检测败血症的方法

文档序号:391963阅读:223来源:国知局
专利名称:检测败血症的方法
检测败血症的方法本申请要求2009年2月2号提交的美国临时申请No. 61/149,277号的优先权,为了任何目的,该临时申请通过引用整体并入本文。1.背景败血症是在血液或其他组织中存在与宿主的炎症反应组合的致病微生物或它们的毒素,被称为由感染引起的全身炎症反应综合征(“SIRS”)。免疫响应由一类被称为toll 样受体(“TLR”)的蛋白介导,toll样受体识别广泛地由微生物共享但可与宿主分子区别的结构上保守的分子。一旦微生物已经突破诸如皮肤或肠道的屏障,身体的TLR识别它们并刺激免疫响应。因此,除了由微生物感染本身引起的症状之外,败血症还以由宿主的免疫响应引起的急性炎症的症状为特征。这些后者的症状可以包括发烧和高的白细胞计数或低的白细胞计数和低的体温。SIRS以血液动力学损伤(hemodynamic compromise)和所产生的代谢失调为特征,并可能伴有诸如高的心率、高的呼吸速率和高的体温的症状。免疫响应还造成急性期蛋白的普遍活化,影响补体系统和凝固途径,这然后造成对脉管系统和器官的损伤。各种神经内分泌反调节系统然后也被活化,常常使该问题更复杂。败血症常常在重症监护病房中用静脉注射液和抗生素和/或抗病毒化合物来治疗。然而,败血症发展迅速,且甚至用直接的和积极的治疗也是一样,重度败血症可以导致器官衰竭和死亡。在美国,估计重度败血症每年引起215,000人死亡,多于急性心肌梗死、 中风或肺炎,这可能是由于败血症的诊断延误或误诊。因此,对在检测败血症中的早期分子标记物存在需求。2.概述提供了用于检测受试者中败血症的存在的方法。在一些实施方案中,方法包括检测来自受试者的样品中的至少一种靶RNA的水平。在一些实施方案中,至少一种靶RNA(i) 能够与具有选自SEQ ID NO :1至86的序列的核酸特异性杂交;或(ii)包含与选自SEQ ID NO :1至86的序列的至少15个连续核苷酸互补的序列;或(iii)包含选自SEQ ID NO :196 至399、565至707和863至897的序列的至少15个连续核苷酸。在一些实施方案中,方法包括比较样品中的至少一种靶RNA的水平与至少一种靶RNA的正常水平。在一些实施方案中,样品中的至少一种靶RNA的水平大于至少一种靶RNA的正常水平就表明受试者中存在败血症。还提供了便于检测受试者中败血症的方法。在一些实施方案中,该方法包括检测来自受试者的样品中的至少一种靶RNA的水平。在一些实施方案中,至少一种靶RNA(i)能够与具有选自SEQ ID NO :1至86的序列的核酸特异性杂交;或(ii)包含与选自SEQ ID NO 1至86的序列的至少15个连续核苷酸互补的序列;或(iii)包含选自SEQ ID NO :196 至399、565至707和863至897的序列的至少15个连续核苷酸。在一些实施方案中,方法包括将检测的结果传送至医师以便确定受试者是否患有败血症。在一些实施方案中,检测样品中的至少一种靶RNA的水平包括使样品的核酸与与样品中的靶RNA或其补体互补的至少一种多核苷酸杂交。在一些实施方案中,方法还包括检测包含与选自靶RNA、靶RNA的DNA扩增子和靶RNA的补体的至少一种核酸杂交的多核苷酸的至少一种复合物。 在一些实施方案中,用于检测受试者中败血症的存在的方法包括从受试者获得样品和给实验室提供所述样品以便检测样品中的至少一种靶RNA的水平。在一些实施方案中,至少一种靶RNA (i)能够与具有选自SEQ ID NO 1至86的序列的核酸特异性杂交;或包含与选自SEQID NO :1至86的序列的至少15个连续核苷酸互补的序列;或(iii) 包含选自SEQ ID NO :196至399、565至707和863至897的序列的至少15个连续核苷酸。在一些实施方案中,该方法包括从实验室接收指示样品中的至少一种靶RNA的水平的信息。在一些实施方案中,至少一种靶RNA的水平大于至少一种靶RNA的正常水平就表明存在败血症。在一些实施方案中,方法包括检测至少两种、至少三种、至少五种或至少十种靶 RNA的水平。在一些实施方案中,检测到至少一种靶RNA的水平大于至少一种靶RNA的正常水平就表明存在败血症。在一些实施方案中,检测到至少两种靶RNA的水平大于至少两种靶RNA的正常水平就表明存在败血症。在一些实施方案中,检测到至少三种靶RNA的水平大于至少两种靶RNA的正常水平就表明存在败血症。在一些实施方案中,检测到至少五种靶RNA的水平大于至少两种靶RNA的正常水平就表明存在败血症。