一种光调控启动子降低黑曲霉β‑葡萄糖苷酶表达酶活的方法与流程

文档序号:12412132阅读:364来源:国知局

技术领域

本发明属于基因工程领域,涉及一种光调控启动子降低黑曲霉β-葡萄糖苷酶表达酶活的方法。



背景技术:

纤维素酶(β-1,4-葡聚糖-4-葡聚糖水解酶)是降解纤维素生成葡萄糖的一组酶的总称,它不是单体酶,而是起协同作用的多组分酶系,是一种复合酶,主要由外切β-葡聚糖酶、内切β-葡聚糖酶和β-葡萄糖苷酶等组成。

在纤维素酶降解纤维素的时候,外切酶先把纤维素酶解为短链可溶的片段,内切酶把短链的片段酶解为纤维二糖,纤维二糖在β-葡萄糖苷酶的作用下酶解为葡萄糖。纤维素酶酶解纤维素是一个协同降解的过程,某一种酶活性过高或者过低都会降低纤维素酶解效率。

黑曲霉是一种食品安全菌,产生的纤维素酶具有广阔的应用领域,比如污水处理、垃圾利用、食品等。黑曲霉生产的纤维素酶中β-葡萄糖苷酶的酶活相对较高,三种酶的组成不利于最大化的发挥酶的催化效率。降低β-葡萄糖苷酶的活性是优化纤维素酶酶系组成的一个重要措施。已有的降低某种酶的表达效率的措施主要为基因敲除,也取得了一些效果。



技术实现要素:

本发明的目的在于克服现有技术的缺点与不足,提供一种光调控启动子降低黑曲霉β-葡萄糖苷酶表达酶活的方法。本发明的目的还在于提供一种光诱导β-葡萄糖苷酶活性降低的黑曲霉菌株。

本发明的目的通过下述技术方案实现:

一种光调控启动子降低黑曲霉β-葡萄糖苷酶表达酶活的方法,包括如下步骤:

(1)将由光调控启动子或含光调控启动子的DNA序列、表达与β-葡萄糖苷酶mRNA互补的反义mRNA的DNA序列和终止子序列组成的DNA片段构建到表达载体上;

(2)将步骤(1)所构建的重组载体转化到黑曲霉中;

(3)转化有重组载体的黑曲霉菌株在光照条件下进行培养。

步骤(1)中所述的含光调控启动子的DNA序列优选如SEQ ID NO.1所示。

步骤(1)中所述的表达与β-葡萄糖苷酶mRNA互补的反义mRNA的DNA序列优选如SEQ ID NO.2所示。

步骤(1)中所述的终止子序列优选如SEQ ID NO.3所示。

步骤(1)中所述的表达载体优选为pCAMBIA1301载体。

步骤(1)优选为:将序列如SEQ ID NO.4所示的DNA片段通过限制性内切酶EcoI、KpnI及DNA连接酶构建到pCAMBIA1301载体上,得到重组载体。

步骤(2)中所述的黑曲霉优选为黑曲霉ATCC16404。

步骤(2)优选通过农杆菌将所构建的重组载体转化到黑曲霉中。

步骤(3)中所述的光照条件优选为蓝光。

一种光诱导β-葡萄糖苷酶活性降低的黑曲霉菌株,为上述方法中构建的转化有重组载体的黑曲霉菌株。

本发明具有如下优点和有益效果:本发明利用光增强表达的启动子调控β-葡萄糖苷酶mRNA互补的反义mRNA转录,有效降低了β-葡萄糖苷酶的翻译量和表达的活性,从而优化了黑曲霉表达的纤维素酶系组合,以最大化发挥纤维素酶系降解纤维素的效率。

具体实施方式

下面结合实施例对本发明作进一步详细的描述,但本发明的实施方式不限于此。

实施例1

1. 材料

黑曲霉(Aspergillus niger)ATCC16404,大肠杆菌(Escherichia coli)DH5α,根癌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)AGL1,质粒pCAMBIA1301(Biovector公司)。

人工合成的DNA序列1(SEQ ID NO.4所示),该序列由含光调控启动子的DNA序列、表达与β-葡萄糖苷酶mRNA互补的反义mRNA的DNA序列、终止子序列及两端的酶切位点序列组成。

