一种高度相似微生物的鉴定和分类方法与流程

文档序号:13446648阅读:来源:国知局

技术特征:

技术总结
本发明公开了一种高度相似微生物的鉴定和分类方法,其包括:(1)使用eggNOG数据库对微生物基因组编码的蛋白序列进行比对,赋予每个微生物基因组一个eggNOG基因ID,生成一个基于eggNOG数据库的微生物基因谱;(2)计算基因谱中不同待测微生物之间的基因内容非相似性,得到一个非相似性矩阵;(3)对矩阵进行聚类分析,将基因内容类似的微生物聚为一簇,判定为同一类微生物,完成微生物的鉴定和分类。本发明方法针对高度相似微生物,创造性地提出微生物水平差异主要驱动因子为基因的获得与丢失,而非传统手段常考虑的核酸位点突变。本发明对高度相似微生物的鉴定和分类有极高的准确性,具有良好的应用前景。

技术研发人员:屠奇超;周集中;束文圣;叶脉;李猛;毛喆
受保护的技术使用者:广东美格基因科技有限公司
技术研发日:2017.09.26
技术公布日:2018.01.12
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