在一些实施方案中,方法包括检测以下至少一种靶RNA的水平(i)不与具有选自 SEQ ID NO :1至86的序列的核酸特异性杂交;和(ii)不包含与选自SEQ ID NO :1至86的序列的至少15个连续核苷酸互补的序列;和(iii)不包含选自SEQ ID NO :196至399、565 至707和863至897的序列的至少15个连续核苷酸。在一些实施方案中,提供了一种合成多核苷酸。在一些实施方案中,合成多核苷酸包括第一区,其中第一区包括与SEQ IDNO 1至67和215至399中的一个的至少8个连续核苷酸的序列相同或互补的至少8个、至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13 个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个或至少18个连续核苷酸的序列。在一些实施方案中,第一区与靶RNA的区相同或互补。在一些实施方案中,合成多核苷酸包括与靶 RNA的区不相同或不互补的第二区。在一些实施方案中,合成多核苷酸包括可检测标记。在一些实施方案中,合成多核苷酸包括FRET标记。在一些实施方案中,提供了组合物。在一些实施方案中,组合物包含多种合成多核苷酸。在一些实施方案中,提供了试剂盒。在一些实施方案中,试剂盒包括合成多核苷酸。 在一些实施方案中,试剂盒包括组合物。在一些实施方案中,试剂盒包括至少一种聚合酶和 / 或 dNTP。下面描述本发明的另外的实施方案和细节。3.附图简述

图1示出在Agilent Bioanalyser 2100上获得的电泳图谱,以评估在用激动剂 Pam3CSK4刺激他之后,如实施例1中所描述的从人单核细胞系THP-I纯化的总RNA的品质。4.详细描述4. 1.检测败血症4. 1. 1. 一般方法
提供了通过测量微RNA物种的水平来检测败血症的方法。在一些实施方案中,升高的微RNA物种水平表示败血症。在一些实施方案中,降低的微RNA物种水平表示败血症。 在一些实施方案中,该方法包括检测能够与选自SEQ ID NO :1至86的序列特异性杂交的至少一种靶RNA的异常水平。在一些实施方案中,该方法包括检测包括选自SEQ ID NO 196 至399、565至707和863至897的序列的至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个、至少20个、至少21个、至少22个、至少23个或至少M个连续核苷酸的至少一种靶RNA的异常水平。在一些实施方案中,该方法包括检测包括与选自SEQ ID NO :1至86的序列的至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个、至少20个、至少21个、至少22个、至少23个或至少M个连续核苷酸互补的序列的至少一种靶RNA的异常水平。在一些实施方案中,以其成熟形式的靶RNA包括少于30种核苷酸。在一些实施方案中,靶RNA 是微RNA。在本公开内容中,“选自......的序列”包括“选自......的一种序列”和“选
自......的一种或多种序列”两者。因此,当使用“选自......的序列”时,应理解,可以
选择所列出的序列中的一种或多于一种。检测到靶RNA的水平大于靶RNA的正常水平就表明从其取样的患者中存在败血症。在一些实施方案中,定量地进行检测。在其他实施方案中,定性地进行检测。在一些实施方案中,检测靶RNA包括形成包含多核苷酸和选自靶RNA、靶RNA的DNA扩增子和靶RNA 的补体的核酸的复合物。在一些实施方案中,然后检测复合物的水平并且将其与相同复合物的正常水平进行比较。在一些实施方案中,复合物的水平与样品中的靶RNA的水平相关。“败血症”是伴随急性炎症反应(全身炎症反应综合征)和与炎症的内源性媒介物释放到血流中相关的全身表现的感染。如果不及时治疗,败血症可以变成重度败血症,重度败血症常常伴随至少一种器官的衰竭或败血性休克,这是伴随对初始液体复苏的响应性较差的器官灌注不足和低血压的重度败血症。全身炎症反应由toll样受体(“TLR”)介导。“Toll样受体”或“TLR”是脊椎动物和无脊椎动物中一类识别微生物上的可与宿主分子区别且介导免疫细胞响应的特定的结构上保守的分子的蛋白。TLR位于细胞表面上或细胞区室中,且根据它们识别的和刺激它们的分子类型来分类,如表1所示的。表权利要求
