用于检测华法林与氯吡格雷个体化用药相关基因的多态性的试剂盒及其应用_5

文档序号:9300632阅读:来源:国知局
相同或互补。4. 如权利要求1至3中任一所述的试剂盒,其特征在于:所述特异性引物中引入人工 错配核苷酸;所述人工错配核苷酸是天然的A、T、C、G或其类似物。5. 如权利要求1至4中任一所述的试剂盒,其特征在于:所述Tag序列为单链寡核苷 酸或肽核酸。6. 如权利要求1至5中任一所述的试剂盒,其特征在于:所述引物组合物甲由如下引 物组合物单元组成:第一个引物组合物单元、第二个引物组合物单元、第三个引物组合物单 元、第四个引物组合物单元和第五个引物组合物单元中的至少一个;所述引物组合物乙由 如下引物组合物单元组成:第六个引物组合物单元、第七个引物组合物单元、第八个引物组 合物单元和第九个引物组合物单元中的至少一个; 第一个引物组合物单元中:一条特异性引物的序列为Tagl序 列-CTGAAAAACAACCATTGTCCG,另一条特异性引物为 Tag2 序列-CTGAAAAACAACCATTTGCCA,共 用引物的序列为TCAAGTGGTTCTCGTGCCTC ; 第二个引物组合物单元中:一条特异性引物的序列为Tag3序 列-GACCTCCCATCCTAGTCCAA£A,另一条特异性引物的序列为Tag4序 列-GACCTCCCATCCTAGTCCAAIG,共用引物的序列为 AGGTCTAAGATGAAAAGCAGGGC ; 第三个引物组合物单元中:一条特异性引物的序列为Tag5序 列-GCACGAGGTCCAGAGAT£CA,另一条特异性引物的序列为Tag6序 列-TGCACGAGGTCCAGAGATAIC,共用引物的序列为 CACCCGGTGATGGTAGAGG ; 第四个引物组合物单元中:一条特异性引物的序列为Tag7序列-CAGGGTCCGGCCACIC, 另一条特异性引物的序列为Tag8序列-CAGGGTCCGGCCACIT,共用引物的序列为 GACATTGTGCTCCCAGACGG ; 第五个引物组合物单元中:一条特异性引物的序列为Tag9序 列-CCCAGAAGACTCAGAGAAQCAG,另一条特异性引物的序列为TaglO序 列-GCCCAGAAGACTCAGAGAQACAA,共用引物的序列为 TGAACTACTGGGCTAAGGGGAC ; 第六个引物组合物单元中:一条特异性引物的序列为Tagll序 列-CCCACTATCATTGATTATTTCCG,另一条特异性引物的序列为Tagl2序 列-CCACTATCAITGATTAIT£CCCA,共用引物的序列为 GCAATCAATAAAGTCCCGAGG ; 第七个引物组合物单元中:一条特异性引物的序列为Tagl3序 列-GATTGTAAGCACCCCCAGG,另一条特异性引物的序列为Tagl4序 列-AGGATTGTAAGCACCCCATGA,共用引物的序列为 CACCCCATGGCTGTCTAGG ; 第八个引物组合物单元中:一条特异性引物的序列为Tagl5序 列-A£TTGTGTCTTCTGTTCTCAAAGC,另一条特异性引物的序列为Tagl6序 列-TITGTGTCTTCGSTTCTCAAAGT,共用引物的序列为 ACACGTGAAGGCAGGAAITG ; 第九个引物组合物单元中:一条特异性引物的序列为Tagl7序 列-CCTCCCTCCTTCTCCATITAC,另一条特异性引物的序列为Tagl8序 列-CCTCCCTCCTTCTCCATGSAT,共用引物的序列为 ITCAGCTCTGTCCGATCTGG。7. 如权利要求1至5中任一所述的试剂盒,其特征在于: 所述引物组合物甲由所述第一个引物组合物单元、所述第二个引物组合物单元、所述 第三个引物组合物单元、所述第四个引物组合物单元和所述第五个引物组合物单元组成; 所述引物组合物乙由所述第六个引物组合物单元、所述第七个引物组合物单元、所述 第八个引物组合物单元和所述第九个引物组合物单元组成。8. 