一种快速检测八角和红毒茴成分的方法

文档序号:10589246阅读:431来源:国知局
一种快速检测八角和红毒茴成分的方法
【专利摘要】本发明提供了一种快速检测八角和红毒茴成分的方法,尤其涉及一种使用实时荧光PCR法检测八角和红毒茴成分的引物和探针及具体检测方法,具有良好的灵敏性和特异性,可用于八角和红毒茴成分的快速检测。
【专利说明】
一种快速检测八角和红毒茴成分的方法
技术领域:
[0001] 本发明属生物检测技术领域,涉及八角和红毒茴成分的检测方法,具体涉及检测 八角和红毒茴成分的引物、探针以及检测方法。
【背景技术】
[0002] 八角,又名八角茴香,为木兰科植物八角茴香(Illicium verum)的干燥成熟果实。 秋、冬二季果实由绿变黄时采摘,置沸水中略烫后干燥或直接干燥。八角是著名的调味香 料,味香甜,多为八瓣,顶端呈较钝的鸟喙状;果皮较厚,有较浓郁的香气;果柄较长,弯曲。 也供药用,有祛风理气、和胃调中的功能,用于中寒呕逆、腹部冷痛、胃部胀闷等,但多食会 损目发疮。果皮、种子、叶都含芳香油,称八角茴香油(简称茴油)是制造化妆品、甜香酒、啤 酒和食品工业的重要原料。八角和茴油除国内需用外,又是重要的出口物资,我国八角占世 界市场的80%以上。
[0003] 红毒茴,又名莽草,外形与八角相似,果实多为8-13瓣,顶端呈较尖的鸟喙状,向后 弯曲;果皮较薄,味略苦;果柄较短,平直或微弯。果和叶有强烈香气,可提芳香油,为高级香 料的原料。红毒茴果含莽草亭,有剧毒,不能作食用香料,过去有的地区曾将果作八角茵香 用,发生严重中毒。本种根、根皮也有毒,民间用作祛风除湿,散疲止痛,治跌打,风湿等,根 用量一般不超过一钱,根皮只用二分。
[0004] 因八角和红毒茴外形相似,而八角每公斤的价格是红毒茴的3倍左右,于是一些生 产厂家和商贩经常将红毒茴掺在八角中进行出售。一般来说,八角和红毒茴可以通过外观 进行区分,但是一些商贩为防顾客鉴别,通常将其多出的角掰掉或弄碎,或者磨成粉末代替 八角加工为五香粉等复合调味料中,使之无法分辨。因红毒茴有剧毒,作为调料使用会引起 中毒,轻者恶心呕吐,严重者烦躁不安,瞳孔散大,血压下降,甚至危及生命安全。
[0005] 周晶等(八角茴香与其伪品莽草的红外光谱三级鉴定研究,光谱学与光谱分析, 2008,第28卷,第12期,2864-2867)使用红外光谱三级鉴定的办法对八角和红毒茴进行了区 分,因为八角和红毒茴的几个特征峰比较接近,而且方法需要依次采用一维红外光谱、二阶 导数谱和二维相关红外光谱,通过逐渐提高分辨率使谱图的差别增大方才可对八角和红毒 茴进行区分,分析方法较为复杂。
[0006] 实时荧光PCR-TaqMAN探针法可从基因水平进行物种鉴定,具体是在PCR扩增反应 体系中添加一个特异性的荧光探针,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,即检测靶核 苷酸序列扩增状态,以进行结果判定。它的主要优点是:
[0007] (1)在闭管状态下进行扩增产物检测,无需PCR产物的后处理,避免了扩增产物污 染而致的假阳性,保证了结果的可靠性;
[0008] (2)探针杂交特异性更强,灵敏性更高,在普通PCR扩增的基础上又多了一条可以 与模板互补配对的荧光探针,提高了特异性,荧光信号由仪器自动收集,进一步提高了灵敏 度;
[0009] (3)无需酶切位点存在,无需进行酶切,电泳,节省了时间,PCR后无需后续处理;
[0010] (4)整个实验耗时短,操作简单快速,数据分析较建安。。
[0011] 目前,对于八角和易掺假且有毒性的红毒茴还没有实时荧光PCR检测方法,本领域 迫切需要开发这种快速简便的检测八角和红毒茴成分的技术。

【发明内容】

[0012] 本发明的目的是为了解决现有技术所存在的上述技术问题,提供了一种使用实时 荧光PCR法检测八角和红毒茴成分的引物和探针及检测方法。
