一种基于ACACB基因鉴定奶牛产奶性状的方法及其应用与流程

文档序号:12545119阅读:来源:国知局

技术特征:

1.检测牛基因组17号染色体上第66218726位脱氧核糖核苷酸和/或第66218117位脱氧核糖核苷酸和/或第66199005位脱氧核糖核苷酸和/或第66167817位脱氧核糖核苷酸和/或第66102564位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质在鉴定或辅助鉴定牛个体产奶性状中的应用;

或检测牛基因组17号染色体上第66218726位脱氧核糖核苷酸和/或第66218117位脱氧核糖核苷酸和/或第66199005位脱氧核糖核苷酸和/或第66167817位脱氧核糖核苷酸和/或第66102564位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定牛个体产奶性状的产品中的应用;

所述产奶性状为305天产奶量和/或乳脂量和/或乳脂率和/或乳蛋白量和/或乳蛋白率。

2.检测牛基因组17号染色体上第66218726位脱氧核糖核苷酸和/或第66218117位脱氧核糖核苷酸和/或第66199005位脱氧核糖核苷酸和/或第66167817位脱氧核糖核苷酸和/或第66102564位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质在牛育种中的应用;

或检测牛基因组17号染色体上第66218726位脱氧核糖核苷酸和/或第66218117位脱氧核糖核苷酸和/或第66199005位脱氧核糖核苷酸和/或第66167817位脱氧核糖核苷酸和/或第66102564位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质在制备牛育种的产品中的应用。

3.检测牛基因组17号染色体上第66218726位脱氧核糖核苷酸和/或第66218117位脱氧核糖核苷酸和/或第66199005位脱氧核糖核苷酸和/或第66167817位脱氧核糖核苷酸和/或第66102564位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质在选育305天产奶量高和/或乳脂量高和/或乳脂率高和/或乳蛋白量高和/或乳蛋白率高的牛中的应用;

或检测牛基因组17号染色体上第66218726位脱氧核糖核苷酸和/或第66218117位脱氧核糖核苷酸和/或第66199005位脱氧核糖核苷酸和/或第66167817位脱氧核糖核苷酸和/或第66102564位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质在制备选育305天产奶量高和/或乳脂量高和/或乳脂率高和/或乳蛋白量高和/或乳蛋白率高的牛的产品中的应用。

4.根据权利要求1-3中任一所述的应用,其特征在于:

所述检测牛基因组17号染色体上第66218726位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质为如下1)或2):

1)由序列表中序列1所示的单链DNA分子和序列表中序列2所示的单链DNA分子组成的引物对A;

2)由序列A所示的单链DNA分子和序列B所示的单链DNA分子组成的引物对B;

所述序列A为将序列1删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列1具有相同功能的核苷酸;

所述序列B为将序列2删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列2具有相同功能的核苷酸;

或所述检测牛基因组17号染色体上第66218117位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质为如下3)或4):

3)由序列表中序列3所示的单链DNA分子和序列表中序列4所示的单链DNA分子组成的引物对C;

4)由序列C所示的单链DNA分子和序列D所示的单链DNA分子组成的引物对D;

所述序列C为将序列3删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列3具有相同功能的核苷酸;

所述序列D为将序列4删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列4具有相同功能的核苷酸;

或所述检测牛基因组17号染色体上第66199005位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质为如下5)或6):

5)由序列表中序列5所示的单链DNA分子和序列表中序列6所示的单链DNA分子组成的引物对E;

6)由序列E所示的单链DNA分子和序列F所示的单链DNA分子组成的引物对F;

所述序列E为将序列5删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列5具有相同功能的核苷酸;

所述序列F为将序列6删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列6具有相同功能的核苷酸;

或所述检测牛基因组17号染色体上第66167817位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质为如下7)或8):

7)由序列表中序列7所示的单链DNA分子和序列表中序列8所示的单链DNA分子组成的引物对G;

8)由序列G所示的单链DNA分子和序列H所示的单链DNA分子组成的引物对H;

所述序列G为将序列7删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列7具有相同功能的核苷酸;

所述序列H为将序列8删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列8具有相同功能的核苷酸;

或所述检测牛基因组17号染色体上第66102564位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质为如下为如下9)或10):

9)由序列表中序列9所示的单链DNA分子和序列表中序列10所示的单链DNA分子组成的引物对I;

10)由序列I所示的单链DNA分子和序列J所示的单链DNA分子组成的引物对J;

