用于组合疗法的患者的选择的制作方法
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背景技术：
癌症、肿瘤、肿瘤相关病症以及肿瘤性疾病状态是严重的且通常威胁生命的病症。这些疾病和病症(其特征在于快速增殖的细胞生长)仍然是旨在鉴定在其治疗中有效的治疗剂的研究工作的对象。这样的药剂可延长患者的生存期、抑制与肿瘤相关的快速增殖的细胞生长或实现肿瘤的消退。
hdac抑制剂(hdaci)是新出现的一类通过染色质重塑和基因表达调节促进血液和实体恶性肿瘤分化和凋亡的治疗剂。尽管已经研究了hdaci的抗肿瘤作用，但是hdaci对于癌症患者系统免疫的影响仍然不清楚。
在多种适应症中，例如非小细胞肺癌、黑素瘤等，需要癌症免疫疗法。因此，本领域非常需要有效化合物、组合物和方法，其可单独或与治疗这些疾病和病症的其它疗法联合用于治疗癌症。本发明旨在满足该需要。
发明简述
因而，在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含hdac抑制剂和第二治疗剂的组合疗法的患者的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于预定百分比，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含hdac抑制剂和第二治疗剂的组合疗法的患者的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症，例如非小细胞肺癌和/或黑素瘤；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16阴性的细胞的数量；测量外周血样品中外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于预定百分比，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含hdac抑制剂和第二治疗剂的组合疗法的患者的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症且进展中和/或被认为对之前的疗法无响应；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于预定百分比，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含hdac抑制剂和第二治疗剂的组合疗法的患者的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症(例如，非小细胞肺癌和/或黑素瘤)且进展中和/或被认为对之前的疗法无响应；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于预定百分比，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种患者中癌症的预后的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中总外周血单核细胞的数量；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于预定百分比，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种患者中癌症的预后的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症，例如非小细胞肺癌和/或黑素瘤；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中总外周血单核细胞的数量；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于预定百分比，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种患者中癌症的预后的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症且进展中和/或被认为对之前的疗法无响应；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中总外周血单核细胞的数量；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于预定百分比，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种患者中癌症的预后的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有非小细胞肺癌和/或黑素瘤且进展中和/或被认为对之前的疗法无响应；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中总外周血单核细胞的数量；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于预定百分比，则施用所述组合疗法。
在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含hdac抑制剂和第二治疗剂的组合疗法的患者的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于约至少5％，比如约至少20％，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含hdac抑制剂和第二治疗剂的组合疗法的患者的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症，例如非小细胞肺癌和/或黑素瘤；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16阴性的细胞的数量；测量外周血样品中外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于约至少5％，比如约至少20％，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含hdac抑制剂和第二治疗剂的组合疗法的患者的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症且进展中和/或被认为对之前的疗法无响应；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于约至少5％，比如约至少20％，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含hdac抑制剂和第二治疗剂的组合疗法的患者的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症(例如，非小细胞肺癌和/或黑素瘤)且进展中和/或被认为对之前的疗法无响应；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于约至少5％，比如约至少20％，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种患者中癌症的预后的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中总外周血单核细胞的数量；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于约至少5％，比如约至少20％，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种患者中癌症的预后的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症，例如非小细胞肺癌和/或黑素瘤；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中总外周血单核细胞的数量；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于约至少5％，比如约至少20％，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种患者中癌症的预后的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症和/或进展中和/或被认为对之前的疗法无响应；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中总外周血单核细胞的数量；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于约至少5％，比如约至少20％，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种患者中癌症的预后的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症(例如非小细胞肺癌和/或黑素瘤)且进展中和/或被认为对于治疗的疗法无响应；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中总外周血单核细胞的数量；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于约至少5％，比如约至少20％，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含恩替司他(entinostat)和第二治疗剂的组合疗法的患者的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于约至少5％，比如约至少20％，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含恩替司他和第二治疗剂的组合疗法的患者的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症，例如非小细胞肺癌和/或黑素瘤；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16阴性的细胞的数量；测量外周血样品中外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于约至少5％，比如约至少20％，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含恩替司他和第二治疗剂的组合疗法的患者的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症且进展中和/或被认为对之前的疗法无响应；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于约至少5％，比如约至少20％，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含恩替司他和第二治疗剂的组合疗法的患者的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症(例如，非小细胞肺癌和/或黑素瘤)且进展中和/或被认为对之前的疗法无响应；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于约至少5％，比如约至少20％，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含恩替司他和pd-1抗体的组合疗法的患者的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于约至少5％，比如约至少20％，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含恩替司他和pd-1抗体的组合疗法的患者的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症，例如非小细胞肺癌和/或黑素瘤；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于约至少5％，比如约至少20％，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含恩替司他和pd-1抗体的组合疗法的患者的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症且进展中和/或被认为对之前的疗法无响应；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于约至少5％，比如约至少20％，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含恩替司他和pd-1抗体的组合疗法的患者的方法，包括：提供来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症(例如，非小细胞肺癌和/或黑素瘤)且进展中和/或被认为对之前的疗法无响应；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总的活外周血单核细胞的百分比大于约至少5％，比如约至少20％，则施用所述组合疗法。