1.一种用于检测受试者中败血症的存在的方法,所述方法包括检测来自所述受试者的样品中的至少一种靶RNA的水平,其中所述至少一种靶RNA (i)能够与具有选自SEQID NO 1至86的序列的核酸特异性杂交;或(ii)包含与选自SEQID NO 1至86的序列的至少15个连续核苷酸互补的序列;或(iii)包含选自SEQID NO :196至399、565至707和863至897的序列的至少15个连续核苷酸;其中所述样品中的至少一种靶RNA的水平大于所述至少一种靶RNA的正常水平就表明所述受试者中存在败血症。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述方法还包括比较所述样品中的至少一种靶 RNA的水平与所述至少一种靶RNA的正常水平。
3.一种便于检测受试者中败血症的方法,包括(a)检测来自所述受试者的样品中的至少一种靶RNA的水平,其中所述至少一种靶RNA (i)能够与具有选自SEQID NO 1至86的序列的核酸特异性杂交;或(ii)包含与选自SEQID NO 1至86的序列的至少15个连续核苷酸互补的序列;或(iii)包含选自SEQID NO :196至399、565至707和863至897的序列的至少15个连续核苷酸;和(b)将所述检测的结果传送至医师以便确定所述受试者是否患有败血症。
4.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中检测样品中的至少一种靶RNA的水平包括(a)使所述样品的核酸与与所述样品中的靶RNA或其补体互补的至少一种多核苷酸杂交;禾口(b)检测包含与选自所述靶RNA、所述靶RNA的DNA扩增子和所述靶RNA的补体的至少一种核酸杂交的多核苷酸的至少一种复合物。
5.一种用于检测受试者中败血症的存在的方法,包括(a)从所述受试者获得样品,(b)给实验室提供所述样品以便检测所述样品中的至少一种靶RNA的水平,其中所述至少一种靶RNA (i)能够与具有选自SEQID NO 1至86的序列的核酸特异性杂交;或(ii)包含与选自SEQID NO 1至86的序列的至少15个连续核苷酸互补的序列;或(iii)包含选自SEQID NO :196至399、565至707和863至897的序列的至少15个连续核苷酸;和(c)从所述实验室接收指示所述样品中的所述至少一种靶RNA的水平的信息;其中至少一种靶RNA的水平大于所述至少一种靶RNA的正常水平就表明存在败血症。
6.根据权利要求1至4中任一项所述的方法,其中所述方法还包括从所述样品分离核酸。
7.根据权利要求6所述的方法,其中所述核酸包括已与DNA分离的RNA。
8.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中以其成熟形式的至少一种靶RNA包含少于30个核苷酸。
9.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中至少一种靶RNA是微RNA。
10.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中检测至少两种靶RNA的水平,其中所述靶RNA中的至少两种(i)能够与具有选自SEQID NO 1至86的序列的核酸特异性杂交;或(ii)包含与选自SEQID NO 1至86的序列的至少15个连续核苷酸互补的序列;或(iii)包含选自SEQID NO :196至399、565至707和863至897的序列的至少15个连续核苷酸;且其中所述至少两种靶RNA是不同的。
11.根据权利要求10所述的方法,其中检测到至少一种靶RNA的水平大于所述至少一种靶RNA的正常水平就表明存在败血症。
12.根据权利要求10所述的方法,其中检测到至少两种靶RNA的水平大于所述至少两种靶RNA的正常水平就表明存在败血症。
13.根据权利要求10所述的方法,其中检测至少三种靶RNA的水平,其中所述靶RNA中的至少三种(i)能够与具有选自SEQID NO 1至86的序列的核酸特异性杂交;或(ii)包含与选自SEQID NO 1至86的序列的至少15个连续核苷酸互补的序列;或(iii)包含选自SEQID NO :196至399、565至707和863至897的序列的至少15个连续核苷酸;且其中所述至少三种靶RNA是不同的。
14.根据权利要求13所述的方法,其中检测到至少一种靶RNA的水平大于所述至少一种靶RNA的正常水平就表明存在败血症。
15.根据权利要求13所述的方法,其中检测到至少两种靶RNA的水平大于所述至少两种靶RNA的正常水平就表明存在败血症。
16.根据权利要求13所述的方法,其中检测到至少三种靶RNA的水平大于所述至少三种靶RNA的正常水平就表明存在败血症。
17.根据权利要求10所述的方法,其中检测至少五种靶RNA的水平。
18.根据权利要求10至17中任一项所述的方法,其中检测以下至少一种靶RNA的水平(i)不与具有选自SEQID NO 1至86的序列的核酸特异性杂交;或(ii)不包含与选自SEQID NO :1至86的序列的至少15个连续核苷酸互补的序列;和(iii)不包含选自SEQID NO :196至399、565至707和863至897的序列的至少15个连续核苷酸。