如权利要求7所述的试剂盒,其特征在于: 所述通用芯片上包括如下18个探针: Tagl 探针的序列为 NH2-ITITITITITITITT-Tagl 序列; Tag2 探针的序列为 NH2-ITITITITITITITT-Tag2 序列; Tag3 探针的序列为 NH2-ITITITITITITITT-Tag3 序列; Tag4 探针的序列为 NH2-ITITITITITITITT-Tag4 序列; Tag5 探针的序列为 NH2-ITITITITITITITT-Tag5 序列; Tag6 探针的序列为 NH2-ITITITITITITITT-Tag6 序列; Tag7 探针的序列为 NH2-ITITITITITITITT-Tag7 序列; Tag8 探针的序列为 NH2-ITITITITITITITT-Tag8 序列; Tag9 探针的序列为 NH2-ITITITITITITITT-Tag9 序列; TaglO探针的序列为NH2-TrmTmrmTT-TaglO序列; Tagll探针的序列为NH2-TrmTmrmTT-Tagll序列; Tag 12探针的序列为NH2-TrmTmrmTT-TagU序列; Tag 13探针的序列为NH2-TTmTmrmTT-Tagn序列; Tag 14探针的序列为NH2-TTmTmrmTT-TagM序列; Tag 15 探针的序列为 NH2-TTmTmrmTT-Tag 15 序列; Tag 16 探针的序列为 NH2-TTmTmrmTT-Tag 16 序列; Tag 17 探针的序列为 NH2-TTmTmrmTT-Tag 17 序列; Tag 18 探针的序列为 NH2-TTmTmrmTT-Tag 18 序列。9. 如权利要求7或8所述的试剂盒,其特征在于:所述Tagl序列至所述Tagl8序列依 次如序列表的序列1至序列表的序列18所示。10. -种引物组,由第一个引物组合物单元、第二个引物组合物单元、第三个引物组合 物单元、第四个引物组合物单元、第五个引物组合物单元、第六个引物组合物单元、第七个 引物组合物单元、第八个引物组合物单元和第九个引物组合物单元中的至少一个引物组合 物单元组成;每个所述引物组合物单元由两条特异性引物和一条共用引物组成; 第一个引物组合物单元中:一条特异性引物的序列为Tagl序 列-CTGAAAAACAACCATTGTCCG,另一条特异性引物为 Tag2 序列-CTGAAAAACAACCATTTGCCA,共 用引物的序列为TCAAGTGGTTCTCGTGCCTC ; 第二个引物组合物单元中:一条特异性引物的序列为Tag3序 列-GACCTCCCATCCTAGTCCAA£A,另一条特异性引物的序列为Tag4序 列-GACCTCCCATCCTAGTCCAAIG,共用引物的序列为 AGGTCTAAGATGAAAAGCAGGGC ; 第三个引物组合物单元中:一条特异性引物的序列为Tag5序 列-GCACGAGGTCCAGAGATQCA,另一条特异性引物的序列为Tag6序 列-TGCACGAGGTCCAGAGATAIC,共用引物的序列为 CACCCGGTGATGGTAGAGG ; 第四个引物组合物单元中:一条特异性引物的序列为Tag7序列-CAGGGTCCGGCCACIC, 另一条特异性引物的序列为Tag8序列-CAGGGTCCGGCCACIT,共用引物的序列为 GACATTGTGCTCCCAGACGG ; 第五个引物组合物单元中:一条特异性引物的序列为Tag9序 列-CCCAGAAGACTCAGAGAAQCAG,另一条特异性引物的序列为TaglO序 列-GCCCAGAAGACTCAGAGAQACAA,共用引物的序列为 TGAACTACTGGGCTAAGGGGAC ; 第六个引物组合物单元中:一条特异性引物的序列为Tagll序 列-CCCACTATCATTGATTATTTCCG,另一条特异性引物的序列为Tagl2序 列-CCACTATCAITGATTAIT£CCCA,共用引物的序列为 GCAATCAATAAAGTCCCGAGG ; 第七个引物组合物单元中:一条特异性引物的序列为Tagl3序 