芳基氧基、取代的杂芳基氧基、杂环基氧基、取代的杂环基氧基、氧基羰基氨基、氧基硫代羰基氨基、-OS(O)2-烷基、-OS(O)2-取代的烷基、-OS(O)2-芳基、-OS(O)2-取代的芳基、-OS(O)2-杂芳基、-OS(O)2-取代的杂芳基、-OS(O)2-杂环基、-OS(O)2-取代的杂环基、-OSO2-NRR、-NRS(O)2-烷基、-NRS(O)2-取代的烷基、-NRS(O)2-芳基、-NRS(O)2-取代的芳基、-NRS(O)2-杂芳基、-NRS(O)2-取代的杂芳基、-NRS(O)2-杂环基、-NRS(O)2-取代的杂环基、-NRS(O)2-NR-烷基、-NRS(O)2-NR-取代的烷基、NRS(O)2-NR-芳基、-NRS(O)2-NR-取代的芳基、NRS(O)2-NR-杂芳基、-NRS(O)2-NR-取代的杂芳基、NRS(O)2-NR-杂环基、-NRS(O)2-NR-取代的杂环基、单-和二-烷基氨基、单-和二-(取代的烷基)氨基、单-和二-芳基氨基、单-和二-(取代的芳基)氨基、单-和二-杂芳基氨基、单-和二-(取代的杂芳基)氨基、单-和二杂环基氨基、单-和二-(取代的杂环基)氨基、不对称二取代的胺,该胺具有不同取代基,该取代基选自烷基、取代的烷基、芳基、取代的芳基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环基和取代的杂环基;以及取代的烯基,其具有被常规保护基团(如Boc、Cbz、甲酰基等)保护的氨基,以及烯基/被下列基团取代的烯基-S(O)2-烷基、-S(O)2-取代的烷基、-S(O)2-烯基、-S(O)2-取代的烯基、-S(O)2-环烷基、-S(O)2-取代的环烷基、-S(O)2-芳基、-S(O)2-取代的芳基、-S(O)2-杂芳基、-S(O)2-取代的杂芳基、-S(O)2-杂环基、-S(O)2-取代的杂环基或-SO2-NRR,其中R是氢或烷基。
“炔基”是指优选具有2-10个碳原子且更优选3-6个碳原子以及具有至少1个且优选1-2个不饱和炔基位点的炔基。
“取代的炔基”是指具有1-5个下列取代基的炔基烷氧基、取代的烷氧基、酰基、酰基氨基、硫代羰基氨基、酰基氧基、氨基、脒基、烷基脒基、硫代脒基、氨基酰基、氨基羰基氨基、氨基硫代羰基氨基、氨基羰基氧基、芳基、取代的芳基、芳基氧基、取代的芳基氧基、芳基氧基芳基、取代的芳基氧基芳基、卤原子、羟基、氰基、硝基、羧基、羧基烷基、羧基-取代的烷基、羧基环烷基、羧基-取代的环烷基、羧基芳基、羧基-取代的芳基、羧基杂芳基、羧基-取代的杂芳基、羧基杂环基、羧基取代的杂环基、环烷基、取代的环烷基、胍基、胍基砜、硫醇、硫代烷基、取代的硫代烷基、硫代芳基、取代的硫代芳基、硫代环烷基、取代的硫代环烷基、硫代杂芳基、取代的硫代杂芳基、硫代杂环基、取代的硫代杂环基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环基、取代的杂环基、环烷氧基、取代的环烷氧基、杂芳基氧基、取代的杂芳基氧基、杂环基氧基、取代的杂环基氧基、氧基羰基氨基、氧基硫代羰基氨基、-OS(O)2-烷基、-OS(O)2-取代的烷基、-OS(O)2-芳基、-OS(O)2-取代的芳基、-OS(O)2-杂芳基、-OS(O)2-取代的杂芳基、-OS(O)2-杂环基、-OS(O)2-取代的杂环基、-OSO2-NRR、-NRS(O)2-烷基、-NRS(O)2-取代的烷基、-NRS(O)2-芳基、-NRS(O)2-取代的芳基、-NRS(O)2-杂芳基、-NRS(O)2-取代的杂芳基、-NRS(O)2-杂环基、-NRS(O)2-取代的杂环基、-NRS(O)2-NR-烷基、-NRS(O)2-NR-取代的烷基、NRS(O)2-NR-芳基、-NRS(O)2-NR-取代的芳基、NRS(O)2-NR-杂芳基、-NRS(O)2-NR-取代的杂芳基、NRS(O)2-NR-杂环基、-NRS(O)2-NR-取代的杂环基、单-和二-烷基氨基、单-和二-(取代的烷基)氨基、单-和二-芳基氨基、单-和二-(取代的芳基)氨基、单-和二-杂芳基氨基、单-和二-(取代的杂芳基)氨基、单-和二杂环基氨基、单-和二-(取代的杂环基)氨基、不对称二取代的胺,该胺具有不同取代基,该取代基选自烷基、取代的烷基、芳基、取代的芳基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环基和取代的杂环基;取代的炔基,其具有被常规保护基团(如Boc、Cbz、甲酰基等)保护的氨基,以及炔基/被下列基团取代的炔基-S(O)2-烷基、-S(O)2-取代的烷基、-S(O)2-烯基、-S(O)2-取代的烯基、-S(O)2-环烷基、-S(O)2-取代的环烷基、-S(O)2-芳基、-S(O)2-取代的芳基、-S(O)2-杂芳基、-S(O)2-取代的杂芳基、-S(O)2-杂环基、-S(O)2-取代的杂环基或-SO2-NRR,其中R是氢或烷基。
“氨基酰基”是指-NRC(O)烷基、-NRC(O)取代的烷基、-NRC(O)环烷基、-NRC(O)取代的环烷基、-NRC(O)烯基、-NRC(O)取代的烯基、-NRC(O)炔基、-NRC(O)取代的炔基、-NRC(O)芳基、-NRC(O)取代的芳基、-NRC(O)杂芳基、-NRC(O)取代的杂芳基、-NRC(O)杂环基和-NRC(O)取代的杂环基,其中R是氢或烷基,且其中烷基、取代的烷基、烯基、取代的烯基、炔基、取代的炔基、环烷基、取代的环烷基、芳基、取代的芳基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环基和取代的杂环基如本文定义。
“氨基羰基氧基”是指-NRC(O)O-烷基、-NRC(O)O-取代的烷基、-NRC(O)O-烯基、-NRC(O)O-取代的烯基、-NRC(O)O炔基、-NRC(O)O-取代的炔基、-NRC(O)O-环烷基、-NRC(O)O取代的环烷基、-NRC(O)O-芳基、-NRC(D)O-取代的芳基、-NRC(O)O杂芳基、-NRC(O)O-取代的杂芳基、-NRC(O)O-杂环基和-NRC(O)O-取代的杂环基,其中R是氢或烷基,且其中烷基、取代的烷基、烯基、取代的烯基、炔基、取代的炔基、环烷基、取代的环烷基、芳基、取代的芳基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环基和取代的杂环基如本文定义。