19.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中至少一种靶RNA(a)能够与选自SEQ ID NO :1、2、3、4、5、7、10、12、16、18、22、24、25、26、28、30、31、32、 35、36、37、41、42、43、44、53、54、55、60、61、63、65、66、68、71、77、80、81、82、83 和 85 的序列特异性杂交;或(b)包含与选自SEQ ID NO :1、2、3、4、5、7、10、12、16、18、22、24、25、26、28、30、31、32、 35、36、37、41、42、43、44、53、54、55、60、61、63、65、66、68、71、77、80、81、82、83 和 85 的序列的至少15个连续核苷酸互补的序列。
20.根据权利要求19所述的方法,其中检测到所述至少一种靶RNA的水平大于所述至少一种靶RNA的正常水平就表明存在由病毒感染引起的败血症。
21.根据权利要求1至18中任一项所述的方法,其中至少一种靶RNA(a)能够与选自SEQ ID NO :6、8、11、13、14、15、17、19、20、21、23、27、29、30、33、34、35、 38、39、45、46、47、48、49、52、56、57、58、59、60、62、63、64、65、67、69、71、73、74、76、78、79、84 和86的序列特异性杂交;或(b)包含与选自SEQ ID NO :6、8、11、13、14、15、17、19、20、21、23、27、29、30、33、34、35、 38、39、45、46、47、48、49、52、56、57、58、59、60、62、63、64、65、67、69、71、73、74、76、78、79、84 和86的序列的至少15个连续核苷酸互补的序列。
22.根据权利要求21所述的方法,其中检测到所述至少一种靶RNA的水平大于所述至少一种靶RNA的正常水平就表明存在由细菌感染引起的败血症。
23.根据权利要求1至18中任一项所述的方法,其中至少一种靶RNA(a)能够与选自SEQ ID NO :6、11、13、15、17、19、20、21、27、29、33、34、35、38、45、46、47、 48、49、56、58、69、71、73、76、84和86的序列特异性杂交;或(b)包含与选自SEQ ID NO :6、11、13、15、17、19、20、21、27、29、33、34、35、38、45、46、47、 48、49、56、58、69、71、73、76、84和86的序列的至少15个连续核苷酸互补的序列。
24.根据权利要求23所述的方法,其中检测到所述至少一种靶RNA的水平大于所述至少一种靶RNA的正常水平就表明存在由革兰氏阴性菌的感染引起的败血症。
25.根据权利要求1至18中任一项所述的方法,其中至少一种靶RNA(a)能够与选自SEQID NO 23、30、39、52、57、60、65、67和79的序列特异性杂交;或(b)包含与选自SEQID NO :23、30、39、52、57、60、65、67和79的序列的至少15个连续核苷酸互补的序列。
26.根据权利要求25所述的方法,其中检测到所述至少一种靶RNA的水平大于所述至少一种靶RNA的正常水平就表明存在由革兰氏阳性菌的感染引起的败血症。
27.根据权利要求1至18中任一项所述的方法,其中至少一种靶RNA(a)能够与选自SEQID NO :8、14、59、62、63、64、74和78的序列特异性杂交;或(b)包含与选自SEQID NO :8、14、59、62、63、64、74和78的序列的至少15个连续核苷酸互补的序列。
28.根据权利要求27所述的方法,其中检测到所述至少一种靶RNA的水平大于所述至少一种靶RNA的正常水平就表明存在由革兰氏阳性菌或分枝杆菌的感染引起的败血症。
29.根据权利要求1至18中任一项所述的方法,其中至少一种靶RNA(a)能够与选自SEQID NO :9、50、51、70、72和75的序列特异性杂交;或(b)包含与选自SEQID NO :9、50、51、70、72和75的序列的至少15个连续核苷酸互补的序列。
30.根据权利要求四所述的方法,其中检测到所述至少一种靶RNA的水平大于所述至少一种靶RNA的正常水平就表明存在由细菌感染、病毒感染或两者引起的未甲基化的CpG 核酸。
