通过施用微生物聚生体或其纯化菌株来提高禽类的农业生产的方法与流程

文档序号:34914125发布日期:2023-07-27 22:56阅读:42来源:国知局
通过施用微生物聚生体或其纯化菌株来提高禽类的农业生产的方法与流程

本公开涉及尤其可应用于禽类养殖的分离的且生物纯的微生物。所公开的微生物可以其分离的且生物纯的状态使用,以及被配制成组合物。此外,本公开提供了微生物聚生体,所述微生物聚生体含有所公开的微生物的至少两种成员;以及利用所述聚生体的方法。此外,本公开提供了调节禽类微生物组的方法。关于序列表的声明与本技术相关的序列表以文本格式代替纸质副本提供,并且特此以引用的方式并入本说明书中。包含序列表的文本文件的名称是asbi_003_03wo_st25.txt。所述文本文件是165kb,于2017年4月13日创建,并通过efs-web以电子方式提交。


背景技术:

1、到2050年,预计全球人口将增加至超过90亿人,同时人均可用的土地、水和其他自然资源的量减少。预测表明,国内平均收入也将增加,中国和印度的gdp预计增长。对富含动物源蛋白质的饮食的需求随着收入增加而上升,因此全球畜牧业将充满使用更少资源生产更多动物产品的挑战。联合国粮食和农业组织(food and agriculture organization ofthe united nations)预测,将必须生产多70%的粮食,但可供使用的可耕土地面积将减少。显然,为了支持人口增长,每单位资源投入的粮食产量将必须大幅增加。

2、近几十年来,养殖业见证了肉类行业的快速增长,这得益于对禽肉的需求不断增长,禽肉以过去五十年中每年的人口增长率的约三倍不断增长。

3、禽肉、蛋及其组分主要用于制备许多不同形式的食品。通过营养调节、激素治疗、动物管理的变化和选择性育种,一直存在许多用于改善家禽和蛋生产的策略;然而,需要更有效地生产每只动物的可食用家禽食品。

4、鉴定用于可持续增加家禽和蛋生产的组合物和方法、同时平衡动物健康和福祉已成为满足不断增长的人口中日常人类需求的必要条件。通过扩大农场禽类总数来增加全球家禽产量不仅在世界许多地方在经济上不可行,而且将进一步导致负面的环境后果,因为家禽业的增长以及集约化和集中化趋势已经引起了许多环境问题,主要是由于产生的废物远远多于土地处置能够管理的废物。

5、大型农场中家禽的种群密度通常伴随着微生物病原体的发病率增加,这使得家禽产量处于风险之中,并且进一步使家禽的最终消费者处于人畜共患病原体(如梭菌属(clostridium)和沙门氏菌属(salmonella)的那些)的风险。考虑到许多人畜共患病原体的广泛存在,家禽不可能完全免受暴露。研究的重点是增加对暴露于这些病原体的家禽的定殖抗性的研究方法。