在一些实施方案中，抗pd-1抗体、抗pd-l1和/或ctla4-阻断治疗剂和hdac抑制剂在时间上接近地施用以治疗癌症。在一些实施方案中，本公开内容提供抗pd-1抗体、抗pd-l1和/或ctla4阻断治疗剂和hdac抑制剂的协同组合物，其中所述抗pd-1抗体、抗pd-l1抗体和/或ctla4阻断治疗剂和hdac抑制剂在人体中(例如，仅在人体中)彼此接触。
在一些实施方案中，本公开内容提供一种通过使抗pd-1抗体、抗pd-l1和/或ctla4-阻断治疗剂和hdac抑制剂在一个位置彼此接触来制备组合物的方法。
附图的简单说明
图1图解了从预处理供体获得的血液样品中cd14+hla-drhicd16-单核细胞相对于总活pbmc的百分比，将所述预处理供体分成以下三类之一：健康供体(hd)、对组合疗法有响应的nsclc患者(响应者)、和对组合治疗无响应的nsclc患者(非响应者)，显示了基线、预处理cd14+hla-drhicd16-细胞相对于总外周血单核细胞的百分比的预测和预后意义。
图2图解了从预处理供体获得的血液样品中cd14+hla-drhicd16-单核细胞相对于总活pbmc的百分比，将所述预处理供体分成以下三类之一：(1)健康供体(hd)，(2)对组合疗法有目标响应(完全响应(cr)和部分响应(pr))的nsclc患者合并治疗时间(tot)≥16周的患者，和(3)进行性疾病(pd)合并治疗时间＜16周的患者，显示了基线、预处理cd14+hla-drhicd16-细胞相对于总外周血单核细胞的百分比的预测和预后意义。
图3图解了从预处理供体获得的血液样品中cd14+hla-drhicd16-单核细胞相对于总活pbmc的百分比，将所述预处理供体分成以下三类之一：(1)健康供体(hd)，(2)对组合疗法有目标响应(完全响应(cr)和部分响应(pr))的nsclc患者合并治疗时间(tot)≥24周的患者，和(3)进行性疾病(pd)合并治疗时间＜24周的患者，显示了基线、预处理cd14+hla-drhicd16-细胞相对于总外周血单核细胞的百分比的预测和预后意义。
图4图解了在特定时间间隔保持无进展的nsclc患者的百分比(无进展存活(pfs))。根据患者的基线cd14+hla-drhicd16-单核细胞相对于总外周血单核细胞的百分比，将患者分组，所述百分比降至高于/等于或低于计算的总外周血单核细胞的13.1％的单核细胞百分比中点。
图5图解了从治疗的第一周期的第一天(c1d1)的供体获得的血液样品中cd14+hla-drhicd16-单核细胞相对于总活pbmc的百分比，将所述供体分成以下三类之一：健康供体(hd)、对组合疗法有响应的黑素瘤患者(c1d1响应者)、和对组合治疗无响应的黑素瘤患者(c1d1非响应者)，显示了基线、预处理cd14+hla-drhicd16-细胞相对于总外周血单核细胞的百分比的预测和预后意义。
图6图解了在特定时间间隔保持无进展的nsclc患者的百分比(无进展存活(pfs))。根据患者的基线cd14+hla-drhicd16-单核细胞相对于总外周血单核细胞的百分比，将患者分组，所述百分比降至高于/等于或低于计算的总的活外周血单核细胞的9％的单核细胞百分比中点。数据显示，在基线时具有单核细胞的hih水平的患者从组合疗法感受到显著更长的pfs益处。
图7图解了从预处理供体获得的血液样品中cd14+hla-drhicd16-单核细胞相对于总活pbmc的百分比，将所述预处理供体分成以下三类之一：(1)健康供体，(2)对组合疗法有响应的nsclc患者，和(3)非响应者，显示了基线、预处理cd14+hla-drhicd16-细胞相对于总外周血单核细胞的百分比的预测和预后意义。
图8图解了在研究期间具有高单核细胞、低单核细胞、证实的部分响应或稳定疾病的患者，显示具有高基线单核细胞的响应者也感受到增强的持久性。
详细说明
选择用于组合疗法的癌症患者的常规方法取决于按照组织学或分子分析评价癌症。本发明公开内容提供了选择用于hdac抑制剂和第二治疗剂的组合疗法的患者的方法，其取决于得自癌症患者的生物样品中作为预测和预后生物标记的cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的外周血单核细胞的水平。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含hdac抑制剂和第二治疗剂的组合疗法的患者的方法，包括：获得来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中总外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的百分比大于5％和40％之间，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含hdac抑制剂和第二治疗剂的组合疗法的患者的方法，包括：获得来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的百分比大于5％，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含hdac抑制剂和第二治疗剂的组合疗法的患者的方法，包括：获得来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞大于10％，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含hdac抑制剂和第二治疗剂的组合疗法的患者的方法，包括：获得来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的百分比大于15％，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含hdac抑制剂和第二治疗剂的组合疗法的患者的方法，包括：获得来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的百分比大于20％，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含hdac抑制剂和第二治疗剂的组合疗法的患者的方法，包括：获得来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的百分比大于约25％，则施用所述组合疗法。
因而，在一个实施方案中，本文提供一种选择用于包含hdac抑制剂和第二治疗剂的组合疗法的患者的方法，包括：获得来自所述患者的外周血样品，其中所述患者被诊断患有癌症；测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量；测量外周血样品中外周血单核细胞的总数；和如果cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的百分比大于约30％，则施用所述组合疗法。
在一些实施方案中，用抗凝血药处理外周血样品。
在一些实施方案中，诊断患有癌症的患者之前已接受治疗。在一些实施方案中，诊断患有癌症的患者之前已接受治疗且进展中。在一些实施方案中，诊断患有癌症的患者之前已接受治疗且发现无响应。在一些实施方案中，之前已接受的治疗选自抗pd-1、抗pd-l1和ctla4阻断治疗。在一些实施方案中，诊断患有癌症的患者从未接受过治疗。
在一些实施方案中，测量外周血样中cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16阴性的细胞的细胞数通过流式细胞术进行。在一些实施方案中，通过细胞表面标记物鉴定外周血单核细胞群。在一些实施方案中，cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16阴性的细胞相对于总pbmc的百分比在至少约1％至100％之间。在一些实施方案中，cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16阴性的细胞相对于总pbmc的百分比在至少约5％至100％之间。在一些实施方案中，cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16阴性的细胞相对于总pbmc的百分比在至少约10％至100％之间。在一些实施方案中，cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16阴性的细胞相对于总pbmc的百分比在至少约15％至100％之间。在一些实施方案中，cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16阴性的细胞相对于总pbmc的百分比在至少约20％至100％之间。在一些实施方案中，所述cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16阴性的细胞的百分比在至少约25％至100％之间。在一些实施方案中，所述cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16阴性的细胞的百分比在至少约30％至100％之间。在一些实施方案中，cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16阴性的细胞在至少约35％至100％之间。在一些实施方案中，所述cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16阴性的细胞的百分比在40％至100％之间。
在一些实施方案中，hdac抑制剂是恩替司他。在一些实施方式中，hdac抑制剂是伏立诺他(saha)。在一些实施方案中，hdac抑制剂是丙戊酸。在一些实施方案中，hdac抑制剂选自贝利司他(pxd101)、laq824、帕比司他(lbh589)、ci994、西达本胺(chidamide)(hbi-8000；
在一些实施方案中，hdac抑制剂是口服施用的。在一些实施方案中，首先施用hdac抑制剂。在一些实施方案中，每周施用hdac抑制剂。在一些实施方案中，每两周施用hdac抑制剂。
在一些实施方案中，第二治疗剂是抗pd-1抗体。在一些实施方案中，所述抗pd-1抗体是派姆单抗(pembrolizumab)。在一些实施方案中，所述抗pd-1抗体是纳武单抗。在一些实施方案中，癌症是肺癌。在一些实施方案中，所述肺癌是非小细胞肺癌、鳞状细胞癌或大细胞癌。在一些实施方案中，癌症是黑素瘤。在一些实施方案中，所述黑素瘤是转移性黑素瘤。
在一些实施方案中，所述第二治疗剂是抗pd-l1抗体。在一些实施方案中，所述抗pd-l1抗体是mpdl3280a。在一些实施方案中，所述抗pd-l1抗体是阿维鲁单抗(avelumab)。在一些实施方式中，抗pd-l1抗体是德瓦鲁单抗(durvalumab)。在一些实施方案中，所述第二治疗剂是mpdl3280a，且所述乳腺癌是三阴性乳腺癌。
在一些实施方案中，所述抗pd-1抗体或抗pd-l1抗体通过输注施用。
在一些实施方案中，第二治疗剂是ctla4-阻断剂。在一些实施方式中，所述ctla4-阻断剂是伊匹单抗。在一些实施方案中，所述ctla4-阻断剂是曲美木单抗(tremelimumab)。
