本发明涉及基因检测,特别是涉及一种检测肝母细胞瘤易感性的引物组、试剂盒及其应用。
背景技术:
1、肝母细胞瘤是儿童最常见的原发性肝脏恶性肿瘤,发病率为1.2~1.5/100万,总生存率较低。随着顺铂化疗的使用和多学科治疗模式的发展,肝母细胞瘤患儿的5年总生存率明显改善,达到了82%。然而,晚期和难治性肝母细胞瘤的治疗之路仍然充满挑战。肝母细胞瘤的发生不仅与父母吸烟、早产、极低出生体重(<1,500g)等因素有关,还与单核苷酸多态性(snps)有关。snps是由单个核苷酸的变异所引起的dna序列多态性。作为最常见的一种遗传变异,snps已被广泛用于病因探索、疾病治疗和预后评估等方面的研究。但目前的检测多为单位点的检测,dna样品利用率和pcr产率均较低。
技术实现思路
1、为了解决上述问题,本发明提供了一种检测肝母细胞瘤易感性的引物组、试剂盒及其应用。本发明提供的引物组可以提高dna样品利用率和pcr产率。
2、为了实现上述目的,本发明提供如下技术方案:
3、本发明提供了一种检测肝母细胞瘤易感性的引物组,包括10对引物;所述10对引物的核苷酸序列如seq id no.1~seq id no.20所示。
4、优选的,所述引物组还包括10个单碱基延伸引物;所述10个单碱基延伸引物的核苷酸序列如seq id no.21~seq id no.30所示。
5、本发明提供了上述技术方案所述的引物组在制备辅助检测肝母细胞瘤易感性的试剂盒中的应用。
6、本发明提供了一种辅助检测肝母细胞瘤易感性的试剂盒,包括上述技术方案所述的引物组。
7、优选的,所述试剂盒还包括多重pcr的试剂。
8、优选的,所述多重pcr的试剂包括extaqpremix。
9、优选的,所述试剂盒还包括单碱基延伸反应的试剂。
10、优选的,所述单碱基延伸反应的试剂包括snapshotmultiplex。
11、有益效果:
12、本发明提供了一种检测肝母细胞瘤易感性的引物组,包括10对引物;所述10对引物的核苷酸序列如seq id no.1~seq id no.20所示。本发明提供的10对引物,可以进行多重pcr,同时扩增含有与肝母细胞瘤的发生具有显著关联的snps位点的片段,包括linc00673 rs11655237g>a,h19 rs2839698c>t,hogg1 rs293795a>g,ythdf1 rs6090311t>c,hmga2 rs968697a>g,h19rs3024270c>g,fto rs9939609t>a,xpc rs2607775c>g,h19rs217727g>a以及xpc rs1870134g>c,可以提高dna样品利用率和pcr产率,且特异性好。
13、进一步的,本发明提供的引物组中的单碱基延伸引物可快速精确地对上述10个snps位点进行分型。
1.一种检测肝母细胞瘤易感性的引物组,其特征在于,包括10对引物;所述10对引物的核苷酸序列如seq id no.1~seq id no.20所示。
2.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于,所述引物组还包括10个单碱基延伸引物;所述10个单碱基延伸引物的核苷酸序列如seq id no.21~seq id no.30所示。
3.权利要求1或2所述的引物组在制备辅助检测肝母细胞瘤易感性的试剂盒中的应用。
4.一种辅助检测肝母细胞瘤易感性的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1或2所述的引物组。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括多重pcr的试剂。
6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,所述多重pcr的试剂包括extaqpremix。
7.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括单碱基延伸反应的试剂。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述单碱基延伸反应的试剂包括snapshotmultiplex。