6、因此,通过简单地扩大目前在大多数发达国家使用的高投入农业系统来满足全球家禽产量预期是根本不可行的。

7、因此,本领域迫切需要增加家禽和蛋生产的改进的方法,同时还减轻微生物病原体的定殖和传播。


技术实现思路

1、在一些实施方案中,存在于本公开的组合物或聚生体中的至少两种微生物菌株或至少一种微生物菌株表现出增加的效用,所述效用在所述菌株单独存在或在所述菌株以天然存在的浓度存在时不展现。在一些实施方案中,包含至少两种如本文所教导的微生物菌株的本公开的组合物在赋予动物至少一种改善的性状方面表现出协同效应。在一些实施方案中,本公开的组合物—包含如本文所教导的一种或多种分离的微生物—与其最接近的天然存在的对应物相比表现出显著不同的特征/性质。也就是说,与其最接近的天然存在的对应物相比,本公开的组合物表现出显著不同的功能和/或结构特征/性质。例如,本公开的微生物至少出于以下原因在结构上不同于天然存在于禽类胃肠道中的微生物:所述微生物可以被分离和纯化,以使得它不存在于胃肠道的环境中,所述微生物可以在胃肠道中不存在的浓度存在,所述微生物可与在胃肠道中不存在的可接受的载体相关联,所述微生物可被配制为储存稳定的并且存在于胃肠道外部,并且所述微生物可与在胃肠道中不存在的浓度下的其他微生物组合。此外,本公开的微生物至少出于以下原因在功能上不同于天然存在于胃肠道中的微生物:所述微生物当以分离和纯化的形式应用时可导致胃肠微生物组的调节、增加的重量增加、增加的饲料利用率、减少量的微生物病原体、减少的病原体相关的gi病变,所述微生物可被配制为储存稳定的并且能够存在于胃肠环境外部,以使得所述微生物现在具有能够施用至禽类的补充剂的新的效用,其中所述微生物在胃肠道中可能不具有处于其自然状态的这种效用,因为所述微生物在没有人工干预以将所述微生物配制成储存稳定状态并赋予具有所述微生物在禽类胃肠道中在其天然存在状态下不具有的上述功能特征的这种新的效用的情况下将不能在胃肠道外部存活。

2、在一些方面,本公开涉及一种降低饲料转化率、增加禽类重量和/或减少禽类胃肠道中病原体相关的病变形成的方法,所述方法包括:a)向禽类施用有效量的储存稳定的禽类补充剂,所述补充剂包含:i)纯化的乳杆菌属细菌的微生物群体,所述群体包含具有与seq id no:1至少约97%相同的16s核酸序列的细菌,并且所述细菌具有至少约0.2的mic评分;和ii)适用于禽类施用的储存稳定的载体,其中与未施用所述补充剂的禽类相比,施用所述有效量的储存稳定的禽类补充剂的禽类表现出饲料转化率降低、重量增加或胃肠道中病原体相关的病变形成减少。

3、在一些方面,本公开涉及一种降低饲料转化率、增加禽类重量或减少禽类胃肠道中病原体相关的病变形成的方法,所述方法包括:a)向禽类施用有效量的储存稳定的禽类补充剂,所述补充剂包含:i)纯化的微生物群体,所述微生物群体包含具有16s核酸序列的细菌,和/或具有its核酸序列的真菌,所述核酸序列与选自由seq id no:1-385组成的组的核酸序列至少约97%相同,并且所述细菌和/或真菌具有至少约0.2的mic评分;和ii)适用于禽类施用的储存稳定的载体;其中与未施用所述补充剂的禽类相比,施用所述有效量的储存稳定的禽类补充剂的禽类表现出饲料转化率降低、重量增加和/或胃肠道中病原体相关的病变形成减少。

4、在一些方面,本公开涉及一种治疗家禽的坏死性肠炎的方法,所述方法包括:a)向鸟类施用有效量的储存稳定的家禽补充剂,所述家禽补充剂包含:i)纯化的微生物群体,所述微生物群体包含具有16s核酸序列的细菌,和/或具有its核酸序列的真菌,所述核酸序列与选自由seq id no:1-385组成的组的核酸序列至少约97%相同,并且所述细菌和/或真菌具有至少约0.2的mic评分;和ii)适用于家禽施用的储存稳定的载体,其中与未施用所述补充剂的鸟类相比,施用所述有效量的储存稳定的家禽补充剂的鸟类表现出胃肠道中引起坏死性肠炎的细菌的数量减少。

5、在一些方面,本公开涉及一种治疗家禽的坏死性肠炎的方法,所述方法包括:向鸟类施用有效量的储存稳定的家禽补充剂,所述家禽补充剂包含:i)纯化的乳杆菌属细菌的微生物群体,所述群体包含具有与seq id no:1至少约97%相同的16s核酸序列的细菌,并且所述细菌具有至少约0.2的mic评分;和ii)适用于家禽施用的储存稳定的载体,其中与未施用所述补充剂的鸟类相比,施用所述有效量的储存稳定的家禽补充剂的家禽表现出胃肠道中引起坏死性肠炎的细菌的数量减少。