2. 方法

(1)质粒pCAMBIA1301的提取

含有质粒pCAMBIA1301的大肠杆菌DH5α在含有50μg/mL的卡那霉素的LB培养基中培养18h。质粒提取按照上海生工的一步法质粒DNA抽提试剂盒(产品编号B518188)的操作流程提取。具体如下:取0.5mL菌液,10000r/m离心3min收集菌体,倒尽或吸干培养基。在菌体沉淀中加入700μL Lysis Buffer UF,吸打或振荡至彻底悬浮菌体,室温放置3min。将裂解液全部小心移入吸附柱,室温放置1min,8000rpm离心2min。倒掉收集管中的液体,将吸附柱放入同一个收集管中,向吸附柱中加入500μL Prewash Solution,8000rpm离心2min。倒掉收集管中的液体,将吸附柱放入同一个收集管中,向吸附柱中加入500μL Wash Solution,8000rpm离心1min。倒掉收集管中的液体,将吸附柱放入同一个收集管中,再次向吸附柱中加入500μL Wash Solution,8000rpm离心1min。倒掉收集管中的液体,将吸附柱放入同一个收集管中,将空吸附柱和收集管放入离心机,8000rpm离心2min。将吸附柱放入干净的1.5mL离心管中,在吸附膜中央加入50μL Elution Buffer,室温静置2min,8000r/m离心2 min。将所得到的质粒DNA溶液置于-20℃保存或用于后续试验。

(2)重组质粒的构建

1)pCAMBIA1301质粒、合成的DNA序列1的酶切、回收

往20μL提取的pCAMBIA1301质粒或用双蒸水稀释10倍的DNA序列1中加入EcoI和KpnI(Takara)各2μL、酶切缓冲液2.2μL,37℃水浴3h后,加入2μL Loading Buffer,终止反应。

酶切的质粒或DNA序列1通过琼脂糖凝胶电泳后用上海生工的SanPrep核酸纯化套件(胶回收)试剂盒(B515103-0100)回收,得pCAMBIA1301质粒酶切回收液、DNA序列1酶切回收液。

2)连接和转化

连接体系为:pCAMBIA1301质粒酶切回收液17.5μL,DNA序列1酶切回收液2μL,DNA连接酶(Takara)2.5μL,连接酶缓冲液2.2μL。16℃连接24h,连接产物备用。

将连接产物转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,挑取转化子培养,提质粒进行酶切、测序鉴定,鉴定正确的重组质粒命名为pCAMBIA01。

(3)黑曲霉孢子原生质体制备及重组质粒的转化

1)斜面活化

在无菌操作台中,将保藏的黑曲霉ATCC16404菌种接入已灭菌的斜面培养基中,置于30℃恒温培养箱中培养3天,斜面长出孢子。

所用斜面培养基为PDA培养基,其配制方法为:取新鲜马铃薯60g,去皮切成细丝状,加入适量蒸馏水,置于蒸煮锅内煮沸并不断用玻璃棒搅拌至快成糊状,用八层纱布过滤取滤液,依次加入用天平称取的葡萄糖2g、琼脂2g,搅匀,最后用蒸馏水定容至100mL,加热溶解。分装于试管中,约至试管的三分之一,然后加塞包扎灭菌,灭菌温度为121℃,压强为0.1Mpa,灭菌20min。灭菌结束后摆斜面冷却待用。

2)孢子悬浮液的制备

将已活化的黑曲霉孢子从试管中刮到装有生理盐水的三角瓶中,置于30℃摇床上,150r/m震荡10min。取出用4层擦镜纸过滤,将滤液用3000r/m离心,弃上清液,用生理盐水洗涤1-2次。然后对悬浮液进行镜检和计数,调整孢子浓度约为5×108个/mL,50℃热激1min,30℃培养8h,得到孢子萌发悬浮液。

3)原生质体悬液的制备

采用高渗溶液即0.8mol/L NaCl溶液配制0.5%蜗牛酶和1%纤维素酶的混合酶液10mL,加入10mL孢子萌发悬浮液,30℃水浴4h,用微孔滤膜过滤,再用0.8mol/L NaCl 溶液反复冲洗滤膜上的孢子,最后滤膜上的孢子溶解到10mL 0.8mol/L NaCl溶液中,得到原生质体悬液。