[0013] 根据八角的微卫星序列(microsatellite sequence)和红毒茴的ITS2基因 (Internal Transcribed Spacer 2)设计特异检测引物和探针。
[0014]实时荧光PCR检测八角成分的引物为:
[0015] 上游引物PI :GGGTTGGTAGGTTCATAA
[0016] 下游引物P2 :GCACTCACACTTATATGTATA
[0017] 检测八角成分的荧光探针序列为:CATGTACACACAATTGGTATTTGCTCA
[0018] 上述荧光探针,5 '端为FAM标记,3 '端为TAMRA标记
[0019] 实时荧光PCR检测红毒茴成分的引物为:
[0020] 上游引物PI :CTCCCCCCTCCCTTGATC
[0021] 下游引物P2: CATGTTTCTCTACTCCTCAAGG
[0022] 检测红毒茴成分的荧光探针序列为:TCCTTGCTTCTTTTATCGA
[0023] 上述荧光染料,5 '端为VIC标记,3 '端为MGB标记。
[0024] 实时荧光PCR检测八角和红毒茴成分的方法,其步骤如下:
[0025] 1、提取待检样品基因组DNA
[0026] 2、将检测八角和红毒茴成分的上游引物、下游引物和探针分别稀释至ΙΟμ mol/L, 然后等体积合并为混合引物(探针),以所提取的DNA作为模板,加入上述引物对和荧光染料 标记的探针以及酶反应液进行实时荧光PCR反应,记录样品反应的Ct值;
[0027]所述的实时荧光PCR反应体系为: 2xReal-time PCR 预混液 10μ1 上游混合引物(ΙΟμιτιοΙ/L) ΙμL 下游混合引物(ΙΟμιτιοΙ/L) ΙμL
[0028] 混合探针(ΙΟμιτιοΙ/L) ΙμL 样品 DNA (1 ~lOOng/μΙ) 2μ1 ddH2〇 5μ1
[0029] 3、所述的实时荧光PCR反应条件为95°C 10min,l个循环;95°C 15s,58°C 30s,40 个循环,在每次循环的58°C 30s时收集荧光,设立FAM和VIC通道。
[0030] 所述的实时荧光PCR方法还设有空白对照、阴性对照、阳性对照,判定标准为:
[0031] 空白对照:以ddH20为模板,按照2和3所述条件,进行实时荧光PCR反应,FAM和VIC 通道检测Ct值大于或等于40;
[0032]阴性对照:以非八角和红毒茴基因组DNA为模板,按照2和3所述条件,进行实时荧 光PCR反应,FAM和VIC通道检测Ct值大于或等于40;
[0033]阳性对照:以含有八角和红毒茴基因组DNA为模板,按照2和3所述条件,进行实时 荧光PCR反应,FAM和VIC通道检测Ct值大于或等于40检测Ct值小于或等于36;
[0034]待测样品FAM和(或)VIC通道检测Ct值大于或等于40,阴性对照,阳性对照和空白 对照结果正常者,判定该样品未检出八角和(或)红毒茴成分;
[0035] 待测样品FAM和(或)VIC通道检测Ct值小于或等于36,阴性对照,阳性对照和空白 对照结果正常者,判定该样品检出八角和(或)红毒茴成分;
[0036] 待测样品FAM和(或)VIC通道检测Ct值在36-40之间,重做实时荧光PCR扩增,再次 扩增后结果Ct值大于40且阴性对照,阳性对照和空白对照结果正常,判定该样品未检出八 角和(或)红毒茴成分;再次扩增后结果Ct值仍小于40且阴性对照,阳性对照和空白对照结 果正常,判定该样品检出八角和(或)红毒茴成分。
[0037] 本发明提供了一种使用实时荧光PCR法检测八角和红毒茴成分的引物和探针及具 体检测方法,具有良好的灵敏性和特异性,可用于八角和红毒茴成分的快速检测。
【附图说明】