为了便于理解本文所述公开内容，一些术语定义如下。
如本文使用的“进展”指疾病比如癌症，其中所述病症已经恶化或已经扩散到全身。
如本文使用的短语“对其无响应”和“对其没有响应”指所治疗的患者或病症，并且该治疗在预防疾病进展或逆转疾病过程之一或两者中无效。
如本文使用的“异常的细胞生长”指不依赖于正常调节机制(例如，丧失接触抑制)的细胞生长，包括正常细胞的异常生长和异常细胞的生长。
如本文所述的“瘤形成”是异常的、未调节的和紊乱的细胞增殖，其与正常细胞的区别在于自发生长和体细胞突变。随着肿瘤细胞生长和分裂，它们将它们的基因突变和增殖特性传递给后代细胞。肿瘤(neoplasm)或肿瘤(tumor)是肿瘤细胞的累积。在一些实施方案中，所述肿瘤可以是良性的或恶性的。
如本文使用的“转移”指肿瘤细胞经由淋巴管或血管扩散。转移也指肿瘤细胞通过直接蔓延迁移穿过浆膜腔或蛛网膜下腔或其他空间。通过转移过程，肿瘤细胞向身体的其他区域的迁移在远离初始出现部位的区域形成肿瘤。
如本文讨论的“血管发生”在肿瘤形成和转移中是显著的。已经发现血管生成因子与若干实体瘤比如横纹肌肉瘤、视网膜母细胞瘤、尤因肉瘤、神经母细胞瘤和骨肉瘤相关。在无血液供应来提供营养并除去细胞废物的情况下，肿瘤无法扩张。其中血管发生很重要的肿瘤包括实体瘤，比如肾细胞癌、肝细胞癌，和良性肿瘤，比如听神经瘤和神经纤维瘤。血管发生与血液肿瘤比如白血病相关。据信血管发生在引起白血病的骨髓异常中起作用。阻止血管发生可以使癌性肿瘤的生长和由于肿瘤的存在而导致的对受试者的损伤停止。
术语“受试者”指动物，包括但不限于灵长类(例如，人)、牛、绵羊、山羊、马、狗、猫、兔、大鼠或小鼠。术语“受试者”和“患者”在本文提及例如哺乳动物受试者比如人类受试者时可互换地使用。
术语“治疗”指包括减轻或消除障碍、疾病或病症，或与障碍、疾病或病症相关的一种或多种症状；或减轻或消除障碍、疾病或病症本身的病因。
术语“治疗有效量”指当施用时，足以预防所治疗的障碍、疾病或病症的一种或多种症状的发展或减轻至一定程度的化合物的量。术语“治疗有效量”还指足以引发研究者、兽医、医生或临床医师所寻找的细胞、组织、系统、动物或人的生物学或医学应答的化合物的量。
术语“可药用载体”、“可药用赋形剂”、“生理学可接受的载体”或“生理学可接受的赋形剂”指可药用物质、组合物或媒介物，比如液体或固体填充剂、稀释剂、赋形剂、溶剂或包封材料。每种组分从与药物制剂的其他成分相容的意义上来说必须是“可药用的”。它还必须适用于与人和动物的组织或器官接触而无过度的毒性、刺激、变态反应、免疫原性或其他问题或并发症，与合理的受益/风险比相称。参见，remington:thescienceandpracticeofpharmacy,第21版；lippincottwilliams&wilkins:philadelphia,pa,2005；handbookofpharmaceuticalexcipients,第5版；rowe等编著,thepharmaceuticalpressandtheamericanpharmaceuticalassociation:2005；和handbookofpharmaceuticaladditives,第3版；ash和asheds.,gowerpublishingcompany:2007；pharmaceuticalpreformulationandformulation,gibson编著,crcpressllc:bocaraton,fl,2004)。
术语“药物组合物”指本文公开的化合物与其他化学组分比如稀释剂或载体的混合物。所述药物组合物促进了向生物体施用所述化合物。本领域中存在的多种施用化合物的技术包括但不限于口服、注射、气雾剂、胃肠外和局部施用。药物组合物还可通过将化合物与无机酸或有机酸比如盐酸、氢溴酸、硫酸、硝酸、磷酸、甲磺酸、乙磺酸、对甲苯磺酸、水杨酸等反应而获得。
术语“高”当用于描述细胞表面标记物在细胞上的表达时，表示相对于对照细胞而言细胞上细胞表面标记物的表达水平升高。高水平的表达可以为相对于未染色的对照细胞，增加约10倍、增加约100倍、增加约1000倍、增加约10000倍、增加约20倍、增加约200倍、增加约2000倍、增加约20000倍、增加约30倍、增加约300倍、增加约3000倍、增加约30000倍、增加约40倍、增加约400倍、增加约4000倍、增加约40000倍、增加约50倍、增加约500倍、增加约5000倍、增加约50000倍、增加约60倍、增加约600倍、增加约6000倍、增加约60000倍、增加约70倍、增加约700倍、增加约7000倍、增加约70000倍、增加约80倍、增加约800倍、增加约8000倍、增加约80000倍、增加约90倍、增加约2900倍、增加约9000倍、增加约90000倍。
术语“高”水平的表达可以为相对于未染色的对照细胞，增加约10倍至增加约100倍、增加约100倍至增加约1000倍、增加约20倍至增加约200倍、增加约200倍至增加约2000倍、增加约30倍至增加约300倍、增加约300倍至增加约3000倍、增加约40倍至增加约400倍、增加约400倍至增加约4000倍、增加约50倍至增加约500倍、增加约500倍至增加约5000倍、增加约60倍至增加约600倍、增加约600倍至增加约6000倍、增加约70倍至增加约700倍、增加约700倍至增加约7000倍、增加约80倍至增加约800倍、增加约800倍至增加约8000倍、增加约90倍至增加约9300倍、增加约900倍至增加约9000倍。
高水平的表达可以为相对于未染色的对照细胞，增加约1个数量级(101)、增加约2个数量级(102)、增加约3个数量级(103)、增加约4个数量级(104)、增加约5个数量级(105)。
癌症、肿瘤、肿瘤相关病症以及肿瘤性疾病状态是严重的且通常威胁生命的病症。这些疾病和病症(其特征在于快速增殖的细胞生长)仍然是旨在鉴定在其治疗中有效的治疗剂的研究工作的对象。这样的药剂可延长患者的生存期、抑制与肿瘤相关的快速增殖的细胞生长或实现肿瘤的消退。
hdac抑制剂
hdac抑制剂是新出现的一类通过染色质重塑和基因表达调节促进血液和实体恶性肿瘤分化和凋亡的治疗剂。hdac抑制剂可以大致分为泛hdac抑制剂和选择性hdac抑制剂。尽管已知的hdac抑制剂具有很大的结构多样性，但它们具有共同的特征：与酶活性位点相互作用的部分和位于通向活性位点的通道内的侧链。这可以用氧肟酸盐比如saha看出，其中氧肟酸基被认为与活性位点相互作用。就缩肽类而言，据信二硫键的细胞内还原产生连接到4-碳烯基链的游离巯基(其与活性位点相互作用)。hdac抑制剂之间的差异在于它们与hdac通道边缘的相互作用，hdac通道边缘位于相对于活性位点的通道的另一端。正是在hdac抑制剂和通道边缘之间的这种相互作用，至少部分上，被认为是解释了一些观察到的泛-hdac抑制剂(比如saha)和选择性hdac抑制剂(比如缩肽)之间的hdac选择性差异。
已经鉴定了几种hdac抑制剂，包括苯甲酰胺(恩替司他)、短链脂肪酸(即，苯丁酸钠)；异羟肟酸(即，辛二酰苯胺异羟肟酸和曲古抑菌素a)；含有2-氨基-8-氧代-9,10-环氧-癸酰基部分的环状四肽(即trapoxina)和不含2-氨基-8-氧代-9,10-环氧-癸酰基部分的环肽(即，fk228)。特别优选的hdac抑制剂是恩替司他。恩替司他的化学名称为n-(2-氨基苯基)-4-[n-(吡啶-3-基)甲氧羰基氨基-甲基]-苯甲酰胺，其化学结构如下所示。
恩替司他的化学结构
恩替司他是一种在多种类型的实体瘤和血液癌症中进行了临床研究的苯甲酰胺hdac抑制剂。恩替司他被快速吸收，半衰期为约100小时，重要的是，在施用恩替司他之后，组蛋白乙酰化的变化持续数周。
i类hdac抑制剂恩替司他显示出有前景的活性。新出现的临床前工作表明恩替司他对免疫抑制细胞(包括调节性t细胞(treg)和骨髓衍生的抑制细胞(mdsc))具有免疫调节作用，并且与免疫检查点阻断剂组合可适度根除免疫原性小鼠肿瘤。该活性显示是经由msdc的还原介导的(kimetal.,pnas2014,111:11774-9)。这些结果可以通过恩替司他对那些1类hdac酶的选择性靶向来解释，所述酶已经显示在treg(shenetal.plosone2012,7:e30815；wangetal.jci2015,125:1111-1123)和mdscs(younetal.nat.immunol2013,14:211–220)的分化和活化中起作用。
方法和结果也描述在tomita等，“表观遗传疗法和免疫在局部复发或转移性雌激素受体阳性乳腺癌中的相互作用：encore301的相关分析，依西美坦与或不与恩替司他的随机、安慰剂对照的ii期试验(“theinterplayofepigenetictherapyandimmunityinlocallyrecurrentormetastaticestrogenreceptor-positivebreastcancer:correlativeanalysisofencore301,arandomized,placebo-controlledphaseiitrialofexemestanewithorwithoutentinostat”),oncoimmunology,taylorandfrancisonline,2016，将其全部内容通过援引加入本文。
总之，得自在encore301中用恩替司他和依西美坦联合治疗的er+乳腺癌患者的血样数据提供了患者中hdaci-介导的免疫抑制性mdsc减少和免疫活性cd14+hla-drhi单核细胞增加的第一证据。这些发现可部分解释改善的总体存活，并且为恩替司他与免疫检查点阻断的计划组合研究提供强有力的理论基础。
在恩替司他治疗的患者中mdsc的减少与最近公开的临床前工作(kim等，pnas2014)一致，证明恩替司他能够通过减少mdsc来增强免疫检查点抑制剂的抗肿瘤活性。
免疫疗法的最新进展突出了免疫检查点抑制的抗肿瘤作用。恩替司他显示免疫调节活性，包括靶向肿瘤微环境中的免疫抑制细胞，如在orillion等，“entinostatneutralizesmyeloid-derivedsuppressorcellsandenhancestheantitumoreffectofpd-1inhibitioninmurinemodelsoflungandrenalcellcarcinoma”,clinicalcancerresearch,americanassociationforcancerresearch,23(2017)；第5187–5201页中所述，将其全部内容通过援引加入本文。据发现恩替司他通过减少肿瘤生长和增加存活而增强了pd-1抑制在两种同基因小鼠肿瘤模型中的抗肿瘤作用。
组蛋白脱乙酰酶
hdac是包括至少十八种酶的家族，分为三类(i类、ii类和iii类)。i类hdac包括但不限于hadc1、2、3和8。i类hdac可以在细胞核中被发现并被认为与转录控制阻遏物有关。ii类hdac包括但不限于hdac4、5、6、7和9，且可在细胞质以及细胞核中被发现。iii类hdac被认为是nad依赖性蛋白质，并且包括但不限于sirtuin蛋白家族成员。sirtuin蛋白的非限制性实例包括sirt1-7。如本文使用的，术语“选择性hdac”指与所有三个hdac类不相互作用的hdac抑制剂。
程序性细胞死亡-1(pd-1)
pd-1是t细胞调节剂cd28家族成员的细胞表面受体，在免疫球蛋白超家族受体之内。人pd-1基因位于染色体2q37上，全长pd-1cdna编码与鼠科动物pd-1具有60％的同源性的具有288个氨基酸残基的蛋白质。它在胸腺发育期间存在于cd4-cd8-(双阴性)胸腺细胞上，且在长期抗原暴露之后，在成熟造血细胞比如t和b细胞、nkt细胞和单核细胞中活化下表达。
不受任何理论的束缚，预期配体pd-l1结合pd-1下调效应物抗-肿瘤t-细胞的活性，且促进免疫逃避。这得到了在包括胃癌、卵巢癌、肺癌和肾癌的几个肿瘤类型中pd-1/pd-l1的表达和预后不良之间的相关性发现的支持。已经报道了在黑素瘤中pd-1主要地由肿瘤浸润性t淋巴细胞表达。
pd-1特异性抗体对pd-1阻断的体外研究显示，增强了细胞毒性t-细胞对黑素瘤特异性抗原的应答，包括增加ifn-γ分泌抗原特异性细胞的频率。
不受任何理论的束缚，预期靶向pd-1可以作为癌症的有效治疗策略。临床上靶向pd-1的主要方法是通过抑制pd-1或pd-l1的功能的基因工程化单克隆抗体的发展。
