一种检测miRNA来源的方法与流程

文档序号:12412785阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种检测miRNA来源的方法,其特征在于,包括以下步骤:

1)提供物种的待检测miRNA前体序列的信息;

2)提供假基因数据库中所述物种的假基因信息;

3)将所述待检测miRNA前体序列与所述物种假基因的核苷酸序列的物理位置比较是否重合,将与miRNA前体序列的物理位置具有重合度的假基因确定候选假基因;

4)根据待检测miRNA前体序列与所述物种基因组的假基因序列在染色体所在的物理位置,计算两类序列的重合度,当所述重合度I符合1≧I>0.3条件时,确定待检测miRNA是由所述步骤3)得到的候选假基因所产生;

所述步骤1)和步骤2)之间没有时间顺序限定。

2.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述步骤1)中信息包括待检测miRNA前体序列在染色体上的物理位置、名称及所在DNA链的正负性。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤2)中的信息包括假基因在染色体上的物理位置、名称及假基因所在DNA链的正负性。

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤4)中重合度I的计算公式为:

I=待检测miRNA前体序列与候选假基因核苷酸序列相互重合部分的长度/待检测miRNA前体序列的长度;

所述计算公式的适用情形包括以下三种:(1)目标miRNA(s)前体序列的起点和终点均位于候选假基因核苷酸序列的内部;(2)目标miRNA(s)前体序列的起点位于候选假基因核苷酸序列的内部,终点位于候选假基因核苷酸序列的外部;(3)目标miRNA(s)前体序列的终点位于候选假基因核苷酸序列的内部,起点位于候选假基因核苷酸序列的外部。

当前第2页1 2 3 
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1