一种鉴定香港牡蛎、熊本牡蛎及其杂交子一代的EST-SSR引物和鉴定方法与流程

文档序号:14827974发布日期:2018-06-30 09:14阅读:来源:国知局
一种鉴定香港牡蛎、熊本牡蛎及其杂交子一代的EST-SSR引物和鉴定方法与流程

技术特征:

1.鉴定香港牡蛎、熊本牡蛎及其杂交子一代的EST-SSR引物Ch513,其特征在于,所述的EST-SSR引物Ch513为:

F:5’-CTGGAATCGGTATGTCTT-3’;

R:5’-GTTACGTGCACCCTAAAT-3’。

2.一种鉴定香港牡蛎、熊本牡蛎及其杂交子一代的试剂盒,其特征在于,含有权利要求1所述的EST-SSR引物Ch513。

3.一种香港牡蛎、熊本牡蛎及其杂交子一代的鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:

提取待测牡蛎样品的基因组DNA,然后用权利要求1所述的EST-SSR引物Ch513进行PCR扩增,将扩增产物进行电泳和染色,若在260bp~290bp区间内出现1~2条条带,则待测牡蛎样品为香港牡蛎,出现1条条带说明该个体为纯合子,出现2条条带则说明该个体为杂合子;若在230bp~250bp区间内出现1~2条条带,则待测牡蛎样品为熊本牡蛎,出现1条条带说明该个体为纯合子,出现2条条带则说明该个体为杂合子;当同时在260bp~290bp区间和230bp~250bp区间内各出现1条带,则待测牡蛎样品为香港牡蛎与熊本牡蛎杂交子一代。

4.根据权利要求3所述的鉴定方法,其特征在于,所述的用EST-SSR引物Ch513进行PCR扩增,其PCR扩增体系为:25μL,其中各种成分及终浓度分别为:DNA模板50ng,Buffer 10mM,引物各0.2mM,dNTP 0.2mM,Mg2+2.0mM,Taq DNA聚合酶1U,用灭菌水补足25μL。

5.根据权利要求3所述的鉴定方法,其特征在于,所述的用EST-SSR引物Ch513进行PCR扩增,其PCR反应程序为:94℃预变性5min;94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸1min,重复30次;72℃延伸10min。

6.根据权利要求3所述的鉴定方法,其特征在于,所述的将扩增产物进行电泳和染色,是将扩增产物经8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,220V稳压电泳4小时,然后用0.1%AgNO3溶液染色10min,银染后用2%NaOH、0.4%甲醛、0.2%NaS2O3、dH2O 1000mL显色,至条带清晰为止。

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