所述序列I为将序列9删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列9具有相同功能的核苷酸;

所述序列J为将序列10删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列10具有相同功能的核苷酸。

5.一种鉴定或辅助鉴定牛产奶性状的方法,为如下(1)和/或(2)和/或(3)和/或(4)和/或(5):

(1)是检测牛个体的基因型是TT基因型还是CC基因型还是TC基因型,根据所述牛个体的基因型确定所述牛个体在第一泌乳期和第二泌乳期的305天产奶量和/或乳脂量和/或乳脂率和/或乳蛋白量:

CC基因型的牛个体在第一泌乳期的305天产奶量和乳蛋白量高于TT基因型的牛个体,TT基因型的牛个体在第一泌乳期的305天产奶量和乳蛋白量高于TC基因型的牛个体;TT基因型的牛个体在第一泌乳期的乳脂量和乳脂率高于TC基因型的牛个体,TC基因型的牛个体在第一泌乳期的乳脂量和乳脂率高于CC基因型的牛个体;

TT基因型的牛个体在第二泌乳期的305天产奶量和乳脂量高于CC基因型的牛个体,CC基因型的牛个体在第二泌乳期的305天产奶量和乳脂量高于TC基因型的牛个体;TT基因型的牛个体在第二泌乳期的乳脂率和乳蛋白量高于TC基因型的牛个体,TC基因型的牛个体在第二泌乳期的乳脂率和乳蛋白量高于CC基因型的牛个体;

所述TT基因型为牛基因组17号染色体上第66218726个核苷酸位点的碱基均为T的纯合体;

所述CC基因型为牛基因组17号染色体上第66218726个核苷酸位点的碱基均为C的纯合体;

所述TC基因型为牛基因组17号染色体上第66218726个核苷酸位点的碱基为T和C的杂合体;

(2)是检测牛个体的基因型是GG基因型还是AA基因型还是GA基因型,根据所述牛个体的基因型确定所述牛个体在第一泌乳期和第二泌乳期的305天产奶量和/或乳脂量和/或乳脂率和/或乳蛋白量:

AA基因型的牛个体在第一泌乳期的305天产奶量高于GG基因型的牛个体,GG基因型的牛个体在第一泌乳期的305天产奶量高于GA基因型的牛个体;GG基因型的牛个体在第一泌乳期的乳脂量高于AA基因型的牛个体,AA基因型的牛个体在第一泌乳期的乳脂量高于GA基因型的牛个体;GG基因型的牛个体在第一泌乳期的乳脂率高于GA基因型的牛个体,GA基因型的牛个体在第一泌乳期的乳脂率高于AA基因型的牛个体;

GG基因型的牛个体在第二泌乳期的305天产奶量、乳脂量和乳蛋白量高于AA基因型的牛个体,AA基因型的牛个体在第二泌乳期的305天产奶量、乳脂量和乳蛋白量高于GA基因型的牛个体;

所述GG基因型为牛基因组17号染色体上第66218117个核苷酸位点的碱基均为T的纯合体;

所述AA基因型为牛基因组17号染色体上第66218117个核苷酸位点的碱基均为C的纯合体;

所述GA基因型为牛基因组17号染色体上第66218117个核苷酸位点的碱基为G和A的杂合体;

(3)是检测牛个体的基因型是GG基因型还是AA基因型还是GA基因型,根据所述牛个体的基因型确定所述牛个体在第一泌乳期和第二泌乳期的305天产奶量和/或乳脂量和/或乳脂率和/或乳蛋白量:

GG基因型的牛个体在第一泌乳期的乳脂量和乳脂率高于GA基因型的牛个体,GA基因型的牛个体在第一泌乳期的乳脂量和乳脂率高于AA基因型的牛个体;

GA基因型的牛个体在第二泌乳期的305天产奶量和乳蛋白量高于GG基因型的牛个体,GG基因型的牛个体在第二泌乳期的305天产奶量和乳蛋白量高于AA基因型的牛个体;GG基因型的牛个体在第二泌乳期的乳脂量高于GA基因型的牛个体,GA基因型的牛个体在第二泌乳期的乳脂量高于AA基因型的牛个体;

所述GG基因型为牛基因组17号染色体上第66199005个核苷酸位点的碱基均为T的纯合体;

所述AA基因型为牛基因组17号染色体上第66199005个核苷酸位点的碱基均为C的纯合体;

所述GA基因型为牛基因组17号染色体上第66199005个核苷酸位点的碱基为G和A的杂合体;