也显示出pd-l1结合b7-1(cd80)，一种还抑制t-细胞增殖和细胞因子产生的相互作用；然而，pd-l1:pd-1和pd-l1：b7-1途径在癌症中的确切相对贡献仍然不清楚。目前研究中的pd-1-靶向试剂同时抑制两种途径。然而，由于pd-1和b7-1的结合位点是相邻的而不是重叠的，可以潜在地研究特异性靶向一种或另一种的试剂。
癌细胞驱动pd-l1在其表面上高水平表达，允许抑制性pd-1受体在浸润肿瘤微环境的任何t细胞上活化，有效地切换了那些细胞(switchingthosecellsoff)。实际上，已经证实在许多不同的癌症类型(例如，黑素瘤[40％-100％]、nsclc[35％-95％]和多发性骨髓瘤[93％])中pd-l1的表达水平上调，高水平的pd-l1表达与临床疗效差有关。而且，肿瘤-浸润性t细胞已经显示出比浸润正常组织的t细胞表达显著更高水平的pd-1。据认为肿瘤微环境可以分泌促炎细胞因子(包括干扰素-γ(ifnγ))，以上调pd-1在肿瘤-浸润性t细胞上的表达，确保其可以响应pd-l1在所述肿瘤上高水平的表达。
派姆单抗
派姆单抗是一种人源化的单克隆igg4抗pd-1抗体，其由移植到具有用于稳定化的工程化的fc区域的人igg4免疫球蛋白分子上的高亲和性小鼠抗pd-1衍生的可变区组成。已经在多种肿瘤类型的动物模型中证实了临床前抗肿瘤活性。在患有晚期难治性恶性肿瘤的患者中，最初和4周之后及然后每两周静脉内给予剂量水平1、3和10mg/kg进行人类首次、i期剂量递增研究。观察到的最大毒性为2级瘙痒，并且没有观察到任何药物相关的3级或更大的不良事件(ae)。因此，没有达到最大耐受剂量。半衰期为13.6-21.7天，且显然不是剂量相关的。四名患者具有一些肿瘤退化。然后，将该研究扩大，在非随机的群组中，患者每2周接受10mg/kg的派姆单抗或每3周接受2或10mg/kg的派姆单抗；总共，有135名患有黑素瘤的患者。招募包括48名患者，其之前接受伊匹单抗(ipilimumab)，但是没有经历严重的免疫相关不良事件(irae)。尽管79％的患者患有某些ae，但是仅有13％患有重度(3级或4级)药物相关的毒性，包括皮疹或瘙痒、疲劳、腹泻、腹痛和肝功能失常。最高比率的严重毒性(23％)出现在接受最高剂量(每2周10mg/kg)的那些中，与之相对，在较小剂量强度群中<10％。自身免疫性质的潜在的ae包括肺炎、肾损伤、肝炎、腹泻、甲状腺功能减退、甲状腺功能亢进和肾上腺功能不全的孤立实例。基于免疫相关应答标准的总体客观响应率(orr)为38％(117中的44)，8名另外的患者感受到未证实的响应。总共77％具有一定程度的肿瘤退化，包括8名患者的疾病稳定超过24周。大部分的响应是由在第12周首次放射学评价的时间确定的。中位无进展生存期超过7个月。应答肿瘤的活组织检查显示被cd8+t细胞稠密浸润。
mpdl3280a
mpdl3280a是一种含有工程化可结晶片段(fc)结构域的人抗-pd-l1mab，其被设计成通过最小化抗体-依赖性细胞的细胞毒性(adcc)优化功效和安全性。不受任何特定理论的束缚，应当理解该结构允许抑制pd-1/pd-l1相互作用，同时使有效的抗肿瘤免疫应答所需的活化t细胞的adcc-介导的耗尽最少。
已经在患有局部晚期或转移性实体瘤的患者的i期试验中评价了mpdl3280a。迄今为止，已经募集了总共175名患者。以≤1、3、10、15和20mg/kg的递增剂量施用作为单一试剂的抗体达127天的中值持续时间。还报道了两个扩展群组(expansioncohorts)的结果：一个群组85名患者(其中53名患者用于评价功效)患有鳞状或非鳞状nsclc，一个群组45名转移性黑素瘤患者(其中35名患者用于评价功效)。在两个群组中，每3周施用≤1、10、15和25mg/kgmpdl3280a的剂量至多1年。mpdl3280a表现出持久的应答且是良好耐受的；将功效数据概括在表1中。在nsclc群组的85名患者中，55％用至少三种之前的治疗剂大程度预治疗过(heavilypretreated)，并且81％为吸烟者或既往吸烟者，19％是从未吸烟者。在鳞状细胞nsclc中，24周pfs比率为44％，在非鳞状细胞nsclc中，其为46％。
阿维鲁单抗
阿维鲁单抗(msb0010718c)是目前在临床试验中正在研究的完全人抗pd-l1igg1抗体。除了破坏由肿瘤细胞上的pd-l1与肿瘤浸润性免疫细胞上的pd-1结合诱导的免疫抑制信号传导之外，阿维鲁单抗被设计为介导抗体依赖性细胞毒性(adcc)。使用全外周血单核细胞(pbmc)或纯化的自然杀伤(nk)细胞作为效应物，已经评估了阿维鲁单抗诱导人癌细胞裂解的能力。
在最近研究中(kwong-yoktsang等人，antibodydependentcellularcytotoxicityactivityofanovelanti-pd-l1antibody,avelumab(msb0010718c),onhumantumorcells，2015asco年会，jclinoncol33,2015(supp；abstr3038))，使用pbmc作为效应物，发现阿维鲁单抗在18种人癌细胞系中的8种中诱导adcc。进一步，发现肿瘤细胞裂解与pd-l1阳性肿瘤细胞的百分比正相关。pd-l1阳性肿瘤细胞的百分比报告为使用流式细胞术测定的平均荧光强度(mfi)。当nk细胞用作效应物时，裂解作用增强。用ifn-γ预处理肿瘤细胞系增加pd-l1表达，但在10个细胞系中仅4个细胞系中增加裂解。然而，用il-12预活化nk细胞增加了裂解，表明通过将阿维鲁单抗与基于il-12的疗法组合具有协同作用的潜力。在nk介导的adcc测定法中，相对于完整pbmc或从pbmc分离的树突细胞，观察到很少或没有裂解。使用nk细胞和阿维鲁单抗通过adcc裂解对cd8+t细胞裂解不敏感的肿瘤细胞系。总之，研究发现阿维鲁单抗经由adcc诱导许多人肿瘤细胞系的裂解，需要进一步的临床试验来确定诱导adcc裂解肿瘤的其它机制是否会导致与没有adcc活性的类似试剂相比临床活性的提高。
ctla4-阻断抗体
细胞毒性t淋巴细胞相关抗原4(ctla4)是一种t细胞表面分子，其最初是通过对鼠溶细胞性t细胞cdna文库的差异筛选而鉴定的。ctla4也是免疫球蛋白(ig)超家族的成员；ctla4包含单个细胞外ig结构域。已经在具有细胞毒性活性的t细胞群中发现了ctla4转录产物，表明ctla4可能在细胞溶解反应中起作用。抗-ctla-4抗体显示了在已经免疫接种来自病原体的保护性抗原例如癌抗原或来自感染原的抗原的受试者中增加保护性免疫的量级的能力。已经描述了抗ctla4的抗体用于治疗癌症。特别地，对于使用抗ctla的拮抗性抗体比如伊匹单抗(fda于2011年批准用于黑素瘤)和曲美木单抗(fda未批准)阻断ctla4的治疗益处的兴趣日益增加，所述拮抗性抗体作为抑制免疫系统对肿瘤耐受的手段，从而为癌症患者提供潜在有用的免疫治疗策略。
肺癌
在美国和全世界，肺癌是女性和男性癌症死亡的主要原因。肺癌已经超过了乳腺癌，成为女性癌症死亡的主要原因。2014年，在美国，估计有158,040人死于肺癌，其比因结肠癌和直肠癌、乳腺癌和前列腺癌加在一起死亡人数还要多。虽然早期诊断出肺癌的存活率较高，约49％的人活了五年或更久，但是在确诊5年之后，那些经诊断肺癌已经扩散到身体其他部位的那些患者中只有约2％还活着。
当正常细胞经历转变，导致它们生长和繁殖不受控制，癌症就发生了。细胞形成与其出现的周围组织不同的肿块或肿瘤。肿瘤是危险的，因为它们从健康细胞中摄取氧气、营养物质和空间，并且因为它们侵入和破坏或降低正常组织功能的能力。
大多数肺肿瘤是恶性的。这意味着它们会侵入和破坏其周围的健康组织，并且可以扩散到整个身体。肿瘤可以扩散到附近的淋巴结或通过血液扩散到其他器官。这个过程称为转移。当肺癌转移时，肺中的肿瘤被称为原发性肿瘤，并且身体其他部位的肿瘤被称为继发性肿瘤或转移性肿瘤。
肺中的一些肿瘤是从身体其它地方的癌症转移的。肺是转移的常见部位。如果是这种情况，癌症不被认为是肺癌。例如，如果前列腺癌经血液扩散到肺部，则它是肺中的转移性前列腺癌(继发性癌症)，并且不称为肺癌。
肺癌包括一组不同类型的肿瘤。肺癌通常分为两个主要组，占所有病例的约95％。分组是基于构成癌症的细胞类型。两种主要类型的肺癌的特征在于当在显微镜下观察时肿瘤的细胞大小。它们被称为小细胞肺癌(sclc)和非小细胞肺癌(nsclc)。nsclc包括几种肿瘤亚型。sclc较不常见，但其生长较快且比nsclc更可能转移。通常，当诊断出癌症时，sclc已经扩散到身体的其它部分。约5％的肺癌属于罕见的细胞类型，包括类癌瘤、淋巴瘤和其它类型。如本文使用的术语“肺癌”包括但不限于sclc、nsclc、类癌瘤、淋巴瘤及其各种亚型。
非小细胞肺癌
nsclc是一种肺癌，其不是小细胞癌(燕麦细胞癌)类型。术语“非小细胞肺癌”适用于各种类型的支气管癌(由支气管的内层引起的那些)。nsclc的具体类型的实例包括但不限于腺癌、鳞状细胞癌和大细胞癌(即大细胞未分化癌)。
腺癌是在器官的内层或内表面中发展的癌症。腺癌是最常见的肺癌类型，占所有肺癌病例的30％-40％。腺癌的亚型被称为支气管肺泡细胞癌，其在胸部x射线上产生肺炎样外观。
鳞状细胞癌是一种在鳞状细胞中开始的癌症。鳞状细胞是薄的、扁平的细胞，在显微镜下观察时像鱼鳞一样。鳞状细胞存在于形成皮肤表面、身体中空器官的内层以及呼吸道和消化道的通道的组织中。鳞状细胞癌可能出现在这些组织的任何一个中。鳞状细胞癌是第二常见类型的肺癌，占所有病例的约30％。
大细胞癌没有显示鳞状或腺体成熟的证据。因此，当已经排除所有其他可能性时，这些肿瘤通常被默认诊断。在活组织检查之前，这些肿瘤缺乏任何诊断特征来表明其诊断。它们倾向于快速增长，早期转移，并且与吸烟有很大关系。大细胞肿瘤通常体积大、笨重、界限分明、有广泛性出血和坏死的粉红灰色肿块。尽管它们通常有中央坏死，但是它们很少有空腔。它们倾向于出现在中部到外周肺部区域。它们可能会在局部扩展，以牵涉节段或亚节段(subsegmental)支气管。大细胞癌的一个变体是巨细胞癌。这种亚型特别具有侵害性，预后非常差。这些肿瘤通常表现为大的外周肿块，并有局部坏死的部分。它们不牵涉大气道，除非直接延伸。大细胞癌占所有肺癌病例的10％-20％。
黑素瘤
黑素瘤是黑素细胞的恶性肿瘤，其是制造色素黑色素且来源于神经嵴的细胞。虽然大多数黑素瘤出现在皮肤中，但是它们也可能来自粘膜表面或神经嵴细胞迁移到的其他部位，包括葡萄膜(uvealtract)。葡萄膜黑素瘤(uvealmelanomas)与皮肤黑素瘤的发生率、预后因素、分子特征和治疗显著不同。
2014年，在美国，估计有9,710人死于黑素瘤，新病例的数量估计为76,100人。皮肤癌是美国诊断的最常见的恶性肿瘤，每年在200万人中诊断出350万例癌症。黑色瘤占皮肤癌的5％以下，但导致大多数死亡。过去四十年来，发病率一直在上升。老年男子风险最高；然而，黑素瘤是25至29岁的青年人中最常见的癌症，是15至29岁年龄的那些人中第二大常见癌症。眼部黑素瘤是眼睛中最常见的癌症，每年诊断约2000例。
黑素瘤主要发生在成年人中，超过50％的病例出现在表面正常的皮肤区域。虽然黑素瘤可以发生在任何地方，包括在粘膜表面和葡萄膜上，但是女性黑素瘤更常见于四肢，而在男性中，其最常见于躯干或头颈部。
预测受原发性肿瘤和转移性肿瘤的特征的影响。最重要的预测因素包括但不限于下述因素：黑素瘤侵袭的厚度或水平、有丝分裂指数(定义为每毫米有丝分裂)、主要部位的溃疡或出血、牵涉的局部淋巴结数、具有大转移和微转移的区别、全身转移、局部—非内脏对肺与所有其他内脏部位、升高的血清乳酸脱氢酶水平。不受任何理论的束缚，预期肿瘤浸润性淋巴细胞的存在可能是潜在的预测因素。
乳腺癌
乳腺癌是从乳腺组织发展的癌症。乳腺癌的症状可以包括乳腺块、乳腺形状的变化、皮肤凹痕、来自乳头的分泌液或皮肤的红色鳞状斑。在该疾病远端扩散的那些中，可能存在骨骼疼痛、淋巴结肿胀、呼吸困难或黄疸。乳腺癌的后果根据癌症类型、疾病范围和受试者年龄而变化。在世界范围内，乳腺癌是女性的主要癌症类型，占所有病例的25％。在2012年，其导致168万病例且522,000例死亡。在发达国家，其更为常见，在女性中比在男性中更常见高达100倍。乳腺癌由若干分级体系进行分类。这些体系的每一种都可影响预后且可影响治疗。乳腺癌一般主要通过其组织学外观进行分类。大多数乳腺癌来源于上皮细胞内壁导管或小叶，这些癌症被分类为导管或小叶癌。原位癌是在特定组织隔室，比如乳导管内的低级癌或癌前细胞的生长而没有侵入周围组织。相反，浸润癌不会将其自身限制在初始组织隔室中。