列-GATTGTAAGCACCCCCAGG,另一条特异性引物的序列为Tagl4序 列-AGGATTGTAAGCACCCCATGA,共用引物的序列为 CACCCCATGGCTGTCTAGG ; 第八个引物组合物单元中:一条特异性引物的序列为Tagl5序 列-A£TTGTGTCTTCTGTTCTCAAAGC,另一条特异性引物的序列为Tagl6序 列-TITGTGTCTTCGSTTCTCAAAGT,共用引物的序列为 ACACGTGAAGGCAGGAAITG ; 第九个引物组合物单元中:一条特异性引物的序列为Tagl7序 列-CCTCCCTCCTTCTCCATITAC,另一条特异性引物的序列为Tagl8序 列-CCTCCCTCCTTCTCCATGSAT,共用引物的序列为 ITCAGCTCTGTCCGATCTGG。11. 如权利要求10所述的引物组,其特征在于:所述Tagl序列至所述TaglS序列依次 如序列表的序列1至序列表的序列18所示。12. -种芯片,包括如下18个探针: Tagl探针的序列为NH2-ITITITITITITITT-Tagl序列; Tag2探针的序列为NH2-ITITITITITITITT-Tag2序列; Tag3探针的序列为NH2-ITITITITITITITT-Tag3序列; Tag4探针的序列为NH2-ITITITITITITITT-Tag4序列; Tag5探针的序列为NH2-ITITITITITITITT-Tag5序列; Tag6探针的序列为NH2-ITITITITITITITT-Tag6序列; Tag7探针的序列为NH2-ITITITITITITITT-Tag7序列; Tag8探针的序列为NH2-ITITITITITITITT-Tag8序列; Tag9探针的序列为NH2-ITITITITITITITT-Tag9序列; TaglO探针的序列为NH2-TrmTmrmTT-TaglO序列; Tagll探针的序列为NH2-TrmTmrmTT-Tagll序列; Tag 12探针的序列为NH2-TrmTmrmTT-TagU序列; Tag 13探针的序列为NH2-TTmTmrmTT-Tagn序列; Tag 14探针的序列为NH2-TTmTmrmTT-TagM序列; Tag 15探针的序列为NH2-TTmTmrmTT-Tag 15序列; Tag 16探针的序列为NH2-TTmTmrmTT-Tag 16序列; Tag 17探针的序列为NH2-TTmTmrmTT-Tag 17序列; Tag 18探针的序列为NH2-TTmTmrmTT-Tag 18序列。13.如权利要求12所述的探针,其特征在于:所述Tagl序列至所述TaglS序列依次如 序列表的序列1至序列表的序列18所示。14.权利要求1至9中任一所述的试剂盒、或权利要求10或11所述引物组、或权利要 求12或13所述芯片,在用于检测华法林耐药性相关基因的多态性和氯吡格雷耐药性相关 基因的多态性中的应用。
【专利摘要】本发明公开了一种华法林与氯吡格雷个体化用药相关基因多态性检测试剂盒及其应用。本发明提供的试剂盒包括通用芯片、引物组合物甲和引物组合物乙;引物组合物甲中的每个引物组合物单元用于鉴别华法林耐药性相关基因的一个多态性位点;引物组合物乙中的每个引物组合物单元用于鉴别氯吡格雷耐药性相关基因的一个多态性位点。本发明的试剂盒具有集成化程度高、灵敏度高、应用范围广、特异性高、检测结果稳定、可靠性高、使用方法快速简便、可操作性强、易于实现自动化等优点,可用于基因突变检测、基因多态性分析等方面,适用于临床疾病突变检测、药物基因组学分析、法医学鉴定等基因分析领域。
【IPC分类】C12Q1/68, C12N15/11
【公开号】CN105018583
【申请号】CN201410180699
【发明人】项光新, 梁书剑, 邢婉丽
【申请人】博奥生物集团有限公司, 清华大学
【公开日】2015年11月4日
【申请日】2014年4月28日
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