6、在一些方面,本公开涉及一种降低饲料转化率、增加禽类重量和/或减少禽类胃肠道中病原体相关的病变形成的方法,所述方法包括:a)向禽类施用有效量的储存稳定的禽类补充剂,所述补充剂包含:i)纯化的乳杆菌属细菌的微生物群体,所述群体包含具有与seq id no:374至少约97%相同的16s核酸序列的细菌,并且所述细菌具有至少约0.2的mic评分;和ii)适用于禽类施用的储存稳定的载体,其中与未施用所述补充剂的禽类相比,施用所述有效量的储存稳定的禽类补充剂的禽类表现出饲料转化率降低、重量增加或胃肠道中病原体相关的病变形成减少。

7、在一些方面,本公开涉及一种降低饲料转化率、增加禽类重量和/或减少禽类胃肠道中病原体相关的病变形成的方法,所述方法包括:a)向禽类施用有效量的储存稳定的禽类补充剂,所述补充剂包含:i)纯化的乳杆菌属细菌的微生物群体,所述群体包含具有与seq id no:382至少约97%相同的16s核酸序列的细菌,并且所述细菌具有至少约0.2的mic评分;和ii)适用于禽类施用的储存稳定的载体,其中与未施用所述补充剂的禽类相比,施用所述有效量的储存稳定的禽类补充剂的禽类表现出饲料转化率降低、重量增加或胃肠道中病原体相关的病变形成减少。

8、在方面,前述微生物物种—即,包含具有16s核酸序列的细菌和/或具有its核酸序列的真菌的纯化的微生物群体,所述核酸序列与选自由以下组成的组的核酸序列至少约97%相同:seq id no:1-385—是markush组的成员,因为本公开说明,所述成员属于一类特征在于各种物理和功能属性的微生物,其可包括以下中的任一种:a)将碳源转化成诸如乙酸酯、丁酸酯、丙酸酯或其组合物的挥发性脂肪酸的能力;b)使可溶性或不溶性碳源降解的能力;c)向施用所述微生物的禽类赋予重量增加增加的能力;d)调节施用所述微生物的禽类的胃肠道的微生物组的能力;e)被配制成储存稳定的组合物的能力;f)在已经施用所述微生物的禽类中表现出饲料转化率降低的能力;g)赋予胃肠道中病原体相关的病变形成减少的能力;h)赋予胃肠道中病原微生物减少的能力;和/或i)在细菌的情况下具有至少约0.2的mic评分,并且在真菌的情况下具有至少约0.2的mic评分。因此,markush组的成员具有至少一种共同的性质,所述性质可负责其在所要求的关系中的功能。

9、在一些方面,所述禽类是肉鸡。在一些方面,所述禽类补充剂在环境条件下稳定至少一周。在一些方面,所述禽类补充剂被配制为:包囊、片剂、胶囊、丸剂、饲料添加剂、食物成分、食物添加剂、食物制剂、食物补充剂、水添加剂、水混合的添加剂、热稳定的添加剂,水分稳定的添加剂、消费性溶液、消费性喷雾添加剂、消费性固体、消费性凝胶、注射液、栓剂、浸液或其组合。