使用tnm系统的乳腺癌分期是基于肿瘤的尺寸(t)，无论肿瘤是否扩散到相邻的淋巴结(n)，以及无论肿瘤是否转移(m)到更远的身体部分。较大尺寸、节扩散和转移具有较大级数和较差预后。主要阶段为0阶段、1-3阶段和4阶段。0阶段是癌前或标记病症，原位导管癌(dcis)或原位小叶癌(lcis)。1-3阶段处于乳腺或局部淋巴结之内。4期为具有较不利预后的转移性癌症。
乳腺癌在其表面上及其细胞质和细胞核中具有受体。化学信使比如激素结合受体，这导致细胞变化。乳腺癌细胞可具有或不可具有三个重要的受体：雌激素受体(er)、孕激素受体(pr)和her2。这导致乳腺癌分裂成激素受体-阳性乳腺癌或er-/pr-阳性乳腺癌、her2-阳性乳腺癌和三阴性乳腺癌，其对于er、pr和her2是阴性的。
在乳腺癌中，骨髓衍生的抑制细胞已经显示出具有若干重要的临床相关性。在乳腺癌的预诊断模型中，骨髓衍生的抑制细胞水平与肿瘤尺寸正相关，且与t细胞反相关。在临床中，在转移性乳腺癌中，循环骨髓衍生的抑制细胞的基线水平与疾病负载、转移性扩散和生存期减少相关。在her2-阴性乳腺癌中，已经显示循环骨髓衍生的抑制细胞的基线水平与对于辅助化疗的响应相关，水平增加指示化疗的响应较差。
激素受体-阳性乳腺癌
激素，比如雌激素和黄体酮，促进激素受体-阳性的癌症生长。约2/3的乳腺癌是激素受体-阳性的，因为它们含有激素雌激素(er-阳性乳腺癌)或黄体酮(pr-阳性乳腺癌)的受体。由于这些乳腺癌依赖于激素生长，治疗剂被设计用于降低雌激素水平或中止乳腺癌细胞的雌激素活性。
中止雌激素活性的治疗剂的非限制性实例包括他莫昔芬、托瑞米芬和氟维司群。他莫昔芬阻断雌激素结合乳腺癌细胞中的雌激素受体。虽然他莫昔芬在乳腺细胞中起抗-雌激素作用，但是其在其它组织如子宫和骨骼中起雌激素作用。因为其在某些组织中起雌激素作用，但是在其它组织中起抗雌激素作用，所以其被称为选择性雌激素受体调节剂(serm)。托瑞米芬是另一种被批准治疗转移性乳腺癌的serm。氟维司群是一种首先阻断雌激素受体且触发其降解的药物。氟维司群不是serm，因为其在整个体内起抗-雌激素作用。氟维司群用于治疗其它激素治疗剂例如他莫昔芬已经停止作用之后的转移性乳腺癌。
芳香酶抑制剂(ai)在绝经后女性中起阻断雌激素产生的作用。芳香酶抑制剂通过阻断芳香酶起作用，芳香酶转化脂肪组织和脑产生的雄激素。芳香酶抑制剂的非限制性实例包括来曲唑、阿那曲唑和依西美坦。
三阴性乳腺癌
三阴性乳腺癌，特征是不表达雌激素受体(er)、孕激素受体(pr)或her-2基因的肿瘤，代表一种重要的临床挑战，因为这些癌症不会响应内分泌疗法或其它可获得的靶标试剂。三阴性乳腺癌的转移潜能与其它乳腺癌亚型的类似，但是这些肿瘤与复发和死亡的中值时间较短相关。因此，一个重要的目标是预测因素和标记物的鉴别，以可靠地选择患有三阴性疾病的高风险和低风险患者亚群，用于对特定试剂具有差别应答的不同亚型治疗方法。然而，可靠的预测标记物难以找到，并且标记物不一定总是有用。例如，已经研究了表皮生长因子受体(egfr)，但是关于就预后而言egfr表达水平的标准测定或临界值仍然没有达成一致。类似地，因为三阴性状况有时用作基底样乳腺癌的替代，已经研究了特定的基底标记物。实际上，设计成使用er/pr和her-2阴性获得(accrue)患有基底样乳腺癌的患者的试验仅可以提供接近三阴性群体，并且有时使用更特定的指示物如ck5/6、egfr状态等再分析，再次被不一致性破坏(marredbydiscordances)。
化疗仍然是治疗三阴性乳腺癌的主要支柱，但是如果要做出任何临床显著的进步，今后几年仍然需要克服重要的限制。目前用于三阴性疾病的治疗策略包括蒽环类、紫杉烷类、伊匹沙隆(ixabepilone)、铂剂和生物试剂。最近，已经提出egfr抑制是三阴性乳腺癌的一种治疗机制，也产生了联合结果。在这些患者或其亚群中，也提出了靶向聚(adp-核糖)聚合酶和雄激素受体的试剂，并且进行中的试验给出了关于这些试剂在三阴性疾病中的价值的明确指导。从er和her-2两者表达的角度来看，三阴性乳腺癌显然是一种不同的临床亚型，但是需要进一步细分。目前，尚不存在三阴性乳腺癌中的目标于最典型的脆弱性(definingvulnerability)的明确的、已证实的有效单一试剂。
三阴性乳腺癌的各种亚型包括基底样tnbc(基底样1和2(bl-1，bl-2)，免疫调节(im))和间充质干细胞样三阴性乳腺癌(msl)，和腔雄激素受体(lar)亚型。
pd-l1表达在包括肾细胞癌、胰腺癌、卵巢癌、胃癌、食管癌和肝细胞癌的许多癌症上。研究已经鉴定了pd-l1的表达为50％(乳腺癌研究中评价的44个肿瘤中的22个)。在15个(34％)中，其限于肿瘤上皮细胞，而在18个(41％)中，其在肿瘤浸润淋巴细胞中被鉴定出。而且，据发现pd-l1的瘤内表达与高组织学等级和阴性激素受体状况有关。与上述研究一致，也在一个单独的研究中约20％的tnbc肿瘤表达pd-l1。这些tnbc肿瘤中的大多数(95％)为3级。
不受任何特定理论的束缚，假设肿瘤可以通过其驱动pd-l1表达的一个可能机制是通过致癌信号转导通路。这首先在成胶质细胞瘤中得到证实，其中可以观察到pten损失与pd-l1的表达增加有关，表明涉及pi3k通路。因为通常在tnbc中观察到pten损失，所以一项研究研究了pten和pd-l1表达之间的关系。在其中存在＞5％的pd-l1表达的乳腺癌组织微点阵中包括的约50％tnbc肿瘤中，观察到pten染色损失。类似地，在tnbc细胞系的组中，据发现具有pten损失的两个示例性的细胞系mda-mb-468和bt-549都具有高细胞表面pd-l1表达。总之，这些数据表明在tnbc中可能存在多种pd-l1调节机制。
卵巢癌
在世界范围内，卵巢癌是全世界女性第八最常见的癌症，估计每年225,500名新诊断者，且估计每年140,200人死亡。
卵巢肿瘤有三种基本类型：上皮、生殖细胞和基质细胞肿瘤。上皮肿瘤从覆盖卵巢外表面的细胞开始；大多数卵巢肿瘤是上皮细胞肿瘤。生殖细胞肿瘤从产生卵的细胞开始。基质肿瘤从将卵巢保持在一起并产生雌性激素的细胞开始。卵巢癌的一个重要危险因素包括经由同源重组的dna修复缺陷，例如brca1或brca2基因中的突变。这些基因最初在具有多个乳腺癌病例的家族中鉴定，但与约5至10％的卵巢癌相关。
卵巢癌的可能治疗包括手术、免疫疗法、化疗、激素疗法、放疗或其组合。用于治疗卵巢癌的外科手术包括减积(debulking)，和单侧或双侧卵巢切除术和/或单侧或双侧输卵管切除术。也已经用于治疗卵巢癌的抗癌药物包括环磷酰胺、依托泊苷、六甲蜜胺和异环磷酰胺。使用药物他莫昔芬的激素疗法也用于缩小卵巢肿瘤。放疗任选地包括外粒子束放疗疗和/或近距疗法。大多数新诊断的卵巢癌患者已显示对一线铂基和紫杉醇化疗有响应。然而，50-80％的对该组合疗法有响应的患者最终会复发。参见例如herzog，“updateontheroleoftopotecaninthetreatmentofrecurrentovariancancer”，theoncologist7(suppl.5)：3-10(2002)。患有晚期卵巢癌的女性由于疾病复发而具有差的长期存活，并且大多数在5年内死亡。在铂治疗的6个月内复发的卵巢癌代表了对治疗具有低响应率(～10％-25％)的异质疾病谱(heterogeneousspectrumofdisease)，通常持续时间短。试图鉴定将对特定药物有响应的患者是具有挑战性的。显然需要改善目前用于复发性卵巢癌的治疗选择。
如本文使用的术语“大程度预治疗过的复发性卵巢癌”和“铂耐药性卵巢癌”指已经用使用比如顺铂、吉西他滨、卡铂的试剂的一轮或多轮铂基化疗治疗的卵巢癌。
pd-l1表达在包括肾细胞癌、胰腺癌、卵巢癌、胃癌、食管癌和肝细胞癌的许多癌症上。已经表明，在恶性卵巢癌患者的腹水和血液中的单核细胞上的pd-l1表达显着高于患有良性/边界疾病(borderlinedisease)的患者，在这些组之间的值没有重叠。此外，最近研究表明大多数卵巢癌通过表达pd-l1逃避宿主免疫系统并加速肿瘤生长。因此，推测pd-1/pd-l途径可能是卵巢癌免疫疗法的潜在靶标。
选择用于组合疗法的患者的方法
在某些实施方案中，本公开内容的方法包括测量cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞，并测量外周血单核细胞，以确定向诊断患有癌症的患者施用组合疗法。
在一些实施方案中，所述方法进一步包括如果cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞在总外周血单核细胞中的百分比大于约20％，则选择所述患者用于组合疗法。
在一些实施方案中，所述方法进一步包括选择从之前治疗进展的患者。
在一些实施方案中，所述方法进一步包括选择包含恩替司他和第二治疗剂的组合疗法。
第二治疗剂的非限制性实例包括抗-pd-1抗体，例如纳武单抗和派姆单抗；抗-pd-l1抗体，比如mpdl3280a；ctla4-阻断抗体，例如伊匹单抗和曲美木单抗。癌症的非限制性实例包括肺癌，例如，非小细胞肺癌、鳞状细胞癌和大细胞癌瘤(即，大细胞未分化癌)。在一些实施方案中，第二治疗剂为派姆单抗，且癌症为肺癌。在一些实施方案中，第二治疗剂为派姆单抗，且乳腺癌为非小细胞肺癌。在一些实施方案中，第二治疗剂为派姆单抗，且癌症为黑素瘤。
在一些实施方案中，口服施用恩替司他。在一些实施方案中，口服施用恩替司他，并且通过输注施用抗-pd-1抗体、抗-pd-l1抗体或ctla4-阻断抗体。输注的非限制性实例包括皮下输注、静脉内输注、腹膜内输注和通过渗透泵输注。
在一些实施方案中，在组合疗法中首先施用恩替司他。在一些实施方案中，每周施用恩替司他。在某些实施方案中，每两周施用恩替司他。
可以约每天、约每两天、约每三天、约每四天、约每五天、约每六天、约每周、约每两周、约每三周、约每四周、约每月、约每五周、约每六周、约每七周、约每八周或约每两个月施用恩替司他、抗-pd-1抗体、抗-pd-l1或ctla4-阻断抗体。可以约每天至约每两天、约每两天至约每三天、约每三天至约每四天、约每四天至约每五天、约每五天至约每六天、约每六天至约每周、约每周至约每两周、约每两周至约每三周、约每三周至约每四周、约每四周至约每个月、约每个月至约每五周、约每五周至约每六周、约每六周至约每七周、约每七周至约每八周或约每八周至约每两个月施用恩替司他、抗-pd-1抗体、抗-pd-l1或ctla4-阻断抗体。
在一些实施方案中，通过获得外周血样品，循环并分别测量外周血中的cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞和外周血单核细胞。在一些实施方案中，将外周血样品收集并转移到含有抗凝血药的容器中。抗凝血药的非限制性实例包括肝素、肝素钠、草酸钾、edta和柠檬酸钠。在一些实施方案中，用红细胞裂解剂处理外周血样品。在一些实施方案中，测量活组织检查中的外周血单核细胞。
在一些实施方案中，测量外周血样品中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞和外周血单核细胞的数量，并确定cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于外周血单核细胞的百分比。
在一些实施方案中，使用cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞相对于总外周血单核细胞的百分比选择用于施用包含hdac抑制剂和第二治疗剂的组合疗法的患者。
cd14-阳性
在一些实施方案中，外周血样品或组织活组织检查中cd14-阳性的细胞相对于总外周血单核细胞的百分比为至少约5％、至少约6％、至少约7％、至少约8％、至少约9％、至少约10％、至少约11％、至少约12％、至少约13％、至少约14％、至少约15％、至少约16％、至少约17％、至少约18％、至少约19％、至少约20％、至少约21％、至少约22％、至少约23％、至少约24％、至少约25％、至少约26％、至少约27％、至少约28％、至少约29％、至少约30％、至少约31％、至少约32％、至少约33％、至少约34％、至少约35％、至少约36％、至少约37％、至少约38％、至少约39％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约60％、至少约70％、至少约80％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％。