[0038] 图1是本发明实施例1检测八角和红毒茴成分阳性样品的荧光PCR扩增图;其中,1 为八角;2为红毒茴;
[0039] 图2是本发明实施例2检测八角、红毒茴、地楓皮、大八角样品的荧光PCR扩增图;其 中,1为八角;2为红毒茴;3为地楓皮;4为大八角。
【具体实施方式】:
[0040] 下面对本发明做进一步详细说明。
[0041 ] 实施例1
[0042] 1.所用引物和探针:
[0043] 利用GenBank数据库(https : //www .ncbi.nlm.nih.gov/genbank/)查找八角 (Iphigenia indica)和红毒茴(Fritillaria maximowiczii)的特异序列,分别确定使用微 卫星序列和ITS2基因,其GenBank Accession登录号分别为KC176699.1和KF022354.1,设计 并合成实时荧光PCR特异性扩增引物和探针。
[0044] 实时荧光PCR检测八角成分的引物为:
[0045] 上游引物PI :GGGTTGGTAGGTTCATAA
[0046] 下游引物P2 :GCACTCACACTTATATGTATA
[0047] 检测八角成分的荧光探针序列为:CATGTACACACAATTGGTATTTGCTCA
[0048] 上述荧光探针,5 '端为FAM标记,3 '端为TAMRA标记
[0049] 实时荧光PCR检测红毒茴成分的引物为:
[0050] 上游引物PI :CTCCCCCCTCCCTTGATC [0051 ]下游引物P2: CATGTTTCTCTACTCCTCAAGG
[0052] 检测红毒茴成分的荧光探针序列为:TCCTTGCTTCTTTTATCGA
[0053] 上述荧光染料,5 '端为VIC标记,3 '端为MGB标记。
[0054] 2.样品DNA的提取与纯化按以下步骤进行:
[0055] (1)分别称取0.5g八角和红毒茴粉碎后材料放入同一个50mL离心管中;
[0056] (2)加入预热的lOmLCTAB抽提裂解缓冲液(使用前加入20yL蛋白酶K、20yL RNA、 200μ〇3-巯基乙醇),振荡悬浮后65°C温浴lh,期间不断晃动,冷却至室温后,5000g离心 lOmin;
[0057] (3)取上清950yL加入2mL离心管中,加入等体积氯仿异戊醇(24:1)轻柔混匀静置 5min,12000rpm离心 15min;
[0058] (4)取上清750yL加入2mL离心管中,加入等体积氯仿异戊醇(24:1)轻柔混匀静置 5min,12000rpm离心 15min;
[0059] (5)取上清500yL加入1.5mL离心管中,加入300yL异丙醇,50yL乙酸钾溶液,轻轻颠 倒混勾,室温静置30min,12000rpm离心15min,弃上清;
[0060] (6)加入1.0mL70 %乙醇溶液,将沉淀悬浮浸泡,并将离心管倾斜,轻轻转动数圈后 室温静置2min,12000rpm离心1 Omin,弃上清,如沉淀多重复此步骤一次;
[0061 ] (7)小心弃去上清液,干燥DNA沉淀,加入50-100yL ddH20,65°C溶解DNA。
[0062] 也可使用等效的商品化试剂盒提取模板DNA。
[0063] 3.建立实时荧光PCR扩增反应体系
[0064]将检测八角和红毒茴的上游引物、下游引物和探针分别稀释至lOwnol/L,然后等 体积合并为混合引物(探针),所述的实时荧光PCR反应体系为: 2xReal-time PCR 预混液 10μ1 上游混合引物(ΙΟμιτιοΙ/L) ΙμL 下游混合引物(ΙΟμ mol/L) ΙμL
[0065] 混合探针(l〇pmol/L) ΙμL 样品 DNA (l-lOOng/μΙ) 2μ1 ddH20 5μ1
[0066] 在各设定的实时荧光PCR反应管中分别加入制备的模板DNA溶液,盖紧管,瞬离5s-10s〇