31.根据权利要求1至18中任一项所述的方法,其中至少一种靶RNA(a)能够与选自 SEQ ID NO :1、2、3、4、5、7、10、12、16、18、22、24、25、26、28、30、31、32、 35、36、37、41、42、43、44、53、54、55、60、61、63、65、66、68、71、77、80、81、82、83 和 85 的序列特异性杂交;或(b)包含与选自 SEQ ID NO :1、2、3、4、5、7、10、12、16、18、22、24、25、26、28、30、31、32、 35、36、37、41、42、43、44、53、54、55、60、61、63、65、66、68、71、77、80、81、82、83 和 85 的序列的至少15个连续核苷酸互补的序列。
32.根据权利要求31所述的方法,其中检测到所述至少一种靶RNA的水平大于所述至少一种靶RNA的正常水平就表明识别病毒衍生的分子的至少一种toll样受体的刺激。
33.根据权利要求1至18中任一项所述的方法,其中至少一种靶RNA(a)能够与选自SEQ ID NO :6、8、11、13、14、15、17、19、20、21、23、27、29、30、33、34、35、 38、39、45、46、47、48、49、52、56、57、58、59、60、62、63、64、65、67、69、71、73、74、76、78、79、84 和86的序列特异性杂交;或(b)包含与选自SEQ ID NO :6、8、11、13、14、15、17、19、20、21、23、27、29、30、33、34、35、 38、39、45、46、47、48、49、52、56、57、58、59、60、62、63、64、65、67、69、71、73、74、76、78、79、84 和86的序列的至少15个连续核苷酸互补的序列。
34.根据权利要求33所述的方法,其中检测到所述至少一种靶RNA的水平大于所述至少一种靶RNA的正常水平就表明识别细菌衍生的分子的至少一种toll样受体的刺激。
35.根据权利要求1至18中任一项所述的方法,其中至少一种靶RNA(a)能够与选自SEQ ID NO :6、11、13、15、17、19、20、21、27、29、33、34、35、38、45、46、47、 48、49、56、58、69、71、73、76、84和86的序列特异性杂交;或(b)包含与选自SEQ ID NO :6、11、13、15、17、19、20、21、27、29、33、34、35、38、45、46、47、 48、49、56、58、69、71、73、76、84和86的序列的至少15个连续核苷酸互补的序列。
36.根据权利要求35所述的方法,其中检测到所述至少一种靶RNA的水平大于所述至少一种靶RNA的正常水平就表明识别革兰氏阳性菌衍生的分子的至少一种toll样受体的刺激。
37.根据权利要求1至18中任一项所述的方法,其中至少一种靶RNA(a)能够与选自SEQID NO 23、30、39、52、57、60、65、67和79的序列特异性杂交;或(b)包含与选自SEQID NO :23、30、39、52、57、60、65、67和79的序列的至少15个连续核苷酸互补的序列。
38.根据权利要求37所述的方法,其中检测到所述至少一种靶RNA的水平大于所述至少一种靶RNA的正常水平就表明识别革兰氏阳性菌衍生的分子的至少一种toll样受体的刺激。
39.根据权利要求1至18中任一项所述的方法,其中至少一种靶RNA(a)能够与选自SEQID NO :8、14、59、62、63、64、74和78的序列特异性杂交;或(b)包含与选自SEQID NO :8、14、59、62、63、64、74和78的序列的至少15个连续核苷酸互补的序列。
40.根据权利要求39所述的方法,其中检测到所述至少一种靶RNA的水平大于所述至少一种靶RNA的正常水平就表明识别革兰氏阳性菌衍生的分子、分枝杆菌衍生的分子或两者的至少一种toll样受体的刺激。
41.根据权利要求1至18中任一项所述的方法,其中至少一种靶RNA(a)能够与选自SEQID NO :9、50、51、70、72和75的序列特异性杂交;或(b)包含与选自SEQID NO :9、50、51、70、72和75的序列的至少15个连续核苷酸互补的序列。
42.根据权利要求41所述的方法,其中检测到所述至少一种靶RNA的水平大于所述至少一种靶RNA的正常水平就表明识别由细菌感染、病毒感染或两者引起的未甲基化的CpG 核酸的至少一种toll样受体的刺激。
43.根据权利要求1至18中任一项所述的方法,其中至少一种靶RNA包含选自SEQID NO 226至观9、565至604和863至868的序列的至少15个连续核苷酸。