在一些实施方案中，外周血样品或组织活组织检查中cd14-阳性的细胞相对于总外周血单核细胞的百分比为约10％至约20％、约10％至约25％、约10％至约30％、约10％至约35％、约10％至约40％、约10％至约45％、约10％至约50％、约15％至约20％、约15％至约25％、约15％至约30％、约15％至约35％、约15％至约40％、约15％至约45％、约15％至约50％、约20％至约25％、约20％至约30％、约20％至约35％、约20％至约40％、约20％至约45％、约20％至约50％、约25％至约30％、约25％至约35％、约25％至约40％、约25％至约45％、约25％至约50％、约30％至约35％、约30％至约40％、约30％至约45％、约30％至约50％、约35％至约40％、约35％至约45％、约35％至约50％、约40％至约45％、约40％至约50％、约45％至约50％。
hla-dr-高
在一些实施方案中，外周血样品或组织活组织检查中hla-dr-高的细胞相对于总外周血单核细胞的百分比为至少约5％、至少约6％、至少约7％、至少约8％、至少约9％、至少约10％、至少约11％、至少约12％、至少约13％、至少约14％、至少约15％、至少约16％、至少约17％、至少约18％、至少约19％、至少约20％、至少约21％、至少约22％、至少约23％、至少约24％、至少约25％、至少约26％、至少约27％、至少约28％、至少约29％、至少约30％、至少约31％、至少约32％、至少约33％、至少约34％、至少约35％、至少约36％、至少约37％、至少约38％、至少约39％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约60％、至少约70％、至少约80％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％。
在一些实施方案中，外周血样品或组织活组织检查中hla-dr-高的细胞相对于总外周血单核细胞的百分比为约10％至约20％、约10％至约25％、约10％至约30％、约10％至约35％、约10％至约40％、约10％至约45％、约10％至约50％、约15％至约20％、约15％至约25％、约15％至约30％、约15％至约35％、约15％至约40％、约15％至约45％、约15％至约50％、约20％至约25％、约20％至约30％、约20％至约35％、约20％至约40％、约20％至约45％、约20％至约50％、约25％至约30％、约25％至约35％、约25％至约40％、约25％至约45％、约25％至约50％、约30％至约35％、约30％至约40％、约30％至约45％、约30％至约50％、约35％至约40％、约35％至约45％、约35％至约50％、约40％至约45％、约40％至约50％、约45％至约50％。
cd16-阴性
在一些实施方案中，外周血样品或组织活组织检查中cd16-阴性的细胞相对于总外周血单核细胞的百分比为至少约5％、至少约6％、至少约7％、至少约8％、至少约9％、至少约10％、至少约11％、至少约12％、至少约13％、至少约14％、至少约15％、至少约16％、至少约17％、至少约18％、至少约19％、至少约20％、至少约21％、至少约22％、至少约23％、至少约24％、至少约25％、至少约26％、至少约27％、至少约28％、至少约29％、至少约30％、至少约31％、至少约32％、至少约33％、至少约34％、至少约35％、至少约36％、至少约37％、至少约38％、至少约39％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约60％、至少约70％、至少约80％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％。
在一些实施方案中，外周血样品或组织活组织检查中cd16-阴性的的细胞相对于总外周血单核细胞的百分比为约10％至约20％、约10％至约25％、约10％至约30％、约10％至约35％、约10％至约40％、约10％至约45％、约10％至约50％、约15％至约20％、约15％至约25％、约15％至约30％、约15％至约35％、约15％至约40％、约15％至约45％、约15％至约50％、约20％至约25％、约20％至约30％、约20％至约35％、约20％至约40％、约20％至约45％、约20％至约50％、约25％至约30％、约25％至约35％、约25％至约40％、约25％至约45％、约25％至约50％、约30％至约35％、约30％至约40％、约30％至约45％、约30％至约50％、约35％至约40％、约35％至约45％、约35％至约50％、约40％至约45％、约40％至约50％、约45％至约50％。
cd14-阳性和hla-dr-高
在一些实施方案中，外周血样品或组织活组织检查中cd14-阳性和hla-dr-高的细胞相对于总外周血单核细胞的百分比为至少约5％、至少约6％、至少约7％、至少约8％、至少约9％、至少约10％、至少约11％、至少约12％、至少约13％、至少约14％、至少约15％、至少约16％、至少约17％、至少约18％、至少约19％、至少约20％、至少约21％、至少约22％、至少约23％、至少约24％、至少约25％、至少约26％、至少约27％、至少约28％、至少约29％、至少约30％、至少约31％、至少约32％、至少约33％、至少约34％、至少约35％、至少约36％、至少约37％、至少约38％、至少约39％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约60％、至少约70％、至少约80％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％。
在一些实施方案中，外周血样品或组织活组织检查中cd14-阳性和hla-dr-高的细胞相对于总外周血单核细胞的百分比为约10％至约20％、约10％至约25％、约10％至约30％、约10％至约35％、约10％至约40％、约10％至约45％、约10％至约50％、约15％至约20％、约15％至约25％、约15％至约30％、约15％至约35％、约15％至约40％、约15％至约45％、约15％至约50％、约20％至约25％、约20％至约30％、约20％至约35％、约20％至约40％、约20％至约45％、约20％至约50％、约25％至约30％、约25％至约35％、约25％至约40％、约25％至约45％、约25％至约50％、约30％至约35％、约30％至约40％、约30％至约45％、约30％至约50％、约35％至约40％、约35％至约45％、约35％至约50％、约40％至约45％、约40％至约50％、约45％至约50％。
cd14-阳性和cd16-阴性
在一些实施方案中，外周血样品或组织活组织检查中cd14-阳性和cd16-阴性的的细胞相对于总外周血单核细胞的百分比为至少约5％、至少约6％、至少约7％、至少约8％、至少约9％、至少约10％、至少约11％、至少约12％、至少约13％、至少约14％、至少约15％、至少约16％、至少约17％、至少约18％、至少约19％、至少约20％、至少约21％、至少约22％、至少约23％、至少约24％、至少约25％、至少约26％、至少约27％、至少约28％、至少约29％、至少约30％、至少约31％、至少约32％、至少约33％、至少约34％、至少约35％、至少约36％、至少约37％、至少约38％、至少约39％、至少40％、至少约45％、至少约50％、至少约60％、至少约70％、至少约80％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％。
在一些实施方案中，外周血样品或组织活组织检查中cd14-阳性和cd16-阴性的的细胞相对于总外周血单核细胞的百分比为约10％至约20％、约10％至约25％、约10％至约30％、约10％至约35％、约10％至约40％、约10％至约45％、约10％至约50％、约15％至约20％、约15％至约25％、约15％至约30％、约15％至约35％、约15％至约40％、约15％至约45％、约15％至约50％、约20％至约25％、约20％至约30％、约20％至约35％、约20％至约40％、约20％至约45％、约20％至约50％、约25％至约30％、约25％至约35％、约25％至约40％、约25％至约45％、约25％至约50％、约30％至约35％、约30％至约40％、约30％至约45％、约30％至约50％、约35％至约40％、约35％至约45％、约35％至约50％、约40％至约45％、约40％至约50％、约45％至约50％。
hla-dr-高和cd16-阴性
在一些实施方案中，外周血样品或组织活组织检查中hla-dr-高和cd16-阴性的细胞相对于总外周血单核细胞的百分比为至少约5％、至少约6％、至少约7％、至少约8％、至少约9％、至少约10％、至少约11％、至少约12％、至少约13％、至少约14％、至少约15％、至少约16％、至少约17％、至少约18％、至少约19％、至少约20％、至少约21％、至少约22％、至少约23％、至少约24％、至少约25％、至少约26％、至少约27％、至少约28％、至少约29％、至少约30％、至少约31％、至少约32％、至少约33％、至少约34％、至少约35％、至少约36％、至少约37％、至少约38％、至少约39％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约60％、至少约70％、至少约80％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％。
在一些实施方案中，外周血样品或组织活组织检查中hla-dr-高和cd16-阴性的细胞相对于总外周血单核细胞的百分比为至少约10％至约20％、约10％至约25％、约10％至约30％、约10％至约35％、约10％至约40％、约10％至约45％、约10％至约50％、约15％至约20％、约15％至约25％、约15％至约30％、约15％至约35％、约15％至约40％、约15％至约45％、约15％至约50％、约20％至约25％、约20％至约30％、约20％至约35％、约20％至约40％、约20％至约45％、约20％至约50％、约25％至约30％、约25％至约35％、约25％至约40％、约25％至约45％、约25％至约50％、约30％至约35％、约30％至约40％、约30％至约45％、约30％至约50％、约35％至约40％、约35％至约45％、约35％至约50％、约40％至约45％、约40％至约50％、约45％至约50％.
cd14-阳性、hla-dr-高和cd16-阴性
在一些实施方案中，外周血样品或组织活组织检查中cd14-阳性、hla-dr-高和cd16-阴性的细胞相对于总外周血单核细胞的百分比为至少5％、至少约6％、至少约7％、至少约8％、至少约9％、至少约10％、至少约11％、至少约12％、至少约13％、至少约14％、至少约15％、至少约16％、至少约17％、至少约18％、至少约19％、至少约20％、至少约21％、至少约22％、至少约23％、至少约24％、至少约25％、至少约26％、至少约27％、至少约28％、至少约29％、至少约30％、至少约31％、至少约32％、至少约33％、至少约34％、至少约35％、至少约36％、至少约37％、至少约38％、至少约39％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约60％、至少约70％、至少约80％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％。
在一些实施方案中，外周血样品或组织活组织检查中cd14-阳性，hla-dr-高和cd16-阴性的的细胞相对于总外周血单核细胞的百分比为约10％至约20％、约10％至约25％、约10％至约30％、约10％至约35％、约10％至约40％、约10％至约45％、约10％至约50％、约15％至约20％、约15％至约25％、约15％至约30％、约15％至约35％、约15％至约40％、约15％至约45％、约15％至约50％、约20％至约25％、约20％至约30％、约20％至约35％、约20％至约40％、约20％至约45％、约20％至约50％、约25％至约30％、约25％至约35％、约25％至约40％、约25％至约45％、约25％至约50％、约30％至约35％、约30％至约40％、约30％至约45％、约30％至约50％、约35％至约40％、约35％至约45％、约35％至约50％、约40％至约45％、约40％至约50％、约45％至约50％。