“氧基羰基氨基”是指-OC(O)NRR、-OC(O)NR-烷基、-OC(O)NR-取代的烷基、-OC(O)NR-烯基、-OC(O)NR-取代基烯基、-OC(O)NR-炔基、-OC(O)NR-取代的炔基、-OC(O)NR-环烷基、-OC(O)NR-取代的环烷基、-OC(O)NR-芳基、-OC(O)NR-取代的芳基、-OC(O)NR-杂芳基、-OC(O)NR-取代的杂芳基、-OC(O)NR-杂环基和-OC(O)NR-取代的杂环基,其中R是氢或烷基,且其中R可与氮原子一起连接形成杂环基或取代的杂环基,且其中烷基、取代的烷基、烯基、取代的烯基、炔基、取代的炔基、环烷基、取代的环烷基、芳基、取代的芳基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环基和取代的杂环基如本文定义。
“芳基”或“Ar”是指6-14个碳原子具有单环(如苯基)或多稠合环(如萘基或蒽基)的不饱和芳香碳环基,其稠合环可以是芳香族的或不是芳香族的(如2-苯并噁唑啉酮、2H-1,4-苯并噁嗪-3(4H)-酮-7-基等)。优选的芳基包括苯基和萘基。
取代的芳基是指被1-3个选自下列的取代基取代的芳基羟基、酰基、酰基氨基、硫代羰基氨基、酰基氧基、烷基、取代的烷基、烷氧基、取代的烷氧基、烯基、取代的烯基、炔基、取代的炔基、脒基、烷基脒基、硫代脒基、氨基、氨基酰基、氨基羰基氧基、氨基羰基氨基、氨基硫代羰基氨基、芳基、取代的芳基、芳基氧基、取代的芳基氧基、环烷氧基、取代的环烷氧基、杂芳基氧基、取代的杂芳基氧基、杂环基氧基、取代的杂环基氧基、羧基、羧基烷基、羧基取代的烷基、羧基-环烷基、羧基-取代的环烷基、羧基芳基、羧基-取代的芳基、羧基杂芳基、羧基-取代的杂芳基、羧基杂环基、羧基-取代的杂环基、羧酰胺基、氰基、硫醇、硫代烷基、取代的硫代烷基、硫代芳基、取代的硫代芳基、硫代杂芳基、取代的硫代杂芳基、硫代环烷基、取代的硫代环烷基、硫代杂环基、取代的硫代杂环基、环烷基、取代的环烷基、胍基、胍基砜、卤素、硝基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环基、取代的杂环基、环烷氧基、取代的环烷氧基、杂芳基氧基、取代的杂芳基氧基、杂环基氧基、取代的杂环基氧基、氧基羰基氨基、氧基硫代羰基氨基、-SO(O)2-烷基、-SO(O)2-取代的烷基、-S(O)2-环烷基、-S(O)2-取代的环烷基、-S(O)2-烯基、-S(O)2-取代的烯基、-S(O)2-芳基、-S(O)2-取代的芳基、-S(O)2-杂芳基、-S(O)2-取代的杂芳基、-S(O)2-杂环基、-S(O)2-取代的杂环基、-OS(O)2-烷基、-OS(O)2-取代的烷基、-OS(O)2-芳基、-OS(O)2-取代的芳基、-OS(O)2-杂芳基、-OS(O)2-取代的杂芳基、-OS(O)2-杂环基、-OS(O)2-取代的杂环基、-OSO2-NRR、-NRS(O)2-烷基、-NRS(O)2-取代的烷基、-NRS(O)2-芳基、-NRS(O)2-取代的芳基、-NRS(O)2-杂芳基、-NRS(O)2-取代的杂芳基、-NRS(O)2-杂环基、-NRS(O)2-取代的杂环基、-NRS(O)2-NR-烷基、-NRS(O)2-NR-取代的烷基、NRS(O)2-NR-芳基、-NRS(O)2-NR-取代的芳基、NRS(O)2-NR-杂芳基、-NRS(O)2-NR-取代的杂芳基、NRS(O)2-NR-杂环基、-NRS(O)2-NR-取代的杂环基、单-和二-烷基氨基、单-和二-(取代的烷基)氨基、单-和二-芳基氨基、单-和二-(取代的芳基)氨基、单-和二-杂芳基氨基、单-和二-(取代的杂芳基)氨基、单-和二杂环基氨基、单-和二-(取代的杂环基)氨基、不对称二取代的胺,该胺具有不同的取代基,该取代基选自烷基、取代的烷基、芳基、取代的芳基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环基、取代的杂环基、在取代的芳基上被常规保护基团(如Boc、Cbz、甲酰基等)保护的氨基,以及-SO2NRR,其中R是氢或烷基。
“芳基氧基”是指基团芳基-O-,其例如包括苯氧基、萘氧基等。
“取代的芳基氧基”是指取代的芳基-O-基团。
“芳基氧基芳基”是指基团-芳基-O-芳基。
“取代的芳基氧基芳基”是指在任一或两个芳环上被选自下列的1-3个取代基取代的芳基氧基芳基羟基、酰基、酰基氨基、硫代羰基氨基、酰基氧基、烷基、取代的烷基、烷氧基、取代的烷氧基、烯基、取代的烯基、炔基、取代的炔基、脒基、烷基脒基、硫代脒基、氨基、氨基酰基、氨基羰基氧基、氨基羰基氨基、氨基硫代羰基氨基、芳基、取代的芳基、芳基氧基、取代的芳基氧基、环烷氧基、取代的环烷氧基、杂芳基氧基、取代的杂芳基氧基、杂环基氧基、取代的杂环基氧基、羧基、羧基烷基、羧基-取代的烷基、羧基-环烷基、羧基-取代的环烷基、羧基芳基、羧基-取代的芳基、羧基杂芳基、羧基-取代的杂芳基、羧基杂环基、羧基-取代的杂环基、羧酰胺基、氰基、硫醇、硫代烷基、取代的硫代烷基、硫代芳基、取代的硫代芳基、硫代杂芳基、取代的硫代杂芳基、硫代环烷基、取代的硫代环烷基、硫代杂环基、取代的硫代杂环基、环烷基、取代的环烷基、胍基、胍基砜、卤素、硝基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环基、取代的杂环基、环烷氧基、取代的环烷氧基、杂芳基氧基、取代的杂芳基氧基、杂环基氧基、取代的杂环基氧基、氧基羰基氨基、氧基硫代羰基氨基、-S(O)2-烷基、-S(O)2-取代的烷基、-S(O)2-环烷基、-S(O)2-取代的环烷基、-S(O)2-烯基、-S(O)2-取代的烯基、-S(O)2-芳基、-S(O)2-取代的芳基、-S(O)2-杂芳基、-S(O)2-取代的杂芳基、-S(O)2-杂环基、-S(O)2-取代的杂环基、-OS(O)2-烷基、-OS(O)2-取代的烷基、-OS(O)2-芳基、-OS(O)2-取代的芳基、-OS(O)2-杂芳基、-OS(O)2-取代的杂芳基、-OS(O)2-杂环基、-OS(O)2-取代的杂环基、-OSO2-NRR、-NRS(O)2-烷基、-NRS(O)2-取代的烷基、-NRS(O)2-芳基、-NRS(O)2-取代的芳基、-NRS(O)2-杂芳基、-NRS(O)2-取代的杂芳基、-NRS(O)2-杂环基、-NRS(O)2-取代的杂环基、-NRS(O)2-NR-烷基、-NRS(O)2-NR-取代的烷基、-NRS(O)2-NR-芳基、-NRS(O)2-NR-取代的芳基、-NRS(O)2-NR-杂芳基、-NRS(O)2-NR-取代的杂芳基、-NRS(O)2-NR-杂环基、-NRS(O)2-NR-取代的杂环基、单-和二-烷基氨基、单-和二-(取代的烷基)氨基、单-和二-芳基氨基、单-和二-(取代的芳基)氨基、单-和二-杂芳基氨基、单-和二-(取代的杂芳基)氨基、单-和二杂环基氨基、单-和二-(取代的杂环基)氨基、不对称二取代的胺,该胺具有不同的取代基,该取代基选自烷基、取代的烷基、芳基、取代的芳基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环基、取代的杂环基、在取代的芳基上被常规保护基团(如Boc、Cbz、甲酰基等)保护的氨基,以及-SO2NRR,其中R是氢或烷基。