10、在一些方面,施用包括将禽类补充剂喂饲给禽类或将禽类补充剂喷洒到禽类上。在一些方面,所述纯化的微生物群体以至少102个细胞的浓度存在于禽类补充剂中。在一些方面,所述纯化的微生物群体包含具有16s核酸序列的细菌,所述核酸序列与选自由以下组成的组的核酸序列至少约97%相同:seq id no:1-50和59-385。在一些方面,所述纯化的微生物群体包含具有its核酸序列的真菌,所述核酸序列与选自由以下组成的组的核酸序列至少约97%相同:seq id no:51-58。在一些方面,所述纯化的微生物群体包含具有16s核酸序列的细菌,所述核酸序列与选自由以下组成的组的核酸序列至少约99%相同:seq idno:1-50和59-385。在一些方面,所述纯化的微生物群体包含具有its核酸序列的真菌,所述核酸序列与选自由以下组成的组的核酸序列至少约99%相同:seq id no:51-58。在一些方面,所述纯化的微生物群体包含具有16s核酸序列的细菌,所述核酸序列选自由以下组成的组:seq id no:1-50和59-385。在一些方面,所述纯化的微生物群体包含具有its核酸序列的真菌,所述核酸序列选自由以下组成的组:seq id no:51-58。

11、在一些方面,所述纯化的微生物群体包含具有16s核酸序列的细菌和具有its核酸序列的真菌,所述核酸序列与选自由以下组成的组的核酸序列至少约97%相同:seq idno:1-385。在一些方面,所述纯化的微生物群体包含具有16s核酸序列的细菌,所述核酸序列与seq id no:1至少约97%相同。在一些方面,所述纯化的微生物群体包含具有16s核酸序列的细菌,所述核酸序列包含seq id no:1,并且其中所述细菌是如作为专利201703004所保藏。

12、在一些方面,所述纯化的微生物群体仅含有为选自以下的组的成员的生物体:乳杆菌属、梭菌属、栖粪杆菌、产氢厌氧杆菌属、顶果孢菌属、芽孢杆菌属、罕见小球菌属、明串珠菌属、毛螺菌科、厌氧细杆菌属、微杆菌属、疣孢菌属、厌氧细杆菌属、布劳特菌属、假单胞菌属、孢杆菌属、棒状杆菌属、链球菌属、副球菌属、解纤维梭菌属、瘤胃球菌属、罗斯氏菌属、拟杆菌属、线黑粉菌属、赤霉菌属、alatospora、毕赤酵母属以及念珠菌属。

13、在一些方面,施用有效量的禽类补充剂的禽类表现出饲料转化率降低至少1%、重量增加至少1%和/或胃肠道中病原体相关的病变形成减少至少1%。在一些方面,施用有效量的禽类补充剂的禽类表现出饲料转化率降低至少10%、重量增加至少10%和/或胃肠道中病原体相关的病变形成减少至少10%。

14、一种能够降低饲料转化率、增加禽类重量或减少禽类胃肠道中病原体相关的病变形成的储存稳定的禽类补充剂,所述补充剂包含:a)纯化的群体,所述群体包含具有16s核酸序列的细菌,和/或具有its核酸序列的真菌,所述核酸序列与选自由seq id no:1-385组成的组的核酸序列至少约97%相同;和b)适用于禽类施用的储存稳定的载体,其中a)的所述纯化的细菌和/或真菌群体以与未施用所述补充剂的禽类相比,可有效降低饲料转化率、增加禽类重量和/或减少禽类胃肠道中病原体相关的病变形成的量存在于所述补充剂中。在一些方面,与未施用所述补充剂的禽类相比,施用所述补充剂的禽类表现出饲料转化率的降低。在一些方面,与未施用所述补充剂的禽类相比,施用所述补充剂的禽类表现出饲料转化率的降低。

15、在一些方面,所述纯化的细菌和/或真菌群体包含具有16s核酸序列的细菌,所述核酸序列与seq id no:1至少约97%相同。在一些方面,所述纯化的细菌和/或真菌群体包含具有16s核酸序列的细菌,所述核酸序列与seq id no:1至少约99%相同。在一些方面,所述纯化的细菌和/或真菌群体包含具有16s核酸序列的细菌,所述核酸序列包含seq id no:1。在一些方面,所述纯化的细菌和/或真菌群体包含具有16s核酸序列的细菌,所述核酸序列包含seq id no:1,并且其中所述细菌是如作为专利201703004所保藏。