44.根据权利要求1至18中任一项所述的方法,其中至少一种靶RNA包含选自SEQID NO :231、236、237、242、245、253、260、261、262、263、266、269、275、287、303、342、352、566、 567、568、571、570、573、574、575、577、579、580、581、588、591、598、601、608、612、613、624、 626、629、632、635、637、641、642、644和648的序列的至少15个连续核苷酸。
45.根据权利要求1至18中任一项所述的方法,其中至少一种靶RNA包含选自SEQID NO :231、236、242、260、261、266、287、566、567、568、571、570、574、580、581、588、598、601、 608,624,626,629和632的序列的至少15个连续核苷酸。
46.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中来自所述受试者的所述样品是血样。
47.根据权利要求46所述的方法,其中所述样品是单核细胞。
48.一种包括第一区的合成多核苷酸,其中所述第一区包括与SEQ ID NO :1至67和215 至399中的一个的至少8个连续核苷酸的序列相同或互补的至少8个连续核苷酸的序列。
49.根据权利要求48所述的合成多核苷酸,其中所述第一区包括与SEQID NO :1至67 和215至399中的一个的至少9个连续核苷酸的序列相同或互补的至少9个连续核苷酸的序列。
50.根据权利要求48所述的合成多核苷酸,其中所述第一区包括与SEQID NO :1至67 和215至399中的一个的至少10个连续核苷酸的序列相同或互补的至少10个连续核苷酸的序列。
51.根据权利要求48所述的合成多核苷酸,其中所述第一区包括与具有SEQID NO=I 至67和215至399中的一个的至少12个连续核苷酸的序列相同或互补的至少12个连续核苷酸的序列。
52.根据权利要求48至51中任一项所述的合成多核苷酸,其中所述多核苷酸包括可检测标记。
53.根据权利要求52所述的合成多核苷酸,其中所述可检测标记是FRET标记。
54.根据权利要求48至53中任一项所述的合成多核苷酸,其中所述第一区与靶RNA的区相同或互补。
55.根据权利要求M所述的合成多核苷酸,其中所述多核苷酸还包括与所述靶RNA的区不相同或不互补的第二区。
56.一种组合物,包含多种合成多核苷酸,其中至少一种多核苷酸包括第一区,所述第一区包括与SEQ ID NO :1至67和215至399中的一个或多个的至少8个连续核苷酸的序列相同或互补的至少8个连续核苷酸的序列。
57.根据权利要求56所述的组合物,其中所述多种合成多核苷酸中的至少两种多核苷酸包括第一区,所述第一区包括与具有SEQ ID NO :1至67和215至399中的一个或多个的至少9个连续核苷酸的序列相同或互补的至少9个连续核苷酸的序列,且其中所述至少两种多核苷酸的第一区是不同的。
58.根据权利要求56所述的组合物,其中所述多种合成多核苷酸中的至少三种多核苷酸包括第一区,所述第一区包括与具有SEQ ID NO :1至67和215至399中的一个或多个的至少10个连续核苷酸的序列相同或互补的至少10个连续核苷酸的序列,且其中所述至少三种多核苷酸的第一区是不同的。
59.根据权利要求56所述的组合物,其中所述多种合成多核苷酸中的至少五种多核苷酸包括第一区,所述第一区包括与SEQ ID NO :1至67和215至399中的一个或多个的至少 12个连续核苷酸的序列相同或互补的至少12个连续核苷酸的序列,且其中所述至少五种多核苷酸的所述第一区是不同的。
60.一种试剂盒,包括权利要求48至55中任一项所述的合成多核苷酸。
61.一种试剂盒,包括权利要求56至59中任一项所述的组合物。
62.根据权利要求60或权利要求61所述的试剂盒,其中所述试剂盒还包括至少一种聚合酶。
63.根据权利要求60至62中任一项所述的试剂盒,其中所述试剂盒还包括dNTP。
全文摘要
提供了来自患者的样品中的败血症的方法。还提供了检测与败血症相关的一种或多种微RNA的表达的变化的方法。还提供了组合物和试剂盒。
文档编号C12Q1/68GK102388149SQ201080014388
公开日2012年3月21日 申请日期2010年2月2日 优先权日2009年2月2日
发明者伯恩哈德·米绍, 奥利维耶·德尔富尔, 戴维·H·佩尔森, 戴维·比拉诺瓦 申请人:西菲伊德公司
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