“环烷基”是指具有单环的3-8个碳原子的环烷基,例如包括环丙基、环丁基、环戊基、环辛基等。该定义排除了多环烷基比如金刚烷基等。
“环烯基”是指具有单个或多个不饱和环但非芳环的3-8个碳原子的环烯基。
“取代的环烷基”和“取代的环烯基”是指优选3-8个碳原子具有1-5个选自下列取代基的环烷基和环烯基氧代(=O)、硫代(=S)、烷氧基、取代的烷氧基、酰基、酰基氨基、硫代羰基氨基、酰基氧基、氨基、脒基、烷基脒基、硫代脒基、氨基酰基、氨基羰基氨基、氨基硫代羰基氨基、氨基羰基氧基、芳基、取代的芳基、芳基氧基、取代的芳基氧基、芳基氧基芳基、取代的芳基氧基芳基、卤原子、羟基、氰基、硝基、羧基、羧基烷基、羧基-取代的烷基、羧基-环烷基、羧基-取代的环烷基、羧基芳基、羧基-取代的芳基、羧基杂芳基、羧基-取代的杂芳基、羧基杂环基、羧基取代的杂环基、环烷基、取代的环烷基、胍基、胍基砜、硫醇、硫代烷基、取代的硫代烷基、硫代芳基、取代的硫代芳基、硫代环烷基、取代的硫代环烷基、硫代杂芳基、取代的硫代杂芳基、硫代杂环基、取代的硫代杂环基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环基、取代的杂环基、环烷氧基取代的环烷氧基、杂芳氧基、取代的杂芳氧基、杂环氧基、取代的杂环氧基、氧基羰基氨基、氧基硫代羰基氨基、-OS(O)2-烷基、-OS(O)2-取代的烷基、-OS(O)2-芳基、-OS(O)2-取代的芳基、-OS(O)2-杂芳基、-OS(O)2-取代的杂芳基、-OS(O)2-杂环基、-OS(O)2-取代的杂环基、-OSO2-NRR、-NRS(O)2-烷基、-NRS(O)2-取代的烷基、-NRS(O)2-芳基、-NRS(O)2-取代的芳基、-NRS(O)2-杂芳基、-NRS(O)2-取代的杂芳基、-NRS(O)2-杂环基、-NRS(O)2-取代的杂环基、-NRS(O)2-NR-烷基、-NRS(O)2-NR-取代的烷基、NRS(O)2-NR-芳基、-NRS(O)2-NR-取代的芳基、NRS(O)2-NR-杂芳基、-NRS(O)2-NR-取代的杂芳基、NRS(O)2-NR-杂环基、-NRS(O)2-NR-取代的杂环基、单-和二-烷基氨基、单-和二-(取代的烷基)氨基、单-和二-芳基氨基、单-和二-(取代的芳基)氨基、单-和二-杂芳基氨基、单-和二-(取代的杂芳基)氨基、单-和二杂环基氨基、单-和二-(取代的杂环基)氨基、不对称二取代的胺,该胺具有不同的取代基,该取代基选自烷基、取代的烷基、芳基、取代的芳基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环基、取代的杂环基;取代炔基,其具有被常规保护基团(如Boc、Cbz、甲酰基等)保护的氨基;以及炔基/被下列基团取代的炔基-S(O)2-烷基、-S(O)2-取代的烷基、-S(O)2-烯基、-S(O)2-取代的烯基、-S(O)2-环烷基、-S(O)2-取代的环烷基、-S(O)2-芳基、-S(O)2-取代的芳基、-S(O)2-杂芳基、-S(O)2-取代的杂芳基、-S(O)2-杂环基、-S(O)2-取代的杂环基或-SO2-NRR,其中R是氢或烷基。
“环烷氧基”是指-O-环烷基。
“取代的环烷氧基”是指-O-取代的环烷基。
“卤素”是指氟、氯、溴和碘且优选氯或溴。
“杂芳基”是指在环内有2-10个碳原子和1-4个选自氧、氮和硫的杂原子的芳香碳环。该杂芳基可具有单环(如吡啶基或呋喃基)或多稠合环(如中吲嗪基或苯并噻吩基)。优选的杂芳基包括吡啶基、吡咯基、吲哚基和呋喃基。
“取代的杂芳基”是指被1-3个选自下列的取代基取代的杂芳基羟基、酰基、酰基氨基、硫代羰基氨基、酰基氧基、烷基、取代的烷基、烷氧基、取代的烷氧基、烯基、取代的烯基、炔基、取代的炔基、脒基、烷基脒基、硫代脒基、氨基、氨基酰基、氨基羰基氧基、氨基羰基氨基、氨基硫代羰基氨基、芳基、取代的芳基、芳基氧基、取代的芳基氧基、环烷氧基、取代的环烷氧基、杂芳基氧基、取代的杂芳基氧基、杂环基氧基、取代的杂环基氧基、羧基、羧基烷基、羧基-取代的烷基、羧基-环烷基、羧基-取代的环烷基、羧基芳基、羧基-取代的芳基、羧基杂芳基、羧基-取代的杂芳基、羧基杂环基、羧基-取代的杂环基、羧酰胺、氰基、硫醇、硫代烷基、取代的硫代烷基、硫代芳基、取代的硫代芳基、硫代杂芳基、取代的硫代杂芳基、硫代环烷基、取代的硫代环烷基、硫代杂环基、取代的硫代杂环基、环烷基、取代的环烷基、胍基、胍基砜、卤素、硝基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环基、取代的杂环基、环烷氧基、取代的环烷氧基、杂芳基氧基、取代的杂芳基氧基、杂环基氧基、取代的杂环基氧基、氧基羰基氨基、氧基硫代羰基氨基、-S(O)2-烷基、-S(O)2-取代的烷基、-S(O)2-环烷基、-S(O)2-取代的环烷基、-S(O)2-烯基、-S(O)2-取代的烯基、-S(O)2-芳基、-S(O)2-取代的芳基、-S(O)2-杂芳基、-S(O)2-取代的杂芳基、-S(O)2-杂环基、-S(O)2-取代的杂环基、-OS(O)2-烷基、-OS(O)2-取代的烷基、-OS(O)2-芳基、-OS(O)2-取代的芳基、-OS(O)2-杂芳基、-OS(O)2-取代的杂芳基、-OS(O)2-杂环基、-OS(O)2-取代的杂环基、-OSO2-NRR、-NRS(O)2-烷基、-NRS(O)2-取代的烷基、-NRS(O)2-芳基、-NRS(O)2-取代的芳基、-NRS(O)2-杂芳基、-NRS(O)2-取代的杂芳基、-NRS(O)2-杂环基、-NRS(O)2-取代的杂环基、-NRS(O)2-NR-烷基、-NRS(O)2-NR-取代的烷基、-NRS(O)2-NR-芳基、-NRS(O)2-NR-取代的芳基、-NRS(O)2-NR-杂芳基、-NRS(O)2-NR-取代的杂芳基、-NRS(O)2-NR-杂环基、-NRS(O)2-NR-取代的杂环基、单-和二-烷基氨基、单-和二-(取代的烷基)氨基、单-和二-芳基氨基、单-和二-(取代的芳基)氨基、单-和二-杂芳基氨基、单-和二-(取代的杂芳基)氨基、单-和二杂环基氨基、单-和二-(取代的杂环基)氨基、不对称二取代的胺,该胺具有不同的取代基,该取代基选自烷基、取代的烷基、芳基、取代的芳基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环基、取代的杂环基、在取代的芳基上被常规保护基团(如Boc、Cbz、甲酰基等)保护的氨基,以及-SO2NRR,其中R是氢或烷基。