[0067] 将加好样后的反应管放入实时荧光PCR检测系统内,记录样本摆放顺序。
[0068] 循环条件设置:95°C 10min,l个循环;95°C 15s,58°C 30s,40个循环,设立FAM和 VIC双通道,在每次循环的58°C 30s时收集荧光,检测完毕后,根据扩增曲线和Ct值判定结 果。
[0069] 4.所述确定质量控制指标
[0070] 空白对照:以ddH20为模板,按照2和3所述条件,进行实时荧光PCR反应,FAM和VIC 通道检测Ct值大于或等于40;
[0071]阴性对照:以八角和红毒茴基因组DNA为模板,按照2和3所述条件,进行实时荧光 PCR反应,FAM和VIC通道检测Ct值大于或等于40;
[0072]阳性对照:以含有八角和红毒茴基因组DNA为模板,按照2和3所述条件,进行实时 荧光PCR反应,FAM和VIC通道检测Ct值大于或等于40检测Ct值小于或等于36;
[0073] 1.结果判定:
[0074]待测样品FAM和(或)VIC通道检测Ct值大于或等于40,阴性对照,阳性对照和空白 对照结果正常者,判定该样品未检出八角和(或)红毒茴成分;
[0075] 待测样品FAM和(或)VIC通道检测Ct值小于或等于36,阴性对照,阳性对照和空白 对照结果正常者,判定该样品检出八角和(或)红毒茴成分;
[0076] 待测样品FAM和(或)VIC通道检测Ct值在36-40之间,重做实时荧光PCR扩增,再次 扩增后结果Ct值大于40且阴性对照,阳性对照和空白对照结果正常,判定该样品未检出八 角和(或)红毒茴成分;再次扩增后结果Ct值仍小于40且阴性对照,阳性对照和空白对照结 果正常,判定该样品检出八角和(或)红毒茴成分。
[0077] 2.检测结果:
[0078]本发明实施例1将待检八角和红毒茴样品混合提取DNA后,进行实时荧光PCR检测, 含有八角和红毒茴的样品显示如图1所示的阳性扩增曲线,表明该引物探针能对八角和红 毒茴成分进行良好扩增。
[0079] 实施例2
[0080] 1.所用引物和探针:
[0081] 选择八角微卫星序列和红毒茴ITS2基因作为对象,设计并合成实时荧光PCR特异 性扩增引物和探针。
[0082]实时荧光PCR检测八角成分的引物为:
[0083] 上游引物PI :GGGTTGGTAGGTTCATAA
[0084] 下游引物P2 :GCACTCACACTTATATGTATA
[0085] 检测八角成分的荧光探针序列为:CATGTACACACAATTGGTATTTGCTCA
[0086] 上述荧光探针,5 '端为FAM标记,3 '端为TAMRA标记
[0087] 实时荧光PCR检测红毒茴成分的引物为:
[0088] 上游引物PI :CTCCCCCCTCCCTTGATC
[0089] 下游引物P2: CATGTTTCTCTACTCCTCAAGG
[0090] 检测红毒茴成分的荧光探针序列为:TCCTTGCTTCTTTTATCGA
[0091] 上述荧光染料,5 '端为VIC标记,3 '端为MGB标记。
[0092]样品DNA的提取与纯化按以下步骤进行:
[0093] (1)分别称取0.5g八角、红毒茴、地楓皮和大八角等样品粉碎后材料放入不同50mL 离心管中;
[0094] (2)加入预热的lOmLCTAB抽提裂解缓冲液(使用前加入20yL蛋白酶K、20yL RNA、 200μ〇3-巯基乙醇),振荡悬浮后65°C温浴lh,期间不断晃动,冷却至室温后,5000g离心 lOmin;
[0095] (3)取上清950yL加入2mL离心管中,加入等体积氯仿异戊醇(24:1)轻柔混匀静置 5rnin,12000rpm 离心 15min;
[0096] (4)取上清750yL加入2mL离心管中,加入等体积氯仿异戊醇(24:1)轻柔混匀静置 5rnin,12000rpm 离心 15min;