(4)是检测牛个体的基因型是AA基因型还是GG基因型还是AG基因型,根据所述牛个体的基因型确定所述牛个体在第一泌乳期和第二泌乳期的305天产奶量和/或乳脂量和/或乳蛋白量和/或乳蛋白率:

AG基因型的牛个体在第一泌乳期的乳脂量和乳蛋白量高于GG基因型的牛个体,GG基因型的牛个体在第一泌乳期的乳脂量和乳蛋白量高于AA基因型的牛个体;

GG基因型的牛个体在第二泌乳期的305天产奶量、乳脂量、乳蛋白量和乳蛋白率高于AG基因型的牛个体,AG基因型的牛个体在第二泌乳期的305天产奶量、乳脂量、乳蛋白量和乳蛋白率高于AA基因型的牛个体;

所述GG基因型为牛基因组17号染色体上第66167817个核苷酸位点的碱基均为T的纯合体;

所述AA基因型为牛基因组17号染色体上第66167817个核苷酸位点的碱基均为C的纯合体;

所述AG基因型为牛基因组17号染色体上第66167817个核苷酸位点的碱基为A和G的杂合体;

(5)是检测牛个体的基因型是AA基因型还是GG基因型还是AG基因型,根据所述牛个体的基因型确定所述牛个体在第一泌乳期和第二泌乳期的305天产奶量和/或乳脂量和/或乳脂率和/或乳蛋白量:

AG基因型的牛个体在第一泌乳期的305天产奶量高于AA基因型的牛个体,AA基因型的牛个体在第一泌乳期的305天产奶量高于GG基因型的牛个体;GG基因型的牛个体在第一泌乳期的乳脂率高于AG基因型的牛个体,AG基因型的牛个体在第一泌乳期的乳脂率高于AA基因型的牛个体;AG基因型的牛个体在第一泌乳期的乳蛋白量高于GG基因型的牛个体,GG基因型的牛个体在第一泌乳期的乳蛋白量高于AA基因型的牛个体;

GG基因型的牛个体在第二泌乳期的305天产奶量和乳蛋白量高于AA基因型的牛个体,AA基因型的牛个体在第二泌乳期的305天产奶量和乳蛋白量高于AG基因型的牛个体;GG基因型的牛个体在第二泌乳期的乳脂量高于AG基因型的牛个体,AG基因型的牛个体在第二泌乳期的乳脂量高于AA基因型的牛个体;

所述GG基因型为牛基因组17号染色体上第66102564个核苷酸位点的碱基均为T的纯合体;

所述AA基因型为牛基因组17号染色体上第66102564个核苷酸位点的碱基均为C的纯合体;

所述AG基因型为牛基因组17号染色体上第66102564个核苷酸位点的碱基为A和G的杂合体。

6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于:

所述(1)中,所述检测牛个体的基因型是TT基因型还是CC基因型还是TC基因型的方法为如下A)或B):

A)直接测序;

B)测序含有牛基因组17号染色体上第66218726个核苷酸的PCR扩增产物;

所述(2)中,所述检测牛个体的基因型是GG基因型还是AA基因型还是GA基因型的方法为如下C)或D):

C)直接测序;

D)测序含有牛基因组17号染色体上第66218117个核苷酸的PCR扩增产物;

所述(3)中,所述检测牛个体的基因型是GG基因型还是AA基因型还是GA基因型的方法为如下E)或F):

E)直接测序;

F)测序含有牛基因组17号染色体上第66199005个核苷酸的PCR扩增产物;

所述(4)中,所述检测牛个体的基因型是AA基因型还是GG基因型还是AG基因型的方法为如下G)或H):

G)直接测序;

H)测序含有牛基因组17号染色体上第66167817个核苷酸的PCR扩增产物;

所述(5)中,所述检测牛个体的基因型是AA基因型还是GG基因型还是AG基因型的方法为如下I)或J):

I)直接测序;

J)测序含有牛基因组17号染色体上第66102564个核苷酸的PCR扩增产物;

7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于:

所述B)中的PCR扩增产物所用的引物为如下1)或2):

1)由序列表中序列1所示的单链DNA分子和序列表中序列2所示的单链DNA分子组成的引物对A;

2)由序列A所示的单链DNA分子和序列B所示的单链DNA分子组成的引物对B;

所述序列A为将序列1删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列1具有相同功能的核苷酸;

所述序列B为将序列2删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列2具有相同功能的核苷酸;

所述D)中的PCR扩增产物所用的引物为如下3)或4):