“杂芳基氧基”是指-O-杂芳基以及“取代的杂芳基氧基”是指-O-取代的杂芳基。
“杂环”或”杂环的”是指具有单环或多稠合环、在环内包含1-10个碳原子和1-4个选自氮、硫或氧的杂原子的饱和或不饱和基团。在稠合环系中,一个或多个环可以是苯基或杂芳基。
“取代的杂环基”是指被1-3个选自下列的取代基取代的杂环基氧代(=O)、硫代(=S)、烷氧基、取代的烷氧基、酰基、酰基氨基、硫代羰基氨基、酰基氧基、氨基、脒基、烷基脒基、硫代脒基、氨基酰基、氨基羰基氨基、氨基硫代羰基氨基、氨基羰基氧基、芳基、取代的芳基、芳基氧基、取代的芳基氧基、芳基氧基芳基、取代的芳基氧基芳基、卤原子、羟基、氰基、硝基、羧基、羧基烷基、羧基-取代的烷基、羧基-环烷基、羧基-取代的环烷基、羧基芳基、羧基-取代的芳基、羧基杂芳基、羧基-取代的杂芳基、羧基杂环基、羧基取代的杂环基、环烷基、取代的环烷基、胍基、胍基砜、硫醇、硫代烷基、取代的硫代烷基、硫代芳基、取代的硫代芳基、硫代环烷基、取代的硫代环烷基、硫代杂芳基、取代的硫代杂芳基、硫代杂环基、取代的硫代杂环基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环基、取代的杂环基、环烷氧基取代的环烷氧基、杂芳氧基、取代的杂芳氧基、杂环氧基、取代的杂环氧基、氧基羰基氨基、氧基硫代羰基氨基、-OS(O)2-烷基、-OS(O)2-取代的烷基、-OS(O)2-芳基、-OS(O)2-取代的芳基、-OS(O)2-杂芳基、-OS(O)2-取代的杂芳基、-OS(O)2-杂环基、-OS(O)2-取代的杂环基、-OSO2-NRR、-NRS(O)2-烷基、-NRS(O)2-取代的烷基、-NRS(O)2-芳基、-NRS(O)2-取代的芳基、-NRS(O)2-杂芳基、-NRS(O)2-取代的杂芳基、-NRS(O)2-杂环基、-NRS(O)2-取代的杂环基、-NRS(O)2-NR-烷基、-NRS(O)2-NR-取代的烷基、NRS(O)2-NR-芳基、-NRS(O)2-NR-取代的芳基、NRS(O)2-NR-杂芳基、-NRS(O)2-NR-取代的杂芳基、NRS(O)2-NR-杂环基、-NRS(O)2-NR-取代的杂环基、单-和二-烷基氨基、单-和二-(取代的烷基)氨基、单-和二-芳基氨基、单-和二-(取代的芳基)氨基、单-和二-杂芳基氨基、单-和二-(取代的杂芳基)氨基、单-和二杂环基氨基、单-和二-(取代的杂环基)氨基、不对称二取代的胺,该胺具有不同的取代基,该取代基选自烷基、取代的烷基、芳基、取代的芳基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环基、取代的杂环基;炔基,其具有被常规保护基团(如Boc、Cbz、甲酰基等)保护的氨基;以及炔基/被下列基团取代的炔基-S(O)2-烷基、-S(O)2-取代的烷基、-S(O)2-烯基、-S(O)2-取代的烯基、-S(O)2-环烷基、-S(O)2-取代的环烷基、-S(O)2-芳基、-S(O)2-取代的芳基、-S(O)2-杂芳基、-S(O)2-取代的杂芳基、-S(O)2-杂环基、-S(O)2-取代的杂环基或-SO2-NRR,其中R是氢或烷基。
杂环和杂芳基例如包括但不限于,氮杂环丁烷、吡咯、咪唑、吡唑、吡啶、吡嗪、嘧啶、哒嗪、吲嗪、异吲哚、吲哚、吲哚满、吲唑、嘌呤、喹嗪、异喹啉、喹啉、酞嗪、萘基吡啶、喹喔啉、喹唑啉、噌啉、蝶啶、咔唑、咔啉、菲啶、吖啶、菲咯啉、异噻唑、吩嗪、异噁唑、吩噁嗪、吩噻嗪、四氢咪唑、咪唑啉、哌啶、哌嗪、二氢吲哚、邻苯二甲酰亚胺、1,2,3,4-四氢异喹啉、4,5,6,7-四氢苯并[b]噻吩、噻唑、噻唑烷、噻吩、苯并[b]噻吩、吗啉代、硫代吗啉代、哌啶基、吡咯烷、四氢呋喃基等。
“杂环基氧基”是指-O-杂环基,“取代的杂环基氧基”是指-O-取代的杂环基。
方法有证据证明若干类似的多系统药物过敏性反应的发病机理涉及药物或药物代谢产物的MHC-限制性呈递,在T细胞活化之前直接将这些非肽抗原结合至MHC分子或半抗原(haptenation)至内源性蛋白(Svensson et al.,2000)。在大疱反应(bullous reaction)如SJS/TEN中发现皮肤-渗透CD8+细胞毒性T细胞占据主导(Hari et al.,2001),而CD4+辅助性T细胞的特征在于较温和皮肤性药物不良反应如斑丘疹(Pichler et al.,1997)。因为已知主要组织相容性复合物(MHC)在测定对于抗原如药物代谢物的T-细胞介导的免疫应答中具有重要作用,我们评价了主要组织相容性复合物的等位基因是否与药物诱发的SJS/TEN/HSS相关。
我们对于具有药物不良反应的患者进行了HLA分型。结果表明HLA-B*1502存在于接受卡马西平的全部42名SJS/TEN患者中(100%)(实施例1)。在接受其它药物的53名SJS/TEN患者中有17人(32%)也发现了该等位基因(8名苯妥因,2名别嘌醇、2名阿莫西林,1名柳氮磺胺吡啶,1名酮洛芬,1名布洛芬和2名未知药物)。特别地,服用苯妥因后发生SJS/TEN的17名患者中有8人也携有HLA-B*1502等位基因。另一方面,该等位基因还发现于4.1%(3/73)卡马西平-耐受组、0%(0/32)苯妥因-耐受组、6.3%(9/142)具有除了SJS外较温和药物不良反应的患者以及5.3%(5/94)普通人群中。通过使用耐受组作为对照,与卡马西平-诱发SJS/TEN相关的B*1502的优势比、灵敏度、特异性、阳性预测值和阴性预测值分别是1712、100%、95.89%、96.0%和100%。对于苯妥因-诱发SJS/TEN相关的B*1502,其优势比、灵敏度、特异性、阳性预测值和阴性预测值分别是58、47%、100%、100%和65.35%。因此,该HLA-B的存在可用于鉴定对于药物-诱发的SJS/TEN特别是卡马西平-和苯妥因-诱发的SJS/TEN具有高危险性的患者。
卡马西平诱发的温和不良反应似乎与另一等位基因-HLA-B*4601相关。由此,对于卡马西平具有这些较温和反应的16名患者中有10人(62.5%)具有HLA-B*4601。相反,该等位基因仅发现于26%(19/73)卡马西平-耐受组中。与卡马西平-诱发的较温和皮肤性ADR相关的B*4601的优势比为4.73。因此,HLA-B*4601可用于卡马西平诱发的温和皮肤性ADR危险率评估。