[0097] (5)取上清500yL加入1.5mL离心管中,加入300yL异丙醇,50yL乙酸钾溶液,轻轻颠 倒混勾,室温静置30min,12000rpm离心15min,弃上清;
[0098] (6)加入1.0mL70 %乙醇溶液,将沉淀悬浮浸泡,并将离心管倾斜,轻轻转动数圈后 室温静置2min,12000rpm离心1 Omin,弃上清,如沉淀多重复此步骤一次;
[0099] (7)小心弃去上清液,干燥DNA沉淀,加入50-100yL ddH20,65°C溶解DNA。
[0100] 也可使用等效的商品化试剂盒提取模板DNA。
[0101] 2.建立实时荧光PCR扩增反应体系
[0102] 将检测八角和红毒茴的上游引物、下游引物和探针分别稀释至ΙΟμ mol/L,然后等 体积合并为混合引物(探针),所述的实时荧光PCR反应体系为: 2xReal-timePCR 预混液 10μ1 上游混合引物(1 Ομιηο?/L ) 1 μL 下游混合引物(ΙΟμL?θΙ/L) ΙμL
[0103] 混合探针(10μL?〇1/υ ΙμL 样品 DNA (l~100ng/pl) 2μ1 ddH2〇 5μ1
[0104] 在各设定的实时荧光PCR反应管中分别加入制备的模板DNA溶液,盖紧管,瞬离5s-10s〇
[0105] 将加好样后的反应管放入实时荧光PCR检测系统内,记录样本摆放顺序。
[0106] 循环条件设置:95°C 10min,l个循环;95°C 15s,58°C 30s,40个循环,设立FAM和 VIC双通道,在每次循环的58°C 30s时收集荧光,检测完毕后,根据扩增曲线和Ct值判定结 果。
[0107] 3.所述确定质量控制指标
[0108] 空白对照:以ddH20为模板,按照2和3所述条件,进行实时荧光PCR反应,FAM和VIC 通道检测Ct值大于或等于40;
[0109] 阴性对照:以八角和红毒茴基因组DNA为模板,按照2和3所述条件,进行实时荧光 PCR反应,FAM和VIC通道检测Ct值大于或等于40;
[0110] 阳性对照:以含有八角和红毒茴基因组DNA为模板,按照2和3所述条件,进行实时 荧光PCR反应,FAM和VIC通道检测Ct值大于或等于40检测Ct值小于或等于36;
[0111] 1.结果判定:
[0112] 待测样品FAM和(或)VIC通道检测Ct值大于或等于40,阴性对照,阳性对照和空白 对照结果正常者,判定该样品未检出八角和(或)红毒茴成分;
[0113] 待测样品基因 FAM和(或)VIC通道检测Ct值小于或等于36,阴性对照,阳性对照和 空白对照结果正常者,判定该样品检出八角和(或)红毒茴成分;
[0114] 待测样品FAM和(或)VIC通道检测Ct值在36-40之间,重做实时荧光PCR扩增,再次 扩增后结果Ct值大于40且阴性对照,阳性对照和空白对照结果正常,判定该样品未检出八 角和(或)红毒茴成分;再次扩增后结果Ct值仍小于40且阴性对照,阳性对照和空白对照结 果正常,判定该样品检出八角和(或)红毒茴成分。
[0115] 2.检测结果:
[0116] 本发明实施例2将八角和红毒茴成分检测引物和探针分别对八角、红毒茴、地楓皮 和大八角等DNA进行实时荧光PCR检测,结果显示样品地楓皮和大八角无扩增信号,只有八 角和红毒茴有扩增信号,实施例2表明本发明的引物和探针具有良好的特异性。
[0117] 上述实施例仅供说明本发明之用,而并非是对本发明专利的限制;应当指出的是, 对于本领域的普通技术人员,在不脱离本发明构思范围的情况下,还可以作出各种变化和 变型,这些都属于本发明的保护范围;因此,凡跟本发明权利要求范围所做的均等变化与修 饰,均应属于本发明权利要求的覆盖范围。
【主权项】