16、在一些方面,所述储存稳定的禽类补充剂还包含:(i)纯化的细菌群体,所述细菌群体包含与选自由以下组成的组的核酸序列至少约97%相同的16s核酸序列:seq id no:1-50和59-385,和/或(ii)纯化的真菌群体,所述真菌群体包含具有its核酸序列的真菌,所述核酸序列与选自由以下组成的组的核酸序列至少约97%相同:seq id no:51-58。

17、在一些方面,所述纯化的细菌群体包含具有16s核酸序列的细菌,所述核酸序列与选自由以下组成的组的核酸序列至少约99%相同:seq id no:1-50和59-385。在一些方面,所述纯化的真菌群体包含具有its核酸序列的真菌,所述核酸序列与选自由以下组成的组的核酸序列至少约99%相同:seq id no:51-58。在一些方面,所述纯化的细菌群体包含具有16s核酸序列的细菌,所述核酸序列选自由seq id no:1-50和59-385组成的组。在一些方面,所述纯化的真菌群体包含具有its核酸序列的真菌,所述核酸序列选自由以下组成的组:seq id no:51-58。在一些方面,所述纯化的细菌群体包含具有16s核酸序列的细菌,所述核酸序列与seq id no:3至少约97%相同。在一些方面,所述纯化的细菌群体包含具有16s核酸序列的细菌,所述核酸序列与seq id no:3至少约99%相同。在一些方面,所述纯化的细菌群体包含具有16s核酸序列的细菌,所述核酸序列包含seq id no:3。在一些方面,所述纯化的细菌群体包含seq id no:1,并且其中所述细菌是如作为专利201703001所保藏。在一些方面,纯化的细菌群体(i)和纯化的真菌群体(ii)两者均存在于所述补充剂中。

18、在一些方面,所述禽类补充剂被配制用于施用至肉鸡。在一些方面,所述补充剂在环境条件下稳定至少一周。在一些方面,所述补充剂被配制为:包囊、包囊、片剂、胶囊、丸剂、饲料添加剂、食物成分、食物添加剂、食物制剂、食物补充剂、水添加剂、水混合的添加剂、热稳定的添加剂,水分稳定的添加剂、消费性溶液、消费性喷雾添加剂、消费性固体、消费性凝胶、注射液、栓剂、浸液或其组合。

19、在一些方面,所述纯化的细菌群体以至少102个细胞的浓度存在于禽类补充剂中。在一些方面,与未施用所述补充剂的禽类相比,施用所述补充剂的禽类表现出重量的增加。在一些方面,与未施用所述补充剂的禽类相比,施用所述补充剂的禽类表现出胃肠道中病原体相关的病变形成减少。

20、在一些方面,与未施用所述补充剂的禽类相比,施用所述补充剂的禽类表现出胃肠道中产气荚膜梭菌相关的病变形成的发病率降低。在一些方面,与未施用所述补充剂的禽类相比,施用所述补充剂的禽类表现出胃肠道中产气荚膜梭菌相关的病变形成的发病率降低1%。在一些方面,与未施用所述补充剂的禽类相比,施用所述补充剂的禽类表现出胃肠道中产气荚膜梭菌相关的病变形成的发病率降低10%。在一些方面,与未施用所述补充剂的禽类相比,施用所述补充剂的禽类表现出胃肠道中产气荚膜梭菌相关的病变形成的发病率降低20%。

21、在一些方面,所述储存稳定的补充剂还包含:(i)纯化的细菌群体,所述细菌群体包含与选自由以下组成的组的核酸序列至少约97%相同的16s核酸序列:seq id no:1-50和59-385,和/或(ii)纯化的真菌群体,所述真菌群体包含与选自由以下组成的组的核酸序列至少约97%相同的its核酸序列:seq id no:51-58。