在一些实施方案中，测定每单位体积生物样品的cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量。单位体积的非限制性实例包括微微升(pl)、纳升(nl)、微升(μl)、毫升(ml)、分升(dl)和升(l)。在一些实施方案中，使用每单位体积的生物样品cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量选择用于施用包含hdac抑制剂和第二治疗剂的组合疗法的患者。在一些实施方案中，所述生物样品为外周血样品。
在一些实施方案中，每单位体积生物样品的cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量为每单位体积约1、约2、约3、约4、约5、约6、约7、约8、约9、约10、约15、约20、约25、约30、约35、约40、约45、约50、约60、约70、约80、约90、约100、约150、约200、约250、约300、约350、约400、约450、约500、约600、约700、约800、约900、约1000、约1500、约2000、约2500、约3000、约3500、约4000、约4500、约5000、约6000、约7000、约8000、约9000、约10000、约15000、约20000、约25000、约30000、约35000、约40000、约45000、约50000、约60000、约70000、约80000、约90000或约100000。
在一些实施方案中，每单位体积生物样品的cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞的数量为每单位体积约1至约2、约2至约3、约3至约4、约4至约5、约5至约6、约6至约7、约7至约8、约8至约9、约9至约10、约10至约15、约15至约20、约20至约25、约25至约30、约30至约35、约35至约40、约40至约45、约45至约50、约50至约60、约60至约70、约70至约80、约80至约90、约90至约100、约100至约150、约150至约200、约200至约250、约250至约300、约300至约350、约350至约400、约400至约450、约450至约500、约500至约600、约600至约700、约700至约800、约800至约900、约900至约1000、约1000至约1500、约1500至约2000、约2000至约2500、约2500至约3000、约3000至约3500、约3500至约4000、约4000至约4500、约4500至约5000、约5000至约6000、约6000至约7000、约7000至约8000、约8000至约9000、约9000至约10000、约10000至约15000、约15000至约20000、约20000至约25000、约25000至约30000、约30000至约35000、约35000至约40000、约40000至约45000、约45000至约50000、约50000至约60000、约60000至约70000、约70000至约80000、约80000至约90000、或约90000至约100000。
在一些实施方案中，使用流式细胞术、质谱流式细胞术(masscytometry)、细胞离心涂片法(cytospin)或免疫组织化学测量cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞和外周血单核细胞。
流式细胞术是用于细胞计数、细胞分选和生物标记检测的基于激光的技术，其通过将细胞悬浮在流体流中并使其通过电子检测装置。其允许每秒同时多参数分析高达数千颗粒的物理和化学特征。
质谱流式细胞计量术是基于电感耦合等离子体质谱的质谱技术，用于测定细胞身份和功能。在该技术中，接合剂用同位素纯的稀土元素标记。然后，这些接合剂应用于标记的细胞及其组分。使细胞雾化并通过氩等离子体激光发送，电离多原子稀土元素标记物。然后，通过飞行时间质谱仪分析电离的标记的细胞。质谱细胞计量术的优点是克服了流式细胞术中光谱重叠导致的限制的能力。
细胞离心涂片法是一种其中将悬浮细胞离心在载玻片上作为细胞染色和细胞计数的涂片的技术。以低粘度介质存在的浓细胞悬液构成涂片制品的良好候选物。存在于稀释介质中的稀释细胞悬液最适合用于通过细胞离心(cytocentrifugation)制备细胞分离物。存在于高粘度介质中的细胞悬液最适合用于作为拭抹制品(swabpreparations)进行测试。这些制品中不变的(constant)是全细胞存在于光滑表面上。
免疫组织化学是一种组织染色，利用抗体特异性结合生物组织中抗原的原理检测组织切片细胞中的抗原。可以以多种方式实现抗体-抗原相互作用的显影。抗体可以结合可以催化显色反应的酶，比如过氧化物酶。可选地，抗体可以标记荧光团，比如荧光素或罗丹明。
在一些实施方案中，通过细胞表面标记物鉴别cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞和外周血单核细胞。鉴别外周血单核细胞的细胞表面标记物的非限制性实例包括cd3、cd14、cd19、cd56和hla-dr。
在一些实施方案中，通过cd14鉴别cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞，通过cd3鉴别高水平的hla-dr及不存在cd16和外周血单核细胞。在一些实施方案中，通过cd14鉴别cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞，并且通过cd14鉴别高水平的hla-dr及不存在cd16和外周血单核细胞。在一些实施方案中，通过cd14鉴别cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞，并且通过cd19鉴别高水平的hla-dr及不存在cd16和外周血单核细胞。在一些实施方案中，通过cd14鉴别cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞，并且通过cd56鉴别高水平的hla-dr及不存在cd16和外周血单核细胞。在一些实施方案中，通过cd14鉴别cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞，并且通过hla-dr鉴别高水平的hla-dr及不存在cd16和外周血单核细胞。在一些实施方案中，通过cd14鉴别cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞，并且通过cd3、cd14、cd19、cd56和hla-dr鉴别高水平的hla-dr及不存在cd16和外周血单核细胞。在一些实施方案中，通过cd14鉴别cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16-阴性的细胞，并且通过cd14鉴别高水平的hla-dr及不存在cd16和外周血单核细胞。
另外的疗法
可有利地与本文公开的疗法组合使用的用于本文所述癌症的可用另外的治疗包括，但不限于作为辅助治疗的放疗、化疗、抗体治疗和酪氨酸激酶抑制剂。
放疗是使用高能x-射线或其他类型的辐射来杀死癌细胞或使其保持不生长的癌症治疗。化疗是一种使用药物来阻止癌细胞生长的癌症治疗，要么杀死细胞，要么阻止细胞分裂。当化疗由口服或注射到静脉或肌肉时，药物进入血流，并且可以到达全身的癌细胞(系统化疗)。当将化疗直接置入脊柱、器官或体腔比如腹部时，药物主要影响那些区域的癌细胞(局部化疗)。给予化疗的方式取决于治疗的癌症的类型和阶段。
用于治疗肺癌的不同化疗剂是本领域已知的。用于治疗肺癌的细胞毒性剂包括卡铂(例如，
用于治疗黑素瘤的不同试剂是本领域已知的，包括阿地白介素(例如，
用于治疗乳腺癌的不同试剂是本领域已知的，包括芳香酶抑制剂，比如阿那曲唑(anastrazole)(比如，
单克隆抗体治疗是使用在实验室中从单一类型免疫系统细胞制备的抗体的癌症治疗。这些抗体可以识别癌细胞上的物质或可有助于癌细胞生长的正常物质。抗体附着于所述物质上并杀死癌细胞，阻止其生长，或阻止其扩散。单克隆抗体通过输注供给。它们可以单独使用或直接携带药物、毒素或放射性物质进入癌细胞。单克隆抗体也与作为辅助治疗的化疗组合使用。
可以有利地与本文公开的组合物和疗法组合的另外的示例性治疗可以包括，但不限于施用下述试剂，包括但不限于拉帕替尼单独或与卡培他滨、多西他赛、表柔比星、埃博霉素a、b或d、醋酸戈舍瑞林、紫杉醇、帕米膦酸盐、贝伐单抗或曲妥单抗组合。
在一些实施方案中，所述另外的疗法包括化疗，其包括向受试者施用一种或多种多柔比星、环磷酰胺、紫杉醇、拉帕替尼、卡培他滨、曲妥单抗、贝伐单抗、吉西他滨、艾瑞布林或白蛋白结合型紫杉醇(nab-paclitaxel)。
口服制剂
含有本文所述活性药物成分的口服剂型可以包括任何常规使用的口服形式，包括：片剂、胶囊、丸剂、锭剂、糖锭、软锭剂、扁囊剂、微丸、药用口香糖、颗粒剂、散装粉末、泡腾或非泡腾粉末或颗粒、溶液、乳剂、混悬剂、溶液、糯米纸囊剂(wafers)、散剂(sprinkles)、酏剂、糖浆剂、口腔形式和口服液体。胶囊可以包含活性化合物与惰性填充剂和/或稀释剂的混合物，比如可药用淀粉(例如玉米、马铃薯或木薯淀粉)、糖、人造甜味剂、粉末状纤维素比如结晶和微晶纤维素、面粉、明胶、树胶等。有用的片剂可以通过常规压制、湿法制粒或干法制粒方法制备，并使用可药用稀释剂、粘合剂、润滑剂、崩解剂、表面改性剂(包括表面活性剂)、悬浮剂或稳定剂，包括但不限于硬脂酸镁、硬脂酸、滑石、月桂基硫酸钠、微晶纤维素、羧甲基纤维素钙、聚乙烯吡咯烷酮、明胶、藻酸、阿拉伯树胶、黄原胶、柠檬酸钠、复合硅酸盐、碳酸钙、甘氨酸、糊精、蔗糖、山梨醇、磷酸二钙、硫酸钙、乳糖、高岭土、甘露醇、氯化钠、滑石、无水淀粉和糖粉。在一些实施方案中，有表面改性剂，其包括非离子和阴离子表面改性剂。例如，表面改性剂包括但不限于泊洛沙姆188、苯扎氯铵、硬脂酸钙、鲸蜡硬脂醇、聚西托醇乳化蜡(cetomacrogol)乳化蜡、脱水山梨醇酯、胶体二氧化硅、磷酸盐、十二烷基硫酸钠、硅酸镁铝和三乙醇胺。本文口服制剂可以使用标准延迟或时间释放制剂来改变活性化合物的吸收。口服剂型还可以包括施用在水或果汁中的活性成分，根据需要，其含有合适的增溶剂或乳化剂。
口服施用
如本文所述的，本文所述的组合疗法可以同时给予或可以以交错方案给予，在化疗过程中，采用与第二药用试剂不同的时间给予hdac抑制剂或恩替司他。施用两种组分之间的时间差范围可以为几分钟、几小时、几天、几周或更长时间。因此，术语“组合”不一定意味着同时或作为单一剂量施用，而是在期望的治疗期间施用每种组分。试剂也可以通过不同的途径施用。作为典型的化疗方案，化疗过程可以在数周后重复，并且两种化合物可以按照相同的时间段施用或者可以基于患者反应进行调整。
在其它实施方案中，本文提供的药物组合物可以以固体、半固体或液体剂型提供用于口服施用。如本文使用的口服施用还包括颊、舌和舌下施用。合适的口服剂型包括，但不限于片剂、胶囊、丸剂、锭剂、糖锭、软锭剂、扁囊剂、微丸、药用口香糖，颗粒剂、散装粉末、泡腾或非泡腾粉末或颗粒、溶液、乳剂、悬浮液、溶液、糯米纸囊剂(wafers)、散剂(sprinkles)、酏剂和糖浆剂。除了活性成分之外，药物组合物可以含有一种或多种可药用载体或赋形剂，包括但不限于粘合剂、填充剂、稀释剂、崩解剂、润湿剂、润滑剂、助流剂、着色剂、染料迁移抑制剂、甜味剂和矫味剂。
粘合剂或制粒剂赋予片剂粘结性，以确保片剂在压制后完好无损。合适的粘合剂或制粒剂包括，但不限于淀粉，比如玉米淀粉、马铃薯淀粉和预胶化淀粉(例如，starch1500)；明胶；糖类，比如蔗糖、葡萄糖、右旋糖、糖蜜和乳糖；天然和合成树胶，比如阿拉伯胶、海藻酸、海藻酸盐、爱尔兰苔提取物、潘瓦尔胶、印度树胶、依莎贝果外皮(isabgolhusks)的胶液、羧甲基纤维素、甲基纤维素、聚乙烯吡咯烷酮(pvp)、硅酸镁铝(veegum)、落叶松阿拉伯半乳聚糖、粉状西黄蓍胶和瓜尔胶；纤维素类，比如乙基纤维素、醋酸纤维素、羧甲基纤维素钙、羧甲基纤维素钠、甲基纤维素、羟乙基纤维素(hec)、羟丙基纤维素(hpc)、羟丙基甲基纤维素(hpmc)；微晶纤维素，比如avicel-ph-101、avicel-ph-103、avicelrc-581、avicel-ph-105(fmccorp.,marcushook，pa)；及其混合物。合适的填充剂包括但不限于滑石、碳酸钙、微晶纤维素、粉末状纤维素、葡萄糖结合剂、高岭土、甘露醇、硅酸、山梨醇、淀粉、预胶化淀粉及其混合物。在本文提供的药物组合物中，粘合剂或填充剂可以以约50至约99重量％存在。