1. 一种快速检测八角和红毒茴成分的方法,其特征为,实时荧光PCR检测八角和红毒茴 成分的引物探针,分别为: 实时荧光PCR检测八角成分的引物为:上游引物P1: GGGTTGGTAGGTTCATAA,下游引物P2: GCACTCACACTTATATGTATA,检测八角成分的荧光探针序列为: CATGTACACACAATTGGTATTTGCTCA; 上述荧光探针,5 '端为FAM标记,3 '端为TAMRA标记; 实时荧光PCR检测红毒茴成分的引物为:上游引物PI: CTCCCCCCTCCCTTGATC,下游引物 P2: CATGTTTCTCTACTCCTCAAGG,检测红毒茴成分的荧光探针序列为:TCCTTGCTTCTTTTATCGA 上述荧光染料,5 '端为VIC标记,3 '端为MGB标记。2. 根据权利要求1所述的一种快速检测八角和红毒茴成分的方法,其特征在于:检测八 角成分探针的荧光染料为:5 '端为FAM标记,3 '端为MGB标记;检测红毒茴成分探针的荧光染 料为:5 '端为VIC标记,3 '端为MGB标记。3. 根据权利要求1所述的一种快速检测八角和红毒茴成分的方法,其特征在于如下步 骤: 1) 提取待检样品基因组DNA; 2) 以所提取的DNA作为模板,加入权利要求1所述的引物对和荧光染料标记的探针以及 酶反应液进行实时荧光PCR反应,记录样品反应的Ct值。4. 根据权利要求3所述的一种快速检测八角和红毒茴成分的方法,其特征在于:将检测 八角和红毒茴的上游引物、下游引物和探针分别稀释至lOMiol/L,然后等体积合并为混合 引物(探针),所述的实时荧光PCR反应体系为: 2 xReal-time PCR 预混液 1 ΟμL 上游混合引物(ΙΟμιτιοΙ/L) ΙμL 下游混合引物(10μL?〇1/υ ΙμL ο 混合探针(ΙΟμιτιοΙ/L) ΙμL 样品 DNA (l-lOOng/μΙ) 2μ1 ddH20 5μ15. 根据权利要求4所述的一种快速检测八角和红毒茴成分的方法,其特征在于:所述的 实时荧光PCR反应条件为95°C lOmin,1个循环;95°C 15s,58°C30s,40个循环。6. 根据权利要求3、4和5所述的一种快速检测八角和红毒茴成分的方法,其特征在于: 所述的实时荧光PCR方法还设有空白对照、阴性对照、阳性对照,判定标准为: 空白对照:以ddH20为模板,按照2和3所述条件,进行实时荧光PCR反应,FAM和VIC通道检 测Ct值大于或等于40; 阴性对照:以非八角和红毒茴基因组DNA为模板,按照2和3所述条件,进行实时荧光PCR 反应,FAM和VIC通道检测Ct值大于或等于40; 阳性对照:以含有八角和红毒茴基因组DNA为模板,按照2和3所述条件,进行实时荧光 PCR反应,FAM和VIC通道检测Ct值大于或等于40检测Ct值小于或等于36; 待测样品FAM和(或)VIC通道检测Ct值大于或等于40,阴性对照,阳性对照和空白对照 结果正常者,判定该样品未检出八角和(或)红毒茴成分; 待测样品FAM和(或)VIC通道检测Ct值小于或等于36,阴性对照,阳性对照和空白对照 结果正常者,判定该样品检出八角和(或)红毒茴成分; 待测样品FAM和(或)VIC通道检测Ct值在36-40之间,重做实时荧光PCR扩增,再次扩增 后结果Ct值大于40且阴性对照,阳性对照和空白对照结果正常,判定该样品未检出八角和 (或)红毒茴成分;再次扩增后结果Ct值仍小于40且阴性对照,阳性对照和空白对照结果正 常,判定该样品检出八角和(或)红毒茴成分。
【文档编号】C12Q1/68GK105950767SQ201610516836
【公开日】2016年9月21日
【申请日】2016年7月4日
【发明人】宋薇, 张斌, 崔山, 闫涛, 郭文宗
【申请人】杭州谱尼检测科技有限公司
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