通过纳米孔捕获对分析物的结构分析

文档序号:36737166发布日期:2024-01-16 12:51阅读:来源:国知局

技术特征:

1.在纳米孔系统中表征分析物的方法,其中所述纳米孔系统包含设置在将第一导电液体介质与第二导电液体介质隔开的膜中的蛋白质纳米孔,其中所述蛋白质纳米孔是mspa、mspa同源物或其变体,其中所述分析物具有构象,并且具有所述构象的分析物可以容纳在所述mspa、所述mspa同源物或其变体的前庭中,但不能移位通过所述mspa、所述mspa同源物或其变体,所述方法包含:

2.根据权利要求1所述的方法,其中所述分析物选自由以下组成的组:核酸,蛋白质,多糖,聚合物,酶,以及核酸、蛋白质、肽、多糖、聚合物、酶和能够与它们相互作用的试剂的复合物。

3.根据权利要求2所述的方法,其中所述核酸选自由以下组成的组:lmw rna,核酸双链体,适体,核酶或具有吻环、三向接合、假结、扭结转角或g-四链体结构的核酸。

4.根据权利要求3所述的方法,其中所述lmw rna包含具有突出端或平端的sirna、trna、mirna和/或rrna。

5.根据权利要求3所述的方法,其中所述核酸双链体具有突出端或平端。

6.根据权利要求3所述的方法,其中所述核酸双链体由mirna和核酸探针组成,并且所述核酸探针是rna、dna或核酸类似物。

7.根据权利要求2所述的方法,其中所述蛋白质分析物选自由以下组成的组:带正电荷的、中性的或带负电荷的。

8.根据权利要求1-7中任一项所述的方法,其中所述分析物包含两种或更多种不同的分析物,并且这些分析物的表征在一次测量中完成。

9.根据权利要求1-8中任一项所述的方法,其中步骤iii)包含将所述测试电流模式与选自由以下组成的组的至少一种特征相关联:存在或不存在所述分析物、所述分析物的身份、所述分析物的序列、所述分析物中的突变、所述分析物的构象、所述分析物的局部结构、所述分析物的含量、所述分析物的总体尺寸、所述分析物的电荷和极性。

10.根据权利要求1所述的方法,其中所述分析物是通过靶分子和辅助分子的组合形成的复合物。

11.根据权利要求10所述的方法,其中步骤iii)包含将所述测试电流模式与所述靶分子的至少一种特征相关联。

12.用于在纳米孔系统中表征分析物和试剂之间相互作用的方法,其中所述纳米孔系统包含设置在将第一导电液体介质与第二导电液体介质隔开的膜中的蛋白质纳米孔,其中所述蛋白质纳米孔是mspa、mspa同源物或其变体,其中所述分析物具有构象,并且具有所述构象的分析物可以容纳在所述mspa、所述mspa同源物或其变体的前庭中,但不能移位通过所述mspa、所述mspa同源物或其变体,所述方法包含:

13.用于在纳米孔系统中表征能够与分析物相互作用的试剂的方法,其中所述纳米孔系统包含设置在将第一导电液体介质与第二导电液体介质隔开的膜中的蛋白质纳米孔,其中所述蛋白质纳米孔是mspa、mspa同源物或其变体,其中所述分析物具有构象,并且具有所述构象的分析物可以容纳在所述mspa、所述mspa同源物或其变体的前庭中,但不能移位通过所述mspa、所述mspa同源物或其变体,所述方法包含:

14.根据权利要求12或13所述的方法,其中所述分析物选自由以下组成的组:核酸、蛋白质、多糖、聚合物和酶。

15.根据权利要求14所述的方法,其中所述核酸是适体或核酶。

16.根据权利要求12或13所述的方法,其中所述分析物可以与离子、小分子、配体、受体或底物相互作用。

17.根据权利要求12-16中任一项所述的方法,其中所述试剂是离子、小分子、配体、受体或底物。

18.根据权利要求12-17中任一项所述的方法,其中所述试剂是多糖,优选肽聚糖、壳聚糖或甲壳素。

19.根据权利要求12-18中任一项所述的方法,其中所述分析物是溶菌酶。

20.根据权利要求1-19中任一项所述的方法,其中,步骤iii)通过将所述测试电流模式与参考电流模式进行比较或者通过使用机器学习算法来进行。

21.用于在纳米孔系统中检测样品中的感兴趣的分析物的方法,其中所述纳米孔系统包含设置在将第一导电液体介质与第二导电液体介质隔开的膜中的蛋白质纳米孔,其中所述蛋白质纳米孔是mspa、所述mspa同源物或其变体,其中所关注的分析物具有构象,并且具有初始构象的所关注的分析物可以容纳在mspa、所述mspa同源物或其变体的前庭中,但不能移位通过所述mspa、所述mspa同源物或其变体,所述方法包含:

22.根据权利要求18所述的方法,其中所述感兴趣的分析物选自由以下组成的组:核酸、蛋白质、多糖、聚合物和酶。

23.根据权利要求21所述的方法,其中所述分析物是乳清蛋白。

24.根据权利要求21所述的方法,其中所述分析物为α-乳白蛋白和/或β-乳球蛋白。

25.根据权利要求21-23中任一项所述的方法,其中所述样品是乳品或蛋白粉。

26.根据权利要求1-24中任一项所述的方法,其中所述mspa、所述mspa同源物或其变体前庭侧的所述导电液体介质含有单价阳离子,并且所述mspa、所述mspa同源物或其变体缢缩部位侧的所述导电液体介质含有二价阳离子。

27.根据权利要求25所述的方法,其中所述单价阳离子是碱金属离子,优选选自k+、na+和li+。

28.根据权利要求25或26所述的方法,其中所述二价阳离子为碱土金属离子,优选选自ca2+、mn2+、mg2+和ba2+。


技术总结
一种在纳米孔系统中表征分析物或所述分析物与试剂之间的相互作用的方法,其中所述纳米孔系统包含设置在将第一导电液体介质与第二导电液体介质隔开的膜中的蛋白质纳米孔,其中所述蛋白质纳米孔是MspA、MspA同源物或其变体,其中所述分析物具有构象,并且具有所述构象的分析物可以容纳在所述MspA、所述MspA同源物或其变体的前庭中,但不能移位通过所述MspA、所述MspA同源物或其变体,所述方法包含:i)在所述第一导电液体介质和所述第二导电液体介质之间施加电位差以将所述分析物驱动到所述纳米孔中,并且任选地使所述试剂与所述分析物接触;ii)测量通过所述蛋白质纳米孔的离子电流以提供测试电流模式,所述模式至少含有在所述分析物处于所述MspA、所述MspA同源物或其变体的前庭内期间测量的离子电流;iii)将所述测试电流模式与所述分析物的至少一种特征或所述分析物与试剂之间的相互作用相关联。

技术研发人员:黄硕,刘瑶,王玉琴,张善雨
受保护的技术使用者:南京大学
技术研发日:
技术公布日:2024/1/15
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