22、在一些实施方案中,本公开涉及一种用于降低饲料转化率、增加禽类重量或减少禽类胃肠道中病原体相关的病变形成的方法,所述方法包括:a)向禽类施用有效量的储存稳定的禽类补充剂,所述补充剂包含:i)纯化的微生物群体,所述微生物群体包含具有与seq id no:13、346、19或22至少约97%相同的16s核酸序列的细菌,并且所述细菌具有至少约0.2的mic评分;和ii)适用于禽类施用的储存稳定的载体,其中与未施用所述补充剂的禽类相比,施用所述有效量的储存稳定的禽类补充剂的禽类表现出饲料转化率降低、重量增加和/或胃肠道中病原体相关的病变形成减少。

23、一种能够降低饲料转化率、增加禽类重量或减少禽类胃肠道中病原体相关的病变形成的储存稳定的禽类补充剂,所述补充剂包含:a)纯化的群体,所述群体包含具有与seqid no:13、346、19或22至少约97%相同的16s核酸序列的细菌;和b)适用于禽类施用的储存稳定的载体,其中a)的所述纯化的细菌群体以与未施用所述补充剂的禽类相比,可有效降低饲料转化率、增加禽类重量和/或减少禽类胃肠道中病原体相关的病变形成的量存在于所述补充剂中。

24、一种用于降低饲料转化率、增加禽类重量和/或减少禽类胃肠道中病原体相关的病变形成的方法,所述方法包括:a)向禽类施用有效量的储存稳定的禽类补充剂,所述补充剂包含:i)纯化的芽孢杆菌属、乳杆菌属或真杆菌属细菌的微生物群体,所述群体包含具有选自seq id no:13、346、19或22的16s核酸序列的细菌,并且所述细菌具有至少约0.2的mic评分;和ii)适用于禽类施用的储存稳定的载体,其中与未施用所述补充剂的禽类相比,施用所述有效量的储存稳定的禽类补充剂的禽类表现出饲料转化率降低、重量增加或胃肠道中病原体相关的病变形成减少。

25、一种能够降低饲料转化率、增加禽类重量或减少禽类胃肠道中病原体相关的病变形成的储存稳定的禽类补充剂,所述补充剂包含:a)纯化的芽孢杆菌属、乳杆菌属或真杆菌属细菌群体,所述群体包含具有与seq id no:13、346、19或22至少约97%相同的16s核酸序列的细菌;和b)适用于禽类施用的储存稳定的载体,其中a)的所述纯化的芽孢杆菌属、乳杆菌属或真杆菌属细菌群体以与未施用所述补充剂的禽类相比,可有效降低饲料转化率、增加禽类重量或减少禽类胃肠道中病原体相关的病变形成的量存在于所述补充剂中。

26、一种治疗家禽的坏死性肠炎的方法,所述方法包括:a)向鸟类施用有效量的储存稳定的家禽补充剂,所述家禽补充剂包含:i)纯化的微生物群体,所述微生物群体包含具有16s核酸序列的细菌,所述核酸序列与选自seq id no:13、346、19或22的核酸序列至少约97%相同,并且所述细菌具有至少约0.2的mic评分;和ii)适用于家禽施用的储存稳定的载体,其中与未施用所述补充剂的鸟类相比,施用所述有效量的储存稳定的家禽补充剂的鸟类表现出胃肠道中引起坏死性肠炎的细菌的数量减少。

27、一种治疗家禽的坏死性肠炎的方法,所述方法包括:a)向鸟类施用有效量的储存稳定的家禽补充剂,所述家禽补充剂包含:i)纯化的芽孢杆菌属、乳杆菌属或真杆菌属细菌的微生物群体,所述微生物群体包含具有选自seq id no:13、346、19或22的16s核酸序列的细菌,并且所述细菌具有至少约0.2的mic评分;和ii)适用于家禽施用的储存稳定的载体,其中与未施用所述补充剂的鸟类相比,施用所述有效量的储存稳定的家禽补充剂的家禽表现出胃肠道中引起坏死性肠炎的细菌的数量减少。