第三种HLA-B等位基因-HLA-B*5801发现于接受别嘌醇的全部17名(100%)具有SJS/TEN或过敏的患者中,但在普通人群中仅有18%。与别嘌醇-诱发SJS/TEN或过敏相关的B*5801的优势比、灵敏度、特异性、阳性预测值和阴性预测值分别是155、100%、82%,84.7%和100%(实施例2)。HLA-B*5801由此可用于预测应答别嘌醇的药物不良反应的危险。
因此,本发明提供了评价患者服药后发生药物不良反应危险的方法,包括测定选自HLA-B*1502、HLA-B*5801和HLA-B*4601的HLA-B等位基因的存在,其中该HLA-B等位基因的存在指示了药物不良反应的危险。在优选实施方案中,HLA-B*1502用于预测SJS/TEN特别是卡马西平-诱发的SJS/TEN的危险。
卡马西平,还被称为Tegretol、Tegol、G-32883、Biston、Calepsin、Carbatrol、Epitol、Finlepsin、Sirtal、Stazepine、Telesmin或Timonil是芳香族抗惊厥剂。其它芳香族抗惊厥剂包括苯妥因(Dilantin)和苯巴比妥,引起类似于卡马西平的药物不良反应。因此,HLA-B*1502还可用于评价对于这些其它芳香族抗惊厥剂药物不良反应的危险。可将HLA-B*1502用作其危险因子的芳香族抗惊厥剂还包括卡马西平、苯妥因或苯巴比妥的代谢物和衍生物。本领域已知这些药物的代谢物(例如参见,Gennis et al.,1991;Leeder,1998;Naisbitt et al.,2003),比如卡马西平-10,11环氧化物、卡马西平-10,11-二醇、卡马西平-2,3-二醇、二氢卡马西平、卡马西平儿茶酚和卡马西平o-醌、p-羟基苯妥因、苯妥因二氢二醇、苯妥因儿茶酚、苯妥因甲基儿茶酚和苯妥因o-醌。
在另一种优选的实施方案中,HLA-B*5801用于预测别嘌醇-诱发SJS/TEN或HSS的危险。别嘌醇是用于高尿酸血症和慢性痛风的药物。与其它药物一样,HLA-B*5801也可用于评价别嘌醇代谢物和衍生物的危险。
HLA-B15、B58或B46位的其它亚型也可导致易患皮肤性药物不良反应,特别是当该患者是不同种族时。本领域已观察到这样的亚型变异。例如,强直性脊椎炎与HLA-B27非常相关。已报道了HLA-B27的许多等位基因或亚型,比如B*2701-B*2723。这些亚型分布于世界的不同地方,许多与强直性脊椎炎相关(Khan,2000;Feltkamp et al.,2001)。我们认为HLA-B15、B58或B46与本文所述皮肤性ADR相关,其它HLA-B15、B58或B46亚型还可替代HLA-B*1502、5801或4601用于危险率评估,例如HLA-B*1503或*1558。
此外,应注意除了特异的HLA等位基因本身,连接于各特异等位基因的遗传标记物也可用于预测相应的ADR。这是因为感兴趣的HLA等位基因附近的遗传标记物倾向于与感兴趣的等位基因共分离或显示连锁不均衡。因此,这些标记物(等价遗传标记物)的存在指示了感兴趣的等位基因的存在,其又指示了ADR危险。如实施例3所示,HLA-B*1502单倍型包括HLA标记物如DRB1*1202、Cw*0801、Cw*0806、A*1101和MICA*019。HLA-B*5801单倍型的HLA标记物包括例如A*3303、Cw*0302、DRB1*0301和MICA*00201。
等价遗传标记物可以是任一标记物,包括HLA标记物、微卫星和单核苷酸多态性(SNP)标记物。优选地,有用的遗传标记物距HLA-B位约200kb或更短。更优选地,这些标记物距HLA-B位约100kb、80kb、60kb、40kb或20kb或更短。特别感兴趣的标记物位于特异HLA-B单倍型的DRB1和HLA-A区域之间。
通过使用本领域已知的任何方法可检测HLA等位基因。优选地,基因组DNA与特异于感兴趣等位基因的探针杂交。探针可被标记以直接检测,或通过特异性结合于探针的第二种可检测分子进行接触。可供选择地,可检测cDNA、RNA或等位基因的蛋白产物。例如,血清分型或微细胞毒方法可用于测定等位基因的蛋白产物。相似地,通过领域已知的任何方法可检测等价遗传标记物。
为了进一步提高危险预测的准确性,感兴趣的等位基因和/或其等价基因标记物可与辅助分子和共刺激分子的遗传标记物一起进行测定,其中该辅助分子和共刺激分子在抗原-存在细胞和T-细胞相互作用中被涉及。这些遗传标记物包括微卫星和单核苷酸多态性(SNP)标记物。辅助和共刺激分子包括细胞表面分子(例如CD80、CD86、CD28、CD4、CD8、T细胞受体(TCR)、ICAM-1、CD11a、CD58、CD2等)和炎性或前炎性细胞激酶、趋化因子(例如、TNF-a)和介质(例如,补体、凋亡蛋白、酶、细胞外基质成分等)。其它感兴趣的是涉及药物生物活性和解毒的药物代谢酶的遗传标记物。药物代谢酶包括I期酶(例如,细胞色素P450超家族等)和II期酶(例如,线粒体环氧化水解酶、芳基胺N-酰化转移酶、UDP-glucuronosyl-转移酶等)。
本发明进一步提供药物基因组序型分析的方法。由此,测定给定个体的一组遗传因子,各遗传因子与疾病或医学情形包括药物不良反应相关。在本方法中,该组的遗传因子包括至少一种选自HLA-B*1502、5801和4601的等位基因。该组优选包括至少两种等位基因,且最优选所有三种。除了HLA-B*1502、5801和/或4601外,该组可包括任何其它已知的遗传因子如硫代嘌呤甲基转移酶和长-QT综合症的基因。还可包括上述的辅助分子、共刺激分子和/或药物代谢酶的遗传标记物。
进一步提供了在药物开发中使用HLA-B*1502、5801或4601作为靶点筛选和/或鉴别可用于治疗药物-诱发的SJS/TEN或HSS的药物的方法。例如表达任一等位基因的细胞可与候选药物接触,结合于等位基因的候选物易于抑制等位基因的表达和/或功能。然后可进一步测试候选物治疗药物诱发的不良反应的效力。
试剂盒本发明另一方面提供了含有用于检测至少一种选自HLA-B*1502、5801或4601等位基因的装置的试剂盒。该装置优选是特异性结合于等位基因的探针,且该试剂盒还优选包含探针的检测试剂。该探针优选是寡核苷酸。该试剂盒可进一步包含采集患者生物样本以及由样本制备基因组DNA、cDNA、RNA或等位基因蛋白的工具和/或试剂。例如,可包括增强基因组DNA相关区域的PCR引物。
该试剂盒优选含有用于检测至少两种选自HLA-B*1502、5801或4601等位基因的装置。任选地,该试剂盒可含有检测其它遗传因子特别是适用于药物基因组序型分析的装置。优选的实例是硫代嘌呤甲基转移酶。