4)根癌农杆菌感受态的制备

挑取根癌农杆菌AGL1接种于3mL LB液体培养基中,28℃、180r/min培养过夜。取2mL 培养液接种于100mL LB液体培养基中继续培养,至OD600为0.5左右。将培养液置冰浴中40min后4℃、5000r/min 离心10min,弃去上清液。用10mL 4℃预冷的无菌水离心洗涤1次,弃去上清液。再用10mL 4℃预冷的10%甘油悬浮菌体,4 ℃、5000r/min离心5min,弃去上清液。最后用1mL 4℃预冷的10%甘油悬浮,分装成每管70μL,-70℃保存。

5)根癌农杆菌的转化和培养

取1μL重组质粒pCAMBIA01,加到70μL根癌农杆菌AGL1感受态细胞中,混匀,吸取并加到间距0.2cm电转杯中,擦拭干净,调节电击电压为2.5kV,电击5ms。将电转化后的根癌农杆菌涂布于LB平板(含50μg/mL卡那霉素)上进行筛选。筛选得到的阳性克隆子在LB平板(含50μg/mL卡那霉素)上划线,28℃培养2d。挑取单菌落接种于5mL LB液体培养基(含50μg/mL卡那霉素)中,28℃、180r/min培养16~20h。取1mL根癌农杆菌菌液接种于含有相应抗性的100mL LB液体培养基中,28℃、180r/min培养至OD600为0.8左右时备用。

6)诱导培养和转化

根癌农杆菌的诱导培养:取4mL(OD600=0.8)的根癌农杆菌菌液5000r/min离心5min 收集菌体,用6mL含有400μmol/L乙酰丁香酮的IM培养基悬浮菌体,28℃悬浮培养5h。IM培养基:KH2PO4 1.45 g,K2HPO4 2.05g,NH4NO3 0.5g,CaCl2 0.01g,MgSO4·7H2O 0.6g,NaCl 0.3g,葡萄糖2g,甘油5g,1000mL水,盐酸调节pH 5.4。

转化:黑曲霉原生质悬液250μL,调节诱导后的根癌农杆菌菌液的浓度,按黑曲霉孢子与根癌农杆菌1:100的数量比例等体积混合均匀,涂布在转化媒介醋酸硝酸混合膜的IM固体培养基上。

7)转化子的筛选

涂布在转化媒介醋酸硝酸混合膜的IM固体培养基上的黑曲霉24℃避光培养48h,然后将孢子用无菌水稀释后涂到含有150μg/mL潮霉素B的平板上进行初筛,培养4d,长出的菌丝随后转接至200μg/mL潮霉素B的IM培养基进行复筛,获得转化成功的转化子。

(4)光诱导降低β-葡萄糖苷酶的表达活性

1)产酶培养

产酶培养基配制:麸皮10g,蛋白胨1g,牛肉膏1g,自来水1L,115℃灭菌30min。在250mL三角瓶中装入150mL液体产酶培养基。

在无菌操作台中,将黑曲霉菌种或筛选的转化子接入已灭菌的斜面PDA培养基中,置于30℃恒温培养箱中培养3d,得到斜面孢子。斜面孢子接入到产酶培养基中,接种量为 1×105孢子/mL,用牛皮纸包裹整个三角瓶,150r/m、30℃培养36h,培养液用滤纸过滤,测定滤液β-葡萄糖苷酶的酶活。出发菌株的酶活为22U/mL,所筛选转化子的酶活为21.0U/mL。

β-葡萄糖苷酶酶活测定按照文献(张莉,王婧,杨婷。产β-葡萄糖苷酶酿酒酵母菌株紫外诱变选育及酶学性质分析。《食品工业科技》,2015。)中的方法。

2)光调控产酶培养

用40W的蓝色荧光灯做蓝光光源,蓝色荧光灯通过蓝色滤膜(73#,由日本株式会社生产的截止性滤膜)照射三角瓶,蓝光最强波长为450nm,半高宽为50nm。

按照上述方法,将斜面孢子接种到产酶培养基后,不用牛皮纸包裹装有产酶培养基三角瓶,三角瓶置于置蓝色荧光灯正下方,垂直距离40cm,150r/m、30℃培养36h,培养液用滤纸过滤,测定滤液β-葡萄糖苷酶的酶活。出发菌株的酶活为23.1U/mL,所筛选转化子的酶活为8.1U/mL。