28、在方面,前述微生物物种—即,包含具有16s核酸序列的细菌和/或具有its核酸序列的真菌的纯化的微生物群体,所述核酸序列与选自由以下组成的组的核酸序列至少约97%相同:seq id no:1-385—是markush组的成员,因为本公开说明,所述成员属于一类特征在于各种物理和功能属性的微生物,其可包括以下中的任一种:a)将碳源转化成诸如乙酸酯、丁酸酯、丙酸酯或其组合物的挥发性脂肪酸的能力;b)使可溶性或不溶性碳源降解的能力;c)向施用所述微生物的禽类赋予重量增加增加的能力;d)调节施用所述微生物的禽类的胃肠道的微生物组的能力;e)被配制成储存稳定的组合物的能力;f)在已经施用所述微生物的禽类中表现出饲料转化率降低的能力;g)赋予胃肠道中病原体相关的病变形成减少的能力;h)赋予胃肠道中病原微生物减少的能力;和/或i)在细菌的情况下具有至少约0.2的mic评分,并且在真菌的情况下具有至少约0.2的mic评分。因此,markush组的成员具有至少一种共同的性质,所述性质可负责其在所要求的关系中的功能。

29、关于出于专利程序目的的微生物保藏的国际认可的布达佩斯条约

30、本技术中描述的一些微生物保藏在位于1815n.university st.,peoria,il61604,usa的美国农业部(usda)农业研究服务(ars)培养物保藏中心本技术中描述的一些微生物保藏在位于60bigelow drive,east boothbay,maine 04544,usa的毕格罗国家海洋藻类和微生物中心。本技术中描述的一些微生物保藏在位于10801universityboulevard,manassas,virginia 20108,usa的美国典型培养物保藏中心(atcc)。

31、所述保藏是根据布达佩斯条约关于出于专利程序目的的微生物保藏的国际认可的条款而作出的。上述布达佩斯条约保藏的atcc和毕格罗国家海洋藻类和微生物中心登录号提供于表3中。本技术中描述的微生物的登录号和相应的保藏日期单独提供于表45中。

32、至少自从2016年3月1日已经在ascus biosciences,inc.的实验室中保藏了以下表中指定的菌株。

33、在表1中,第2和5列中列出了微生物分类的最接近的预测命中。第2列是通过blast预测的最高分类学命中,并且第5列是通过blast预测的属+种的最高分类学命中。至少自从2016年3月1日已经在ascus biosciences,inc.的实验室中保藏了以下表中指定的菌株。

34、表1列举了本公开的细菌和真菌的菌株名称。如果括号中的字母遵循任何菌株名称,则表明那些菌株中的每种都具有与参考菌株(具有括号内的(a))共有至少97%序列同一性的变体。ascusbbr_5796(a)具有两种变体,分别与ascusbbr_5796(a)共有97.8%和98.2%序列同一性的ascusbbr_5796(b)和ascusbbr_5796(c)。ascusbbr_14690(a)具有两种变体,分别与ascusbbr_14690(a)共有97.8%和98.2%序列同一性的ascusbbr_14690(b)和ascusbbr_14690(c)。ascusbbr_38717(a)与ascusbbr_38717(b)共有98.6%序列同一性。ascusbbr_33(a)与ascusbbr_33(b)共有98.2%序列同一性。ascusbbr_409(b)、ascusbbr_409(c)、ascusbbr_409(d)分别与ascusbbr_409(b)共有98.2%、97.3%和97.8%序列同一性。ascus_331885(b)和ascus_331885(c)分别与ascus_331885(a)共有97.8%和97.3%序列同一性。ascusbbr_247(a)与ascusbbr_247(b)共有97.8%序列同一性。ascusbbr_10593(a)与ascusbbr_10593(b)共有99.6%序列同一性。ascusbbr_32731(a)与ascusbbr_32731(b)共有97.3%序列同一性。ascusbbr_1436(a)与ascusbbr_1436(b)共有97.8%序列同一性。ascusbbr_265(a)与ascusbbr_265(b)共有99.6%序列同一性。

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