本发明涉及分子生物学,尤其涉及一组与南疆绵羊抗病力有关的基因及其筛选方法与应用。
背景技术:
1、目前,有文献报道南疆现存绵羊品种12个,包括和田羊、多浪羊、策勒黑羊、塔什库尔干羊、柯尔克孜羊、叶城羊、巴尔楚克羊、罗布羊、巴者布鲁克羊、卡拉库尔羊、洛普羊、诺维什羊。这些绵羊品种的生产性状主要包括肉、毛、皮、抗病、抗逆性等,其中有以生产地毯毛为主的和田羊;以产肉为主的多浪羊、巴音布鲁克羊等;以生产羔皮为主的卡拉库尔羊、策勒黑羊等。它们具有抗逆性好、抗病力强、耐粗饲、耐远牧等优良特点,并能适应南疆荒漠化环境,是我国独特的优势绵羊资源群体。鉴于家畜的体型外貌特征(体尺、外形特征等)与当地生态环境密切相关,在个别地域甚至起着重要作用,比如南疆的地方绵羊品种,通过查阅大量的相关文献可知,该地区牧民根据当地生产实践的需要所选育的绵羊品种对该地区的生活环境及气候有较强的适应性,从而使得南疆地方绵羊品种的抗病性和抗逆性都较强。而引入的绵羊品种的抗病性和抗逆性就相对较差,容易得病。
2、寻找和发掘与南疆地方绵羊品种抗病性相关的基因,以期为今后引种和选育具有较强抗病性品种提供理论基础。从而提高当地养殖户的经济效益和当地的畜牧生产力水平。但是现有技术公开的用于研究与绵羊抗病性相关的抗病基因相对较少,并未发现哪种基因与绵羊的抗病有关。
技术实现思路
1、本发明的目的在于提供一组与南疆绵羊抗病力有关的基因及其筛选方法与应用。
2、为了实现上述发明目的,本发明提供以下技术方案:
3、本发明提供了一组与南疆绵羊抗病力有关的基因,所述基因包括如下42种的一种或多种;
4、分别为cd68、dvl2、alox12b、ybx2、thada、arnt2、rptor、pdzd8、pim1、abcc10、rasgrf2、bcas3、smyd3、polk、pibf1、atp2b2、duox2、emilin1、ripk1、glrx3、elp2、pcsk2、pdss2、pebp4、irak3、lipt2、alox12、spa17、cdkl1、slc25a26、ttc36、rab3ip、dlgap1、tax1bp1、cyp2e1、pcdh1、slc1a2、rnf19b、pax4、rbfox1、vps4a、dcdc2。
5、本发明还提供了所述的基因的筛选方法,包括如下步骤:
6、(1)提取绵羊组织的dna,制备绵羊基因组芯片,并输出数据。
7、(2)对输出的数据进行筛选和整合,之后利用fst法对绵羊进行群体间选择信号分析,并进行基因注释;
8、步骤(1)所述的绵羊为本地绵羊品种和引入绵羊品种。
9、作为优选,所述绵羊组织为绵羊耳部组织;
10、绵羊组织的dna的浓度≥50ng/μl;
11、绵羊组织的dna的纯度od260/od280为1.7~2.0,od260/od230为1.8~2.1。
12、作为优选,步骤(2)所述筛选的软件为genomestudio;
13、所述整合的软件为plink。
14、作为优选,所述进行基因注释时依据的数据库为ncbi和csiro。
15、本发明还提供了所述的基因在制备具有提高南疆绵羊抗病力的遗传育种中的应用。
16、本发明还提供了所述的筛选方法筛选得到的基因在提高制备具有提高南疆绵羊抗病力的遗传育种中的应用。
17、本发明提供了一组与南疆绵羊抗病力有关的基因及其筛选方法与应用。按照本发明的方法可以筛选得到与南疆地区绵羊品种抗病相关的基因,这些基因为以后选育南疆地区绵羊的引种和选育种抗病性较强的品系提供理论基础,从而提高养殖户的经济效益和畜牧业的生产力水平,为后期绵羊的抗病育种提供依据。
1.一组与南疆绵羊抗病力有关的基因,其特征在于,所述基因包括如下42种的一种或多种;
2.权利要求1所述的基因的筛选方法,其特征在于,包括如下步骤:
3.根据权利要求2所述的筛选方法,其特征在于,所述绵羊组织为绵羊耳部组织;
4.根据权利要求3所述的筛选方法,其特征在于,步骤(2)所述筛选的软件为genomestudio;
5.根据权利要求5所述的筛选方法,其特征在于,所述进行基因注释时依据的数据库为ncbi和csiro。
6.权利要求1所述的基因在制备具有提高南疆绵羊抗病力的遗传育种中的应用。
7.权利要求2~5任意一项所述的筛选方法筛选得到的基因在提高制备具有提高南疆绵羊抗病力的遗传育种中的应用。