3)由序列表中序列3所示的单链DNA分子和序列表中序列4所示的单链DNA分子组成的引物对C;

4)由序列C所示的单链DNA分子和序列D所示的单链DNA分子组成的引物对D;

所述序列C为将序列3删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列3具有相同功能的核苷酸;

所述序列D为将序列4删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列4具有相同功能的核苷酸。

所述F)中的PCR扩增产物所用的引物为如下5)或6):

5)由序列表中序列5所示的单链DNA分子和序列表中序列6所示的单链DNA分子组成的引物对E;

6)由序列E所示的单链DNA分子和序列F所示的单链DNA分子组成的引物对F;

所述序列E为将序列5删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列5具有相同功能的核苷酸;

所述序列F为将序列6删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列6具有相同功能的核苷酸。

所述H)中的PCR扩增产物所用的引物为如下7)或8):

7)由序列表中序列7所示的单链DNA分子和序列表中序列8所示的单链DNA分子组成的引物对G;

8)由序列G所示的单链DNA分子和序列H所示的单链DNA分子组成的引物对H;

所述序列G为将序列7删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列7具有相同功能的核苷酸;

所述序列H为将序列8删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列8具有相同功能的核苷酸。

所述J)中的PCR扩增产物所用的引物为如下9)或10):

9)由序列表中序列9所示的单链DNA分子和序列表中序列10所示的单链DNA分子组成的引物对I;

10)由序列I所示的单链DNA分子和序列J所示的单链DNA分子组成的引物对J;

所述序列I为将序列9删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列9具有相同功能的核苷酸;

所述序列J为将序列10删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列10具有相同功能的核苷酸。

8.一种鉴定或辅助鉴定牛产奶性状的产品,为检测牛基因组17号染色体上第66218726位脱氧核糖核苷酸和/或第66218117位脱氧核糖核苷酸和/或第66199005位脱氧核糖核苷酸和/或第66167817位脱氧核糖核苷酸和/或第66102564位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质。

9.根据权利要求8所述的产品,其特征在于:

所述检测牛基因组17号染色体上第66218726位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质为如下1)或2):

1)由序列表中序列1所示的单链DNA分子和序列表中序列2所示的单链DNA分子组成的引物对A;

2)由序列A所示的单链DNA分子和序列B所示的单链DNA分子组成的引物对B;

所述序列A为将序列1删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列1具有相同功能的核苷酸;

所述序列B为将序列2删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列2具有相同功能的核苷酸;

或所述检测牛基因组17号染色体上第66218117位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质为如下3)或4):

3)由序列表中序列3所示的单链DNA分子和序列表中序列4所示的单链DNA分子组成的引物对C;

4)由序列C所示的单链DNA分子和序列D所示的单链DNA分子组成的引物对D;

所述序列C为将序列3删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列3具有相同功能的核苷酸;

所述序列D为将序列4删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列4具有相同功能的核苷酸;

或所述检测牛基因组17号染色体上第66199005位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质为如下5)或6):

5)由序列表中序列5所示的单链DNA分子和序列表中序列6所示的单链DNA分子组成的引物对E;

6)由序列E所示的单链DNA分子和序列F所示的单链DNA分子组成的引物对F;

所述序列E为将序列5删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列5具有相同功能的核苷酸;

所述序列F为将序列6删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列6具有相同功能的核苷酸;

或所述检测牛基因组17号染色体上第66167817位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质为如下7)或8):

7)由序列表中序列7所示的单链DNA分子和序列表中序列8所示的单链DNA分子组成的引物对G;

8)由序列G所示的单链DNA分子和序列H所示的单链DNA分子组成的引物对H;

所述序列G为将序列7删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列7具有相同功能的核苷酸;

所述序列H为将序列8删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列8具有相同功能的核苷酸;

或所述检测牛基因组17号染色体上第66102564位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质为如下为如下9)或10):

9)由序列表中序列9所示的单链DNA分子和序列表中序列10所示的单链DNA分子组成的引物对I;

10)由序列I所示的单链DNA分子和序列J所示的单链DNA分子组成的引物对J;

所述序列I为将序列9删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列9具有相同功能的核苷酸;

所述序列J为将序列10删除或增加或改变一个或几个核苷酸,且与序列10具有相同功能的核苷酸。

10.根据权利要求1-4中任一所述的应用或权利要求5-7中任一所述的方法或权利要求8或9所述的产品,其特征在于:所述牛为奶牛。

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