用于提高蛋白质与配体之间结合的阻断概率的方法和系统与流程

文档序号:37275524发布日期:2024-03-12 21:08阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种用于提高蛋白质与配体之间结合的阻断概率的方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的用于提高蛋白质与配体之间结合的阻断概率的方法,其特征在于,原蛋白质-配体复合物的相互作用原子指的是原蛋白质与相应配体结合区域的原子。

3.根据权利要求1或2所述的用于提高蛋白质与配体之间结合的阻断概率的方法,其特征在于,步骤(3)中划分外中内三层的过程,首先是将原蛋白质的热点原子全部投影在相互作用平面上,然后使用边缘检测算法确定相互作用平面上位于最外层的投影点,将这些投影点对应的热点原子作为外层的热点原子,最后根据相互作用平面上其余投影点距离最外层的投影点的距离确定其对应空间中的中层的热点原子和内层的热点原子。

4.根据权利要求1至3中任意一项所述的用于提高蛋白质与配体之间结合的阻断概率的方法,其特征在于,

5.根据权利要求4所述的用于提高蛋白质与配体之间结合的阻断概率的方法,其特征在于,

6.根据权利要求5所述的用于提高蛋白质与配体之间结合的阻断概率的方法,其特征在于,可变参数包括第一预设值、第二预设值、外层热点原子对应的球体的半径、内层热点原子对应的球体的半径、上层热点原子对应的球体的半径、以及下层热点原子对应的球体的半径。

7.一种用于提高蛋白质与配体之间结合的阻断概率的系统,其特征在于,包括:


技术总结
本发明公开了一种用于实现蛋白质与配体之间高阻断概率的方法,包括:获取原蛋白质的所有热点原子、以及原蛋白质‑配体复合物的相互作用原子,进而获取其相互作用平面,根据相互作用平面将原蛋白质的所有热点原子划分为外、中、上、下四层,针对四层的每一个热点原子而言,建立以该热点原子的坐标为球心的球体,获取原蛋白质被改造以后该球体内部所包含的新增原子数量作为该热点原子对应的球体新增原子数,从四层中任选一个热点原子,判断该热点原子的球体新增原子数是否小于等于该热点原子的球体新增原子数阈值。本发明能够解决现有计算掩蔽肽覆盖率的方法中存在的覆盖率准确率低,进而降低了蛋白质与配体之间结合的阻断概率的技术问题。

技术研发人员:陈亮,邓楠,胡志鹏,邓新宇,梁国龙
受保护的技术使用者:深圳太力生物技术有限责任公司
技术研发日:
技术公布日:2024/3/11
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