上述结果说明,在蓝光诱导下,光调控启动子启动了转化子的β-葡萄糖苷酶反义mRNA的转录,反义mRNA与β-葡萄糖苷酶mRNA的结合,抑制了β-葡萄糖苷酶mRNA的翻译,降低了转化子β-葡萄糖苷酶的翻译效率,从而降低了其表达量。

上述实施例为本发明较佳的实施方式,但本发明的实施方式并不受上述实施例的限制,其他的任何未背离本发明的精神实质与原理下所作的改变、修饰、替代、组合、简化,均应为等效的置换方式,都包含在本发明的保护范围之内。

SEQUENCE LISTING

<110> 湖北工业大学

<120> 一种光调控启动子降低黑曲霉β-葡萄糖苷酶表达酶活的方法

<130> 1

<160> 4

<170> PatentIn version 3.3

<210> 1

<211> 1430

<212> DNA

<213> Artificial

<220>

<223> 含光调控启动子的DNA序列

<400> 1

attggaatgc tacagacgct atatgtaccc cttctgttat gtacataaag taacatttca 60

catctggctc tcttatgcag cataaaaaaa gattgttctg cgctccaatt cggtccatgc 120

tgacatgagc gggaggtgcg cgtgagggtt gacaaaagtc gagaggtcta gctttcagct 180

ctcagatatt agattcttgg cgactgcgtc ctgctcccta ttaaatgctc accccttgat 240

cggaaaatca aacctgcctg cgcaattacc taactatcag ttttaaaggc actgtattct 300

attccaacca ggtatccacg tagctcccac cgggcctccc atcgctctcc gttcgctccg 360

cccactaagg agctaccagc atcccactag tactccattt ttgtgaatta acaatacaat 420

actaaactgg cgtcgtggga ctagagtaaa atagatatgg tgataacatt gtctagataa 480

ggataaaaaa aataatatat aaaaatatat aatatgatag tagaagtact tggaggctct 540

tgtctcttac tactgggcag gagagactta tatttggcag tagatcccgc tgcgattggt 600

tgttctacct ggttattctc ttgatttgat ggagcggaaa ggttgtttgg tcccagtact 660

tacgacatac catgtaataa taaatattat tggagaaaag ggtgggaggg gacaaaaggg 720

agttctttca tgcgccaggc agagcgaaag atggaggaac agaagacatt tgggggggct 780

ggtggtggga agaatcagca gacaccgtcc taatggctac ctcactggtc catggccgag 840

cgagagaccc tgaccaactt atgcgcgttt ggcttttccc gctcggaact acgtaaaaca 900

gggcaagaaa gtccgagcag cctgcagctg cttgcgcggt ttcagtattt gcagggataa 960

ctatcggctt atcttaacgt tgctcatgct atttattggt gggtgatgtc gagcaaccta 1020

agagctagat ggatcggacc tttttgcaac aggtatgaga tacatataag tcgactacac 1080

tacgctcgag cagactgcac tctcatttca ctagcaatgg ttgtccttat ctcggctggt 1140

ggtatcggct atttgcgcca tcgggagtat tcatttagct agtagtaaac cgcagtggct 1200

atagactata catcttctac cacgaatttc atgaaattac gatgcgctag tcaggaaggt 1260

ccatgacagt tccattgctg gatctctttc actattaaag ttattacacg gcgcgcctct 1320

ttccactact tttatctttg cctttatttc ttctctgaaa cgctttagta tgtcatccca 1380

tcaaaccagc cccagaggaa tgtcgtgtct tgcattgtgc tcatccgaca 1430

<210> 2

<211> 110

<212> DNA

<213> Artificial

<220>

<223> 表达与β-葡萄糖苷酶mRNA互补的反义mRNA的DNA序列

<400> 2

acagacacaa agaccggtaa agttgaggcg cgggatctcg gcaatgaagc cggagcagcc 60

agtcttcgag ctcactccag ccgtgagatt gaccttttcg tcgtccgtca 110

<210> 3

<211> 214

<212> DNA

<213> Artificial

<220>

<223> 终止子序列

<400> 3

cgacaagctc gacctcgagt ttctccataa taatgtgtga gtagttccca gataagggaa 60

