lncRNA在调节牛传染性鼻气管炎病毒复制中的用途

本发明属于生物医药领域，具体涉及lncrna在调节牛传染性鼻气管炎病毒复制中的用途。

背景技术：

1、长链非编码rna(long non-coding rna，lncrna)是一种长度超过200个核苷酸的非编码rna。它主要分布在细胞质，细胞核和外泌体中，结构类似于信使rna，缺乏开放阅读编码框架。lncrna可通过rna聚合酶ii或ⅲ转录，其转录具有细胞特异性，组织特异性和阶段特异性，且在不同的生物过程中有不同的作用，具有5′端帽子且有或无poly(a)尾巴。它们通常并不编码蛋白，但是通过rna的方式如表观遗传调控，转录调控，转录后调控等多种形式参与基因调控。

2、牛传染性鼻气管炎病毒(infectious bovine rhinotracheitis virus，ibrv)，又称牛疱疹病毒i型(bhv-1)，是疱疹病毒科、疱疹病毒亚科、水疱病毒属的成员。病毒为双股dna，有囊膜，直径约130-180nm。牛传染性鼻气管炎(infectious bovinerhinotracheitis，ibr)，又称坏死性鼻炎、红鼻病，是由bhv-1引起的一种牛呼吸道接触性传染病。临床表现形式多样，以呼吸道为主，伴有结膜炎、流产、乳腺炎，有时诱发小牛脑炎等。急性ibrv呼吸道感染还可以继发细菌性肺炎。此病目前在世界范围内流行，对乳牛的产奶量、公牛的繁殖力及役用牛的使役力均有较大影响。

3、因此，详细解析出具有调节ibrv复制功能的宿主lncrna，对于防治牛传染性支气管炎病具有重要意义。

技术实现思路

1、为弥补现有技术的不足，本发明提供了lncrna在调节牛传染性鼻气管炎病毒复制中的用途。

2、为实现上述目的，本发明采用如下技术方案：

3、本发明的第一方面提供了一种lncrna，所述lncrna具有如下所述的核苷酸序列：

4、(1)seq id no:1所示的核苷酸序列；

5、(2)在seq id no:1所示核苷酸序列基础上经替换、缺失或添加一个或几个核苷酸形成的具有同等功能的核苷酸序列。

6、本发明的第二方面提供了如下任一种物质：

7、(1)包括本发明第一方面所述的lncrna的载体；

8、(2)包括本发明第一方面所述的lncrna或(1)中所述的载体的宿主细胞。

9、进一步，所述载体还包括至少一个启动子。

10、本发明的第三方面提供了检测本发明第一方面所述的lncrna表达水平的试剂在制备诊断牛传染性鼻气管炎病毒感染的产品中的应用。

11、进一步，所述试剂选自特异性识别所述lncrna的探针、特异性扩增所述lncrna的引物。

12、进一步，所述特异性扩增所述lncrna的引物的序列如seq id no:2-3所示。

13、进一步，所述试剂还包括可检测标记。

14、本发明的第四方面提供了一种诊断牛传染性鼻气管炎病毒感染的产品，所述产品包括能够检测本发明第一方面所述的lncrna表达水平的试剂。

15、进一步，所述产品还包括通过rt-pcr法、qrt-pcr法检测所述lncrna表达水平所需的试剂。

16、进一步，所述产品包括芯片、试剂盒或核酸膜条。

17、本发明的第五方面提供了一种用于治疗牛传染性鼻气管炎病毒感染相关疾病的药物组合物，所述药物组合物包括本发明第一方面所述的lncrna的抑制剂。

18、进一步，所述抑制剂包括核酸分子、小分子化学药、核酸构建体。

19、进一步，所述核酸分子包括sirna、shrna、dsrna、核酶、反义寡核苷酸。

20、进一步，所述抑制剂选自sirna。

21、进一步，所述sirna的序列选自seq id no:6-11中的一种或几种。

22、进一步，所述牛传染性鼻气管炎病毒感染相关疾病为牛传染性鼻气管炎。

23、本发明的第六方面提供了本发明第一方面所述的lncrna的抑制剂在制备治疗牛传染性鼻气管炎病毒感染相关疾病的药物组合物中的应用。

24、进一步，所述药物组合物还包括药学上可接受的载体。

25、进一步，所述牛传染性鼻气管炎病毒感染相关疾病为牛传染性鼻气管炎。

26、本发明的第七方面提供了一种筛选治疗牛传染性鼻气管炎病毒感染相关疾病的候选物质的方法，所述方法包括：

27、1)使测试物质与表达本发明第一方面所述的lncrna基因的培养体系接触；并

28、2)选择与在该测试物质不存在时检测到的表达水平相比降低所述的lncrna基因的表达水平的测试物质。

29、进一步，所述牛传染性鼻气管炎病毒感染相关疾病为牛传染性鼻气管炎。

30、本发明的第八方面提供了本发明第一方面所述的lncrna在筛选治疗牛传染性鼻气管炎病毒感染相关疾病的候选物质中的应用。

31、进一步，所述牛传染性鼻气管炎病毒感染相关疾病为牛传染性鼻气管炎。

32、本发明的第九方面提供了一种体外调节牛传染性鼻气管炎病毒复制的方法，所述方法包括施用本发明第一方面所述的lncrna的抑制剂。

33、进一步，lncrna的抑制剂通过调节糖蛋白的水平调节牛传染性鼻气管炎病毒复制。

34、进一步，所述糖蛋白包括gb和/或gd蛋白。

35、进一步，所述抑制剂包括核酸分子、小分子化学药、核酸构建体。

36、进一步，所述核酸分子包括sirna、shrna、dsrna、核酶、反义寡核苷酸。

37、进一步，所述抑制剂选自sirna。

38、进一步，所述sirna的序列选自seq id no:6-11中的一种或几种。

39、进一步，所述方法为非治疗目的的方法。

40、本发明的第十方面提供了一种牛传染性鼻气管炎病毒感染的诊断系统，所述诊断系统包括：

41、(1)检测单元：所述检测单元用于检测本发明第一方面所述的lncrna的表达量；

42、(2)结果判断单元：所述结果判断单元用于根据检测单元所检测得到的表达量的结果，输出牛传染性鼻气管炎病毒感染的诊断结果。

43、进一步，所述结果判断单元包括输入单元、分析单元和输出单元。

44、进一步，所述输入单元用于输入所述lncrna的表达量。

45、进一步，所述分析单元用于根据所述lncrna的表达量，分析牛传染性鼻气管炎病毒感染的诊断结果。

46、进一步，所述输出单元用于输出分析单元的分析结果。

47、进一步，所述lncrna的表达量显著上调，则诊断为牛传染性鼻气管炎病毒感染。

48、本发明的优点和有益效果：

49、本技术首次在牛传染性鼻气管炎病毒感染的mdbk细胞样品中发现一种长链非编码rna6up(lncrna-6up)，设计了能检测出该基因的引物序列，并设计、合成了该基因的小干扰rna，进一步研究表明，其表达量在病毒感染组显著上调，lncrna-6up沉默后抑制病毒的复制，为牛传染性鼻气管炎病毒感染的检测及相关疾病的治疗提供了新的思路。