由此,在一个优选的实施方案中,该试剂盒可含有用于检测所有三种等位基因HLA-B*1502、5801和4601的探针。更优选地,该试剂盒进一步含有适用于各等位基因的PCR引物。
提供了下面的实施例以举例说明本发明,不得解释为以任何方式限制本发明的范围。虽然参考其优选实施方案具体表明并描述了本发明,本领域技术人员将理解到,可进行形式和细节的多种改变而不偏离如权利要求所定义的本发明的精神和范围。
实施例在下面的实施例中,下面的缩写具有下述含义。未定义的缩写具有它们通常被接受的含义。
℃=摄氏度hr=小时min=分钟sec=秒μM=微摩尔mm=毫摩尔M=摩尔ml=毫升μl=微升mg=毫克μg=微克ADR=药物不良反应SJS=斯-约二氏综合症(Stevens-Johnson symdrome)TEN=中毒性表皮坏死溶解(toxic epidermal necrolysis)HSS=过敏症状(hypersensitivity syndrome)DRESS=伴有嗜酸性细胞增多和全身症状的药物反应(drug reactionwith eosinophilia and systemic symptoms)
SSO=顺序特异的寡核苷酸(sequence-specific oligonucleotide)PCR=聚合酶链反应HLA=人白细胞抗原(human leukocyte antigen)STRP=短串联重复多态性(short tandem repeat polymorphism)材料和方法患者和对照受试者为了实施例1和2所述的研究,从Chang Gung Memorial Hospital或从全台湾的若干其它医学中心总共招募到112名SJS/TEN患者。在这些患者中,42人患有卡马西平(tegretol)-诱发的SJS/TEN,17人患有别嘌醇-诱发的严重ADR。此外,还招收了126名患者,其发生了对于不同药物的中等程度过敏反应。记录的服药史包括剂量和疗程以及药物不良反应的表型。临床形态学的诊断标准根据Roujeau(Roujeau JC、1994)定义。我们将SJS定义为皮肤脱离(skin detachment)低于体表面积的10%,交错SJS-TEN定义为皮肤脱离为10-30%,以及TEN为高于30%。SJS、交错SJS-TEN和TEN总称为SJS/TEN。
对于各患者,停用被怀疑的药物并观察患者的症状。排除发生皮肤性药物不良反应且在停用药物后没有平息的患者。包括73名tegretol-耐受的患者作为对照。还招募了普通台湾人志愿者(n=94;年龄范围20-80岁)。该研究经学会委员会批准并获得了知情同意。
HLA的基因分型逆lineblot顺序特异的寡核苷酸(SSO)的试剂购自DYNAL BiotechLtd.(Bromborough、UK)并用于HLA基因分型。简言之,使用将HLA I组或II组位的第二和第三外显子生物素化的引物对产生PCR产物,然后杂交至固定于尼龙膜上的探针的SSO的lineblot。使用抗生蛋白链菌素-辣根过氧化物酶(HRP)和发色的可溶性底物检测结合于特异探针的生物素化PCR产物的存在从而在阳性探针位置产生蓝“线”。该探针反应模式通过基因分型软件DynalRELITMSSO(DYNAL Biotech Ltd.;Bromborough、UK)解释。潜在的模糊之处通过根据IHWG Technical Manual(International Histocompatibility WorkingGroup)进行的基于序列的分型和DNA测序进一步解析。
SNP基因分型通过使用PUREGENE DNA纯化体系(Gentra systems、Minnesota、USA)分离基因组DNA。SNP基因分型通过高通量MALDI-TOF质谱仪进行。简言之,使用Spectro DESIGNER软件(Sequenom、San Diego、CA、USA)设计引物和探针。进行多重聚合酶链反应(PCR),未并入的dNTP经弱碱性磷酸酶(Hoffman-LaRoche、Basel、Switzerland)脱磷酸化,随后进行引物延伸。将该纯化的引物延伸反应涂点至384-元素的硅芯片(SpectroCHIP、Sequenom)上,使用Bruker Biflex III MALDI-TOF SpectroREADER质谱仪(Sequenom)和具有SpectroTYPER(Sequenom)的波谱仪进行分析。
短串联重复多态性(STRP)基因分型从NCBI数据库中选择位于MHC区域的20个高度多态性的微卫星标记物(即,D6S258、D6S2972、D6S510、D6S265、D6S388、D6S2814、HLAC_CA1、HLABC_CA2、MIB、MICA、TNFd、BAT2_CA、D6S273、D6S1615、DQCAR、G51152、D6S2414、D6S1867、D6S1560、和D6S1583)。标记物的平均杂合性为0.72,估计具有230kb的间距。
基于数据库内报道的寡核苷酸序列而设计引物。使用GeneAmp 9700热循环子(thermocyclers)(Applied Biosystems、Foster City、CA、USA)在包含10ng基因组DNA和0.33μM各引物的5μl体积中进行基因分型PCR。在毛细管凝胶电泳之前,将总共6个合适大小的产物和荧光标记置于池中。多态性扩增子的尺寸通过ABI 3730 DNA定序器(Applied Biosystems)电泳而确定,使用LIZ500尺寸标准物作为尺寸内标(Applied Biosystems)。使用GENMAPPER程序3.0版(Applied Biosystems)计算等位基因尺寸。使用SAS程序进行allelecalling和binning。为了定性对照的目的,在所有基因分型试验中均包括三种CEPH对照个体(1331-01、1331-02、1347-2)和H20。
统计分析通过构建2x2表经具有Y值校正(Yates correction)的卡方方法比较不同组中的等位基因频率。通过该区域内存在的观察到的HLA等位基因的数目乘以原始P值而比较多个HLA等位基因从而校正P值(Pc)。使用Haldane′smodification计算优势率,其向所有细胞增加了0.5以调节可能的零计数。
实施例1HLA-B*1502等位基因在具有ADR的238人的组中,经诊断112例患有SJS/TEN,126人对于多种药物出现较缓和的皮肤性药物不良反应(红斑多形物、斑丘疹、荨麻疹、血管性水肿和固定性药疹)。在112名SJS/TEN患者中,42人接触卡马西平(tegretol),17人服用别嘌醇、53人服用除卡马西平和别嘌醇外的其它药物。