合适的稀释剂包括，但不限于磷酸氢钙、硫酸钙、乳糖、山梨醇、蔗糖、肌醇、纤维素、高岭土、甘露醇、氯化钠、干淀粉和粉状糖。某些稀释剂，比如甘露醇、乳糖、山梨醇、蔗糖和肌醇，当以足够量存在时，可以赋予一些压制片各种性能，以允许通过咀嚼在口中崩解。这种压制片可以用作咀嚼片。
合适的崩解剂包括，但不限于琼脂；膨润土；纤维素类，比如甲基纤维素和羧甲基纤维素；木制品；天然海绵；阳离子交换树脂；海藻酸；树胶类，比如瓜尔豆胶和veegumhv；柑橘纸浆；交联纤维素类，比如交联羧甲基纤维素；交联聚合物，比如交聚维酮；交联淀粉；碳酸钙；微晶纤维素，比如淀粉乙醇酸钠；波拉克林钾；淀粉类，比如玉米淀粉、马铃薯淀粉、木薯淀粉和预糊化淀粉；粘土；藻胶(aligns)；及其混合物。崩解剂在本文提供的药物组合物中的含量随制剂的类型而变化，且容易由本领域普通技术人员确定。本文提供的药物组合物可以包含约0.5至约15％或约1至约5％重量的崩解剂。
合适的润滑剂包括，但不限于硬脂酸钙；硬脂酸镁；矿物油；轻质矿物油；甘油；山梨醇；甘露醇；二醇，比如山嵛酸甘油酯和聚乙二醇(peg)；硬脂酸；月桂基硫酸钠；滑石；氢化植物油，包括花生油、棉籽油、葵花籽油、芝麻油、橄榄油、玉米油和大豆油；硬脂酸锌；油酸乙酯；月桂酸乙酯；琼脂；淀粉；石松；二氧化硅或硅胶比如
合适的助流剂包括胶体二氧化硅cab-o-
应当理解，即使在同一制剂之内，许多载体和赋形剂可以发挥多种功能。
在进一步的实施方案中，本文提供的药物组合物可以作为压制片剂、研制片剂、咀嚼锭剂、快速溶解片剂、多层压制片剂或肠包衣片剂、糖衣或薄膜包衣片剂提供。肠包衣片是用抗胃酸作用但在肠中溶解或崩解的物质包衣的压制片剂，从而保护活性成分免受胃酸环境的影响。肠溶衣包括，但不限于脂肪酸、脂肪、水杨酸苯酯、蜡、虫胶、氨化虫胶和乙酸邻苯二甲酸纤维素。糖衣片是由糖衣包裹的压制片剂，其可能有益于掩盖令人不愉快的味道或气味并保护片剂免于氧化。膜包衣片是用薄层或水溶性材料膜覆盖的压制片剂。膜包衣包括但不限于羟乙基纤维素、羧甲基纤维素钠、聚乙二醇4000和邻苯二甲酸乙酸纤维素。膜包衣具有与糖包衣相同的一般特征。多层压制片剂是通过多于一个压制循环制成的压制片剂，包括分层片剂和压制包衣或干包衣片剂。
片剂剂型可以由粉末状、结晶状或颗粒状的活性成分，单独或与本文中所述的一种或多种载体或赋形剂，包括粘合剂、崩解剂、控释聚合物、润滑剂、稀释剂或着色剂组合制成。矫味剂和甜味剂特别适用于形成咀嚼片和糖锭。
本文提供的药物组合物可以作为软胶囊或硬胶囊提供，其可以由明胶、甲基纤维素、淀粉或藻酸钙制成。硬明胶胶囊也称为干填充胶囊(dfc)，由两部分组成，一部分滑过另一部分，从而完全包封活性成分。软弹性胶囊(sec)是柔软的球形壳，比如明胶壳，其通过加入甘油、山梨糖醇或类似的多元醇塑化。软明胶壳可以包含防腐剂，以防止微生物生长。合适的防腐剂是如本文所述的那些，包括尼泊金甲酯和尼泊金丙酯，及山梨酸。本文提供的液体、半固体和固体剂型可以包囊在胶囊中。合适的液体和半固体剂型包括在碳酸亚丙酯、植物油或甘油三酯中的溶液和悬浮液。含有这样的溶液的胶囊可以如美国专利no.4,328,245；4,409,239；和4,410,545的描述制备。为了改变或延缓活性成分的溶出，胶囊也可以按本领域技术人员已知的方式进行包衣。
在其它实施方案中，本文提供的药物组合物可以以液体和半固体剂型提供，包括乳剂、溶液、混悬剂、酏剂和糖浆剂。乳剂是两相体系，其中一种液体以小球的形式分散在另一种液体中，其可以是水包油或油包水。乳剂可以包括可药用非水性液体或溶剂、乳化剂和防腐剂。混悬剂可以包括可药用助悬剂和防腐剂。水性醇溶液剂可包括可药用缩醛，比如低级烷基醛的二(低级烷基)缩醛(术语“低级”指具有1至6个碳原子的烷基)，例如乙醛缩二乙醇缩醛(acetaldehydediethylacetal)；和具有一个或多个羟基的水混溶性溶剂，比如丙二醇和乙醇。酏剂是透明的、有甜味和水醇溶液。糖浆剂是糖例如蔗糖的浓缩水溶液，并且也可以含有防腐剂。对于液体剂型，例如聚乙二醇的溶液，可以用足量的可药用液体载体例如水稀释，以方便测量用于施用。
其它有用的液体和半固体剂型包括，但不限于含有本文提供的活性成分的那些，以及二烷基化的单或聚亚烷基二醇，包括1,2-二甲氧基甲烷、二甘醇二甲醚、三甘醇二甲醚、四甘醇二甲醚、聚乙二醇-350-二甲醚、聚乙二醇550-二甲醚、聚乙二醇-750-二甲醚，其中350、550和750指聚乙二醇的近似平均分子量。这些制剂可以进一步包括一种或多种抗氧剂，比如丁基化羟基甲苯(bht)、丁基化羟基苯甲醚(bha)、没食子酸丙酯、维生素e、氢醌、羟基香豆素、乙醇胺、卵磷脂、脑磷脂、抗坏血酸、苹果酸、山梨醇、磷酸、亚硫酸氢盐、焦亚硫酸氢钠、硫代二丙酸及其酯和二硫代氨基甲酸盐。
本文提供用于口服施用的药物组合物还可以以脂质体、胶束、微球或纳米系统的形式提供。胶束剂型可以如美国专利no.6,350,458中描述的制备。
在其它实施方案中，本文提供的药物组合物可以以非泡腾的或泡腾的颗粒剂和粉末形式提供，以重构液体剂型。在非泡腾颗粒或粉末中使用的可药用载体和赋形剂可以包括稀释剂、甜味剂和润湿剂。在泡腾颗粒或粉末中使用的可药用载体和赋形剂可以包括有机酸和二氧化碳源。
在所有上述剂型中可以使用着色剂和矫味剂。
本文提供的药物组合物可以配制成立即释放或改性释放剂型，包括延迟释放、缓释释放、脉冲释放、控制释放、靶向释放和程序化释放的形式。
在进一步的实施方案中，本文提供的药物组合物可以与不损害期望治疗作用的其它活性成分或与补充期望作用的物质共同配制。在一些实施方案中，抗-pd-1抗体、抗-pd-l1和/或ctla4-阻断治疗剂和hdac抑制剂在时间上接近地施用(例如，抗-pd-1抗体、抗-pd-l1和/或ctla4-阻断治疗剂和hdac抑制剂可以同时施用)。因此，本公开内容提供一种治疗或预防癌症的方法，其包括在时间上接近地施用抗pd-1抗体、抗pd-l1和/或ctla4阻断治疗剂和hdac抑制剂。在一些实施方案中，“在时间上接近”指一种治疗剂的施用发生在另一种治疗剂的施用之前或之后的时间段之内，使得一种治疗剂的治疗效果与另一种治疗剂的治疗效果重叠。在一些实施方案中，一种治疗剂的治疗效果与另一种治疗剂的治疗效果完全重叠。在一些实施方案中，“在时间上接近”指一种治疗剂的施用发生在另一种治疗剂的施用之前或之后的时间段之内，使得一种治疗剂和另一种治疗剂之间存在协同作用。“在时间上接近”可以根据各种因素而变化，包括但不限于待施用治疗剂的受试者的年龄、性别、体重、遗传背景、医学状况、病史和治疗史；待治疗或改善的疾病或病症；要达到的治疗结果；治疗剂的剂量、给药频率和给药持续时间；治疗剂的药代动力学和药效学；以及治疗剂的给药途径。在一些实施方案中，“在时间上接近”指在15分钟内、在30分钟内、在一小时内、在两小时内、在四小时内、在六小时内、在八小时内、在12小时内、在18小时内、在24小时内、在36小时内、在2天内、在3天内、在4天内、在5天内、在6天内、在一周内、在2周内、在3周内、在4周内、在6周内或在8周内。在一些实施方案中，一种治疗剂的多次施用可以在时间上接近另一种治疗剂的单次施用而发生。在一些实施方案中，时间上接近可以在治疗周期期间或在给药方案内改变。
实施例
实施例1.用于恩替司他与派姆单抗组合疗法的nsclc患者选择
为了选择用hdac抑制剂和第二治疗剂的组合治疗的患者，从患者采集外周血样品。患者被诊断为患有在抗pd-1或抗pd-l1治疗期间进展或对其无响应的非小细胞肺癌。将5毫升(ml)外周血样品收集到edta收集管中，将其在冰上快速冷却。将血样转移到锥形管中，用15ml红细胞裂解缓冲液稀释，并在室温下培养10分钟。通过用30ml磷酸盐缓冲盐水(pbs)稀释来淬灭红细胞裂解。将细胞悬浮液在4℃下以400×g离心5分钟，弃去上清液。将沉淀颗粒(pellet)再悬浮于5ml的pbs中，并转移到新的锥形管中。将再悬浮的样品用5ml的
将与初始抽取血液等体积(anequalvolumetotheoriginalblooddraw)加入到新锥形管中的沉淀颗粒中，以洗涤细胞。在4℃下，将细胞悬浮液以400×g离心5分钟，并弃去上清液。将细胞以与初始抽取血液等体积再悬浮于含1％牛血清白蛋白和0.5％edta的pbs(染色缓冲液)中。然后，使用血细胞计数器对活细胞计数。在4℃下，将细胞悬浮液以400×g离心5分钟，弃去上清液，将细胞再悬浮于染色缓冲液中至细胞浓度为约107细胞/ml，并将1ml等分试样转移至新管中。
将以下抗体加入再悬浮细胞中：fitc-缀合的抗-cd14；pe-缀合的抗hla-dr；和apc缀合的抗-cd3、抗-cd19和抗-cd56。对照样品包括未染色的细胞和染色的细胞，其中省去(leftout)各荧光染料抗体组中的每一种。将细胞覆盖以使光暴露最小化，并在室温下静置20分钟。通过在4℃下以400×g离心5分钟，使染色的细胞在染色缓冲液中洗涤两次，弃去上清液，并且再悬浮于等体积的染色缓冲液中。然后，将染色的细胞转移至聚丙烯管，以用于在流式细胞仪上使用。
流式细胞术是在cytomicsfc500流式细胞仪上进行的，其自动化基于管的获取流式细胞术数据。在进行自动化运行之后，对于背景荧光(使用未染色的样品)和荧光染料补偿(使用个别地省去的荧光染料样品)两者都校正样品。通过cd14阳性、hla-dr高表达和cd16、cd3、cd19和cd56阴性鉴别cd14阳性、hla-dr高和cd16阴性的细胞。通过cd3、cd19和cd56阳性鉴别外周血单核细胞。使用这些值计算总外周血单核细胞中cd14阳性、hla-dr-高和/或cd16阴性的细胞。在这种情况下，如果患者具有的cd14阳性、hla-dr-高和cd16阴性的细胞的百分比在至少5％至100％之间，表明存在升高数量的cd14阳性、hla-dr-高和cd16阴性的细胞，则选择该患者用于用恩替司他和派姆单抗的组合疗法。
实施例2.用于恩替司他与派姆单抗组合疗法的黑素瘤患者选择
为了选择用恩替司他与派姆单抗的组合疗法进行组合治疗的患者，从患者采集外周血样品。该患者被诊断为在抗pd-1或抗pd-l1治疗期间进展或对其无应答的黑素瘤。将5毫升(ml)外周血样品收集到edta收集管中，将其在冰上快速冷却。将血样转移到锥形管中，用15ml红细胞裂解缓冲液稀释，并在室温下培养10分钟。通过用30ml磷酸盐缓冲盐水(pbs)稀释来淬灭红细胞裂解。在4℃下，将细胞悬浮液以400×g离心5分钟，并弃去上清液。将沉淀颗粒再悬浮于5ml的pbs中，并转移到新的锥形管中。将再悬浮的样品用5ml的
将与初始抽取血液等体积(anequalvolumetotheoriginalblooddraw)加入到新锥形管中的沉淀颗粒中，以洗涤细胞。在4℃下，将细胞悬浮液以400×g离心5分钟，并弃去上清液。将细胞以与初始血液等体积再悬浮于含1％牛血清白蛋白和0.5％edta的pbs(染色缓冲液)中。然后，使用血细胞计数器对活细胞计数。在4℃下，将细胞悬浮液以400×g离心5分钟，弃去上清液，将细胞再悬浮于染色缓冲液中至细胞浓度为约107细胞/ml，并将1ml等分试样转移至新管中。
将以下抗体加入再悬浮细胞中：fitc-缀合的抗-cd14；pe-缀合的抗hla-dr；和apc缀合的抗-cd3、抗-cd19和抗-cd56。对照样品包括未染色的细胞和染色的细胞，其中省去(leftout)各荧光染料抗体组中的每一种。将细胞覆盖以使光暴露最小化，并在室温下静置20分钟。通过在4℃下以400×g离心5分钟，使染色的细胞在染色缓冲液中洗涤两次，弃去上清液，并且再悬浮于等体积的染色缓冲液中。然后，将染色的细胞转移至聚丙烯管，以用于在流式细胞仪上使用。
流式细胞术是在cytomicsfc500流式细胞仪上进行的，其自动化基于管的获取流式细胞术数据。在进行自动化运行之后，对于背景荧光(使用未染色的样品)和荧光染料补偿(使用个别地省去的荧光染料样品)两者都校正样品。通过cd14阳性、hla-dr高表达和cd16、cd3、cd19和cd56阴性鉴别cd14阳性、hla-dr高和cd16阴性的细胞。通过cd3、cd19和cd56阳性鉴别外周血单核细胞。使用这些值计算总外周血单核细胞中cd14-阳性、hla-dr-高和/或cd16阴性的细胞。在这种情况下，如果患者具有的cd14阳性、hla-dr-高和cd16阴性的细胞的百分比在至少5％至100％之间，表明存在升高数量的cd14阳性、hla-dr-高和cd16阴性的细胞，则选择该患者用于用恩替司他和派姆单抗的组合疗法。
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