ttagggttcc tatagggttt cgctcatgtg ttgagcatat aagaaaccct tagtatgtat 120

ttgtatttgt aaaatacttc tatcaataaa atttctaatt cctaaaacca aaatccagta 180

ctaaaatcca gatcccccga attaattcgg cgtt 214

<210> 4

<211> 1770

<212> DNA

<213> Artificial

<220>

<223> DNA序列1

<400> 4

ggggtaccat tggaatgcta cagacgctat atgtacccct tctgttatgt acataaagta 60

acatttcaca tctggctctc ttatgcagca taaaaaaaga ttgttctgcg ctccaattcg 120

gtccatgctg acatgagcgg gaggtgcgcg tgagggttga caaaagtcga gaggtctagc 180

tttcagctct cagatattag attcttggcg actgcgtcct gctccctatt aaatgctcac 240

cccttgatcg gaaaatcaaa cctgcctgcg caattaccta actatcagtt ttaaaggcac 300

tgtattctat tccaaccagg tatccacgta gctcccaccg ggcctcccat cgctctccgt 360

tcgctccgcc cactaaggag ctaccagcat cccactagta ctccattttt gtgaattaac 420

aatacaatac taaactggcg tcgtgggact agagtaaaat agatatggtg ataacattgt 480

ctagataagg ataaaaaaaa taatatataa aaatatataa tatgatagta gaagtacttg 540

gaggctcttg tctcttacta ctgggcagga gagacttata tttggcagta gatcccgctg 600

cgattggttg ttctacctgg ttattctctt gatttgatgg agcggaaagg ttgtttggtc 660

ccagtactta cgacatacca tgtaataata aatattattg gagaaaaggg tgggagggga 720

caaaagggag ttctttcatg cgccaggcag agcgaaagat ggaggaacag aagacatttg 780

ggggggctgg tggtgggaag aatcagcaga caccgtccta atggctacct cactggtcca 840

tggccgagcg agagaccctg accaacttat gcgcgtttgg cttttcccgc tcggaactac 900

gtaaaacagg gcaagaaagt ccgagcagcc tgcagctgct tgcgcggttt cagtatttgc 960

agggataact atcggcttat cttaacgttg ctcatgctat ttattggtgg gtgatgtcga 1020

gcaacctaag agctagatgg atcggacctt tttgcaacag gtatgagata catataagtc 1080

gactacacta cgctcgagca gactgcactc tcatttcact agcaatggtt gtccttatct 1140

cggctggtgg tatcggctat ttgcgccatc gggagtattc atttagctag tagtaaaccg 1200

cagtggctat agactataca tcttctacca cgaatttcat gaaattacga tgcgctagtc 1260

aggaaggtcc atgacagttc cattgctgga tctctttcac tattaaagtt attacacggc 1320

gcgcctcttt ccactacttt tatctttgcc tttatttctt ctctgaaacg ctttagtatg 1380

tcatcccatc aaaccagccc cagaggaatg tcgtgtcttg cattgtgctc atccgacaac 1440

agacacaaag accggtaaag ttgaggcgcg ggatctcggc aatgaagccg gagcagccag 1500

tcttcgagct cactccagcc gtgagattga ccttttcgtc gtccgtcacg acaagctcga 1560

cctcgagttt ctccataata atgtgtgagt agttcccaga taagggaatt agggttccta 1620

tagggtttcg ctcatgtgtt gagcatataa gaaaccctta gtatgtattt gtatttgtaa 1680

aatacttcta tcaataaaat ttctaattcc taaaaccaaa atccagtact aaaatccaga 1740

tcccccgaat taattcggcg ttgaattcgg 1770

当前第1页1 2 3 
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1