对患者进行材料和方法中所述的HLA分型。如表1所示,HLA-B位置中DNA变化的等位基因(HLA-B*1502)与具有药物-诱发的SJS/TEN的患者特别是接受卡马西平(tegretol)的患者是相关的。
表1卡马西平(tegretol)-诱发斯-约二氏综合症/中毒性表皮坏死溶解的42名台湾患者体内的HLA-B*1502机率
a,具有较SJS更温和的药物不良反应的患者b,普通台湾人群c,卡马西平耐受患者X2,具有Y值校正的卡方Pc,观察到的HLA-B等位基因的数目(35)乘以原始P值而算得。
由此,在接受卡马西平的42名SJS/TEN患者中检测到42次(100%)HLA-B*1502。该等位基因还在接受其它药物(8人苯妥英、2人别嘌醇、2人阿莫西林、1人柳氮磺吡啶、1人酮洛芬、1人布洛芬和2人未知药物)的53名(32%)SJS/TEN患者中发现17次。特别地,服用苯妥英后发生SJS/TEN的17名患者中有8人(47.05%)也带有HLA-B*1502等位基因。另一方面,该等位基因仅在卡马西平-耐受组的4.1%(3/73)中发现,苯妥英-耐受组的0%(0/32)中发现,具有除SJS外更温和药物不良反应的患者的6.3%(9/142)中发现,以及普通人群的5.3%(5/94)中发现。通过使用耐受组作为对照,与卡马西平-诱发的SJS/TEN相关的B*1502的优势比、灵敏度、特异性、阳性预测值和阴性预测值分别是1712、100%、95.89%、96.0%和100%。具有如此高的预测值和灵敏度,该HLA-B等位基因的分型可用于鉴定对于药物诱发的SJS/TEN特别是tegretol-诱发的SJS/TEN高危险的患者。
B*1502等位基因没有表现出与tegretol诱发的所有表型相关。如表2所示,在患对于tegretol较温和的皮肤反应(如斑丘疹)的16名患者中没有检测到表位基因(表2)。但是,另一种等位基因,HLA-B*4601,与这些较较温和的皮肤反应明显相关(16名患者者中有10名,或62.5%)。由此,HLA-B*4601可用作温和皮肤ADR的危险因素,特别是对于由tegretol诱发的ADR。
表2tegretol-诱发的皮肤ADR患者的表型/基因型数据
实施例2HLA-B*5801等位基因和SJS/TEN我们已确定了HLA-B*5801等位基因为发生别嘌醇-诱发的SJS/TEN的危险因素。在服用别嘌醇的所有17名(100%)SJS/严重ADR患者体内均发现了HLA-B*5801等位基因(表3和4),但仅在18%普通台湾人体内发现(优势比155、灵敏度100%、特异性82%、阳性预测值84.7%、阴性预测值100%、Pc=3.7×10-9)。因此,HLA-B*5801等位基因可单独或与其它遗传标记物一起用于服用别嘌醇个体发生SJS的危险率评估。
表3别嘌醇-诱发严重皮肤性药物不良反应的17名台湾患者体内的HLA-B*5801机率
a,具有较SJS更温和的药物不良反应的患者b,普通台湾人群
X2,具有Y值校正的卡方Pc,观察到的HLA-B等位基因的数目(35)乘以原始P值而算得。
表4别嘌醇-诱发的皮肤ADR患者的表型/基因型数据
实施例3HLA-B*5801等位基因诱发的过敏综合症在另一种广泛地研究中,进一步发现HLA-B*5801还与别嘌醇-诱发的过敏综合症(HSS)相关联。研究了31名患者,包括12名SJS、3名SJS/TEN、1名TEN和15名HSS患者。HSS的标准为皮疹(如弥散性斑丘疹、剥脱性皮炎),以及两种如下症状发热、嗜曙红细胞增多、非典型循环胸腺依赖性细胞、白细胞增多、急性肝细胞损伤或肾功能恶化(Arellano et al.,1993)。在所有征集的病例中,如果ADR症状发作出现在首次接触别嘌醇的2个月内且停药后消除ADR症状,那么别嘌醇被认为是激怒药物(offending drug)。排除具有下列任一病情的患者在此接触别嘌醇后未出现症状的患者、以及较温和皮疹尚未达到HSS、SJS或TEN标准的患者。
所有患者症状的发作在首次接触别嘌醇2个月内,且2名患者再次接触的2天内第二次发作。12名患者接受除别嘌醇外的多种药物,但它们的医疗记录表明当服用这些共用药物而不服用别嘌醇时没有药物不良反应。所有患者具有高尿酸血症和/或痛风性关节炎,以及其它慢性疾病,包括高血压(14/31)、慢性肾病(16/31)和糖尿病(9/31)。
引入服用别嘌醇至少6个月(平均=38个月,范围=6-107个月)而无ADR的98名痛风性关节炎患者作为别嘌醇-耐受的对照。耐受组的性别分布与中国人中普通痛风发病率相当。此外,作为另一对照组的93名正常受试者,为正常的台湾人群。这3组人口统计学的变化示于表5中。
表5在严重ADR患者、耐受患者以及正常受试者中接触别嘌醇的人口统计学的变化、剂量和疗程
HLA-B*5801等位基因在所有31名别嘌醇-诱发严重ADR患者中存在31次(100%),98名耐受患者中有16次(16.3%)(优势比315、Pc<10-15),93名正常受试者中有19次(20%)(优势比241、Pc<10-13)。相对于别嘌醇-耐受组,存在的该等位基因对于别嘌醇-ADR具有100%的阴性预测值,存在的B*5801具有66%的阳性预测值。因此,HLA-B*5801是别嘌醇-诱发严重ADR(包括皮肤ADR)和别嘌醇-诱发DRESS(嗜曙红细胞增多和全身症状的药物反应)的高特异性(84%)和灵敏度(100%)标记物。
实施例4连接于HLA-B*1502或B*5801等位基因的等价遗传标记物存在的HLA-B*1502、5801或4601可通过其它遗传标记物指示。特别地,接近感兴趣的HLA等位基因的遗传标记物趋向于与感兴趣的等位基因共分离或显示了连锁不均衡。因此,存在这些标记物(等价遗传标记物)预示了存在感兴趣的等位基因。
为了测试药物不良反应患者体内潜在的等价遗传标记物发生率,测量了HLA-B*1502单倍型中的若干标记物与药物不良反应的关联性。实际上,HLA-B*1502单倍型的HLA标记物,如DRB1*1202、Cw*0801、Cw*0806、A*1101和MICA*019在已接触卡马西平的SJS/TEN患者中具有明显较高的发生率(表6)。
表6B*1502-祖单倍型(ancestral haplotyoes)的标记物对于易患药物不良反应的贡献
还测定了与HLA-B*5801相关的标记物。受HLA-B*5801等位基因纯合的4名患者指引,我们分析了混合的HLA位的等位基因分布并定义了祖单倍型为HLA-A*3303、Cw*0302、B*5801和DRB1*0301。该祖单倍型存在于31名别嘌醇-ADR患者的12人(38.7%)中(表7),但在耐受患者中仅存在7.1%,在正常受试者中仅存在9.7%。
