本发明涉及试剂盒领域,具体为一种肺癌诊断试剂盒及检测方法。
背景技术:
1、肺癌是起源于肺部支气管黏膜或腺体的恶性肿瘤,发病率和死亡率增长最快,对人群健康和生命威胁最大的恶性肿瘤之一。
2、现有技术中,诊断试剂盒是指能对人体体液、血液等反映人体健康状况的物质作出定性、定量的检测;目前肺癌试剂盒通常使用荧光定量pcr法进行检测,其中包含重亚硫酸盐修饰。
3、但是,现有的试剂盒主要存在检测的灵敏度和特异性较低的问题,还有就是也有取样不方便的问题。
技术实现思路
1、本发明的目的在于提供一种肺癌诊断试剂盒及检测方法,以解决上述背景技术中提出的问题。
2、为实现上述目的,本发明提供如下技术方案:一种肺癌诊断试剂盒,包括用于检测肺组织内基因的甲基化水平的试剂。
3、优选的,所述肺组织内基因为:cycs、loc283585、znf316、
4、theg5、mir1233-1、loc102724050中的1~6个。
5、优选的,所述用于检测肺组织内基因的甲基化水平的试剂包括检测肺组织内基因cycs、loc283585、znf316、theg5、
6、mir1233-1、loc102724050中的任意1~6个的甲基化水平的试剂。
7、优选的,所述甲基化水平的试剂包括重亚硫酸盐试剂、测序建库试剂和pcr扩增试剂。
8、优选的,所述pcr扩增试剂包括引物对。
9、优选的,所述甲基化水平的试剂包括甲基化特异性pcr试剂、甲基化敏感性单核苷酸引物延伸试剂、甲基化敏感性单链构象分析试剂或甲基化敏感性变性梯度凝胶电泳试剂。
10、一种肺癌诊断试剂盒检测方法,所述检测方法包括以下步骤:
11、对已确诊为良性肺疾病或肺癌患者肺组织内基因cycs、loc283585、znf316、theg5、mir1233-1、loc102724050甲基化水平进行机器学习训练;
12、得到区分良性肺疾病和肺癌患者的二分类模型;
13、将待检测患者的肺组织内基因cycs、loc283585、znf316、theg5、mir1233-1、loc102724050甲基化水平输入前述二分类模型,得出患者为良性肺疾病或肺癌患者的诊断结果。
14、优选的,机器学习训练为采用lasso回归模型进行训练。
15、与现有技术相比,本发明的有益效果是:
16、本发明提出的肺癌诊断试剂盒及检测方法采用肺癌和良性肺疾病患者的肺组织内基因cycs、loc283585、znf316、theg5、mir1233-1、loc102724050甲基化水平存在显著差异,将这6个基因的甲基化水平通过机器学习训练,即可得到可区分肺癌和良性肺疾病的二分类模型,进而实现肺癌和良性肺疾病的准确辨别。
1.一种肺癌诊断试剂盒,其特征在于:包括用于检测肺组织内基因的甲基化水平的试剂。
2.根据权利要求1所述的一种肺癌诊断试剂盒,其特征在于:所述肺组织内基因为:cycs、loc283585、znf316、theg5、mir1233-1、loc102724050中的1~6个。
3.根据权利要求1所述的一种肺癌诊断试剂盒,其特征在于:所述用于检测肺组织内基因的甲基化水平的试剂包括检测肺组织内基因cycs、loc283585、znf316、theg5、mir1233-1、loc102724050中的任意1~6个的甲基化水平的试剂。
4.根据权利要求3所述的一种肺癌诊断试剂盒,其特征在于:所述甲基化水平的试剂包括重亚硫酸盐试剂、测序建库试剂和pcr扩增试剂。
5.根据权利要求4所述的一种肺癌诊断试剂盒,其特征在于:所述pcr扩增试剂包括引物对。
6.根据权利要求3所述的一种肺癌诊断试剂盒,其特征在于:所述甲基化水平的试剂包括甲基化特异性pcr试剂、甲基化敏感性单核苷酸引物延伸试剂、甲基化敏感性单链构象分析试剂或甲基化敏感性变性梯度凝胶电泳试剂。
7.一种肺癌诊断试剂盒检测方法,其特征在于:所述检测方法包括以下步骤:
8.根据权利要求7所述的一种肺癌诊断试剂盒检测方法,其特征在于:机器学习训练为采用lasso回归模型进行训练。