表7在别嘌醇诱发严重药物不良反应、别嘌醇耐受患者以及正常受试者中单一或联合位的HLA-B*5801祖单倍型的频率
+优势比(别嘌醇-ADR/耐受)315(95%Cl,18.3-5409.5),Pc=7.5×10-16。
++优势比(别嘌醇-ADR/耐受)241(95%Cl,14.1-4111),Pc=6.×10-14。
我们还通过分型MHC区域中的STRP(短串联重复多态性)标记物独立分析了单倍型。连锁不均衡曲线表明在别嘌醇-ADR患者组中的HLA-C和TNFd之间存在阻滞,但不在于耐受组中。在该阻滞中,确定了HLA-B基因附近的单倍型(MIB*358-MICA*206-TNFd-140),其与发现的B*5801与疾病的关联(p=0.0018)相一致。通过使用STPR标记物和测序MICA等位基因,我们发现所分析的别嘌醇-ADR患者携有相同的B等位基因(B*5801)、MICA等位基因(MICA*00201)和TNF STRP标记物(TNFd*140)。但是,一名患者没有与其它患者相同的MIB标记物(MIB*358)。这些数据表明除了MIB之外的易患基因存在于HLA-B和TNF位之间的230kb区域。
权利要求
1.一种评价患者发生应答于药物的药物不良反应危险的方法,其包括测定选自HLA-B*1502、HLA-B*5801和HLA-B*4601的HLA-B等位基因的存在,其中HLA-B等位基因的存在指示了药物不良反应的危险。
2.根据权利要求1的方法,其中所述药物选自卡马西平、别嘌醇、苯妥因、柳氮磺吡啶、阿莫西林、布洛芬和酮洛芬。
3.根据权利要求1或2的方法,其中所述药物是卡马西平。
4.根据权利要求1或2的方法,其中所述药物是别嘌醇。
5.根据权利要求1-4任一项的方法,其中所述药物不良反应是斯-约二氏综合症(SJS)、中毒性表皮坏死溶解(TEN)或药物过敏综合症(HSS)。
6.根据权利要求1、2、3或5的方法,其中所述药物不良反应是SJS或TEN,所述药物是卡马西平,以及所述等位基因是HLA-B*1502。
7.根据权利要求1、2、4或5的方法,其中所述药物不良反应是SJS、TEN或HSS,所述药物是别嘌醇,以及所述等位基因是HLA-B*5801。
8.根据权利要求1、2或5的方法,其中所述药物不良反应是SJS、TEN或HSS,所述药物是苯妥因,以及所述等位基因是HLA-B*1502。
9.根据权利要求1-8任一项的方法,其中通过使用与编码等位基因的核酸特异性杂交的寡核苷酸测定等位基因的存在。
10.根据权利要求1-9任一项的方法,其中通过使用由患者外周血制备的DNA测定等位基因的存在。
11.根据权利要求1-9任一项的方法,其中通过使用由患者外周血制备的RNA、蛋白、细胞或血清测定等位基因的存在。
12.根据权利要求1-11任一项的方法,其中通过测定等位基因的等价遗传标记物测定等位基因的存在,其中所述等价遗传标记物的存在指示了等位基因的存在。
13.根据权利要求12的方法,其中所述等价遗传标记物选自HLA-DRB 1*1202、Cw*0801、Cw*0806、A*1101、MICA*019、A*3303、Cw*0302、DRB1*0301和MICA*00201。
14.一种开发用于药物诱发的不良反应的治疗的方法,其包括使用其中至少一种HLA-B等位基因作为靶点的测定法来筛选候选药物,其中所述HLA-B等位基因选自HLA-B*1502、HLA-B*5801和HLA-B*4601。
15.根据权利要求14的方法,其中所述不良反应是斯-约二氏综合症(SJS)、中毒性表皮坏死溶解(TEN)或药物过敏综合症(HSS)。
16.根据权利要求14或15的方法,其中所述药物选自卡马西平、别嘌醇、苯妥因、柳氮磺吡啶、阿莫西林、布洛芬和酮洛芬。
17.根据权利要求14、15或16的方法,其中所述药物是卡马西平或别嘌醇。
18.根据权利要求14-17任一项的方法,其中所述不良反应是SJS或TEN,所述药物是卡马西平,以及所述等位基因是HLA-B*1502。
19.根据权利要求14-17任一项的方法,其中所述不良反应是SJS、TEN或HSS,所述药物是别嘌醇,以及所述等位基因是HLA-B*5801。
20.根据权利要求14-19任一项的方法,其中所述测定法包括提供表达HLA-B等位基因的细胞。
21.一种药物基因组序型分析的方法,其包括测定至少一种选自HLA-B*1502、HLA-B*5801和HLA-B*4601的HLA-B等位基因的存在。
22.根据权利要求21的方法,其中测定了HLA-B*1502和HLA-B*5801二者的存在。
23.根据权利要求21或22的方法,其进一步包括测定至少一种选自硫代嘌呤甲基转移酶和长-QT综合症基因的遗传因子的存在。
24.根据权利要求21-23任一项的方法,其中通过使用与编码等位基因的核酸特异性杂交的寡核苷酸测定等位基因的存在。
25.根据权利要求21-24任一项的方法,其中通过使用由患者外周血制备的DNA测定等位基因的存在。
26.根据权利要求21-24任一项的方法,其中通过使用由患者外周血制备的RNA、蛋白、细胞或血清测定等位基因的存在。
27.一种评价患者发生应答于药物的SJS、TEN或HSS的危险的方法,包括测定患者体内HLA亚型的存在,其中所述HLA亚型是SJSTEN或HSS的危险因子。
28.根据权利要求27的方法,其中所述药物选自卡马西平、别嘌醇、苯妥因、柳氮磺吡啶、阿莫西林、布洛芬和酮洛芬。
29.一种鉴定诱发SJS、TEN或HSS的药物的方法,其包括使含有HLA亚型的细胞与候选药物进行接触。
30.根据权利要求27、28或29的方法,其中所述HLA亚型是HLA-B亚型。
31.根据权利要求27-30任一项的方法,其中所述HLA亚型是HLA-B15、B58或B46亚型。
32.根据权利要求27-31任一项的方法,其中所述HLA亚型是HLA-B*1502、HLA-B*5801和HLA-B*4601。
33.根据权利要求29-32任一项的方法,其中所述细胞位于非人动物中。
全文摘要
本发明提供了一种预测患者发生药物不良反应特别是SJS、TEN或过敏综合症(HSS)的方法。已发现HLA-B等位基因,HLA-B
文档编号C12Q1/68GK1902328SQ200480040177
公开日2007年1月24日 申请日期2004年6月18日 优先权日2003年11月10日
发明者陈垣崇, 洪舜郁, 钟文宏, 邬哲源 申请人:中央研究院
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